Protein Alignment Cep135 and Root

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001189108.1
• Gene: Cep135 / 39647
• FlyBaseID: FBgn0036480
• Length: 1065
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_651216.2
• Gene: Root / 42860
• FlyBaseID: FBgn0039152
• Length: 2048
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1217
• Identity: 257/1217 - (21%)
• Similarity: 462/1217 - (37%)
• Gaps: 295/1217 - (24%)

  Fly    45 CLRDTKKKV---------AELLEEKTCWELGVEPYKCD-----NSRL---LAECNELHLQFLRDR 92
            |.||....|         |||     |.:|..|..:|:     ||.|   |.|.|..:.....|.
  Fly   196 CSRDYVDDVLVTGGGAGAAEL-----CRKLEEEHQRCEQIVAQNSALRQQLEESNRTNEALTNDL 255

  Fly    93 E----DY-----ELRLCESERKIRNLELDKQHLQSHNDGLQRQLDALLTKQMVSSVTN--KKATA 146
            :    |:     ||.:.|.|.|.........:...||..|:...:.:..|:....:..  |...|
  Fly   256 QKLTNDWASLRDELLIKEDEFKEEEQAFKDYYNSEHNRLLKMWREVVAVKRSFKEMQTAMKAEVA 320

  Fly   147 GIGRQTKKPFITTVRSGIAMPTTLGTSSSALKCTKCNAGVFQKTTTTTKDGVTVTQTSGQEELDK 211
            .:|::     |..|...|.     |::::.       |...|:......|.:..:|.|.    |:
  Fly   321 KMGQE-----INCVGKDIN-----GSNATV-------AFAVQQAKRAADDELKQSQRSN----DE 364

  Fly   212 MQNDLTAAGEQLEFFKRKVEARNR-------EIRRLNDMLAGGRPLAALAKDCCYKD-------- 261
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  Fly   365 LQNQLATLKVQYESARHEIMERDQRLLELMNQLKKLEDRCAQAESQAALASR--YSDEIERLNNS 427

  Fly   262 ----VGALSQDIDLLQRE-------------------------------------KSDLMMQVR- 284
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  Fly   428 MREIAQAVVQDAENADREADAEVTGGVMQHMHLTRDAASVVGGAGGAGSTAGGGGKSPRRNSTRA 492

  Fly   285 --EFQDKMHDAMQRA-----LSSEEDKIKLQTQLEELKEAALQVE-------------QQANAEI 329
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  Fly   493 SQAFAEGTISAVQAALHKYQLALHDMQVKFQNTSETLRTTKAQLETSEGTKQLLTTKMQQLTEKL 557

  Fly   330 DAKESELRQLQLE---LKKKGKDHRLTGGFASNQSD--KHNLNERLNLLTRREEELQATNEKHKK 389
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  Fly   558 DSSNSKLSELLQERESLQRGLDDIRV----QKQQSEMGRADINSAFENLSSDYEKMQLNCGKLQK 618

  Fly   390 KIQKMQ----AKILELQKELKDQN----------------KHSNVTLDEEKIRLSSERDFFQKEY 434
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  Fly   619 RIDSMEEDKKAVELEIQRILKDKNITELNLRSEEDRSSRLREETISLREELNRVSLNRDLLEQQR 683

  Fly   435 LRLMSKTGSESEIAFLHAQIKSKDEELKALRSELFHGGKQQFSPQKSVQYETLPPPTASSITSTV 499
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  Fly   684 IE------SDNLINLLEKQKSDLEYDLDKLLLE---------KCDLQEKHEKLSNNSCS--TSDE 731

  Fly   500 TSNTSDCVQAA-----IARVERERDCART-ELERVRCERDTLREKQLSTVQLHADE-LQALRLRN 557
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  Fly   732 LKSVQNCLQEAQEERKKLRIQSVDQCNEIGELKKELAILDKAR-LELETDNLSAGEKLKCLQLEK 795

  Fly   558 EELNDRLRQMERDNRELNSARLPTETNLVLLKEDLLQMRQRVASMQTEIDQLKTENDQITMLNDQ 622
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  Fly   796 EKILQDLACVTRDRGDIHNQLTAMCRKKEALNEELMRTRQR-------LEQTTETNSR---LNRN 850

  Fly   623 NERIIADYQSKLLVA---ERQRQSADVRASTLDSSRESNRSEVTQLRMDLGALRQTYISLEHEKD 684
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  Fly   851 LEEMVKDVEEKQVVIDLHEKDTHRLNELLAALRSEKESLESVLFDTNTSLEATEERRSQLERDLQ 915

  Fly   685 TLLHQLDTKTERVYKLEYELKDCKEKR--------NALEQNVKDLEDQLRKL---ANRNRQRDSE 738
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  Fly   916 EALVREESLKNHVARLQKELEQCQRKAQETKTQLLNAARAAESDFNQKIANLQACAEEAAKRHGE 980

  Fly   739 --LTETSTESKTLRQQIVALKASRDEAIAENRRLMDKLSDAQVEARTLQKKLTDSELQVANMKQQ 801
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  Fly   981 EILQLRNALEKRMQQALQALQTAKDDEI---EKLQERLATLQAHLESLVQQHEEALIRAESEKQQ 1042

  Fly   802 LHKYVQEVKKAEDLLI-----QKVSSKFKEKERDDMLDQYHCLTQGQATLEGNNQSLECEAVEFR 861
            .            |||     |.|:.:.:...||        |...|.:|:.:.:.......:.|
  Fly  1043 A------------LLIAHRDKQAVAERLEAVSRD--------LKTEQESLDRSRREANARDEKQR 1087

  Fly   862 RQICELECEVHSLK-----EQLQLRQCALHDMEVQLTAARASVRCLERELENARDDIRVQKVDLE 921
            ..|.:|:.|:..::     .:::|.:| :...|:||::.|.....|.|..|..:.:||:::..:|
  Fly  1088 AAIAQLKDEMVQMRTKEEEHKIKLEEC-IRKQELQLSSLREERESLCRVSEELKMEIRLKEDRME 1151

  Fly   922 A----------------------RKELCD------KLDVERSKL---NAELND-VNEIRKKLEKQ 954
            :                      ||||.|      ..::||.|.   |.||.| |..:.....:|
  Fly  1152 STNNELQDALRKSKEGEGFIDSLRKELTDCRRQLADSNIERDKYSGSNKELRDHVKRVESAKREQ 1216

  Fly   955 CEKLRDELQQSLAI----NQVTNETTDLMLGRLHNDQQHQEDDDIRSKHEMDRLQRQLQQTLDQL 1015
            ...:.:.||:...:    |.:.||.|     ||....:..|:...::..:::..:.|||:...:.
  Fly  1217 ARAIEEALQKISNLEDTKNSLENERT-----RLSTILKETENHFTKTTQDLNATKAQLQKAQVEF 1276

  Fly  1016 QE-----ERVRCR--HHEELAEKWEQQVRDLRRNLADDRYNQARTRE 1055
            .:     :.::|:  ...||.|:.:|::..:::.|:|...|...||:
  Fly  1277 AQKDEGGKELQCKLVAEVELKERAQQELCQIKKQLSDLEANLCATRQ 1323

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Cep135	NP_001189108.1	DR0291	206..>346	CDD:441187	43/219 (20%)
		SMC_prok_B	286..1044	CDD:274008	188/876 (21%)
Root	NP_651216.2	Rootletin	110..330	CDD:464459	32/143 (22%)
		Gp58	<336..>604	CDD:369586	54/284 (19%)
		SMC_prok_B	503..1314	CDD:274008	188/871 (22%)
		SMC_prok_B	991..>1779	CDD:274008	75/362 (21%)