DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment l(3)72Ab and Ascc3

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_648818.3 Gene:l(3)72Ab / 39737 FlyBaseID:FBgn0263599 Length:2142 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001263986.1 Gene:Ascc3 / 309887 RGDID:1307995 Length:2201 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2221 Identity:858/2221 - (38%)
Similarity:1278/2221 - (57%) Gaps:182/2221 - (8%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    54 DRYQRTKPEKTEERKVKRQKRDEAQYDF--ERMKGATLLSEGIDEMVGIVYRPKTQETRQTYEVL 116
            |.|.    |:..:.|:||.|..|...||  ...|....|:|.::       :.|.|...:..:.:
  Rat    20 DNYN----EEVADLKLKRSKLHEQALDFGLSWKKIVKFLNEKLE-------KNKMQTINEDLKDI 73

  Fly   117 LSFIQEALG-DQPRD-ILCGAADEILAVLKNDRLKDRERKKDIDSLLGAVTDERFALLVNLGKK- 178
            |...::.:| |...: |..|||...:.....|.:...|.|. |..:.|...........|...: 
  Rat    74 LQAAKQIVGTDNGNEAIESGAAFLFMTFHMTDSVGYTETKA-IRQMFGPFPSSSATSACNATSRI 137

  Fly   179 ITDFGSDAVNALTAAPNNEEQIDETYGINVQFEESEEESDNDMYGEIRDDDAQDEGEEARIDHTL 243
            |:.|..|.:.||..|..|:......:|.|:.|  |.:..|.|.:.|:      ....||:...:|
  Rat   138 ISHFSQDDLTALVQATENQCNDRVVFGRNLAF--SFDMHDLDHFDEL------PVNGEAQKTISL 194

  Fly   244 HAENLANEEAANNVKKERSLHPLDIDAYWLQRCLSKFYKDAMVSQSKAA--------DVLKILKD 300
            ..:...||:.......|  |.|::.....|..|..:.|.:|.:.:...|        .:..:|..
  Rat   195 DYKKFLNEQFQEPYTPE--LKPVEKSNGSLLWCEVEKYLNATLKEMTEAPRVEDLCCTLYDMLAS 257

  Fly   301 AADDRDCENQLVLLLGYDCFDFIKQLKLNRQMVLYCTMLASAQTDSERQRIRE---KMRGNSALA 362
            |....:.:::|..|||....|.|::|..||  :.......::.:|.:.|.:::   |:.|.:|..
  Rat   258 AKSGDELQDELFELLGPGGLDLIEKLLQNR--ITIVDRFLNSSSDHKFQVLQDNCKKILGENAKP 320

  Fly   363 KILRQLDTGKSEDQEE-------GEARGSKRGKGDAEDGGAAAAG-------------------- 400
            ....|: |.:||.:::       .|.|.::|.|...|||..:..|                    
  Rat   321 NYGCQV-TIQSEQEKQLMKQYRREEKRIARREKKAGEDGEVSGEGLLPFDPKELRLQREHALLNA 384

  Fly   401 ---QVAGVRQLLELEEM----------AFTQGSHFMANKRCQLPDGSYRKQRKGYEEVHVPALKP 452
               .:.|.::..|:|::          |..:.|.|:|..:..||:|..|:..|.||||.:|..:|
  Rat   385 RSAPILGRQRDTEVEKIRYPHVYDSQAAARETSAFIAGAKMILPEGIQRENTKLYEEVRIPYSEP 449

  Fly   453 VPFDANEELQPVDKLPKYVQPVFEGFKTLNRIQSRLYKAALDSDENMLLCAPTGAGKTNVALLTM 517
            :|....|:...:..|.:..|..|:|.|.||||||.::..|.:::||||:||||||||||:|:||:
  Rat   450 MPVGFEEKPVYIQDLDEVGQLAFKGMKRLNRIQSIVFDTAYNTNENMLICAPTGAGKTNIAMLTV 514

  Fly   518 MREIGKHINEDGTINAQDFKIIYVAPMKSLVQEMVGNFGRRLACYNLTVSELTGDHQLTREQIAA 582
            :.||.:|.:: |.:...:|||:||||||:|..||...|.:||....:.|.|||||.||::.:|..
  Rat   515 LHEIRQHFHQ-GVLKKNEFKIVYVAPMKALAAEMTNYFSKRLEPLGIVVKELTGDMQLSKSEILR 578

  Fly   583 TQVIVCTPEKWDIITRKG-GERTFVSLVRLVIIDEIHLLHDERGPVLEALVARTIRNIETTQEEV 646
            ||::|.||||||::|||. |:.....:|:|:|:||:||||::||||||::||||:|.:|:||..:
  Rat   579 TQMLVTTPEKWDVVTRKSVGDVALSQIVKLLILDEVHLLHEDRGPVLESIVARTLRQVESTQSMI 643

  Fly   647 RLVGLSATLPNYQDVATFLRVKPDKGLFYFDNSYRPVSLEQQYIGVTEKKALKRFQVMNEIVYEK 711
            |::|||||||||.||||||.|.|..||||||..:|||.|.|.::|:.....:::...|:|:.||.
  Rat   644 RILGLSATLPNYLDVATFLHVNPYIGLFYFDGRFRPVPLGQTFLGIKSANKMQQLNNMDEVCYES 708

  Fly   712 TMEH--AGRNQVLVFVHSRKETGKTARAVRDMCLEQDTLGSFL-KEGSASMEVLRTEAEQVKNTE 773
            .::.  || :||:||||:|..|.:||.::.:.......:..|| .:|......|: :.::.:|.:
  Rat   709 VLKQVKAG-HQVMVFVHARNATVRTAMSLIERAKNSGQISCFLPTQGPEYGHALK-QVQKSRNKQ 771

  Fly   774 LKELLPYGFAIHHAGMTRVDRTLVEDLFADRHIQVLVSTATLAWGVNLPAHTVIIKGTQVYNPEK 838
            ::||...||:||||||.|.||.|||:||::.||:|||.|||||||||||||.|||||||:|..::
  Rat   772 VRELFSDGFSIHHAGMLRQDRNLVENLFSNGHIKVLVCTATLAWGVNLPAHAVIIKGTQIYAAKR 836

  Fly   839 GRWVELSALDVLQMLGRAGRPQYDTKGEGILITNHSELQFYLSLLNQQLPIESQFISKLPDMLNA 903
            |.:|:|..|||:|:.|||||||:|..||||:||.|.:|..|||||.||.||||||:..|.|.|||
  Rat   837 GSFVDLGILDVMQIFGRAGRPQFDKFGEGIIITTHDKLSHYLSLLTQQNPIESQFLESLADNLNA 901

  Fly   904 EIVLGTVQHLQDAVNWLGYTYLYIRMLRNPTLYGVSHDAIKADPLLEQHRADLLHTAACCLERSG 968
            ||.||||.::::||.|:.|||||:||..||..||:||.|.:.||.|.:||..||......|:::.
  Rat   902 EIALGTVTNVEEAVKWMSYTYLYVRMRANPLAYGISHKAYQMDPTLRKHREQLLIEVGQKLDKAR 966

  Fly   969 LIKYDRKTGHFQVTDLGRIASHYYLTHETMLTYNQLLKQTLSEIELFRVFSLSSEFRHISVREEE 1033
            :|:::.:||:|..|||||.|||||:.:.|:.|:|:|.....:|.::|.:.|.:.||..|.|||||
  Rat   967 MIRFEERTGYFSSTDLGRTASHYYIKYNTIETFNELFDAHKTEGDIFAIVSKAEEFDQIKVREEE 1031

  Fly  1034 KLELQKLMER-VPIPIKESIEEHSAKVNVLLQAYISQLKLEGFALMSDMVFITQSAARLMRAIFE 1097
            ..||..|:.. ..:.....:|....|:|:|||.|||:.:::.|:|:||..::.|:|||::||:||
  Rat  1032 IEELDALLNNFCELSAPGGVENSYGKINILLQTYISRGEMDSFSLISDSAYVAQNAARIVRALFE 1096

  Fly  1098 IVLTRGWAQLADKTLTLCKMIDRRMWQSMTPLRQFKKMPDEIAKKLEKKHFPWGRLYDLEPHELG 1162
            |.|.:.|..:..:.|.|.|:||:|:|...:|||||..:|..|..:||:|:....:|.|:...|:|
  Rat  1097 IALRKRWPTMTYRLLNLSKVIDKRLWGWASPLRQFSVLPPHILTRLEEKNLTVDKLKDMRKDEIG 1161

  Fly  1163 ELIRVPKLGKTIHKFVHQFPKLELSTHIQPITRGTLRVELTITPDFQWDEKVHGQ-SEGFWVLIE 1226
            .::....:|..:.:.|||.|.:.:...||||||..|||.|.|.|||.|:::|||. .|.:|:.:|
  Rat  1162 HILHHVNIGLKVKQCVHQIPSVTMEASIQPITRTVLRVSLNIYPDFSWNDQVHGTVGEPWWIWVE 1226

  Fly  1227 DVDSELILHHEFFLL--KQKYSQDEHQLKFFVPVFEPLPPQYFLRIVSDRWIGAETQLPVSFRHL 1289
            |..::.|.|.|:||.  ||..:::...|.|.:|:|||||.||::|.|||||:|||....::|:||
  Rat  1227 DPTNDHIYHSEYFLALKKQVINKEAQLLVFTIPIFEPLPSQYYIRAVSDRWLGAEAVCIINFQHL 1291

  Fly  1290 ILPEKNMPPTELLDLQPLPISALRQPKFESFYSQRFPQFNPIQTQVFNAVYNSDENVFVGAPTGS 1354
            ||||::.|.||||||||||::||....:|:.|:  |..|||:|||:|:.:|::|.||.:||||||
  Rat  1292 ILPERHPPHTELLDLQPLPVTALGCKAYEALYN--FSHFNPVQTQIFHTLYHTDCNVLLGAPTGS 1354

  Fly  1355 GKMTIAEFAIMRLFTTQSDARCVYLVSEEALADLVFADW----HSKFGSLDIKVVKLTGETGTDL 1415
            ||...||.||.|:|.....::.||:...:||......||    ..|.|.   ||::|||:...|:
  Rat  1355 GKTVAAELAIFRVFNKYPTSKAVYIAPLKALVRERMDDWKIRIEEKLGK---KVIELTGDVTPDM 1416

  Fly  1416 KLIAKGQLVITTADKWDVLSRRWKQRKNVQLVNLFIVDELQLVGGEEGPVLEIVCSRMRYISSQI 1480
            |.|||..|::||.:|||.:||.|:.|..||.||:.|:||:.|:|.|.|||||::.||..:|||..
  Rat  1417 KSIAKADLIVTTPEKWDGVSRSWQNRSYVQQVNILIIDEIHLLGEERGPVLEVIVSRTNFISSHT 1481

  Fly  1481 EKQIRIVALSASLTDARDVAQWLGCNPNATFNFHPSVRPIPLELHIQGYNVTHNATRIATMSKPV 1545
            ||.:|||.||.:|.:|||:|.||.......|||.|||||:|||:||||:...|...|:|:|:||.
  Rat  1482 EKPVRIVGLSTALANARDLADWLNIKQMGLFNFRPSVRPVPLEVHIQGFPGQHYCPRMASMNKPA 1546

  Fly  1546 YNAILKYSAHKPVIVFVSSRKQARLTAIDVLTYAASDLQPNRFFHAEEEDIKPFLERMTDKTLKE 1610
            :.||..:|..|||::|||||:|.||||::::.:.|::..|.::.:.:|::::..:..:.|..||.
  Rat  1547 FQAIRSHSPAKPVLIFVSSRRQTRLTALELIAFLATEEDPKQWLNMDEQEMENIIATVRDSNLKL 1611

  Fly  1611 TLAQGVAYLHEGLSASDHRLVEQLFDSGAVQVAVISRDLCWGMSISAHLVIIMDTQFYNGKNHSY 1675
            |||.|:...|.||...|.:.||:||.:..|||.:.:..|.||::..||||||..|::|:||...|
  Rat  1612 TLAFGIGMHHAGLHERDRKTVEELFVNCKVQVLIATSTLAWGVNFPAHLVIIKGTEYYDGKTRRY 1676

  Fly  1676 EDYPITDVLQMIGRANRPNEDADAKCVLMCQSSKKDFFKKFINEPLPIESHLDHRMHDHFNAEVV 1740
            .|:||||||||:|||.||..|...|.|::....||||:|||:.||.|:||.|...:.||.|||:.
  Rat  1677 VDFPITDVLQMMGRAGRPQFDDQGKAVILVHDIKKDFYKKFLYEPFPVESSLLGVLSDHLNAEIA 1741

  Fly  1741 TKTIENKQDAVDYLTWTFLYRRLTQNPNYYNLQGVTHRHLSDHLSELVENTLSDLEQSKCISV-E 1804
            ..||.:||||:||:|||:.:|||..||:||||..|:...::..||.|:..:|.:||.|.||.| |
  Rat  1742 GGTITSKQDALDYITWTYFFRRLIMNPSYYNLGDVSQDAINKFLSHLIGQSLVELELSHCIEVGE 1806

  Fly  1805 DDMDTLPLNLGMIAAYYYINYTTIELFSLSLNSKTKVRGLLEIISSAAEYEDVVVRHHEEQVLRT 1869
            |:....||..|.||:|||:.:.|:::|...|..:.....||.|:|.|.||.|:.|||:|:.....
  Rat  1807 DNRSIEPLTCGRIASYYYLKHKTVKMFKDRLKPECSTEELLSILSDAEEYTDLPVRHNEDHTNNE 1871

  Fly  1870 LSQRLPNKLTGPNETAPKFNDPHIKTNLLLQAHLSRLQLG-PELQGDTEQILSKAIRLIQACVDV 1933
            |::.||.:| .|:    .|:.||.|.:|||||||||..|. |:...||:.:|.:|:|:.||.:||
  Rat  1872 LAKCLPIEL-NPH----SFDSPHTKAHLLLQAHLSRAMLPCPDYDTDTKTVLDQALRVCQAMLDV 1931

  Fly  1934 LSSNGWLSPAVAAMELAQMVTQAMWSKDSYLKQLPHFS--------------------------- 1971
            .:|.|||...:....|.|||.|..|.|||.|..:|:..                           
  Rat  1932 AASQGWLVTTLNITHLIQMVIQGRWLKDSSLLTIPNIEQHHLHLFRKWKPPVKGPHAKCRTSIEC 1996

  Fly  1972 -PEIVKRCTEKKIETVFDIMELEDEDRTRLLQLSDLQMADVARFCNRYPNIELNYEVVDK--DRI 2033
             ||::..|..|  |.||..| :|.|       |...:......|.:..|.|.:...|...  |.:
  Rat  1997 LPELIHACEGK--EHVFSSM-VEKE-------LQPAKTKQAWNFLSHLPVINVGISVKGSWDDSV 2051

  Fly  2034 NSGSTVNV-VVQLEREDEVT-----------------------------GPVIAPFFPQKREEGW 2068
            ...:.::: .:..::.||.|                             ...:.|.||:.::|||
  Rat  2052 EGHNELSISTLTADKRDENTWIKLHADQQYVLQVSLQRVHFEFHKVKHESHAVTPRFPKLKDEGW 2116

  Fly  2069 WVVIGDPKTNSLLSIKRL-TLQQKAKVKLDFVAP-SPGKHDYTLYYMSDSYLGCDQEYKFSIEV- 2130
            ::::|:.....|:::||: .::...:..:.|..| :||::.:|||.|||.|||.||:|...:.| 
  Rat  2117 FLILGEVDKRELVAVKRVGFVRTHHEASISFFTPEAPGRYIFTLYLMSDCYLGLDQQYDIFLNVT 2181

  Fly  2131 -GDFQSESESE 2140
             .|..::..:|
  Rat  2182 KADISTQINTE 2192

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
l(3)72AbNP_648818.3 BRR2 466..1241 CDD:224125 368/780 (47%)
DEAD 482..661 CDD:278688 97/179 (54%)
HELICc 773..859 CDD:197757 55/85 (65%)
Sec63 982..1285 CDD:280962 126/306 (41%)
DEXDc 1320..1506 CDD:214692 89/189 (47%)
DEAD 1329..1495 CDD:278688 80/169 (47%)
HELICc 1615..1694 CDD:197757 39/78 (50%)
Sec63 1811..2127 CDD:280962 112/378 (30%)
Ascc3NP_001263986.1 BRR2 478..1240 CDD:224125 362/764 (47%)
DEVH box 612..615 2/2 (100%)
DEXHc_ASCC3_2 1327..1515 CDD:350780 89/190 (47%)
BRR2 1328..2061 CDD:224125 310/750 (41%)
DEIH box 1454..1457 2/2 (100%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 1 0.900 - - E1_COG1204
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 1 1.010 - - QHG54133
OrthoDB 1 1.010 - - D154891at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0001085
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100305
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
76.730

Return to query results.
Submit another query.