Protein Alignment Mdr65 and pmd1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_476831.1
• Gene: Mdr65 / 38726
• FlyBaseID: FBgn0004513
• Length: 1302
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001342744.1
• Gene: pmd1 / 2538709
• PomBaseID: SPCC663.03
• Length: 1362
• Species: Schizosaccharomyces pombe
• Alignment Length: 1374
• Identity: 455/1374 - (33%)
• Similarity: 697/1374 - (50%)
• Gaps: 139/1374 - (10%)

  Fly     7 STSSSEGKSQEE-------------APMAEGL-------EPTEPIAFLKLFRFSTYGEIGWLFFG 51
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pombe    34 STEKSENEASESHVVDVVKDPFEQYTPEEQEILYKQINDTPAKLSGYPRILSYADKWDIMLQLAG 98

  Fly    52 FIMCCIKALTLPAVVIIYSEFTSMLVDRAMQFGTSSNVHALPLFGGGKTLTNASREENNEALYDD 116
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pombe    99 TITGIGAGLGMPLMSLVSGQLAQAFTDLASGKGASSFQHTVDHF----------------CLY-- 145

  Fly   117 SISYGILLTIASVVMFISGIFSVDVFNMVALRQVTRMRIKLFSSVIRQDIGWHDLASKQNFTQSM 181
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pombe   146 ------FIYIAIGVFGCSYIYTV-TFIIAGERIARRIRQDYLHAILSQNIGYFDRLGAGEITTRI 203

  Fly   182 VDDVEKIRDGISEKVGHFVYLVVGFIITVAISFSYGWKLTLAVSSYIPLV---ILLNYYVAKFQG 243
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pombe   204 TTDTNFIQDGLGEKVGLVFFAIATFVSGFVIAFIRHWKFTLILSSMFPAICGGIGLG---VPFIT 265

  Fly   244 KLTAREQESYAGAGNLAEEILSSIRTVVSFGGEKSEVQRYENFLVPARKASQWKGAFSGLSDAVL 308
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pombe   266 KNTKGQIAVVAESSTFVEEVFSNIRNAFAFGTQDILAKLYNKYLITAQRFGINKAIAMGLMVGWM 330

  Fly   309 KSMLYLSCAGAFWYGVNLI-IDDRNVENKEYTPAILMIAFFGIIVGADNIARTAPFLESFATARG 372
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pombe   331 FFVAYGVYGLAFWEGGRLLHAGDLDVSK-------LIGCFFAVLIASYSLANISPKMQSFVSCAS 388

  Fly   373 CATNLFKVIDLTSKIDPLSTDGKLLNYGLRGDVEFQDVFFRYPSRPEVIVHRGLNIRIRAGQTVA 437
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pombe   389 AAKKIFDTIDRVSPINAFTPTGDVVK-DIKGEIELKNIRFVYPTRPEVLVLDNFSLVCPSGKITA 452

  Fly   438 LVGSSGCGKSTCVQLLQRFYDPVFGSVLLDDLDIRKYNIQWLRSNIAVVGQEPVLFLGTIAQNIS 502
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pombe   453 LVGASGSGKSTIIGLVERFYDPIGGQVFLDGKDLRTLNVASLRNQISLVQQEPVLFATTVFENIT 517

  Fly   503 YGKP----GATQKE-----IEAAATQAGAHEFITNLPESYRSMIGERGSQLSGGQKQRIAIARAL 558
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pombe   518 YGLPDTIKGTLSKEELERRVYDAAKLANAYDFIMTLPEQFSTNVGQRGFLMSGGQKQRIAIARAV 582

  Fly   559 IQNPKILLLDEATSALDYQSEKQVQQALDLASKGRTTIVVSHRLSAIRGADKIVFIHDGKVLEEG 623
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pombe   583 ISDPKILLLDEATSALDSKSEVLVQKALDNASRSRTTIVIAHRLSTIRNADNIVVVNAGKIVEQG 647

  Fly   624 SHDDLMALEGAYYNMVRA----GDINMPDEVEKE--------------DSIEDTKQKSL--ALFE 668
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pombe   648 SHNELLDLNGAYARLVEAQKLSGGEKDQEMVEEELEDAPREIPITSFGDDDEDNDMASLEAPMMS 712

  Fly   669 KSFETSPLNFEKGQKNSVQFEEPIIK------------ALIKDTNAQSAEAPPEKPN-------- 713
            .:.:|..||.:..:|::|.||:..::            |.:.:.|.:..::...|.|
pombe   713 HNTDTDTLNNKLNEKDNVVFEDKTLQHVASEIVPNLPPADVGELNEEPKKSKKSKKNNHEINSLT 777

  Fly   714 -------FFRTFSRILQLAKQEWCYLILGTISAVAVGFLYPAFAVIFGEFYAALAEKDPEDALRR 771
                   |.||...|:       | |::|.::::..|..||..|.:|..|.....:....|.|.:
pombe   778 ALWFIHSFVRTMIEII-------C-LLIGILASMICGAAYPVQAAVFARFLNIFTDLSSTDFLHK 834

  Fly   772 TAVLSWACLGLAFLTGLVCFLQTYLFNYAGIWLTTRMRAMTFNAMVNQEVGWFDDENNSVGALSA 836
            ..|.:...|.||.:......:..:...||...:..|:|...|..::.|:|.:||...|:|||::.
pombe   835 VNVFAVYWLILAIVQFFAYAISNFAMTYAMEAVLQRIRYHLFRTLLRQDVEFFDRSENTVGAITT 899

  Fly   837 RLSGEAVDIQGAIGYPLSGMIQALSNFISSVSVAMYYNWKLALLCLANCPIIVGSVILEAKMMSN 901
            .||.:...::|..|..|....|.|:|.||...:::...|||.|:.|:..|:|:.:.....:.:..
pombe   900 SLSTKIQSLEGLSGPTLGTFFQILTNIISVTILSLATGWKLGLVTLSTSPVIITAGYYRVRALDQ 964

  Fly   902 AVVREKQVIEEACRIATESITNIRTVAGLRREADVIREYTEEI---QRVEVLIRQKLRWRGVLNS 963
            ...:.....:|:...|.||.:.|||||.|.||.:|..||.:.:   .|...:...|   .|:..|
pombe   965 VQEKLSAAYKESAAFACESTSAIRTVASLNREENVFAEYCDSLIKPGRESAIASLK---SGLFFS 1026

  Fly   964 TMQASAFFAYAVALCYGGVLVSEGQLPFQDIIKVSETLLYGSMMLAQSLAFTPAFSAALIAGHRL 1028
            ..|...|...|:...||..|:.:|:............:::|.....|...::...:.|..|...:
pombe  1027 AAQGVTFLINALTFWYGSTLMRKGEYNIVQFYTCFIAIVFGIQQAGQFFGYSADVTKAKAAAGEI 1091

  Fly  1029 FQILDRKPKIQSPMGTIKNTLAKQLNLFE--GVRYRGIQFRYPTRPDAKILNGLDLEVLKGQTVA 1091
            ..:.:.||||.:     .:|..|::...:  .:.:|.::|.||||...|:|.||:|.|..||.||
pombe  1092 KYLSESKPKIDT-----WSTEGKKVESLQSAAIEFRQVEFSYPTRRHIKVLRGLNLTVKPGQFVA 1151

  Fly  1092 LVGHSGCGKSTCVQLLQRYYDPDEGTIHIDHDDIQHDLTLDGVRTKLGIVSQEPTLFERSIAENI 1156
            .||.|||||||.:.|::|:||.|.|.:.:|..::: |..::..|.::.:|||||||::.::.|||
pombe  1152 FVGSSGCGKSTTIGLIERFYDCDNGAVLVDGVNVR-DYNINDYRKQIALVSQEPTLYQGTVRENI 1215

  Fly  1157 AYGDNRRSVSMVEIIAAAKSANAHSFIISLPNGYDTRMGARGTQLSGGQKQRIAIARALVRNPKI 1221
            ..|.: :.||..|:|.|.|.||.|.||:.|||||:|..|.:|:.|||||||||||||||:|||||
pombe  1216 VLGAS-KDVSEEEMIEACKKANIHEFILGLPNGYNTLCGQKGSSLSGGQKQRIAIARALIRNPKI 1279

  Fly  1222 LLLDEATSALDLQSEQLVQQALDTACSGRTCIVIAHRLSTVQNADVICVIQNGQVVEQGNHMQLI 1286
            |||||||||||..||::||:||:.|..|||.:.||||||::|:||.|.|...|.:.|.|.|.:|:
pombe  1280 LLLDEATSALDSHSEKVVQEALNAASQGRTTVAIAHRLSSIQDADCIFVFDGGVIAEAGTHAELV 1344

  Fly  1287 SQGGIYAKL 1295
            .|.|.|.:|
pombe  1345 KQRGRYYEL 1353

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Mdr65	NP_476831.1	MdlB	118..641	CDD:440747	203/535 (38%)
		MdlB	711..1299	CDD:440747	212/605 (35%)
pmd1	NP_001342744.1	MdlB	73..666	CDD:440747	218/628 (35%)
		PTZ00265	139..1354	CDD:240339	437/1269 (34%)