DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Taf2 and Taf2

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001261668.1 Gene:Taf2 / 39164 FlyBaseID:FBgn0011836 Length:1221 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_579853.1 Gene:Taf2 / 170844 RGDID:621487 Length:1200 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1240 Identity:572/1240 - (46%)
Similarity:785/1240 - (63%) Gaps:97/1240 - (7%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    13 RPFKLAHQVVSLTGISFERRSIIGVVELTIVPNSENLRLIRLNAKQLRIYSVVLNDVCQADFTYF 77
            ||:||.||||.:..|:|:|:|::|.|||||.|...||..|:||:||.|||.|.:||: :|.|.|.
  Rat    24 RPYKLTHQVVCINNINFQRKSVVGFVELTIFPTVANLNRIKLNSKQCRIYRVRINDL-EAAFIYN 87

  Fly    78 DPFQNICYKEHKSRALEVYSKHHLTAAQYTDPDVNNGELLIQVPPEGYSMIQEGQGLRIRIEFSL 142
            ||...:|:.|.|.|.|..:|..:..|....|||..||||.|:||.|.:..:.|.:.|:|.|.|||
  Rat    88 DPTLEVCHSESKQRNLNYFSNAYAAAVSAVDPDAGNGELCIKVPSELWKHVDELKVLKIHINFSL 152

  Fly   143 ENPKCGVHFVIPPASTDEETQMNSSHMFTNCYENSSRLWFPCVDSFADPCTWRLEFTVDKNMTAV 207
            :.||.|:|||:|  |.:.......:|:|:..|:||:|.|||||||:::.|||:||||||..|.||
  Rat   153 DQPKGGLHFVVP--SVEGSMAERGAHVFSCGYQNSTRFWFPCVDSYSELCTWKLEFTVDAAMVAV 215

  Fly   208 SCGELLEVIMTPDLRKKTFHYSVSTPVCAPNIALAVGQFEIYVDPHMHEVTHFCLPGLLPLLKNT 272
            |.|:|:|.:.|.|:|||||||.::.|..|.||:||:|.|||.|||:||||||||||.||||||:|
  Rat   216 SNGDLVETVYTHDMRKKTFHYVLAIPTAASNISLAIGPFEILVDPYMHEVTHFCLPQLLPLLKHT 280

  Fly   273 VRYLHEAFEFYEETLSTRYPFSCYKQVFVDELDTDISAYATMSIASVNLLHSIAIIDQTYISRTF 337
            ..||||.||||||.|:.|||:||:|.||:||...:::|||:|||.|.|||||..|||:|.::|..
  Rat   281 TSYLHEVFEFYEEILTCRYPYSCFKTVFIDEAYVEVAAYASMSIFSTNLLHSAMIIDETPLTRRC 345

  Fly   338 MSRAVAEQFFGCFITSHHWSDTWLAKGIAEYLCGLYSRKCFGNNEYRAWVQSELARVVRYEEQYG 402
            :::::|:|||||||:...|||.|:.|||:.|:.||:.:|.||.|||..|::.||.::|.||.:.|
  Rat   346 LAQSLAQQFFGCFISRMSWSDEWVLKGISGYIYGLWMKKTFGVNEYHHWIKEELDKIVAYELKTG 410

  Fly   403 GIILDCSQPPAPLPVSGTNQSAASSKQQEIVH-YFPIKSLHTVSPKYVEAMRRKAHFVIRMLENR 466
            |::|.        |:.|    ....|.....| :|.||..||:|.:|....:.|||.|:|::|||
  Rat   411 GVLLH--------PIFG----GGKEKDNPASHLHFSIKHPHTLSWEYYTMFQCKAHLVMRLIENR 463

  Fly   467 IGQELLIQVFNKQLALASSAATTKIGAGLWSQLLISTNIFIKAIFTVTGKDMSVFMDQWVRTGGH 531
            |..|.::|||||.|:|||:|::.|..:.:|||:|:||..|:|:|..|:|||:...:.|||...|.
  Rat   464 ISMEFMLQVFNKLLSLASTASSQKFQSHMWSQMLVSTYGFLKSISNVSGKDIQPLIKQWVDQSGV 528

  Fly   532 AKFSLTSVFNRKRNTIELEIRQDYVNQRGIRKYNGPLMVQLQELDGTFKHTLQIESTLVKSDITC 596
            .||..:..||||||.:||||:|||.:. |.:||.|||.|.:|||||:|.||||||...:|.||.|
  Rat   529 VKFYGSFAFNRKRNVLELEIKQDYTSP-GTQKYVGPLKVTVQELDGSFNHTLQIEENSLKHDIPC 592

  Fly   597 HSKSRRNKKKKIPLCTGEEVDMDLSAMD-DSPVLWIRLDPEMILLRDLIIEQPDFQWQYQLRHER 660
            ||||||||||||||..|||||||||||| |||:||||:||:|.:||.:..||.||.|||:||:||
  Rat   593 HSKSRRNKKKKIPLMNGEEVDMDLSAMDADSPLLWIRIDPDMSVLRKVEFEQADFMWQYELRYER 657

  Fly   661 DVTAQFQAIQALQKYPTNATRLALTDTIESERCFYQVRCEAAHSLTKVANQMVASWSGPPAMLNI 725
            ||.||.::|.||:|:||.|:||||||.:|.|:|||:||..|...|.|:||.||::|:|||||.::
  Rat   658 DVVAQQESILALEKFPTPASRLALTDILEQEQCFYRVRMSACFCLAKIANSMVSTWTGPPAMKSL 722

  Fly   726 FRKFFGSFSAPHIIKLNNFSNFQLYFLQKAIPVAMAGLRTSHGICPPEVMRFLFDLFKYNENSRN 790
            |.:.|...:.|:|:|.|||.:||.|||||.:|||||.||..|.:||.||:.|:.||.|||:|.:|
  Rat   723 FTRMFCCKTCPNIVKTNNFMSFQSYFLQKTMPVAMALLRDVHNLCPKEVLTFILDLIKYNDNRKN 787

  Fly   791 HYTDAYYRAALVEALGETLTPVVSVAIHGTQITTDSLSTDAKLVLDEVTRLLNMEKHLPSYKYMV 855
            .::|.||||.:::||..::||.|||  :....|.|:|:.|.:|:|:|:||.|||||.||||::.:
  Rat   788 KFSDNYYRAEMIDALANSVTPAVSV--NNEVRTLDNLNPDVRLILEEITRFLNMEKLLPSYRHTI 850

  Fly   856 SVSCLKVIRKLQKFGHLPSLPHIYRSYAEYGIYLDLRIAAMECLVDFVKVDGRSEDLEHLITLLE 920
            :||||:.||.|||.||:||...:::||||||.::|:||||:|.:||:.|||...|:|:.|:.:::
  Rat   851 TVSCLRAIRVLQKNGHVPSDASLFKSYAEYGHFVDIRIAALEAVVDYTKVDRSYEELQWLLNMIQ 915

  Fly   921 TDPDPAARHALAQLLIDNPPFTRESRSRLDKPNLVDRLWFSINR-LPYDTKLRCDIVDLYYALYG 984
            |||.|..||.:..:|..|||||:...|.|....|||:||..:|. ..:|.:|||..||||:.|:|
  Rat   916 TDPVPYVRHKILNMLTKNPPFTKNMESPLCNEALVDQLWKLMNSGTAHDWRLRCGAVDLYFTLFG 980

  Fly   985 TKRPNCLQAGE-----NQSFYKDLMKDNNSSVGSVTGSFKKTSDSKSHLPTPTNTLDN---EPQE 1041
            ..||:||...|     |....|.::   |.::....|...:.:.|.....|......|   ..|:
  Rat   981 LSRPSCLPLPELGLVLNLKEKKAVL---NPTIIPEAGVGNQETASNPGCHTQLAGFQNPFSSSQD 1042

  Fly  1042 RQKPAMVTIKRTATEAFEVGDEIIKLER------------SEEITVLDE--------PVNVQAYD 1086
            .::..|.|:.  .::|| :...:..|||            |...:::.:        |.....:.
  Rat  1043 EEEVDMDTVH--DSQAF-ISHHLNMLERPSTPGLSKYRPSSSRSSLMPQHALGCDITPTTKPQWS 1104

  Fly  1087 SE-TKVNALQADEEARDTHQAAKRLKNEMYAEDDNSSTMLDVGDSTRYESSHEEGKLKSGDGGLK 1150
            .| ::..|.:........|..|..|  .::|::..||..    .|..:...|.|           
  Rat  1105 MELSRKGAGKEQPLEMGVHPVAAPL--SVFAKEALSSAR----HSEHHHHHHHE----------- 1152

  Fly  1151 KKKKKEKKKHKHKHKHRHSKD-KDKDKDKERKDKDKRDPHISRLQARETATPDTLSSEDSSNSNS 1214
              .||:||||||||||:|..| ||||||||                     |.|.||..|..|..
  Rat  1153 --HKKKKKKHKHKHKHKHKHDGKDKDKDKE---------------------PFTFSSPASGRSVR 1194

  Fly  1215 LPPMN 1219
            .|.::
  Rat  1195 SPSLS 1199

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Taf2NP_001261668.1 M1_TAF2 16..544 CDD:189018 261/528 (49%)
Taf2NP_579853.1 M1_TAF2 27..541 CDD:189018 255/514 (50%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C166352950
Domainoid 1 1.000 574 1.000 Domainoid score I210
eggNOG 1 0.900 - - E1_KOG1932
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H31137
Inparanoid 1 1.050 1085 1.000 Inparanoid score I225
OMA 1 1.010 - - QHG57568
OrthoDB 1 1.010 - - D134492at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0004794
OrthoInspector 1 1.000 - - oto97913
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_102824
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR15137
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X4475
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 1 0.960 - -
1615.770

Return to query results.
Submit another query.