DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Neurl4 and Neurl4

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_648688.2 Gene:Neurl4 / 39558 FlyBaseID:FBgn0283503 Length:1780 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001401280.1 Gene:Neurl4 / 303248 RGDID:1308056 Length:1563 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1909 Identity:635/1909 - (33%)
Similarity:873/1909 - (45%) Gaps:538/1909 - (28%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    10 HTRCGRSIRLYNNNRMAQRSM--RDFSHALVFSAEPLEDDVLFEVVIEKKNTYWGGSIEIGVTAE 72
            |.|.||.:.|....|.|:|..  ::|:|.||.|.|||.|..:|.|.|::|...|.|||||||||.
  Rat    47 HPRTGRLVSLSACGRTARRQQPGQEFNHGLVLSREPLRDGRVFTVRIDRKVNSWSGSIEIGVTAL 111

  Fly    73 SPDDLELVACATAMRNGTWVMSGIDVRKDGRRLFEFYGTDLETLNENDRVGVMRTSGNDLVFYVN 137
            .|..|:..:.||.::.|:||:||..|.:|||.:.|.||.||:.|.|.|||||.||:..:|..:||
  Rat   112 DPSVLDFPSSATGLKGGSWVVSGCSVLRDGRSVLEEYGQDLDQLVEGDRVGVERTATGELRLWVN 176

  Fly   138 GESQGVAAKNMPKPLWALVDLYGRCVQVSLCPRDG------------------------SGSGEL 178
            |...||||..:|..:||:|||||:|.|:::.|.:.                        |..|..
  Rat   177 GRDCGVAATGLPARVWAVVDLYGKCTQITVLPPEPGFSPSTPISTPPLEPLAPPEDSALSEQGTS 241

  Fly   179 LD-----SPLQ------------------QPLQQVVQN----------LDVAMNVNIVVDSDAWM 210
            :|     ||.|                  ..|.:||.|          |:|:::.....|.   :
  Rat   242 VDEAFMVSPAQARPETFPNSLDSHNDFASMELSEVVSNAILSAYNGGLLNVSLSSPPAADG---L 303

  Fly   211 QGNGSVSG----ADDRLCFHTRCGSLVKLSPNFRSAERRRPLDEFNNGVVMTHRPLRDNELFEIR 271
            ..:||.:.    ::|.|.||.:||:|:|||.|.::|||||||||||||||||:|||||||:||||
  Rat   304 ASSGSATSPILTSNDALLFHEKCGTLIKLSNNNKTAERRRPLDEFNNGVVMTNRPLRDNEMFEIR 368

  Fly   272 IDKLVDKWSGSIEVGVTTHNPAVLHFPATMTNMRSGTIMMSGCGILTNGKGTRRQYGEFNLDELR 336
            |||||||||||||:|||||||..|.:||||||::||||||||||||||||||||:|.||:||||:
  Rat   369 IDKLVDKWSGSIEIGVTTHNPNSLEYPATMTNLQSGTIMMSGCGILTNGKGTRREYCEFSLDELQ 433

  Fly   337 EGDRVGMMRKANGNLHNYINGQDQGVAATRAPSTLWGVIDLYGMTIKVTIVDRDEREQQNLVTRR 401
            |||.:|:.||:|..||.:|||.|||||....|..::||:|||||.:|||||..:....:   .||
  Rat   434 EGDHIGLTRKSNSALHFFINGIDQGVATPLTPPVVYGVVDLYGMAVKVTIVHNNNHSDR---LRR 495

  Fly   402 NNIVAGMTACSSGAGAQHTQHQQHSGTPTLSLLSPESEMNAAGAAGGLSETISSTRAIARNDDRL 466
            ||.:                         |..||||..:..|..|.            :...:||
  Rat   496 NNAI-------------------------LRALSPEGALRRAAPAA------------SAEPERL 523

  Fly   467 TFHHICGTHATVTQSGRTALRPNAADDFNNGVVLTRRPLRPNELFQVRLERVVTKWAGSVEMGVT 531
            .||..||..|.:|..|||||||:|.||||:||||:.|.||..|:||||::::|.|||||:|:|||
  Rat   524 LFHPNCGQKAAITHEGRTALRPHATDDFNHGVVLSSRALRDGEVFQVRIDKMVDKWAGSIEIGVT 588

  Fly   532 THSADELDFPFTMTNVRSGTWMMTGNGVMQNGVTVIEQYGQNLDRLQVGDRVGVVRKDDGTLHFW 596
            ||:...|..|.||||:|||||||||||||.||.|::::||.|||||:.||.|||||::||||||:
  Rat   589 THNPAYLQLPSTMTNLRSGTWMMTGNGVMHNGTTILDEYGHNLDRLKAGDTVGVVRREDGTLHFF 653

  Fly   597 VNGVDQGPAANNVPERVYGVIDLYGQAAQASIVDTSE---CGSP-DTGNSTISNTTLYSEV---P 654
            |||:.|||||.|||..||.|:|||||||||:|||..|   ...| ..||:.:|.::..|.|   .
  Rat   654 VNGMTQGPAAWNVPPGVYAVVDLYGQAAQATIVDDVEVPPVSEPLPEGNNQMSPSSPASAVGGSD 718

  Fly   655 LRFHSIHGANAGISNSGLTASRPNSLAEFNDAIVFSNRPLRQRELFEVELETMVRHWSGNIEIGV 719
            ||||.:||:||.|:|.|.||.|.|..:|||||||.|||.||..||||:.::.||..|||:||.||
  Rat   719 LRFHQLHGSNAVITNGGRTALRHNCRSEFNDAIVISNRALRDGELFEIVIQKMVDRWSGSIEAGV 783

  Fly   720 TGTRPEDIQLAPNATDLEASDTIILCGPMIFHNRKTIRTNILLDLDTLGPSTRVGVMR--NGDFI 782
            |..||||::.....||:: .||.:|.|..|..:..|:|.|...|||.||...|:|:||  .|| :
  Rat   784 TAIRPEDLEFPNTMTDID-YDTWMLSGTAIMQDGNTMRNNYGCDLDALGTGARIGMMRTAKGD-L 846

  Fly   783 HFFVDGMDQGPACECHAP--NIWAIIDLYGQCAQVSLTQTQLDIRAPYATSENSQSCQATSVIQH 845
            |:|::|.|||.||....|  .::|::||||||.|||:|.....:....|||  :.:.:.:..:..
  Rat   847 HYFINGQDQGAACSGLPPGKEVYAVVDLYGQCVQVSITNATGPMDNSLATS--NTATEKSFPLHS 909

  Fly   846 PAMETKHRWTCVSG-NVSLTKDWTEASRFTGAAAPLSHCLVFSEHPLSVGSPFEIKLTSVNSMFA 909
            |.....||:....| ||:|.:|.|.|.|..|.|    |.||||...|.....||:|:..::..:|
  Rat   910 PVAGVAHRFHSTCGKNVTLEEDGTRAVRVAGYA----HGLVFSTKELKAEEVFEVKVEELDEKWA 970

  Fly   910 GCLSIGVTDLNLSD----ESVRKKLPTSIRRI-PANVWYVSGNEVCFNSSCLQRSL--ASLEWLR 967
            |.|.:|:|.|...|    ......||.|:..: ....|.||..|| .....|||..  .:||.|.
  Rat   971 GSLRLGLTTLAPEDMGPGAGSGPGLPPSLPELRTKTTWMVSSCEV-RRDGHLQRMNYGRNLERLG 1034

  Fly   968 VDDRITLER-VENSLNILLNSENVNIHFHNVPNDVYVVAELRGSTMGIQVISAQGPASPLRPCSL 1031
            |..|:.:.| .:::::||::.|::......:..:|:.|.:|.|....:.::|           |.
  Rat  1035 VGSRVGIRRCADDTMHILVDGEDMGPAATGIAKNVWAVLDLYGPVRSVAIVS-----------ST 1088

  Fly  1032 RLQDSMDFGVDPLNKQDSSMLESIDSE------------------ALNYEFLDVSQKNARLSDDR 1078
            ||::..  |..|.:....:..|..:.|                  ||  |||:...||..||:..
  Rat  1089 RLEEPE--GTQPPSPSSDTGSEGEEDEEGEEHGLRGQNQVGVMPTAL--EFLENHGKNILLSNGN 1149

  Fly  1079 RSVTRIKSYNQSIVCLNKPLCKGESISIKVDALNNKWKGTVGLGVLSASPQTV--PISLLDFKRS 1141
            |:.||:.||||.||.:::||.....:.:::|.||.:|..::.|||::..|:.:  |.|....||:
  Rat  1150 RTATRVASYNQGIVVISQPLVPHMLVQVRIDFLNRQWTSSLVLGVITCPPERLNFPASACALKRA 1214

  Fly  1142 CWLATHDYVNINGQVMPSKYGDALEQIQVGTVITLTLTHAGMLIIMIGSTNLEDLASGLPNHVYP 1206
            .||.....|..||..:..|:|..|:....||::.|.|..:|.|.:.|...:.......:|...:.
  Rat  1215 AWLLRGRGVFHNGLKICEKFGPNLDTCPEGTILGLRLDSSGGLHLHINGVDQGVAVPDVPQPCHA 1279

  Fly  1207 VFDVYGKCEKITLIT---GNDAGRTGNANGTPILEAPEALELDNGMPQQCEKAHLEMHEKEKDTE 1268
            :.|:||:||::|:::   |..:|:|....|                  ..|||.           
  Rat  1280 LVDLYGQCEQVTIVSPDPGTASGKTAGTQG------------------DMEKAD----------- 1315

  Fly  1269 QVCESGPSTSGAPSNAMTRSVMESVSENLLLNISIKNRTLEQQRNELGGSSSTCCLRESLQLQHN 1333
                            |...:.|||                                        
  Rat  1316 ----------------MVDGIKESV---------------------------------------- 1324

  Fly  1334 TNLNIQRSQSTQRFQNSLNTSATAAGSSGTSGCTANTQHLSNSGVYDTNKEYDDLPNPPNPLVNS 1398
                                            |.                      .||      
  Rat  1325 --------------------------------CW----------------------GPP------ 1329

  Fly  1399 VDEASGAITSVSTTIDHSENNAEALELSASNEREMSGEPALNDNVLEDDEIDYMNHLLLLQQLQQ 1463
                                                                             
  Rat  1330 ----------------------------------------------------------------- 1329

  Fly  1464 NEYTRHHLMPDQASLLNLDLPSLNSMESDTNSVGQTRPSGGTDSLRSTATGASVEQNDCEYLRQV 1528
                                |:.:.::|                              |||....
  Rat  1330 --------------------PAASPLKS------------------------------CEYHALC 1344

  Fly  1529 RRFCASLVLPQAFFDSRLEP----VCFCLKCSGPSIGGNGDKLE--------------GWVYFKL 1575
            .||...|:||:.:|   :.|    :|:|..|...    .||:..              ||..|.|
  Rat  1345 SRFQELLLLPEDYF---MPPPKRSLCYCESCRKL----RGDEAHRRRGEPPREYALPFGWCRFNL 1402

  Fly  1576 NQQTVNV-LSTSTSTASAGGGASSATAPQVHFDLNGDWLPFYYMTRVDKIRAILDRGQ------- 1632
            .   ||. |...|.|..                    |...|:.:.|..:|.:||||:       
  Rat  1403 R---VNPHLEAGTLTKK--------------------WHMAYHGSSVAVVRRVLDRGELGAGTTS 1444

  Fly  1633 ---PLPLETDPD---EEP---AAAALKDEPGTRL---ELYYSPNATVIEPVLPQHHFASEQGLHR 1685
               ..||:.:|.   |||   .|...:::|...|   .|.|:...|:...|  |......|..|:
  Rat  1445 ILSCRPLKGEPGVGFEEPGENCAPPREEQPPAVLLSPSLQYAGAETLASKV--QFRDPKSQRTHQ 1507

  Fly  1686 ISTSFEVYVRRQSISGVTTGKAAAEAKRRSLGSTDHDHGGTGQGADGVGVTPSATLNE-SSVHLL 1749
            ...:|:|.||..|   .|.|                              .|||.|.| ...|..
  Rat  1508 AQVAFQVCVRPGS---YTPG------------------------------PPSAALRELPDQHFS 1539

  Fly  1750 -NDLCWFTKEAGACIINALIIKLD 1772
             ::|.|.|||.||.::.||:::::
  Rat  1540 PSELEWVTKEKGATLLYALLVRVE 1563

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Neurl4NP_648688.2 SPRY_NHR_like 8..168 CDD:293945 76/159 (48%)
SPRY_NHR_like 225..387 CDD:293945 119/161 (74%)
SPRY_NHR_like 467..629 CDD:293945 107/161 (66%)
SPRY_NHR_like 656..818 CDD:293945 84/165 (51%)
SPRY_NHR_like 854..1016 CDD:293945 50/170 (29%)
SPRY_NHR_like 1063..1220 CDD:293945 52/158 (33%)
Neurl4NP_001401280.1 SPRY_NHR_like 45..207 CDD:293945 76/161 (47%)
SPRY_NHR_like 322..484 CDD:293945 81/161 (50%)
SPRY_NHR_like 525..686 CDD:293945 103/164 (63%)
SPRY_NHR_like 720..884 CDD:293945 73/167 (44%)
SPRY_NHR_like 917..1085 CDD:293945 46/175 (26%)
SPRY_NHR_like 1134..1293 CDD:293945 41/163 (25%)

Return to query results.
Submit another query.