DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Tnpo and tnpo1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_477368.1 Gene:Tnpo / 38721 FlyBaseID:FBgn0024921 Length:893 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_691079.2 Gene:tnpo1 / 562607 ZFINID:ZDB-GENE-080819-1 Length:891 Species:Danio rerio


Alignment Length:893 Identity:666/893 - (74%)
Similarity:766/893 - (85%) Gaps:8/893 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     3 WEPQGEGLQQIIAILKESQSPDTATQMAVQMKLEEFNRYPDFNNYLIYVLTKLKTEDEPTRSLSG 67
            |:|..:|||||:.:|||||||||:||.:||.|||:.|:|||||||||:|||||||||||||||||
Zfish     5 WKPDEQGLQQILQLLKESQSPDTSTQRSVQQKLEQLNQYPDFNNYLIFVLTKLKTEDEPTRSLSG 69

  Fly    68 LILKNNIRMHGTTLQPEIVEYIKHECLQAVGDASPLIRATVGILITTIASNGGLHNWPQLLPSLC 132
            ||||||::.|.......:.::||:||||::||:|||||||||||||||||.|.|.|||:|||.||
Zfish    70 LILKNNVKAHYQNFPNGVSDFIKNECLQSIGDSSPLIRATVGILITTIASKGELQNWPELLPKLC 134

  Fly   133 EMLDNQDYNVCEGAFSALQKICEDSAEILDSAALNRPLNIMIPKFLEYFKHSSPKIRSHAIACIN 197
            .:||::|||.|||||.|||||||||||||||..|.||||:||||||::|||||||||||||||:|
Zfish   135 LLLDSEDYNTCEGAFGALQKICEDSAEILDSDMLERPLNVMIPKFLQFFKHSSPKIRSHAIACVN 199

  Fly   198 QFIINRSQALMLNIDSFIENLFHLSSDEDHEVRKNVCHGLVMLLEVRMDRLMPHMSQIIEYMLLR 262
            ||||:|:|||||:||.||||||.|:.||:.|||||||..||||||||:|||:|||..||||||.|
Zfish   200 QFIISRTQALMLHIDPFIENLFALAGDEEPEVRKNVCRALVMLLEVRLDRLLPHMHNIIEYMLQR 264

  Fly   263 TQDTDEGVALEASEFWLSLAEQSICKDVLAPYLAQLAPVLVRGMRYSEVDIILLKGNVEEDDMVP 327
            |||.||.|||||.||||:||||.:||:||..:|.:|.||||.||:|||:|||||||:||||:.:|
Zfish   265 TQDQDENVALEACEFWLTLAEQPVCKEVLCGHLPKLTPVLVNGMKYSEIDIILLKGDVEEDEAIP 329

  Fly   328 DREEDIRPRFHKSRAHTIRSTQEGGAGATGDDDDDEFEDGMDDDSSLSEWNLRKCSAAALDVLAN 392
            |.|:|||||||:||  |:....|||.....||||   ||.:|||.::|:||||||||||||||||
Zfish   330 DNEQDIRPRFHRSR--TVAQQHEGGDSIEEDDDD---EDDLDDDETISDWNLRKCSAAALDVLAN 389

  Fly   393 VFREDCLPVVLPILKETLFHQEWVIKESGVLALGAIAEGCMQGMIQHLPELIPYLISCLSDKKAL 457
            |||:|.|..:||:|||.|||.||:|||||:|.|||||||||||||.:||||||:|:.||||||||
Zfish   390 VFRDDLLLHILPLLKELLFHPEWLIKESGILVLGAIAEGCMQGMIPYLPELIPHLVLCLSDKKAL 454

  Fly   458 VRSITCWTLSRYANWVVNQPHDQYLKPLMEELLKRILDSNKRVQEAACSAFATLEEEACTELVPY 522
            |||||||||||||:|||:||.|.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   455 VRSITCWTLSRYAHWVVSQPPDTYLKPLMTELLKRILDSNKRVQEAACSAFATLEEEACTELVPY 519

  Fly   523 LEYILKTLVFAFSKYQHKNLLILYDAVGTLADSVGHHLNKPQYIDILMPPLIDKWNLLKDDDKDL 587
            |.|||.||||||||||||||||||||:||||||||||||||:||.:||||||.|||.|||:||||
Zfish   520 LAYILDTLVFAFSKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNKPEYIQMLMPPLIQKWNQLKDEDKDL 584

  Fly   588 FPLLECLSSIATALQSGFLPYCDPVYRRCISLIEQTINQEMLCKQNQT--YDHPDKERMIVALDL 650
            |||||||||:||||||||||||:|||:||::|:::|:.|.:| .|||.  |:.|||:.|||||||
Zfish   585 FPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVNLVQKTLAQAVL-HQNQPEYYEAPDKDFMIVALDL 648

  Fly   651 LSGLAEGLDRHIETLVANSNIMHLLYQCMQDVLPEVRQSSFALLGDLTKACFPHVHPFMADFFPI 715
            ||||||||..:||.|||.|||:.|:||||||.:|||||||||||||||||.|.||.|.:|:|.||
Zfish   649 LSGLAEGLGGNIEQLVARSNILTLMYQCMQDKMPEVRQSSFALLGDLTKASFQHVKPCIANFMPI 713

  Fly   716 LGQNLNPDFISVCNNATWAIGEICMKLGEETKQYIRLVLSDLFIIINRPNTPKTLLENTAITIGR 780
            ||.||||:.||||||||||||||.:::|.|.:.|:.|||..|..|||||||||||||||||||||
Zfish   714 LGTNLNPELISVCNNATWAIGEISIQMGSEMQPYVPLVLQQLVEIINRPNTPKTLLENTAITIGR 778

  Fly   781 LGYVCPVEVAPYLPEFVRQWCTSLRHIRDNDEKDSAFRGMCHMITVNPAGVVADFIFFCDAIASW 845
            ||||||.||||.|.:|:|.||||||:||||:||||||||:|.||||||.|||.||||||||:|||
Zfish   779 LGYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEKDSAFRGICTMITVNPGGVVQDFIFFCDAVASW 843

  Fly   846 VNPPEDLHQMIQKILHGFKTQVGEENWRRFVEQFPPTLAERLTTMYNI 893
            :||.:||.:|..|||||||.|||:||||||.:||||.|.|||...|.:
Zfish   844 MNPKDDLREMFYKILHGFKNQVGDENWRRFSDQFPPPLKERLAAFYGV 891

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
TnpoNP_477368.1 KAP95 22..754 CDD:227540 548/733 (75%)
HEAT repeat 127..155 CDD:293787 20/27 (74%)
HEAT repeat 172..202 CDD:293787 25/29 (86%)
HEAT repeat 213..239 CDD:293787 17/25 (68%)
HEAT repeat 252..281 CDD:293787 22/28 (79%)
HEAT repeat 402..430 CDD:293787 20/27 (74%)
HEAT repeat 442..472 CDD:293787 26/29 (90%)
HEAT repeat 481..510 CDD:293787 27/28 (96%)
tnpo1XP_691079.2 KAP95 24..760 CDD:227540 552/741 (74%)
HEAT repeat 129..157 CDD:293787 20/27 (74%)
HEAT repeat 174..204 CDD:293787 25/29 (86%)
HEAT repeat 215..241 CDD:293787 17/25 (68%)
HEAT repeat 254..283 CDD:293787 22/28 (79%)
HEAT repeat 404..424 CDD:293787 14/19 (74%)
HEAT repeat 440..468 CDD:293787 24/27 (89%)
HEAT repeat 481..511 CDD:293787 28/29 (97%)
HEAT repeat 522..548 CDD:293787 23/25 (92%)
HEAT repeat 563..594 CDD:293787 25/30 (83%)
HEAT repeat 663..699 CDD:293787 29/35 (83%)
HEAT repeat 709..739 CDD:293787 23/29 (79%)
HEAT repeat 750..778 CDD:293787 23/27 (85%)

Return to query results.
Submit another query.