Protein Alignment Prm and myh9a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_523982.2
• Gene: Prm / 39002
• FlyBaseID: FBgn0003149
• Length: 879
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001091647.3
• Gene: myh9a / 333938
• ZFINID: ZDB-GENE-030131-5870
• Length: 1961
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 825
• Identity: 221/825 - (26%)
• Similarity: 425/825 - (51%)
• Gaps: 12/825 - (1%)

  Fly    36 SLSRLEDKIRLLQDDLEVERELRQRIEREKADLSVQVIQMSERLEEAEGGAEHQFEANRKRDAEL 100
            |:..:|.:|..||:|||:|:..|.:.|:::.||..::..:...||:.......|.|...||:.|:
Zfish  1109 SIREMEAQISELQEDLELEKAARNKAEKQRRDLGEELEALKTELEDTLDSTAAQQELRAKRETEV 1173

  Fly   101 LKLRKLLEDVHLESEETTLLLKKKHNEIITDFQEQVEILTKNKARAEKDKAKFQTEVYELLSQIE 165
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Zfish  1174 TQLKKTLEDEARAHEQMLSEVRQKHNQAFEELNEQLEQSKRSKASVDKAKQALESERNELQIELK 1238

  Fly   166 SYNKEKIVSEKHISKLEVSISELNVKIEELNRTVIDISSHRSRLSQENIELTKDVQDLKVQLDTV 230
            |.::.|..||....|.|..:.||.||..|..|...::....|::..|...|...|  .||:..::
Zfish  1239 SLSQSKNDSENRRKKAESQLQELQVKHTESERQKHELLDKVSKMQAELESLQGTV--TKVESKSI 1301

  Fly   231 SFSK--SQVISQLEDARRRLEDEDRRRSLLESSLHQVEIELDSVRNQLEEESEARIDLERQLVKA 293
            ..:|  |.|.|||:||:..||:|.|::..:.:.|.|:|.|.::::..||||.|::.::|:||..|
Zfish  1302 KAAKDCSAVESQLKDAQALLEEETRQKLAISTRLRQLEDEQNNLKEMLEEEEESKKNVEKQLHTA 1366

  Fly   294 NADATSWQNKWNSEVAARAEEVEEIRRKYQVRITELEEHIESLIVKVNNLEKMKTRLASEVEVLI 358
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Zfish  1367 QAQLAEMKKKIEQE-AQSLESMEDGKKKLQREVESVLQQLEERNASYDKLDKTKTRLQRELDDVL 1430

  Fly   359 IDLEKSNNSCRELTKSVNTLEKHNVELKS---RLDETIILYETSQRDLKNKHADLVRTVHELDKV 420
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Zfish  1431 VDQGHLRQTVQELERKQKKFDQMLAEEKSISTKYAEERDRAEAEAREKETKSLTLAR---ELEAM 1492

  Fly   421 KDNNNQLTRENKKLGDDLHEAKGAINELNRRLHELELELRRLENERDELTAAYKEAEAGRKAEEQ 485
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Zfish  1493 TDLKNELERVNKQLKTEMEDLVSSKDDAGKSVHELERAKRGMEQQLEEMKTQLEELEDELQLTED 1557

  Fly   486 RGQRLAADFNQYRHDAERRLAEKDEEIEAIRKQTSIEIEQLNARVIEAETRLKTEVTRIKKKLQI 550
            ...||..:....:...||.|..:||:.|..|||...::.::... :|.|.:.:.:...::|||::
Zfish  1558 AKLRLEVNMQALKAQFERDLQSRDEQGEEKRKQLVKQVREMEME-LEDERKQRAQAVSVRKKLEL 1621

  Fly   551 QITELEMSLDVANKTNIDLQKVIKKQSLQLTELQAHYEDVQRQLQATLDQYAVAQRRLAGLNGEL 615
            .::||...:|:|||...:..|.:||...|:.|....:||::.....:|:|....:|::..:..|:
Zfish  1622 DLSELAAQIDLANKARDEALKQLKKLQAQMKEQMREFEDLRLSRDESLNQAKENERKIKSMEAEI 1686

  Fly   616 EEVRSHLDSANRAKRTVELQYEEAASRINELTTANVSLVSIKSKLEQELSVVASDYEEVSKELRI 680
            .::...|.:|:||||.::.:.:|....||.....|......:.:||..::.:..:.||....:.:
Zfish  1687 MQLHEDLAAADRAKRQIQQERDELQDEINSQNAKNSLSSDERRRLEARIAQLEEELEEEHLSVEL 1751

  Fly   681 SDERYQKVQVELKHVVEQVHEEQERIVKLETIKKSLEVEVKNLSIRLEEVELNAVAGSKRIISKL 745
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Zfish  1752 VNDRLKKASLQAEQVTVELTAERSNSQRLEGLRSQLDRQNKDMKQKLQELEGAVKSKYKSTITAL 1816

  Fly   746 EARIRDLELELEEEKRRHAETIKILRKKERTVKEVLVQCEEDQKNLILLQDALDKSTAKINIYRR 810
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Zfish  1817 ETKIQQLEEQLDSEMKERQQSTKQVRRVEKKLKEVLLQVEDERRNADQSKTETEKANIRLKQMKR 1881

  Fly   811 QLSEQEGVSQQTTTRVRRFQRELEAAEDRADTAESSLNIIRAKHR 855
            ||.|.|..:.:.....|:.:||||.|.:.|......::.::.|.|
Zfish  1882 QLEETEEEAARANASCRKLRRELEDATESASAMNREVSTLKNKLR 1926

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Prm	NP_523982.2	Myosin_tail_1	<34..853	CDD:460256	219/821 (27%)
myh9a	NP_001091647.3	None