DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG10738 and Gucy2g

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_729905.2 Gene:CG10738 / 39516 FlyBaseID:FBgn0036368 Length:1250 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_620611.2 Gene:Gucy2g / 245708 RGDID:621853 Length:1103 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1175 Identity:379/1175 - (32%)
Similarity:573/1175 - (48%) Gaps:187/1175 - (15%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    14 HSGLLHPLLLLLFLLAFSNFRPTHGEVFTLGYLTASQRRPGNLDYNRPGLTISGAISLAVEEVNA 78
            ||.|:..|.:::.:......:           ||.....|.|:.:......:...:.:||:::|:
  Rat    28 HSSLVLTLFVVMLMTCLEAAK-----------LTVGFHAPWNISHPFSVQRLGAGLQIAVDKLNS 81

  Fly    79 GRLRDRGHSLQFVVAETYGEEVVSIRQTAALWTQQV-----AAYIGP--QETCVHEGRMAAAFNL 136
            ..:.....|.:|    ||.....:.:::.|.:..||     :..|||  .|.....|.:|:.:::
  Rat    82 EPVGPGNLSWEF----TYTNATCNAKESLAAFIDQVQREHISVLIGPACPEAAEVIGLLASEWDI 142

  Fly   137 PMIS-----------YYCTHRDPSNKADFPTFARTRPPDTQISKSVVALLLAFNWTQVSFLYLDD 190
            |:..           ::|           .|.....||..:|...:...|....|..:.......
  Rat   143 PLFDFVGQMTALEDHFWC-----------DTCVTLVPPKQEIGTVLRESLQYLGWEYIGVFGGSS 196

  Fly   191 ASGQYQPVAETILSTLTDAGVSIRDIRTWNTIYHHGFMDNPFEALVEQTYANTRIYLILGHYYEH 255
            |...:..|.|  |....:..:.:....|....|..|..|...|.|...: :..|:.:::....:.
  Rat   197 AGSSWGEVNE--LWKAVEDELQLHFTITARVRYSSGHSDLLQEGLRSMS-SVARVIILICSSEDA 258

  Fly   256 VGLMVSLQRRGILSKGDYFVVGIDIEQYDPAKPEKYLRGLLLEDVEPLAVQAFQSYLGIVPT--- 317
            ..::.:.:..|:.|:...|::   ::|.:    :.:.:.:|.||......:.::|...|.|:   
  Rat   259 KHILQAAEDLGLNSREFVFLL---LQQLE----DSFWKEVLAEDKVTRFPKVYESVFLIAPSTYG 316

  Fly   318 ASVSFATFANEVNKYMERPPFNFPNPLGPFGGVKQISAEAAYLYDAVHLYAKALMEVLDSGGRPR 382
            .|.....|..:|.:.:.||||.     .......|:|..:|||:||:.|||:.:.|::.:....|
  Rat   317 GSAGDDDFRKQVYQRLRRPPFQ-----SSISSEDQVSPYSAYLHDALLLYAQTVEEMMKAEKDFR 376

  Fly   383 NGSAIVAAIKGSRYR-SAMGYHVYIDENGDAAGNYTVLARGSVRNGRNQTVLGLRPVGTFIHRNS 446
            :|..:::.::..:.. ..:...|.:|..|....:|:|.|.....||..     ..|   |:|.:|
  Rat   377 DGRQLISTLRADQVTLQGITGPVLLDAQGKRHMDYSVYALQKSGNGSR-----FLP---FLHYDS 433

  Fly   447 S-------LSSISKALPHQNLKLFSPIDWVGGTRPAAAPRCGFGGEKC-------VNYTGEISAA 497
            .       ...::.:.||             |:.|...|.|||..:.|       ...|..::|.
  Rat   434 FQKVIRPWRDDLNASGPH-------------GSHPEYKPDCGFHEDLCRTKPPTGAGMTASVTAV 485

  Fly   498 IAGGALLLL----SLVSLVLYR-NWRYEQELDSLLWKIDFREVQIHENEREQQSQKQTRHLLNHL 557
            |....||::    ::..|:|:| ..:.:.......|:|.:..:.:                   |
  Rat   486 IPTVTLLVVASAAAITGLMLWRLRGKVQNHPGDTWWQIHYDSITL-------------------L 531

  Fly   558 PRRLPPQSTHPLIR-----TSQVSLSSNPDADFRYT-----TIFTPIGLYKGQLYAI-------- 604
            |:..|.....|:.|     .|.|.:|:: ...|..|     ..:.|:|||:|...|:        
  Rat   532 PQHKPSHRGTPMSRCNVSNASTVKISAD-CGSFAKTHQDEELFYAPVGLYQGNHVALCYIGEEAE 595

  Fly   605 KKVRKKSVDITREMKKELKLLRDARHDNICAFIGACTDPPNICIISEYCTRGSLKDILENEDVKL 669
            .:::|.:|      .:|:.|:.:.:|:||..|.|.||:||||||:::.|.:|||||:|.|.|.::
  Rat   596 ARIKKPTV------LREVWLMCELKHENIVPFFGVCTEPPNICIVTQCCKKGSLKDVLRNSDHEM 654

  Fly   670 DNMFIASMVADIIRGVIYLHDSPIRFHGALCTSNCLVDSRWVVKLTDFGLFAFKQG-----IEDS 729
            |.:|..|.|.||:.|:::||.||:|.||.|..|||||||...:||..|||:.||.|     ....
  Rat   655 DWIFKLSFVYDIVNGMLFLHGSPLRSHGNLKPSNCLVDSHMQLKLAGFGLWEFKHGSTCRIYNQE 719

  Fly   730 STDMQHMSAKCLKLLYRAPEL--LRQGPSSLVMGTQRGDAYSFGILLYEM-HVR-RGPFGETGLT 790
            :||..       :|.:.||||  ||:.|.|   ||.:||.|||.|||.:: |.: .|||.:....
  Rat   720 ATDHS-------ELYWTAPELLRLRELPWS---GTPQGDVYSFAILLRDLIHQQAHGPFEDLEAA 774

  Fly   791 P---MQCLQKVLQPQDYLNPYRPSLQPLETAFD-CVSECLRECWAERPEDRPDFKTIRTKLRPLR 851
            |   :.|::....|.    |.||||  ||...| .:...:|.||||.||.||.|.:|:..||...
  Rat   775 PEEIISCIKDSRAPV----PLRPSL--LEDKGDERIVALVRACWAESPEQRPAFPSIKKTLREAS 833

  Fly   852 KGMRPNIFDNMMAMMEKYANNLEALVDDRTDQLQEEKKKTDALLHEMLPRCVADQLKKGHKVDPE 916
            ...|.:|.|:||..:|.||::||.:|::||.||..||:|.:.||..|||..|.:||..|..|:||
  Rat   834 PRGRVSILDSMMGKLEMYASHLEEVVEERTCQLVAEKRKVEKLLSTMLPSFVGEQLIAGKSVEPE 898

  Fly   917 HYEQVSIYFSDIVGFTAMSAECTPLQVVDFLNDLYTCFDSIIGHYDVYKVETIGDAYMVVSGLPL 981
            |:|.|:|:||||||||.:.:..:|||||..|||||:.||..|..:||||||||||||||.||||:
  Rat   899 HFESVTIFFSDIVGFTKLCSLSSPLQVVKLLNDLYSLFDHTIQTHDVYKVETIGDAYMVASGLPI 963

  Fly   982 RNGDLHAAEIATMSLHLLSAVSEFKIRHRPTNRLLLRIGIHSGPVCAGVVGLKMPRYCLFGDTVN 1046
            |||..||.|||||||||||..:.|:|.|.|..||.||||:|:|||.|||||:.||||||||||||
  Rat   964 RNGAQHADEIATMSLHLLSVTTNFQIGHMPEERLKLRIGLHTGPVVAGVVGITMPRYCLFGDTVN 1028

  Fly  1047 TASRMESSGVPLKIHCSWQCRQLLDRLGGYHFAERGVISMKGKGDQRTYWLLGED---------- 1101
            .|||||||.:||:||.|....:.|...||||..:||.||:||||:|.|:||.|:|          
  Rat  1029 MASRMESSSLPLRIHVSQSTARALLVAGGYHLQKRGTISVKGKGEQTTFWLTGKDGFAVPLPEFT 1093

  Fly  1102 -EEAR 1105
             |||:
  Rat  1094 EEEAK 1098

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG10738NP_729905.2 PBP1_SAP_GC-like 41..441 CDD:380593 78/421 (19%)
PK_GC-A_B 570..853 CDD:270944 117/313 (37%)
HNOBA <860..907 CDD:462234 22/46 (48%)
CYCc 886..1078 CDD:214485 121/191 (63%)
Gucy2gNP_620611.2 PBP1_GC_G-like 50..439 CDD:380595 80/426 (19%)
PK_GC 558..832 CDD:270894 113/296 (38%)
CYCc 868..1058 CDD:214485 119/189 (63%)

Return to query results.
Submit another query.