Protein Alignment Prm and cgnl1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_523982.2
• Gene: Prm / 39002
• FlyBaseID: FBgn0003149
• Length: 879
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_017947906.2
• Gene: cgnl1 / 100145705
• XenbaseID: XB-GENE-5754486
• Length: 1272
• Species: Xenopus tropicalis
• Alignment Length: 890
• Identity: 196/890 - (22%)
• Similarity: 385/890 - (43%)
• Gaps: 145/890 - (16%)

  Fly     2 SSSQAVRSSKYSYRATSTGPGTADVNIEYIQD-LSSLSRLEDKIRLLQDDLE----VERELRQRI 61
            ::...|..|..:.:..:|.....| :|.|:.. |.|..:..|.:::::..|:    :....|:.|
 Frog   433 NAQSKVYGSLQNQKEKNTNADEPD-SISYLSSTLPSRGKKYDDVKMIKSTLQLKDCISSPPREGI 496

  Fly    62 EREKADL--SVQVIQMSERL------------EEA----------EGGAEHQFEANRKRDAELLK 102
            .|..|.:  |.||.|.:..|            ||.          ||..::.....||.:....|
 Frog   497 RRAAATMQGSSQVAQATPDLLKGQQQVALQTNEETAKQILFNYLKEGSPDNDDATKRKVNLVFEK 561

  Fly   103 LRKL----LEDVHLESEETTLLL--KKKHNEIITDFQEQVEILTKNKARAEKDKAKFQTEVYELL 161
            ::.|    ...|...|.:..:||  ||:..:.:...||:::...||..| :|:.:..:..:.:..
 Frog   562 IQTLKSRAANTVQDPSADIKVLLEQKKELEKRVAALQERLDEEIKNHKR-DKEDSNTKANMKDFH 625

  Fly   162 SQIESYNKEKIVSEKHISKLEVSISELNVKIEELNRTVIDISSHRSRLSQENIELTKDVQDLKVQ 226
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 Frog   626 DQLEQSMDENLVLRKRLGESE---KELRKHLDEL-----------FELKMEQEQYQTEIRDLQEQ 676

  Fly   227 LDTVSFSKSQVISQLEDARRRLEDEDRRRSLLESSLHQVEIELDSVRNQLEEESEARIDLERQLV 291
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 Frog   677 L-------SEMHDELDNAKSSVDDGE-REAFIE--------ELMQMKQSFQEVLLAKEEQEDLLR 725

  Fly   292 KANADATSWQNKWNSEVAARAEEVEEIRRKYQVRITELEEHIESLIVKVNNLEKMKTRLASEVEV 356
            |...:.|:.:.....|||...:|:::::.:|...:..:.:::.:.:...:::...|
 Frog   726 KRERELTALKGALKEEVATHDQELDKLKEQYDKELKSIRDNLTAAVKNSSDIANQK--------- 781

  Fly   357 LIIDLEKSNNSCRELTKSVNTLEKHNVELKSRLDETIILYETSQRDLKNKHADLVRTVHELDKVK 421
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 Frog   782 -----DEANQLKAVFENRVKGLLQENEELKSKIENLEAKIAALRQEIKDLNEENERIKDKLSKSE 841

  Fly   422 DNNNQL--TRENKKLGDDLHEAKGAINELNRRLHELELELRRLENERDELTAAYKEAEAGRKAEE 484
            ....||  ..||.|  |...||.....:|..:|.:.:..|.|:.:|..:||...|| ||.:|.:
 Frog   842 KEKQQLAIALENSK--DQEKEALQFARKLENQLEDTKRSLSRVSHEHQQLTERLKE-EANQKEQ- 902

  Fly   485 QRGQRLAADFNQYRHDAERRLAEKDEEIEAIRKQTSIEIEQLNARVIEAETRL---KTEVTRIKK 546
                     ....:::.|....:.|:.||.::|:.|..:|......:|.:.:.   |.:..|...
 Frog   903 ---------LRNLKNEMENERWQLDKTIEKLQKEISENVEFSRMSTVELQKQFDEYKDKYRRESA 958

  Fly   547 KLQIQITELEMSLDVANKTNIDLQKVIKKQSLQLTELQAHYEDVQRQLQATLDQYAVAQRRLAGL 611
            ::|.||.:..:.::.|.:|       |||...::..|:.:.:|.||.....|.:..:.|:.:..|
 Frog   959 EMQRQIKDKNLEVERACQT-------IKKLQDEVRHLEENLQDHQRAQDEALTKNHLLQQTIKDL 1016

  Fly   612 NGELEEVRSHLDSANRAKRTVELQYEEAASRINELTTANVSLVSIKSKLEQELSVVASDYEEVSK 676
            ..|| :.::|:..                .||.::.:....|    |:||.||     |.|:.:.
 Frog  1017 QYEL-DAKTHVKD----------------DRIRQIKSMEDKL----SQLEMEL-----DEEKNNS 1055

  Fly   677 ELRISDERYQKVQVELKHVVEQVHEE--QERIVK--LETIKKSLEVEVKNLSIRLEEVELNAVAG 737
            :|.:  ||..:.:.:    :||...|  |||..|  ||..|.|||.:.|:|..|:..:|.:..:.
 Frog  1056 DLLL--ERVTRCREQ----IEQTRSELFQERAAKQDLECDKISLERQNKDLKSRIVHLENSHRSN 1114

  Fly   738 SKRIISKLEARIRDLELELEEEKRRHAETIKILRKKERTVKEVLVQCEEDQKNLILLQDALDKST 802
            .:.:::::|.||.:||..||.|:|..|......|:.||.|||:::|.:::.   :.|.|..|:.:
 Frog  1115 KEGLVAQMETRIAELEERLENEERERASLQLNNRRLERKVKELMMQVDDEH---LTLTDQKDQLS 1176

  Fly   803 AKINIYRRQLSEQEGVSQQTTTRVRRFQRELEAAEDRADTAESSL 847
            .::...:||:.|.|....:..:..::.||:||...|..|..::.|
 Frog  1177 LRLKSMKRQVEEAEEEIDRLESAKKKLQRDLEEQTDINDQLQTQL 1221

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Prm	NP_523982.2	Myosin_tail_1	<34..853	CDD:460256	190/857 (22%)
cgnl1	XP_017947906.2	Myosin_tail_1	<586..1228	CDD:460256	165/736 (22%)