Protein Alignment Prm and nmy-3

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_523982.2
• Gene: Prm / 39002
• FlyBaseID: FBgn0003149
• Length: 879
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_501620.2
• Gene: nmy-3 / 177750
• WormBaseID: WBGene00012437
• Length: 1464
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 889
• Identity: 188/889 - (21%)
• Similarity: 353/889 - (39%)
• Gaps: 241/889 - (27%)

  Fly    95 KRDAEL----LKLRKLLEDVHLESEETTLLLKKKHNEIITDFQEQVEILTKNKARAEKDKAKFQT 155
            |.||.|    ||...:||.:.:..|.....|  .|:|.|    |:..:|.|||   |:.|...:.
 Worm   665 KIDAPLVLAQLKCNGVLEGIRICREGYPSRL--SHSEFI----ERYSLLMKNK---EQSKGASEK 720

  Fly   156 EVYELLSQIESYNKEK--IVSEKHISKLEVSISELNVKIEE-LNRTVIDISSHRSRLSQENI--- 214
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 Worm   721 EKCTLICQDAQVRKERYAVGKTKLFCKVGV-ISELETKRNNYISSFII--------LIQANIRYL 776

  Fly   215 ELTKDVQDLKVQLDTV--------SFSK-SQ------------VISQLEDARRRLEDEDRRRSLL 258
            .:.||:.:.:.:|:.|        .|:: ||            :|.:..| :.|:|:.:..:..|
 Worm   777 NIQKDLIERRKKLEAVVTIQDNVRQFAELSQWPWYRIYHLTRGLIPRNRD-KERIEELENEKLKL 840

  Fly   259 ESSLHQVEIELDSVRNQ-------LEEESEARIDLERQLVKANADATSWQNKWNSEVAARAEEVE 316
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 Worm   841 EEEIQEMEIKNEEALKENLKLSMLLDREKSEKVKVQKELEEVEKQGREKLLEKEREFRKTMEEME 905

  Fly   317 E-------IRRKYQVRITELEEHIESLIVKVNNLEKMKTRLASEVEVLIIDLEKSNNSCREL--- 371
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 Worm   906 QNEEIFNVLERKYN------EQH--KKVMKMNDVLREYERKIEQLNMEKTDLENENQKLRETQNR 962

  Fly   372 -TKSVNTLEKHNVELKSRLDE-----------------TIILYETSQRDLKNKHA-------DLV 411
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 Worm   963 QDSHYSNLEKEVMEKSSLIDELQNQIQKLSDENNEQRLTIAKLETALEDEKARFARQNNTIGDMQ 1027

  Fly   412 RTVHEL-DKV----------KDNNNQLTRENKKLGDDLHEAKGAINELNRRLHELELELRRLENE 465
            :.:.|| :|:          :::..::.||.:||.::|..||..|.:..:::.||:.|.|:.:||
 Worm  1028 KLISELNEKIARFDNIALNERNSTRKIEREKEKLNEELTTAKEIIQKQAKKIDELKEECRKRKNE 1092

  Fly   466 RDELTAAYKEAEAGRKAEEQRGQRLAAD-FNQYRHDAERRLAEKDEEIEAIRKQTSIEIEQLNAR 529
            ...|.         ||.|::  :.:.|| ..:.:...:.||.|.::::|.::::.|
 Worm  1093 ASRLE---------RKLEDK--EAMMADCVKELKDSHKERLKEMEQKVEDVKRKNS--------- 1137

  Fly   530 VIEAETRLKTEVTRIKKKLQIQITELEMSLDVANKTNIDLQKVIKKQSLQLTELQAHYEDVQRQL 594
                    |.|.....:|.||:..:.|.|:|                           .|..|..
 Worm  1138 --------KLENENSTQKSQIETFQRESSVD---------------------------SDYGRSS 1167

  Fly   595 QATLD----QYAV------AQRRLAGLNGELEEVRSHLDSANRAKRTVELQYEEAASRINELTTA 649
            ...|.    ||::      :..|..||....:.: |.:.|:..:.|..:..|:..:|.|....:.
 Worm  1168 SGRLSTLGRQYSLTSIGSFSSIRTVGLGSRKDSI-SDMTSSMYSLRRRDSTYDMTSSTIGLQRSP 1231

  Fly   650 NVSLVSIKSK----LEQELSVVASDYEEVSKELRISDERYQKVQVELKHVV----EQVHEEQERI 706
            :.|.|..|.:    ||:|.:.:.:|.:.|.:||.:...:...|:.|.:.:.    :|.::.||..
 Worm  1232 STSQVMEKERRILELEKEKAAINTDLQLVKRELDVYKSQLSAVESEKESLQTANRKQSNQLQETT 1296

  Fly   707 VKLETIKKSLEVEVKNLSIRLE------------------EVELNAVAGSKRIISKLEARIRDLE 753
            .:|.:.:|:.:    ||::||:                  |.:...:...||.:.:.||..::.|
 Worm  1297 RQLNSAQKNAD----NLALRLKKALADCDEWKKKHEESIVESKTEILMERKRAMDRAEACEKETE 1357

  Fly   754 LELEEEKRRHAETIKILRKK-----ERT------VKEVLVQCEEDQKNLILLQDALDKSTAKINI 807
            |     |:....||:..|.:     .||      .:::::|.||:.|:...|.::..:....:|.
 Worm  1358 L-----KQSRMATIESARMELGGELARTQSELDRCRQIIIQLEENLKSQESLGNSFGRHQTNLNF 1417

  Fly   808 ---------------YRRQLSEQEGVSQQ--TTTRVRRFQRELE 834
                           .|||..:.|.::||  |...:..|:.::|
 Worm  1418 EIENLRDENCALKAKIRRQYKQIELLTQQDETNDELNHFENKVE 1461

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Prm	NP_523982.2	Myosin_tail_1	<34..853	CDD:460256	188/889 (21%)
nmy-3	NP_501620.2	MYSc_class_II	97..747	CDD:276951	26/90 (29%)
		SMC_prok_B	848..>1463	CDD:274008	137/687 (20%)