DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment rhea and TLN2

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001246674.1 Gene:rhea / 38978 FlyBaseID:FBgn0260442 Length:2836 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_005254765.1 Gene:TLN2 / 83660 HGNCID:15447 Length:2557 Species:Homo sapiens


Alignment Length:2586 Identity:1220/2586 - (47%)
Similarity:1727/2586 - (66%) Gaps:94/2586 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MSTLSLRIQLEGGRVTKTIQFQPNTTVFDACKVIRDKFAEAVQGQPSEYGLFISDEQNQQGVWLE 65
            |..|||:|.:....|.||:||:|:|.|:|||:|||::..||..||.|:||||:|||..::|:|||
Human     1 MVALSLKICVRHCNVVKTMQFEPSTAVYDACRVIRERVPEAQTGQASDYGLFLSDEDPRKGIWLE 65

  Fly    66 PGRTLGYYILHNQDTLEYRRKTRTLRVRMLDGAVKTILVDDSQPVSQLMVVICTKIGITNHEEYG 130
            .||||.||:|.|.|.|||::|.|..::|||||:|||::||||:.|.:|:|.||::|||||:|||.
Human    66 AGRTLDYYMLRNGDILEYKKKQRPQKIRMLDGSVKTVMVDDSKTVGELLVTICSRIGITNYEEYS 130

  Fly   131 LVREDNEAQNENLPDNKFGTLTLKRKIMEKDR-----DAKMESLRKKLKTDDEMNWVDVSRTLRE 190
            |::|..|.:.|.      ||.|||     |||     :.|||.|:.||.|||::||:|.|||.||
Human   131 LIQETIEEKKEE------GTGTLK-----KDRTLLRDERKMEKLKAKLHTDDDLNWLDHSRTFRE 184

  Fly   191 QGIDEAETVLLRRRFFFSDQNIDSRDPVQLNLLYVQARDAILDGTHPVTQDKACEFAGIQVHIQF 255
            ||:||.||:||||:||:||||:|||||||||||||||||.||:|:|||:.:|||||.|.|..|||
Human   185 QGVDENETLLLRRKFFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQARDDILNGSHPVSFEKACEFGGFQAQIQF 249

  Fly   256 GPHNEAKHKTGFLDLKDFLPQSYVRTKGIEKKIFSEHRKHVDLSEIDAKVLYTKTARELPTYGVT 320
            |||.|.|||.||||||:|||:.|::.:|.||:||.||:...::|||:|||.|.|.||.|.||||:
Human   250 GPHVEHKHKPGFLDLKEFLPKEYIKQRGAEKRIFQEHKNCGEMSEIEAKVKYVKLARSLRTYGVS 314

  Fly   321 FFLVKEKMNGKNKLVPRLLGVTKDSVLRLDEHTKEILISWPLTTVRRWGASPNTFTLDFGDYANQ 385
            ||||||||.|||||||||||:|||||:|:||.|||:|..||||||:||.|||.:||||||:|...
Human   315 FFLVKEKMKGKNKLVPRLLGITKDSVMRVDEKTKEVLQEWPLTTVKRWAASPKSFTLDFGEYQES 379

  Fly   386 YYSVQTTEAEQIVQLIAGYIDIILKKKQTKDHFGIEGDEGSTMVEESVAPSKATFLQHETNRMEQ 450
            ||||||||.|||.|||||||||||||||:||.||:||||.|||:||||:|.|:|.||.:.||..:
Human   380 YYSVQTTEGEQISQLIAGYIDIILKKKQSKDRFGLEGDEESTMLEESVSPKKSTILQQQFNRTGK 444

  Fly   451 LNVESLAHPGIMRP-YDGERSYMENEVQTVQYGAFVGQVNHAHQPPTTKEVRISSVNLTEPQRAL 514
            ....|:|.|.:||. ..|..::....:.:.|....|||::..|.||           ||..|:||
Human   445 AEHGSVALPAVMRSGSSGPETFNVGSMPSPQQQVMVGQMHRGHMPP-----------LTSAQQAL 498

  Fly   515 LGYISAGQDVLIRADEELRTKAPIQELGSDLRSIEWRENTLDTSKQAVSSHVATMSAATAQII-- 577
            :|.|:.....:.:|.::|.....:..||.|:.|..|.:|.:|.||..:.|.|..::|.||.::  
Human   499 MGTINTSMHAVQQAQDDLSELDSLPPLGQDMASRVWVQNKVDESKHEIHSQVDAITAGTASVVNL 563

  Fly   578 TASHPDEVDTEAISASVSQIAQTIPEVTKEVRLIAALMENDT-SGDQLLEAARNLCSAFSDLLKA 641
            ||..|.:.|..|:..:::.|:..:.|::|.|:|:||||:::. ||:.||.|||.|..|.||||||
Human   564 TAGDPADTDYTAVGCAITTISSNLTEMSKGVKLLAALMDDEVGSGEDLLRAARTLAGAVSDLLKA 628

  Fly   642 AEPESKEPPQHLINAASRVGEATTHVLSTIAEEEVPENRDLHDMLLALAKAVANTTAALVLRAKN 706
            .:|.|.||.|.::.||..:|:|:..:|..|.|.|..|.  ..|:|::|||||||..|.|||:|||
Human   629 VQPTSGEPRQTVLTAAGSIGQASGDLLRQIGENETDER--FQDVLMSLAKAVANAAAMLVLKAKN 691

  Fly   707 IAASCDDEQARNRVIGAASQCALATSQLVACAKVVAPTLHNAACREQLEAAAKNVARAVNSLCEV 771
            :|...:|...:||||.||:||||:|||||||||||:||:.:..|:|||..|.|.|.|:|.:....
Human   692 VAQVAEDTVLQNRVIAAATQCALSTSQLVACAKVVSPTISSPVCQEQLIEAGKLVDRSVENCVRA 756

  Fly   772 CNEASNDPKLKADLLAAARDVSKSLTDMLEHVKLSSREHANRTSTELSPVENVIIGTD------- 829
            |..|:.|.:|...:.|||..||::|.|:|:||    |:.|:|.    .|:......||       
Human   757 CQAATTDSELLKQVSAAASVVSQALHDLLQHV----RQFASRG----EPIGRYDQATDTIMCVTE 813

  Fly   830 -ILVSTHDPQEMVRHARTLGQTTAQLIQSIKGEADQQQDADMKRHLLSAAKQLADATAKLVEAAR 893
             |..|..|..||||.||.|.|.|:.|:.:::.:|:.:.|.:..:.||:|||.|||:||::||||:
Human   814 SIFSSMGDAGEMVRQARVLAQATSDLVNAMRSDAEAEIDMENSKKLLAAAKLLADSTARMVEAAK 878

  Fly   894 LCSSNPHDSDNQNALRKAAEELREITTTAANTPAMKRGLIQRLEFCSKQAASAATQCISAAQNAV 958
            ..::||.:.|.|..||:|||.|| :.|.||...|:|:.::.|||..:||||:||||.|:|:|||.
Human   879 GAAANPENEDQQQRLREAAEGLR-VATNAAAQNAIKKKIVNRLEVAAKQAAAAATQTIAASQNAA 942

  Fly   959 QHSQDHQTKETLLQDCKRVADTIPRLVTSLKTTRAQPDDPNAQLNLIEAAEQFIEPALQVSKSSR 1023
            ..:::...::.|:|.||.|||.||:||..::.::||.:|.:|||.||.:::.|::|..::..|::
Human   943 VSNKNPAAQQQLVQSCKAVADHIPQLVQGVRGSQAQAEDLSAQLALIISSQNFLQPGSKMVSSAK 1007

  Fly  1024 ALQPTVTDIPSATQLSKGALHLGQCVSELHSVAQRARDACGGQELESALEEVRKLHDVLDDTRQA 1088
            |..|||:|..:|.|||:.|.:|...::||.:.:|:|.:|||..|::|||..|:.|.:.|.|.:.|
Human  1008 AAVPTVSDQAAAMQLSQCAKNLATSLAELRTASQKAHEACGPMEIDSALNTVQTLKNELQDAKMA 1072

  Fly  1089 AIAGQLRPLPGQTVENTADELRKSAKNVGIALSQLLSSVLHNQRSYAGAAGRDTALALGDFTRSV 1153
            |:..||:||||:|:|..|.:|..::|.||.:::|||:........|.|.|.|:||.||....::.
Human  1073 AVESQLKPLPGETLEKCAQDLGSTSKAVGSSMAQLLTCAAQGNEHYTGVAARETAQALKTLAQAA 1137

  Fly  1154 HGVAATTQNP----AIIDCADDVVTSSARLIEQAQRTL---QGASNPEALTQAGREVTGALSATV 1211
            .||||:|.:|    |::|.|.||:..||.||::|::.|   ..|...:.|.|..:.|:.:|:..|
Human  1138 RGVAASTTDPAAAHAMLDSARDVMEGSAMLIQEAKQALIAPGDAERQQRLAQVAKAVSHSLNNCV 1202

  Fly  1212 DCIPGQREVDVALRNVSELSEILSMSEFPPSSRPYATLQSELKQVAEQLSSAGGEIV-VSYSSPA 1275
            :|:|||::|||||:::.|.|:.|.:...|||::|:...||||.|.|..|:.:.||:| .:.....
Human  1203 NCLPGQKDVDVALKSIGESSKKLLVDSLPPSTKPFQEAQSELNQAAADLNQSAGEVVHATRGQSG 1267

  Fly  1276 LLAESSQNFAANYRDLLSVSMEMAGQTQEEEVRSHMIESLRHVSTQSCSLLSTAKSIAADPGQPN 1340
            .||.:|..|:.::.:.|...:|||||.|.:|.:..:|.:|:::|..|..||..|||::.|||.||
Human  1268 ELAAASGKFSDDFDEFLDAGIEMAGQAQTKEDQIQVIGNLKNISMASSKLLLAAKSLSVDPGAPN 1332

  Fly  1341 AKNLLHAAARGVTESINQLVDASIQSAPGQKECDNAMRNIEALRLMLDYPHEPINELGYFDCVEQ 1405
            |||||.||||.||||||||:....|.||||||||||:|.:|.::.|||.|:||:::|.||||:|.
Human  1333 AKNLLAAAARAVTESINQLITLCTQQAPGQKECDNALRELETVKGMLDNPNEPVSDLSYFDCIES 1397

  Fly  1406 ATGKSRNLGYAISEMINNAKQSQHVEFSQSVNNVNDSIQGLIESSSQAAYLIGVSHPSSVAGRPG 1470
            ....|:.||.:::.:..|||......|.:.|...:.::.||.|:::|||||:|:|.|:|.||..|
Human  1398 VMENSKVLGESMAGISQNAKTGDLPAFGECVGIASKALCGLTEAAAQAAYLVGISDPNSQAGHQG 1462

  Fly  1471 IIDQAQLTWAYQGIRQHCDIVSSQQSTKPQMISALTVIAKHTSYLCSICRQASMNTSNPVAKNEF 1535
            ::|..|...|.|.|:..|..:....|:..|::||.|::|||||.||:.||.||..|:|||||..|
Human  1463 LVDPIQFARANQAIQMACQNLVDPGSSPSQVLSAATIVAKHTSALCNACRIASSKTANPVAKRHF 1527

  Fly  1536 IVLAKQVATATSDLVQDIKAIEEQSAGGSRER---LVDPLLEAVKAVRQYASSSEFSSVPAKISA 1597
            :..||:||.:|::||:.|||::...:..:|.:   ...||:|||:.:..:||:.||.|:||:||:
Human  1528 VQSAKEVANSTANLVKTIKALDGDFSEDNRNKCRIATAPLIEAVENLTAFASNPEFVSIPAQISS 1592

  Fly  1598 EGRKAQEPVIQAGRGVIDGVVEMVKAAKSLALTPDNPPVWQQLSMHSTPVSESVKRLVDNIRDKA 1662
            ||.:||||::.:.:.:::....:::.|:|||:.|.:||.|..|:.||..||:|:|.|:.:|||||
Human  1593 EGSQAQEPILVSAKTMLESSSYLIRTARSLAINPKDPPTWSVLAGHSHTVSDSIKSLITSIRDKA 1657

  Fly  1663 PGQAQCEQVLHTLGTCTRELDSCALAVNAQGLSQRRDNNLHGFSGQTMNSASELIDKLEPIRMAG 1727
            |||.:|:..:..:..|.|:::..:||..:|.|:.|.|.::.....|..:...|:...::||..|.
Human  1658 PGQRECDYSIDGINRCIRDIEQASLAAVSQSLATRDDISVEALQEQLTSVVQEIGHLIDPIATAA 1722

  Fly  1728 KNNAEQLGHAVGEISRYVVPMVNGAIGACTHIVHSQQQMSLIQQTRSVVESAITLVQSAKESAGN 1792
            :..|.||||.|.:::.|..|::..|:|..:.|:..||||:::.||:::.|||:.::.:|||..||
Human  1723 RGEAAQLGHKVTQLASYFEPLILAAVGVASKILDHQQQMTVLDQTKTLAESALQMLYAAKEGGGN 1787

  Fly  1793 PRATHAHPRLDDAIDGTREAIQELQQTVEKINAETGIVTGLMEQVNRSITRLTDKRQSLLNASYS 1857
            |:|.|.|..:.:|....:||:.::..|:.:..:|.|:|.|:::.:..::::|.:...    ....
Human  1788 PKAQHTHDAITEAAQLMKEAVDDIMVTLNEAASEVGLVGGMVDAIAEAMSKLDEGTP----PEPK 1848

  Fly  1858 DTFVDYQTRMVARAKEIASLANEMNAKSSVEPSALPQLAVDMTQNYQQLTQDSVGASTTTSSPDV 1922
            .|||||||.:|..:|.||..|.||..||...|..|..||..||.:|..|......|:.|....::
Human  1849 GTFVDYQTTVVKYSKAIAVTAQEMMTKSVTNPEELGGLASQMTSDYGHLAFQGQMAAATAEPEEI 1913

  Fly  1923 AMRIRTTVIDLGRSVSSMIQSSAGGAR--PNDAGAQKEIARSAREVSEKVAQVLAALQAGSRGTQ 1985
            ..:|||.|.|||.....::| .||..:  |.|:..::|:...||.|:|||:.||:|||||::|||
Human  1914 GFQIRTRVQDLGHGCIFLVQ-KAGALQVCPTDSYTKRELIECARAVTEKVSLVLSALQAGNKGTQ 1977

  Fly  1986 ACINAAHTVSGIIGDLDTTIMFATAGTLHSDGDGSFADHREHILQTAKALVEDTKVLVTGAAGTQ 2050
            |||.||..|||||.||||||||||||||:::...:||||||:||:||||||||||:||:|||.|.
Human  1978 ACITAATAVSGIIADLDTTIMFATAGTLNAENSETFADHRENILKTAKALVEDTKLLVSGAASTP 2042

  Fly  2051 DQLANAAQNAVSTITQLAEAVKRGACSLGSTQPDSQVMVINAVKDVASALGDLINCTKLASGKSI 2115
            |:||.|||::.:|||||||.||.||.||||..|::||::|||:||||.||.|||:.||.|:.|.:
Human  2043 DKLAQAAQSSAATITQLAEVVKLGAASLGSDDPETQVVLINAIKDVAKALSDLISATKGAASKPV 2107

  Fly  2116 NDPSMQDLKESARVMVLNVSSLLKTVKAVEDEHTRGTRAMEATVEAISQEIRAMHSPPPVGNTQV 2180
            :||||..||.:|:|||.||:||||||||||||.||||||:|||:|.|.||:....|......|. 
Human  2108 DDPSMYQLKGAAKVMVTNVTSLLKTVKAVEDEATRGTRALEATIECIKQELTVFQSKDVPEKTS- 2171

  Fly  2181 GPEDLIRVTMNVTAATAKAVAAGTSNLQADIVSAANLGRRAISEMLIVCRSVAWNCAETEELRSR 2245
            .||:.||:|..:|.|||||||||.|..|.|:::.|||.|:|:|:||..|:..:::...::|:|:|
Human  2172 SPEESIRMTKGITMATAKAVAAGNSCRQEDVIATANLSRKAVSDMLTACKQASFHPDVSDEVRTR 2236

  Fly  2246 TLEAGTAVGESYRDLLSG---ILHNCSADDRMHL---SRRVAKCVTDLVAMARLLKGSDWIDPED 2304
            .|..||.....|.|||..   ||...:.:.:..|   |:|||..||:|:..|..:||::|:||||
Human  2237 ALRFGTECTLGYLDLLEHVLVILQKPTPEFKQQLAAFSKRVAGAVTELIQAAEAMKGTEWVDPED 2301

  Fly  2305 PTVIAENELLGAAASIDAAAKKLASLRPRRQADVKIELDENMKFDEMILEAAKGIMGASAALVRA 2369
            ||||||.|||||||||:||||||..|:||.:..   :.||.:.|:|.||||||.|..|::|||::
Human  2302 PTVIAETELLGAAASIEAAAKKLEQLKPRAKPK---QADETLDFEEQILEAAKSIAAATSALVKS 2363

  Fly  2370 ANAAQRELIDTGKVARRPLTSSDDGQWSEGLISAARLVAAATHSLVEAAQNLVRGVGTEEMLIST 2434
            |:||||||:..|||...|..::||||||:|||||||:|||||.||.|||...|:|..:||.|||:
Human  2364 ASAAQRELVAQGKVGSIPANAADDGQWSQGLISAARMVAAATSSLCEAANASVQGHASEEKLISS 2428

  Fly  2435 AKQVAASTAQLLIACKVKSNPNSEAGRRLQ---------------AAGNAVIKSTDNLVHSAQQG 2484
            ||||||||||||:|||||::.:|||.||||               ||||||.:::||||.:||:.
Human  2429 AKQVAASTAQLLVACKVKADQDSEAMRRLQVMVTDAGGKILLLERAAGNAVKRASDNLVRAAQKA 2493

  Fly  2485 LEAE-EEHSLKINTSMVDGMAQEINARSAVLRKEKELEEARQLLKNVRHAQ 2534
            ...: ::..:.:.|..|.|:||.|.|:..:|:||:||||||:.|..:|..|
Human  2494 AFGKADDDDVVVKTKFVGGIAQIIAAQEEMLKKERELEEARKKLAQIRQQQ 2544

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
rheaNP_001246674.1 FERM_f0 4..85 CDD:293120 46/80 (58%)
B41 89..322 CDD:214604 142/237 (60%)
FERM_N 92..147 CDD:286467 29/54 (54%)
FERM_M 215..322 CDD:278785 70/106 (66%)
FERM_C_Talin 318..409 CDD:269973 71/90 (79%)
Talin_middle 510..668 CDD:286254 59/160 (37%)
I_LWEQ 686..>778 CDD:302998 51/91 (56%)
Vinculin <874..>1035 CDD:279395 73/160 (46%)
talin-RS 1661..1832 CDD:213393 55/170 (32%)
Tar <1694..2005 CDD:223910 115/312 (37%)
VBS 1859..1982 CDD:286057 52/124 (42%)
I_LWEQ 2392..2534 CDD:279885 84/157 (54%)
TLN2XP_005254765.1 FERM_f0 4..85 CDD:318667 46/80 (58%)
B41 90..316 CDD:214604 142/236 (60%)
FERM_C_Talin 312..403 CDD:269973 71/90 (79%)
Talin_middle 494..655 CDD:312608 59/160 (37%)
I_LWEQ 706..842 CDD:327626 62/143 (43%)
talin-RS 1045..>1174 CDD:213393 53/128 (41%)
talin-RS 1656..1827 CDD:213393 55/170 (32%)
VBS 1850..1974 CDD:312463 52/124 (42%)
ILWEQ 2337..2547 CDD:214607 111/208 (53%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C165152094
Domainoid 1 1.000 863 1.000 Domainoid score I56
eggNOG 1 0.900 - - E1_KOG4261
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H56692
Inparanoid 1 1.050 2215 1.000 Inparanoid score I41
Isobase 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 1 1.010 - - D7374at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0003071
OrthoInspector 1 1.000 - - otm41512
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_103395
Panther 1 1.100 - - O PTHR19981
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 1 1.030 - avgDist Average_Evolutionary_Distance R4187
SonicParanoid 1 1.000 - - X1785
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 1 0.960 - -
User_Submission 00.000 Not matched by this tool.
1514.790

Return to query results.
Submit another query.