Protein Alignment Prm and myh9b

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_523982.2
• Gene: Prm / 39002
• FlyBaseID: FBgn0003149
• Length: 879
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001427874.1
• Gene: myh9b / 561431
• ZFINID: ZDB-GENE-030131-998
• Length: 1960
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 829
• Identity: 219/829 - (26%)
• Similarity: 415/829 - (50%)
• Gaps: 22/829 - (2%)

  Fly    37 LSRLEDKIRLLQDDLEVERELRQRIEREKADLSVQVIQMSERLEEAEGGAEHQFEANRKRDAELL 101
            :..||.::..||:|||:||..|.:.|:.:.||..::..:...||:.......|.|...||:.|:.
Zfish  1109 IRELESQLSELQEDLELERAARTKAEKHRRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRTKRETEVA 1173

  Fly   102 KLRKLLEDVHLESEETTLLLKKKHNEIITDFQEQVEILTKNKARAEKDKAKFQTEVYELLSQIES 166
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Zfish  1174 QLKKALEEDAKVHEQVMAEIRQKHSQAFDELNEQLEQVKRNKVSVEKSKQALESERNELQIELQT 1238

  Fly   167 YNKEKIVSEKHISKLEVSISELNVKIEELNRTVIDISSHRSRLSQE--NIE-LTKDVQDLKVQLD 228
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Zfish  1239 LMQGKGESEHRRKKAEAQLQELQVKHTESERQRIELAERLTKMQAELDNVNTLLSDAEGKSIK-- 1301

  Fly   229 TVSFSKSQVISQLEDARRRLEDEDRRRSLLESSLHQVEIELDSVRNQLEEESEARIDLERQLVKA 293
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Zfish  1302 -ASKDCSTVESQLQDVQEVLQEETRQKLSLNTRLRQLEDEQHSLREQLEEEEEAKRNLEKQIGTM 1365

  Fly   294 NADATSWQNKWNSEVAARAEEVEEIRRKYQVRITELEEHIESLIVKVNNLEKMKTRLASEVEVLI 358
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Zfish  1366 QAQLVDMKKKMEQE-SGSLECAEESRKRVQRDLEAVSQRLDERNAAFDKLDKTKTRLQQELDDML 1429

  Fly   359 IDLEKSNNSCRELTKSVNTLEKHNVELKSRL--DETIILYETSQRD-----LKNKHADLVRTVHE 416
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Zfish  1430 VDQD-------HLRQIVSNLEKKQKKFDQMLAEEKSISARYAEERDRAEAEAREKETRMLALARE 1487

  Fly   417 LDKVKDNNNQLTRENKKLGDDLHEAKGAINELNRRLHELELELRRLENERDELTAAYKEAEAGRK 481
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Zfish  1488 LETLTDMKEELDRTNKLLRAEMEDLVSSKDDVGKSVHDLEKSKRAMEQQLEEMKTQLEELEDELQ 1552

  Fly   482 AEEQRGQRLAADFNQYRHDAERRLAEKDEEIEAIRKQTSIEIEQLNARVIEAETRLKTEVTRIKK 546
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Zfish  1553 ATEDAKLRLEVNMQAMKAQYERDLQGRDELGEEKKRQLLKQVREMEME-LEDERKQRTLAMAARK 1616

  Fly   547 KLQIQITELEMSLDVANKTNIDLQKVIKKQSLQLTELQAHYEDVQRQLQATLDQYAVAQRRLAGL 611
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Zfish  1617 KMELDLKELEAAIDQANKNRDEALKQLKKVQAQMKDLLRELEDTRLSREEILAQSKENEKKVKSM 1681

  Fly   612 NGELEEVRSHLDSANRAKRTVELQYEEAASRINELTTANVSLVSIKSKLEQELSVVASDYEEVSK 676
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Zfish  1682 EAEMIQMQEELAAAERAKRQAQQERDELQDEINNQAAKGALGSEERRRLEARIAQLEEELEEEQN 1746

  Fly   677 ELRISDERYQKVQVELKHVVEQVHEEQERIVKLETIKKSLEVEVKNLSIRLEEVELNAVAGSKRI 741
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Zfish  1747 NTELVNDRLKRALLQTDQMNVELTAERSTSQRLEGARSQQERQNKELKLKLTELEGTVKSKYKAT 1811

  Fly   742 ISKLEARIRDLELELEEEKRRHAETIKILRKKERTVKEVLVQCEEDQKNLILLQDALDKSTAKIN 806
            |:.|||:|..||.:|:.|.|...:..|::|:.|:.:|||::|.:::::|....:|..||..:::.
Zfish  1812 IAALEAKIGQLEEQLDVETRERQQASKLVRRTEKKLKEVILQVDDERRNTEQYKDQSDKLNSRMK 1876

  Fly   807 IYRRQLSEQEGVSQQTTTRVRRFQRELEAAEDRADTAESSLNIIRAKHR 855
            ..:|||.|.|..:|:.....|:.|||||.|.:.||.....:|.:::|.|
Zfish  1877 QLKRQLEEAEEEAQRANANRRKLQRELEDATESADAMNREVNSLKSKLR 1925

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Prm	NP_523982.2	Myosin_tail_1	<34..853	CDD:460256	217/825 (26%)
myh9b	NP_001427874.1	None