DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment dop and kin-4

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001261884.1 Gene:dop / 39686 FlyBaseID:FBgn0267390 Length:2139 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001255551.1 Gene:kin-4 / 178068 WormBaseID:WBGene00002192 Length:1831 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:2123 Identity:657/2123 - (30%)
Similarity:919/2123 - (43%) Gaps:656/2123 - (30%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     8 ASRPADGATGPVASSSSSTSS------NHSVSAVLGSKISTSTPQKNDEHQEQEFINQSVASEIE 66
            :|.|.|..|. .||:.|.|:|      :.|...:|....||.....:|        |::..:|..
 Worm   124 SSPPPDRRTS-FASTMSDTNSSITIPMSSSYQNLLSPMWSTMKYSSDD--------NETPPNEPS 179

  Fly    67 AMSISDSASAESSSGATATATATMSGSPVPKRHLSTANLSRIRPQSSYSARVLIFDDSDQE---- 127
            ......:.|..|||..........  |||..|.:.:     :.|..|.|.......:||.|    
 Worm   180 PRRSKSALSNRSSSDCINVPPIVF--SPVLSRPIRS-----MSPTMSMSPTFRTHHNSDSESDTG 237

  Fly   128 AAAAAAALAAASSSCNSSVKSCSGLELLPTSPAKL------SIGNDSTNGSSMMRNL-------- 178
            |.||...|.|.:||.:..|...||..::|  |.:.      ..||||::.:|.:..|        
 Worm   238 AQAAGVCLFACTSSASGLVWKGSGSLMIP--PRRSFHRPQGGGGNDSSDSNSNVERLLKRNRRRT 300

  Fly   179 ----------NLTKSSSGGLSGSSSSL--------HSRGYTALLRKISYQQHTNSLR-AVSGETS 224
                      ..|.:|:|..|.|.::|        ||....:.....|:...|:||. |....|:
 Worm   301 MAIHGVETEPGQTAASTGWTSASMTNLCRVRSSLGHSDPQLSSSSTNSFNTSTSSLHPATKSSTT 365

  Fly   225 NLLRMRHSSLGKS---APCLTGNYFRHELTAPLPVQPPGFGASPLGGHNISRSGSCAGIGLAKHH 286
            .|.....||..:|   .|.|      |..|:|:.:|.   ..||:.....|.|.|          
 Worm   366 ALSSFSTSSANRSPANRPSL------HSSTSPVTLQR---CRSPMRVPQRSTSSS---------- 411

  Fly   287 HHHHLHGVVMRGSAGGGAGSGGGS-SSGVAHHRLSLVTNSAAVAAAGGSRTHSPYSASPVDSPRL 350
              |:.      |:||.|..|.|.| .||.       :|.|..       ||:|..:.|.:.:|  
 Worm   412 --HNF------GAAGAGPSSSGSSVHSGT-------ITLSVC-------RTYSARNGSSLMAP-- 452

  Fly   351 NSPMPFAFAPIKRIASCRGVVADGRRWSVASLPS-SGYGT--TPGSSNLSSQCSSQEGLNQLAHN 412
                                |.|.||||:||||| |||||  |..:|.:|||.||.|.:.::   
 Worm   453 --------------------VQDTRRWSLASLPSTSGYGTPGTGSNSGVSSQYSSSEQIGEM--- 494

  Fly   413 IPPGVQEADAAAVAAGACCAEHLKQHCPKHCALLLAVSQKQLTPQPPKPTQLQPQKSMTAACVNC 477
                                                :.|.:::                      
 Worm   495 ------------------------------------LDQTRIS---------------------- 501

  Fly   478 CAELSVTCGGQQAGGGAANGGSSANSSGS-----SAMQVGGRMSPYFRPRSRSLSSPSRSPIVDN 537
                          |......|..:|:.|     |..|...:.:...|||||||:||.:. :.:.
 Worm   502 --------------GPVRQNSSRFDSNDSYDDMASHQQAAAQNAFLNRPRSRSLTSPMKF-LNEY 551

  Fly   538 EIAVMN--TLYKERFPKATQQMEERLKLFINEN---------KSA-------------------- 571
            .|.::|  ::||||||:|..||||||..|:.||         :||                    
 Worm   552 NIEMVNRTSVYKERFPRAKLQMEERLNAFVAENGPLSGGISQQSARDDTDRVDDLSARQSGSSSG 616

  Fly   572 --------------------ACNSFRDSQPI-------VRFVHHQVLEMARDCLHKSEAKLITSQ 609
                                ...|:.|...:       .||:|||::|:|.|||.||:..|||..
 Worm   617 LKAKDSVEEAVMRSRRSTVLEAESYADRSLLRLIGDGATRFLHHQIVEIALDCLGKSKDDLITCS 681

  Fly   610 YFYELSENLERLLVETKEK-SPEAAAELNGVIKKLLLIISRPARLLECLEFDPQEFYELLEAAEG 673
            ||.|:|:.||..|.|.:.| |||:...|:.::||||:|:||||||||||||||.|||.|||.|||
 Worm   682 YFCEMSQRLEETLNEAQMKTSPESLEYLSKLVKKLLMIVSRPARLLECLEFDPDEFYHLLEEAEG 746

  Fly   674 HAKAMPVIK----------ADIPQYIIHKLGLNRDPIAELQQELRETQQMCSEQVTVDADPLHPG 728
                  |::          .|:|||||.||||:|||:.:..:.                      
 Worm   747 ------VVREQLGSGTARVPDLPQYIIGKLGLDRDPLIDSTEH---------------------- 783

  Fly   729 GSLLLNSPLTSAAKQLSSLALDAIAMDSGSGTATPQQPPQTPVATCDTAPSFALAISQMNEEKGG 793
                                     :||...|                           :....|
 Worm   784 -------------------------VDSSENT---------------------------HATTSG 796

  Fly   794 SSSAVGGGSSSKVAGAEGITGGSAATATGSGAQQPSPQENDFDIVKLISNGAYGAVYLVKHKTTR 858
            ::||.|.||:.:....                   :|.|:|||.::|:|||||||||||:|:.||
 Worm   797 TTSAKGAGSAWQETNR-------------------APCEDDFDTIRLVSNGAYGAVYLVRHRETR 842

  Fly   859 QRFAMKKINKNNLILRNQVEQVFAERDILSFADNPFVVSMYCSFETKKHLCLVMEYVEGGDCGTL 923
            ||||:||:||..|:|||||:|||||||||:.||||||||.|.||||:::||::|||||||||..|
 Worm   843 QRFALKKMNKQTLMLRNQVDQVFAERDILTMADNPFVVSFYGSFETRQYLCMLMEYVEGGDCAAL 907

  Fly   924 LKNIGPLPADMARFYFAETVLAVEYLHSYGIVHRDLKPDNLLITALGHIKLTDFGLSKMGLMSLA 988
            ||:.|.||.::.|.|.|||:||:||||||||||||||||||||||:||||||||||||:|||:..
 Worm   908 LKSAGTLPVELVRLYVAETILAIEYLHSYGIVHRDLKPDNLLITAMGHIKLTDFGLSKIGLMNRT 972

  Fly   989 TNLYEGYIDS--ETRQFSDKQVYGTPEYIAPEVILRQGYGKPVDWWSMGIILYEFLIGCVPFFGE 1051
            |.:.||| |:  ||:||.|||:.|||||||||||||:|||||||||::||||||||:|.||||||
 Worm   973 TLVAEGY-DAVVETQQFQDKQLCGTPEYIAPEVILRRGYGKPVDWWALGIILYEFLVGIVPFFGE 1036

  Fly  1052 TTEELFAHTVNDDIEWPDSEDWPVQAEAKDIISQLLQQNPRDRLGTQSGALEMKEHEYFLGMDWN 1116
            |.|.||:..:::|:|:|: ||..:..||.|:..:||::||.:||||.:||.::..||:|:.:|:.
 Worm  1037 TPEALFSKVISEDVEYPE-EDEALPPEAADLCRRLLEKNPAERLGTLNGAAQLMAHEFFILLDFT 1100

  Fly  1117 SLLRQKAEFVPQLSHDDDTSYFDTRMDRYNHD---LGGEDT--DDTDDTPVFGSFNSYTPQYR-- 1174
            |||||||||||||.:::||||||||.|||||:   .|.|:.  .....:.:|.||::.:|::.  
 Worm  1101 SLLRQKAEFVPQLDNEEDTSYFDTRTDRYNHEAESCGEEEIVGSSAASSMMFHSFSTASPRHSIV 1165

  Fly  1175 ---KQHYSWSRHATPTSTDGAKPTGPPPLSSLPSRAQETPAATVGATSTGALPKLKSGMGSGSGS 1236
               ..|..   |...|:...||........|:.||.:..|..:.   |||..|            
 Worm  1166 SIDPAHLP---HLLSTANAAAKEIERSHSVSMSSRPETRPERSY---STGQAP------------ 1212

  Fly  1237 GSGSGSGSASHDGVVNKFLNTPQLRKLDLSSSCLKVPSTPDADYLPELLHNVTIGNDAELRMLKH 1301
                                                         |||.   .:|:|        
 Worm  1213 ---------------------------------------------PELF---KVGDD-------- 1221

  Fly  1302 YLQQPNPGATQRMQQRHSMPPNTTTIISTPATPPPTQTQATMAATPPTATVGSFSRSTPESSQTD 1366
                 |......:::|.|...:..:..|:..|     ...|..||..::|..|...|:....|..
 Worm  1222 -----NTSTAVNLRRRFSAQRHNVSTTSSSGT-----GSGTCFATAASSTDSSIDASSLPLFQPP 1276

  Fly  1367 SDDFSPQINRKRKGVC---ARDILPRFSISIEDET-ISAGSSSTENMNLPREQSPLALQHQPKSM 1427
            |          |..:.   :|..||:||||.|.|. :|......::::..|..:.::        
 Worm  1277 S----------RSSIAERGSRSPLPKFSISCEGEAGVSRSGDDHDDLDDSRNSTIVS-------- 1323

  Fly  1428 DGSTSGS--SVKHHRSRSIVKSASALGLSLMTSLDNSQL------AAQLCGIQSPG--------- 1475
            ..|:.|:  :|:..|..|....||.|.| ::.|:.:||.      |.:.|.:..|.         
 Worm  1324 TASSGGADETVRFRRQSSGRTPASQLQL-VIPSISSSQSSQSAEPARETCYVMYPSGPSTSVGSQ 1387

  Fly  1476 ---GGGNGSSTASSRDTS-----PCRELSPLV----------TNLKPPIIIRRGPRGFGFTVHTI 1522
               ||.:.||.:||.|..     |.....||.          |.....|.||:||.|||||:.::
 Worm  1388 LSPGGASVSSASSSNDVGSPHPLPLHHEHPLTSHDSSAASSSTAPSKTITIRKGPFGFGFTLKSV 1452

  Fly  1523 RVYYGD-TDFYTMHHLVMAVDEGSPAFEAGLRPADLITHVNGEAVQGLFHTQVLQLLLSGGEHVT 1586
            |||.|: :::||:.|:|.||.||||||.|.|:..|:||||||..|..|.|.|::..||:.|..:.
 Worm  1453 RVYLGEHSEYYTIEHIVTAVVEGSPAFHANLQAEDMITHVNGHPVHNLTHPQLMHRLLANGNELI 1517

  Fly  1587 LRATPLEHTSIQSGGRKRDLMQSKLAKKGVNRQKKQTKREHDKKRKTS-LFRRISSKRANAEMQQ 1650
            ||..||.:|||:.|..:|.:  .|:|:|...|.:::......|.||.| |.||:|.|||..::  
 Worm  1518 LRLVPLANTSIREGAARRTV--GKMARKKPKRPQRRVVPLEKKTRKPSALLRRLSGKRATNDI-- 1578

  Fly  1651 YSAGTSSPTTPSARNLSPLDSSYHSSCC------QSAANSSSQSTSPSSSS-------------- 1695
             ..|:||    ..:...|..:|....|.      .|..:....|..||:||              
 Worm  1579 -VPGSSS----QKQAFMPRSASSQDGCILTHLPGTSKISQQEASQEPSTSSQGMVRRSVNEIETN 1638

  Fly  1696 -PNTPTGSSGS----NHGGNAGSVAVAPSALSVQLPSAPPPTQLVLLPHVGAVVGSNPTSVGNVP 1755
             |::...:|.|    :|..:..|||.||:.    |||..|       .::..:..|:|:|     
 Worm  1639 RPSSLRSTSNSHHHHHHPASTSSVASAPAT----LPSTTP-------SNLSRMASSSPSS----- 1687

  Fly  1756 VSPTGVVPQLYQRPSTLHGLKHKLHAATAVIAGGGNANNPAGGLKTLHTTNNNSLPNRRKSVGHI 1820
                                          .|.....::||.      |::..|:..::..  .|
 Worm  1688 ------------------------------SASNSGTSSPAA------TSSGISIVKQKSQ--SI 1714

  Fly  1821 PLSPLA-----RTPSPS-----PLPSSPTRSPSPLAFPLVGHQPGASNTTQ-------------- 1861
            .:||||     |:||||     |..||.|..|..:..|.....|..|...|              
 Worm  1715 AVSPLARDTRMRSPSPSHLHHRPASSSYTTRPDGVVTPATSSSPNNSGFVQDLISSRQSPNLSAR 1779

  Fly  1862 --SYSPGSTLPTLQTAVNANTKKAGFARTKSAEPSSPLLRRAL 1902
              ||.|.:|...:......:.:  ||  :.:|:.:..||.|.|
 Worm  1780 RRSYQPTTTTSMIVPPTTHHLR--GF--SAAAQSAQDLLNRLL 1818

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
dopNP_001261884.1 DUF1908 344..702 CDD:286070 133/434 (31%)
STKc_MAST 834..1115 CDD:270760 189/282 (67%)
S_TKc 835..1110 CDD:214567 187/276 (68%)
PDZ_signaling 1506..1587 CDD:238492 42/81 (52%)
kin-4NP_001255551.1 DUF1908 455..779 CDD:286070 131/405 (32%)
STKc_MAST 818..1099 CDD:270760 189/282 (67%)
S_TKc 819..1094 CDD:214567 187/276 (68%)
PDZ_signaling 1434..1521 CDD:238492 44/86 (51%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C160167198
Domainoid 1 1.000 391 1.000 Domainoid score I398
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 1 1.050 655 1.000 Inparanoid score I413
Isobase 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0001156
OrthoInspector 1 1.000 - - oto18360
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100724
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR24356
Phylome 00.000 Not matched by this tool.
RoundUp 1 1.030 - avgDist Average_Evolutionary_Distance R3124
SonicParanoid 1 1.000 - - X479
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1010.010

Return to query results.
Submit another query.