DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dnah3 and Dhc93AB

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_647937.2 Gene:Dnah3 / 38586 FlyBaseID:FBgn0035581 Length:4385 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001262793.1 Gene:Dhc93AB / 42485 FlyBaseID:FBgn0013812 Length:4496 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:4690 Identity:1333/4690 - (28%)
Similarity:2184/4690 - (46%) Gaps:731/4690 - (15%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   109 DSLQELQLEDIIMP-----EQFE-----MLRDAKDHLYNFDSTACNQFPWIDKWMTG-------- 155
            |.|..| :|::::|     :.:.     :.:|.:.|:::..||...    :...::|        
  Fly   121 DQLSAL-VEEVLVPLLSNEDNYRNWPIMVAQDVQKHVHSLKSTVHQ----VKGQVSGETILAMPV 180

  Fly   156 ----VRPSEQEIYEMTSHLLEIYCNRRVRIFYPGCGTSSSLWTNQLRRQ-HGSPSELIGAYRTPS 215
                :..:.:|:.|......::|....:.      |.... |..|:... ..|||....      
  Fly   181 GVEKIVKAAKELVETEQCQFDLYLKSAIE------GVVIK-WATQIHEVIKESPSNAFA------ 232

  Fly   216 ARHMRVNNMRGPPKKEKFTAGDH------YAFRTPQECRNELMRVGKIIDE------------LI 262
                   |.:.|....:||..::      :.:   .:.|||.:|...:|.|            |.
  Fly   233 -------NGQNPTPHTEFTFWNNRLKNLSFIY---DQLRNERIRAMALILEYSMSAYHPCFQTLF 287

  Fly   263 EPVLKA-AEHKIGHGLTKYPDP-------------PSCKDNTNRILRSAGILVGKKK-NCYVGKC 312
            :.|:.| ||.|   .:|.|.:|             ..||......:.:.|||.|..: .|...|.
  Fly   288 KNVVTALAEAK---DITLYLNPLKRPLQHLEEIDFAECKPLLIPFMNTVGILWGNSRYYCQSAKI 349

  Fly   313 RIHRKDFAT--NEEFLRCLKRMEATHFPYMQPLQPVDPDDQKIKMLAK----YRVELA------- 364
            .:..::...  ..:..|.|......|....:.:|.:....|.:|...:    |:..||       
  Fly   350 TVLLQEICNLIIHQAKRYLDPSSIFHSDIDEAMQRLTLSIQILKFFRELFDYYKERLATFFTEPE 414

  Fly   365 -RAEKLFTL---KIQKRYQCLLKSMSIVQLATYPSHLIRKAFR------RINPRSALLQDAY--- 416
             |...|:|.   .:.||:...|:.::.:|...:......|..:      |....|..:.|.|   
  Fly   415 ERPPILWTFHPNSVFKRFNAFLERLTTIQWFFFTVIEFLKLEKVEIGGLRGRQLSTRITDVYVEF 479

  Fly   417 --QFIVKEKRDWPKLPPEVILMDYLFVG--DRGVRQDLAILIIVCLI-----DLQEDFRHYVKRS 472
              .|.....:.:..|.|:....|..|.|  .|.:..|:.:..|:|..     :|:..|:      
  Fly   480 NQYFTAFASKSYDVLDPDDHEFDEDFKGFQTRILELDMKLAAILCQAFDDCHNLESIFK------ 538

  Fly   473 FLNYLLSSNMERRRLQLEREPPEFPI-------LTISPPVSWRSNLLRGKARIGEVLMTTH--PT 528
             |..::.|.::|.:::.|.......|       :||...:..:...|:   ::|:.|...:  |.
  Fly   539 -LISIVGSVLDRPKIKEEFTQRYAEIVRMLDDEMTICESIYDKQMELK---KVGDNLYPNYNCPP 599

  Fly   529 VQALNRLWHDLYEDLVVVDLGQLLLAQRPL-DADTVQVFIEK---------SCADVRDLLLNDWL 583
            |.|..|..|.| |..:...:......|..: ..:..|..:|:         ||   :....:|| 
  Fly   600 VAAFIRWCHQL-ETRITAPVKNFKALQHEITKTEKSQEIVERYEILMVKLGSC---KTQFFDDW- 659

  Fly   584 PRCADLMNEMRGTWKDLVPMSGKYGGRAAMLFRCIHSAMSRHLNSLISKSINYLFKVLCAFKGGN 648
                                :|:..|:.....:....|..|..||||......||.:|       
  Fly   660 --------------------AGQLDGQIEENLKKSLIARDRRHNSLILNFSAALFSIL------- 697

  Fly   649 RIEKYSMFDAKLKRIPLMTLIASVVGAHFDHEPINMGPGVRPASNIYVYDEDDADPFQ----QPQ 709
             .|.:.|...|::.||.:.:..:.....|....:|:...:...::|    ::.:.|.:    :|:
  Fly   698 -REVHYMQQMKIEGIPQIAIDFAEKSDVFRSYTLNLEKTIDWYNSI----QEGSSPVELRLIEPE 757

  Fly   710 -----------VNQFVENVPDI--------DDVA--QFELDHS--NKLYIYPYM----------- 740
                       |||.|.|..||        ..||  |..:||:  |...|...|           
  Fly   758 IKMIDDLVEIGVNQLVWNSSDILSYLDKLRKPVAALQNRMDHTQGNLRQIRKIMGVWAKQPLFER 822

  Fly   741 -----------QELPRIFTEHFKSILAVGYEIPR------LEFVMSGGEPETKGFLHFIDEDHVD 788
                       .|.|...::.:..|.|...||.:      |:|.|     |:|       :|...
  Fly   823 RDCKKDTVLSIDERPDRTSKRYAEIQAASIEIHKLLQDNMLQFDM-----ESK-------QDDAV 875

  Fly   789 FLELCEKVEQIVKVN---WQGVHV-YL----------KPVYKYYFGL------------------ 821
            :|...:.|:.||..|   ..||.| ||          .|:::....|                  
  Fly   876 WLSYVDFVDNIVYENILKTVGVSVGYLAENMDPENNYAPLFESRLELVEPNLVFVPSLDPEDPMG 940

  Fly   822 FQKLILPMVQKVWTENNLPELGAVQELLKKLQAVSDTTYYLRDFIPLNLFMLD-NRHVKLSLRMY 885
            |..:::.:::      ::.::|:   |:|:|:......|.  :.|..|..::| .|.:...:.:.
  Fly   941 FNNMLIELMR------DIMKMGS---LIKRLKPNEKRNYV--EMIKENQDIIDMRREILNGVDLV 994

  Fly   886 VREIYDFIIDF--YKALNWNENRAIC-------------EELEEMSMKAGERP------------ 923
            :.|...|...|  |..| |.::|..|             :|:|.:.:....:|            
  Fly   995 MEEASRFCRQFERYSYL-WLDDREECMEYFLEYGRMLDPDEIELILINDPNQPPPQPCQPTIEAF 1058

  Fly   924 -EETPEVVALQNYINDCREMRIFA------------------------IKDEIKNVLKRVVFLLT 963
             |:.....:|.|.|.|....::|:                        .|:.:...:...:..|:
  Fly  1059 REQIDNYESLFNEIEDIGPFQVFSSWFQVDVRPFRQALLNTVCKWGNMFKEHLVTTVTSSLMNLS 1123

  Fly   964 HTYLSSDE-------------------------------------------------LHLNSRTF 979
            |....:||                                                 :.:.....
  Fly  1124 HFIRKADEGLLQTVKEKDYEGLVSIMAYLMQVKERAAKTDEMFEPMQETIQLLKYYDMDIPEEVN 1188

  Fly   980 ILPGEL---------------EEVLDLSAARLAVVRDNLELALRERRMEFEKLLAQEKRTMDGFR 1029
            :|..||               ::|..|.|..:..:|:  ::||.|..::   |..:..:|.|.||
  Fly  1189 VLLQELPEQWANTKKIASTVKQQVSPLQATEVVSIRN--KIALFESHIQ---LFREVFKTYDFFR 1248

  Fly  1030 IREIRDVLTLEELKERVDTVDLLFTTIENLSREAKAINTEETLLQIDVSAFPLLAEIIEKMEPIE 1094
            ....:..|.::.:.:     |:..     ...|.:.|....:|.::::..|.:|.:..:::..::
  Fly  1249 FDCYKPYLLMDRIND-----DMFL-----CESEMRDIQESGSLFEVNIPEFKVLKQCRKELRMLK 1303

  Fly  1095 KLWKTSYEFEKDYLIWMFERFECLNADGVRE-QVENMHKIMYKLSRQLAYNPVAKRAAEQMRMKI 1158
            :||        ||:..:....:.......|: .||||             :...|:.|:.:|:..
  Fly  1304 QLW--------DYVNIVATSIDDWKTTPWRKVDVENM-------------DIECKKFAKDIRLLD 1347

  Fly  1159 EKFRVY----------------LPVLDSICRHGLEKRHWDQISK------ILGRKVNPKLF---- 1197
            ::.|.:                |..:..:....:.:|||:|:..      .|.::|..|..    
  Fly  1348 KEMRPWDTFINLESTVKNMLTSLRAVGELQNPAIRERHWNQLMNSTKSLAALPKEVTVKFIMDHE 1412

  Fly  1198 PTLKDMIDVDIMSILPQLEEIANAAGKEYDLNNGLRIMQADWRDVMFEVLQYRDSDTHILASLDD 1262
            .||.:::.:::.....:::.|.:.|.||..:...||.:...|..:.|:...:..:..::|.:.::
  Fly  1413 TTLAELLGLNLHECEEEVKNIVDKAVKEMSMEKILRDLNTTWTVMEFDHELHPRTGCNLLKASEE 1477

  Fly  1263 IQTLLDDHIMRTQAMKRSPFITALGSKADDWEARLLLIQNIIDAWTQVQITWMYLEPIF-SSEDI 1326
            :...|:|:.:..|.:..|.:|.....:...|:.:|::...:|..|.:||.||.:||.|| |||||
  Fly  1478 LIETLEDNQVCLQNLITSKYIAHFLEEVSTWQNKLMIADQVITVWFEVQRTWTHLESIFMSSEDI 1542

  Fly  1327 MRQMPLEGRNFKAVDKLWRKIMKHTLKDRHVMAATEYPEMLEVFTKAIEDLETVTKGLNTYLEQK 1391
            .:|:|::...|..:|..:|.:|.......:|:|:|....::|......::|....|.|..|||.|
  Fly  1543 RKQLPVDSDRFDNIDAEFRVLMDEMSVSSNVVASTNRSGLIERLEHLQKELTLCEKALAEYLETK 1607

  Fly  1392 RLFFARFFFLSNDELLEILSETKDPMRVQPHLRKCFEGIGSLTF--DDNMEI---VEMVSDEEER 1451
            ||.|.||:|:|:.:||::||....|..|..||.|.|:.|..|.|  |::.||   ..|.:.:.|.
  Fly  1608 RLAFPRFYFVSSADLLDVLSNGIQPEMVTKHLTKLFDSIARLKFNRDESNEINTASGMYAKDGEY 1672

  Fly  1452 VALVRKINPQLAN--GLVEMWLKEVEMVMLDSVKEQMREAWEDYAMVERISWVVSWPGQVVQGIS 1514
            |    :.| :||:  |.||:||..::..|..|::..:.||...|...:|..|:..:|.||....|
  Fly  1673 V----EFN-ELASIRGPVEVWLNRIQAAMRASLRHYVMEAVIAYEEKQREQWLFDYPAQVSLCGS 1732

  Fly  1515 CMAWTYEVEEAIETKE------LPAYLEKSNLQIADLVQLVRTDLQAGVRIAVEALIVLDVHDRD 1573
            .:.|:.||..|....|      :..|.:|...|::.|:.|:..:|..|.|..:..:..:|||.||
  Fly  1733 QIWWSTEVNIAFSRLEEGYDNAIKDYYKKQISQLSLLITLLLGELSKGDRQKIMTICTIDVHSRD 1797

  Fly  1574 VVKYLTDCRITNIQDFDWISQLRYYWKVNEKNEDWVCVSMVV-TDVEYGMEYLGNLPRLVVTPLT 1637
            ||..:...::.:...|.|.||||:.:...||:    |.:.:. .:.:|..|||||.||||:||||
  Fly  1798 VVAKMIQAKLDSGSAFMWQSQLRHRFDDVEKD----CFANICDAEFQYCHEYLGNTPRLVITPLT 1858

  Fly  1638 DRCYRTLMGALKLCLGGAPEGPAGTGKTETCKDLAKAVAKKCVVFNCSDGLDYKALGKFFKGLAQ 1702
            ||||.||..:|.|.:||||.||||||||||.|||.:|:.....|||||:.:||::.|..:|||||
  Fly  1859 DRCYITLTQSLHLVMGGAPAGPAGTGKTETTKDLGRAIGISVYVFNCSEQMDYQSCGNIYKGLAQ 1923

  Fly  1703 SGAWACFDEFNRIELEVLSVVAQQILTIQRAIGRKVVKFFFEDTMLKLDPTCSIFITMNPGYAGR 1767
            :|||.||||||||.:|||||||.|:.::|.||..|..||.|...|:...||..||||||||||||
  Fly  1924 TGAWGCFDEFNRITVEVLSVVAVQVKSVQDAIRDKKDKFNFMGEMISCVPTVGIFITMNPGYAGR 1988

  Fly  1768 TELPDNLKVLFRTVAMMVPDYAMIGEITLYSNGFDMARNLSQKIVQAYKLCSEQLSSQSHYDYGM 1832
            ||||:|||.|||..||:|||:.:|.||.|.:.||..||.|::|.:..|.||.|.||.|.|||:|:
  Fly  1989 TELPENLKALFRPCAMVVPDFELICEIMLVAEGFQDARVLARKFITLYTLCKELLSKQDHYDWGL 2053

  Fly  1833 RAVKSVLLASASLRRLYVDLPEPEIVLRAIVDVNLPKFLEQDISLFIGIYMDLFPGVELPMPQRG 1897
            ||:||||:.:.||:|.....||.|:::||:.|.|:||.:..|:.:|:|:..||||.:::|..:..
  Fly  2054 RAIKSVLVVAGSLKRGDPGRPEEEVLMRALRDFNIPKIITDDMPVFMGLISDLFPALDVPRKRDQ 2118

  Fly  1898 DILKWLHINLADRNLQATPWYLEKILQIYEMLLVRHGLMIVGGSMGGKTTAYQVLAQTLRNVSTD 1962
            |..:.:....:|..||....::.|::|:.|:|.|||.:.|||.:..|||..::.|.:|.:|:   
  Fly  2119 DFERTVKQAASDLLLQPEDNFILKVVQLEELLEVRHSVFIVGNAGTGKTQVWKTLLRTYQNI--- 2180

  Fly  1963 EEATLKEFPVTFRIINPKAITMGQLYGRFDPVSHEWYDGVLAKTFREQVQGPKGERAWVMFDGPV 2027
                 |..|: |..:||||:|..:|:|..:|.:.||.||:.:...|:|......:..|::.||.:
  Fly  2181 -----KRKPI-FNDLNPKAVTNDELFGIINPATREWKDGLFSVLMRDQANITGDQPKWIVLDGDI 2239

  Fly  2028 DAVWIENLNTVLDDNKKLCLMSGEIMQMTKLMNMMFEPADLEQASPATVSRCGMIYMEPSQLGWR 2092
            |.:|||:||||:||||.|.|.|.|.:.:|..|.::||.::|..|:||||||.|::|:.|..|||.
  Fly  2240 DPMWIESLNTVMDDNKVLTLASNERIALTPSMRLLFEISNLRTATPATVSRAGILYINPQDLGWN 2304

  Fly  2093 ALHKSFINV------LVNKVGLGDIYMTLFEDMTEWLVPAALEFL-PQCKQMLELSPIYQYQTFS 2150
            ....|::..      ..|.|.|.|.|           :|.:||.: .:.|::..::.:...|...
  Fly  2305 PYVTSWVETRKIPAEKSNLVMLFDKY-----------IPPSLETIRVRFKKITPVAEMAHIQMLC 2358

  Fly  2151 RFFLHFL---EKHKQFNQAWFQQMFLFCFAWAYCSALTGQGQKTFDALLRKVIYGS---NENFPK 2209
            .....||   .......:.|.:..|:|...||:.||:. |.|    |:..:|.:..   || |..
  Fly  2359 HLLNCFLIPANTPADCPKEWHELYFVFACIWAFGSAMF-QDQ----AIDYRVEFSKWWVNE-FKT 2417

  Fly  2210 PKYFSLNRGQMFPEKLLFLDYRFD-EAENWWTWQKSDDSASTTSNFPENAQISELIVPTKETGYI 2273
            .|         ||......||..| |.:.:..|.:........|:.|    :..:||.|.|:..:
  Fly  2418 VK---------FPPGGTVFDYFLDSETKTFLPWTEKIPKFELDSDLP----LQAVIVHTSESIRL 2469

  Fly  2274 SYWQEFCISKSYAMLVVGPTGTGKSAIITSNLLAMPK-FANLVNVINFSARTSAQMVQDTIMSKL 2337
            .::.:..:.|.:.:::||..|.||:.::...|.::.: :|  |..|.|:..|:::|:|..:...|
  Fly  2470 RFFLDLLMDKKHPVMLVGNAGCGKTVLVNEKLQSLSENYA--VTTIPFNYYTTSEMLQKILEKPL 2532

  Fly  2338 DRRRKGVFGPSLGKKCTVFCDDVAMPSKDTYGSQAPLELLRTWLDHGYWSDLVDTTKIELVDMTL 2402
            :::....:||...|....|.||:.||..|.||:..|..|:|..||:|:|.|....|..::.:...
  Fly  2533 EKKAGRNYGPPGNKLLCYFVDDINMPEVDAYGTVQPHTLMRQHLDYGHWYDRNKLTLKDIHNCQY 2597

  Fly  2403 MCAMGTLGGSNFIFPRLYRHMFVVAVDSFEDSTIVRIFTTIGDWHFSKGYPEKVALLSR---GLS 2464
            :..|....||..|.|||.||..|:||......:|..::::|...||:....:...:::|   .:.
  Fly  2598 VACMNPTSGSFTINPRLQRHFCVLAVSFPGPESITVMYSSILAQHFANAEQKFTPIVTRMTPNIV 2662

  Fly  2465 EAMVSVYRDAIRSFLPTPAKSHYSFSLRDITRVFQGIVMVPPKRMPDPEKLGRLWAHETYRVFYD 2529
            .|.::::...::.||||..||||.|:||||:.||||::....:.:.....|.|||.|||.||:.|
  Fly  2663 AATIALHNKCLQVFLPTAIKSHYIFNLRDISNVFQGLLFSSTECLTGSTDLIRLWQHETQRVYSD 2727

  Fly  2530 RLVDQQDRDRLLVMAVDACKSNLRFPLEQAFGERIEPGEKLTDN---DLRNLFYGNYMEPDAEPK 2591
            :|.|.:|.|....|..|..|.:.               |::.::   |..|: |.::.....:||
  Fly  2728 KLTDDKDIDSFTKMQHDIVKKSF---------------EEIDESVIFDKPNI-YCHFAGGIGDPK 2776

  Fly  2592 FYD-EGDTYEKLEKLMKYYLREYNSFSSTPMDLVMFRFAIEHVSRVSRVLQMPRGNILMVGMGGS 2655
            :.. :|  :.:|.||::..:..||...:. |:||:|..|:.||.|::|:|:.|||:.|:||:|||
  Fly  2777 YMPIKG--WPELHKLLQEAMSSYNDLVAA-MNLVLFEDAMMHVCRINRILESPRGSALLVGVGGS 2838

  Fly  2656 GRRSSARLAAYIADCRLMTVQVSKSYTITDWRDDLKKILMSASFNLNHTVFLFSDAQATDEGYVE 2720
            |::|.|||||:|:...::.:|:.|.|.:.|.:::...:.:.|.......:||.:|||...|.::.
  Fly  2839 GKQSLARLAAFISSLEVVQIQLKKGYGVNDLKNEFSGLYLKAGLKNVGIMFLMTDAQIPSEDFLV 2903

  Fly  2721 DINGILNTGDLPNLYQLEDKATIMENMANVAKQLGKILDTLPSEVYAYYIDRIREQLHIALAFSP 2785
            .||.:|.||::|:|:..::...|:..:.|..|..| ::|| ....:.::|||:|:||.|.|.|||
  Fly  2904 LINDMLATGEIPDLFPDDEIENIIAGVRNEVKGAG-LVDT-RENCWKFFIDRVRKQLKIVLCFSP 2966

  Fly  2786 IGDSFKERIRVYPSLINCCTIDWYMPWPEEALSRVGVYFVSSMNLNRPHGEETQEPVQSKDAADP 2850
            :|.:.:.|.|.:|::||..:|:|:..||:|||..|.:.|::                |:|...:.
  Fly  2967 VGSTLRVRSRKFPAIINATSINWFHEWPQEALISVAMNFLA----------------QNKVLPEN 3015

  Fly  2851 DEEEVRRETVGVEREQTQLEADLVDCVMYFHQSVVDASEKCYLELNRR-NYVTPSAYLELLKAFR 2914
            ..:.|.:                  .:.|.|.| |:.:.|.||:..|| ||.||.:|||.:..:.
  Fly  3016 HRDSVAK------------------FMAYVHTS-VNTTSKVYLQNERRYNYTTPKSYLEQINLYI 3061

  Fly  2915 TFYTRKLDEITRLRDRYTTGLEKLDFAAGQVGEMQTNLYDLQPKLKVLSEETDRI--MVNIERET 2977
            .....|.:::....:|...|||||...|.||.:::..|...:.:||..:|..|.:  :|.||.|.
  Fly  3062 KLLNHKNEDLQSKIERLENGLEKLRSTALQVADLKVKLAVQEIELKEKNEAADALIEIVGIETEK 3126

  Fly  2978 AEAEKKKEVVGADEAAANEAAAAAQAIKD--DCETDLAEAIPAMEAALEALNTLKPADIFIVKSM 3040
            .:.||    ..|||.....|..|.:..|.  |||.||.:|.||:.||.:|||||..|::..:||.
  Fly  3127 VQTEK----AVADEEEMKVALIADEVSKKQRDCEEDLLKAEPALMAAQDALNTLNKANLTELKSF 3187

  Fly  3041 KNPPYGVKLTMEAVCVIRG----IKPDRKPDPSGHMVEDYW-GPSMRMLSDMKFLDSLKTFDKDN 3100
            .:||..|.....||.|:..    :..||.           | ...:.|.....|||||..:||:|
  Fly  3188 GSPPGAVTNVTAAVMVLLSQGGKVPKDRS-----------WKAAKIAMAKVDTFLDSLINYDKEN 3241

  Fly  3101 IPPPIIKRIREKYIADRDFVPEKIKAASMACEGICRWVRAMDVYDKVARIVMPKKAALAEAEGEL 3165
            |.|.|.|.| :.|:.|.:|.||.:::.|.|..|:|.||..:..:.:|...|.||:.|||.|..||
  Fly  3242 IHPEITKAI-QPYLKDPEFEPEFVRSKSGAAAGLCAWVINIIKFYEVYCDVEPKRKALAAANAEL 3305

  Fly  3166 SQQMEKLNAKRAELQVILDKLQKLNDFFAEKSREKKRLEDEIDNCEKKLNRAEKLLGGLGGEKTR 3230
            :...:||...:.::..:.::|.||...|.:.:.:|.|.:.|.|..:..:..|.:|:|||..|..|
  Fly  3306 AAAQDKLAGIKRKVMSLEEQLGKLTADFEKATADKLRCQQEADATQATIALANRLVGGLASENVR 3370

  Fly  3231 WSEAAKNLHESISNIVGDVLLAGGCTAYLGYFTTEYRVN-ILDDWNALCKR--KHIPSSETFSLA 3292
            |:||..|..:....:.||:||.....:|:|.||..:|:: :|..|....|.  ..||::|.....
  Fly  3371 WAEAVNNFVKQGITLPGDILLITAFISYVGCFTKGFRIDLLLKMWTPFLKSIDPPIPTTENLDPL 3435

  Fly  3293 TTLGHPMTIRAWSLAGLPADNFSVENGIIVTNSSRYSLLIDPQVQANKWIKNMEKNNNLKVIKQS 3357
            :.|....||..|:..|||:|..|:||..|::||.|:.|:||||:|..|||| .:...:||||:..
  Fly  3436 SLLTDDTTIAIWTNEGLPSDRMSIENATILSNSDRWPLMIDPQLQGVKWIK-QKYGEDLKVIRLG 3499

  Fly  3358 DANYMQVLELAITFGQPVLIENVGEKLDSNLTPILEKNVIKHKGGLFIKSGDQMIEYNPNFRLYI 3422
            ..:|:.::|.:|..|..|||||:.|.||..|..:|.:|:||.  |..||.||:.||||.||||.:
  Fly  3500 QRSYLDIIEKSINAGCNVLIENIDENLDPVLDSLLGRNLIKK--GKAIKIGDKEIEYNSNFRLIL 3562

  Fly  3423 TTCLRNPRYPPEVMVMVTVLNFMITEQGLREQLLAIVVAHERPDLQEKKEQLIIESARNRDALYT 3487
            .|.|.||.|.||:....|::||.:|..||.:||||.||..|||||:|.|..|..:....:..|..
  Fly  3563 HTKLANPHYKPEMQAQTTLINFTVTRDGLEDQLLAEVVKAERPDLEELKADLTKQQNDFKIMLKK 3627

  Fly  3488 IESKILEVLSTSEGNVLEDENAINILSSSKILSEDIQEKQVIAVATEIEIDAARQQYIPVSKHSA 3552
            :|..:|..||::..|:|.|...:..|.::|..:.:|::|...|..|..|||.||:.|.|.:..::
  Fly  3628 LEDDLLSRLSSAGENILGDTALVENLETTKSTASEIEQKVAEAKITSKEIDKAREYYRPAAARAS 3692

  Fly  3553 ILFFCISELANVDPMYQYSLSWFLNLFVNTILKAPKSDQLSERLKNLNDYFTKSIYTNVCRSLFE 3617
            :|:|.::||..::|:||:||..|..:|...|.||...|.|..|:.||.|..|.|::....|.|||
  Fly  3693 LLYFILNELNTINPIYQFSLKAFSVVFQKAIAKAEPGDTLDLRVSNLIDCITYSVFQYTSRGLFE 3757

  Fly  3618 KDKLVISLVMCLGILVSQGRVEKAALLFFLTGGIGYKTIPPNPLGAWLPDKSWASVCKAADLEGL 3682
            .|||:.:..|...||:....|..|.|.|.|...|  |....:|:. :|.::||..:|..|..:..
  Fly  3758 CDKLIFASQMTFQILLMNEEVTSAELDFLLRFPI--KPHVTSPVD-FLTNQSWGGICSLASKDEF 3819

  Fly  3683 KNLPQMMETYSDEWHNFYDASNPDQLQLPAPHNTVNDMYFLIVIKSLRPDKLVPAVRAFITRNLD 3747
            :||.:.:||.|..|....::..|::.:.|........:..|.:|::||||::..|:..||...|.
  Fly  3820 RNLDRDIETSSKRWKKLVESELPEKEKFPQEWKNKTALQRLCMIRALRPDRMTYALADFIEEKLG 3884

  Fly  3748 RSFVEPPPFDLAASFADSSPKIPLVFLLSAGSDPMASLFMFAKQRNM---YDKLKTISLGQGQGP 3809
            ..:||....:.|.|:.::||..|:.|:||.|.:|:..:....||...   ......:||||||..
  Fly  3885 SKYVESRAMEFAKSYEEASPSTPIFFILSPGVNPLKDVEALGKQMGFSMDLGNFHNVSLGQGQEA 3949

  Fly  3810 RAEKMIMEAARHGQWVVLQNCHVAISWMGDLERICNDTTLTDGANHDYRLWCTSYPSA-----VF 3869
            .||..:..||:||.||||||.|:...|:..||:...  ...:.::.|||::.::.|::     :.
  Fly  3950 IAEAAMDTAAKHGHWVVLQNIHLVRKWLPVLEKKLE--YYAEDSHPDYRMFLSAEPASTPSAHII 4012

  Fly  3870 PVSVLQNSVKMTNEPPKGLRANMHRSFTSDPLMRDKFFTNAFLFSDSANKCWLRGVFALVFFHAV 3934
            |..:|::|:|:|||||.|:.||:|::..:        ||...|........:...:|:|.:||||
  Fly  4013 PQGILESSIKITNEPPTGMLANLHKALDN--------FTQETLEMSGKEAEFKAILFSLCYFHAV 4069

  Fly  3935 VQERREFGPLGWNIPYEFNESDLKISLLQLKMFINQSQSIPFRGHVYLTGECNYGGRVTDDKDRR 3999
            |.|||:|||.|||..|.||..||.||:..|..::..:..:|:....||.||..|||.:|||.|||
  Fly  4070 VAERRKFGPQGWNKIYPFNVGDLNISVSVLYNYLEANAKVPWEDLRYLFGEIMYGGHITDDWDRR 4134

  Fly  4000 LILSLLNMIYNPNTIEEDNYALSQSGTYRVPLSPTRLNSIEYVSSFPLSPHPEVYGLHENADINR 4064
            |.::.|.....|:.::.:   |..:.::..|.:........||.....:..|.:||||.||:|  
  Fly  4135 LCITYLEEYMQPDLVDGE---LFLAPSFPAPPNTDYQGYHTYVDEMMPAESPYLYGLHPNAEI-- 4194

  Fly  4065 NVKETNALISGVLLTQTD-------LMASVKASSSGGA---KEDPAIAICKQVLKQLPEEFNIDE 4119
                      |.|.|:.:       .|....|.:.|||   :||....|..:::::||||||:.|
  Fly  4195 ----------GFLTTRAENIFRTVFEMQPRDAGAGGGATVTREDKVKQIVDEIIEKLPEEFNMVE 4249

  Fly  4120 V-----SKTYPVIYTNSMNTVLRQELIRFNRLLSYIRKSLVNVGKAVVGQIAMIPELERTHASMV 4179
            :     .:|..||       |..||..|.|.|.|.:::||..:...:.|::.:..::|....|:.
  Fly  4250 IMNKVEERTPYVI-------VAFQECERMNFLTSEMKRSLKELDLGLKGELTITSDMEVLENSLF 4307

  Fly  4180 IGKLPADWLKKSYPSLKPLGSYVSDLLARLAFFQEW-IDNGEPMVYWISGFYFTQSFITGVLQNY 4243
            :.::|..|.:::||||..|.::..||..||...:.| .|...|...|::||:..||.:|.::|:.
  Fly  4308 LDQVPPIWTQRAYPSLLGLNNWFIDLCLRLRELETWSTDFVLPSCVWLAGFFNPQSLLTAIMQST 4372

  Fly  4244 SRKNRFQIDMILIEFAVTKFEVQVPGT-PDIGAYIRGIFIEGARWNRKTKEVDESFSKVLFDTLP 4307
            :|:|...:|.:.::..|||.:.:...| |..|..:.|||:|||||:.:...:.||..|.|:.::|
  Fly  4373 ARRNDLPLDKMCLQCDVTKKQKEEFTTAPRDGCCVHGIFMEGARWDIQQGIIMESRLKELYPSMP 4437

  Fly  4308 VIYLRPVLKALEDLPRSTAGGEPETIYDCPVYKTSERRGVLSTTGHSTNFVMYLQLRCSRKPMHW 4372
            ||.:|.:.:..:||         ..:|:||||||..|        ..|.:|..|.|:...||..|
  Fly  4438 VINIRAITQDKQDL---------RNMYECPVYKTRTR--------GPTTYVSNLNLKTKDKPGKW 4485

  Fly  4373 INRGTACLCQ 4382
            |..|.|.|.|
  Fly  4486 ILAGVALLLQ 4495

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dnah3NP_647937.2 DHC_N2 1083..1489 CDD:462462 108/440 (25%)
DYN1 <1322..4005 CDD:227570 952/2739 (35%)
AAA_6 1620..1946 CDD:463697 171/325 (53%)
AAA_9 3302..3523 CDD:463702 93/220 (42%)
Dynein_C 4067..4381 CDD:465677 99/330 (30%)
Dhc93ABNP_001262793.1 DHC_N1 205..782 CDD:462457 118/649 (18%)
DHC_N2 1292..1707 CDD:462462 108/440 (25%)
DYN1 1305..4143 CDD:227570 1002/2996 (33%)
AAA_6 1841..2167 CDD:463697 171/325 (53%)
MT 3076..3419 CDD:463699 120/358 (34%)
Dynein_C 4198..4494 CDD:465677 97/319 (30%)

Return to query results.
Submit another query.