DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Tnpo and Tnpo1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_477368.1 Gene:Tnpo / 38721 FlyBaseID:FBgn0024921 Length:893 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001386360.1 Gene:Tnpo1 / 309126 RGDID:1308372 Length:898 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:892 Identity:662/892 - (74%)
Similarity:761/892 - (85%) Gaps:7/892 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     3 WEPQGEGLQQIIAILKESQSPDTATQMAVQMKLEEFNRYPDFNNYLIYVLTKLKTEDEPTRSLSG 67
            |:|..:|||||:.:|||||||||..|..||.|||:.|:|||||||||:||||||:||||||||||
  Rat    13 WKPDEQGLQQILQLLKESQSPDTTIQRTVQQKLEQLNQYPDFNNYLIFVLTKLKSEDEPTRSLSG 77

  Fly    68 LILKNNIRMHGTTLQPEIVEYIKHECLQAVGDASPLIRATVGILITTIASNGGLHNWPQLLPSLC 132
            ||||||::.|.......:.::||.|||..:||:|||||||||||||||||.|.|.|||.|||.||
  Rat    78 LILKNNVKAHFQNFPNGVTDFIKSECLNNIGDSSPLIRATVGILITTIASKGELQNWPDLLPKLC 142

  Fly   133 EMLDNQDYNVCEGAFSALQKICEDSAEILDSAALNRPLNIMIPKFLEYFKHSSPKIRSHAIACIN 197
            .:||::|||.|||||.|||||||||||||||..|:|||||||||||::||||||||||||:||:|
  Rat   143 SLLDSEDYNTCEGAFGALQKICEDSAEILDSDVLDRPLNIMIPKFLQFFKHSSPKIRSHAVACVN 207

  Fly   198 QFIINRSQALMLNIDSFIENLFHLSSDEDHEVRKNVCHGLVMLLEVRMDRLMPHMSQIIEYMLLR 262
            ||||:|:|||||:|||||||||.|:.||:.|||||||..||||||||||||:|||..|:||||.|
  Rat   208 QFIISRTQALMLHIDSFIENLFALAGDEEAEVRKNVCRALVMLLEVRMDRLLPHMHNIVEYMLQR 272

  Fly   263 TQDTDEGVALEASEFWLSLAEQSICKDVLAPYLAQLAPVLVRGMRYSEVDIILLKGNVEEDDMVP 327
            |||.||.|||||.||||:||||.||||||..:|.:|.||||.||:||::|||||||:||||:.:|
  Rat   273 TQDQDENVALEACEFWLTLAEQPICKDVLVRHLPKLIPVLVNGMKYSDIDIILLKGDVEEDEAIP 337

  Fly   328 DREEDIRPRFHKSRAHTIRSTQEGGAGATGDDDDDEFEDGMDDDSSLSEWNLRKCSAAALDVLAN 392
            |.|:|||||||:||  |:....|.......||||||    :|||.::|:||||||||||||||||
  Rat   338 DSEQDIRPRFHRSR--TVAQQHEEDGIEEDDDDDDE----IDDDDTISDWNLRKCSAAALDVLAN 396

  Fly   393 VFREDCLPVVLPILKETLFHQEWVIKESGVLALGAIAEGCMQGMIQHLPELIPYLISCLSDKKAL 457
            |:|::.||.:||:|||.|||.|||:||||:|.|||||||||||||.:||||||:||.||||||||
  Rat   397 VYRDELLPHILPLLKELLFHHEWVVKESGILVLGAIAEGCMQGMIPYLPELIPHLIQCLSDKKAL 461

  Fly   458 VRSITCWTLSRYANWVVNQPHDQYLKPLMEELLKRILDSNKRVQEAACSAFATLEEEACTELVPY 522
            |||||||||||||:|||:||.|.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   462 VRSITCWTLSRYAHWVVSQPPDTYLKPLMTELLKRILDSNKRVQEAACSAFATLEEEACTELVPY 526

  Fly   523 LEYILKTLVFAFSKYQHKNLLILYDAVGTLADSVGHHLNKPQYIDILMPPLIDKWNLLKDDDKDL 587
            |.|||.||||||||||||||||||||:||||||||||||||:||.:||||||.|||:|||:||||
  Rat   527 LAYILDTLVFAFSKYQHKNLLILYDAIGTLADSVGHHLNKPEYIQMLMPPLIQKWNMLKDEDKDL 591

  Fly   588 FPLLECLSSIATALQSGFLPYCDPVYRRCISLIEQTINQEMLCK-QNQTYDHPDKERMIVALDLL 651
            |||||||||:||||||||||||:|||:||::|:::|:.|.||.. |.:.|:.|||:.||||||||
  Rat   592 FPLLECLSSVATALQSGFLPYCEPVYQRCVNLVQKTLAQAMLNNAQPEQYEAPDKDFMIVALDLL 656

  Fly   652 SGLAEGLDRHIETLVANSNIMHLLYQCMQDVLPEVRQSSFALLGDLTKACFPHVHPFMADFFPIL 716
            |||||||..:||.|||.|||:.|:||||||.:|||||||||||||||||||.||.|.:|||.|||
  Rat   657 SGLAEGLGGNIEQLVARSNILTLMYQCMQDKMPEVRQSSFALLGDLTKACFQHVKPCIADFMPIL 721

  Fly   717 GQNLNPDFISVCNNATWAIGEICMKLGEETKQYIRLVLSDLFIIINRPNTPKTLLENTAITIGRL 781
            |.||||:|||||||||||||||.:::|.|.:.||.:||..|..||||||||||||||||||||||
  Rat   722 GTNLNPEFISVCNNATWAIGEISIQMGIEMQPYIPMVLHQLVEIINRPNTPKTLLENTAITIGRL 786

  Fly   782 GYVCPVEVAPYLPEFVRQWCTSLRHIRDNDEKDSAFRGMCHMITVNPAGVVADFIFFCDAIASWV 846
            |||||.||||.|.:|:|.||||||:||||:||||||||:|.||:|||:||:.||||||||:|||:
  Rat   787 GYVCPQEVAPMLQQFIRPWCTSLRNIRDNEEKDSAFRGICTMISVNPSGVIQDFIFFCDAVASWI 851

  Fly   847 NPPEDLHQMIQKILHGFKTQVGEENWRRFVEQFPPTLAERLTTMYNI 893
            ||.:||..|..|||||||.|||:||||||.:|||..|.|||...|.:
  Rat   852 NPKDDLRDMFCKILHGFKNQVGDENWRRFSDQFPLPLKERLAAFYGV 898

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
TnpoNP_477368.1 KAP95 22..754 CDD:227540 547/732 (75%)
HEAT repeat 127..155 CDD:293787 20/27 (74%)
HEAT repeat 172..202 CDD:293787 25/29 (86%)
HEAT repeat 213..239 CDD:293787 18/25 (72%)
HEAT repeat 252..281 CDD:293787 21/28 (75%)
HEAT repeat 402..430 CDD:293787 20/27 (74%)
HEAT repeat 442..472 CDD:293787 27/29 (93%)
HEAT repeat 481..510 CDD:293787 27/28 (96%)
Tnpo1NP_001386360.1 KAP95 32..767 CDD:227540 551/740 (74%)
HEAT repeat 103..124 CDD:293787 16/20 (80%)
HEAT repeat 137..165 CDD:293787 20/27 (74%)
HEAT repeat 182..212 CDD:293787 25/29 (86%)
HEAT repeat 223..249 CDD:293787 18/25 (72%)
HEAT repeat 262..291 CDD:293787 21/28 (75%)
HEAT repeat 407..431 CDD:293787 17/23 (74%)
HEAT repeat 447..475 CDD:293787 25/27 (93%)
HEAT repeat 488..518 CDD:293787 28/29 (97%)
HEAT repeat 529..555 CDD:293787 23/25 (92%)
HEAT repeat 570..601 CDD:293787 25/30 (83%)

Return to query results.
Submit another query.