DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Vps13D and vps-13A

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_729825.2 Gene:Vps13D / 39448 FlyBaseID:FBgn0052113 Length:3919 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_740900.1 Gene:vps-13A / 172705 WormBaseID:WBGene00011629 Length:3212 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:4141 Identity:748/4141 - (18%)
Similarity:1383/4141 - (33%) Gaps:1435/4141 - (34%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MLRDLITWVLNTYLGKYLENLNSAQLSVALLSGEVELENIPIRKDALRSFNLPVEVTAGSIRKIK 65
            :...|:..:||.:||.:::||:|:||::.:..|:|:|:|:.:::.||..|:||:::..|.:..:.
 Worm     2 VFESLVADLLNRFLGDFVDNLDSSQLNIGIWGGDVKLDNLQVKETALDDFDLPIKLKYGYLSSLV 66

  Fly    66 LQIPVRQFRTSPWCISIEGLFCIICPKNLDNWDYEK--EKLQDLEYK-LAVLDTAEAGWRSEKGK 127
            |:||.:.....|...:::||..|:.|.....::.||  :.:|:::.| ||.|:.|....|..|..
 Worm    67 LKIPWKNLYNEPVIATVDGLNLIVVPNKGVVYNEEKVAKNIQEIKQKTLARLEEARKERRKPKDP 131

  Fly   128 QMESYYFSSYNNWLKYGTNMATNIIDNIELKISDVHFRFEDIVDTGKSKICTGIKIGSLTAQSCD 192
            |.::           :...|.|.||.|:::.:|::|.||||...........||.:..|..::.|
 Worm   132 QADT-----------FTEKMITQIIKNLQISVSNIHVRFEDRYTNRHRPFAMGITLEKLNFKTTD 185

  Fly   193 CDWTNGSYKMNNNEMNYKLVELKELSVYWDLLHE---DIKCQSYSNQEILEKMHSTCE-LRSHNF 253
            .:|....:| :..::.||||.|:.|::||:...|   |:..:....:::.|.:|:... ...:|:
 Worm   186 ENWRETIHK-DVVKIIYKLVSLQNLAIYWNSSTEFISDLDDKEAIRKKLQETIHNGKNGPEGYNY 249

  Fly   254 IIKPICATARWKRDKCQQVIRTKDK-PRVSCELLVPEVVIDISKVQRLQMLDKLSEIRQVKEVRQ 317
            |::||...|:.|.::..:...:..| |::...:.:..:.|.|.|.|...:|..|....:.....|
 Worm   250 ILEPIQMEAKLKLNQKPETDGSNWKIPKIDLAVDMHALSIAIGKFQYQDVLLFLEAQERFNAAGQ 314

  Fly   318 YRLKRPTCT-VESNPIAWWKYA---TICHGFDFKKNEEKWLMLKENLRYMLLYKSIIL------N 372
            |...||... .:.:..||||:|   .:......::|...|..::::.:.:..|:...:      :
 Worm   315 YLKYRPNLNEFKGHYKAWWKFAYTSILEEKVRRRRNNWSWDRMQKHRQLVRKYQKAWVRRQTEAS 379

  Fly   373 PNENLSAADKEFKAYIESDRKISDLTIMRRICFEKVFTKGFAFESQNEQGKNMLFHWFPNWMGWY 437
            |..::.|..||    .|....:.::.:.|:....::..:|...:.....|   ...|..:|.|  
 Worm   380 PGADVQATIKE----AEKKLDVFNVNVARQQAELEIDREGLTRQEDKPTG---WVAWGKSWFG-- 435

  Fly   438 ANSPSTPNNEQ---------DESLKHLEDDILVALENSLQN--SSDLKSDAVFGHFSIKLLKGLV 491
            .....||:.::         .|::...|...|....:..:|  .::...:.|...|..||.:..:
 Worm   436 GGGGPTPDKKKGAKDIGSQFQEAMTPEEKAKLFEAIDYQENIPPTNYPKEFVENKFDFKLGQVAI 500

  Fly   492 ILQTEDKLNDGRNKSMEMQFNNFSAYLQLSPQLTSYTVGISLQEVYLIDKTSSDTMH-------- 548
            ::       ||   ::.||.....|.::..|..::..|..|:||:.: |...::.:.        
 Worm   501 VV-------DG---AVSMQLLKLVASVEQRPSASAMHVESSIQELRM-DGCGTEIIRVRDPSIPW 554

  Fly   549 -NYLI--KPQTGNTATPNQLVKNAALQEDILFQLQYENCNHLRFQLNIKSKGLDLIYNEDAIQWL 610
             ::|:  .|..||.   :||||.|..                  .:|||       |...||...
 Worm   555 MSFLLDTNPLKGNY---DQLVKLAVA------------------PINIK-------YQAPAINNA 591

  Fly   611 LDFLADSNSFKYSPRNRVAKKTDFMKNWNEMFSGNEV-------NRKIWMFEIEIFAPRIIFLEN 668
            :|......|.:.:....:|     |..:.|:.:.:..       :|...:.:::|...||...|.
 Worm   592 IDVFKPPESVRLNQLTALA-----MSRYEEVKARSATGLAYAVEHRSRLVLDVQIQPARIYVSEG 651

  Fly   669 YKVSNSLMVLL-DFGKLEMRKMEVKRVIPVIESAVTENTSDDDETYLTPCSTPPASEKSGSESPT 732
            ...|:....|| |.|.|               |.||.:.|..|                      
 Worm   652 GTYSSEKPTLLADMGLL---------------SVVTVDNSSVD---------------------- 679

  Fly   733 LLENPKTESFLNKNVQLEYVLHNKIYDKYLINFTNLQVLVCKYEERWQACL-KTSSNFHLIDKFN 796
                   .|.:||..    .|..|.||::.:..:|:.:...:..|..:.|: :..|..|::....
 Worm   680 -------TSGMNKMA----ALMEKAYDRFHVKLSNVVIAFAENVETAENCVFEKESPLHVLKPTG 733

  Fly   797 INLTLEQRNIFTVDPEYPSFMLFGTCPTILIH-GNEELINNCCNIMK-----PI------IKASK 849
            :::.:.:.:|  .|.:.....:.|..|.|:|. .::.||    .:||     |.      .||.|
 Worm   734 LDIQIHKSSI--DDLKLAKMRVIGDLPNIVIGISDDRLI----GLMKLGLSIPTPKADEKTKAEK 792

  Fly   850 EME--------------------------NIYRGGNTIYASERIKNLAEDDRSRVVIEFVMDQLV 888
            |:|                          ....||:.  ..:..|....:.:.::.::..::|:.
 Worm   793 ELEVPVAKIKDRAKMRTIMEVEEMEEDVTQKEEGGDD--DEKEKKKKTSEQQVQIELDLRLNQIG 855

  Fly   889 IEMQSTERSIAELQIIGARAGL---------TKEPHETNISMSVHGLLLVDAIQSFGPDFELLVA 944
            :.:...:....::.|:.....|         |.|.....|||               |:|:.|..
 Worm   856 VVVYRKDAVFCDVSILKMACKLQMRTFDMVVTAELGSIKISM---------------PEFKSLDE 905

  Fly   945 SHRH---VGMDSLSGSLKHSAIVSPTSPGSPNFFDRATSPHMITKAVQNIKMGDRSTEFCDDEDS 1006
            ...|   :..|.|.|:|.....|. .:|.||.|                      :||:...|. 
 Worm   906 KREHLYLIDNDELQGALMTLKFVQ-ANPESPFF----------------------ATEYALTEQ- 946

  Fly  1007 TALISVDIKIVPPNESNSMQLHTTSITFNSLDIIANQDTIIEILNFAKRTLLAQNIFPSESPESP 1071
                |||.:                  |..|.:..:|:.::|:..|.:......|.....:||..
 Worm   947 ----SVDFR------------------FTKLAVSLHQEGVLELKAFGEALQAQLNELQKNTPEEK 989

  Fly  1072 KEATEAPVDVVDQVDHKSHNEIFFDFFRLNILLLYTIKRDKFNVGRKVGTVTL-------TEAKI 1129
            |         |::...|...::......:..:......::|....:.||:.|.       .:.:|
 Worm   990 K---------VEETARKISRKLSDSVMSIASMSRTPSGKEKRQRKKTVGSATQEMDVSRNIKQRI 1045

  Fly  1130 NASFQSDLSIIGSLGGIQV----------IDITSEAF------------------CHPRILSV-G 1165
            .|||.|...:||:...::.          :.||.:|.                  .:.::||| |
 Worm  1046 KASFGSLALMIGTQKHLETSLAIENINANVKITEKAMEVVATLRAISMKDRTPGAVYKKLLSVTG 1110

  Fly  1166 RDQILRASDTNKQTVLSQLSNEIYSNNYNEETKSDESDAISFQSHWSDKTTCTFQMRMASASYTH 1230
            ::.:||.                   ::.:..::||..|:.    .|.......:||:|...:..
 Worm  1111 KEDMLRF-------------------DFVQYQRTDEQRALM----KSSDVDMVVKMRLAQMRFVF 1152

  Fly  1231 CPRFLRDVNACITYFKRSLREFATSIGNKATDMAKEFVQQVRAVEQIGPVYPQRNRQDNWLDIII 1295
            ...:|..:.|.:..|:......|.:....|.:.|....|.|:.:.:..|...|       ||:|:
 Worm  1153 LNLWLARLMAWLAPFQNEAVLAAQAAQAAAAEKAATAAQNVKQIMEQSPPRIQ-------LDVIL 1210

  Fly  1296 SSPIIILPISNTSTNVLIANLGKISCSNAVKCDSDEFNESYTIEIKNTYVYSLNIDEGEYSFNVH 1360
            .:|.|::|..:||.:|::.:||:::..|.::.||:                             :
 Worm  1211 EAPFIVVPRLSTSRDVIVLHLGRLALKNEIRGDSE-----------------------------Y 1246

  Fly  1361 PAKNKDAIPILHDTAITLQLYAGYSDDNDEDKQLNRFSIKGSMVEALKVSLNRKQYELLLESIRY 1425
            |....|.:.||                               |.:.                   
 Worm  1247 PKAIIDRMDIL-------------------------------MTDC------------------- 1261

  Fly  1426 ATNFSNEVLNESDELDQNGDIEPTANIDAESIISTTIQFSVPVFQINLQNEYHNDLINLTFKNFN 1490
              :|...|:||                |..::.|:.:......|::.||.       ||||.   
 Worm  1262 --SFGMGVMNE----------------DVSAVSSSCLILKPISFKLALQR-------NLTFA--- 1298

  Fly  1491 VKHISKGFDK-DVEVVLKSVLME----DLKSDLTSPFRNMVTSVDLEQKIKKNEMTSSSCPDLPS 1550
               ::|...: .|:..:.|:..|    |.|:.:.:...|:....||          :...|..||
 Worm  1299 ---VAKELPEIVVDAHIHSIEAEMSDADYKTLMQTLSGNLAEGADL----------AIPPPPPPS 1350

  Fly  1551 YCNSLKNRSSSVPSCFYNHMQVKVFGGDQKYTSSNKNELGKKKESQT--LVIYKSHTGRSAQNGK 1613
               ||::.:::.                 ..||..|.:..|.:|:..  .||.||||        
 Worm  1351 ---SLESSNTAA-----------------ALTSPGKEKEKKDREANAGPPVIEKSHT-------- 1387

  Fly  1614 LEQTSSIQFNCLNLAICVERWYTIFDFFGLVSVDNVNEKYPEEMKLVEKHIDKVCSKLKVSIRSF 1678
                                 ..:|.|.                      :||:.:.|       
 Worm  1388 ---------------------RIVFQFV----------------------LDKISAVL------- 1402

  Fly  1679 NFTLIRNESLLSRVNVSNAVFMILQDPYSKIVEGCLGSVSVNDLTKYGNIYKQKFLTSGTEALNF 1743
                                           .||                          ||:|.
 Worm  1403 -------------------------------YEG--------------------------EAVNG 1410

  Fly  1744 VYKKKLVDLEALNTLDTDSTLRINMSAVHYIHTKRFSTELHVFVKDLLQLQTPVIRKLKKHGSEQ 1808
            ..|:.          |..:.||:.                                         
 Worm  1411 ERKES----------DAFAALRLK----------------------------------------- 1424

  Fly  1809 NMRPSKMKLVIQADSPVIVLPSSYNRNEVIIAYLGQFSLKNSFHFASDNNIISKMSATPSKDEIL 1873
                                                 ::|.|.....||:|:..||        |
 Worm  1425 -------------------------------------NVKTSGKIGEDNSIVFAMS--------L 1444

  Fly  1874 DVMRIDLVNINLFSGERSSMKAKADQEKDRIIIADMNFLRLGQPFFNESCFLHLQLERNLSADAH 1938
            |...:|        .||.. |.|..:..|:....|..||.:.   ||:....:.|:...:||...
 Worm  1445 DAFTMD--------DERKE-KTKISKLMDKKGSKDDRFLDMS---FNQDAEANKQIRLKMSAFFI 1497

  Fly  1939 RVCPDISVQGTFSKLSGIINIQQYKLIRSFLNNNIGEQTDDIYMNYHNNSCTSIERLSTINLMPK 2003
            .:||:.     ...|:...|:.|.:           ||               :|:.:....:|.
 Worm  1498 CLCPEF-----LGCLTRFFNVPQSE-----------EQ---------------LEKQAVTANVPT 1531

  Fly  2004 NEVSKIVSILISIRILLEDVSLLLALNTSQSAAIEPLACIHFLKSTLEIDLFSDGSQDIDLISSN 2068
            ..||...|.          .|.......:.|...:|:       .||.|        |.|:....
 Worm  1532 KAVSASPSA----------SSTFTGGTKTSSGPPQPV-------GTLAI--------DCDMHGVE 1571

  Fly  2069 ILIVDERNESDKSNENVFKNILEPSKKEVRIEN-SVQVEVHCRKKATFSKYTIMLNNMRVFALLS 2132
            :::|::.              :.|...:..|.: :|....|..::...:|..:.:.|:.:|:   
 Worm  1572 VILVEDS--------------MHPESTQALILSFNVTAASHPNEQTKDTKMNVAVENLTIFS--- 1619

  Fly  2133 FLDQLKSYLQEDSPAPVVNNAANQIAQKPQIDTSISTEYVVNITDSEIIFAEECSRLDSNAIILK 2197
                  ||.|        ::..|::..  |:.|.:..|.:||:....                 |
 Worm  1620 ------SYYQ--------SSRRNEVTY--QVLTPVRIEALVNMNTER-----------------K 1651

  Fly  2198 STTVICYKPNSNIVPLSLDINHLEIFSCTLDAEEESALSIIDPFTLIIELRSNCLNILIQKHLNI 2262
            :|..:                                                           :
 Worm  1652 TTDAV-----------------------------------------------------------L 1657

  Fly  2263 RLSYVDVKLFSRMARLLPTQTSRPKNVISKADSDLEKAAPLVAMGFEISDCLYAMQINNW----- 2322
            ::|.:|:|:...:.|||           |...::..|::   |.|...|....|.::..|     
 Worm  1658 KMSALDIKMSPSIIRLL-----------SAVSAEFSKSS---APGETGSISQKAAKLRKWPNYFD 1708

  Fly  2323 --RINDAAIW-----LSQ----------QKQNTYRNPALEMKTAVVDASLISVFIIDDCMDADVP 2370
              .|:....|     ::|          |:..:..:..:..::|.||...||..:........||
 Worm  1709 SKPIDHRKYWFFAAPVAQEAVEEELDVTQEDKSRTDSMIGKESAKVDIERISFTLEAGTGAIPVP 1773

  Fly  2371 LLEVSLSKFLLNFTFQTQDPNPKETNIRHY---SLGNIDTEVSV--NYYNRRLSGWEPVAETWES 2430
            |:.:.:.                 .|...|   |...:.:.|||  :|||..:|.|||:.|..|:
 Worm  1774 LIFLDML-----------------VNAEAYDWSSAMRVSSGVSVQMSYYNESVSVWEPIIEPVEN 1821

  Fly  2431 NL----NWKYT--------KGHLDNKKRFEIGISSKQMLKLNVTSTFIELFHMVLKNWTNDFNDN 2483
            ..    .||..        :...|:..:.|:.|.:.:||.:.||.:.:.|.        |..::.
 Worm  1822 EKGEFERWKLAMTMKSRNKQDSSDSSPQTEVKIEADKMLNVTVTKSLLSLL--------NKLSEV 1878

  Fly  2484 GAKNFRQRSP--------FIPFALQNLSGTPLLFKPIYAPLGDLTRSDLQQVELIKNWYSVQPNE 2540
            .|...:|.:|        ..||.:.|.:|  :..|.:          |.:.:.:.:|..:|....
 Worm  1879 FATAAKQITPTKTRHLPGISPFVVLNETG--ISVKVL----------DTETIRVSENGQAVDATH 1931

  Fly  2541 TKTFDFSQKSKLRHVHSHQLNLHQIFVQIHG---WTLIGPISVDKVGMFFRTTKLDSQFLTKSRI 2602
            .:..|...|::...|...:|::.|  .:|.|   :.|.|.:...|:|      :.:.:.:...|:
 Worm  1932 GEFVDVFLKNRKSDVEDRRLSIEQ--EEITGDLKFELAGTVRETKIG------RAEKRVIHLPRV 1988

  Fly  2603 --------VFDISLIGSAQKLIKVKSSLGVINKLDRNVFL------KMTLKGT--HSDGLSSISV 2651
                    :...:.:.::::|:.:.|.:...|.|...|.:      .:.|.||  |.:.:     
 Worm  1989 SDGGHKWLIVAETTVENSRRLVTLNSHVKFTNHLSYAVEIYSKRDTTLDLFGTVEHGETI----- 2048

  Fly  2652 IKPNDELSVPLKFI-DASLYVAHNTSESDAYEDTGFSNEEILWK----------ACGKDDTRQLL 2705
                 .|:|||.|. ...:|:   ....|.||   .|.|.:.|.          .|..|.|    
 Worm  2049 -----PLAVPLLFSPSGDIYL---KPVDDKYE---VSFESLCWHNFEHNRRQAVRCEADST---- 2098

  Fly  2706 AGYDTNKSILYTFVNISRE------------IYHCKEQNLPGHKITLLPPLKINNMLCCDLMFKI 2758
               |.:.|.:|....:..|            |||          :.|.|||:.:|.|..|:..::
 Worm  2099 ---DGSFSGIYIDSVVHEEKIQDGIDDQTTSIYH----------VHLHPPLEFHNNLPFDINIEL 2150

  Fly  2759 HEHATGRINSSESVNIYNVNICQPLNLSITLDNFQLSGQLKIPVSHRGVIEPKLKLIDIQKRELH 2823
            .|.   ::..:....:.||....|:...:|.            :..:.|::..:..|   |:::.
 Worm  2151 PEQ---KVLGAGMSTLLNVVAGSPVKAWLTY------------LGEKYVLDMSIPEI---KKDVE 2197

  Fly  2824 VRVSIQSVPGK--------------GMELYISAPVWIINKTGLPLIYKQEG---TSHTAAG---- 2867
            | |::.:..|.              ..::|:.||.|::|.|...|.:.:..   .|:||.|    
 Worm  2198 V-VALNTETGSDELLLGLHWTSEYGDQKVYLYAPFWLVNNTDKMLRHVESSGNMLSNTARGCVPC 2261

  Fly  2868 ------QFEEHETARQ----VAPLMFSFSDQEGSPALVLRLGK----AYGSNNMWCKSFSTHKDL 2918
                  ..:|::.|.|    ..|::..|      ||:.|...|    ...:.:.|.:.|..  |.
 Worm  2262 GKKSVVTSQENDDAVQHLPTENPIILPF------PAIDLSKKKKARVRIENLSEWSEEFPL--DT 2318

  Fly  2919 ADRDLRAENTKGS---YAIGISVRRGR-GLYACTTFVTLSPRFHLHNRSGYKLEFMQLCDIVNYD 2979
            .....|. ..|||   :.:.:.::..: ||   |..||.:|.:.:.|.....:|.          
 Worm  2319 VGNAARI-TCKGSEHDFDLTVDIKLCQSGL---TKIVTFAPFYLVSNLGKNPMEI---------- 2369

  Fly  2980 RPDPRK-IISAPVDCNFAFHWP-NWDQEQIICVRI---PEIECCCWSKGIPI---------KDVQ 3030
            |.:.:| .:..|.:..... || ...:.:::|||.   ||.|    |...||         .|.:
 Worm  2370 REEGQKGWVDIPAETCVGI-WPVERKKRKLMCVRYKEEPEAE----SLLFPITENYETLCHMDGE 2429

  Fly  3031 SLYINVRNEWGEMFFLRLEIISKDATFILLFTDARTLPPPIRIDNCSEVVINFSQLRSKPVWITP 3095
            ::.:.|....||         |..|..:..|.....   |:::.|...|.:.|.|          
 Worm  2430 AIGVEVSVSTGE---------SSVAIHLSSFVPGMC---PVQVMNNLTVPVTFGQ---------- 2472

  Fly  3096 VRPQSSLSYVMDDPLGQQILLMEAPGGNMIEFPINNKNNIKKTLTYTNFIYIAFQGTFERSNEEE 3160
                                                |.:||.|:....|.:.::....|..    
 Worm  2473 ------------------------------------KGHIKTTVGPNEFAHFSWSSIIEPK---- 2497

  Fly  3161 NTHRQLVLGVRGKKVVIVEKNSGDRSQLWLMNSNGQLEHEGSTPPIQTNDANAVRLVLDLEKAPN 3225
                            ::|.:.||    |...........|.               |.::|:..
 Worm  2498 ----------------VLEVDIGD----WHFEDKLDQNRFGD---------------LQIDKSVR 2527

  Fly  3226 PME-FTNLVVRTPNKQRVTTQT------------WRFENGRLMCHANMCVQSRFGESGLKPNYEA 3277
            ... ::|.::   .:|||...|            |  |...:...|.:.:|. ||.|.:    :.
 Worm  2528 RFSYYSNFLI---GRQRVLLFTPDVDIAKAAYGSW--ETDVVDMQAEISLQG-FGLSVV----DN 2582

  Fly  3278 VVGR-TENRASSSKQIPIGQHIVAQKLRPGSGQLELSTKMDGPISTIEICDIKIKQNSVFLTPDL 3341
            :||| ....|.||..|...:.:...:.:|      |:.|.      :::.:.|.:.:.|....|.
 Worm  2583 IVGREIIYMAISSSDILWEEEVKKGRFKP------LAVKY------MQVLEEKYQAHLVTPNDDY 2635

  Fly  3342 LWMHA-SLN-NRQITDKGKVSFVHEYLINVELVKGIGISIIARKPCEEIMFISLDHINCDIVQSA 3404
            ..|.| .:| ||.|..|.|                 |..:..|:..|:.::....       :|:
 Worm  2636 EAMEAFEVNVNRMIMKKKK-----------------GKEVKLRRIFEKGLWACYG-------KSS 2676

  Fly  3405 LENSLDLNIAYIQIDNQLLDAVSPIALHTQTSNDLEETQNAVVLKLKMLPSPNKNAIIFK----Y 3465
            ....|...|.:|||||||...:.|..                   |.::|.| |:.|:..    :
 Worm  2677 QRTRLHAKINHIQIDNQLDACIFPRV-------------------LSVVPPP-KSVIVDNTPKPF 2721

  Fly  3466 LTLDL---KPSTASLEEKLILKVASFLGYGKINRQNLSVQYQ-----------FENTDDKP---- 3512
            :.|.|   :|..:|:.|         :.||.:..|..|||..           ......||    
 Worm  2722 IELSLLQRQPEFSSIAE---------IEYGHVLIQEFSVQVDQGLINALLLLISGEVTRKPYGKE 2777

  Fly  3513 -FLQDMK------------------RYYFENLSIGATQVRLS----------AFTSSKLPVE--- 3545
             |.:|:|                  :.::.:|.|....:.||          |.:...:|::   
 Worm  2778 MFDEDIKICHVTLSETASTYRSQRPKSFYNDLHISPIMMHLSFSQGGTSGDVAASGVSMPIQSEM 2842

  Fly  3546 LHETKKALGLTLIKFEDALIELDRYSDKLHFETMDVYRKELKKHYINQ-VKWHAAAILGSVDFLG 3609
            ::...:::|:||.:.:|.:.:|..:..|..|.:.:....|:..||..| :|.....:|| :|.:|
 Worm  2843 INVLLRSVGVTLTELQDVVFKLAYFERKCVFYSPEQLNSEIISHYAKQFIKQVYVLVLG-LDIIG 2906

  Fly  3610 NPLGFANDLSEGVSGLI---FEGS--------------VKSLVKNVTHGISNSTAKLTETLSDSL 3657
            ||.|...|||.||..|.   |:|:              |:|:..:...|.:.:..::|.|:...:
 Worm  2907 NPFGLVRDLSAGVEDLFYQPFQGAIQGPEEFAAGVALGVQSMFGHAVGGAAGAVGRITGTVGKGV 2971

  Fly  3658 GKVVLDDHDNETRQRILELQSNTSGGHLAAGLKGLGFGLLGGVTSIVRHTYDGATSDGVPGFLSG 3722
            ..:..||...:.||..|..:..:.|..:|.||||||.|::||:|.:|....:||..:|..||:.|
 Worm  2972 AALTFDDDYMKKRQEDLNRKPQSFGEGMARGLKGLGMGVVGGITGVVTKPIEGAKQEGGFGFVKG 3036

  Fly  3723 LGKGLVGTVTKPIIGVLDLASETASAVRETSRDSHRNAPERKRLPR 3768
            :||||:|.||:|:.||:|.||.|.::||..:..:....|.|.  ||
 Worm  3037 VGKGLIGVVTRPVSGVVDFASGTMNSVRAVAGTNREAGPLRP--PR 3080

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Vps13DNP_729825.2 MRS6 1..>938 CDD:227376 201/1032 (19%)
VPS13 143..367 CDD:465309 54/232 (23%)
MRS6 <2039..>2694 CDD:227376 119/722 (16%)
SHR-BD 2836..3113 CDD:461974 61/315 (19%)
beta-trefoil_Ricin_VPS13D 3157..3308 CDD:467331 27/164 (16%)
MRS6 <3346..3802 CDD:227376 124/497 (25%)
vps-13ANP_740900.1 MRS6 4..>2154 CDD:227376 514/2993 (17%)
VPS13 136..373 CDD:465309 55/237 (23%)
SHR-BD 2224..2490 CDD:461974 66/350 (19%)
MRS6 <2684..3177 CDD:227376 112/429 (26%)
VPS13_C 2803..2982 CDD:465310 40/179 (22%)

Return to query results.
Submit another query.