Protein Alignment Mdr65 and pgp-6

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_476831.1
• Gene: Mdr65 / 38726
• FlyBaseID: FBgn0004513
• Length: 1302
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001041287.2
• Gene: pgp-6 / 181278
• WormBaseID: WBGene00004000
• Length: 1263
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 1302
• Identity: 423/1302 - (32%)
• Similarity: 693/1302 - (53%)
• Gaps: 83/1302 - (6%)

  Fly    20 PMAEGLEPTEPIAFLK-LFRFSTYGEIGWLFFGFIMCCIKALTLPAVVIIYSEFTSMLVDRAMQF 83
            |.::..:|::..:|:: :|:.|:..|......|.:...:.....|.:...:.|.:.:||
 Worm    14 PQSDEKKPSQICSFIRVVFKCSSCFEKFLFLLGVLFSLMTGFCQPFMSYTFGEVSQVLV------ 72

  Fly    84 GTSSNVHALPLFGGGKTLTNASREENNEALYDDSISYGIL-LTIASVVMFISGIFSVDVFNMVAL 147
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 Worm    73 -TITNAI------NNKTIDPADLEKAYEE-YERGMNQVVFHFFLCGCAYFIFASLQHAIMKYVGD 129

  Fly   148 RQVTRMRIKLFSSVIRQDIGWHDLASKQNFTQSMVDDVEKIRDGISEKVGHFVYLVVGFIITVAI 212
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 Worm   130 NTTYRVRKQYISRLLKKDAQYFDSVSTGHLSTVLNDNLERFREVFNEKIALIIAFVTDFTLGTAL 194

  Fly   213 SFSYGWKLT---------LAVSSYIPLVILLNYYVAKFQGKLTAREQESYAGAGNLAEEILSSIR 268
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 Worm   195 AFYTDWRLASYGIFFSLGIAFSGFINSAGVM---------KTTGKQNTHYANAGSIAFQTLGAYK 250

  Fly   269 TVVSFGGEKSEVQRYENFLVPARKASQWKGAFSGLSDAVLKSMLYLSCAG----AFWYGVNLIID 329
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 Worm   251 TVCSLNGQKTEIERYTEEL----KAGEKYGIRRALMYSISRGVTYFFCNSLNTVVLYVGATMIYS 311

  Fly   330 DRNVENKEYTPAILMIAFFGIIVGADNIARTAPFLESFATARGCATNLFKVIDLTSKIDPL---- 390
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 Worm   312 G-TLET-----AVVVRLFHYMLFGAFCLSEALPHISRLA---GAISSTAPIAEMLIKDDNVIEKD 367

  Fly   391 STDGKLLNYGLRGDVEFQDVFFRYPSRPEVIVHRGLNIRIRAGQTVALVGSSGCGKSTCVQLLQR 455
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 Worm   368 ETDYD-VEVEVNGNISFKNVKFSYPTRPDAQVLKGISFDVQNGECIALVGASGSGKSTVVQLLLH 431

  Fly   456 FYDPVFGSVLLDDLDIRKYNIQWLRSNIAVVGQEPVLFLGTIAQNISYGKPGATQKEIEAAATQA 520
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 Worm   432 YYNIDSGNIFIDGMDLNDMNIKRLRRVIGVVSQEPVLFNTTIEENIRFGNPNVSLPEIYGALRKA 496

  Fly   521 GAHEFITNLPESYRSMIGERGSQLSGGQKQRIAIARALIQNPKILLLDEATSALDYQSEKQVQQA 585
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 Worm   497 NAYDFVCSFPKGIKTIVGERGTQLSGGQKQRIAIARTLVRNPKILLLDEATSALDNESEQVVQKA 561

  Fly   586 LDLASKGRTTIVVSHRLSAIRGADKIVFIHDGKVLEEGSHDDLMALEGAYYNMVRAGDINMPDEV 650
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 Worm   562 LENASQGRTTIVVAHRLSTIRNASKIIVMQKGEIVEVGNHDELIAKRGVYNDLVQA------QLL 620

  Fly   651 EKEDSIEDTKQKSLALFEKSFETSPLN---FEKGQKNSVQFEEPIIKALIKDTNAQSAEAPPEKP 712
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 Worm   621 ESHDDHEEL--PPLAARQLSQELSPLHSYAIQRSTSNDAGVHDDDMERILDELSKEGA----KKS 679

  Fly   713 NFFRTFSRILQLAKQEWCYLILGTISAVAVGFLYPAFAVIFGEFYAALAEKDPEDALRRTAVLSW 777
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 Worm   680 N----LREIVKQCRPDYCFLFIAVFGSAIQGVSYPILAQLIVRTYEGFA-MIGEDMLYYSHLWAL 739

  Fly   778 ACLGLAFLTGLVCFLQTYLFNYAGIWLTTRMRAMTFNAMVNQEVGWFDDENNSVGALSARLSGEA 842
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 Worm   740 SFMFLAVFRPLTLYCQYYYFGKVSEQLSTRLRIKSFSHMLSLPCAFYDDPNHSATRLSNRLNTDS 804

  Fly   843 VDIQGAIGYPLSGMIQALSNFISSVSVAMYYNWKLALLCLANCPIIVGSVILEAKMMSNAVVREK 907
            .:::.|:...|..:|..:.....:::.|..|.||:.|..|...|::..:..........|:..:.
 Worm   805 SNVKAAVDDRLGCVIMTVVAISIAITTASLYCWKMTLEVLMFFPLLYLAEYCYEAATETAIQEDT 869

  Fly   908 QVIEEACRIATESITNIRTVAGLRREADVIREYTEEIQRVEVLIRQKLRWRGVLNSTMQASAFFA 972
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 Worm   870 IAFENSNRTAIEALENVRTVRALNLEDKIMSLISEHLQKIHKSYFKRAIIQGAANGLSLSCFLFV 934

  Fly   973 YAVALCYGGVLVSEGQLPFQDIIKVSETLLYGSMMLAQSLAFTPAFSAALIAGHRLFQILDRKPK 1037
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 Worm   935 YSVSFKFGTYLALRKEVAPMDTYLVLMTLSMTANMAGSAAAYLPDYKKAVHAAGLIFHLFTYPAT 999

  Fly  1038 IQSPMGTIKNTLAKQLNLFEGVRYRGIQFRYPTRPDAKILNGLDLEVLKGQTVALVGHSGCGKST 1102
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 Worm  1000 MPFSSSDGKKNIEKGEIIGENV-----QFHYDQRPDRMILNGVNLKVDPGKTLALVGPSGCGKST 1059

  Fly  1103 CVQLLQRYYDPDEGTIHIDHDDIQHDLTLDGVRTKLGIVSQEPTLFERSIAENIAYGDNRRSVSM 1167
            .:.||:|:|...:|.:.||.:::: |:.|:.:|:.|.:||||||||..||.||:.|| ..|||..
 Worm  1060 IISLLERFYHAVDGEVKIDSENVE-DINLNHLRSNLALVSQEPTLFNCSIRENLLYG-LTRSVPQ 1122

  Fly  1168 VEIIAAAKSANAHSFIISLPNGYDTRMGARGTQLSGGQKQRIAIARALVRNPKILLLDEATSALD 1232
            :|:..|.::|||.:|:...|.|.||.:|.||.|||||||||||||||::||||:|||||||||||
 Worm  1123 LELEKALQTANAFNFVFQFPQGLDTLVGERGAQLSGGQKQRIAIARAILRNPKVLLLDEATSALD 1187

  Fly  1233 LQSEQLVQQALDTACSGRTCIVIAHRLSTVQNADVICVIQNGQVVEQGNHMQLISQGGIYAKLHK 1297
            ..||::||.|||||....:.:|:|||||||.|||.|.|::||:|.|||.|.:|:.:..||.:|.:
 Worm  1188 SDSEKVVQNALDTASERLSTVVVAHRLSTVVNADSIAVLKNGKVAEQGTHEELLRKRSIYWRLVQ 1252

  Fly  1298 TQ 1299
            .|
 Worm  1253 KQ 1254

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Mdr65	NP_476831.1	MdlB	118..641	CDD:440747	183/540 (34%)
		MdlB	711..1299	CDD:440747	207/587 (35%)
pgp-6	NP_001041287.2	MdlB	40..622	CDD:440747	197/624 (32%)
		MdlB	681..1254	CDD:440747	205/580 (35%)