DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Mdr65 and pgp-14

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_476831.1 Gene:Mdr65 / 38726 FlyBaseID:FBgn0004513 Length:1302 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_510128.1 Gene:pgp-14 / 181416 WormBaseID:WBGene00004008 Length:1327 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:1319 Identity:465/1319 - (35%)
Similarity:702/1319 - (53%) Gaps:129/1319 - (9%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    29 EPIAFLKLFRFSTYGEIGWLFFGFIMCCIKALTLPAVVIIYSEFTSMLV---DRAMQFGTSSNVH 90
            :|::...|||:....:...||.|.|...|..::.|.:.::....|:.|:   ..:.||       
 Worm    86 QPVSIPGLFRYGKKFDYLLLFIGTICAIISGVSQPILALVSGRVTNALLVYPPTSKQF------- 143

  Fly    91 ALPLFGGGKTLTNASREENNEALYDDSISYGILLTIASVVMFISGIFSVDVFNMVALRQVTRMRI 155
                           |.:.||.:| ..:..||.::|.:.:.::       .|.....|.:.:||.
 Worm   144 ---------------RNKANENVY-IFLGIGIFISITNFIQYM-------CFQHCCTRVMAQMRH 185

  Fly   156 KLFSSVIRQDIGWHDLASKQNFTQSMVDDVEKIRDGISEKVGHFVYLVVGF---IITVAISFSYG 217
            :...||:||:.||.|.......|..:.|.:|:||:||.:|:|   .|:.||   |..:.:::.|.
 Worm   186 RFVYSVLRQNAGWFDKNHSGTITTKLNDSMERIREGIGDKLG---VLLRGFAMLIAAIVVAYIYE 247

  Fly   218 WKLTLAVSSYIPLVILLNYYVAKFQGKLTAREQESYAGAGNLAEEILSSIRTVVSFGGEKSEVQR 282
            |:|...:....|...:....:|:.....|.:|......||::|||.|..:|||.:|.|::..|.|
 Worm   248 WRLASMMLGVAPTCCICMSLLARQMTSTTIKELIGVGKAGSIAEESLMGVRTVQAFNGQEEMVGR 312

  Fly   283 YENFLVPARKASQWKGAFSGLSDAVLKSML--YLSCA---GAFWYGVNLIIDDRNVENKEYTPAI 342
            ||..|...||.:.|||.:||....:....|  :|.|.   ||:...|.:|.          ||..
 Worm   313 YEAELEKGRKFAVWKGFWSGFFGGLFFFWLFSFLGCGMLYGAYLLKVGIIT----------TPGD 367

  Fly   343 LMIAFFGIIVGADNIARTAPFLESFATARGCATNLFKVIDLTSKIDPLSTDGKLLNYGLRGDVEF 407
            :.|....:::||..:...:|.:.....||..|.::::.||...||||.|..||.|. .:.|.|:|
 Worm   368 VFIVVMSMLLGAYFLGLISPHMMVLLNARVSAASIYQTIDRVPKIDPYSKAGKRLQ-NVVGRVKF 431

  Fly   408 QDVFFRYPSRPEVIVHRGLNIRIRAGQTVALVGSSGCGKSTCVQLLQRFYDPVFGSVLLDDLDIR 472
            ::|.||||||.:..:..|||:.:..|.:|||||.|||||||.|.||.|.|:|..|:|.:|..|:|
 Worm   432 ENVHFRYPSRKDAKILNGLNLVVEPGTSVALVGHSGCGKSTSVGLLTRLYEPEAGNVTIDGTDVR 496

  Fly   473 KYNIQWLRSNIAVVGQEPVLFLGTIAQNISYGKPGATQKEIEAAATQAGAHEFITNLPESYRSMI 537
            :.||:|||:.:.:|.|||:||..||..|:..|.||:|::.:......|.||:||..:|:.|.::|
 Worm   497 ELNIEWLRNTVGIVQQEPILFNDTIHNNLLIGNPGSTRETMIEVCKMANAHDFIEKMPKGYDTLI 561

  Fly   538 GERGSQLSGGQKQRIAIARALIQNPKILLLDEATSALDYQSEKQVQQALDLASKGRTTIVVSHRL 602
            |:.|.|||||||||:||||.||::||:|||||||||||.|||..||.||:.||||||||:::|||
 Worm   562 GDGGVQLSGGQKQRVAIARTLIRDPKVLLLDEATSALDAQSESIVQSALNNASKGRTTIMIAHRL 626

  Fly   603 SAIRGADKIVFIHDGKVLEEGSHDDLMALEGAYYNMVRA----GDINMPDEVEKED-SIEDTKQK 662
            |.||.||||||...|.::|.|:|::|:.|.|.|:::|:|    .|....:|.|:|: .::||.:.
 Worm   627 STIREADKIVFFEKGVIVEAGNHEELVRLGGRYFDLVKAQQFKADPEATEEFEEEEIDLDDTSRS 691

  Fly   663 SLALFEKSFETSPLNFEKGQKNSVQFEEPIIKALIKDTNAQSAEAPPEKPNFFRT---------- 717
            |......|..:....|.:|...:..|          ..:.:||:|..|...|...          
 Worm   692 SRRSSMTSARSGSEAFRRGNSLNDSF----------SGSKRSAQADAENSAFAANEAAIMAEDGQ 746

  Fly   718 ----FSRILQLAKQEWCYLILGTISAVAVGFLYPAFAVIFGEFYAALAEKDPEDALRR---TAVL 775
                :..|.:.||..:.|:.|||:.|:..|...||.|:|||..:...........:..   .||:
 Worm   747 ITAGYLDIFKNAKGNYLYMFLGTVFALIRGLELPALALIFGWVFEGFTFVPYGGRMMHRMAMAVI 811

  Fly   776 SWACLGLAFLTGLVCFLQ---TYLFNYAGIWLTTRMRAMTFNAMVNQEVGWFDDENNSVGALSAR 837
            ::|.:|:.     |.|.|   :.||......|:.|.|..:|..::.|:..:||:..::.|.|..|
 Worm   812 AFASVGVG-----VWFSQLASSVLFAVVSENLSMRFRVQSFRNLLYQDASYFDNPAHAPGKLITR 871

  Fly   838 LSGEAVDIQGAIGYPLSGMIQALSNFISSVSVAMYYNWKLALLCLANCPIIVGSVILEAKMMSNA 902
            |:.:|.:|:..:...:..:|.||:..|:::::|..|.|::.:|..:...::...:|..|..:|..
 Worm   872 LASDAPNIKAVVDARMLQVIYALAAIIANIAIAFIYCWQIGILGTSLILLLAFVMIGLAYKISLM 936

  Fly   903 VVREKQVIEEACRIATESITNIRTVAGLRREADVIREYTEEIQRVEVLIRQKLRWRGVLN----S 963
            .|.:.| .::|.|||.|.|.|::|:..|.|.......|....::.:   |.:|: :|::.    |
 Worm   937 NVEQIQ-NDDAGRIAIEIIENVKTIQLLTRCELFFDHYQTSSKQQK---RSELK-KGMIEAINYS 996

  Fly   964 TMQASAFFAYAVALCYGGVLVSEGQLPFQDIIKVSETLLYGSMMLAQSLAFTPAFSAALIAGHRL 1028
            ..|:..:|........|..::.:|.....|..|....::.|::.:..|..:.|.|..|..|...|
 Worm   997 LTQSFMYFMMCFTYAVGIRIIYQGDKSSDDTFKGIIAMMLGAVAVMNSAQYFPEFVKAKTAAGML 1061

  Fly  1029 FQILDRKPKIQSPMGTIKNTLAKQLNLFEGVR--------YRGIQFRYPTRPDAKILNGLDLEVL 1085
            |.|:.|||:..              :|.||.|        :..::|.||.||...|:.||....|
 Worm  1062 FNIIYRKPRTG--------------DLMEGDRPEIRGNILFENVKFSYPQRPLQPIMKGLQWTAL 1112

  Fly  1086 KGQTVALVGHSGCGKSTCVQLLQRYYDPDEGTIHIDHDDIQHDLTLDGVRTKLGIVSQEPTLFER 1150
            :||||||||.||.||||.:.:|:|:||...|.:.||..||: .|:|..:||::.:|.|||.||..
 Worm  1113 RGQTVALVGPSGSGKSTNIGMLERFYDVTGGALRIDGQDIR-KLSLFHLRTQMALVGQEPRLFAG 1176

  Fly  1151 SIAENIAYGDNRRSVSMVEIIAAAKSANAHSFIISLPNGYDTRMGARGTQLSGGQKQRIAIARAL 1215
            :|.||:..|  .:.|.:.:|..|.:.|||:.|:.:||.|.||.:|.:|.||||||||||||||||
 Worm  1177 TIRENVCLG--LKDVPLEKINQALELANANRFLANLPAGIDTDVGEKGGQLSGGQKQRIAIARAL 1239

  Fly  1216 VRNPKILLLDEATSALDLQSEQLVQQALDTACSGRTCIVIAHRLSTVQNADVICVIQNGQVVEQG 1280
            ||:||||||||||||||.:||:.||:|||.|..|||||.||||||::||:|:|..|..|:|.|.|
 Worm  1240 VRDPKILLLDEATSALDSESERAVQEALDRAREGRTCITIAHRLSSIQNSDLIVYIDKGKVQEAG 1304

  Fly  1281 NHMQLISQGGIYAKLHKTQ 1299
            ||.||:.|.|.|.||.|.|
 Worm  1305 NHTQLMHQKGRYYKLIKKQ 1323

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Mdr65NP_476831.1 MdlB 118..641 CDD:440747 212/530 (40%)
MdlB 711..1299 CDD:440747 218/619 (35%)
pgp-14NP_510128.1 MdlB 93..667 CDD:440747 230/617 (37%)
PTZ00265 104..1321 CDD:240339 459/1297 (35%)

Return to query results.
Submit another query.