DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG10226 and PGP10

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_648040.1 Gene:CG10226 / 38725 FlyBaseID:FBgn0035695 Length:1320 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_172538.1 Gene:PGP10 / 837611 AraportID:AT1G10680 Length:1227 Species:Arabidopsis thaliana


Alignment Length:1302 Identity:449/1302 - (34%)
Similarity:711/1302 - (54%) Gaps:108/1302 - (8%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    29 KEKAQPMVSYTELFRYIAGWDYLVLLSGFVAAFLQSLVFPIAIVVYSELVAMFIERTLGQGTSSV 93
            |||.:|.||:.:||.:...:|.:::..|.:.|.:.....|:..:.:.:|:.:             
plant    17 KEKKRPSVSFLKLFSFADFYDCVLMALGSIGACIHGASVPVFFIFFGKLINI------------- 68

  Fly    94 TIGLS-LFGGGKILTNASYEENMQELRKDSVSFGILMTLNTLLMLFSGVYYVDAFNRLALKLTVR 157
             |||: ||.          :|...::.|.|:.|..|    ::::|||....|..:.....:...:
plant    69 -IGLAYLFP----------QEASHKVAKYSLDFVYL----SVVILFSSWLEVACWMHTGERQAAK 118

  Fly   158 MRREFFKATLRQEIGWHDMAKDQNFAV-RITDNMEKIRSGIAENLGHYVEIMCDVIISVVLSFIY 221
            :|:.:.::.|.|:|...|........: .||..:..::..|:|.:|:::..:...|....:.|..
plant   119 IRKAYLRSMLSQDISLFDTEISTGEVISAITSEILVVQDAISEKVGNFMHFISRFIAGFAIGFAS 183

  Fly   222 GWKLALAIVFYIPLTLVVNSAVAHYQGKLTGQEQSSYVRASSVVEEVIGAIRTVVAFGGERSESL 286
            .|:::|..:..:|...:.....|.....|..:.:.|||:|:.:.|||||.:|||.||.||.....
plant   184 VWQISLVTLSIVPFIALAGGIYAFVSSGLIVRVRKSYVKANEIAEEVIGNVRTVQAFTGEEKAVS 248

  Fly   287 RYDSLLKPALKAGKWKGAFSGLSDTVMKAMLFITGAGSFWYGANLILYYRDPSIPIDEREYTPAV 351
            .|...|:.....|:..|...||....:..:||::.|...|: .:::::   ..|......:| .:
plant   249 SYQGALRNTYNYGRKAGLAKGLGLGSLHFVLFLSWALLIWF-TSIVVH---KGIANGGESFT-TM 308

  Fly   352 VMIVISGIIVSANQISRTSPFLETFAMARGSASAILDVIDRTSLIDPLSKAGKILNYGLKGAVEF 416
            :.:||:|:     .:.:.:|.:.||..|..:|..|..:|:|.:    ..|.|:.|. .:.|.:.|
plant   309 LNVVIAGL-----SLGQAAPDISTFMRASAAAYPIFQMIERNT----EDKTGRKLG-NVNGDILF 363

  Fly   417 RDVFFRYPAREDVIVLRGLNVVVEEGQTVALVGPSGCGKSTCIQLLQRFYDPVFGQVLLDGEDVR 481
            :||.|.||:|.||::...||.|:..|:.|||||.||.||||.|.|::|||:|..|.|:|||.|:|
plant   364 KDVTFTYPSRPDVVIFDKLNFVIPAGKVVALVGGSGSGKSTMISLIERFYEPTDGAVMLDGNDIR 428

  Fly   482 KYNIKWLRSNIAVVGQEPVLFQGSIGENIRHGKPEATQKEVEDAAKAANAHDFIIALHKGYDTDI 546
            ..::||||.:|.:|.||||||..:|.|||.:||.:||.:|:.:|||.:.|..||..|.:|::|.:
plant   429 YLDLKWLRGHIGLVNQEPVLFATTIRENIMYGKDDATSEEITNAAKLSEAISFINNLPEGFETQV 493

  Fly   547 SEKGVQLSGGQRQRIAIARALIQQPKILLLDEATSALDYHSEKLVQAALDKACKGRTTLVVSHRL 611
            .|:|:||||||:|||:|:||:::.|.||||||||||||..|||:||.|||:...||||:||:|||
plant   494 GERGIQLSGGQKQRISISRAIVKNPSILLLDEATSALDAESEKIVQEALDRVMVGRTTVVVAHRL 558

  Fly   612 SAIRHAHRIVYIENGKAVEQGTHEELMKLEGFYHKMVTVHSYDDSAEELLNELEEVAEIKERKMS 676
            |.:|:|..|..:..||.:|.|:|:||:             |..|.|...|..::|.|        
plant   559 STVRNADIIAVVGGGKIIESGSHDELI-------------SNPDGAYSSLLRIQEAA-------- 602

  Fly   677 YEVEPYQLGTRNSIVSLEKNAEFQMKNLNGLANITMNQEIDDPRVPSANFISTFFRILGWARPEW 741
               .|....|.:..||.:...|..:.....    :::|.::.|.......: |..|:....||:|
plant   603 ---SPNLNHTPSLPVSTKPLPELPITETTS----SIHQSVNQPDTTKQAKV-TVGRLYSMIRPDW 659

  Fly   742 SFLIIGAICAGLYGVTMPVFSVVLAELYGSLAKPTDEEVLEQSASMAIISLVIGIAAGVVCY-IQ 805
            .:.:.|.:.:.:.|..||:|::.:|:...|..  .|.|..:.......|....|....|:.: |:
plant   660 KYGLCGTLGSFIAGSQMPLFALGIAQALVSYY--MDWETTQNEVKRISILFCCGSVITVIVHTIE 722

  Fly   806 TFFFNLAGVWLTTRMRSKTFRCIMNQEMGWFDRKENSIGALSARLSGDAASVQGAI----GFPLS 866
            ...|.:.|..||.|:|.|.|..|:..|:||||:.:|:...|::||..||..::..:    ...|.
plant   723 HTTFGIMGERLTLRVRQKMFSAILRNEIGWFDKVDNTSSMLASRLESDATLLRTIVVDRSTILLE 787

  Fly   867 NIIQAFTNFICSIAIAFPYSWELALICLSTSPFMVASIVFEARFGEKSALKEKEVLEETSRIATE 931
            |:....|.||    |:|..:|.|.|:.|:|.|.:::..:.|..|.:.......:...:.:.:|.|
plant   788 NLGLVVTAFI----ISFILNWRLTLVVLATYPLIISGHISEKIFMQGYGGNLSKAYLKANMLAGE 848

  Fly   932 TITQIRTVAGLRREEELIKIYDKEVERYRHQILSRLKWRGLVNSLGKSLMFFGYAVTLTYGGHMC 996
            :|:.||||.....||:::.:|.||:.....:...|.:..|::..:.:..:|..|.:.|.||..:.
plant   849 SISNIRTVVAFCAEEKVLDLYSKELLEPSERSFRRGQMAGILYGVSQFFIFSSYGLALWYGSILM 913

  Fly   997 ADGKIKFETIMKISNTMLYGLFILAQSLAFTPAFNAALLSANRM----YEIIDRKPQIQSPESFE 1057
            ..|...||::||....::....::.:.||..|    .||..|:|    :|::||:.|:......|
plant   914 EKGLSSFESVMKTFMVLIVTALVMGEVLALAP----DLLKGNQMVVSVFELLDRRTQVVGDTGEE 974

  Fly  1058 IQQNGNGTAYKTNVVQQGVSYRGLNFSYPSRPHIKVLQNFNLDINQGQTVALVGASGSGKSTCVQ 1122
            : .|..||          :..:|::|||||||.:.:..:|||.:..|:::||||.||||||:.:.
plant   975 L-SNVEGT----------IELKGVHFSYPSRPDVTIFSDFNLLVPSGKSMALVGQSGSGKSSVLS 1028

  Fly  1123 LLMRYYDPDEGKILIDQESIHHDMDLKTLRRRLGIVSQEPSLFEKSIADNIGYGDTSRQVPMQQI 1187
            |::|:|||..|.|:||.:.| ..:.||:|||.:|:|.|||:||..:|.:||.||  .......::
plant  1029 LVLRFYDPTAGIIMIDGQDI-KKLKLKSLRRHIGLVQQEPALFATTIYENILYG--KEGASESEV 1090

  Fly  1188 IEAAKMANAHEFIMSLPAQYDTVLGSKGTQLSGGQKQRIAIARAMVRNPKILLLDEATSALDFQS 1252
            :||||:||||.||.|||..|.|.:|.:|.|:||||:||||||||:::||:||||||||||||.:|
plant  1091 MEAAKLANAHSFISSLPEGYSTKVGERGIQMSGGQRQRIAIARAVLKNPEILLLDEATSALDVES 1155

  Fly  1253 ERVVQQALDSACSGRTCIVIAHRLSTIQNANVICVIQAGKIVEQGSHSQLLA-KNGIYSKLYRCQ 1316
            |||||||||.....||.:|:|||||||:|:::|.|||.|||:|||||:.|:. |||.||||...|
plant  1156 ERVVQQALDRLMRDRTTVVVAHRLSTIKNSDMISVIQDGKIIEQGSHNILVENKNGPYSKLISLQ 1220

  Fly  1317 TK 1318
            .:
plant  1221 QR 1222

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG10226NP_648040.1 MdlB 147..652 CDD:440747 182/505 (36%)
MdlB 723..1320 CDD:440747 227/606 (37%)
PGP10NP_172538.1 PTZ00265 40..1221 CDD:240339 439/1276 (34%)

Return to query results.
Submit another query.