DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG6928 and Slc26a11

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_648539.1 Gene:CG6928 / 39367 FlyBaseID:FBgn0036240 Length:612 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001385736.1 Gene:Slc26a11 / 360670 RGDID:1306178 Length:593 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:610 Identity:228/610 - (37%)
Similarity:343/610 - (56%) Gaps:51/610 - (8%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     9 RLLPGLKWLHGYTGQDAVADLIAGVTVGLTVLPQGLAYATLAGLEPQYGLYSAFVGGIIYAMLGS 73
            |.||.|.||..|:.:....|:|||::|||||:||.||||.:|||.|||||||||:|..:|.:||:
  Rat    15 RRLPVLAWLPNYSLRWLRMDVIAGLSVGLTVIPQALAYAEVAGLPPQYGLYSAFMGCFVYFVLGT 79

  Fly    74 CRQVTIGPTALLALMTSRHTGFGLGSGPAYAILLCLISGVVELGMAVLKLGALVDLISLPVTVGF 138
            .|.||:||||:::|:.|.:|    ...||||:||..:||.::|.|.:|.||.|:|.||.||..||
  Rat    80 SRDVTLGPTAIMSLLVSYYT----FREPAYAVLLAFLSGCIQLAMGLLHLGFLLDFISCPVIKGF 140

  Fly   139 TSATAVIIGTSQLKGLLGLRGGSGSDFINTMRSVFGNLHKVRTGDFTLGLTSIIVLLLLRKLKD- 202
            |||.::.||..|:|.||||:......|:....: |.::.:.|.||..|||..:::||:|:.::: 
  Rat   141 TSAASITIGFGQVKNLLGLQNIPRQFFLQVYHT-FLHIGETRVGDAILGLVCMVLLLVLKLMREH 204

  Fly   203 -----------VKLDGRIRNLRTQQLVSGSIWVIGTGRNALVVLVTSVLAYSTCEQMESCPFILT 256
                       ||..            .|.:|.:.|.||||||...:::||: .|...|.|||||
  Rat   205 IPPPHPEMPLGVKFS------------RGLVWTVTTARNALVVSFAALIAYA-FEVTGSHPFILT 256

  Fly   257 GKVKSGLPNVSLPKFETTILDRNGTEIRQNFEQMLSELGPSMLILPIIAVLGNVAISKAFGGAG- 320
            ||:..|||.|.:|.|..|..::.     .:|.:|:.::|..:.::|::.:|..:|::|:|.... 
  Rat   257 GKIAQGLPPVRMPPFSVTTDNKT-----ISFSEMVQDMGVGLAVVPLMGLLETIAVAKSFASQNN 316

  Fly   321 --LSPTRELVALSMSNICGAFCSSMPVTGSFSRSAVNHASGVRTPLGGCYTSVLVLLALGLLAPY 383
              :...:||:|:.::|:.|:..||.||||||.|:|||..:||.||.||..|.|||||:|..|...
  Rat   317 YRIDANQELLAIGLTNVLGSLVSSYPVTGSFGRTAVNAQTGVCTPAGGLVTGVLVLLSLDYLTLL 381

  Fly   384 FQYIPKAALSAVIISAVIFMIEFEVIKPLWRCSRRELLPGAITFVMSLAVGVEIGLLLGVSTDVA 448
            |.||||:||:||||.||..:.:.::.:.||...|.:|||..:||::|. ..::.|:|.|....:.
  Rat   382 FYYIPKSALAAVIIMAVAPLFDVKIFRRLWLVQRLDLLPLCVTFLLSF-WEIQYGILAGTLVSLL 445

  Fly   449 FLVYRAARPVLSVSKLQTTNGINYILIRPKHSSLYFPAVEWVRSGISK-ALTIHGTAPVVLDCAH 512
            .|::..|||...||:.|       ||:....|.|:||||:.:|..::| ||........||:|.|
  Rat   446 ILLHSVARPKTQVSEGQ-------ILVLQPASGLHFPAVDALREAMTKRALEASPPRSAVLECTH 503

  Fly   513 VHEFDFTAARGMGSLQKELAKANAPLFLMSADKTIGVILKESTNIDFPTIDCPDDLEFLLEQ--- 574
            |...|:|...|:|.|.::..|....|..:.....:...|..:....|......::.|..|:|   
  Rat   504 VSNIDYTVILGLGELLEDFQKKGVTLAFVGLQVPVLRTLLAADLKGFQYFTTLEEAEKSLQQEPG 568

  Fly   575 TADYVLHLQISAPLVESRLVHGDSG 599
            |..|.:. :.:||...|.|:...||
  Rat   569 TQPYSIR-EDTAPEHRSSLLKSPSG 592

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG6928NP_648539.1 SUL1 19..540 CDD:440424 209/536 (39%)
Slc26a11NP_001385736.1 SUL1 25..567 CDD:440424 214/572 (37%)

Return to query results.
Submit another query.