DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Ncc69 and NKCC

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001261758.1 Gene:Ncc69 / 39410 FlyBaseID:FBgn0036279 Length:1207 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_730938.1 Gene:NKCC / 40663 FlyBaseID:FBgn0051547 Length:1068 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1207 Identity:525/1207 - (43%)
Similarity:730/1207 - (60%) Gaps:158/1207 - (13%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    18 NRFQVNPVNGNSRKSQGADGPGSGSGAGAGAGAGAGEDGPHEVYRRLTNAEGELLEDDTFDATQM 82
            :|||::.|||.                     |.||.||           |....|.|..||...
  Fly     3 DRFQISKVNGT---------------------ANAGYDG-----------EARSAESDQTDAAHP 35

  Fly    83 L------NQRQPR------QQRQSIKSSFRDKDKPSRFKDLQTTTRFQVDPQNEESDESNDSQEE 135
            |      |...|:      :.|:|.:.|||......|                       .|..|
  Fly    36 LPPTSNENHLHPKASGETGENRRSSRLSFRGFGNFLR-----------------------KSDAE 77

  Fly   136 RELLDNEYDTKYGKSFRHFTREALPRLDNYRNMMSIQAAYRPTLDELHNATLVGKNTHSLTRNQD 200
            |:.           |....|:|:||||||||  :|::...||::.||....:    ..|:| ..:
  Fly    78 RKF-----------SLAQLTKESLPRLDNYR--ISMRNLKRPSIGELQGEAV----DQSIT-IPE 124

  Fly   201 PESGILNGVLKFGWIKGVLVRCLLNIWGVMLFLRLSWVVGQAGVIEGFVLILTTTAVTTITALSM 265
            ||.....|.:|.|||.|||:.||||||||||||||||||.::|:::..::|..:..|..||.||:
  Fly   125 PEPEATGGHIKLGWIVGVLIPCLLNIWGVMLFLRLSWVVAESGILQSLIIITISAVVCVITTLSL 189

  Fly   266 SAISTNGVIKGGGTYYMISRSLGPEFGGSIGLIFSLANAVACAMYVVGFCESMLAMMTTFGWEII 330
            |||||||.:||||.|::||||||||||.|:|::|:.||||:.:|..:|||||:..::.....:|:
  Fly   190 SAISTNGEVKGGGVYFIISRSLGPEFGASVGVVFAFANAVSASMNTIGFCESLNVLLKNNDLKIV 254

  Fly   331 DGGVQDVRIIGCITILLLLIIVVVGMEWEAKAQIGLLIILLVAIGDFVIGSFIGPKSDAE-MAKG 394
            |.|:.|:||:|.||:|:|::|..||||||.|||..|::.:::||.:|:||:.|||:.:.| :::|
  Fly   255 DNGINDIRIVGSITVLVLILICCVGMEWETKAQNFLIVTIVLAIFNFLIGAAIGPQGNEEQISRG 319

  Fly   395 FLGYNATLFKNNLFADYRPEKGGIQHDFFSVFAIFFPAATGILAGANISGDLKDPQKSIPKGTIL 459
            |:|::....|.|..:|||..: |:.||||||||||||:.|||.|||||.|||||...:|||||..
  Fly   320 FVGFSWATLKENFGSDYRYAE-GVNHDFFSVFAIFFPSVTGIQAGANICGDLKDAGAAIPKGTFW 383

  Fly   460 AIVITTGTYLIMVLQCGATVARDATGNLSDVVNGTF--AFLDCQ-PGECNYGLQNSFQVIELVSA 521
            :::|:..:|.:.||..|....|||:|..:|:||||.  :.|.|. .|.|.:||.||:::::.:|.
  Fly   384 SLLISMSSYALFVLFAGGAAVRDASGIPADLVNGTIVSSELPCMATGNCTWGLFNSYEMMQEMSL 448

  Fly   522 FGPLIYAGCYAATLSSALASLVSAPKVFQALCKDELYPKIVWFAKGYGKNNEPVRGYVLTFIIAC 586
            :||||||||:|||||:||.:|:|.|::.|||..|::||.:::|:|.|||:.||.|||||||.|..
  Fly   449 WGPLIYAGCFAATLSTALTNLLSVPRLVQALGIDQIYPGLIFFSKPYGKHGEPYRGYVLTFFITT 513

  Fly   587 AFILIGELNLIAPLISNFFLAAYMLINFSTFHASLAKPVGWRPTFKYYNMWLSLLGAILCVAVMF 651
            .|:|||||||||||||.|:||:|.||||.||||:..||:||||||||||.||||.|..:|||:||
  Fly   514 GFLLIGELNLIAPLISTFYLASYALINFCTFHAAFVKPLGWRPTFKYYNAWLSLFGFAMCVAIMF 578

  Fly   652 LISWATALITFAAVLALYLIVAYRKPDVNWGSTTQAQTYKNALMSVQQLNNVEEHVKNYRPQILV 716
            ||::..|:|||..:.||||:|.||||:.|||||||||.||.|||:|.:|.||.:|||||.||:||
  Fly   579 LINYVAAIITFGIIFALYLVVMYRKPEANWGSTTQAQQYKAALMAVHRLQNVSDHVKNYHPQVLV 643

  Fly   717 LSGLPNTRPVLVDLAYMLTKNLSLLVCGHVLKGSSSQKYRTYLQERAGNWFRKHRVKGFYALVDG 781
            |||.|.|||.|||..|:||||.||:...:::......|.|.:|.:....:....::|.||.::||
  Fly   644 LSGDPKTRPPLVDFGYLLTKNNSLMFVANIIPVRVGYKNRQHLVKDGQKYLDARKIKAFYNVIDG 708

  Fly   782 EDFESGTRALMQATGIGKLKPNIILMGYKTDWQTCDHKELDQYFNVMHKALDMYLSVAILRVPQG 846
            ...|.|..||.::||.||:.|||:|:|||.||..|..:|::.||::::.|....:.||:||:|.|
  Fly   709 FSLEDGINALTKSTGFGKMSPNIVLVGYKPDWNRCRKEEVESYFSILYNAFSQRMGVALLRLPNG 773

  Fly   847 LDCSQVLGSQDGWKTVSDVPRTLQPNESSGDLQAVDSSVRNGLSGSIDSLSRNVSQEDRNRNQLV 911
            ||.|::         .|:|  || |....|.:...::   :|.:..:...:...|       :|:
  Fly   774 LDFSEL---------SSEV--TL-PANGMGHMHTANA---HGFTNELMPAANAAS-------ELL 816

  Fly   912 HSEQNSLKIVKLRFKQGLRRMRSWPGAASSTSDLSFIAGNQSKDVSGMPDPLDAKSANLVSNSLR 976
            |.:.| |.:                 |:..:.:.||.          ||.|  |...|:..||..
  Fly   817 HIDSN-LNL-----------------ASMDSPNSSFT----------MPQP--APMPNMQRNSRS 851

  Fly   977 KSKLKHDDPASLYKGPGGAELPKEVLADLTQFTRKRSHAVIDVWWLYDDGGLTLLLPYIISTRRT 1041
            ......|:||..|...||:::|:.:|..:|.||||:....|||:|||||||||:|||||||.|..
  Fly   852 YKVTSSDEPAVTYHTKGGSDIPQNLLDAMTIFTRKQPKGTIDVFWLYDDGGLTILLPYIISMRSH 916

  Fly  1042 WQSCKLRVYALANKNSELEFEQRSMASLLSKFRIDYSDLTLIPDITKKPQETSTQFFNELIKDFV 1106
            ||:.||||:|:.:...| |.|::||||||:||||.||:|.::..::::|:..:......||:.| 
  Fly   917 WQNSKLRVFAMCHGKDE-EQEEKSMASLLTKFRIKYSELIMLKGVSEQPRADTVLKHKRLIEPF- 979

  Fly  1107 VTEKDGENGTSSRATLNEDDALITDDDLLAVQDKTNRYLRLREYLREQSTKSDLVVMTLPMPRKN 1171
                       .|...||..  ||||:|.::.:||||.||:.|.:.:.|:.:.||||:||||||.
  Fly   980 -----------RRGARNEFG--ITDDELQSMSEKTNRQLRIHELVVKHSSNASLVVMSLPMPRKE 1031

  Fly  1172 IVSAPLYMAWLESLSRDMP-PFLFVRGNQTSVLTFYS 1207
            .:||||||:|||.|:.||. |....|||||.|||.||
  Fly  1032 AISAPLYMSWLEMLTSDMKCPVALARGNQTPVLTLYS 1068

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Ncc69NP_001261758.1 AA_permease_2 155..1207 CDD:459263 494/1056 (47%)
NKCCNP_730938.1 AA_permease_2 85..1068 CDD:459263 494/1057 (47%)

Return to query results.
Submit another query.