Protein Alignment Cul6 and mr

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_648620.1
• Gene: Cul6 / 39474
• FlyBaseID: FBgn0036332
• Length: 670
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_611862.1
• Gene: mr / 45906
• FlyBaseID: FBgn0002791
• Length: 802
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 707
• Identity: 135/707 - (19%)
• Similarity: 246/707 - (34%)
• Gaps: 194/707 - (27%)

  Fly    17 LIDNILQVVNQIFDDYTSFDGQKLMHLYHLIYKQCAAERNWNNPAQKNGR-----SLYIVLSDCL 76
            |....:..:|::.|.:     |.||.:...:.:...||   ..|..|..:     .:...|.|||
  Fly   103 LFTQFIDAINELHDSF-----QSLMQVKPRLIQLVGAE---TKPTAKTVKLMQEEGIKNCLRDCL 159

  Fly    77 MKRLKNIAWVMENQLDDNKPIRLIAKYLEHWVPYQRSCEKLNLA-------------CYHFNRNW 128
            :.           ||..|..:.:.|.|   ||.::...:..|||             |...|
  Fly   160 LA-----------QLPPNFSVVVGAFY---WVHFKLFTKASNLALTTVDSDVFDELLCVGCN--- 207

  Fly   129 VERERLKGDKETYPIYRLAMISWKELVFEPSV-------TILAAIRLILSQ---------MPREY 177
            .|.|:....:.|..:.:..|     .:||.::       .:.|.|:|.:.:         ..|.:
  Fly   208 FEAEQCCCQRLTDMVNKTNM-----KLFEMNLIDRLTGSALTALIKLKIKEHISDTCMGIFDRSH 267

  Fly   178 NKSLEYQVYQVLQS-----IVELYANDKYQDVSLPSRIDKIFTEKVMDF----YKSTTLHEFQKI 233
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  Fly   268 LKQLETWLSDVIMSWLTNIFTEWKSKDSISDIEVPESV-KSFKVKLTYFMYETFAQSVIGQFFSI 331

  Fly   234 VVSNDYKDFKHFLRYACLAMPEIENGTQFKAILKRYLAARLQETRLSGKDYIQAFLGLCRGPLQR 298
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  Fly   332 II--DYPDSIPAIDDLKICMEKIDMRVYLTESLRNSLEARILHPGVNTMDILTGYVAAI-----K 389

  Fly   299 ALR--DHT-KLAEVVDAVCKEEINRKGQIIDPTRLLVTYANELMTKRQESEEAIIDELKR---IV 357
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  Fly   390 AIRHLDSTGVILEMVTAPIKDYLRKRN---DTVRRVVTGLTE------EGPTDLSEELAKGETIK 445

  Fly   358 KCVEFLSDEYK-------------------------------------------FIDMYLKALRI 379
            :|.:..:||:.                                           |:..|...:..
  Fly   446 ECKDSGTDEFSNWENWQPDPFGIDASIMQYNSSRKMRSADIISMVVDIYGSKELFMTEYRNLMAD 510

  Fly   380 RQINETSTSDGVESIMYSLLNKKMANFVTRCIYVQLRDVDKLRTLKKEFQDHLNSKGIKLG---F 441
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  Fly   511 RLLAQLDFNSEKEIRNLELLKIRFGESLLHSCEVMLKDV----TDSKRINAHIHSDGDRTENQLF 571

  Fly   442 D---------FRPKCFKNDGSFENFNLTLPDELQQAWKEFRIFYEA----RKLQSKAII-QLNNE 492
            |         |.|       ||...:|.||:|::..:|::...|||    |.|..:.:. ::|.|
  Fly   572 DISSLIVSAQFWP-------SFNKESLQLPEEIENEFKKYTKAYEAYKGNRTLNWRTVTGRVNIE 629

  Fly   493 LSSGEITCHLNQSVYILEVSTLQMAVLMLFNRHERFTEQELVTALGVELETLQ------------ 545
            :..|:.|..       :.||.:...::..|.....:|.::|.:...|....|:
  Fly   630 IEIGDRTME-------MVVSPILAVIIYHFQTKNEWTIEDLSSITKVPASALRRRLSFWQNHGLI 687

  Fly   546 -EALKQIKFLVYIEVNKVNYIEINMDFTNRKRRLFCNEPLPRKMRKIEEKSEIELKI 601
             |....|..|:..|..|..|.::::...:       .|.|...|....::.|.||::
  Fly   688 SETTPGIFTLLEKESEKSQYEDMSLAEAD-------EEDLESAMASASDQREEELQV 737

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Cul6	NP_648620.1	COG5647	25..670	CDD:227934	134/699 (19%)
mr	NP_611862.1	CULLIN	494..632	CDD:214545	33/148 (22%)
		ANAPC2	741..800	CDD:462556