Protein Alignment Prm and myh11b

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_523982.2
• Gene: Prm / 39002
• FlyBaseID: FBgn0003149
• Length: 879
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_017210292.1
• Gene: myh11b / 566080
• ZFINID: ZDB-GENE-101124-2
• Length: 2005
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 907
• Identity: 209/907 - (23%)
• Similarity: 417/907 - (45%)
• Gaps: 79/907 - (8%)

  Fly     3 SSQAVRSSKYSYRATSTGPGTADVNIEYIQDLSSLSRLEDKIRLLQDDLEVERELRQRIEREKAD 67
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Zfish  1105 SEMEIQELQASVEAESTQKSNA---------LKKIHEMEGLLSELQDELEAEQGAGRKSEKARKE 1160

  Fly    68 LSVQVIQMSERLEEAEGGAEHQFEANRKRDAELLKLRKLLEDVHLESEETTLLLKKKHNEIITDF 132
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Zfish  1161 LEEELSALRTELEDSLDTTAVQQELRAKREQEVAMLKKLIEDEGRSHEAQVHELKQKHAQAVDEL 1225

  Fly   133 QEQVEILTKNKARAEKDKAKFQTEVYELLSQIESYNKEKIVSEKHISKLEVSISELNVKIEELNR 197
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Zfish  1226 SQQLDQSKRAKATLEKAKQALEKEVGDLNGNLRSLGNAKQDLEQKKKKVETQLADLQTRFNESER 1290

  Fly   198 TVIDISSHRSRLSQE--------------NIELTKDVQDLKVQLDTVSFSKSQVISQLEDARRRL 248
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Zfish  1291 KREELGDAVSKLNTEYNNVNSILNEAESKNIKLSKDVVSLN--------------SQLQDAQELL 1341

  Fly   249 EDEDRRRSLLESSLHQVEIELDSVRNQLEEESEARIDLERQLVKANADATSWQNKWNSEVAARAE 313
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Zfish  1342 AEETRQKLNFSTRLRQMEDERNGLLEQIDEETEARRNVERHVSSLNTQLSEAKKRLD-EYSSNFQ 1405

  Fly   314 EVEEIRRKYQVRITELEEHIESLIVKVNNLEKMKTRLASEVEVLIIDLEKSNNSCRELTKSVNTL 378
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Zfish  1406 MLEESKKRLQRDLEATKGELEEKTASYDKSEKTKNHLQQELDDVLLDLDNQ----RQL---VSNM 1463

  Fly   379 EKHNVELKSRL-DETIILYETSQR------DLKNKHADLVRTVHELDKVKDNNNQLTRENKKLGD 436
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Zfish  1464 EKKQRKFDQMLADEKTLSSKYSQERDCAEAEAREKETKCLALTRALEECQGSLRELEKLNKTLRT 1528

  Fly   437 DLHEAKGAINELNRRLHELELELRRLENERDELTAAYKEAEAGRKAEEQRGQRLAADFNQYRHDA 501
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Zfish  1529 DMEDLISSKD--NKNAHELEKTKRALEAQVEEMTIQMEELEDELQAAEDAKLHLEVNMQALKVQI 1591

  Fly   502 ERRLAEKDEEIEAIRKQTSIEIEQLNARVIEAETRLKTEVTRIKKKLQIQITELEMSLDVANKTN 566
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Zfish  1592 QRDIQGREEQSEEKRKQLLKQVRELEAE-LEDEQKMRTSLAAAKKKLEGDLQDLEDQVDVNSRAR 1655

  Fly   567 IDLQKVIKKQSLQLTELQAHYEDVQRQLQATLDQYAVAQRRLAGLNGELEEVRSHLDSANRAKRT 631
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Zfish  1656 DEAVKQLRKIQTQMKDYQRELEDARASHKEVLSDARESERKARAMEAEILHLHEELASAEKARKH 1720

  Fly   632 VELQYEEAASRINELTTANVSLVSIKSKLEQELSVVASDYEEVSKELRISDERYQKVQVELKHVV 696
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Zfish  1721 AERERDEIAGEMASGSFGKSGTSDEKRRLESKIQHLEEELDDEQATTETLNERLRRSVQEVDQLT 1785

  Fly   697 EQVHEEQERIVKLETIKKSLEVEVKNLSIRLEEVELNAVAGSKRIISKLEARIRDLELELEEEKR 761
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Zfish  1786 NELHTERSNAQRMESGWQQMERQNKELRAKLLEMEGQVKSKQRSTVAALESKLQQTEDQLDHESR 1850

  Fly   762 RHAETIKILRKKERTVKEVLVQCEEDQKNLILLQDALDKSTAKINIYRRQLSEQEGVSQQTTTRV 826
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Zfish  1851 ERQAIAKAMRQKDKKLKELMNQVEDERKQMEQYKDQAEKANLRARQLKMQMEESDEESQRATAAR 1915

  Fly   827 RRFQRELEAAEDRADTAESSLNIIRAK------------------------HRTFVTTSTVP 864
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Zfish  1916 RKLQKELNEAIEANDALSREVSSLRSKLRRGSDSSFSTPLRRSAGGSFRQARRTMMETSEIP 1977

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Prm	NP_523982.2	Myosin_tail_1	<34..853	CDD:460256	197/839 (23%)
myh11b	XP_017210292.1	Myosin_N	32..74	CDD:460670
		MYSc_class_II	97..788	CDD:276951
		Myosin_tail_1	865..1943	CDD:460256	203/871 (23%)