DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Hsp110 and Hspa4l

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001189103.1 Gene:Hsp110 / 39557 FlyBaseID:FBgn0026418 Length:836 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001099898.2 Gene:Hspa4l / 294993 RGDID:1306528 Length:838 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:858 Identity:368/858 - (42%)
Similarity:535/858 - (62%) Gaps:42/858 - (4%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MSVIGIDFGNESCYVAAARSGGIETLANDYSLRATPSFVAFDGKKRIIGVAAKNQQVTNMKNTVG 65
            |||:|||.|..:||:|.||||||||:||:||.|.||:.::...:.|.||.|||:|.|||::||:.
  Rat     1 MSVVGIDLGFLNCYIAVARSGGIETIANEYSDRCTPACISLGSRTRAIGNAAKSQIVTNVRNTIH 65

  Fly    66 GFKRLLGRKFNDPHVQHELTSIPARVEARGDGSIGIKVNYLGEDQHFGPEQLTAMLFTKLKETSA 130
            |||:|.||.|:||.||.|...:|..::...:||.|:||.||.|::.|..||:|.||..||||||.
  Rat    66 GFKKLHGRSFDDPIVQTERIRLPYELQKMPNGSAGVKVRYLEEERPFAIEQVTGMLLAKLKETSE 130

  Fly   131 AAMQTQVNDCVIACPVFFTNAERKALLDAAQIAGLNVLRLMNETTATALAYGFYKNDL--FEDKP 193
            .|::..|.||||:.|.|||:|||::::.|||:||||.|||||||||.|||||.||.||  .::||
  Rat   131 NALKKPVADCVISIPSFFTDAERRSVMAAAQVAGLNCLRLMNETTAVALAYGIYKQDLPSLDEKP 195

  Fly   194 RNVIFVDFGHSSLQASACAFTKGKLKMLASTWD-QIGGRDIDLALGDYFAKEFQERYKINAKTNA 257
            |||:|:|.|||:.|.|.|||.|||||:||:|:| .:|||:.|.||.|||..||:.:||||.|.|:
  Rat   196 RNVVFIDMGHSAYQVSVCAFNKGKLKVLATTFDPYLGGRNFDEALVDYFCDEFKAKYKINVKENS 260

  Fly   258 RANLRLLTEIEKLKKQMSANSTKLPLNIECFLDDIDVSSSMQRSQMEELCAPVLQRVEQTFKRLL 322
            ||.|||..|.|||||.||||::.||||||||::|:||||.|.|:|.|:|||.:|.|||...|.::
  Rat   261 RALLRLYQECEKLKKLMSANASDLPLNIECFMNDLDVSSKMNRAQFEQLCASLLARVEPPLKAVM 325

  Fly   323 AESKLQLDDIHSVEIVGGSSRIPSVKQLIEQVFNKPASTTLNQDEAVSRGAALQCAIMSPAVRVR 387
            .::.||.:||:|:|||||::|||:||:.:.:.|.|..|||||.||||:||.||||||:|||.:||
  Rat   326 DQANLQREDINSIEIVGGATRIPAVKEQVTRFFLKDISTTLNADEAVARGCALQCAILSPAFKVR 390

  Fly   388 EFGVTDIQNYAVKVLWDSEGSAAPGEIEIFPQYHASPFSRLLTINRKGPFNVSIVYG--QQVPYP 450
            ||.:||:..|:|.:.|.:......||.|:|.:.|.:|||:::|.::|.||.:...|.  .:||||
  Rat   391 EFSITDLVPYSVTLSWKTSFEEGTGECEVFSKNHPAPFSKVITFHKKEPFELEAFYTNLHEVPYP 455

  Fly   451 DQTIGVWKVKDVKPTERGEGQDVKLKVRINNNGIVLISSATLVEKKEAE----EAAAAAEQAASE 511
            |..||.:.:::|.|...|:...||:|||||.:||..::||:::||:..|    :|....|.:.:|
  Rat   456 DPRIGNFTIQNVFPQSDGDSSKVKVKVRINIHGIFSVASASVIEKQNLEGDHNDAPMETEASKNE 520

  Fly   512 EKPGDQTNNTGEPADGQQEAYCEN----EDDNNTSTASSPGGQGWAQRVKGWFGSGADK------ 566
            .|.........:...|.|:.:.|:    |.|:..:.|.:|               .:||      
  Rat   521 GKEDVDKMQVDQEEGGHQKCHAEHTPEEEIDHTGAKAKAP---------------PSDKQDRINQ 570

  Fly   567 --KKKASKATELPLECTTHGFSPVDLSN-YTQQESKMIGNDQKETERIDAKNALEEFVYDMRNKL 628
              ||...|:.:||::.:.:.....||.| |.:.|.|||..|:.|.||.|||||:||:|||.|:||
  Rat   571 TIKKGKIKSIDLPIQSSLYRQLTQDLLNSYIENEGKMIMQDKLEKERNDAKNAVEEYVYDFRDKL 635

  Fly   629 QGGPFERYVVEAEREKIVSQLNDLENWLYEDGEDCERDIYTSRLQALHQKTDPIKLRASDYEQGP 693
             |..:|:::...:..|:.:.|.|.||||||:|||..:.:|..:||.|.:...||:::..::|:.|
  Rat   636 -GTVYEKFITPEDMNKLSAMLEDTENWLYEEGEDQPKQVYVDKLQELKKYGQPIQMKYVEHEERP 699

  Fly   694 AAFDELKNSIAIARLAVAEFRKGVPKYDHLTETEFINISETADKAQSWLDANLPKFTQSPRTADS 758
            .|.::|...|.:....:...|....:||||...|...:.:....:.:||::.:....:...|.|.
  Rat   700 KALNDLGKKIQLVLKVIEAHRNKDERYDHLDPAEMEKVEKYISDSMNWLNSKMNAQNKLSLTQDP 764

  Fly   759 PVQISAVRQEVQTLNSCVSSVINRAKPKPTPAKTATPPKDEANAEQNGGEPAANSGDKMDVDNNG 823
            .|::|.:..:.:.|::..:.::.:.|||    ..|...|.:|::|.||.....|..:.......|
  Rat   765 VVKVSEIVTKSKELDNFCNPIVYKPKPK----VEAPEDKTKASSEHNGPMDGQNGAESSPDPPKG 825

  Fly   824 QSAAGNDPSMEVE 836
            .|...:...|||:
  Rat   826 GSQHTDSGEMEVD 838

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Hsp110NP_001189103.1 ASKHA_NBD_HSP70_HSPA4_like 4..378 CDD:466826 217/376 (58%)
Hspa4lNP_001099898.2 ASKHA_NBD_HSP70_HSPA4L 2..384 CDD:466844 222/381 (58%)

Return to query results.
Submit another query.