DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Hsp110 and hsp-110

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001189103.1 Gene:Hsp110 / 39557 FlyBaseID:FBgn0026418 Length:836 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_498868.1 Gene:hsp-110 / 176195 WormBaseID:WBGene00016250 Length:776 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:831 Identity:337/831 - (40%)
Similarity:478/831 - (57%) Gaps:66/831 - (7%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MSVIGIDFGNESCYVAAARSGGIETLANDYSLRATPSFVAFDGKKRIIGVAAKNQQVTNMKNTVG 65
            |||:|.|.||.:||:..||.||||.:.|||||.|||:.|:|..|.|.:||||:....||:||||.
 Worm     1 MSVLGFDIGNLNCYIGVARQGGIEVITNDYSLHATPACVSFGPKDRSMGVAARQAVTTNIKNTVI 65

  Fly    66 GFKRLLGRKFNDPHVQHELTSIPARVEARGDGSIGIKVNYLGEDQHFGPEQLTAMLFTKLKETSA 130
            .||.|:||||:||..|..:..||.:|....:..||::|:||||...|.|||:.|.|.|||:....
 Worm    66 NFKHLIGRKFSDPVAQRFIPFIPCKVVKLPNDDIGVQVSYLGEPHTFTPEQVLAALLTKLRTIVE 130

  Fly   131 AAMQ--TQVNDCVIACPVFFTNAERKALLDAAQIAGLNVLRLMNETTATALAYGFYKNDLFED-- 191
            :.:.  .:|:|||:|.|.:||:.:|:|:|.|.|.||||.||::|||||.|||||.||.||.|:  
 Worm   131 SQLSDVKKVSDCVLAVPSYFTDVQRRAVLSAIQYAGLNSLRIVNETTAIALAYGIYKQDLPEEDA 195

  Fly   192 KPRNVIFVDFGHSSLQASACAFTKGKLKMLASTWD-QIGGRDIDLALGDYFAKEFQERYKINAKT 255
            |.|||:|:|.||||.|||..||.:|||:|:.:::| :.||...|..:.::|.|||:.:|.|:|.|
 Worm   196 KSRNVVFLDIGHSSTQASLVAFNRGKLQMVNTSYDLESGGIWFDALIREHFRKEFKTKYGIDAAT 260

  Fly   256 NARANLRLLTEIEKLKKQMSANSTKLPLNIECFLDDIDVSSSMQRSQMEELCAPVLQRVEQTFKR 320
            :.|..||||.|.|::|||||||.|.:|||||||::|.||:..|||.:.|:|.||:..|::|....
 Worm   261 SPRPWLRLLDECERVKKQMSANQTPIPLNIECFMEDKDVTGKMQRQEFEDLAAPIFNRIKQVLIN 325

  Fly   321 LLAES-KLQLDDIHSVEIVGGSSRIPSVKQLIEQVFNKPASTTLNQDEAVSRGAALQCAIMSPAV 384
            |.|:. .::.::|..:||||||||||.::::::.:|.|...||:||||||:||||:||||:||..
 Worm   326 LFADGVSIKPEEIDEIEIVGGSSRIPMIREIVKDLFGKEPKTTMNQDEAVARGAAMQCAILSPTF 390

  Fly   385 RVREFGVTDIQNYAVKVLWDSEGSAAPGEIEIFPQYHASPFSRLLTINRKGPFNVSIVYGQQ--V 447
            |||||.:.|.|.|.:::.|:|.|... ||.::|......|||:|:::.|.|||||...|.|.  |
 Worm   391 RVREFAIKDTQPYRIRLSWNSTGENG-GENDVFSPRDEVPFSKLVSLLRSGPFNVEAHYAQPNVV 454

  Fly   448 PYPDQTIGVWKVKDVKPTERGEGQDVKLKVRINNNGIVLISSATLVEKKEAEEAAAAAEQAASEE 512
            |:....||.|||...:|...|..|.||:|||:|.:||..|:|||:.|.:..||..|.|.:...:.
 Worm   455 PHNQVHIGSWKVNGARPGADGGNQKVKVKVRVNPDGIFTIASATMYEPRIVEEVPAEAMEVDGDA 519

  Fly   513 KPGDQTNNTGEPADGQQEAYCENEDDNNTSTASSPGGQGWAQRVKGWFGSGADKKKKASKATELP 577
            |       |..||:..:..                                  ||.|.     :|
 Worm   520 K-------TEAPAEPLEPV----------------------------------KKTKL-----VP 538

  Fly   578 LECTTHGFSPV--DLSNYTQQESKMIGNDQKETERIDAKNALEEFVYDMRNKLQGGPFERYVVEA 640
            ::.......||  |:..:...|.:|..:|.:|..:.||||:|||:||:||:|: ...:..::..|
 Worm   539 VDLEVIESIPVSYDVQKFHNLELQMQESDAREKAKADAKNSLEEYVYEMRDKV-SDQYAEFITPA 602

  Fly   641 EREKIVSQLNDLENWLYEDGEDCERDIYTSRLQALHQKTDPIKLRASDYEQGPAAFDELKNSIAI 705
            ..::..|.|...|:|||::|||.|||:|..||..|.....|:..|..:.|....|||....||..
 Worm   603 AADEFRSVLTSTEDWLYDEGEDAERDVYEKRLSELKAVGTPVVERYRESETRKPAFDSFDQSIMR 667

  Fly   706 ARLAVAEFRKGVPKYDHLTETEFINISETADKAQSWLDANLPKFTQSPRTADSPVQIS-AVRQEV 769
            .|.|..::..|.|.|.||...|...:....:..:.|||....|.....:| |:||..: .:.|..
 Worm   668 VRKAYEDYANGGPTYAHLDSKEMEKVINAIEDKKKWLDEARHKQETRSKT-DAPVVFTEEILQNK 731

  Fly   770 QTLNSCVSSVINRAKPKPTPAKTATPPKDEANAEQNGGEPAANSGDKMDVD 820
            ....:.|:.::|:.|| ..||    |||.|......|.:|.:..|: ||||
 Worm   732 NVFENVVNPILNKKKP-AAPA----PPKKEEPQPAAGDQPQSQPGE-MDVD 776

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Hsp110NP_001189103.1 ASKHA_NBD_HSP70_HSPA4_like 4..378 CDD:466826 190/379 (50%)
hsp-110NP_498868.1 HSP70 3..650 CDD:394970 295/694 (43%)

Return to query results.
Submit another query.