DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG10226 and ABCB15

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_648040.1 Gene:CG10226 / 38725 FlyBaseID:FBgn0035695 Length:1320 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_189475.1 Gene:ABCB15 / 822463 AraportID:AT3G28345 Length:1240 Species:Arabidopsis thaliana


Alignment Length:1331 Identity:456/1331 - (34%)
Similarity:732/1331 - (54%) Gaps:134/1331 - (10%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    23 QKKKKTKEKAQPMVSYTELFRYIAGWDYLVLLSGFVAAFLQSLVFPIAIVVYSELVAMFIERTLG 87
            ::|:..:.|.....|...:|.:..|.|:|::..|.:.|.......|:.:::.|:|          
plant     5 EEKESGRNKMNCFGSVRSIFMHADGVDWLLMGLGLIGAVGDGFTTPLVLLITSKL---------- 59

  Fly    88 QGTSSVTIGLSLFGGGKILTNASYEENMQELRKDSVSFGILMTLNTLLMLFSGVYYVDAFNRLAL 152
                     ::..||....|:..    ||.:.|:||:. :.:...:.::.|...|   .:.|...
plant    60 ---------MNNIGGSSFNTDTF----MQSISKNSVAL-LYVACGSWVVCFLEGY---CWTRTGE 107

  Fly   153 KLTVRMRREFFKATLRQEIGWHDM--AKDQNFAVRITDNMEKIRSGIAENLGHYVEIMCDVIISV 215
            :.|.|||.::.:|.|||::|:.|:  ....:....::.:...|:..::|.|.:::......:.|.
plant   108 RQTARMREKYLRAVLRQDVGYFDLHVTSTSDVITSVSSDSFVIQDVLSEKLPNFLMSASTFVGSY 172

  Fly   216 VLSFIYGWKLALAIVFYIPLTLVVNSAVAHYQGKLTGQEQSSYVRASSVVEEVIGAIRTVVAFGG 280
            ::.||..|:||:..:.:|.|.::...........::.:.:..|..|..|.|:.|.::|||.||.|
plant   173 IVGFILLWRLAIVGLPFIVLLVIPGLMYGRALISISRKIREEYNEAGFVAEQAISSVRTVYAFSG 237

  Fly   281 ERSESLRYDSLLKPALKAGKWKGAFSGL---SDTVMKAML-FITGAGSFWYGANLILYYRDPSIP 341
            ||....::.:.|:.::|.|..:|...|:   |:.:..||. |::     |||:.:::|:....  
plant   238 ERKTISKFSTALQGSVKLGIKQGLAKGITIGSNGITFAMWGFMS-----WYGSRMVMYHGAQG-- 295

  Fly   342 IDEREYTPAVVMIVISGIIVSANQISRTSPFLETFAMARGSASAILDVIDRTSLIDPLSKAGKIL 406
                    ..|..|.:.|.:....:......|:.|..|......|::||:|...||..:..|..|
plant   296 --------GTVFAVAAAIAIGGVSLGGGLSNLKYFFEAASVGERIMEVINRVPKIDSDNPDGHKL 352

  Fly   407 NYGLKGAVEFRDVFFRYPAREDVIVLRGLNVVVEEGQTVALVGPSGCGKSTCIQLLQRFYDPVFG 471
            . .::|.|||::|.|.||:|.:..:.....:.|..|:||||||.||.||||.|.||||||||:.|
plant   353 E-KIRGEVEFKNVKFVYPSRLETSIFDDFCLRVPSGKTVALVGGSGSGKSTVISLLQRFYDPLAG 416

  Fly   472 QVLLDGEDVRKYNIKWLRSNIAVVGQEPVLFQGSIGENIRHGKPEATQKEVEDAAKAANAHDFII 536
            ::|:||..:.|..:|||||.:.:|.|||.||..:|.|||..||.:|:..:|.:||||:|||:||.
plant   417 EILIDGVSIDKLQVKWLRSQMGLVSQEPALFATTIKENILFGKEDASMDDVVEAAKASNAHNFIS 481

  Fly   537 ALHKGYDTDISEKGVQLSGGQRQRIAIARALIQQPKILLLDEATSALDYHSEKLVQAALDKACKG 601
            .|..||:|.:.|:|||:||||:||||||||:|:.|.||||||||||||..||::||.||:.|..|
plant   482 QLPNGYETQVGERGVQMSGGQKQRIAIARAIIKSPTILLLDEATSALDSESERVVQEALENASIG 546

  Fly   602 RTTLVVSHRLSAIRHAHRIVYIENGKAVEQGTHEELMK-LEGFYHKMVTVHSYDDSAEELLNELE 665
            |||::::||||.||:|..|..::||..||.|:|:|||: ::|.|..:|              .|:
plant   547 RTTILIAHRLSTIRNADVISVVKNGHIVETGSHDELMENIDGQYSTLV--------------HLQ 597

  Fly   666 EVAEIKERKMSYEVEPY---QLGTRNS--IVSLEKNAEFQMKNLNGLANITMNQEIDDPRVPSAN 725
            :: |.::..:|.::.|.   ....|||  :.:|.:::  ...::.|.:.|....|.:.|::||  
plant   598 QI-EKQDINVSVKIGPISDPSKDIRNSSRVSTLSRSS--SANSVTGPSTIKNLSEDNKPQLPS-- 657

  Fly   726 FISTFFRILGWARPEWSFLIIGAICAGLYGVTMPVFSVVLAELYGSLAKPTDEEVLEQS------ 784
                |.|:|....|||...:.|.|.|.|:|...|.::..|..:.......:.:|:.|::      
plant   658 ----FKRLLAMNLPEWKQALYGCISATLFGAIQPAYAYSLGSMVSVYFLTSHDEIKEKTRIYALS 718

  Fly   785 -ASMAIISLVIGIAAGVVCYIQTFFFNLAGVWLTTRMRSKTFRCIMNQEMGWFDRKENSIGALSA 848
             ..:|::|.:|.|:       |.:.|...|.:||.|:|.:....::..|:|||||.|||.||:.:
plant   719 FVGLAVLSFLINIS-------QHYNFAYMGEYLTKRIRERMLSKVLTFEVGWFDRDENSSGAICS 776

  Fly   849 RLSGDAASVQGAIGFPLSNIIQAFTNFICSIAIAFP----YSWELALICLSTSPFMVASIVFEAR 909
            ||:.||..|:..:|..::.::|.    :.::.|||.    .:|.|||:.::..|.::  :.|..|
plant   777 RLAKDANVVRSLVGDRMALVVQT----VSAVTIAFTMGLVIAWRLALVMIAVQPVII--VCFYTR 835

  Fly   910 -----FGEKSALKEKEVLEETSRIATETITQIRTVAGLRREEELIKIYDKEVERYRHQILSRLKW 969
                 ...|.|:|.:   :|:|::|.|.::.:||:.....:|.::|:.:|..|..|.:.:.:..:
plant   836 RVLLKSMSKKAIKAQ---DESSKLAAEAVSNVRTITAFSSQERIMKMLEKAQESPRRESIRQSWF 897

  Fly   970 RGLVNSLGKSLMFFGYAVTLTYGGHMCADG----KIKFETIMKISNTMLYGLFILAQSLAFTPAF 1030
            .|...::.:||....:|:...|||.:..||    |..|||.|.:.:|..    ::|.:.:.|...
plant   898 AGFGLAMSQSLTSCTWALDFWYGGRLIQDGYITAKALFETFMILVSTGR----VIADAGSMTTDL 958

  Fly  1031 NAALLSANRMYEIIDRKPQIQSPESFEIQQNGNGTAYKTNVVQQGVSYRGLNFSYPSRPHIKVLQ 1095
            .....:...::.::||...| .||        :...|:|..:...|.:..::||||:||.:.:.:
plant   959 AKGSDAVGSVFAVLDRYTSI-DPE--------DPDGYETERITGQVEFLDVDFSYPTRPDVIIFK 1014

  Fly  1096 NFNLDINQGQTVALVGASGSGKSTCVQLLMRYYDPDEGKILIDQESI--HHDMDLKTLRRRLGIV 1158
            ||::.|.:|::.|:||.|||||||.:.|:.|:|||.:|.:.||...|  :|   |::|||.:.:|
plant  1015 NFSIKIEEGKSTAIVGPSGSGKSTIIGLIERFYDPLKGIVKIDGRDIRSYH---LRSLRRHIALV 1076

  Fly  1159 SQEPSLFEKSIADNIGYGDTSRQVPMQQIIEAAKMANAHEFIMSLPAQYDTVLGSKGTQLSGGQK 1223
            ||||:||..:|.:||.||..|.::...:||||||.||||:||.||...|||..|.:|.|||||||
plant  1077 SQEPTLFAGTIRENIIYGGVSDKIDEAEIIEAAKAANAHDFITSLTEGYDTYCGDRGVQLSGGQK 1141

  Fly  1224 QRIAIARAMVRNPKILLLDEATSALDFQSERVVQQALDSACSGRTCIVIAHRLSTIQNANVICVI 1288
            ||||||||:::||.:|||||||||||.|||||||.||:....|||.:|||||||||||.:.|.|:
plant  1142 QRIAIARAVLKNPSVLLLDEATSALDSQSERVVQDALERVMVGRTSVVIAHRLSTIQNCDAIAVL 1206

  Fly  1289 QAGKIVEQGSHSQLLAK--NGIYSKLYRCQT 1317
            ..||:||:|:||.||:|  .|||..|...||
plant  1207 DKGKLVERGTHSSLLSKGPTGIYFSLVSLQT 1237

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG10226NP_648040.1 MdlB 147..652 CDD:440747 192/511 (38%)
MdlB 723..1320 CDD:440747 229/619 (37%)
ABCB15NP_189475.1 MdlB 32..600 CDD:440747 209/625 (33%)
PTZ00265 34..1235 CDD:240339 447/1298 (34%)

Return to query results.
Submit another query.