DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG10226 and ABCB17

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_648040.1 Gene:CG10226 / 38725 FlyBaseID:FBgn0035695 Length:1320 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_189479.1 Gene:ABCB17 / 822467 AraportID:AT3G28380 Length:1240 Species:Arabidopsis thaliana


Alignment Length:1302 Identity:456/1302 - (35%)
Similarity:722/1302 - (55%) Gaps:88/1302 - (6%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    24 KKKKTKEKAQPMVSYTELFRYIAGWDYLVLLSGFVAAFLQSLVFPIAIVVYSELVAMFIERTLGQ 88
            :|:..::|.:...|...:|.:..|.|::::..|.:.|.....:.|:.:.:::.|:     ..||.
plant     6 EKESGRDKMKSFGSIRSIFMHADGVDWILMALGLIGAVGDGFITPVVVFIFNTLL-----NNLGT 65

  Fly    89 GTSSVTIGLSLFGGGKILTNASYEENMQELRKDSVSFGILMTLNTLLMLFSGVYYVDAFNRLALK 153
            .:|:               |.::   ||.:.|:.|:. :.:...:.::.|...|   .:.|...:
plant    66 SSSN---------------NKTF---MQTISKNVVAL-LYVACGSWVICFLEGY---CWTRTGER 108

  Fly   154 LTVRMRREFFKATLRQEIGWHDM--AKDQNFAVRITDNMEKIRSGIAENLGHYVEIMCDVIISVV 216
            ...|||.::.:|.|||::|:.|:  ....:....|:.:...|:..::|.|.:::......:.|.:
plant   109 QAARMREKYLRAVLRQDVGYFDLHVTSTSDVITSISSDSLVIQDFLSEKLPNFLMNASAFVASYI 173

  Fly   217 LSFIYGWKLALAIVFYIPLTLVVNSAVAHYQGKLTGQEQSSYVRASSVVEEVIGAIRTVVAFGGE 281
            :|||..|:|.:....:|.|.||...........::.:....|..|.|:.|:.|.::|||.|||.|
plant   174 VSFILMWRLTIVGFPFIILLLVPGLMYGRALVSISRKIHEQYNEAGSIAEQAISSVRTVYAFGSE 238

  Fly   282 RSESLRYDSLLKPALKAGKWKGAFSGL---SDTVMKAM-LFITGAGSFWYGANLILYYRDPSIPI 342
            .....::.:.|:.::|.|..:|...|:   |:.|..|: .|:|     |||:.|::.:....   
plant   239 NKMIGKFSTALRGSVKLGLRQGLAKGITIGSNGVTHAIWAFLT-----WYGSRLVMNHGSKG--- 295

  Fly   343 DEREYTPAVVMIVISGIIVSANQISRTSPFLETFAMARGSASAILDVIDRTSLIDPLSKAGKILN 407
                   ..|.:|||.|......:.::...|:.|:.|..:...||:||.|...||...|.|:||.
plant   296 -------GTVFVVISCITYGGVSLGQSLSNLKYFSEAFVAWERILEVIKRVPDIDSNKKEGQILE 353

  Fly   408 YGLKGAVEFRDVFFRYPAREDVIVLRGLNVVVEEGQTVALVGPSGCGKSTCIQLLQRFYDPVFGQ 472
             .:||.|||..|.|.|.:|.:..:...|.:.:..|:||||||.||.||||.|.||||||||:.|:
plant   354 -RMKGEVEFNHVKFTYLSRPETTIFDDLCLKIPAGKTVALVGGSGSGKSTVISLLQRFYDPIAGE 417

  Fly   473 VLLDGEDVRKYNIKWLRSNIAVVGQEPVLFQGSIGENIRHGKPEATQKEVEDAAKAANAHDFIIA 537
            :|:||..:.|..:.||||.:.:|.||||||..||.|||..||.:|:..||.:||||:|||.||..
plant   418 ILIDGVSIDKLQVNWLRSQMGLVSQEPVLFATSITENILFGKEDASLDEVVEAAKASNAHTFISQ 482

  Fly   538 LHKGYDTDISEKGVQLSGGQRQRIAIARALIQQPKILLLDEATSALDYHSEKLVQAALDKACKGR 602
            ...||.|.:.|:|||:||||:||||||||:|:.||||||||||||||..||::||.:||.|..||
plant   483 FPLGYKTQVGERGVQMSGGQKQRIAIARAIIKSPKILLLDEATSALDSESERVVQESLDNASIGR 547

  Fly   603 TTLVVSHRLSAIRHAHRIVYIENGKAVEQGTHEELMK-LEGFYHKMVTVHSYDDSAEELLNELEE 666
            ||:|::||||.||:|..|..|.||:.||.|:||||:| ::|.|..:|       |.:::.||   
plant   548 TTIVIAHRLSTIRNADVICVIHNGQIVETGSHEELLKRIDGQYTSLV-------SLQQMENE--- 602

  Fly   667 VAEIKERKMSYEVEPYQLGTRNSIVSLEKNAEFQMKNLNGLANITMNQEIDDPRVPSAN--FIST 729
                 |..::..|..    |::.::||.|:.::...|..|..:.::...:.| .:|:.|  .:.:
plant   603 -----ESNVNINVSV----TKDQVMSLSKDFKYSQHNSIGSTSSSIVTNVSD-LIPNDNQPLVPS 657

  Fly   730 FFRILGWARPEWSFLIIGAICAGLYGVTMPVFSVVLAELYGSLAKPTDEEVLEQSASMAIISLVI 794
            |.|::...||||...:.|.:.|.|.||..||.:.....:.......:.:::.|::....::.:.:
plant   658 FTRLMVMNRPEWKHALYGCLSAALVGVLQPVSAYSAGSVISVFFLTSHDQIKEKTRIYVLLFVGL 722

  Fly   795 GIAAGVVCYIQTFFFNLAGVWLTTRMRSKTFRCIMNQEMGWFDRKENSIGALSARLSGDAASVQG 859
            .|.:.:|...|.:.|...|.:||.|:|.:....|:..|:.|||..:||.||:.:||:.||..|:.
plant   723 AIFSFLVNISQHYGFAYMGEYLTKRIREQMLSKILTFEVNWFDIDDNSSGAICSRLAKDANVVRS 787

  Fly   860 AIGFPLSNIIQAFTNFICSIAIAFPYSWELALICLSTSPFMVASIVFEARFGEKSALKEKEVLEE 924
            .:|..:|.::|..:..|.:..|....:|.||::.:|..|.:|.....:....:..:.|..:..:|
plant   788 MVGDRMSLLVQTISAVIIACIIGLVIAWRLAIVMISVQPLIVVCFYTQRVLLKSLSEKASKAQDE 852

  Fly   925 TSRIATETITQIRTVAGLRREEELIKIYDKEVERYRHQILSRLKWRGLVNSLGKSLMFFGYAVTL 989
            :|::|.|.::.|||:.....:|.:||:..|..|..|.:.:.|....|:|....:||:....|:..
plant   853 SSKLAAEAVSNIRTITAFSSQERIIKLLKKVQEGPRRESVHRSWLAGIVLGTSRSLITCTSALNF 917

  Fly   990 TYGGHMCADGKIKFETIMKISNTMLYGLFILAQSLAFTPAFNAALLSANRMYEIIDRKPQIQSPE 1054
            .|||.:.|||||..:...:|....:....::|.:...|......|.:...::.::||...|: |:
plant   918 WYGGRLIADGKIVSKAFFEIFLIFVTTGRVIADAGTMTTDLARGLDAVGSVFAVLDRCTTIE-PK 981

  Fly  1055 SFEIQQNGNGTAYKTNVVQQGVSYRGLNFSYPSRPHIKVLQNFNLDINQGQTVALVGASGSGKST 1119
                    |...|....::..:::..::|:||:||.:.:.:||:::|::|::.|:||.|||||||
plant   982 --------NPDGYVAEKIKGQITFLNVDFAYPTRPDVVIFENFSIEIDEGKSTAIVGTSGSGKST 1038

  Fly  1120 CVQLLMRYYDPDEGKILIDQESI--HHDMDLKTLRRRLGIVSQEPSLFEKSIADNIGYGDTSRQV 1182
            .:.|:.|:|||.:|.:.||...|  :|   |::||:.:.:|||||.||..:|.:||.||.||.::
plant  1039 IIGLIERFYDPLKGTVKIDGRDIRSYH---LRSLRKYISLVSQEPMLFAGTIRENIMYGGTSDKI 1100

  Fly  1183 PMQQIIEAAKMANAHEFIMSLPAQYDTVLGSKGTQLSGGQKQRIAIARAMVRNPKILLLDEATSA 1247
            ...:||||||.||||:||.||...|||..|.||.|||||||||||||||:::||.:|||||||||
plant  1101 DESEIIEAAKAANAHDFITSLSNGYDTNCGDKGVQLSGGQKQRIAIARAVLKNPSVLLLDEATSA 1165

  Fly  1248 LDFQSERVVQQALDSACSGRTCIVIAHRLSTIQNANVICVIQAGKIVEQGSHSQLLAK--NGIYS 1310
            ||.:||||||.||:....|||.|:||||||||||.::|.|:..|||||.|:||.||.|  .|.|.
plant  1166 LDSKSERVVQDALERVMVGRTSIMIAHRLSTIQNCDMIVVLGKGKIVESGTHSSLLEKGPTGTYF 1230

  Fly  1311 KL 1312
            .|
plant  1231 SL 1232

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG10226NP_648040.1 MdlB 147..652 CDD:440747 204/511 (40%)
MdlB 723..1320 CDD:440747 219/596 (37%)
ABCB17NP_189479.1 MdlB 32..600 CDD:440747 219/617 (35%)
MdlB 657..1236 CDD:440747 218/588 (37%)

Return to query results.
Submit another query.