DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment melt and Veph1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_523953.2 Gene:melt / 38785 FlyBaseID:FBgn0023001 Length:994 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_008759273.1 Gene:Veph1 / 361954 RGDID:1308217 Length:833 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1019 Identity:318/1019 - (31%)
Similarity:479/1019 - (47%) Gaps:228/1019 - (22%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MHELFNKVLAKRDLSRAGDLFSVPDADIVDDITEVLSEISPIISHADYVKNNNDQSVVEICVTRV 65
            ||:||..||.::||||||||||:.||:|.|.:||.|.:|..|.|..||..|||||:|||||:||:
  Rat     1 MHQLFRLVLGQKDLSRAGDLFSLDDAEIEDSLTEALEQIKVISSSLDYQTNNNDQAVVEICITRI 65

  Fly    66 LSCIRETKTAERYCAALVDLLRTCLLWNLQPSGTTKEEPPHAKIAADIISSIFLNYDKKELMKIA 130
            .:.||||::.|::..|||.|..:||..||:|:| ..|:.||||||:||:|.|..||::..:|.:|
  Rat    66 TTAIRETESIEKHARALVGLWDSCLEHNLRPAG-KDEDTPHAKIASDIMSCILQNYNRTPVMVLA 129

  Fly   131 LPVAVQFLPKGNRELSRNLASYLSLAAIDHAGLLSPHTESVMESILSGNYGLLRVLSQVYEVAPE 195
            :|:||:||.:|::||.||:::|||||||..|.||:.|||.:::|||.||..|||||..|||..|:
  Rat   130 VPIAVKFLHRGSKELCRNMSNYLSLAAITKADLLADHTEGIVKSILQGNAMLLRVLPAVYEKQPQ 194

  Fly   196 AVTPHAPLLMPLLPQCDPQERMAVFQ-LYLLIVQKSPEVLESCVPQLCGSLLDSDTSSITMQILL 259
            .:..|...|:.|:.|.:..|:..:.: |::...:|..||::.|||.|..:|.:|..:.|.:.||:
  Rat   195 PINRHLAELLALMSQLEQTEQYHLLRLLHVAAKRKDVEVVQKCVPFLIRNLKESTYNDIILNILI 259

  Fly   260 KLSQHSPSLLVDHFEQLRLAAKTNPGTIPLCAQIMTTAGIGSKETAQQALDFVLEHLPTQA---- 320
            :::.|.|..|......|:..|:..|......|:|....|...:|.|:..|.:::..|....    
  Rat   260 EIAGHEPLALNSFLPMLKEIAEQFPYLTGQMARIFGAVGHVDEERARSCLRYLVSQLANMEHSFH 324

  Fly   321 -LLQQEATRLCSAYPVLFTDKVLACVRQKNA------ALSSQQDVGNGLANKTSGGVTIVSLNSS 378
             :|..|...|..|:..:.........|..|:      .||.|.:                  ||.
  Rat   325 HILLLEIKSLTDAFSSILGPHSRDIFRMSNSFTNIAKLLSRQLE------------------NSK 371

  Fly   379 SPSPPLKPVPVGAPAINTTIVQPASVVSATPTPPPSSASAPI-----ASSTPVSAATPTPQHAGY 438
            :.|        |.....|.:..|..........|.|.....:     |....::|.:.||   |.
  Rat   372 AES--------GRRRTGTEVSFPEKFREPKTMEPKSEDHEKLQVKIQAFEDKINAESHTP---GS 425

  Fly   439 TRRVKLGDSRSTGRLHPASNTHRSVTRLNVASGSVG----------GLHKSMTRLSNSQINQQPG 493
            .||..|.......|.:...:..||:....|.:.||.          |:|.|   :|.|:|:    
  Rat   426 VRRYSLDHVSKEERKNVRFSRSRSLALNTVLTNSVNVEDGEIEGKTGMHAS---ISLSEID---- 483

  Fly   494 GSSNGNVVVQSGATPKTPTGLSNPPVTPVPPLSNNVVITGHNRHGIPVTSGGVTVTTSPSKVRPH 558
                                         ||           .|||    |.|     |.|...|
  Rat   484 -----------------------------PP-----------GHGI----GKV-----PFKTDTH 499

  Fly   559 SQGPSTLLNSSTVLMKYSTDALNQSVGSISIPQSAAVATLPSTQTQNAVSVHHASPA-LPQSASN 622
            .   |.|.|||                          |:.|        |:.|:.|. :|::...
  Rat   500 G---SQLRNSS--------------------------ASHP--------SIIHSEPENMPETFKE 527

  Fly   623 GHAKSVMKLPVNGNSEVIVSGPTTNVAPRRSDNTSRTLLNANSVMDQRMSTFEPYQIMRDPVQQF 687
                       |...|:    |...::|                        ..||   |.:...
  Rat   528 -----------NVQEEI----PEAAISP------------------------VEYQ---DKLYLH 550

  Fly   688 CEKNFNSIKSYMDEVSQHLPPPTRCSIEVSNEFAERRTKKVAKLHFACQIRGPHCLYSKTCFTMR 752
            .::|.:.:|:|..|:::.:|.|.:|:||      :.....||||.|.|.::|.:|||||:.||:.
  Rat   551 LKENLSKVKAYALEIAKKVPIPDQCTIE------DNTRSCVAKLFFTCSLKGHYCLYSKSSFTLV 609

  Fly   753 TRNPKTWIHMMFLDFQVRHFVKEKCVLSTRESGISNLKNIWQILKCE---NRSFTELVT-SQFPQ 813
            ::.|:.||.:||| ||...|.:.   ||.:...:..||.:|:  |.:   ..||...:| |.|||
  Rat   610 SQAPQPWIQIMFL-FQQSLFPEP---LSIQSGSVQFLKALWE--KTQGTGTHSFEVAMTESTFPQ 668

  Fly   814 VKDREILVNELRHSGFLDVFEVSKTDKSNPNCNELEYQWGCFLCNHPDKAVGFLNGSNQPMIEGQ 878
            .||.:.|...|....|.|||..|:|..:          |.||:||:|:||. .:|...||:|||:
  Rat   669 QKDLDQLQLHLEEVRFFDVFGFSETAGA----------WQCFMCNNPEKAT-VINQDGQPLIEGK 722

  Fly   879 LKEKKGKWRLFRRWRTRYFTLSGAHLSC-KGSSGGE----SIDVNQIRSVKV---SRGARNIPKA 935
            ||||:.:|:..:||:||||||:|..|.. ||.|..:    .|::::::|||.   .|..|::|:|
  Rat   723 LKEKQVRWKFIKRWKTRYFTLAGNQLLFQKGKSKDDPDDSPIELSKVQSVKAVAKKRRDRSLPRA 787

  Fly   936 FEIFTADQTLILKPKDGKNAEEWVQCLSIVVAHSQARDNPTAKT 979
            |||||.::|.:.|.||.||||||:||:::.:|.::.|::....|
  Rat   788 FEIFTDNKTYVFKAKDEKNAEEWLQCINVALAQAKERESREVTT 831

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
meltNP_523953.2 DUF5585 508..>659 CDD:465521 25/151 (17%)
PH_MELT_VEPH1 872..972 CDD:269965 49/107 (46%)
Veph1XP_008759273.1 PH_MELT_VEPH1 716..824 CDD:269965 49/107 (46%)

Return to query results.
Submit another query.