DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment l(3)72Ab and AT2G42270

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_648818.3 Gene:l(3)72Ab / 39737 FlyBaseID:FBgn0263599 Length:2142 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_181756.1 Gene:AT2G42270 / 818828 AraportID:AT2G42270 Length:2172 Species:Arabidopsis thaliana


Alignment Length:2187 Identity:1185/2187 - (54%)
Similarity:1587/2187 - (72%) Gaps:72/2187 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     2 ADAAARQLQYEYKANSNLVLQADVRLIERPRRD--EATGEVCSLVGKLDGTRMGDRYQRTKPEKT 64
            |:..||..||.||.||:|||.:|.|     |||  |::||..||.|::|....|||..|.:|.:.
plant     9 AEEQARLKQYGYKVNSSLVLNSDER-----RRDTHESSGEPESLRGRIDPKSFGDRVVRGRPHEL 68

  Fly    65 EERKVKRQKRDEAQYDF--------ERMKGATLLSEGIDEMVGIVYRPKTQETRQTYEVLLSFIQ 121
            :||..|.:|:.|...|.        .|::..::|::..|.    ||:|||:|||..:|::|..||
plant    69 DERLNKSKKKKERCDDLVSARESKRVRLREVSVLNDTEDG----VYQPKTKETRVAFEIMLGLIQ 129

  Fly   122 EALGDQPRDILCGAADEILAVLKNDRLKDRERKKDIDSLLGAVTDERFALLVNLGKKITDF--GS 184
            :.||.||.||:|||||||||||||:.:|:.|:|.:|:.||..:||:.|:..|::||.|||:  |.
plant   130 QQLGGQPLDIVCGAADEILAVLKNESVKNHEKKVEIEKLLNVITDQVFSQFVSIGKLITDYEEGG 194

  Fly   185 DAVNALTAAPNNEEQIDETYGINVQFEESEEESDNDMYGEIRDDDAQDEGEEARIDHT--LHAEN 247
            |   :|:...:.:..:|...|:.::.||.::|||.||..:.:|::.:|..|   ::.|  :....
plant   195 D---SLSGKASEDGGLDYDIGVALECEEDDDESDLDMVQDEKDEEDEDVVE---LNKTGVVQVGV 253

  Fly   248 LANEEAANNVKKERSLHPLDIDAYWLQRCLSKFYK---DAMVSQSKAADVLKILKDAADDRDCEN 309
            ..|.|.|...|::.||:.||||||||||.:|:.|:   ||...|..|.::||||.: .:|||.|.
plant   254 AINGEDARQAKEDTSLNVLDIDAYWLQRKISQEYEQKIDAQECQELAEELLKILAE-GNDRDVEI 317

  Fly   310 QLVLLLGYDCFDFIKQLKLNRQMVLYCTMLASAQTDSERQRIREKMRG-NSALAKILRQLDTGKS 373
            :|:..|.::.|..:|.|..||..|::||.||..:...||.:|.|:|.| .|.||.|:::|...::
plant   318 KLLEHLQFEKFSLVKFLLQNRLKVVWCTRLARGRDQEERNQIEEEMLGLGSELAAIVKELHAKRA 382

  Fly   374 EDQEEGEAR------------------GSKRGKGDAEDGGAAAAGQVAGVRQLLELEEMAFTQGS 420
            ..:|..|.|                  ...||..|.:|.. ...|.:.|.||:::||.:||.||.
plant   383 TAKEREEKREKDIKEEAQHLMDDDSGVDGDRGMRDVDDLD-LENGWLKGQRQVMDLESLAFNQGG 446

  Fly   421 HFMANKRCQLPDGSYRKQRKGYEEVHVPALKPVPFDANEELQPVDKLPKYVQPVFEGFKTLNRIQ 485
            ....|.:|:|||.|:|.:.|.::|||||.:.. .||:||:|..:..||::.||.|.|.:.|||:|
plant   447 FTRENNKCELPDRSFRIRGKEFDEVHVPWVSK-KFDSNEKLVKISDLPEWAQPAFRGMQQLNRVQ 510

  Fly   486 SRLYKAALDSDENMLLCAPTGAGKTNVALLTMMREIGKHINEDGTINAQDFKIIYVAPMKSLVQE 550
            |::|..||...:|:||||||||||||||:||::.::|.::|..||.|..::||:||||||:||.|
plant   511 SKVYGTALFKADNILLCAPTGAGKTNVAVLTILHQLGLNMNPGGTFNHGNYKIVYVAPMKALVAE 575

  Fly   551 MVGNFGRRLACYNLTVSELTGDHQLTREQIAATQVIVCTPEKWDIITRKGGERTFVSLVRLVIID 615
            :|.:..:||..:.:||.||:||..||.::|..||:||.|||||||||||.|:||:..||||:|||
plant   576 VVDSLSQRLKDFGVTVKELSGDQSLTGQEIKETQIIVTTPEKWDIITRKSGDRTYTQLVRLLIID 640

  Fly   616 EIHLLHDERGPVLEALVARTIRNIETTQEEVRLVGLSATLPNYQDVATFLRVKPDKGLFYFDNSY 680
            |||||.|.||||||::||||:|.||:|:|.:|||||||||||..|||:||||....|||.||.||
plant   641 EIHLLDDNRGPVLESIVARTLRQIESTKEHIRLVGLSATLPNCDDVASFLRVDLKNGLFIFDRSY 705

  Fly   681 RPVSLEQQYIGVTEKKALKRFQVMNEIVYEKTMEHAGRNQVLVFVHSRKETGKTARAVRDMCLEQ 745
            |||.|.|||||:..||.|:|||:||:|.|:|.:..||::|||:||||||||.|||||:||..:..
plant   706 RPVPLGQQYIGINVKKPLRRFQLMNDICYQKVVAVAGKHQVLIFVHSRKETAKTARAIRDTAMAN 770

  Fly   746 DTLGSFLKEGSASMEVLRTEAEQVKNTELKELLPYGFAIHHAGMTRVDRTLVEDLFADRHIQVLV 810
            |||..||||.|.|.|:|:..|..:||.:|||||||||||||||:||.||.:||:.|...::|||:
plant   771 DTLSRFLKEDSQSREILKCLAGLLKNNDLKELLPYGFAIHHAGLTRTDREIVENQFRWGNLQVLI 835

  Fly   811 STATLAWGVNLPAHTVIIKGTQVYNPEKGRWVELSALDVLQMLGRAGRPQYDTKGEGILITNHSE 875
            |||||||||||||||||||||||||||:|.|:|||.|||:||:|||||||||.:||||:||.:|:
plant   836 STATLAWGVNLPAHTVIIKGTQVYNPERGEWMELSPLDVMQMIGRAGRPQYDQQGEGIIITGYSK 900

  Fly   876 LQFYLSLLNQQLPIESQFISKLPDMLNAEIVLGTVQHLQDAVNWLGYTYLYIRMLRNPTLYGVSH 940
            ||:||.|:|:||||||||||||.|.|||||||||:|:.::|.:||||||||:||:|||||||||.
plant   901 LQYYLRLMNEQLPIESQFISKLADQLNAEIVLGTIQNAREACHWLGYTYLYVRMVRNPTLYGVSP 965

  Fly   941 DAIKADPLLEQHRADLLHTAACCLERSGLIKYDRKTGHFQVTDLGRIASHYYLTHETMLTYNQLL 1005
            ||:..|.|||:.||||:|:||..|:::.|||||||:|||||||||||||:||::|.|:..||:.|
plant   966 DALAKDLLLEERRADLIHSAATILDKNNLIKYDRKSGHFQVTDLGRIASYYYISHGTIAAYNENL 1030

  Fly  1006 KQTLSEIELFRVFSLSSEFRHISVREEEKLELQKLMERVPIPIKESIEEHSAKVNVLLQAYISQL 1070
            |.|:::|||.|:||||.||::::||::||:||.||::|||||:||::|:.|||:|||||.|||:|
plant  1031 KPTMNDIELCRLFSLSEEFKYVTVRQDEKMELAKLLDRVPIPVKETLEDPSAKINVLLQVYISKL 1095

  Fly  1071 KLEGFALMSDMVFITQSAARLMRAIFEIVLTRGWAQLADKTLTLCKMIDRRMWQSMTPLRQFKKM 1135
            ||||.:|.||||:|||||.||:||||||||.||||||:.|.|.|.||:.:|||...|||.||..:
plant  1096 KLEGLSLTSDMVYITQSAGRLLRAIFEIVLKRGWAQLSQKALNLSKMVGKRMWSVQTPLWQFPGI 1160

  Fly  1136 PDEIAKKLEKKHFPWGRLYDLEPHELGELIRVPKLGKTIHKFVHQFPKLELSTHIQPITRGTLRV 1200
            |.||..||||....|.|.|||...||||||..||:|:.:||::||||||:|:.|:|||:|..|:|
plant  1161 PKEILMKLEKNDLVWERYYDLSSQELGELICNPKMGRPLHKYIHQFPKLKLAAHVQPISRSVLQV 1225

  Fly  1201 ELTITPDFQWDEKVHGQSEGFWVLIEDVDSELILHHEFFLLKQKYSQDEHQLKFFVPVFEPLPPQ 1265
            |||:||||.||:|.:...|.||:::||.|.|.|||||:||.|::...::|.|.|.||:.||:|||
plant  1226 ELTVTPDFHWDDKANKYVEPFWIIVEDNDGEKILHHEYFLFKKRVIDEDHTLNFTVPISEPIPPQ 1290

  Fly  1266 YFLRIVSDRWIGAETQLPVSFRHLILPEKNMPPTELLDLQPLPISALRQPKFESFYSQRFPQFNP 1330
            ||:|:|||:|:.:.|.|||||||||||||..||||||||||||:.|||.|.:|:.| |.|..|||
plant  1291 YFIRVVSDKWLDSPTVLPVSFRHLILPEKYPPPTELLDLQPLPVMALRNPSYETLY-QDFKHFNP 1354

  Fly  1331 IQTQVFNAVYNSDENVFVGAPTGSGKMTIAEFAIMR--LFTTQSDARCVYLVSEEALADLVFADW 1393
            :|||||..:||:.:||.|.|||||||...|||||:|  |....|..|.||:...||:|...|.||
plant  1355 VQTQVFTVLYNTSDNVVVAAPTGSGKTICAEFAILRNHLEGPDSAMRVVYIAPLEAIAKEQFRDW 1419

  Fly  1394 HSKFG-SLDIKVVKLTGETGTDLKLIAKGQLVITTADKWDVLSRRWKQRKNVQLVNLFIVDELQL 1457
            ..||| .|.::||:|||||..||||:.|||::|:|.:|||.|||||||||.:|.|:|||||||.|
plant  1420 EKKFGKGLGLRVVELTGETLLDLKLLEKGQIIISTPEKWDALSRRWKQRKYIQQVSLFIVDELHL 1484

  Fly  1458 VGGEEGPVLEIVCSRMRYISSQIEKQIRIVALSASLTDARDVAQWLGCNPNATFNFHPSVRPIPL 1522
            :||:.|.|||::.|||||||||:..:|||||||.||.:|:|:.:|:|.:....|||.|:|||:||
plant  1485 IGGQGGQVLEVIVSRMRYISSQVGNKIRIVALSTSLANAKDLGEWIGASSCGVFNFPPNVRPVPL 1549

  Fly  1523 ELHIQGYNVTHNATRIATMSKPVYNAILKYSAH-KPVIVFVSSRKQARLTAIDVLTYAASD-LQP 1585
            |:||.|.::.....|:..|:||.|.||::::.: ||.||||.:||..||||:|::.|:..| ::.
plant  1550 EIHIHGVDILSFEARMQAMTKPTYTAIVQHAKNKKPAIVFVPTRKHVRLTAVDLIAYSHMDNMKS 1614

  Fly  1586 NRFFHAEEEDIKPFLERMTDKTLKETLAQGVAYLHEGLSASDHRLVEQLFDSGAVQVAVISRDLC 1650
            ..|.....|:::|||.::.::||||||..|:.|||||||..|..:|.|||::|.:||.|:|..||
plant  1615 PDFLLGNLEELEPFLIQICEETLKETLRHGIGYLHEGLSNLDQEIVTQLFEAGRIQVCVMSSSLC 1679

  Fly  1651 WGMSISAHLVIIMDTQFYNGKNHSYEDYPITDVLQMIGRANRPNEDADAKCVLMCQSSKKDFFKK 1715
            ||..:.||||::|.|.||:|:.:|:.||||:::|||:||.:||..|...|||:.|.:.:|:::||
plant  1680 WGTPLKAHLVVVMGTHFYDGRENSHSDYPISNLLQMMGRGSRPLLDDAGKCVIFCHAPRKEYYKK 1744

  Fly  1716 FINEPLPIESHLDHRMHDHFNAEVVTKTIENKQDAVDYLTWTFLYRRLTQNPNYYNLQGVTHRHL 1780
            |:.|.||:||||.|.:||:||||||.:.|||||||||||||:|:||||.||||||||.||:||||
plant  1745 FLYEALPVESHLQHFLHDNFNAEVVARVIENKQDAVDYLTWSFMYRRLPQNPNYYNLLGVSHRHL 1809

  Fly  1781 SDHLSELVENTLSDLEQSKCISVEDDMDTLPLNLGMIAAYYYINYTTIELFSLSLNSKTKVRGLL 1845
            ||||||||||||||||.||||.:::::|..||||||||:||||||||||.||..|.||||::|||
plant  1810 SDHLSELVENTLSDLEVSKCIEIDNELDLSPLNLGMIASYYYINYTTIERFSSLLASKTKMKGLL 1874

  Fly  1846 EIISSAAEYEDVVVRHHEEQVLRTLSQRLPNKLTGPNETAPKFNDPHIKTNLLLQAHLSRLQLGP 1910
            ||::||:||:.:.:|..||..:|.|...  .:.:..|   |:..||.:||:.|||||.||.::..
plant  1875 EILTSASEYDLIPIRPGEEDAVRRLINH--QRFSFQN---PRCTDPRVKTSALLQAHFSRQKISG 1934

  Fly  1911 ELQGDTEQILSKAIRLIQACVDVLSSNGWLSPAVAAMELAQMVTQAMWSKDSYLKQLPHFSPEIV 1975
            .|..|..::|..|.||:||.|||:||||.|:.|:.|||::|||||.||.:||.|.|||||:.::.
plant  1935 NLVMDQCEVLLSATRLLQAMVDVISSNGCLNLALLAMEVSQMVTQGMWDRDSMLLQLPHFTKDLA 1999

  Fly  1976 KRCTE---KKIETVFDIMELEDEDRTRLLQLSDLQMADVARFCNRYPNIELNYEVVDKDRINSGS 2037
            |||.|   ..|||:||::|:||:.|..|||:||.|:.|:||||||:|||:|.||:|..:.::.|.
plant  2000 KRCHENPGNNIETIFDLVEMEDDKRQELLQMSDAQLLDIARFCNRFPNIDLTYEIVGSNEVSPGK 2064

  Fly  2038 TVNVVVQLEREDE---VTGPVIAPFFPQKREEGWWVVIGDPKTNSLLSIKRLTLQQKAKVKLDFV 2099
            .:.:.|.|||:.|   ..|||.||.:|:.:|||||:|:|:.|||.|::|||::||:||:|||:|.
plant  2065 DITLQVLLERDMEGRTEVGPVDAPRYPKTKEEGWWLVVGEAKTNQLMAIKRISLQRKAQVKLEFA 2129

  Fly  2100 APS-PGKHDYTLYYMSDSYLGCDQEYKFSIEVGDFQSESESE 2140
            .|: .|:..||||:|.||||||||||.|:::|.|..:....|
plant  2130 VPTETGEKSYTLYFMCDSYLGCDQEYSFTVDVKDSDAADHME 2171

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
l(3)72AbNP_648818.3 BRR2 466..1241 CDD:224125 495/774 (64%)
DEAD 482..661 CDD:278688 109/178 (61%)
HELICc 773..859 CDD:197757 66/85 (78%)
Sec63 982..1285 CDD:280962 180/302 (60%)
DEXDc 1320..1506 CDD:214692 110/188 (59%)
DEAD 1329..1495 CDD:278688 102/168 (61%)
HELICc 1615..1694 CDD:197757 42/78 (54%)
Sec63 1811..2127 CDD:280962 171/322 (53%)
AT2G42270NP_181756.1 BRR2 484..1270 CDD:224125 499/785 (64%)
DEAD 507..686 CDD:278688 109/178 (61%)
HELICc 790..884 CDD:197757 69/93 (74%)
Sec63 1007..1310 CDD:280962 180/302 (60%)
DEAD 1353..1526 CDD:278688 103/172 (60%)
HELICc 1631..1722 CDD:197757 47/90 (52%)
SEC63 1837..2160 CDD:214744 173/327 (53%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Domainoid 1 1.000 425 1.000 Domainoid score I116
eggNOG 1 0.900 - - E1_COG1204
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H5859
Inparanoid 1 1.050 2194 1.000 Inparanoid score I2
OMA 1 1.010 - - QHG54133
OrthoDB 1 1.010 - - D154891at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0001085
OrthoInspector 1 1.000 - - otm2764
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100305
Panther 1 1.100 - - O PTHR24075
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X2806
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 1 0.960 - -
1413.840

Return to query results.
Submit another query.