Protein Alignment Prm and myh6

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_523982.2
• Gene: Prm / 39002
• FlyBaseID: FBgn0003149
• Length: 879
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_942118.1
• Gene: myh6 / 386711
• ZFINID: ZDB-GENE-031112-1
• Length: 1936
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 843
• Identity: 290/843 - (34%)
• Similarity: 497/843 - (58%)
• Gaps: 6/843 - (0%)

  Fly    25 DVNIEYIQDLSSLSRLEDKIRLLQDDLEVERELRQRIEREKADLSVQVIQMSERLEEAEGGAEHQ 89
            |..:..:|....|...:.:|..|:::|:.||..|.::|::::|:|.::..:|||||||.|....|
Zfish  1096 DEQMASVQLQKKLKENQARIEELEEELDAERAARAKVEKQRSDISRELEDISERLEEAGGATSAQ 1160

  Fly    90 FEANRKRDAELLKLRKLLEDVHLESEETTLLLKKKHNEIITDFQEQVEILTKNKARAEKDKAKFQ 154
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Zfish  1161 VELNKKRDAEFQKIRRDLEESTLQHEATTASLRKKHADSVAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKVELK 1225

  Fly   155 TEVYELLSQIESYNKEKIVSEKHISKLEVSISELNVKIEELNRTVIDISSHRSRLSQENIELTKD 219
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Zfish  1226 LELDDLASNMESIVKAKVNLEKMCRSLEDQMNEHRSKAEEAQRALNDVSTQKAKLLTENGELGRQ 1290

  Fly   220 VQDLKVQLDTVSFSKSQVISQLEDARRRLEDEDRRRSLLESSLHQVEIELDSVRNQLEEESEARI 284
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Zfish  1291 LEEKECLISQLTRGKTSYAQQLEDLRRQLEEEVKAKNALAHAVQSARHDCDLLREQFEEEQEAKA 1355

  Fly   285 DLERQLVKANADATSWQNKWNSEVAARAEEVEEIRRKYQVRITELEEHIESLIVKVNNLEKMKTR 349
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Zfish  1356 ELQRALSKANTEVATWRARYETDGIQRTEELEDAKKKLVQKLQDAEEAVEAVNAKCSSLEKTKHR 1420

  Fly   350 LASEVEVLIIDLEKSNNSCRELTKSVNTLEKHNVELKSRLDETIILYETSQRDLKNKHADLVRTV 414
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Zfish  1421 LQNEIEDLMLDLERSNAASAALDKKQRSFDKVMAEWKQKYEESQCELEGAQKEARSLSTELFKLK 1485

  Fly   415 HELDKVKDNNNQLTRENKKLGDDLHEAKGAINELNRRLHELELELRRLENERDELTAAYKEAEAG 479
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Zfish  1486 NSYEETLDHLETIKRENKNLQEEISDLTDQVSEGRKSVHELEKLRKQLEQEKTELQSALEEADAS 1550

  Fly   480 RKAEEQRGQRLAADFNQYRHDAERRLAEKDEEIEAIRKQTSIEIEQLNARVIEAETRLKTEVTRI 544
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Zfish  1551 VEHEEGKILRAQLEFNQLKADFERKMSEKDEEMEQARRNYQRMIESLQAS-LEAETRSRNEALRV 1614

  Fly   545 KKKLQIQITELEMSLDVANKTNIDLQKVIKKQSLQLTELQAHYEDVQRQLQATLDQYAVAQRRLA 609
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Zfish  1615 KKKMEGDLNEMEIQLSQANRQAADAQKQLKMVQSCLKETQLQMDDTLHSNDDLKENITLLERRNN 1679

  Fly   610 GLNGELEEVRSHLDSANRAKRTVELQYEEAASRINELTTANVSLVSIKSKLEQELSVVASDYEEV 674
            .:..||||:|..|:...|.::..|.:..:|..|:..|.:.|..|::.|.|.|.:|..:.::.||:
Zfish  1680 LMQTELEELRGILEQTERVRKLAEQELTDATERMQLLHSQNTGLINQKKKQESDLLQLQNELEEL 1744

  Fly   675 SKELRISDERYQKVQVELKHVVEQVHEEQERIVKLETIKKSLEVEVKNLSIRLEEVELNAVAGSK 739
            .:|.|.::|:.:|...:...:.|::.:||:....||.:||::|..:|:|..||:|.|..|:.|.|
Zfish  1745 VQENRNAEEKAKKAITDAAMMAEELKKEQDTSAHLERMKKNMEQTIKDLQHRLDEAEQVAMKGGK 1809

  Fly   740 RIISKLEARIRDLELELEEEKRRHAETIKILRKKERTVKEVLVQCEEDQKNLILLQDALDKSTAK 804
            :.:.|:|||||:||.||:.|::|.:|::|.:||.||.:||:..|.:||:|||..|||.:||...|
Zfish  1810 KQLQKMEARIRELENELDAEQKRGSESVKGVRKFERRIKELTYQTDEDRKNLARLQDLVDKLQLK 1874

  Fly   805 INIYRRQLSEQEGVSQQTTTRVRRFQRELEAAEDRADTAESSLNIIRAKHRTFVTTSTVPGSQ 867
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Zfish  1875 VKSYKRSAEEAEELANANTAKLRKLQHELEEAEERADIAESQVNKLRAK-----TRDGAPGKK 1932

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Prm	NP_523982.2	Myosin_tail_1	<34..853	CDD:460256	283/818 (35%)
myh6	NP_942118.1	Myosin_N	32..76	CDD:460670
		MYSc_class_II	99..766	CDD:276951
		Myosin_tail_1	846..1923	CDD:460256	285/827 (34%)