Protein Alignment mus301 and polq

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_648178.1
• Gene: mus301 / 38905
• FlyBaseID: FBgn0002899
• Length: 1051
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_009293682.1
• Gene: polq / 566079
• ZFINID: ZDB-GENE-040724-232
• Length: 2576
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1171
• Identity: 306/1171 - (26%)
• Similarity: 517/1171 - (44%)
• Gaps: 239/1171 - (20%)

  Fly     4 KHNLCKKRSLDLSEESTSESHAKRQCTENLF---------------WPEGEDDDSFFSNAHLEDL 53
            :|.:.|.|.|.|::|...:......|.|::.               |..|  |.|...:..:...
Zfish    13 QHRIVKTRGLSLADEKPGQRQLSNLCQEDVSENRSIIAPKQIQSKQWMPG--DSSLAMDEEILQA 75

  Fly    54 LDGRKEELFGTQATTSTNKMTQSGSDDGLGLFADTSFPSAQSVPPNSASKPDEASAPTDKHQIDL 118
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Zfish    76 IDELGPEVM------KFKKIEKIQQTEPAPLKKNCDFPKNAEIPKEQNAENISPSSPSEHKRTRT 134

  Fly   119 ADEENAD--KLFKKINLNDLSIAEMEDIFHGAD---DFSDPMVQNTQLFLDAM--TFKKPKTPEK 176
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Zfish   135 QAKKEGDWKDLAQKLLFSETKKIEVGGRTHDLKQNRDYSSP-----QKILNSMKKTSKVAKSKQK 194

  Fly   177 L-----LAPLKDDSMSFISKSVIEGLVQGTQYVTCEE----------LKNQS---LLDPVNWETQ 223
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Zfish   195 LNFREVTSP--NDSKDYI-------LFSPTHMAAAKERSVLQQQKRSLKNQSVSVLTPPPGLDLT 250

  Fly   224 AFADFEKNN-----------QDIDKFPSKGEFYGLPDKVKKMILE---HKGINSLYEWQDECLNL 274
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Zfish   251 VLGDATLSDAAQSIHMGRPADQLDKLLLSS--WGLP----KPVLEKYQSLGVHRMFEWQAECLTL 309

  Fly   275 PAIRQRKNLIYALPTSGGKTLVAEILMLRELLCRERNVLFILPYVSIVQEKVSAMSPFAIDLDFI 339
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Zfish   310 GKVLEGQNLVYSAPTSAGKTLVSELLILKRVLETRQKAMFILPFVSVAREKMFYLQNVFQEAGIR 374

  Fly   340 VEEY---TAGKGKCPPQPRRKRRSLFIASIEKGAVLMDSLIDVQRPHEIGLVVVDELHLIGEKGR 401
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Zfish   375 VEGYMGSTSAAGGF------SALDVAVCTIEKANGLVNRLIEEDKLDLLGTVVVDELHMVGDSGR 433

  Fly   402 GATLEAFLTKVMFL-------------NANIQIVGMSATIGNLSEISSFLNADVYTRGFRPVELK 453
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Zfish   434 GYLLELLLTKIRYIAQKTATRNSGQSTSTGVQIIGMSATLPNLDLLARWLSAELYSTNYRPVPLM 498

  Fly   454 EYIKCGPDLLE--INSAGQTLEEIFVPSRSVEYNYSEAVKRADPDHLAGLISECAPE-HCCLVFC 515
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Zfish   499 EWVKIGTNIYDGSLNLVRQ-----FTPALPI---------KGDDDHIVSLCFETVQDGHSALLFC 549

  Fly   516 PSRKNCENVALLLSRIVPKHKFF--EHRRSEK--------------LDLMDALDKMCGILSPVLA 564
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Zfish   550 PSKNWCEKLADSIGR-----EFYNLHHKEMQSGSGGQSISLNQEGLLDVLAQLKRTPAGLDHVLQ 609

  Fly   565 KTLPYGIAYHHSGLTTDERKYIETAYRFGVVTVICCTSTLAAGVNLPAKRVIIRAPYVGQEFLTL 629
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Zfish   610 RTVPWGVAFHHAGLTFDERDILEGAFRQGYIRVLAATSTLSSGVNLPARRVIIRTPVFNGHLLDI 674

  Fly   630 CKYKQMVGRAGRAGLGEAGESILIAQSKDNLLVGQMLFSPMDKALSS-LDQNEAVG-----LQSL 688
            ..||||||||||.|:...|||:|:.:..:. ..|..|.....|.:|| |.:.|..|     |:::
Zfish   675 LTYKQMVGRAGRKGVDTIGESVLVCKEAER-AKGMSLIQGSLKPISSCLVKREGEGVTTSMLRAI 738

  Fly   689 ILSVVGLNLAECRRDLNRLVNSTLLSVQAKSLEVAVNEIVLRILREMFKNKVLQLAEPQAKSK-- 751
            :..:|| .:|...:|:......|||:....:.||..:.                 :|.:|::|
Zfish   739 LEIIVG-GVASSPQDVRMYAACTLLAASIAAEEVHQDG-----------------SESEARNKGA 785

  Fly   752 -------INSSDIITSQDVSQANRPAGDRRLLIGQSTPFKLTNIGRAAFKAGIDYKRANAIHKEL 809
                   :..::.|..|......|              :..|::|.|...:.:....|..|..:|
Zfish   786 IEACIEWLMDNEFIHIQKEGDVER--------------YCPTHLGSATLSSSLSPPEALGIFADL 836

  Fly   810 KQAQQQLILTNYLHLLYLVVCFNSNERGDELFPA-------DASILFGVYTSLPLDSQAMFKQLG 867
            ::|.:..:|.|.||:||            ::.|.       |....|.::..||...:.:.:.:|
Zfish   837 QRAMKGFVLENDLHILY------------QITPVYVDWTTIDWYQFFCLWEQLPSAMKRVAEMVG 889

  Fly   868 FTEAHAAR------LFKTQSVQGPLSLQLNRLYKVLILADILNLLPIPSVASKYNVERGTLQHLI 926
            ..|...||      :.||:..:..:::. .|.:..|:|.|:::..|:.:||.||...||.||.|.
Zfish   890 IQEGFLARSVGGKLIAKTEKQRRQMAIH-KRFFTTLVLLDLVSEEPLGAVAKKYGCSRGQLQSLQ 953

  Fly   927 SQSTAAASAIVRLCEELEEFWCYKPLFERILHKMDRCGTF----ELEPLMELPAVKINRARQLYA 987
            ..::..|..:...|..|.  |   ...|.:|.:.....:|    ||..|:.:..:...|||.||:
Zfish   954 QSASTYAGMVTVFCNRLG--W---HNLELLLSQFQSRLSFGVQRELCDLVRISLLTAQRARTLYS 1013

  Fly   988 AGFQTIGDIARVRPSHLVQSL-EHMPLRVATEIVSAAKIILMKKLDHLEEETENLKD--CLKTSD 1049
            :||.|:.::||...:.:.::| :.:|.:.:.:.|           |..|.|.:..|.  |:..|.
Zfish  1014 SGFVTVAELARADVTEVEKALRKAIPFKSSRQAV-----------DESEVEAQERKSMRCIWVSG 1067

  Fly  1050 K 1050
            |
Zfish  1068 K 1068

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
mus301	NP_648178.1	DEXHc_POLQ-like	247..449	CDD:350784	76/220 (35%)
		BRR2	255..828	CDD:440817	193/625 (31%)
polq	XP_009293682.1	BRR2	287..855	CDD:440817	193/637 (30%)
		DNA_pol_A_theta	2093..2571	CDD:176475