DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Vps13D and Vps13d

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_729825.2 Gene:Vps13D / 39448 FlyBaseID:FBgn0052113 Length:3919 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001382518.1 Gene:Vps13d / 313825 RGDID:1308403 Length:4390 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4526 Identity:1346/4526 - (29%)
Similarity:2143/4526 - (47%) Gaps:763/4526 - (16%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MLRDLITWVLNTYLGKYLENLNSAQLSVALLSGEVELENIPIRKDALRSFNLPVEVTAGSIRKIK 65
            ||..|:.||||||||||:.|||:.|||||||.|.|||||:|::||||:...||.||.||.|.|:.
  Rat     1 MLEGLVAWVLNTYLGKYVNNLNTDQLSVALLKGAVELENLPLKKDALKELELPFEVKAGLIGKVT 65

  Fly    66 LQIPVRQFRTSPWCISIEGLFCIICPKNLDNWDYEKEKLQDLEYKLAVLDTAEAGWRSEKGKQM- 129
            ||||..:....||.|||.||..|..|:.:.:::.|||||.:.|.|..:|...|..|:||:.:|. 
  Rat    66 LQIPFYRPHVDPWVISISGLHVIGAPEKIQDFNDEKEKLLERERKKVLLQALEERWKSERRQQKG 130

  Fly   130 ESYYFSSYNNWLKYGTNMATNIIDNIELKISDVHFRFEDIVDTGKSKICTGIKIGSLTAQSCDCD 194
            |||       |.....::.|.|::||||||.|||.||||.:.........||.|.:::.|     
  Rat   131 ESY-------WYSVTASVVTRIVENIELKIQDVHLRFEDGLTNPSHPFAFGICIKNVSMQ----- 183

  Fly   195 WTNGSYKMNNNEMNYKLVELKELSVYWDLLHEDIKCQ---SYSNQEILEKMHSTCELRSHNFIIK 256
              |.:.:.....|..|.:::.|.|:||     |:.|.   .....|:.|.|..:.|.|||::|::
  Rat   184 --NAANEPVQKLMRKKRLDVAEFSIYW-----DVNCTLLGDLPQAELQEAMARSMESRSHHYILE 241

  Fly   257 PICATARWKRDKCQQVIRTKDKPRVSCELLVPEVVIDISKVQRLQMLDKLSEIRQVKEVRQYRLK 321
            |:||:|..||:..::.:|::..||:.|::.:..:.:.:|::|..|::..|.|:.:.:...::|..
  Rat   242 PVCASALLKRNCSKEPLRSRHSPRIECDIQLETIPLKLSQLQYRQIMAFLKELERKERQVKFRKW 306

  Fly   322 RPTCTVESNPIAWWKYATICHGFDFKKNEE--KWLMLKENLRYMLLYKSIILNPNEN--LSAADK 382
            :|...|..|...||.:|...:.::.::..:  .|..|....|..:.|.....|..:.  |||.||
  Rat   307 KPKVAVSKNCREWWYFALNANLYEIREQRKCCTWDFLLHRARDAVFYTDRYFNKLKGGVLSADDK 371

  Fly   383 EFKAYIESDRKISDLTIMRRICFEKVFTKGFAFESQNEQ----------------GKNMLFH--- 428
            |....||.::...:|.|:|.:..::.:.:....||..|.                |..||.:   
  Rat   372 EEMCRIEEEQSFEELKILRELVHDRFYKQEELAESLREPQFDSPGASPGDPDGSGGSGMLQYLQS 436

  Fly   429 WFPNWMGWYANSPSTPNNEQDESL-----KHLEDDILVALENSLQNSSD-------LKSDAVFGH 481
            |||.|.|||..  .:|..:..|.|     :|...:.::..|.....::|       .|.|.||..
  Rat   437 WFPGWGGWYGQ--QSPEGKVAEGLTAESHEHWMPEDILGTEEFFDPTADASCMNTYTKRDHVFAK 499

  Fly   482 FSIKLLKGLVILQTEDKLNDGRNKS--MEMQFNNFSAYLQLSPQLTSYTVGISLQEVYLIDKTSS 544
            .:::|.:|.|.|..:::.....|:|  |:::|::.....:..|:..|..:.:.|..::|.|..:.
  Rat   500 LNVQLQRGTVTLLHQERGAAHANESAFMQLEFSDVKLLAESLPRRNSSLLLVRLGGLFLRDLATE 564

  Fly   545 DTMHNYLIKP---------------QTGNTATPNQLVKNAALQEDILFQLQYE-NCNHLRFQ--L 591
            .||...|:.|               ||.:....:|.  :||..::.:|::.|| |..|..|:  |
  Rat   565 GTMFPLLVFPNPQKEVGRVSQSFGLQTASEDRSDQY--SAADPDNPVFEMLYERNPVHSHFERRL 627

  Fly   592 NIKSKGLDLIYNEDAIQWLLDFL----ADSNSFKYSP--RNRVAK-------------KTDFMKN 637
            ::.::.|::|||..||:.:.||.    ..::.|.|..  ..|||:             |.:..:.
  Rat   628 HVSTRPLNIIYNPQAIKKVADFFYKGKVHTSGFGYQSELELRVAEAARRQYNKLKMQTKAEIRQT 692

  Fly   638 WNEMFSGNEVNR-KIWMFEIEIFAPRIIFLENYKVSNSLMVLLDFGKLEM-RKMEVKRVIPVIES 700
            .:.:..|:.:.. |.|...::|.||::||.:::...|.::|::|.|::.: ...|..|.....:|
  Rat   693 LDRLLVGDFIEESKRWTVRLDISAPQVIFPDDFTFKNPVLVVVDLGRMLLTNTQEDSRRKSGDDS 757

  Fly   701 AVTENTSDDDETYLTPCSTPPASEKSGSESPTLLENPKTESFLNKNVQLE-YVLHNKIYDKYLIN 764
            |..||...||| |.||.:|||::....:.|....:.|..........||: :::..::|::|.:.
  Rat   758 ASEENQFSDDE-YKTPLATPPSTPPPETNSSNGEKTPPFSGVEFSEEQLQAHLMSTQMYERYSLT 821

  Fly   765 FTNLQVLVCKYEERWQACLKTS-SNFHLIDKFNINLTLEQRNIFTVDPEYPSFMLFGTCPTILIH 828
            |.:|||:|.:..:.|:...... ...|:::|||::|.||:|.|:|.||:||..:|.|..|.:.||
  Rat   822 FMDLQVMVGRVRDNWKRVQDIDVGPTHVVEKFNVHLQLERRLIYTSDPKYPGAVLSGNLPDLKIH 886

  Fly   829 GNEELIN---NCCNIM-KPIIKASKEM--ENIY-----RGGNTIYASERIKNLAE-----DDRSR 877
            .||:.|:   ||..:: .|..|.|...  |.|:     ||.    ..:.:.||.:     :..:|
  Rat   887 INEDKISALKNCFALLTTPETKPSDTQFREKIFPQEGPRGS----LQDSVMNLTQSIVMLEQHTR 947

  Fly   878 VVI--------EFVMDQLVIEMQSTERSIAELQIIGARAGLTKEPHETNISMSVHGLLLVDAIQS 934
            .|:        ||.::.:.:.::|:.|.|:.|::.|..|...|.|::..:|::||||||||.:|:
  Rat   948 EVLVESQLLLAEFKVNCMQLGVESSGRYISVLKVFGTNAHFVKRPYDAEVSLTVHGLLLVDTMQT 1012

  Fly   935 FGPDFELLVASHRHVGMDSLSGSLKHSAIVSPTSPGSPNF---FDRAT-SPHMITKAVQNIKMGD 995
            :|.||:||:|||:::..|..:|||:.|...||.|  .||.   .|.|| :....|.:|       
  Rat  1013 YGADFDLLMASHKNLSFDIPTGSLRDSRAQSPVS--GPNVAFQTDVATLNDQSATTSV------- 1068

  Fly   996 RSTEFCDDEDSTALISVDIKIVPPNESNSMQLHTT----SITFNSLDIIANQDTIIEILNFAKRT 1056
             |.|....::..:||.::.:.| .:|..||.|.:|    |:..|:||||.|.:||:|::.|.:::
  Rat  1069 -SLEKILTKEQESLIKLEYQFV-SSECPSMNLDSTLQVISLQVNNLDIILNPETIVELIGFLQKS 1131

  Fly  1057 LLAQNIFPSESPE-SPKE-ATEAPVDVVD----QVDHKSHNEIFFDFFRLNILLLYTI-KRDKFN 1114
                  ||.|..: ||:. .|:....:::    |..::.:.|:..:..|||:|||.|: ..|...
  Rat  1132 ------FPKEKDDVSPQPLMTDLERSIMEQGTVQSTYEQNTEVAVEIHRLNLLLLRTVGMSDGER 1190

  Fly  1115 VGRKVGTVTLTEAKINASFQSDLSIIGSLGGIQVIDITSEAFCHPRILSVGRDQILRASDTNKQT 1179
            .|||:.|.::...|:|.|..|...:.||||.:|::|:|.|...:..::|:|       :....:.
  Rat  1191 HGRKIATASIGGTKVNVSMGSSFDMNGSLGCLQLMDLTQENVKNQYVVSIG-------NSIGYEN 1248

  Fly  1180 VLSQLSNEIYSNNYNEETKSDESDAISFQSHWSDKTTCTFQMRMASASYTHCPRFLRDVNACITY 1244
            ::|.:.  .:.:.:.....:..::|:||......|..|...::|||..|.|..:||:::...:..
  Rat  1249 IVSDIG--YFESVFVRMEDASLTEALSFTFAEKSKQECFLNLKMASLHYNHSAKFLKELTLSMDE 1311

  Fly  1245 FKRSLREFATSIGNKATDM----AKEFVQQVRAVEQIGPVYPQRNR-----QDN----------- 1289
            .:.:.|....|...|.|.:    ..|:.:.|...|.     |::.|     ::|           
  Rat  1312 LEENFRSMLKSAATKVTTVLATKTAEYSEMVSLFET-----PKKTRDPFVLEENEIYGFGLPSPR 1371

  Fly  1290 ------WLDIIISSPIIILPISNTSTNVLIANLGKISCSNAVKCDSDEFNESYTIEIKNTYVYSL 1348
                  .|:|.|.||::.:|....|..:|:.:||:|...|.|..|.:..::...:|||:..:|||
  Rat  1372 SDTVKLILNINIESPVVSIPRRPGSPELLVGHLGQIFIQNFVAGDDESRSDRLQVEIKDIKLYSL 1436

  Fly  1349 NI-----------------------------DEGEYSFN-----------VHPAKNK------DA 1367
            |.                             :|..::.:           .|...|.      :.
  Rat  1437 NCTQLAGRDGAGPEVSRAFCPPSGSASVSSQEEAHFTRHDFFESLHRGQAFHILNNTTIQFKLEK 1501

  Fly  1368 IPILHDTAITLQLYAGYSDDNDEDKQLNRFSIKGSMVEALKVSLNRKQYELLLESIRYATNFSNE 1432
            |||..:|.:|..|      ..||....:...|:|..|..::|.|.:..||.:|:::        :
  Rat  1502 IPIERETELTFSL------SPDELGTSSIMKIEGKFVNPVQVVLAKHVYEQVLQTM--------D 1552

  Fly  1433 VLNESDELDQ-----------NGDI-------EPTANIDAESIIS-------------------- 1459
            .|..|::|::           |..:       ||||......:.|                    
  Rat  1553 NLVYSEDLNKFAASAPPSPCPNSPLPPLSSCGEPTAEKKENGLFSHSSFSSASQKSLSVKESKAF 1617

  Fly  1460 TTIQ--FSVPVFQINLQNEY---HNDLINLTFKNFNVKHISKGFDKD------VEVVLKSVLMED 1513
            |.||  |.:...|:.|..:.   ...|::|.|::|.|:     |.||      :::.|:|:||||
  Rat  1618 TQIQANFCISELQVQLSGDLTLGAQGLVSLKFQDFEVE-----FSKDHPQTLSIQIALRSLLMED 1677

  Fly  1514 -LKSDLTSPFRNMVTS--VDLEQKIKKNEMTSSSCP-----DLPSYCNSLKNRSSSVPSCFYNHM 1570
             |:.:..|.:::::.|  ......:.:.|..|.|||     :.|:...||.:.....|:.|..:.
  Rat  1678 LLEKNPDSKYKSLMVSRGAPKPSSLAQKEYLSQSCPSVSCVEYPAMPRSLPSHMEEAPNVFQLYQ 1742

  Fly  1571 ---------QVKVFGGDQKY-----TSSNKNE----LGKKKESQTLV------IYKSHTGRSAQN 1611
                     |.:|  .|:.|     .|.:.:|    :||.|...:||      :.|.|...|:..
  Rat  1743 RPISTCRKKQKEV--QDKSYPQTPPPSPSVDEPKVLVGKSKFDDSLVHINIFLVDKKHPEFSSSY 1805

  Fly  1612 GKLEQTSSIQFNCLNLAICVERWYTIFDFFGLVS-VDNVNEKYPEEMKL----------VEKHI- 1664
            |::.::..:.||||::.|.::.|..|.||||:.| .||...|.|.|..|          ::..: 
  Rat  1806 GRINRSIDVDFNCLDVLITLQTWVVILDFFGIGSTADNHAMKVPPEGPLQNVKAEATASMQSELQ 1870

  Fly  1665 DKVCSKLKVSIRSFNFTLIRNESLLSRVNVSNAVFMILQDPYSKIVEGCLGSVSVNDLTKYGNIY 1729
            :.|.|||.:.:.|.:..|.:..|.|::.|||..|..:........::|.:||:|::|||.:|::|
  Rat  1871 EPVNSKLDLKVHSLSLVLSKATSELAKANVSKLVAHMEMIEGDLALQGSIGSLSLSDLTPHGDLY 1935

  Fly  1730 KQKFLTSGTEAL---NFVYKKKLVDLEALNTLDTDSTLRINMSAVHYIHTKRFSTELHVFVKDLL 1791
            :::|.|||.|||   .|.|.:.    :.|...:.|..:.:.|::|.|:||:||..|:..|::...
  Rat  1936 RERFTTSGEEALIFQTFKYGQP----DPLLQREHDIRVSLQMASVQYVHTQRFQAEVVAFIQHFT 1996

  Fly  1792 QLQTPVIR-KLKKHGS---EQNMRPSKMKLVIQADSPVIVLPSSYNRNEVIIAYLGQFSLKNSFH 1852
            |||..:.| :....|.   :|..|.|::.|.|:|.:||:::|.|...|.:|:|.||:..:||.|.
  Rat  1997 QLQDVLGRQRAAVEGQTVRDQAQRCSRILLDIEAGAPVLLIPESSRSNNLIVANLGKLKVKNKFL 2061

  Fly  1853 FA--------SDNNIISKMSAT----------PSKDE---------------------------- 1871
            ||        .|...:...|.|          ||.::                            
  Rat  2062 FAGFPGTFSLQDKESVPSASPTDTMKHSMKKMPSTEDPKGPQVQGLFMMPPAGMGLGSLKSDFVP 2126

  Fly  1872 ---------------------------ILDVMRIDLVNINLFSGERSSMK-AKADQEKDRIIIAD 1908
                                       :||.:.:||.::::|:.||...: :||.:.....:|..
  Rat  2127 SASIKQRGQQAVPPISQSSSSPEDHVCLLDCIVVDLQDMDIFAAERHPREGSKASESSSGDLIFP 2191

  Fly  1909 MNFLR-LGQPFFNESCFLHLQLERNLSADAHRVCPDISVQGTFSKLSGIINIQQYKLIRSFLNNN 1972
            ..|:| .|.....|.|.|.||:||||..:......||||.|:.|.:...:::.:|||||..|.||
  Rat  2192 SYFVRQTGGSLLTEPCRLKLQVERNLDKEISHTVADISVHGSLSSVHCSLDLCKYKLIRGLLENN 2256

  Fly  1973 IGEQTDDIYMNYHNNSCTSIERLSTINLMPKNEVSKIVSILISIRILLEDVSLLLALNTSQSAAI 2037
            :||..:|....|....    .|:.|:   ...||...:..||.    :.:|||.|. :.......
  Rat  2257 LGEPIEDFMRPYDLQD----PRIHTV---LSGEVYTCMCFLID----MVNVSLELK-DPKGKEGT 2309

  Fly  2038 EPLACIHFLKSTLEIDLFSDGSQDIDLISSNILIVDERNESDKSNE---NVFKNILEPSKKEVRI 2099
            ..||...|.|..|..:.||:.::.|:|:|.:::..|.|....|.:.   |||..|.:|||.....
  Rat  2310 GSLARFDFKKCKLLYESFSNQTKSINLVSHSMMAFDTRYSGQKPSHGMTNVFNCIFQPSKSSSAT 2374

  Fly  2100 ENSVQVEVHCRKKATFSKYTIMLNNMRVFALLSFLDQLKSYLQEDSPAPVVN-------NAANQI 2157
            :.|:|:|:|.|.....|.:|::|||:|||.:..:|..:..:|...|.....|       ||:::.
  Rat  2375 QGSIQIELHFRSTKDSSCFTVVLNNLRVFLIFDWLLLVHDFLHTPSDVKKQNVTPARYRNASSES 2439

  Fly  2158 AQKPQ-IDTSIST-------------EYVVNITDSEIIFAEECSRLDSNAIILKSTTVICYKPNS 2208
            |..|: :.:.:.|             |..||:|.:|.:..|:.|..|:||||||.|||:.|||..
  Rat  2440 AVVPKTVKSGVVTKRSSLPVSNERHLEVKVNVTGTEFVVVEDVSCFDTNAIILKGTTVLTYKPRF 2504

  Fly  2209 NIVPLSLDINHLEIFSCTLDAEEESALSIIDPFTLIIELRSN--------------------CLN 2253
            ...|.|..:..:|:|||.|..|:::||||:||..:.:||..|                    .|.
  Rat  2505 VDRPFSGSLFGIEVFSCRLGNEQDTALSIVDPVQIQVELVGNSSYQNSSGLMDAFNSEDFPPILE 2569

  Fly  2254 ILIQKHLNIRLSYVDVKLFSRMARLLPTQTS--RPKNVISKADS-------------DLEKA--- 2300
            |.:|. |:|||||.||:||..:|:.:|.|.|  .|.:...:|||             |:.:.   
  Rat  2570 IQLQA-LDIRLSYNDVQLFLAIAKSIPEQASAAAPDSAALEADSVSSNLPGASRIGEDVREGSRH 2633

  Fly  2301 ----------APLVAMGFEISDCLYAMQINNWRINDAAIWL-------------SQQKQNTYRNP 2342
                      |.|..:||.:.||..|:.:...::..||.||             |..:.|.....
  Rat  2634 TLDPVLELQLARLQELGFSMDDCRKALLVCQGQLKKAASWLFKNAEPLKSLSLVSSSRDNQGAMS 2698

  Fly  2343 ALEMKTAVVDASLISVFIIDDCMDADVPLLEVSLSKFLLNFTFQTQDPNPKETNIRHYSLGNIDT 2407
            |..:....|.|..:.:..||||||.||||.|::.|:  ||| .|....||:  ...|::|     
  Rat  2699 APRISGVEVKAESVCICFIDDCMDCDVPLAELTFSR--LNF-LQHIRTNPE--GYAHFTL----- 2753

  Fly  2408 EVSVNYYNRRLSGWEPVAETWESNLNWKYTKGHLDNKKRFEIGISSKQMLKLNVTSTFIELFHMV 2472
              |.:||||.||||||..|.|..:::|:.......:..|.::...:|:.|.:|:||..|:.:...
  Rat  2754 --SGDYYNRALSGWEPFIEPWPCSVSWQQQAASRLHPPRLKLEAKAKRRLDINITSVLIDQYVST 2816

  Fly  2473 LKNWTNDFNDNG--------------------------------------------------AKN 2487
            .::|..|:....                                                  .|.
  Rat  2817 KESWLADYCKEDKETESAKTEDWMGSSVDPPCFGQSLPLVYLRTRSTASLTNLEHQIYARAEVKT 2881

  Fly  2488 FRQRSPFIPFALQNLSGTPLLF----------------KPIYAPLGDLTRSDLQQVELIKNWYSV 2536
            .::|.||:||||:|.:|..|.|                .|...|.|:  .:.|.....:..|..|
  Rat  2882 PKRRQPFVPFALRNHTGCTLWFATLTTTPTRAALSHSGSPGVVPEGN--GAFLDDTHNVSEWREV 2944

  Fly  2537 QPNETKTFDFSQKSKLRHVHSHQLNLHQIFVQIHGWTLIGPISVDKVGMFFRTTKLDS------- 2594
            ...|...|:|..:.||||.|:|.|.:||:.|:::||..:.|:||||||.|||....|.       
  Rat  2945 LTGEEIPFEFEARGKLRHRHTHDLRIHQLQVRVNGWEQVSPVSVDKVGTFFRYAAPDKNSSSSTI 3009

  Fly  2595 ----------------QFLTKSRIVFDISLIGSAQKLIKVKSSLGVINKLDRNVFLKMTLKGTHS 2643
                            ..|...|:||.:::.|||:|:|.|:|:|.|.|:|:..:.|::       
  Rat  3010 GSPSSRTNIIHPQVYFSSLPPVRVVFAVTMEGSARKVITVRSALIVKNRLETPMELRL------- 3067

  Fly  2644 DGLSS------ISVIKPNDELSVPLKFIDASLYVAHNTSESDAYEDTG----FSNEEILW----K 2694
            |..|:      :..|.|.|..:|||          |.||........|    |....|.|    |
  Rat  3068 DSPSAPDKPVVLPAIMPGDSFAVPL----------HLTSWRLQARPKGLGVFFCKAPIHWTNVVK 3122

  Fly  2695 ACGKDDTRQLLAGYDTNKSILYTF-VNISREIY-HCKEQNL-----------PGHKITLLPPLKI 2746
            ......:::.....||.||..:.| |.|.:|.| .....|:           |||.|.|||.:.|
  Rat  3123 TAEVSSSKRECHSMDTEKSRFFRFCVAIKKENYPDYMPSNIFSDSAKQIFRQPGHTIYLLPTVVI 3187

  Fly  2747 NNMLCCDLMFKIH-EHATGRINSSESVNIYNVNICQPLNLSITLDNFQLSGQLKIPVSHRGVIEP 2810
            .|:|.|:|.|.:. ....|.:...:...:...:..|.:.|.::|:||.|..:|.||...:..: .
  Rat  3188 CNLLPCELDFYVKGMPINGTLKPGKEAALPTADTSQNIELGVSLENFPLCKELLIPPGTQNYM-V 3251

  Fly  2811 KLKLIDIQKRELHVRVSIQSVPGKGMELYISAPVWIINKTGLPLIYKQEGTSHTAAGQFEEHETA 2875
            :::|.||.:|:|::.:.|.......::::||||.|:|||||||||::|:.....|||||||||.|
  Rat  3252 RMRLYDISRRQLNLTIRIACRAEGSLKIFISAPYWLINKTGLPLIFRQDNAKTDAAGQFEEHELA 3316

  Fly  2876 RQVAPLMFSFSDQEGSPALVLRLGKAYGSNNM--WCKSFSTHKDLADRDLRA---ENTKG-SYAI 2934
            |.::||:|.::|:|......:|:|:......|  ||:.||.......|.|:.   .|..| .|.|
  Rat  3317 RSLSPLLFCYADKEQPNLCTMRIGRGIHPEGMPGWCQGFSLDGGSGVRALKVIQQGNRPGLIYNI 3381

  Fly  2935 GISVRRGRGLYACTTFVTLSPRFHLHNRSGYKLEFMQLCDIVNYDRPDPRKIISAPVDCNFAFHW 2999
            ||.|::|||.|..|..|..:||:.|.|:|.:||.|.|..........:|...||.....:..|||
  Rat  3382 GIDVKKGRGRYIDTCMVIFAPRYLLDNKSSHKLAFAQREFARGQGTANPSGYISTLPGSSVVFHW 3446

  Fly  3000 PNWDQEQIICVRIPEIECCCWSKGIPIKDVQSLYINVRNEWGEMFFLRLEIISKDATFILLFTDA 3064
            |..|.:|::|||:.::..|.||.|..:....|.:||:|:..|:.||||:||..:.||:.:.|:|.
  Rat  3447 PRNDYDQLLCVRLMDVPNCIWSGGFEVNKNNSFHINMRDTLGKCFFLRVEITLRGATYRISFSDT 3511

  Fly  3065 RTLPPPIRIDNCSEVVINFSQLR-SKPVWITPVRPQSSLSYVMDDPLGQQILLMEAPGGNMIEFP 3128
            ..||||.||||.|:|.|.|:|.. ::|...|.|:|..||.|..|:|.....:.:...|....|..
  Rat  3512 DQLPPPFRIDNFSKVPIVFTQHGVAEPRLRTEVKPMMSLHYAWDEPTLPPFITLTVKGAGSSEIN 3576

  Fly  3129 INN---KNNIKKTLTYTNFIYIA----FQGTFERSNEEENTHR-----QLVLGVRGK--KVVIVE 3179
            .|.   :||  :.|.|.||||||    |.|..|.......:|:     :|||.|..|  :|::.:
  Rat  3577 CNMNDFQNN--RQLYYENFIYIAATYTFSGLQEGKGRPVASHKAITCAELVLDVSPKTQRVILKK 3639

  Fly  3180 KNSGDRSQLWLMNSNGQLEHEGSTPPIQTNDANAVR-----LVLDLE--KAPNPMEFTNLVVRTP 3237
            |..|.|||||.|...|.|.||||..|...|..:|.|     .:||:.  .|.....:..|::|.|
  Rat  3640 KEPGKRSQLWRMTGTGMLAHEGSAVPHNPNKPSATRSIEGSAILDIAGLAAVTDNRYEPLMLRKP 3704

  Fly  3238 NKQRVTTQTWRFENGRLMCHAN-MCVQSRFGESGLKPNYEAVVGRTENRASSSKQIPIGQHIVAQ 3301
            :::|.|||||.|..|:|.|..: :.||::.|.|||....|.|:| .::.......:|..|....|
  Rat  3705 DRRRSTTQTWCFHEGKLTCGLHGLVVQAKGGLSGLFDGAEVVLG-PDSSVELLGSVPPEQQFANQ 3768

  Fly  3302 KLRPGSGQLELSTKMDGPISTIEICDI--KIKQNSVFLTPDLLWMHASLNNRQITDKGKVSFVHE 3364
            |:|||||.|.:....|||...::|.|.  :..:.|.:...:|......|...:..|      .|:
  Rat  3769 KMRPGSGMLSVRVIPDGPTRALQITDFCQRKSERSSYEVEELPVTEQELQKLRNPD------THQ 3827

  Fly  3365 YL-INVELVKGIGISIIARKPCEEIMFISLDHINCDIVQSALENSLDLNIAYIQIDNQLLDAVSP 3428
            .| :.|.|..|||:|:|.:.| ||::|.||..||....|.|..:.|:|:|..:|:||||:....|
  Rat  3828 ELEVLVRLEGGIGVSLINKVP-EELVFASLTGINIHYTQLATSHMLELSIQDVQVDNQLIGTTQP 3891

  Fly  3429 IALH-TQTSNDLEETQNAVVLKLKMLPSPNKNAI--IFKYLTLDLKPSTASLEEKLILKVASFLG 3490
            ..|: |..||:.|..:....:::..:..|:|:|:  |:|:|.:..:..|..:||||:||:.||.|
  Rat  3892 FMLYVTPLSNENEVIETGPAVQVNAVKFPSKSALTNIYKHLMVTAQKFTVQIEEKLLLKLLSFFG 3956

  Fly  3491 YGKINRQNLSVQYQFENTDDKPFLQ--DMKRYYFENLSIGATQVRLSAFTSSKLPVELHETKKAL 3553
            |.:...:   |:...||..:|...|  ...|||||||.|...|::||.|||:|||::|...|..|
  Rat  3957 YDQAESE---VEKYDENIHEKTAEQGGTPTRYYFENLKISIPQIKLSVFTSNKLPLDLKALKSTL 4018

  Fly  3554 GLTLIKFEDALIELDRYSDKLHFETMDVYRKELKKHYINQVKWHAAAILGSVDFLGNPLGFANDL 3618
            |..||:||||:|.||.::....:||.:....::.||:..::...||.|||||||||||:|..||:
  Rat  4019 GFPLIRFEDAVINLDPFTRVHPYETKEFIINDILKHFQEELLSQAARILGSVDFLGNPMGLLNDV 4083

  Fly  3619 SEGVSGLIFEGSVKSLVKNVTHGISNSTAKLTETLSDSLGKVVLDDHDNETRQRILELQSNTSGG 3683
            ||||:|||..|:|..|::|||||:|||.||...||||.|||.:  |:.:::.:..:...:.|||.
  Rat  4084 SEGVTGLIKYGNVGGLIRNVTHGVSNSAAKFAGTLSDGLGKTM--DNRHQSEREYIRYHAATSGE 4146

  Fly  3684 HLAAGLKGLGFGLLGGVTSIVRHTYDGA-TSDGVPGFLSGLGKGLVGTVTKPIIGVLDLASETAS 3747
            ||.||:.||..|::||:||::..|.:|. |..||.||:||||||||||||||:.|.||.|||||.
  Rat  4147 HLVAGIHGLAHGIIGGLTSVITSTVEGVKTEGGVSGFISGLGKGLVGTVTKPVAGALDFASETAQ 4211

  Fly  3748 AVRETSR-DSHRNAPERKRLPRCVTGAPGGLLPLYSNRQSKGQQYLYLINQKNFSEKIISYEPNL 3811
            |||:|:. ...|...:|.|.|||.|| |.||||.||..|::||:.|:.:......|..|:.| |:
  Rat  4212 AVRDTATLSGPRTQAQRVRKPRCCTG-PQGLLPRYSESQAEGQEQLFKLTDNIQDEFFIAVE-NI 4274

  Fly  3812 WSDKEARLRLLVSTEYVRIFSLSD--ANPTIMFECHVSEILSCHPVVTNAGTTPTTSSRASASHY 3874
            .|     ..:|:|::.|......|  ....|..|....::..| .|..:.|......::.:|:..
  Rat  4275 DS-----YCVLISSKAVYFLKSGDYIDREAIFLEVKYDDLYHC-LVSKDHGKVYVQVTKKAANSS 4333

  Fly  3875 IEISTNLPKITRPRIRCRSEECAEAASRCINYAKSVFDERE 3915
            ..:|...|...:|.:..:||..|...|:.||||||::.|::
  Rat  4334 SGVSIPGPSHQKPMVHVKSEVLAVKLSQEINYAKSLYYEQQ 4374

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Vps13DNP_729825.2 Chorein_N 4..112 CDD:315323 60/107 (56%)
VPS13 147..368 CDD:318996 62/225 (28%)
VPS13_mid_rpt <656..837 CDD:318998 58/186 (31%)
VPS13 <2039..>2694 CDD:330393 235/842 (28%)
SHR-BD 2836..3113 CDD:310922 115/283 (41%)
VPS13 <3346..3802 CDD:330393 201/463 (43%)
Vps13dNP_001382518.1 None


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C166343683
Domainoid 1 1.000 685 1.000 Domainoid score I126
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H15583
Inparanoid 1 1.050 1710 1.000 Inparanoid score I67
OMA 1 1.010 - - QHG50136
OrthoDB 1 1.010 - - D10953at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0006123
OrthoInspector 1 1.000 - - oto97051
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_106938
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR16166
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X4414
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1413.910

Return to query results.
Submit another query.