DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment sff and Brsk2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_648814.3 Gene:sff / 39732 FlyBaseID:FBgn0036544 Length:861 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038957200.1 Gene:Brsk2 / 293631 RGDID:1566256 Length:757 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:819 Identity:434/819 - (52%)
Similarity:526/819 - (64%) Gaps:128/819 - (15%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     9 AENCQFVGPYRLEKTLGKGQTGLVKLGVHCVIGKKVAIKIINREKLSESVLMKVEREIAIMKLID 73
            |::.|:|||||||||||||||||||||:|||..:||||||:|||||||||||||||||||:|||:
  Rat    11 AQHAQYVGPYRLEKTLGKGQTGLVKLGIHCVTCQKVAIKIVNREKLSESVLMKVEREIAILKLIE 75

  Fly    74 HPHVLGLSDVYENKKYLYLILEHVSGGELFDYLVKKGRLTPKEARKFFRQIISALDFCHSHSICH 138
            |||||.|.|||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    76 HPHVLKLHDVYENKKYLYLVLEHVSGGELFDYLVKKGRLTPKEARKFFRQIISALDFCHSHSICH 140

  Fly   139 RDLKPENLLLDEKNNIKIADFGMASLQPAGSMLETSCGSPHYACPEVIRGEKYDGRKADVWSCGV 203
            ||||||||||||:|||:||||||||||...|:|||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   141 RDLKPENLLLDERNNIRIADFGMASLQVGDSLLETSCGSPHYACPEVIRGEKYDGRKADVWSCGV 205

  Fly   204 ILYALLVGALPFDDDNLRQLLEKVKRGVFHIPHFVPPDCQSLLRGMIEVNPDRRLTLAEINRHPW 268
            ||:|||||||||||||||||||||||||||:|||:||||||||||||||:..|||||..|.:|.|
  Rat   206 ILFALLVGALPFDDDNLRQLLEKVKRGVFHMPHFIPPDCQSLLRGMIEVDAARRLTLEHIQKHIW 270

  Fly   269 VTAGGKGELELELPMMEVVQTHVIPTATAVDPDVLNAICSLGCFKEKEKLIQELLSSSHNTEKVI 333
            . .|||.|.|.|.|:...||...:|:...:|||||:::.|||||:::.||:|:|||...|.||:|
  Rat   271 Y-IGGKNEPEPEQPIPRKVQIRSLPSLEDIDPDVLDSMHSLGCFRDRNKLLQDLLSEEENQEKMI 334

  Fly   334 YFLLLERKRRRPALEDDDEIAQKSRSELDAVDPPRKRLDTCRINGTNAPSYGQISEGSPLTPRRQ 398
            |||||:||.|.|:.||:|   ...|:|   :||||||:|                  ||:..|  
  Rat   335 YFLLLDRKERYPSHEDED---LPPRNE---IDPPRKRVD------------------SPMLNR-- 373

  Fly   399 AFNFRSYSSTRNHQRRSPTTVTSSVRS-SSYHSPTRCNSPMSSAQQ-QANAISRPSSPAAGTRHS 461
                        |.:|.|...:..|.| :...||......:..||. |:.|:...|...| ..|.
  Rat   374 ------------HGKRRPERKSMEVLSVTDGGSPVPARRAIEMAQHGQSKAVFSKSLDIA-EAHP 425

  Fly   462 TYGDRDR----SGHHSSVSRTPSHSSQKSIEGDVVVVREPRIERRDSLRQERGGGSPRDRGDCGI 522
            .:...||    ||..|.:|.:|..|              ||:....|.|     |||     ...
  Rat   426 QFSKEDRSRSISGASSGLSTSPLSS--------------PRVTPHPSPR-----GSP-----LPT 466

  Fly   523 PPGSPGGNSSGSTSASPSVHHRANSGPTIAISMFHDPDSNSVVNPNGSPMMNNSSPGMPGSPCNT 587
            |.|:|                            .|.|..:....||.:|         |.||  :
  Rat   467 PKGTP----------------------------VHTPKESPAGTPNPTP---------PSSP--S 492

  Fly   588 PGGQLWKTRLTNIKNSFLGSPRFHRRKMQVSADE--VHLTPESSPELTKRSWFGNLITTEKDETF 650
            .||..|:|||.:|||||||||||||||:||...|  .:|||||||||.|:|||||.|..||:|..
  Rat   493 VGGVPWRTRLNSIKNSFLGSPRFHRRKLQVPTPEEMSNLTPESSPELAKKSWFGNFINLEKEEQI 557

  Fly   651 TILVKGKPIATVKAHLIHAFLSMAELSHSVVSPTSFRVEYKRNGNGPVMFQRHVKFQVDISAICK 715
            .:::|.||::::||.::|||||:..|||||:|.||||.|||..| ||.:||:.|||||||:  ..
  Rat   558 FVVIKDKPLSSIKADIVHAFLSIPSLSHSVISQTSFRAEYKATG-GPAVFQKPVKFQVDIT--YT 619

  Fly   716 QGDIADM---LFALTFTLLSGNIRRFRRICEHIQSQVCSKRFPGPSSPPTVTSVTQAVSESSSCG 777
            :|..|..   ::::|||||||..|||:|:.|.||:|:.|.. ..||:        |.:|::::|.
  Rat   620 EGGEAQKENGIYSVTFTLLSGPSRRFKRVVETIQAQLLSTH-DQPSA--------QHLSDTTNCM 675

  Fly   778 SVSSERLSYKRQVIEN--DMENDSIFSYKSGNGRRASTT 814
            .|.:.|||.....:.|  |:........|:|...:|.:|
  Rat   676 EVMTGRLSKCGTPLSNFFDVIKQLFSDEKNGQAAQAPST 714

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
sffNP_648814.3 STKc_BRSK1_2 16..269 CDD:270983 225/252 (89%)
UBA_BRSK 298..350 CDD:270525 30/51 (59%)
Brsk2XP_038957200.1 STKc_BRSK1_2 18..271 CDD:270983 225/252 (89%)
UBA_BRSK 298..351 CDD:270525 30/52 (58%)

Return to query results.
Submit another query.