DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Frl and Fmnl3

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_729954.2 Gene:Frl / 39561 FlyBaseID:FBgn0267795 Length:1183 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001386695.1 Gene:Fmnl3 / 300225 RGDID:1583854 Length:1087 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1123 Identity:481/1123 - (42%)
Similarity:678/1123 - (60%) Gaps:149/1123 - (13%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    68 PSLRSRSQQPMPTTDELDRRFAKVLASMDLPPDKAKLLRNYDDEKKWDMICDQEMVQAKDPPSHY 132
            |.|....:.|||...||:.|||.||:||:||||||:|||.||:|||||:|||||..|.|:||..|
  Rat    18 PLLLPPGKTPMPEPCELEERFALVLSSMNLPPDKARLLRQYDNEKKWDLICDQERFQVKNPPHTY 82

  Fly   133 LSKLRTYLDPKASRSHRLYLFYFLCQKRKMVGESTSTQVLRDLEISLRTNHIEWVKEFLDDTNQG 197
            :.||:::|||..:|.          :.|:.|.|  ||:|||:||||||||||.||:|||:|.|:|
  Rat    83 IQKLQSFLDPNVTRK----------KFRRRVQE--STKVLRELEISLRTNHIGWVREFLNDENKG 135

  Fly   198 LDALVDYLSFRLQMMRHEQRLQGVLCASEERLNLTNGGDGG-EIVMGNSSSVSPGGGGGLLSHGN 261
            ||.|||||||....:..:  .:|          |.:|.||. :.:...|.|:..      |...|
  Rat   136 LDVLVDYLSFAQCSVMFD--FEG----------LESGDDGAFDKLRSWSRSIED------LQPPN 182

  Fly   262 STGHGLANGTLDSRQQHTMSYGFLRPTIADALDSPSLK--RRSRHIAKLNMGAATDDIHVSIMCL 324
            :......|....|.:|..:.|..|          |..:  :.||.:::      .||:||.|:||
  Rat   183 ALSAPFTNSLARSARQSVLRYSTL----------PGRRALKNSRLVSQ------KDDVHVCILCL 231

  Fly   325 RAIMNNKYGFNMVIQHREAINCIALSLIHKSLRTKALVLELLAAICLVKGGHEIILGSFDNFKDV 389
            |||||.:||||:|:.|..|:|.|||||.:|:.||||||||||||:|||:|||||||.:|||||:|
  Rat   232 RAIMNYQYGFNLVMSHPHAVNEIALSLNNKNPRTKALVLELLAAVCLVRGGHEIILAAFDNFKEV 296

  Fly   390 CQEKRRFQTLMEYFMNFEAFNIDFMVACMQFMNIVVHSVEDMNYRVHLQYEFTALGLDKYLERIR 454
            |:|..||:.|||||.| |..||||:||||||:|||||||||||:|||||||||.|||:::|::.|
  Rat   297 CKELHRFEKLMEYFRN-EDSNIDFLVACMQFINIVVHSVEDMNFRVHLQYEFTKLGLEEFLQKSR 360

  Fly   455 LTESEELKVQISAYLDNVFDVAALMEDSETKTSALERVQELEDQL----EREIDRNSEFLYKYAE 515
            .||||:|:|||.|||||||||..|:||:|||..|||:|:|||:.:    |:.:|..:|.:.:.||
  Rat   361 HTESEKLQVQIQAYLDNVFDVGGLLEDAETKNVALEKVEELEEHVSHLTEKLLDLENENMMRVAE 425

  Fly   516 LESESLTLKTEREQLAMIRQKLEEELTVMQRMLQHNEQELKKRDTLLHTKNMELQTLSRSLPRSA 580
            ||.:.|..:.|.|.:....:....::..::|:::..|:..::|        ..|:..:|||  .:
  Rat   426 LEKQLLQREKELESIKETYENTSNQVHTLRRLIKEKEEAFQRR--------CHLEPSARSL--ES 480

  Fly   581 SSGDGSLANGG---LMAGSTSGAASLTLPPPPPPMPASPTASSAAPPPPPPPAPPAPPPPPGFSP 642
            ..|..:||..|   |..|||.....|..|.|    ||..|.     |.|||||||.|||||    
  Rat   481 MGGSEALARVGPTELTEGSTPSDLDLLAPAP----PAEETL-----PLPPPPAPPLPPPPP---- 532

  Fly   643 LGSPSGSLASTAPSPPHAPPMLSSFQPPPPPVAGFMPAPD-----GAMTIKRKVPTKYKLPTLNW 702
                        |.|...        ||.||:.|..|:..     .|:.||:.:.||::||..||
  Rat   533 ------------PLPDKC--------PPAPPLPGAAPSVVLTVGLSAIRIKKPIKTKFRLPVFNW 577

  Fly   703 IALKPNQVRGTIFNELDDEKIFKQIDFNEFEERFKIGIGGALRNGSNGTEVDGSLQSSKRF-KRP 766
            .||||||:.||:|:|||||||.:.:|.::|||.||        ..:.|..:|.....:|.. |..
  Rat   578 TALKPNQINGTVFSELDDEKILEDLDLDKFEELFK--------TKAQGPALDLICSKNKTAQKAA 634

  Fly   767 DNVSLLEHTRLRNIAISRRKLGMPIDDVIAAIHSLDLKKLSLENVELLQKMVPTDAEVKSYKEYI 831
            ..|:|||..|.:|:||:.||.|...:::..|||:.||:.|.::.||.|.:.:||:||||..::|.
  Rat   635 SKVTLLEANRAKNLAITLRKAGRTAEEICRAIHTFDLQTLPVDFVECLMRFLPTEAEVKLLRQYE 699

  Fly   832 IERKDQQLLTEEDKFMLQLSRVERISSKLAIMNYMGNFVDSVHLISPQVQSIAGASTSLKQSRKF 896
            .||:..:.|..||:|||..|:|||::.::|.|.::|||.|::.:::||:.:|..||.|:|.|:|.
  Rat   700 RERQPLEELAAEDRFMLLFSKVERLTQRMAGMAFLGNFQDNLQMLTPQLNAIIAASASVKSSQKL 764

  Fly   897 KAVLEIVLAFGNYLNSNKRGPAYGFKLQSLDTLIDTKSTDKRSSLLHYIVATIRAKFPELLNFES 961
            |.:|||:||.|||:||:|||..|||||||||.|:||||||::.:|||:|..|::.|:|||.||..
  Rat   765 KQMLEIILALGNYMNSSKRGAVYGFKLQSLDLLLDTKSTDRKMTLLHFIALTVKEKYPELANFWQ 829

  Fly   962 ELYGTDKAASVALENVVADVQELEKGMDLVRKEAELRVKGAQTHILRDFLNNSEDKLKKIKSDLR 1026
            ||:..:|||:|:||||:.||:||.:||:|:|:|..:.    ...:||:||:.:|.||.|::.|.:
  Rat   830 ELHFVEKAAAVSLENVLLDVKELGRGMELIRRECSIH----DNSVLRNFLSTNEGKLDKLQRDAK 890

  Fly  1027 HAQEAFKECVEYFGDSSRNADAAAFFALIVRFTRAFKQHDQENEQRLRLEKAAALAASKKENDQV 1091
            .|:||:...|.|||:|.:....:.||.:.|||.|::|:.:||||.|             |:.::|
  Rat   891 TAEEAYNAVVRYFGESPKTTPPSVFFPVFVRFIRSYKEAEQENEAR-------------KKQEEV 942

  Fly  1092 LMRNKVNQKKQQL----PSNGALSLQEAVINELKSKAHSVREKKLLQQDEVY---NGALEDILLG 1149
            :...::.|:.::|    ||......|:.:|.||       |.::..:...||   :||:|||:.|
  Rat   943 MREKQLAQEAKKLDAKTPSQRNKWQQQELIAEL-------RRRQAKEHRPVYEGKDGAIEDIITG 1000

  Fly  1150 LKSEPYRRADAVRRSQRR 1167
            ..    .....|..||.|
  Rat  1001 FN----HHQPMVTHSQAR 1014

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
FrlNP_729954.2 Drf_GBD 77..371 CDD:461886 134/296 (45%)
Drf_FH3 374..567 CDD:461885 102/196 (52%)
FH2 687..1063 CDD:396655 171/376 (45%)
Fmnl3NP_001386695.1 Drf_GBD 27..278 CDD:461886 134/296 (45%)
Drf_FH3 281..472 CDD:461885 102/199 (51%)
FH2 562..927 CDD:396655 171/376 (45%)

Return to query results.
Submit another query.