DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG10738 and Gyc32E

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_729905.2 Gene:CG10738 / 39516 FlyBaseID:FBgn0036368 Length:1250 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001097148.1 Gene:Gyc32E / 34553 FlyBaseID:FBgn0010197 Length:1191 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1140 Identity:465/1140 - (40%)
Similarity:662/1140 - (58%) Gaps:114/1140 - (10%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     5 PCPAPAGNYHSGLLHPLLLLLFLLAFSNFRPTHGEVFTLGYLTASQRRPGN-------LDYNRPG 62
            ||.:.|.       ...:|:|.||......|     ...|...:|.||..:       .:|::..
  Fly     4 PCASAAA-------FSCILVLLLLGCQRSNP-----LAAGATVSSMRRLTDTINIGFLAEYSQMR 56

  Fly    63 LTISGAISLAVEEVN-----------AGRLRDRGHSLQFVVAETYGEEVVSIRQTAALWTQQVAA 116
            :|: |.:.||:|:||           |.:..|.||.:.       ...|..:|....:....|.|
  Fly    57 VTL-GGLPLAIEDVNKNPNLLPGKKLAFKPVDIGHKMS-------AYRVKPLRAMTQMREAGVTA 113

  Fly   117 YIGPQETCVHEGRMAAAFNLPMISYYCTHRDPSNKADFPTFARTRPPDTQISKSVVALLLAFNWT 181
            :|||.|:|..|..:|:|:|.||:|:.|:....|||:.|.|||||..|.:::||||::||.||:|.
  Fly   114 FIGPDESCTTEALLASAWNTPMLSFKCSDPIVSNKSTFHTFARTLAPASKVSKSVISLLNAFHWN 178

  Fly   182 QVSF------LYLDDASGQYQPVAETILSTLTDAGVSIRDIRTWNTIYHHGFMDNPFEALVEQTY 240
            :.|.      ::..|.:...|.:||....|::........|.|..|:       :..:.::|:||
  Fly   179 KFSIVVSSKPIWGSDVARAIQELAEARNFTISHFKYISDYIPTTKTL-------SQIDKIIEETY 236

  Fly   241 ANTRIYLILGHYYEHVGLMVSLQRRGILSKGDYFVVGIDIEQYDPAKP---------EKYLRGLL 296
            |.||||:.:|.:...|..:..||.|.:|..|||.||.:|.|.||..:.         :.|:|   
  Fly   237 ATTRIYVFIGEHIAMVDFVRGLQNRRLLESGDYIVVSVDDEIYDSNRRVNIMERNYLDPYIR--- 298

  Fly   297 LEDVEPLAVQAFQSYLGIVPT--ASVSFATFANEVNKYMERPPFNFPNPLGPFGGVKQISAEAAY 359
            .|..:.|...:|:|.:.|..|  .:.......:::..|..:.||..|.....|..: .:.....:
  Fly   299 KEKSKSLDKISFRSVIKISMTYPQNPHIRDICSKIKDYARKTPFLVPYHQRVFDNI-SVPIYGLH 362

  Fly   360 LYDAVHLYAKALMEVLDSGGRPRNGSAIVAAIKGSRYRSAMGYHVYIDENGDAAGNYTVLA-RGS 423
            |||:|.:|.:|:.|||..||...:|:.:::.|....|.|..|:.||||.||||.|||||:. :..
  Fly   363 LYDSVMIYVRAITEVLRLGGDIYDGNLVMSHIFNRSYHSIQGFDVYIDSNGDAEGNYTVITLQND 427

  Fly   424 VRNGR---NQTVLGLRPVGTFIHRNSSLSSISKALPH-QNLKLFSPIDWVGGTRPAAAPRCGFGG 484
            |.:|.   :...:.::|||.|.:..:|:      :|. :.:|...||.|:.|..|.|.|.|||.|
  Fly   428 VGSGASIGSLAKMSMQPVGFFAYDKNSV------IPEFRYIKNDRPIQWLNGRPPLAEPLCGFHG 486

  Fly   485 EKCVNYTGEISAAIAGGALLLLSLVSL-VLYRNWRYEQELDSLLWKIDFREVQ-IHENEREQQSQ 547
            |.|.....:....::|....|:.:|:: :|.:::||||.|..||||:|.::|. |:..|....:.
  Fly   487 ELCPRKKLDWRYLVSGPLCALVVVVAIALLIKHYRYEQTLAGLLWKVDMKDVTVINLGEYNNPTN 551

  Fly   548 KQTRHLLNHLPRRLPPQSTHPLIRTSQVSLSSNPDADFRYTTIFTPIGLYKGQLYAIKKVRKKSV 612
            |                :...:.|.| :.:...|:     ...||.|.|::|.:.|:||:.||||
  Fly   552 K----------------NIFQICRQS-ILVVGEPN-----KRSFTNIALFRGNIVAMKKIHKKSV 594

  Fly   613 DITREMKKELKLLRDARHDNICAFIGACTDPPNICIISEYCTRGSLKDILENEDVKLDNMFIASM 677
            ||||.::|||||:|:.||:||..||||.||..::.|.:.||.||||:|:|.|||:.||:|||:|:
  Fly   595 DITRSIRKELKLMREVRHENIINFIGASTDHGSVIIFTTYCARGSLEDVLANEDLHLDHMFISSL 659

  Fly   678 VADIIRGVIYLHDSPIRFHGALCTSNCLVDSRWVVKLTDFGLFAFKQGIED-SSTDMQHMSAKCL 741
            |:||::|:||||||.|..||.|.:||||:|||||.:::||||...|.|.|: :.::::...|.|:
  Fly   660 VSDILKGMIYLHDSEIISHGNLRSSNCLIDSRWVCQISDFGLHELKAGQEEPNKSELELKRALCM 724

  Fly   742 KLLYRAPELLRQG--PSSLVMGTQRGDAYSFGILLYEMHVRRGPFGETGLTPMQCLQKVLQPQDY 804
                 ||||||..  |.   .|:|:||.||||||||||..|:||:|:|..:..:.:|.|..|:..
  Fly   725 -----APELLRDAYRPG---RGSQKGDVYSFGILLYEMIGRKGPWGDTAYSKEEIIQFVKCPEML 781

  Fly   805 LN-PYRPSLQPLETAF-DCVSECLRECWAERPEDRPDFKTIRTKLRPLRKGMRPNIFDNMMAMME 867
            .: .:||:|....... |.:.:||.:||.|.||.|||.:.:|..|:.|:.|::|||||||:::||
  Fly   782 QHGVFRPALTHTHLDIPDYIRKCLCQCWDEDPEVRPDIRLVRMHLKELQAGLKPNIFDNMLSIME 846

  Fly   868 KYANNLEALVDDRTDQLQEEKKKTDALLHEMLPRCVADQLKKGHKVDPEHYEQVSIYFSDIVGFT 932
            |||.|||.||.:||:.|.|||||||.||::||||.||:.||:|..|:.|.::.|:|.||||||||
  Fly   847 KYAYNLEGLVQERTNLLYEEKKKTDMLLYQMLPRPVAELLKRGDPVEAECFDCVTILFSDIVGFT 911

  Fly   933 AMSAECTPLQVVDFLNDLYTCFDSIIGHYDVYKVETIGDAYMVVSGLPLRNGDLHAAEIATMSLH 997
            .:....||.:||:.|||.|||.||||.:|||||||||||||||||||||:||..||.|||:::||
  Fly   912 ELCTTSTPFEVVEMLNDWYTCCDSIISNYDVYKVETIGDAYMVVSGLPLQNGSRHAGEIASLALH 976

  Fly   998 LLSAVSEFKIRHRPTNRLLLRIGIHSGPVCAGVVGLKMPRYCLFGDTVNTASRMESSGVPLKIHC 1062
            ||..|...||||:||..:.||||:||||..|||||.||||||||||||||||||||:|..::||.
  Fly   977 LLETVGNLKIRHKPTETVQLRIGVHSGPCAAGVVGQKMPRYCLFGDTVNTASRMESTGDSMRIHI 1041

  Fly  1063 SWQCRQLLDRLGGYHFAERGVISMKGKGDQRTYWL 1097
            |....|||..:|.|...|||:.|:|||||.|||||
  Fly  1042 SEATYQLLQVIGSYVCIERGLTSIKGKGDMRTYWL 1076

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG10738NP_729905.2 PBP1_SAP_GC-like 41..441 CDD:380593 131/438 (30%)
PK_GC-A_B 570..853 CDD:270944 131/287 (46%)
HNOBA <860..907 CDD:462234 31/46 (67%)
CYCc 886..1078 CDD:214485 125/191 (65%)
Gyc32ENP_001097148.1 PBP1_SAP_GC-like 44..448 CDD:380593 127/422 (30%)
PK_GC-A_B 550..832 CDD:270944 132/311 (42%)
CYCc 865..1057 CDD:214485 125/191 (65%)

Return to query results.
Submit another query.