DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Vps13D and Vps13c

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_729825.2 Gene:Vps13D / 39448 FlyBaseID:FBgn0052113 Length:3919 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_056840501.1 Gene:Vps13c / 363087 RGDID:1560364 Length:3740 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4292 Identity:851/4292 - (19%)
Similarity:1596/4292 - (37%) Gaps:1051/4292 - (24%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MLRDLITWVLNTYLGKYLENLNSAQLSVALLSGEVELENIPIRKDALRSFNLPVEVTAGSIRKIK 65
            :|..::..:||.:||.|:||||.:||.:.:..|.|.|:|:.|:::||...::|.:|.||.|.|:.
  Rat     2 VLESVVADLLNRFLGDYVENLNKSQLKLGIWGGNVALDNLQIKENALSELDVPFKVKAGQIDKLT 66

  Fly    66 LQIPVRQFRTSPWCISIEGLFCIICPKNLDNWDYEKEK--LQDLEYK------LAVLDTAEAGWR 122
            |:||.:.........::|||:.::.|.....:|.|||:  |||::.|      .|:...||.|..
  Rat    67 LKIPWKNLYGEAVVATLEGLYLLVVPGASIKYDAEKEEKSLQDIKQKELCRIEEALQKAAEKGAH 131

  Fly   123 SEKGKQMESYYFSSYNNWLK-----------------------------YGTNMATNIIDNIELK 158
            .|....:||..:.......|                             :...:||.:|.|:::|
  Rat   132 GEFMYGLESLLYKDVKPGRKRKKHKKHFKKRFKGLDRSKDKPKEAKKDTFLEKLATQVIKNVQVK 196

  Fly   159 ISDVHFRFEDIVDTGKSKICTGIKIGSLTAQSCDCDWT----NGSYKMNNNEMNYKLVELKELSV 219
            |:|:|.::||.|...:..:..|:.:...:..:.:..||    |.:.|     :.||||:|..||.
  Rat   197 ITDIHIKYEDDVTDPERPLSFGVTLREFSLLTTNEHWTPCILNEAEK-----IIYKLVKLDSLSA 256

  Fly   220 YWDLLHEDIKCQSY--SNQEILEKMHSTCELRS-------HNFIIKPICATAR-WKRDKCQQVIR 274
            ||::    ..|.||  |.:.||:::  .||:.:       |.:|.:||.|:|: :.....:...:
  Rat   257 YWNV----GCCVSYRGSREHILDQL--KCEILTSTNIPPDHQYIFQPISASAKLYMNPGAESEFK 315

  Fly   275 TKDKPRVSCELLVPEVVIDISKVQRLQMLDKLSEIRQVKEVRQYRLKRPTCTVESNPIAWWKYA- 338
            |   |::...:.|..:.|:::|.|.|.|:|.|..:..:.....||..||...:.::...||||| 
  Rat   316 T---PKLDGNVEVQNIAIELTKPQYLSMIDFLESLDYMVRNAPYRKYRPCLPLHTDCRQWWKYAI 377

  Fly   339 -----------TICHGFDFKKNEEKWLMLKENLRYMLLYKSIILNPNENLSAADKEFKAYIESDR 392
                       |....::..||..:  :||.   |.:.||:.:..     :...:|.:..|:...
  Rat   378 DSVLEVHIRRYTRPWSWNNIKNHRQ--LLKS---YKMAYKNKLTQ-----TKVSEEIQKQIQDLE 432

  Fly   393 K---ISDLTIMRRICFEKVFTKGFAF-ESQNEQGKNMLFHWFPNWMGWYANSPSTPNNEQDESLK 453
            |   :.::.::|:....:|...|... :..:|.|:..  .||..:.|    .......:::.|:.
  Rat   433 KSLDVFNIILVRQQAQVEVIHSGQKLRKKSSEAGEKR--GWFSGFWG----KKECKKRDEESSVP 491

  Fly   454 HLEDDILVALENSLQNSSDLKSDAVFGH----FSIKLLKGLV-------ILQTEDKLNDGRN--K 505
            ...||::...|..       |.....|:    :::.|.|..|       :|.|...:.:.||  :
  Rat   492 ETIDDLMTPEEKD-------KLFTAIGYSENAYNLALPKQYVAHILTLKLLSTSIVVRENRNVPE 549

  Fly   506 SMEMQFNNFSAYLQLSPQLTSYTVGISLQEVYLIDKTSSDTMHNYLIKPQTGNTATPNQLVKNAA 570
            .:.:|.......:...|...:..:...|:..|:......|.:.:  :....|:|.  :.|:|   
  Rat   550 ILRIQIIGLGTQVSQRPGAQALKIEAKLEHWYVTGLRQQDIVPS--LVASIGDTT--SSLLK--- 607

  Fly   571 LQEDILFQLQYENCNHLRFQLNIKSKGLDLIYNEDAIQWLLDFLADSNSFKYSPRNRVAKKTDFM 635
                |.|:...|| :.....|.::|:.:::||:...|..:::|.   .|.|.....::...|  :
  Rat   608 ----IEFETNPEN-SPADQTLIVQSQPVEVIYDAKTINAVVEFF---QSNKGLDLEQITSAT--L 662

  Fly   636 KNWNEMFSGNEV-------NRKIWMFEIEIFAPRIIFLE---NYKVSNSLMVLLDFGKLEMRKME 690
            ....|:.:....       .||:....|.:....:|..:   :::.||  :::||||..::.   
  Rat   663 MKLEEIKARTATGLTHIIETRKVLDLRINLKPSYLIIPQTGFHHEKSN--LLILDFGTFQLN--- 722

  Fly   691 VKRVIPVIESAVTENTSDDDETYLTPCSTPPASEKSGSESPTLLENPKTESFLNKNVQLEYVLHN 755
                                            |:..|::..|             |..||.:: :
  Rat   723 --------------------------------SKDQGAQKTT-------------NSSLEEII-D 741

  Fly   756 KIYDKYLINFTNLQVLVCKYEERWQAC-LKTSSNFHLIDKFNINLTLEQRNIFTVDPEYPSFMLF 819
            |.|||:.:...::|:|..|..|.|:.| .:..|..|::...:|::.|.:..: ..|.....|.:.
  Rat   742 KAYDKFDVEIKSVQLLFAKAGENWKKCRFQHPSTMHILQPMDIHVELAKAMV-EKDVRMARFKVS 805

  Fly   820 GTCPTILIHGNEELINNCCNIMK--------------------PIIK---------------ASK 849
            |..|.:.:..:::.|.:...::.                    |::.               ...
  Rat   806 GGLPLMHVRISDQKIRDALCLINSIPLPQKSSTQSPERQVASIPVLSGGTKVLLGTSLLLDGVES 870

  Fly   850 EMENIY--------RGGNTIYASERIKNLAE---DDRSRVVIEFVMDQLVIEMQSTERSIAELQI 903
            |.::.|        :....:.||| ::..||   ::...::::|.:.::|:|             
  Rat   871 ESDDEYFDAEDGDSQAARPVKASE-LRKAAEVPNEELVTLLLKFEIKEVVLE------------- 921

  Fly   904 IGARAGLTKEPHETNISMSVHGLLLVDAIQSFGPD-----FELLVASH-RHVGMD--SLSGSLKH 960
                  |||:..|..       .:||..:...|.:     |:|...|: |.:.:|  .:.||.|.
  Rat   922 ------LTKQQKEEE-------TILVFNVTQLGTEATMRTFDLTAVSYLRKISLDYHEIKGSRKK 973

  Fly   961 SAIVSPTSPGSPNFFDRATSPHMITKAVQNIKMGDRSTEFCDDEDSTALISVDIKIVPPNESNSM 1025
            ...:..:|       ||   |.:....|:.||:......|....:.|.                 
  Rat   974 PIHLVSSS-------DR---PGLDLLKVEYIKVDRNGPSFQTTFEKTE----------------- 1011

  Fly  1026 QLHTTSITFNSLDIIANQDTIIEILNFAKRTLLAQNIFPSESPES--PKEA---TE----APVDV 1081
              .|..:.|:||:::.....::..||:      ...:.||:|..:  .||.   ||    :|:..
  Rat  1012 --QTVKVAFSSLNLLLQTQALLSSLNY------LTTVIPSDSQNAGVAKEVQTITEKQKNSPLQK 1068

  Fly  1082 VDQVDHKSHNEIFFDFF-RLNILLLYTIKRDKFNVGRKVGTVTLTEAKI-----NASFQS-DLSI 1139
            | .|..:..:.|.|..| :||...: |:..:|.|:         .|.||     :.|.|| ..|:
  Rat  1069 V-MVPSRDSDVIGFRLFAKLNAFCV-TVCDEKSNI---------AEIKIQGLDSSLSLQSKKQSL 1122

  Fly  1140 IGSLGGIQVIDITSEAFCHPRILSVGRDQILRASDTNKQTVLSQLSNEIYSNN---YNEETKSDE 1201
            ...|..|.|.|:..:. .|.:.:|:                   :.||::..|   |.:.|:.|.
  Rat  1123 FARLENIIVTDVDPKT-VHKKAVSI-------------------VGNEVFRFNLDLYPDATEGDS 1167

  Fly  1202 SDAISFQSHWSDKTTC--TFQMRMASASYTHCPRFLRDVNACITYF---KRSLREFATSIGNKAT 1261
                     ::|.:|.  ...:.:......:..:||..:.:.:..|   |.:|.........||.
  Rat  1168 ---------YTDMSTVDGVVALHVGCIQIVYLHKFLMSLLSFLNNFQVAKEALSAATAQAAEKAA 1223

  Fly  1262 DMAKEFVQQVRAVEQIGPVYPQRNRQDNWLDIIISSPIIILPISNTSTNVLIANLGKISCSN--A 1324
            ...|:..|:...|.               :||.:.:|:|::|.|:.|||.::.:||.|...|  :
  Rat  1224 TSVKDLAQRSFRVS---------------VDIDLKAPVIVIPQSSLSTNAVVVDLGLIRVHNQFS 1273

  Fly  1325 VKCDSDEFN----ESYTIEIKNTYVYSLNIDEGEYSFNVHPAKNKDAIPILH----DTAITLQLY 1381
            :....|..|    :...:::....:....|..|.    .||     .|.:||    :..:...|.
  Rat  1274 LVSGEDAVNPPVIDKMKVQLTKLKLCRTAIQSGV----SHP-----DIQLLHPINLEFCVNRNLA 1329

  Fly  1382 AGYSDDNDEDKQLNRFSIKGSMVEALKVSLNRKQ----YELLLESIRYATNFSNEVLNESDELDQ 1442
            |.:.      .::....|||.: :::.||||::.    :.:|.|::..||   .::......:.:
  Rat  1330 ANWY------HKVPVVEIKGRL-DSMNVSLNQEDLNLLFRILAENLGEAT---EDIDKGKPRIQE 1384

  Fly  1443 NGDIEPTANIDAESIISTTIQFSVPVFQINLQNEYHNDLINLTFKNFNVKHISKGFDKDVEVVLK 1507
            .|..:...::.....:.||  ..||..::  :.....|:||:.. ||.:|.:.....|..|  .|
  Rat  1385 IGKTKACQDVSTPQDVHTT--QGVPAARV--EETRPVDIINVLL-NFEIKEVVVTLMKKAE--KK 1442

  Fly  1508 SVLMEDLKSDLTSPFRNMVTSVDLEQKIKKNEMTSSS--------CPDLPSYCNSLKNRSSSVPS 1564
            ...:.:||          :..:.:|.|:|.::||:.:        |.|.|.        |...|.
  Rat  1443 GNPLHELK----------ILHLGMEAKVKAHDMTAKAYLRKITMRCFDFPD--------SKGEPL 1489

  Fly  1565 CFYNHMQVKVFGGDQKYTSSNKNELGKKKESQTLVIYKSHT-GRSAQ--NGKLEQTSSIQFNCLN 1626
            ...|...|           |:...|       |::..|:.: |...|  :...:|...:.|:.|:
  Rat  1490 HIVNSSDV-----------SDGTLL-------TMLFIKADSDGPDFQTIHDNTKQKLKVSFSSLD 1536

  Fly  1627 LAICVERWYTIFDFF--GLVSVDNVNEKYPEEMK--------LVEKHI------DKVCSKLKVSI 1675
            |.:.:|...::.||.  .:.|.|:.:.:...|:|        |..|.:      |....|:...:
  Rat  1537 LVLHLEALLSLMDFLSCAVPSPDSSSSETESELKPLVGGSRSLAVKAVPSSSEGDVFDLKVTAEL 1601

  Fly  1676 RSFNFTLIRNESLLSRVNVSNAVFMILQDPYSKIVEGCLGSVSVNDLTKYGNIYKQKFLTSGTEA 1740
            .:||..:...:|.::.:.:......:........|...|.::.|.::... :|:|:.....|.|.
  Rat  1602 NAFNIFICDQKSNIAEIKIHGMDASVSMKAKQTDVFARLKNIIVMNVDSL-SIHKKAVSILGDEV 1665

  Fly  1741 LNFVYKKKLVDLEALNTLD---TDSTLRINMSAVHYIHTKRFSTELHVFVKDLL----QLQTPVI 1798
            ..|.........|..|..|   .|..|.:.:..:..::..:|...|..|:.:..    .|.|..:
  Rat  1666 FRFQMSLYPDATEGENYGDMSKVDGRLGLKVGCIQIVYVHKFFMSLLSFLNNFQAAKEALSTATV 1730

  Fly  1799 RKLKKHGSE-QNMRPSKMKLVIQAD--SPVIVLPSSYNRNEVIIAYLGQFSLKNSFHFASDNNII 1860
            :..::..|. :::.....:|::..|  :|||.:|.|.....|:||.||...::|.|...|    :
  Rat  1731 QAAERAASSVKDLAQKSFRLLMDIDLKAPVITIPQSSVSPNVVIADLGLIRVENKFSLVS----V 1791

  Fly  1861 SKMSATPSKDEILDVMRIDLVNINLFSGERSSMKAKADQEKDRIIIADMNFLRLGQPFFNESCFL 1925
            .::|..|    :.|.|.:.|..:.|   .|:.::|.:.|. |..|:..:|.|             
  Rat  1792 EQLSLPP----VADKMSVQLTQLKL---SRTVLQADSPQH-DIEILKPVNML------------- 1835

  Fly  1926 HLQLERNLSADAHRVCPDISVQGTFSKLSGIINIQQYKLIRSFLNNNIGEQTDDIYMNYHNNSCT 1990
             |.::|||||..:...|.:.:.|....:...::.....::...|..|:||.:.............
  Rat  1836 -LSIQRNLSAAWYTQIPGMEITGKLKPMQVALSQDDLTVLMKILLENLGEASSQPSPTQFAQEAA 1899

  Fly  1991 SIER--------LSTINLM-PKNEVSKIVSILISIRILLEDVSLLLALNTSQSAAIEPLA----- 2041
            .::|        |...:|. ||....:.|::......    .||.:.|..|.......|:     
  Rat  1900 RVKRDTRSGPDCLKEQDLAEPKPPGDQTVTLQFDFHF----DSLSIVLYNSDGCQESRLSFHNDS 1960

  Fly  2042 ------CIHFLKSTLEIDLFSDGSQDIDLISSNILIVDERNESDKSNENVFKNILEPSKKEVRIE 2100
                  .:|.:.|..:  :|.|||.::.|......:.|.|...:::...:.      .||..:..
  Rat  1961 FRLGELTLHLMASAGK--MFKDGSMNVSLKLKTCTLDDLREGIERATSRMI------DKKNDQDG 2017

  Fly  2101 NSVQVEVHCRKKATFSKYTIMLNNMRVFALLSFLDQLKSY-----------LQEDSPAPVVNNAA 2154
            ||..::|...:....|:...:|:.:.|.|.:.||..:..:           :.:|...|....|.
  Rat  2018 NSSMIDVSYSQDKNGSQIDAVLDKLYVCASVEFLMTVADFFIKAMPESPENIAKDIQIPSRKTAP 2082

  Fly  2155 NQIAQKPQIDTSISTEYVVN--ITDSEIIFAEECSRLDSNAIILKSTTVICYKPNSNIVPLSLDI 2217
            .::  |.:.|.|:.....:.  |||.|::|....::.|:.|:.......:....:.....:...:
  Rat  2083 GRV--KMEKDDSVKPNMTLKAMITDPEVVFVANLTKADAPALTASFQCNLSLSTSKLEQMMEASV 2145

  Fly  2218 NHLEIFSCTLDAEE--ESALSIIDPFTLIIELRSNC--------LNILIQKHLNIRLSYVDVK-L 2271
            ..|::.:|....|.  :|..:::.|.:|.:|   .|        :|::: |...|::|.:.:. :
  Rat  2146 RDLKVLACPFLRERRGKSVTTVLQPCSLFME---KCTWASGKQNINVMV-KEFVIKISPIILNTV 2206

  Fly  2272 FSRMARLLPTQTSRPKNVISKADSDLEKAAPLVAMGFEISDCLYAMQ----INNWRINDAAIWLS 2332
            .:.||.|.|          ...:.|.|..|       |..|.|:|::    .|:|.:.......:
  Rat  2207 MTIMAALSP----------KTKEEDQEDTA-------EEKDSLWAIKPITDYNSWFLGVDMATEA 2254

  Fly  2333 QQKQNTYRNPALEMKTAVVDASLISVFIIDDCMDADVPLLEVSLSKFLLNFTFQTQDPNPKETNI 2397
            .:....:.:..:| :..||....:.|.:........|||| ::.|:|              ..||
  Rat  2255 TESFRDFEHTQIE-ENCVVAVESVQVTLECGLGHRTVPLL-LAESRF--------------SGNI 2303

  Fly  2398 RHYS---LGNIDTEVSVNYYNRRLSGWEPVAE------TWESNLNWKYTKGHLDNKK-------- 2445
            ::::   ....|..:.|:|||...:.|||:.|      .|...||.|  |..|.:|.        
  Rat  2304 KNWTSLMAAAADMTLEVHYYNETHAVWEPLIERVEGKTPWSLKLNVK--KNPLQDKSLMPGDDFI 2366

  Fly  2446 ---RFEIGISSKQMLKLNVTSTFIELFHMVLKNWTNDFNDNGAKNF----RQRSPFIPFALQNLS 2503
               ...:.|||...:.:.::.:.:.:|:    |....|::..|..|    :.|:   ||.::|..
  Rat  2367 PEPHTAVHISSGSTMNITISKSCLNVFN----NLAKGFSEGAASTFDYSLKDRA---PFTVRNAL 2424

  Fly  2504 GTPLLFKP--IYAPLGDLTRSDL------QQVELIKNWYSVQPNETKTFDFSQKSKLRHVHSHQL 2560
            |.|:..:|  ....:|...:||:      |.:||  .:.|::|        |::.||..:...:.
  Rat  2425 GVPMKVQPNRNLRVMGSPEKSDVYDVGAGQHLEL--EYASLEP--------SRQGKLSLLSRQES 2479

  Fly  2561 NLHQIFVQIHGWTLIGPISVDKVGMFFRTTKLDSQFLTKSRIV-FDISLIGSAQKLIKVKSSLGV 2624
            ....:....||:|.:..:.|.:.|......:..|...:.|.:| .|.:   ...|::.::|.|.:
  Rat  2480 TFFTLTFVPHGYTEVASVPVARPGRRLYNVRNPSASRSDSVLVQIDAT---EGNKVVTLRSPLQI 2541

  Fly  2625 IN---------KLDRNVFLKMTLKGTHSDGLSSISVIKPNDELSVPLKFIDASLYVAHNTSESDA 2680
            .|         |..:||.|           |..|.::||.:|..|||......|||....|....
  Rat  2542 KNHFSIAFIIYKFVKNVKL-----------LERIGIVKPEEEFHVPLDSYRCQLYVQPAGSLEQQ 2595

  Fly  2681 YEDTGFSNEEILWK--ACGKDDTRQLLAGYDTNKSILYTFVN-------ISREIYHCKEQNLPGH 2736
            |..   |...|.||  .....:.|.:|.......:.|...||       :|....|.::.: |.:
  Rat  2596 YTQ---STTYISWKEELHRSREVRCMLQCPAVEVNFLPLIVNTVALPDELSYIGAHGEDWD-PAY 2656

  Fly  2737 KITLLPPLKINNMLCCDLMF------KIHEHATG--------RINSSESVNIYNV---------- 2777
            .|.|.|||.:.|:|...:.:      :.||.|.|        || |.|.:.:..|          
  Rat  2657 IIHLYPPLTLRNLLPYSIRYLLEGTAEAHELAEGSSADVLHSRI-SGEIIELVLVKYLGKNWNGH 2720

  Fly  2778 -NICQPLNLSITLDNFQL-------SGQLKIPVSHRGVIEPKLKLIDIQKRELHVRVSIQSVPGK 2834
             .||.      ||..|.|       :..|.:.:|                  :|||..     |.
  Rat  2721 FRICD------TLPEFFLVCFSSDTAEVLTVDLS------------------VHVRRI-----GC 2756

  Fly  2835 GMELYISAPVWIINKTGLPLIYKQEGTSHTAAGQFEEHETARQVAPLMFSFSDQE--GSPALVLR 2897
            .|||.:.:|.|:||||...|.|:.|.........|.:        .::|||..:.  ....:.|:
  Rat  2757 RMELSVFSPYWLINKTSRVLQYRSEEIHVKHPADFRD--------IILFSFKKKNIFSKNKVQLK 2813

  Fly  2898 LGKAYGSNNMWCKSFSTHKDLADRDLRAENTKGSYAIGISVRRGRGLYACTTFVTLSPRFHLHNR 2962
            :     |.:.|...||.....:...::...|...|.:|:|::...  :..:..|||:|...:.|:
  Rat  2814 I-----STSAWSNGFSLDTVGSYGCVKCPATTMEYLVGVSIKMSS--FNLSRIVTLTPFCTVANK 2871

  Fly  2963 SGYKLEFMQLCDIVNYDRPDPRKIISAPVDCNFAFHWPNWDQEQI---ICVRIPEIECCCWSKGI 3024
            |..:||..::..  :...|..:....|..:| ..| ||    |.:   :|||:...|        
  Rat  2872 SSLELEVGEIAS--DGSIPTNKWHYIASSEC-IPF-WP----ENLSGKLCVRVVGYE-------- 2920

  Fly  3025 PIKDVQSLYINVRNEWGEMFFLR-------LEIISKDATFILLFTDARTLPPPIRIDNCSE-VVI 3081
              ...:..:.| |.:.|.:..|.       ::|.:.:.:.::.|:|......|..|.|.:: .|:
  Rat  2921 --GSSKPFFYN-RQDNGTLLSLEDLNGGILVDINTAEHSTVITFSDYHEGSAPALIMNHTQWNVL 2982

  Fly  3082 NFSQLRSKPVWITPVRPQSSLSYVMDDPLGQQILLMEAPGGNMIEFPINNKNNIKKTLTYTNFIY 3146
            .:.|..|:...:  :.|..:..:...||.|.:                      |.|.:|.    
  Rat  2983 TYKQSGSQEALV--LLPGETRLFAWADPTGTR----------------------KLTWSYA---- 3019

  Fly  3147 IAFQGTFERSNEEENTHRQLVLGVRGKKVVIVEKNSGDRSQLWLMNSNGQLEHEGSTPPIQTNDA 3211
                                             .|.|:..  .|.:..||..:          ||
  Rat  3020 ---------------------------------ANFGEHD--LLKDECGQFPY----------DA 3039

  Fly  3212 N-AVRLVLDLEKAPNPMEFTNLVVRTPNKQRVTTQTWRFENGRLMCHANMCVQSRFGESGLKPNY 3275
            | .:..|..|:.....:.||:.|                                          
  Rat  3040 NIQIHWVSFLDGRQRVLLFTDDV------------------------------------------ 3062

  Fly  3276 EAVVGR---TENRASSSKQIPIGQHIVAQKLRPGSGQLELSTKMDGPISTIEICDIKIKQN-SVF 3336
             |:|.:   .|....:..::.:..|.:...|.....:.|:|  ..|..|:..:.::|.||. ..|
  Rat  3063 -ALVSKALQAEEMEQADLEVALSLHSLGLSLVNNENKQEVS--YVGVTSSGVVWEMKPKQKWKPF 3124

  Fly  3337 LTPDLLWMHASLNNRQIT--DKGKVSFVHEYLINVELVKGIGISIIARKPCEEIMFISLDHINCD 3399
            ....::.:..|. .:.:|  |:|.:.....:.:|.:.|. :.:.:..|.|.:...   |..|..:
  Rat  3125 SQKQIMLLEQSY-QKHLTSQDRGWIKLDSNFEVNFDKVP-MEMRLPLRCPIKRDF---LSGIQVE 3184

  Fly  3400 IVQSALENSLDLNIAYIQIDNQLLDAVSPIALH--TQTSNDLEETQNAVVLKLKMLPSPNK--NA 3460
            ..||..:.||...:.::|:||||...:.|:..|  ....:...:::....:.:.::...|:  ..
  Rat  3185 FKQSPHQRSLRARLYWLQVDNQLPGTMFPVVFHPVAPPKSIALDSEPKPFIDVSVITRFNEYSKV 3249

  Fly  3461 IIFKYLTLDLKPSTASLEEKLILKV-ASFLGYGKINRQNLSVQYQFENTDD--------KPFLQD 3516
            :.|||..:        |.:::.||| ..|||         :|...|..|.|        |...||
  Rat  3250 LQFKYFMV--------LIQEMALKVDQGFLG---------AVIALFTPTSDPEAERKRTKLIQQD 3297

  Fly  3517 MKRY----------------YFENLSIGATQVRLSAFTSS---------KLPVELHETK---KAL 3553
            :...                :||:..|...::.||....|         :..:.:|...   |::
  Rat  3298 IDALNTELLESSMSDMSILSFFEHFHISPVKLHLSLSLGSGGEESDKEKQEMIAIHSVNLLLKSI 3362

  Fly  3554 GLTLIKFEDALIELDRYSDKLHFETMDVYRKELKKHYINQ-VKWHAAAILGSVDFLGNPLGFAND 3617
            |.||...:|.:.:|..|..:..|...|.....:.:||..| :|.....:|| :|.||||.|....
  Rat  3363 GATLTDVDDLIFKLAYYEIRYQFYKRDQLMWSVVRHYSEQFLKQMYVLVLG-LDVLGNPFGLIRG 3426

  Fly  3618 LSEGVSGLIFEG-----------------SVKSLVKNVTHGISNSTAKLTETLSDSLGKVVLDDH 3665
            |||||..|.:|.                 .|:||..:...|.:...:::|.::...|..:.:|..
  Rat  3427 LSEGVEALFYEPFQGAVQGPEEFAEGLVIGVRSLFGHTVGGAAGVVSRITGSVGKGLAAITMDKE 3491

  Fly  3666 DNETRQRILELQSNTSGGHLAAGLKGLGFGLLGGVTSIVRHTYDGATSDGVPGFLSGLGKGLVGT 3730
            ..:.|:..:..|....|..||.|.||...|::||||.|:....:||..:|..||..|:||||||.
  Rat  3492 YQQKRREEMGRQPKDFGDSLARGGKGFLRGVVGGVTGIITKPVEGAKKEGAAGFFKGIGKGLVGA 3556

  Fly  3731 VTKPIIGVLDLASETASAVRETSRDSHRNAPERKRLPRCVTGAPGGLLPLYSNRQSKGQQYLYLI 3795
            |.:|..|::|:||.|...::..:..:...:..|.  ||.:  ...|::..|..::|:|...|.  
  Rat  3557 VARPTGGIIDMASSTFQGIQRVAESTEEVSSLRP--PRLI--HEDGIIRPYDRQESEGSDLLE-- 3615

  Fly  3796 NQ-KNFSEKIISYEPNLWSDKEARL----RLLVSTEYVRIFSLSDANPTIMFECHVSEILSCHPV 3855
            || |....:...:...:..:|.|.|    |.::..:.|.|.    .:.::.::|...:.| |.|.
  Rat  3616 NQIKKLEGEAYQFHCTVPGNKRAVLMITNRRVLFIKEVEIL----GHMSVDWQCLFEDFL-CPPG 3675

  Fly  3856 VT 3857
            |:
  Rat  3676 VS 3677

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Vps13DNP_729825.2 MRS6 1..>938 CDD:227376 214/1073 (20%)
VPS13 143..367 CDD:465309 64/249 (26%)
MRS6 <2039..>2694 CDD:227376 145/735 (20%)
SHR-BD 2836..3113 CDD:461974 61/289 (21%)
beta-trefoil_Ricin_VPS13D 3157..3308 CDD:467331 18/154 (12%)
MRS6 <3346..3802 CDD:227376 125/517 (24%)
Vps13cXP_056840501.1 MRS6 3..>1363 CDD:227376 317/1598 (20%)
VPS13 181..412 CDD:465309 64/249 (26%)
MRS6 <1236..>2606 CDD:227376 302/1560 (19%)
SHR-BD 2758..>2936 CDD:461974 47/211 (22%)
MRS6 <3178..3650 CDD:227376 121/495 (24%)
VPS13_C 3317..3494 CDD:465310 42/177 (24%)

Return to query results.
Submit another query.