DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG10226 and Mdr65

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_648040.1 Gene:CG10226 / 38725 FlyBaseID:FBgn0035695 Length:1320 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_476831.1 Gene:Mdr65 / 38726 FlyBaseID:FBgn0004513 Length:1302 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1327 Identity:723/1327 - (54%)
Similarity:968/1327 - (72%) Gaps:56/1327 - (4%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     5 ETREDVPAADADEATPAAQKKKKTKEKAQPMVSYTELFRYIA----GWDYLVLLSGFVAAFLQSL 65
            :::|:.|.|:..|.|             :| :::.:|||:..    ||    |..||:...:::|
  Fly    14 KSQEEAPMAEGLEPT-------------EP-IAFLKLFRFSTYGEIGW----LFFGFIMCCIKAL 60

  Fly    66 VFPIAIVVYSELVAMFIERTLGQGTSSVTIGLSLFGGGKILTNASYEENMQELRKDSVSFGILMT 130
            ..|..:::|||..:|.::|.:..||||....|.||||||.|||||.|||.:.|..||:|:|||:|
  Fly    61 TLPAVVIIYSEFTSMLVDRAMQFGTSSNVHALPLFGGGKTLTNASREENNEALYDDSISYGILLT 125

  Fly   131 LNTLLMLFSGVYYVDAFNRLALKLTVRMRREFFKATLRQEIGWHDMAKDQNFAVRITDNMEKIRS 195
            :.:::|..||::.||.||.:||:...|||.:.|.:.:||:|||||:|..|||...:.|::||||.
  Fly   126 IASVVMFISGIFSVDVFNMVALRQVTRMRIKLFSSVIRQDIGWHDLASKQNFTQSMVDDVEKIRD 190

  Fly   196 GIAENLGHYVEIMCDVIISVVLSFIYGWKLALAIVFYIPLTLVVNSAVAHYQGKLTGQEQSSYVR 260
            ||:|.:||:|.::...||:|.:||.|||||.||:..||||.:::|..||.:|||||.:||.||..
  Fly   191 GISEKVGHFVYLVVGFIITVAISFSYGWKLTLAVSSYIPLVILLNYYVAKFQGKLTAREQESYAG 255

  Fly   261 ASSVVEEVIGAIRTVVAFGGERSESLRYDSLLKPALKAGKWKGAFSGLSDTVMKAMLFITGAGSF 325
            |.::.||::.:|||||:||||:||..||::.|.||.||.:||||||||||.|:|:||:::.||:|
  Fly   256 AGNLAEEILSSIRTVVSFGGEKSEVQRYENFLVPARKASQWKGAFSGLSDAVLKSMLYLSCAGAF 320

  Fly   326 WYGANLILYYRDPSIPIDEREYTPAVVMIVISGIIVSANQISRTSPFLETFAMARGSASAILDVI 390
            |||.|||:..|:    ::.:|||||::||...||||.|:.|:||:||||:||.|||.|:.:..||
  Fly   321 WYGVNLIIDDRN----VENKEYTPAILMIAFFGIIVGADNIARTAPFLESFATARGCATNLFKVI 381

  Fly   391 DRTSLIDPLSKAGKILNYGLKGAVEFRDVFFRYPAREDVIVLRGLNVVVEEGQTVALVGPSGCGK 455
            |.||.|||||..||:|||||:|.|||:|||||||:|.:|||.||||:.:..||||||||.|||||
  Fly   382 DLTSKIDPLSTDGKLLNYGLRGDVEFQDVFFRYPSRPEVIVHRGLNIRIRAGQTVALVGSSGCGK 446

  Fly   456 STCIQLLQRFYDPVFGQVLLDGEDVRKYNIKWLRSNIAVVGQEPVLFQGSIGENIRHGKPEATQK 520
            |||:||||||||||||.||||..|:|||||:||||||||||||||||.|:|.:||.:|||.||||
  Fly   447 STCVQLLQRFYDPVFGSVLLDDLDIRKYNIQWLRSNIAVVGQEPVLFLGTIAQNISYGKPGATQK 511

  Fly   521 EVEDAAKAANAHDFIIALHKGYDTDISEKGVQLSGGQRQRIAIARALIQQPKILLLDEATSALDY 585
            |:|.||..|.||:||..|.:.|.:.|.|:|.||||||:|||||||||||.|||||||||||||||
  Fly   512 EIEAAATQAGAHEFITNLPESYRSMIGERGSQLSGGQKQRIAIARALIQNPKILLLDEATSALDY 576

  Fly   586 HSEKLVQAALDKACKGRTTLVVSHRLSAIRHAHRIVYIENGKAVEQGTHEELMKLEGFYHKMVTV 650
            .|||.||.|||.|.|||||:||||||||||.|.:||:|.:||.:|:|:|::||.|||.|:.|  |
  Fly   577 QSEKQVQQALDLASKGRTTIVVSHRLSAIRGADKIVFIHDGKVLEEGSHDDLMALEGAYYNM--V 639

  Fly   651 HSYDDSAEELLNELEEVAEIKERKM-----SYEVEP--YQLGTRNSIVSLEKNAEFQMKNLNGLA 708
            .:.|.:..:.:.:.:.:.:.|::.:     |:|..|  ::.|.:||:       :|:...:..|.
  Fly   640 RAGDINMPDEVEKEDSIEDTKQKSLALFEKSFETSPLNFEKGQKNSV-------QFEEPIIKALI 697

  Fly   709 NITMNQEIDDPRVPSANFISTFFRILGWARPEWSFLIIGAICAGLYGVTMPVFSVVLAELYGSLA 773
            ..|..|..:.| ....||..||.|||..|:.||.:||:|.|.|...|...|.|:|:..|.|.:||
  Fly   698 KDTNAQSAEAP-PEKPNFFRTFSRILQLAKQEWCYLILGTISAVAVGFLYPAFAVIFGEFYAALA 761

  Fly   774 KPTDEEVLEQSASMAIISLVIGIAAGVVCYIQTFFFNLAGVWLTTRMRSKTFRCIMNQEMGWFDR 838
            :...|:.|.::|.::...|.:....|:||::||:.||.||:|||||||:.||..::|||:||||.
  Fly   762 EKDPEDALRRTAVLSWACLGLAFLTGLVCFLQTYLFNYAGIWLTTRMRAMTFNAMVNQEVGWFDD 826

  Fly   839 KENSIGALSARLSGDAASVQGAIGFPLSNIIQAFTNFICSIAIAFPYSWELALICLSTSPFMVAS 903
            :.||:|||||||||:|..:|||||:|||.:|||.:|||.|:::|..|:|:|||:||:..|.:|.|
  Fly   827 ENNSVGALSARLSGEAVDIQGAIGYPLSGMIQALSNFISSVSVAMYYNWKLALLCLANCPIIVGS 891

  Fly   904 IVFEARFGEKSALKEKEVLEETSRIATETITQIRTVAGLRREEELIKIYDKEVERYRHQILSRLK 968
            ::.||:....:.::||:|:||..|||||:||.||||||||||.::|:.|.:|::|....|..:|:
  Fly   892 VILEAKMMSNAVVREKQVIEEACRIATESITNIRTVAGLRREADVIREYTEEIQRVEVLIRQKLR 956

  Fly   969 WRGLVNSLGKSLMFFGYAVTLTYGGHMCADGKIKFETIMKISNTMLYGLFILAQSLAFTPAFNAA 1033
            |||::||..::..||.|||.|.|||.:.::|::.|:.|:|:|.|:|||..:|||||||||||:||
  Fly   957 WRGVLNSTMQASAFFAYAVALCYGGVLVSEGQLPFQDIIKVSETLLYGSMMLAQSLAFTPAFSAA 1021

  Fly  1034 LLSANRMYEIIDRKPQIQSPESFEIQQNGNGTAYKTNVVQ----QGVSYRGLNFSYPSRPHIKVL 1094
            |::.:|:::|:||||:||||         .||...|...|    :||.|||:.|.||:||..|:|
  Fly  1022 LIAGHRLFQILDRKPKIQSP---------MGTIKNTLAKQLNLFEGVRYRGIQFRYPTRPDAKIL 1077

  Fly  1095 QNFNLDINQGQTVALVGASGSGKSTCVQLLMRYYDPDEGKILIDQESIHHDMDLKTLRRRLGIVS 1159
            ...:|::.:||||||||.||.|||||||||.||||||||.|.||.:.|.||:.|..:|.:|||||
  Fly  1078 NGLDLEVLKGQTVALVGHSGCGKSTCVQLLQRYYDPDEGTIHIDHDDIQHDLTLDGVRTKLGIVS 1142

  Fly  1160 QEPSLFEKSIADNIGYGDTSRQVPMQQIIEAAKMANAHEFIMSLPAQYDTVLGSKGTQLSGGQKQ 1224
            |||:|||:|||:||.|||..|.|.|.:||.|||.||||.||:|||..|||.:|::||||||||||
  Fly  1143 QEPTLFERSIAENIAYGDNRRSVSMVEIIAAAKSANAHSFIISLPNGYDTRMGARGTQLSGGQKQ 1207

  Fly  1225 RIAIARAMVRNPKILLLDEATSALDFQSERVVQQALDSACSGRTCIVIAHRLSTIQNANVICVIQ 1289
            |||||||:|||||||||||||||||.|||::||||||:||||||||||||||||:|||:||||||
  Fly  1208 RIAIARALVRNPKILLLDEATSALDLQSEQLVQQALDTACSGRTCIVIAHRLSTVQNADVICVIQ 1272

  Fly  1290 AGKIVEQGSHSQLLAKNGIYSKLYRCQ 1316
            .|::||||:|.||:::.|||:||::.|
  Fly  1273 NGQVVEQGNHMQLISQGGIYAKLHKTQ 1299

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG10226NP_648040.1 MdlB 147..652 CDD:440747 316/504 (63%)
MdlB 723..1320 CDD:440747 341/598 (57%)
Mdr65NP_476831.1 MdlB 118..641 CDD:440747 326/528 (62%)
MdlB 711..1299 CDD:440747 340/596 (57%)

Return to query results.
Submit another query.