Protein Alignment CG17687 and cfap43

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001368937.1
• Gene: CG17687 / 39495
• FlyBaseID: FBgn0036348
• Length: 1594
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_017947698.2
• Gene: cfap43 / 100491900
• XenbaseID: XB-GENE-6464245
• Length: 1660
• Species: Xenopus tropicalis
• Alignment Length: 1880
• Identity: 380/1880 - (20%)
• Similarity: 703/1880 - (37%)
• Gaps: 547/1880 - (29%)

  Fly     7 VCWCNIWDKDTLVNVGPDVLCQRNGNAMKFVHMQTKAVTFFKAETVSTGLSISCFAGHNRFPLFA 71
            |.|....:|..:..:....:|...||.:.|....|:..:|.:..|.|.|    .|:.:....:.|
 Frog    11 VRWVQGINKKKVTFINDHTVCYPCGNFIVFHDTNTRKQSFLQCMTGSIG----AFSVNTYSEVVA 71

  Fly    72 FAEVVLRPNIYIYRYPDMAK----------------FSSIPPHMMSYTDIRFSELDLLIAVGGYP 120
            |::..|.|:||:|.:|...|                ||:..|::.|::.:              |
 Frog    72 FSDQKLHPSIYVYTFPGFVKRVELKEGAQLDYSLIAFSNAAPYLASFSSV--------------P 122

  Fly   121 DYCLCVFNYRTGTLVLEQFTNVPTV-----------------ERGIVI----------SFTSLPS 158
            |:.|.::|::.|..:..|..:..|.                 |..:::          ...::|
 Frog   123 DHVLTIWNWQEGIPLCSQSESQTTYTTLTFNPMNWHQLCLSSETSLIVWNIEICDNLYQLKAMP- 186

  Fly   159 IIQLNKQDMTIICYEICTVEKESF-----------------------LYKVAEV----ELGKKFL 196
             ::|..:|.||      .||:|:|                       :.:.||:    |..|..:
 Frog   187 -VKLPSEDGTI------GVEEENFNSSAPNGVSYYGPVMPKSAVAGLVGEEAEIFIPKEQRKHSV 244

  Fly   197 KSCNRCLSFGEDNTLYATNDFGHLLSVDV---ACFALKPQWQPTSESDSVTEMEKMPRSHGLTYH 258
            :....|.:...|  ||...:.|.:|::..   ....|..:.|.......||.:|...::  :.:|
 Frog   245 QPSFHCWNATSD--LYVGCERGKILTISAETQKVIVLAQKDQDADPLSGVTLLEGNIKT--MAFH 305

  Fly   259 KSGFLIWNSTTAYYVKKKAGV----------FKLE--WEFEGRLNEVVRFLSNN--------NGE 303
            |.|.         |:..|.||          .|||  |..:..: |.:.|..|.        .|.
 Frog   306 KEGL---------YIAGKDGVLRSCTIKGSELKLEDCWSVQESI-ESISFSPNYKMLSIATCKGS 360

  Fly   304 IYA--ERRPGHIDQVV----------------------VDRNGTVSLEAVVPTGKPVIT------ 338
            :|.  .|.||...:|.                      .|.:|.|.|.: |..|:.|.:
 Frog   361 VYLYNHRNPGETYKVFDVYSGDLLAADFLTFGNKYCLSTDISGHVQLWS-VEDGRSVSSLSLNIQ 424

  Fly   339 --------------------------------FRVVQGLKDECVCVLH---------------DE 356
                                            .||||.::..||.|.|               |.
 Frog   425 ATAMACCPSSNYAAVGSSTGHIYFIDAMKIEALRVVQRMRLYCVPVQHIHFDPRGNFLLTGAADR 489

  Fly   357 GVAMMDLAKGNTLCEVSVPGATAMCNHRSLALVVVGTLDA----SIVLI-------------HFE 404
            .:.::|....::.   .|.|...:|. ..|.|..:.:.|:    ::.||             ..|
 Frog   490 HIFILDARPSHSF---EVLGYIVVCG-EILTLSSLSSEDSQQTKAMALICPVNEGKEEKGGTRLE 550

  Fly   405 RASLPHVLCDLKMETAAVVGIEFNDSWVVFQDQMKVLHVVQVDNRPHKLTHYFEMNPPELSQVFI 469
            ..|||     |:|.::.   .|:.|...:|:|.|     ||      |::  ::::.|..|.|..
 Frog   551 MFSLP-----LQMLSSP---SEYIDEKGMFKDAM-----VQ------KIS--YDVDQPLFSAVLG 594

  Fly   470 HTFLLADG-----PRLMVFINRDHSMKRP--GFATELWLYNWGKDKRLHRREYILPKQYGFFCVQ 527
            :......|     |.|:.::........|  ...||          ::.|..::.|   |..|:.
 Frog   595 YNVSSVFGFGSYAPMLLKYVIHKEISGDPLTALVTE----------KVVRGSHLGP---GVLCLS 646

  Fly   528 PPVGRWALIEIVATEYNTLNFDQFALNEKDELQWIASTKSGH-------FSYILGAGMTKHLVTW 585
            |.: :|                 .:::.:|.:.::...|:..       .||..| |:..  :::
 Frog   647 PHL-KW-----------------ISVSGRDGIVYVKDIKNMETVAQVQCHSYHTG-GINS--LSF 690

  Fly   586 SLGG-------------ILVHFKQHKRAKKPFMICRFLNLGMQTEYILRVKECFNSKYLIILLA- 636
            ||.|             :.:.:|....::          ||...||        ...:.:.|.|
 Frog   691 SLDGQSIITTGTSDGALVCLQWKSTGSSR----------LGAAVEY--------GKAFTLSLQAA 737

  Fly   637 --NKSMRVMRLP-------SLADFVRE----NVALPLPTEEGIP---CFVEQIIHKVDMFVPLSQ 685
              .::..:.|:|       |:|...:|    |:::.:..::..|   ..|..|..|:
 Frog   738 MKEENQMLSRMPEWTADTSSMAVESKEKEYRNLSVDVTEQDTFPNTSADVTWIYRKL-------- 794

  Fly   686 RQEVKEEYTRADLAKREKLFTIIKDFAAKVTALIDY-----DISKTGKTQGIFKKFCFHYRWLDA 745
             :|.|::.|....|::|.:.|.||.....:.|::..     ||.|..:.:       |:   ||
 Frog   795 -EEAKKKETEKYAAEKEIIKTGIKKLRKTIQAMMRENESLPDIEKLDQQE-------FN---LD- 847

  Fly   746 LTEEAHKLCALERESLERAIADQSRIRDWILRLVTRDAVSINYRVRSIFADANFESFSVRRKVEM 810
             |||..:| .||.|.      :.:|:|    :.:..:.:|..| :|.:.....::|.:|:.:..|
 Frog   848 -TEEQERL-YLESEK------EVARVR----QEIELENLSKQY-LREVIKQECWDSMAVKGRSVM 899

  Fly   811 SEFDKYRFY----------DLEDHLR-LSLGSFE-----------EEEPPAPAAGGHGPPAAIED 853
            :....|...          :|||..| |:|...|           |.:|...|          :|
 Frog   900 AFHTGYEVMNYPMKERTPKELEDFARVLNLKKIEAVDLKVRKEIVETQPKIKA----------DD 954

  Fly   854 GEVDEEETVEVVQGLRELKPFVVE---GPSVYEHIMAPVFQLQDK-NLVTSNQLFNYNCKIRFYL 914
            .|..|||:|...|....|...:.:   |.:.|.:....:...::| |.:...|...:|
 Frog   955 EEEVEEESVSKSQDSSSLVGSLSDLYGGDTSYLYSQLILHSREEKINQIILLQDIIHN------- 1012

  Fly   915 NDPLKQEFNKLFHEAQQLKQDTIDSVMNTNVVLNKIYDNMNIMLRLLNMDQFKPPELTVPSLAKD 979
               :|:.|||.|..|.:.|:..:..|...|..:.:|...:|:..:||.           |:...:
 Frog  1013 ---IKKAFNKDFDIACRQKEQEVTRVKERNNRIQEIMVELNLQEKLLE-----------PTFTDN 1063

  Fly   980 EVIKQIMEVDDSEVKAINRRKPKTIDTGGKKGRLLLWSKEFWA------------RALIVMMDGV 1032
            |..::.:.|||||||......|:      :|.:....:||..|            |||..||.||
 Frog  1064 EKPERALTVDDSEVKVERYLTPE------QKAKAEKLAKEEEAKRLAEQEDNAKQRALDDMMGGV 1122

  Fly  1033 LEKLWEEEIKKDIPEPEFMQKKQPHEFNLEEQKIFRAYEEAVHLLELDRRKYLRILHENEEKTLA 1097
            ||...|:.::.::|:|.|:.:.:. |:..||:|.|:.||:....|..::.||.::| |.|.|.|.
 Frog  1123 LEVKKEDILRMEVPQPGFIARAEA-EWTDEEKKQFKEYEKKCKDLSEEKEKYSKVL-EAEMKKLQ 1185

  Fly  1098 LKASQILK-LNQRVAELMILKLKYDFALKQGQLR-------MLTLEKINFGRV--------QMRK 1146
            |...:..: .:..:|.|...|:|.:.|:.|.:|:       :|..|:|| .||        :.||
 Frog  1186 LSVIETTQSFDDVLARLFEKKVKSEMAIYQEELKINNLLFSLLIEEEIN-TRVAHLAHILDKKRK 1249

  Fly  1147 RYNMFRKDIDKLNDYMTRYSNLLDFYDKAFLDVKTRLEAQQTRDRAVERQFRSQFLPLVPHATHE 1211
            :.|   :..:.:..:.|:.....:.||....:           |:.::|.|:.:|..:..:...:
 Frog  1250 QKN---QTAEIVKSFKTQVLAFRESYDNLVAE-----------DKLLDRGFKKEFSDITSYQVDQ 1300

  Fly  1212 MTKLFKKRPKLPGKVFNSVLICMEASNKLSGKPSHRTPF--------PLPDDVLEFLNYLAEFDQ 1268
            :.||:|:||::               .:|..:.....||        ...|.:...:..:.|.|.
 Frog  1301 LYKLYKRRPRV---------------QRLRTQTDSAAPFGERPGSAKANKDSIALLMKAMDELDT 1350

  Fly  1269 PKQCPPNVDPKSWDAFVKLRRQKTESELRLKGIGYQLLDSQALLGVLNKDLAALKESKILTQRNS 1333
            |:..|..|:...|:.|...||.|.|.|.::|.....|.:.||.|     |....::.||   |..
 Frog  1351 PENMPEGVEFPVWERFCLARRSKIEYEQQVKIKALVLAEMQAFL-----DKRIEEDEKI---RQD 1407

  Fly  1334 EDSIQTYL-----EKMR---NMTIQLTLTMGQVEVSVMGQFTKLSNTVLMHVDDINDVNRQIQEA 1390
            .::|...|     |||:   ::|:|..|..||||:..........:.:|:|...|.|:|..|:..
 Frog  1408 TENIMQELNVLRSEKMKFQLDLTVQFLLKQGQVELENSDLIPSFEDAILLHRSVIEDLNSTIRGL 1472

  Fly  1391 GNKKIKAMQRVAVFRRQVIFKEWEHKLYKANIAYLKYMLDAIEKCKVSMEFLNIL--RNWEKVKT 1453
            |.:||.:|.....||:.:...||||:..:..:..|:.....|....||.:|...|  :|::|..:
 Frog  1473 GEQKIASMVESKDFRKGIFQLEWEHRKIRMEMEDLEQKSRDISLLHVSKDFQVFLSEQNYDKRIS 1537

  Fly  1454 ERQKYIAGAI---ERVIEQKIAVFRKNIDRVNIKIDAVKAQTLEIKRSNHAIDFKIERIKVDVTF 1515
            ::.:.:...:   |:..|:.:..::|::..:...|:..:...|:       :|..::.:.|..:.
 Frog  1538 DQIQVLEATLNAQEKQHEKNVKTYKKSLKDLETNINKKRTANLD-------LDKDLQELLVSFSE 1595

  Fly  1516 QNTLRDTM-MEDKRDREQRERMSQIKTHRQLMENVRRNYAHVLELQTILELLRLRTYPTL 1574
            :..:.|.: :|...::..:||..:|...|:|::..:.....::||:|.::.||::|:|.|
 Frog  1596 RKHIYDVVGVEQSTEKAAKERYVEIVQRRKLVDLAKIQAQEIIELRTEVDRLRMKTFPAL 1655

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
CG17687	NP_001368937.1	None
cfap43	XP_017947698.2	WD40 repeat	290..337	CDD:293791	14/57 (25%)
		WD40	<296..497	CDD:441893	38/213 (18%)
		WD40 repeat	340..377	CDD:293791	9/37 (24%)
		WD40	373..702	CDD:475233	64/388 (16%)
		WD40 repeat	384..420	CDD:293791	7/36 (19%)
		WD40 repeat	425..462	CDD:293791	3/36 (8%)
		WD40 repeat	643..676	CDD:293791	5/50 (10%)
		PTZ00121	<1078..1258	CDD:173412	51/191 (27%)
		CCDC158	1170..>1648	CDD:464943	114/523 (22%)