DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Muc68D and Muc68E

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_648504.2 Gene:Muc68D / 39326 FlyBaseID:FBgn0036203 Length:1514 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_996064.1 Gene:Muc68E / 2768990 FlyBaseID:FBgn0053265 Length:1799 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1823 Identity:443/1823 - (24%)
Similarity:750/1823 - (41%) Gaps:475/1823 - (26%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    69 VIMNNATQSIKKSNDHK-KEVTIKQN------ISVDRPLIFNIFGNFNFFASLWGNSHETTPSPL 126
            ||.:..||.||.....| .::.:.:|      :.:..|..:.|              ..|:|:.:
  Fly    66 VIRDGDTQYIKSRTSEKVSQLNLNKNNDTASKLKIGAPYYYQI--------------KITSPTKI 116

  Fly   127 KPNPIAHFQFINSAVGIEPLSQDNLADKDKKDIISSSSDSSP-----TEDATYSSTQVSSTQVPE 186
            |..|:........:.||:...:|.....::...::..:...|     .||.|..:.: ::|:.||
  Fly   117 KSLPVEVENDRKDSSGIDTTVEDLTPIPEETTTVAQETTYDPEGSTTREDDTTVAIE-TTTEKPE 180

  Fly   187 DASSAESI----QESTT---------QGSRSSTD-----ISLSTEASLDDIILSSESIVPTESST 233
            |.::.|..    :||||         :||.:..|     |..:||...||..:...:.:| |.||
  Fly   181 DDTTVEDSTPIPEESTTVAQETTYDPEGSTTREDDTTVAIETTTEKPEDDTTVEDSTPIP-EEST 244

  Fly   234 TIISSST---EGSW----ESHISTDSSIGSKVESLLIEALYSLIQESSS-SSESPVSNEPSTGAT 290
            |:...:|   |||.    |:.::.:::.....:...:|....:.:||:: :.|:....|.||...
  Fly   245 TVAQETTYDPEGSTTRDDETTVAIETTTEKPEDDTTVEDSTPIPEESTTVAQETTYDPEGSTTRE 309

  Fly   291 DDS-----SSTESLPDST---------QESSS---------------SSESPVSFELSTEATNES 326
            ||:     ::||...|.|         :||::               ..::.|:.|.:||...:.
  Fly   310 DDTTVAIETTTEKPEDDTTVEDSTPIPEESTTVAQETTYDPEGSTTREDDTTVAIETTTEKPEDD 374

  Fly   327 SSSES---LPNSS-------TQDSSSST----ETSFQTESTTDATDESSSTE-SQP---DSTT-- 371
            ::.|.   :|..|       |.|...||    :|:...|:||:..::.::.| |.|   :|||  
  Fly   375 TTVEDSTPIPEESTTVAQETTYDPEGSTTREDDTTVAIETTTEKPEDDTTVEDSTPIPEESTTVA 439

  Fly   372 QESSSSTEGPLSTESSTAVTDQSSSTESSQDSTTQESSSSTEGPLSTESSTEA-----------T 425
            ||::...||..:.|..|.|..: ::||..:|.||.|.|:    |:..||:|.|           |
  Fly   440 QETTYDPEGSTTREDDTTVAIE-TTTEKPEDDTTVEDST----PIPEESTTVAQETTYDPEGSTT 499

  Fly   426 NE-------SSSTESSQDSTTQESSSSTEGPLSTESST---EATNE---------------SSST 465
            .|       .::||..:|.||.|.|:    |:..||:|   :.||:               .::|
  Fly   500 REDDTTVAIETTTEKPEDDTTAEDST----PIPEESTTVAQDTTNDPEGSTTREDDTTVAIETTT 560

  Fly   466 ESSQDSTTQESSSSTEGPLSTESSTEA-----------TNE-------SSSTESSQDSTTQESSS 512
            |..:|.||.|.|:    |:..||:|.|           |.|       .::||..:|.||.|.|:
  Fly   561 EKPEDDTTAEDST----PIPEESTTVAQETTYDPEGSTTREDDTTVAIETTTEKREDDTTVEDST 621

  Fly   513 SSEGPLSTESST---EATNESSSTESSQDSTTQESSSSTESP---LSTEPSTEANESSSTESSQD 571
                |:..||:|   :.||:...:.:.:|.||....::||.|   .:.|.||...|.|:|.:.:.
  Fly   622 ----PIPEESTTVAQDTTNDPEGSTTREDDTTVAIETTTEKPEDDTTAEDSTPIPEESTTVAQET 682

  Fly   572 STTQESSSSTED--PLSTESSTEATNESSSTESS----QDSTT--QESSSSTEGPLSTESSTEGS 628
            :...|.|::.||  .::.|::||...:.::.|.|    ::|||  ||::...||..:.|..|..:
  Fly   683 TYDPEGSTTREDDTTVAIETTTEKPEDDTTVEDSTPIPEESTTVAQETTYDPEGSTTREDDTTVA 747

  Fly   629 NESSSTESSQDSTTQKSSSSTESPLSTEPSTEANES-------------------SSTESSQDST 674
            .| ::||..:|.||.:.|    :|:..|.:|.|.::                   ::||..:|.|
  Fly   748 IE-TTTEKPEDDTTAEDS----TPIPEESTTVAQDTTNDPEGSTTREDDTTVAIETTTEKREDDT 807

  Fly   675 T---------------QESSSSTEGPLSTEPSTEANESSSTESSQDSTTQESSSSSEGPLSTESS 724
            |               ||::...||..:.|..|.....::||..:|.||.|.|:    |:..||:
  Fly   808 TVEDSTPIPEETTTVGQETTYDPEGSTTREEDTTVAIETTTEKPEDDTTAEDST----PIPEEST 868

  Fly   725 TEANES-------------------SSTESSQDSTTQESSSSTESPLSTEPSTEANES------- 763
            |.|.|:                   ::||..:|.||.|.|    :|:..|.:|.|.::       
  Fly   869 TVAQETTYDPEGSTTREDDTTVAMETTTEKREDDTTVEDS----TPIPEESTTVAQDTTNDPEGS 929

  Fly   764 ------------SSTESSQDSTT---------------QESSSSTEGPLSTEPSTEANESSSTES 801
                        ::||..:|.||               ||::...||..:.|..|.....::||.
  Fly   930 TTREEDTTVAIETTTEKPEDDTTVEDSTPIPEETTTVGQETTYDPEGSTTREDDTTVAIDTTTEK 994

  Fly   802 SQDSTT---------------QESSSSSEGPLSTESSTEANESSSTESSQDSTTQESSSSTEDPL 851
            .:|.||               |::::..||..:.|..|.....::||..:|.||.|.|:    |:
  Fly   995 PEDDTTVEDSTPIPEESTTVAQDTTNDPEGSTTREDDTTVAIDTTTEKPEDDTTVEDST----PI 1055

  Fly   852 STESST---EATYESSSTESSQDSTTQESSSSTEGP---LSTESSTEGSNESS-----STESSQD 905
            ..||:|   |.||:...:.:.:|.||....::||.|   .:.|.||....||:     :|...:.
  Fly  1056 PEESTTIAQETTYDPEGSTTREDDTTVAIETTTEKPEDDTTVEDSTPIPEESTTVAQDTTNDPEG 1120

  Fly   906 STTQESSSSTESPLSTE-PSTEANESSSTESSQDSTT--QESSSSTEGPLSTESSTEANESSSTE 967
            |||:|..::.....:|| |..:.....||...::|||  |::::..||..:.|..|.....::||
  Fly  1121 STTREDDTTVAIDTTTEKPEDDTTVEDSTPIPEESTTVAQDTTNDPEGSTTREEDTTVAIETTTE 1185

  Fly   968 SSQDSTTQESSSSTEGPLSTESSTEGSNESSSTESSQDSTTQESSSSTESPLSTE-PSTEANESS 1031
            ..:|.||.|.|:    |:..|::|.|   ..:|...:.|||:|..::.....:|| |..:.....
  Fly  1186 KPEDDTTVEDST----PIPEETTTVG---QETTYDPEGSTTREDDTTVAIDTTTEKPEDDTTVED 1243

  Fly  1032 STESSQDSTT--QESSSSTEGPLSTESSTEASNESSSTESSQDSTTQESSSSTEGPLSTESST-- 1092
            ||...::|||  |::::..||..:.|..|..:.: ::||..:|.||.|.|:    |:..||:|  
  Fly  1244 STPIPEESTTVAQDTTNDPEGSTTREDDTTVAID-TTTEKPEDDTTVEDST----PIPEESTTVA 1303

  Fly  1093 -EVTQEPSPTESLPNSSTQGTPCTTDNP---SSLEPSPSTPGND---------DDSGNSGSENGN 1144
             :.|.:|..:.:..:.:|.....||:.|   :::|.|...|...         |..|::..|  :
  Fly  1304 QDTTNDPEGSTTREDDTTVAIDTTTEKPEDDTTVEDSTPIPEESTTIAQETTYDPEGSTTRE--D 1366

  Fly  1145 SSTSGSPCTTDNPSD----------PESSSSTPGNDDDSGNSGSENGNSSTSGSPCTTDNPSD-- 1197
            .:|.....||:.|.|          ||.|::...:..:.....:.....:|.....||:.|.|  
  Fly  1367 DTTVAIETTTEKPEDDTTVEDSTPIPEESTTVAQDTTNDPEGSTTREEDTTVAIETTTEKPEDDT 1431

  Fly  1198 --------PESSSSTPGNDDDSGNSGSESGITSTTGAPYTT------------DNPASQEPSPSA 1242
                    || .::|.|.:......||.:....||.|..||            ..|..:|.:..|
  Fly  1432 TVEDSTPIPE-ETTTVGQETTYDPEGSTTREDDTTVAIETTTEKPEDDTTVEDSTPIPEETTTVA 1495

  Fly  1243 PENPGDSGNS------------SSESP-----PEGATP---------------------CTPNAP 1269
            .|...|...|            ::|.|     .||:||                     .|.|.|
  Fly  1496 QETTYDPEGSTTRDDTTVAIETTTEKPEDDTTAEGSTPIPDTSTTVNQDTTTDESSTVVTTTNIP 1560

  Fly  1270 KKSTTSSYTAHPTPKYTTEGNKAETSTLKSPTGTTPGHQEDR-------------TDCSNMP--- 1318
            |:|||...:.....:.:|.|..:.::||...|.::|.....|             |..|::|   
  Fly  1561 KESTTLGDSTLSPGENSTAGQVSTSTTLVYDTTSSPIPSSSRSTTLEPSSSSSPETTTSSLPPLS 1625

  Fly  1319 --NGI-FLRDFQSCNKYYVCLNGKAIAGHCPRNLHFDIKRKVCNFPSLVDCPLDEAPENVTKKPS 1380
              .|. :|....:|:||..|.||..:...||.||::|..:.||:..|.| |            .:
  Fly  1626 CSTGYQYLPHPTNCHKYIHCSNGHELIMECPANLYWDYHKFVCSGDSGV-C------------YN 1677

  Fly  1381 DTE-STPDCKSLRNGA-YVRDPKSCSRFYVCANGRAIPRQCPQGLHFDIKSNFCNYPILVQCSLE 1443
            ||| |.|:.|....|. ::..|..|:.:..|:||.|:.|:||..|:::.:...|::......:|.
  Fly  1678 DTENSNPEEKVCGPGVDFLAHPTDCTMYLQCSNGVALERKCPDPLYWNPEIKSCDWSNKYCTNLR 1742

  Fly  1444 ESQADAHGALLAEGV--PDCTKVKEDTRFGDVKQHNKYYVCLKGKAVLHYCSPGNWFDLRSQKCI 1506
            .||:.:..|.:...|  .||               :||..|...:.|:..|:.|.:::..||.|.
  Fly  1743 ASQSISCAAGMNFNVFQSDC---------------SKYVKCFGLRGVVMSCNSGLYWNPVSQVCE 1792

  Fly  1507 DQR 1509
            ..|
  Fly  1793 KSR 1795

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Muc68DNP_648504.2 ChtBD2 21..69 CDD:214696 443/1823 (24%)
PHA03249 1088..>1209 CDD:223023 32/155 (21%)
CBM_14 1314..1366 CDD:279884 19/57 (33%)
CBM_14 1388..1440 CDD:279884 13/52 (25%)
ChtBD2 1459..1505 CDD:214696 10/45 (22%)
Muc68ENP_996064.1 ChtBD2 <1761..1791 CDD:214696 10/44 (23%)
ChtBD2 1626..1668 CDD:214696 13/41 (32%)
ChtBD2 1688..1734 CDD:214696 12/45 (27%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
Isobase 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 1 1.010 - - D33909at6656
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0012676
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 00.000 Not matched by this tool.
Panther 1 1.100 - - P PTHR23301
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 00.000 Not matched by this tool.
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
44.020

Return to query results.
Submit another query.