Protein Alignment Cul6 and Cul2

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_648620.1
• Gene: Cul6 / 39474
• FlyBaseID: FBgn0036332
• Length: 670
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_313365.5
• Gene: Cul2 / 1274269
• VectorBaseID: AGAMI1_002671
• Length: 766
• Species: Anopheles gambiae
• Alignment Length: 753
• Identity: 169/753 - (22%)
• Similarity: 303/753 - (40%)
• Gaps: 158/753 - (20%)

  Fly    47 IYKQCAAERNWNNPAQKNGRSLYI----VLSDCLMKRLKNIAWVMENQLDDNK-----------P 96
            :|:.|.|     :|.....| ||:    .|.:.:...|:....:.::|...|:           |
Mosquito    42 VYEICVA-----HPEPLADR-LYLETKTFLENHVQTLLEERVLIGDSQNASNEQSAGTGSSSASP 100

  Fly    97 IRLIAKYLEHWVPYQRSCEKLNLACYHFNRNWVERERLK-----------GD-KETYPIYRLAMI 149
            ..|:.:|.:.|:.|....:.||....:.|:..:::::|.           || :|...|..|.:.
Mosquito   101 YLLLERYYDVWMEYSSGSQYLNHLYLYLNQQHIKKQKLNEAEAVYGCSNHGDNQEKMEIGELTLE 165

  Fly   150 SWKELVFEPSVTILAAIRLILSQMPRE--------YNKSLEYQVYQVLQSIV------------- 193
            .|.:.:.:.....|  :..|||.:..|        :|||.|. :..|:||.|
Mosquito   166 IWNQYMIQRLGNEL--VDQILSGINAERVNNSSGQHNKSTEV-IRGVIQSFVAVQEDRRKGSLKL 227

  Fly   194 --ELY---------------ANDKYQDVSLPSRIDKIF-----TEKVMDFY-KSTTLHEFQKIVV 235
              ||:               |::..|..|:...:::|.     .||:...| ..::|.:.:|:..
Mosquito   228 YQELFETRMLEESGQNFRIVASELLQVCSVSQYMERIIKKFEEEEKLAKIYLHESSLPKLRKVCE 292

  Fly   236 SNDYKDFKHFLRYACLAMPEIENGTQFKAI----------LKRYLAARLQETRLSGKDYIQAFLG 290
            ........:||...|..|...|..|..:.:          |||.:...|:..:..||..|...
Mosquito   293 EEMVTKHMNFLYSECKEMVATEKSTDLRNLYILLKPVTDGLKRLIEVFLEHIKEQGKKTISCM-- 355

  Fly   291 LCRGP------LQRALRDHTKLAEVV--------------DAVCKEEINRK---GQIIDPTRLLV 332
              :|.      ::..|..|.|..|::              |..|...||.|   .|:.....|:.
Mosquito   356 --KGDSVHIQFVENMLDVHRKYEELIHTTFKSDPLFLGALDKACARIINEKHSNNQVCRSAELVA 418

  Fly   333 TYANELMTKRQESEEAIIDELKRIVKCVEFLSDEYKFIDMYLKALRIRQINETSTSDGVESIMYS 397
            .|.:.|:.|.:.:|..|..:|.|.:...:::.|:..:...|.:.|..|.|:|.|.|...|.:|.:
Mosquito   419 KYCDSLLKKSKTTEGEIDQKLTRSIIIFKYIEDKDVYQKFYSRMLAKRLIHEQSQSMDAEELMIN 483

  Fly   398 LLNKKMANFVTRCIYVQLRDVDKLRTLKKEFQDHLNSKGIKLGFDFRPKCFKND----------G 452
            .|.:......|..::....|:.....|..:|..:||....:.|.:|..|..:..          .
Mosquito   484 KLKQACGYEFTNKLHRMFTDISVSTDLNAKFSKYLNDNKHETGINFSVKVLQAGAWPLGPTQVVA 548

  Fly   453 SFENFNLTLPDELQQAWKEFRIFY----EARKLQSKAIIQLNNELSSGEITCHLNQSVYILEVST 513
            ||     .:|.|.:::.:.|..||    ..|||      ...:.|..||:.....:..||:.:.|
Mosquito   549 SF-----AIPQEFEKSIRLFEEFYHINFSGRKL------TWLHHLCHGEMKLSFEKRNYIVTMQT 602

  Fly   514 LQMAVLMLFNRHERFTEQELVTALGVELETLQ---EALKQIKFLVYIE--VNKVNYIEINMDFTN 573
            .|||:|::|...:::|.:||.|:|.::.|..|   ::|.:.|.|:..|  :|....:.||::::|
Mosquito   603 YQMAILLMFENTDKYTCKELQTSLQLQQEIFQRHLQSLVEAKILLLNEEKMNDDTEVSINVNYSN 667

  Fly   574 RKRRLFCNEPLPRKMRKIEEKSEIELKIR-----RDKQVDAAIVRIMKGQKQLEYSELISLVYEE 633
            ::.:......|.:     |...|:|..:.     |...:.||||||||.:|.|.::.||..:..:
Mosquito   668 KRTKFKITTNLQK-----ETPQEVEHTMNAVDEDRKMYLQAAIVRIMKSRKVLRHNTLIQEILSQ 727

  Fly   634 LKDRVKPQVSFIKKRLDYLVEREYLER-DNYYNIYRYL 670
            .|....|.||.|||.::.|::::|:|| .|..:.|.|:
Mosquito   728 SKVSFAPNVSMIKKCIESLIDKQYIERTPNSGDEYSYV 765

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Cul6	NP_648620.1	COG5647	25..670	CDD:227934	168/751 (22%)
Cul2	XP_313365.5	None