DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dnah3 and Dhc64C

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_647937.2 Gene:Dnah3 / 38586 FlyBaseID:FBgn0035581 Length:4385 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001261432.1 Gene:Dhc64C / 38580 FlyBaseID:FBgn0261797 Length:4661 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:4862 Identity:1208/4862 - (24%)
Similarity:2103/4862 - (43%) Gaps:952/4862 - (19%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    69 LQEKI--------SHMQTDKIVGHC---NREFDFHRYDLDNVKDEYDECDDDSLQELQLEDIIMP 122
            ||:.|        :|...:.::..|   ||:        ..|.|..|:.:|.|...|        
  Fly   196 LQQNIDIPEITLTAHQTVNNVIRKCAEENRK--------AKVADFGDKVEDSSFLNL-------- 244

  Fly   123 EQFEMLRDAKDHLYNFDSTACNQFPWIDKWMTGVRPSEQEIYEMTSHLLEIYCNRRVRIFYPGCG 187
                        |.|          .:::|:.       ||.::|.      .||.     ||.|
  Fly   245 ------------LQN----------GVNRWIA-------EIKKVTK------LNRD-----PGSG 269

  Fly   188 TS---SSLWTN--------QLRRQ------------HGSPSELIGAYRT---------------P 214
            |:   .|.|.|        |.:|:            ||.......::.|               |
  Fly   270 TALQEISFWLNLERALYRIQEKRESPEVALTLDILKHGKRFHATVSFDTDTGLKQALATVADYNP 334

  Fly   215 SARHMRVNNMRGPPKKEKFTAGDHYAFRTPQECRN---ELMRVGKIID----ELIEPVLKAAEHK 272
            ..:...:|::....:.||........|...::.||   .:.|..|:|:    :|.:.:||..   
  Fly   335 LMKDFPINDLLSATELEKIRPAVQQIFAHLRKVRNTKYPIQRCLKLIEAISRDLSQQLLKVL--- 396

  Fly   273 IGHGLTKYPDPP---------------SC----KDNTNRILRSAGILVGKKKNCY---VGKCRIH 315
               |..:....|               ||    .|....:||.   :|.||::.:   |.:....
  Fly   397 ---GTRRLMHIPFDEFERVMNQCFEIFSCWDDEYDKLQGLLRD---IVKKKRDEHLKMVWRVSPA 455

  Fly   316 RKDFATNEEFLRCLKRM-EATHFPYMQPLQPVDP----DDQKIKMLAKYRVELARAEKLFTLKIQ 375
            .|...|..|.:|..:|. |......::.|:|..|    |...::....|.::.|.|..:  .::.
  Fly   456 HKKLQTRMEHMRKFRRQHEQLRTVILRVLRPTKPAVGDDGNVVETKQPYSLDAADANAI--EEVN 518

  Fly   376 KRYQCLLKSMSIVQLATYPSHLIRKAFRRINPRSALLQDAYQFIVKEKRDWPKLPPEVILM---- 436
            ..|: .:|.:..:.:....|.....|.:|...:...::......::::....|...|:..:    
  Fly   519 LAYE-NVKEVDCLDITKEGSEAWEAAVKRYEEKIDRVETRITAHLRDQLGTAKNANEMFRIFSRF 582

  Fly   437 DYLFVGD--RGVRQDLAILIIVCLID----LQEDFRHYVKRSFLNYLLSSNMERRRLQLERE-PP 494
            :.|||..  ||..::....:|..:.|    |.|.|:       :.|..|.:.   ||...|: ||
  Fly   583 NALFVRPHIRGAIREYQTQLIQRVKDDIEALHEKFK-------VQYPQSKSC---RLSSVRDLPP 637

  Fly   495 EFPILTISPPVSWR----SNLLRGKARIGEVL---MTTHPTVQALNRLWHDLYEDLVVVDLGQ-- 550
                  ::..:.|.    :.|.....|:.:||   ..||...|.|..........|.:.|:..  
  Fly   638 ------VAGSIIWARQIDNQLTMYLKRVEDVLGKGWETHIEGQKLKADGDSFRAKLSISDVFHEW 696

  Fly   551 LLLAQRPLDADTVQVFIEKSC------ADVRDLLLNDWLPRCADLMNEMRGTWKDL---VPM--- 603
            ....|......|.::|..:|.      .:|..|.:| :||....|..|:|.. |:|   ||:   
  Fly   697 ARKVQERNFGSTGRIFTIESTRSRIGRGNVLRLRVN-FLPEIITLAKEVRNI-KNLGFRVPLTIV 759

  Fly   604 -----SGKYGGRAAMLFRCIHSAMSRHLNSLISKSI--NYLFKVLCAFKGGNRIEKYSMFDAKLK 661
                 :.:....|..|...:.: ..|.|..|.::|:  |.:||:                :.:..
  Fly   760 NKAHQANQIYPYAISLIESVRT-YERTLEKLNNRSLAQNSVFKI----------------EDRAS 807

  Fly   662 RIPLMTLIASVVGAHFDHEPINM---GPGVRPASNIYVYDEDDADPF---QQPQVNQFVENVPD- 719
            .:||      |.|...|  .:|:   |.|:       :::....||:   ....|.||.|.|.| 
  Fly   808 IVPL------VAGLRKD--VLNLVSEGIGL-------IWESYKLDPYVIRLSECVTQFQEKVDDL 857

  Fly   720 ----------------------------------IDDVA--QF------------ELDHSNKLYI 736
                                              :||::  |:            |::....|.:
  Fly   858 LVVEEQLDVDVRSLETCPYSAATFVEILSKIQHAVDDLSLRQYSNLSVWVTRLDEEVEKKLALRL 922

  Fly   737 YPYMQELPRIFTEHFKSI-LAVGYEIPRLEFVMSGGEPETKGFLHFI---DEDHVDFLELCEKVE 797
            ...:|......|.:.|.: .::..:.|.......||:|:.:..:|.|   ::....:..:.|...
  Fly   923 QAGIQAWTEALTGNKKEVDTSMDTDAPAQPTHKLGGDPQIQNAVHEIRITNQQMYLYPSIEEARF 987

  Fly   798 QIVK--VNWQGV---HVYLKPVYKYYFGLFQKLILPMVQKVWTENNLPE-------LGAVQELLK 850
            ||::  ..||.:   .|.|:.. :|..|| :|.:....:.:.|:  |||       .||::    
  Fly   988 QIMQQFFAWQAIVTSQVRLQST-RYQVGL-EKHVSQTYRNLLTK--LPEGKILENAYGAIE---- 1044

  Fly   851 KLQAVSDTTYYLRDFI-------------------PLNLFMLDNRHVKLSLRMY----VREIY-D 891
              |.||:...|:.:::                   .:||::.....:|.|...:    .|..| .
  Fly  1045 --QKVSEVRNYVDEWLRYQSLWDLQADMLYGRLGEDVNLWIKCLNDIKQSRTTFDTSDTRRAYGP 1107

  Fly   892 FIIDFYKAL--------NW-----------------------NENRAICEELEEMSMKAGERPEE 925
            .|||:.|..        :|                       :::|.   :||..|::|....:.
  Fly  1108 IIIDYAKVQAKVTLKYDSWHKEALGKFGTLLGTEMTSFHSKVSKSRT---DLEMQSIEAASTSDA 1169

  Fly   926 TPEVVALQNYINDC----REMRIFAIKDEIKNVLKRVVFLLTHTYLSSDELHLNSRTFILPGELE 986
            ...:..:|:...|.    :::.:|.   |.:.:|:|..|...:|:|..|.:.         ||  
  Fly  1170 VSFITYVQSLKKDMIAWDKQVEVFR---EAQRILERQRFQFPNTWLHVDNIE---------GE-- 1220

  Fly   987 EVLDLSAARLAVVRDNLELALRERRMEFEKLLAQEK----RTMD-----------GFRIREIRDV 1036
                .||....:.|.:..:..:...:: .|::|::|    ||:|           |.:||....:
  Fly  1221 ----WSAFNEIIKRKDTAIQTQVASLQ-AKIVAEDKAVETRTVDFLNDWEKTKPTGGKIRPDDAL 1280

  Fly  1037 LTLE-------ELKERVDTV-------DLLFTTIENLSREAKAINTEETLLQIDVSAFPLLAEII 1087
            ..|:       .|||..|.|       :|..:.:.|.|.|...:..||            |.::.
  Fly  1281 QQLQIFESKYSRLKEERDNVVKAKEALELQESAVPNNSAERMNVALEE------------LQDLR 1333

  Fly  1088 EKMEPIEKLWKTSYEF-EKDYLIWMFERFECLNADGVREQVENMHKIMYKLSRQL----AYNPVA 1147
            .....:.|:|....|. ||.:|        .:....:|:|:|.|...:.:|..:|    :|..|.
  Fly  1334 GVWSELSKVWTQIDETREKPWL--------SVQPRKLRQQLEAMMAQLKELPARLRMYESYEYVK 1390

  Fly  1148 KRAAEQMRMKIEKFRVYLPVLDSICRHGLEKRHWDQISKILGRKVNPKLFP-TLKDMIDVDIMSI 1211
            |..  |..:|:....|.|.      ...|::|||.|::|.|  :||..|.. :|..:.||::...
  Fly  1391 KLI--QSYIKVNMLIVELK------SDALKERHWKQLTKQL--RVNWVLSDLSLGQVWDVNLQKN 1445

  Fly  1212 LPQLEEIANAAGKEYDLNNGLRIMQADWRDVMFEVLQYRDSDTHILASLDDIQTLLDDHIMRTQA 1276
            ...:::|...|..|..|...|:.::..|::...:::.|::. ..|:...||:...:.:||....|
  Fly  1446 EGIVKDIILVAQGEMALEEFLKQVRESWQNYELDLINYQNK-CRIIRGWDDLFNKVKEHINSVAA 1509

  Fly  1277 MKRSPFITALGSKADDWEARLLLIQNIIDAWTQVQITWMYLEPIFS-SEDIMRQMPLEGRNFKAV 1340
            ||.||:......:|..||.:|..|..:.|.|..||..|:|||.||| |.||...:|:|...|:::
  Fly  1510 MKLSPYYKVFEEEALTWEEKLNRINALFDVWIDVQRRWVYLEGIFSGSADIKTLLPVETSRFQSI 1574

  Fly  1341 DKLWRKIMKHTLKDRHVMAATEYPEMLEVFTKAIEDLETVTKGLNTYLEQKRLFFARFFFLSNDE 1405
            ...:..:||...|...||.....|.:.....:..:.|..:.|.|..|||::|..|.||:|:.:::
  Fly  1575 SSEFLGLMKKVTKSPKVMDVLNIPAVQRSLERLADLLGKIQKALGEYLERERTSFPRFYFVGDED 1639

  Fly  1406 LLEILSETKDPMRVQPHLRKCFEGIGSLTF-DDNMEIVEMVSDEEERVALVRKINPQLANGLVEM 1469
            ||||:..:|:..|:|.|.:|.|.|:.::.. ::|..|:.:.|.|.|.|..:..:: .:.:..:..
  Fly  1640 LLEIIGNSKNIARLQKHFKKMFAGVAAILLNEENNVILGISSREGEEVHFMNPVS-TVEHPKINE 1703

  Fly  1470 WLKEVEMVMLDSVKEQMREAWEDYAMVE--------RISWVVSWPGQVVQGISCMAWTYEVEEAI 1526
            ||..||..|..::...:.:|.:|.....        .:.|...:..|:|...:.:.|:.:||.|:
  Fly  1704 WLSLVEKQMRFTLASLLAQAVQDIKQFRDGKIDPQAYMEWCDKYQAQIVVLAAQILWSEDVESAL 1768

  Fly  1527 E-----TKELPAYLEKSNLQ-----IADLVQLVRTDLQAGVRIAVEALIVLDVHDRDVVKYLTDC 1581
            :     .:..|......|::     :||.|...:..|:   |..:|.||...||.|.|.:.|.:.
  Fly  1769 QQASENNQSKPMQRVLGNVESTLNVLADSVLQEQPPLR---RRKLEHLINEFVHKRTVTRRLLNN 1830

  Fly  1582 RITNIQDFDWISQLRYYWKVNEKNE-DWVCVSMVVTDVEYGMEYLGNLPRLVVTPLTDRCYRTLM 1645
            .:|:.:.|.|:.::|:|:...:... ..:.:.|......||.||||...|||.||||||||.|:.
  Fly  1831 GVTSPKSFQWLCEMRFYFDPRQTEVLQQLTIHMANARFFYGFEYLGVQDRLVQTPLTDRCYLTMT 1895

  Fly  1646 GALKLCLGGAPEGPAGTGKTETCKDLAKAVAKKCVVFNCSDGLDYKALGKFFKGLAQSGAWACFD 1710
            .||:..|||:|.|||||||||:.|.|...:.:..:||||.:..|::|:|:.|.||.|.|||.|||
  Fly  1896 QALESRLGGSPFGPAGTGKTESVKALGNQLGRFVLVFNCDETFDFQAMGRIFVGLCQVGAWGCFD 1960

  Fly  1711 EFNRIELEVLSVVAQQILTIQRAI------GRKVVKFFFEDTMLKLDPTCSIFITMNPGYAGRTE 1769
            ||||:|..:||..:|||.|||.|:      .::.:........:::.|..:||||||||||||:.
  Fly  1961 EFNRLEERMLSACSQQIQTIQEALKYEMDSNKESITVELVGKQVRVSPDMAIFITMNPGYAGRSN 2025

  Fly  1770 LPDNLKVLFRTVAMMVPDYAMIGEITLYSNGFDMARNLSQKIVQAYKLCSEQLSSQSHYDYGMRA 1834
            ||||||.|||::||..||..:|.|:.|:|.||..|..|:.|||..:|||.||||:|||||:|:||
  Fly  2026 LPDNLKKLFRSLAMTTPDRQLIAEVMLFSQGFRSAEKLACKIVPFFKLCDEQLSNQSHYDFGLRA 2090

  Fly  1835 VKSVLLASASLRR----------------------LYVDLPEPEIVLRAIVDVNLPKFLEQDISL 1877
            :||||:::.:::|                      :..:|||.||:::::.:..:||.:.:||.|
  Fly  2091 LKSVLISAGNVKRDRIMKIKEQMKQRGDENIDEASVAENLPEQEILIQSVCETMVPKLVAEDIPL 2155

  Fly  1878 FIGIYMDLFPGV------------ELPMPQRGDIL----------KWLHINLADRNLQATPWYLE 1920
            ...:..|:||.|            |:....:.|.|          .|:     ::.|.:|  :::
  Fly  2156 LFSLLSDVFPNVGYTRAEMKGLKEEIRKVCQEDYLVCGEGDEQGAAWM-----EKGLGST--WVD 2213

  Fly  1921 KILQIYEMLLVRHGLMIVGGSMGGKTTAYQVLAQTLRNVSTDEEATLKEFPVTFRIINPKAITMG 1985
            |:||:|::..:.||||:||.|..||:||::.|.:.|......|...        .:|:||||:..
  Fly  2214 KVLQLYQISNLNHGLMMVGPSGSGKSTAWKTLLKALERFEGVEGVA--------HVIDPKAISKE 2270

  Fly  1986 QLYGRFDPVSHEWYDGVLAKTFREQVQGPKGE---RAWVMFDGPVDAVWIENLNTVLDDNKKLCL 2047
            .|||..||.:.||.||:.....|:.:...:||   |.|::|||.||..|:||||:||||||.|.|
  Fly  2271 ALYGVLDPNTREWTDGLFTHILRKIIDNVRGEINKRQWIIFDGDVDPEWVENLNSVLDDNKLLTL 2335

  Fly  2048 MSGEIMQMTKLMNMMFEPADLEQASPATVSRCGMIYMEPSQLGWRALHKSFINVLVNKVGL--GD 2110
            .:||.:.:...:.:|||..||:.|:.||||||||::.....|....:.:::::.| ..:.|  ||
  Fly  2336 PNGERLSLPPNVRVMFEVQDLKFATLATVSRCGMVWFSEDVLSTEMIFENYLSRL-RSIPLEDGD 2399

  Fly  2111 IYMTLFEDMTEWLVPA-----------------ALEFLP----------------------QCKQ 2136
                  ||....:.||                 ||..||                      ...:
  Fly  2400 ------EDFVGVIKPAKDKEEEVSPSLQVQRDIALLLLPFFSADGIVVRTLEYAMDQEHIMDFTR 2458

  Fly  2137 MLELSPIY-QYQTFSRFFLHFLEKHKQFN------QAWFQQMFLFCFAWAYCSALTGQGQKTFDA 2194
            :..||.:: .....:|..|.|..:|..|.      :.:..:..::...|::..          ||
  Fly  2459 LRALSSLFSMLNQAARNVLTFNAQHPDFPCSADQLEHYIPKALVYSVLWSFAG----------DA 2513

  Fly  2195 LLR-KVIYG----SNENFPKPKYFSLNRGQMFPEKLLFLDYRFDEAENWWTWQKSDDSASTTSNF 2254
            .|: ::..|    |....|.|......          .:||..:.:.:|..|         ::..
  Fly  2514 KLKVRIDLGDFVRSVTTVPLPGAAGAP----------IIDYEVNMSGDWVPW---------SNKV 2559

  Fly  2255 P----ENAQIS--ELIVPTKET----GYISYWQEFCISKSYAMLVVGPTGTGKSAIITSNLLAMP 2309
            |    |..:::  :::|||.:|    ..:..|    :::...:::.||.|:||:..:.|.|.|:|
  Fly  2560 PVIEVETHKVASPDIVVPTLDTVRHESLLYTW----LAEHKPLVLCGPPGSGKTMTLFSALRALP 2620

  Fly  2310 KFANLVNVINFSARTSAQMVQDTIMSKLDRRRKG---VFGP-SLGKKCTVFCDDVAMPSKDTYGS 2370
            ...  |..:|||:.|:.:::..|.....:.|:..   |..| .:||...:|||::.:|..|:||:
  Fly  2621 DME--VVGLNFSSATTPELLLKTFDHYCEYRKTPNGVVLSPVQIGKWLVLFCDEINLPDMDSYGT 2683

  Fly  2371 QAPLELLRTWLDH-GYW--SDLVDTTKIELVDMTLMCAMGTLGGSNFIFPRLYRHMFVVAVDSFE 2432
            |..:..||..::| |::  ||.. ...:|.:.....|...|..|...:..|..||:.::.||...
  Fly  2684 QRVISFLRQLVEHKGFYRASDQA-WVSLERIQFVGACNPPTDPGRKPLSHRFLRHVPIIYVDYPG 2747

  Fly  2433 DSTIVRIFTTIGDWHFS----------KGYPEKVALLSRGLSEAMVSVYRDAIRSFLPTPAKSHY 2487
            ::::.:|:.|     ||          :||.|.       |:.|||..|. |.:.......:.||
  Fly  2748 ETSLKQIYGT-----FSRAMLRLMPALRGYAEP-------LTNAMVEFYL-ASQDRFTQDMQPHY 2799

  Fly  2488 SFSLRDITRVFQGI--VMVPPKRMPDPEKLGRLWAHETYRVFYDRLVDQQDRDRLLVMAVDACKS 2550
            .:|.|::||..:||  .:.|...:| .|.|.||||||..|:|.|||||..:|             
  Fly  2800 VYSPREMTRWVRGICEAIRPLDSLP-VEGLVRLWAHEALRLFQDRLVDDSER------------- 2850

  Fly  2551 NLRFPLE--QAFGERIEPGEKLTDNDLRNLFYGNYMEPDAEPKFYDEGDTYEKLEKLMKYYLREY 2613
              |:..|  ...|::..||....:...|.:.|.|::..|..|         ...|:|.:|.....
  Fly  2851 --RWTNENIDLVGQKHFPGINQEEALQRPILYSNWLSKDYMP---------VNREELREYVHARL 2904

  Fly  2614 NSFSSTPMD--LVMFRFAIEHVSRVSRVLQMPRGNILMVGMGGSGRRSSARLAAYIADCRLMTVQ 2676
            ..|....:|  ||:|...::||.|:.|:.:.|:|::|::|:.|:|:.:.:|..|::....:..::
  Fly  2905 KVFYEEELDVPLVLFDEVLDHVLRIDRIFRQPQGHLLLIGVSGAGKTTLSRFVAWMNGLSIFQIK 2969

  Fly  2677 VSKSYTITDWRDDLKKILMSASFNLNHTVFLFSDAQATDEGYVEDINGILNTGDLPNLYQLEDKA 2741
            |...||..|:.:||:.:|..:........|:..::...|.|::|.:|.:|..|::|.|::.::..
  Fly  2970 VHNKYTSEDFDEDLRCVLRRSGCKDEKIAFILDESNVLDSGFLERMNTLLANGEVPGLFEGDEYT 3034

  Fly  2742 TIMENMANVAKQLGKILDTLPSEVYAYYIDRIREQLHIALAFSPIGDSFKERIRVYPSLINCCTI 2806
            |:|......|::.|.:||: ..|:|.::..::...||:....:|..|..|:|....|:|.|.|.:
  Fly  3035 TLMTQCKEGAQREGLMLDS-SDELYKWFTQQVMRNLHVVFTMNPSTDGLKDRAATSPALFNRCVL 3098

  Fly  2807 DWYMPWPEEALSRVGVYFVSSMNLNRP--HGEETQEPVQSKDAADPDEEEVRRETVGVEREQTQL 2869
            :|:..|.:.||.:||..|.:.::|.:|  |..:....|.....|:|                |..
  Fly  3099 NWFGDWSDSALFQVGKEFTTRVDLEKPNWHAPDFFPSVCPLVPANP----------------THR 3147

  Fly  2870 EADLVDCVMYFHQSVVDASEKCYLELNRRNYVTPSAYLELLKAFRTFYTRKLDEITRLRDRYTTG 2934
            :|.:..|| |.||::..|:.:......|...|||..||:.:..|...|..|..::...:.....|
  Fly  3148 DAVINSCV-YVHQTLHQANARLAKRGGRTMAVTPRHYLDFIHHFVKLYNEKRSDLEEQQLHLNVG 3211

  Fly  2935 LEKLDFAAGQVGEMQTNLYDLQPKLKVLSEETDRIMVNIERETAEAEKKKEVVGADEAAANEAAA 2999
            |.|:.....||.|||.:|...:.:|:..:|..:..:..:.::..||||||  :.:.|.   :...
  Fly  3212 LNKIAETVEQVEEMQKSLAVKKQELQAKNEAANAKLKQMFQDQQEAEKKK--IQSQEI---QIRL 3271

  Fly  3000 AAQAIKDD-----CETDLAEAIPAMEAALEALNTLKPADIFIVKSMKNPPYGVKLTMEAVCVIRG 3059
            |.|.:|.:     ...|||:..||:..|..|:.:::...:..|::|.|||..|||.:|::|::.|
  Fly  3272 ADQTVKIEEKRKYVMADLAQVEPAVIDAQAAVKSIRKQQLVEVRTMANPPSVVKLALESICLLLG 3336

  Fly  3060 IKPDRKPDPSGHMVEDYWGPSMRMLSDMKFLDSL-KTFDKDNIPPPIIKRIREKYIADRDFVPEK 3123
               :...|         |.....::....|::|: ..|..:||...:.::::.||:::.|:..||
  Fly  3337 ---ENATD---------WKSIRAVIMRENFINSIVSNFGTENITDDVREKMKSKYLSNPDYNFEK 3389

  Fly  3124 IKAASMACEGICRWVRAMDVYDKVARIVMPKKAALAEAEGELSQQMEKLNAKRAELQVILDKLQK 3188
            :..|||||..:.:|..|...|..:.:.|.|    |.|....|.:|.:...|...|.:.::::|::
  Fly  3390 VNRASMACGPMVKWAIAQIEYADMLKRVEP----LREELRSLEEQADVNLASAKETKDLVEQLER 3450

  Fly  3189 ----LNDFFAEKSREKKRLEDEIDNCEKKLNRAEKLLGGLGGEKTRWSEAAKNLHESISNIVGDV 3249
                ..:.:|:...:.:.::.:::|.:.|::|:..||..|..|:.||...::.....:|.|:|||
  Fly  3451 SIAAYKEEYAQLISQAQAIKTDLENVQAKVDRSIALLKSLNIERERWESTSETFKSQMSTIIGDV 3515

  Fly  3250 LLAGGCTAYLGYFTTEYRVNILDDWNALCKRKHIPSSETFSLATTLGHPMTIRAWSLAGLPADNF 3314
            ||:....||.|||...||:|:...|:...:...|......:....|.:|.....|....||.|:.
  Fly  3516 LLSAAFIAYGGYFDQHYRLNLFTTWSQHLQAASIQYRADIARTEYLSNPDERLRWQANALPTDDL 3580

  Fly  3315 SVENGIIVTNSSRYSLLIDPQVQANKWIKNMEKNNNLKVIKQS--DANYMQVLELAITFGQPVLI 3377
            ..||.|::...:||.|:|||..||..::.|  :....|:.|.|  |.::.:.||.|:.||.|:|:
  Fly  3581 CTENAIMLKRFNRYPLIIDPSGQATTFLLN--EYAGKKITKTSFLDDSFRKNLESALRFGNPLLV 3643

  Fly  3378 ENVGEKLDSNLTPILEKNVIKHKGGLFIKSGDQMIEYNPNFRLYITTCLRNP--RYPPEVMVMVT 3440
            ::| |..|..|.|:|.:.:.:..|.:.|..|||.|:.:|:|.::::|  |:|  .:||::...||
  Fly  3644 QDV-ENYDPILNPVLNRELRRTGGRVLITLGDQDIDLSPSFVIFLST--RDPTVEFPPDICSRVT 3705

  Fly  3441 VLNFMITEQGLREQLLAIVVAHERPDLQEKKEQLIIESARNRDALYTIESKILEVLSTSEGNVLE 3505
            .:||.:|...|:.|.|..|:..||||:.||:..|:......|..|..:|..:|:.|:.::|.:|:
  Fly  3706 FVNFTVTRSSLQSQCLNQVLKAERPDIDEKRSDLLKLQGEFRLRLRQLEKSLLQALNDAKGKILD 3770

  Fly  3506 DENAINILSSSKILSEDIQEK-----QVIAVATEIEIDAARQQYIPVSKHSAILFFCISELANVD 3565
            |::.|..|.:.|..:.||.:|     :|||     ||:...|||:|:|...:.::|.:..|..|.
  Fly  3771 DDSVITTLETLKKEAYDINQKVDETDKVIA-----EIETVSQQYLPLSVACSNIYFTMDSLNQVH 3830

  Fly  3566 PMYQYSLSWFLNLFVNTILKAPKSD---QLSERLKNLNDYFTKSIYTNVCRSLFEKDKLVISLVM 3627
            .:|||||..||::|...:...||.:   ..||||..:.....:..|..|.|.:...|:|..:|:|
  Fly  3831 FLYQYSLKMFLDIFSTVLYNNPKLEGRTDHSERLGIVTRDLFQVCYERVARGMIHIDRLTFALLM 3895

  Fly  3628 CLGIL--VSQGRVEKAALLFFLTGGIGYKTIPPNPLGAWLPDKSWASVCKAA--------DLEGL 3682
            |...|  .|:..:: |...|||....|....|....|  |..:...||.:.|        .||.:
  Fly  3896 CKIHLKGTSESNLD-AEFNFFLRSREGLLANPTPVEG--LSAEQIESVNRLALRLPIFRKLLEKV 3957

  Fly  3683 KNLPQMMETYSDEWHNFYDASNPDQL------QLPAPHNTVNDMYFLIVIKSLRPDKLVPAVRAF 3741
            :::|::     ..|   ...|:|:|:      :..|.....:.::.|::|::.|||:::.|....
  Fly  3958 RSIPEL-----GAW---LQQSSPEQVVPQLWDESKALSPIASSVHQLLLIQAFRPDRVIAAAHNV 4014

  Fly  3742 ITRNLDRSFVEPPPFDLAASFADSSPK-----IPLVFLLSAGSDPMASLFMFAKQRNMYDKLKTI 3801
            :...|...|:  |..:....|.....|     .|.:.....|.|....:...|.::|  .::.:|
  Fly  4015 VNTVLGEDFM--PNAEQELDFTSVVDKQLNCNTPALLCSVPGFDASGRVDDLAAEQN--KQISSI 4075

  Fly  3802 SLGQGQG-PRAEKMIMEAARHGQWVVLQNCHVAISWMGDLERICNDTTLTDGANHDYRLWCTSYP 3865
            ::|..:| .:||:.|..|.:.|:||:|:|.|:|..|:..||:..:......|    :||:.|...
  Fly  4076 AIGSAEGFNQAERAINMACKTGRWVLLKNVHLAPQWLVQLEKKMHSLQPHSG----FRLFLTMEI 4136

  Fly  3866 SAVFPVSVLQNSVKMTNEPPKGLRANMHRSFTSDPLMRDKFFTNAFLFSDSANKCWLRGVFALVF 3930
            :...||::|:.......|||.|:|||:.|:|::.|..|        :....:.:.  |..|.|.:
  Fly  4137 NPKVPVNLLRAGRIFVFEPPPGIRANLLRTFSTVPAAR--------MMKTPSERA--RLYFLLAW 4191

  Fly  3931 FHAVVQERREFGPLGWNIPYEFNESDLKISLLQLKMFINQS---------QSIPFRGHVYLTGEC 3986
            |||:||||..:.||||...||||||||:::...|..:|:.:         :.:|:...|.|..:.
  Fly  4192 FHAIVQERLRYVPLGWAKKYEFNESDLRVACDTLDTWIDTTAMGRTNLPPEKVPWDALVTLLSQS 4256

  Fly  3987 NYGGRVTDDKDRRLILSLLNMIYNPNTIEEDNYAL-----SQSGTYR---VPLSPTRLNSIEYVS 4043
            .|||::.:|.|:||:.|.|..::...:.|.| :||     ..||..|   :|....|.:.::::.
  Fly  4257 IYGGKIDNDFDQRLLTSFLKKLFTARSFEAD-FALVANVDGASGGLRHITMPDGTRRDHFLKWIE 4320

  Fly  4044 SFPLSPHPEVYGLHENADINRNVKETNALISGVLLTQ-----TDLMASVK---ASSSGGAKEDPA 4100
            :......|...||..||:..........|:|.:|..|     .:|..||:   ..|:.|..||..
  Fly  4321 NLTDRQTPSWLGLPNNAEKVLLTTRGTDLVSKLLKMQQLEDDDELAYSVEDQSEQSAVGRGEDGR 4385

  Fly  4101 IAICKQV-------LKQLPEEFNIDEVSKTYPVIYTNSMNTVLRQELIRFNRLLSYIRKSLVNVG 4158
            .:..|.:       |:.||:  |:..:.:|...| .:.:.....:|:...:|||..:...|.:|.
  Fly  4386 PSWMKTLHNSATAWLELLPK--NLQVLKRTVENI-KDPLYRYFEREVTSGSRLLQTVILDLQDVV 4447

  Fly  4159 KAVVGQIAMIPELERT--HASM----VIGKLPADWLKKSYPSLKPLGSYVSDLLARLAFFQEWID 4217
            ....|      |.::|  |.||    |.|.:|..|.:.:.|:...:..:::|...|:...|:...
  Fly  4448 LICQG------EKKQTNHHRSMLSELVRGIIPKGWKRYTVPAGCTVIQWITDFSNRVQQLQKVSQ 4506

  Fly  4218 ----------NGEPMVYWISGFYFTQSFITGVLQNYSRKNRFQIDMILIEFAVTKFEVQVPGTPD 4272
                      .|.|:  |:.|....:::||...|..::.|.:.::.:.::..:|          |
  Fly  4507 LVSQAGAKELQGFPV--WLGGLLNPEAYITATRQCVAQANSWSLEELALDVTIT----------D 4559

  Fly  4273 IGAY---------IRGIFIEGARWNRKTKEVDESFSKVLFDTLPVIYLRPVLKALEDLPRSTAGG 4328
            .|..         :.|:.::||:.  |..|:..: |.::.| |||..|:.:..:.|  ||.:.  
  Fly  4560 AGLKNDQKDCCFGVTGLKLQGAQC--KNNELLLA-STIMMD-LPVTILKWIKISSE--PRISK-- 4616

  Fly  4329 EPETIYDCPVYKTSERRGVLSTTGHSTNFVMYLQLRCSRKPMHWINRGTACL 4380
                 ...|||..|.|..:|        |.:.|.:...::...:..||.|.|
  Fly  4617 -----LTLPVYLNSTRTELL--------FTVDLAVAAGQESHSFYERGVAVL 4655

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dnah3NP_647937.2 DHC_N2 1083..1489 CDD:462462 111/413 (27%)
DYN1 <1322..4005 CDD:227570 820/2897 (28%)
AAA_6 1620..1946 CDD:463697 155/375 (41%)
AAA_9 3302..3523 CDD:463702 73/224 (33%)
Dynein_C 4067..4381 CDD:465677 75/354 (21%)
Dhc64CNP_001261432.1 DHC_N1 242..839 CDD:462457 127/706 (18%)
DYN1 1022..4338 CDD:227570 961/3555 (27%)
Dynein_C 4343..4656 CDD:465677 75/355 (21%)

Return to query results.
Submit another query.