DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG4835 and LOC1269088

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_647965.3 Gene:CG4835 / 38619 FlyBaseID:FBgn0035607 Length:1224 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_061512186.1 Gene:LOC1269088 / 1269088 VectorBaseID:AGAMI1_003465 Length:1316 Species:Anopheles gambiae


Alignment Length:1200 Identity:320/1200 - (26%)
Similarity:474/1200 - (39%) Gaps:319/1200 - (26%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    65 NCSLFLVCDC-LYPTVKLCPANLWWDNKTQQCNYPQAVEC---------IYYSIETPEPT--DGT 117
            :|:.:.:|.. |..||. ||.:|.::.:..:|::.:.|.|         :.|:..|...|  |.|
Mosquito   120 SCTKYNLCVLGLMLTVS-CPNDLRFNKERCECDFKEKVYCEGEDPATTTVDYASTTDATTVYDST 183

  Fly   118 TRFTPEPTSSTQKITPEPTEPPSSTAKITTESTTGTST-------EITSSTPSSYLPT--SSWDP 173
            |:.:.....:|:..|.|.|...|:|.:.|||.|...||       |.|:...:|.|.|  |:.:.
Mosquito   184 TKDSTTEEFTTEVATSESTTEDSTTEESTTEVTVSESTTEDSTTEESTTEVATSELTTEESTTEE 248

  Fly   174 PPAPPGISDDYCRNKEDGSVHYYPYDCQAYINCTYGWPVLNYCIEDKVFNKYLGICDTPDMADCE 238
            ......:|:.   ..||.:......:.....:.|          |:....:           ...
Mosquito   249 STTEVIVSES---TTEDSTTEESTTEAATSESTT----------EESTTEE-----------STT 289

  Fly   239 ELPLPTTTTEMPPTSTTEEDVVCGPTPEGIEEDYCVPKGNGFYEYPYNCSGYLACKNGCTDLDYC 303
            |:.:..:|||   .|||||......|.|...||                   ...:...|::...
Mosquito   290 EVTVSESTTE---DSTTEESTTEAATSESTTED-------------------STTEESTTEVATS 332

  Fly   304 QPDKLFNNWLHICDTPDSVRCDPLPFPTTPGTTNKPTTPSVTTTPSIT-TTPSTPTTLPS--DGS 365
            :           ..|.||...:    .||...|::.||...||..||| .|.|..||..|  :.|
Mosquito   333 E-----------STTEDSTTEE----STTEVVTSESTTEDSTTEESITEVTVSESTTEDSTTEES 382

  Fly   366 TTEI--HSSTTEEIVTTTDGLPSDVDPNDCKDEKDGTIFAYIGNCSEYLICKDNQVQMGHCPPNT 428
            |||:  ..||||:  :||:...::|..::...|:..|                            
Mosquito   383 TTEVATSESTTED--STTEEFTTEVATSESTTEESTT---------------------------- 417

  Fly   429 LFNPDLLVCDEPDDVVCLGDRTTTPIPTTIPTTTTEKTTPTTTTTTVATTLGPDQLCDGQELGAS 493
                               :.:||.:  |:...|||.:|...:||.|||:....:....:|....
Mosquito   418 -------------------EESTTEV--TVSEATTEDSTTEESTTEVATSESTTEESTTEESTTE 461

  Fly   494 FSYPDDCSKYYLCLGGGQWTLAPCIYGSYFDPSTGQCGPDVAPDACKPSQVTT--TTTTTTTETT 556
            .:..:..::                     |.:|.:...:||.......:.||  :||..||..:
Mosquito   462 VTVSESTTE---------------------DSTTEESTTEVATSESTTEESTTEESTTEVTTSES 505

  Fly   557 TTERNTTPKST------------ATTTERTT------------TTVAPKTGICGGRNENENIAYP 597
            |||.:||.:||            :||.|.||            ||..|.|.:....:..|.....
Mosquito   506 TTEDSTTEESTTEVTVSESTTEDSTTEESTTEVVTSESTTEDSTTEEPTTEVATSESTTEESTTE 570

  Fly   598 NNCTKYIVCVSPIPIAFFCPDGTFFSSKLEKCIDDWDESDCEGDQSTT-------TLEPGYTRPP 655
            .:.|:..|..|.      ..|.|...|..|....:....|...::|||       |.|...|...
Mosquito   571 ESTTEVTVSEST------TEDSTTEKSTTEAATSESTTEDSTTEESTTEVTVSESTTEDSTTEES 629

  Fly   656 PEPTMCTNSSRDTFPYPDNCQWFIRCVDDYIYMMDVCNCGEYYDPITEKCGADVPSDACRWDYTS 720
            ....:.:.|:.:                               |..||:...:|.:.    :.|:
Mosquito   630 TTEVVTSESTTE-------------------------------DSTTEEATTEVATS----ESTT 659

  Fly   721 TTSTTSEPTTTTAVTRPPPQKGPCDDVEDGALVAYPNDCSKYIQCDRPIAVAFECEKGDEFSVEL 785
            ..|||.|.||..|.:....:....::.           .::.:..:.....:...|...|.:|..
Mosquito   660 EDSTTEESTTEVATSESTTEDSTTEEA-----------TTEVVTSESTTEDSTTEEATTEVTVSE 713

  Fly   786 GKCVDASLANCSITTTAKPSESTTTPRDGEGSTT---PSEPST-GSSTESST------ESTTEPS 840
            ....|::....  ||....|||||.....|.|||   .||.:| .|:||.||      |||||.|
Mosquito   714 STTEDSTTEES--TTEVATSESTTEDSTTEESTTEVVTSESTTEHSTTEESTTEVATSESTTEES 776

  Fly   841 T--ESTTE-STTESTTE-STTESSTGQ---STETTESST----VLSTDTSESPSTISTPPSSTT- 893
            |  ||||| :|:||||| ||||.||.:   |..|||.||    :.....|||.:..||...||| 
Mosquito   777 TTEESTTEVATSESTTEDSTTEESTTEVVTSESTTEDSTTEESITEVTVSESTTEDSTTEESTTE 841

  Fly   894 MEPGTTNPEASTTEKPADGIC--EGKTDDSLVPYPRNCSKYIKCQYPIPVGYDCPDGLEFSPTEL 956
            :....:..|.||||:....:.  |..|::|..                          |.|.||:
Mosquito   842 VATSESTTEDSTTEEITTEVATSESTTEESTT--------------------------EESTTEV 880

  Fly   957 TCMDPELAGCSTKLTTPGLTT-------LSTEASSTPVTTVSTTPEATTTEMSTTPKTTTTESTT 1014
            |..:......:|:.:|..:.|       .:||.|.|.||...:|.|.:|||.||| :.|.:||||
Mosquito   881 TVSEATTEDSTTEESTTEVVTSESTTEDSTTEESITEVTVSESTTEDSTTEESTT-EVTVSESTT 944

  Fly  1015 ISTTTTDSTTPQTTTTESTTSKTTTTEST--IISTTPTTTEPTTPKT----TTTESTTIPTTTTE 1073
            ..:||.:||| :..|:||||..:||.|||  ::::..||.:.||.::    |.:||||..:||.|
Mosquito   945 EDSTTEESTT-EVATSESTTEDSTTEESTTEVVTSESTTEDSTTEESITEVTVSESTTEDSTTEE 1008

  Fly  1074 STTATTTPQTTTTESTTISTTPKTTTTESTTVSTTPTTTESTT-ISTTPTTT-EPTTVSTTPKTT 1136
            |||...|.::||.||||..:|.:.|.:||||..:  ||.|||| ::|:.:|| |.||..:|.:..
Mosquito  1009 STTEVATSESTTEESTTEESTTEVTVSESTTEDS--TTEESTTEVATSESTTEESTTEESTTEVV 1071

  Fly  1137 TTESTTVTTTTESTT---TVSTPTTLDPYT 1163
            |:||||..:|||.:|   |||..||.|..|
Mosquito  1072 TSESTTEDSTTEESTTEVTVSESTTEDSTT 1101

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG4835NP_647965.3 CBM_14 51..103 CDD:426342 10/38 (26%)
CBM_14 185..237 CDD:426342 4/51 (8%)
CBM_14 273..322 CDD:426342 3/48 (6%)
CBM_14 393..444 CDD:426342 2/50 (4%)
CBM_14 485..539 CDD:426342 5/53 (9%)
CBM_14 585..638 CDD:426342 8/52 (15%)
CBM_14 661..714 CDD:426342 5/52 (10%)
CBM_14 744..796 CDD:426342 4/51 (8%)
CBM_14 914..962 CDD:426342 8/49 (16%)
CBM_14 1175..1212 CDD:426342
LOC1269088XP_061512186.1 None
Blue background indicates that the domain is not in the aligned region.

Return to query results.
Submit another query.