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Protein Alignment Dnah3 and dync1h1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_647937.2 Gene:Dnah3 / 38586 FlyBaseID:FBgn0035581 Length:4385 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001036210.2 Gene:dync1h1 / 335110 ZFINID:ZDB-GENE-030131-7050 Length:4642 Species:Danio rerio


Alignment Length:4871 Identity:1194/4871 - (24%)
Similarity:2109/4871 - (43%) Gaps:901/4871 - (18%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MQKKVAPERRPYCDPRLQDDKLRRKRTLHLPRVS------------QAQKKGEKRQLNDC----- 48
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Zfish   181 VEKKIA---------ELEMGLLHLQQNIEIPEISLLIHPIISNVAKQCYERGEKPKVTDFGDKVE 236

  Fly    49 --PFYN-LTYGFD----------QLPLDPVKEFLQEKISH--------------------MQTDK 80
              .|.| |..|.:          :|..||......::||.                    :.|..
Zfish   237 DPTFLNQLQSGVNRWIREIQKVTKLDRDPASGTALQEISFWLNLERALNRIQEKRESPEVLLTLD 301

  Fly    81 IVGHCNREFDFH---RYDLD-NVKDEYDECDDDS--LQELQLEDIIMPEQFEMLRDAK----DHL 135
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Zfish   302 ILKHGKR---FHATVSFDTDTGLKQAVETVNDYNPLMKDFPLNDLLSATELDKIRQALVAIFTHL 363

  Fly   136 YNFDSTACNQFPWIDKWMTGVRPSEQEIYEMTSHLLEIYCNRR-VRIFYP-------GCGTSSSL 192
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Zfish   364 RKIRNT---KYP-IQR---ALRLVEAISRDLSSQLLKVLGTRKLMHVAYEEFEKVMVACFEVFQT 421

  Fly   193 WTNQLRRQHGSPSELIGAYRTPSARHMRVNNM----RGPPKKEKFTAG-DHY-AFRTPQECRNEL 251
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Zfish   422 WEDEYEKLQVLLRDIV--------KRKREENLKMVWRLSPAHRKLQARLDHMRRFRRQHE----- 473

  Fly   252 MRVGKIIDELIEPVLKA------------AEHKIGHGLTKYPDPPSCK------DNTNRILRSAG 298
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Zfish   474 -QLRAVIVRVLRPQVSAVPQHAQGESAEPADLKVAEVLFDAADANAIEEVNLAYENVKEV---DG 534

  Fly   299 ILVGKKKNCYVGKCRIHRKDFATNEEFLRCLKRMEATHFPYMQPLQPVDPDDQKIKMLAKYRVEL 363
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Zfish   535 LDVSKEG-----------------------MEAWEAAMKRYDERIDRVE-----TRITARLRDQL 571

  Fly   364 A---RAEKLFTLKIQKRYQCLLKSMSI-VQLATYPSHLIRKAFRRINPRSALLQDAYQFIVKEK- 423
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Zfish   572 GTAKNANEMF--RIFSRFNALFVRPHIRGAIREYQTQLI----QRVKDDIESLHDKFKVQYPQSQ 630

  Fly   424 -------RDWPKLPPEVILMDYLFVGDRGVRQDLAILIIVCLIDLQEDFRHYVKRSFLNYLLSSN 481
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Zfish   631 SCKMSHVRDLPPVSGSII----------WAKQ----------IDRQ--LTAYMKR--VEDVLGKG 671

  Fly   482 MER--RRLQLEREPPEFPILTISPPV--SW-----RSNL-----------LRGKARIGEVL---M 523
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Zfish   672 WENHVEGLKLKQDGDSFRAKLNTQEIFDDWARKVQQRNLGVSGRIFTIENTRARGRTGTVLKLKV 736

  Fly   524 TTHPTVQAL-----NRLWHDLYEDLVVVDLGQLLLAQRPLD---ADTVQVFIEKSCADVRDLL-- 578
            ...|.:..|     |..|......|.:|:.........|..   .::|:.: |::|..|.:.:  
Zfish   737 NFLPEIITLSKEVRNLKWLSFRVPLAIVNKAHQANQLYPFAISLIESVRTY-ERTCEKVEERVSI 800

  Fly   579 ---------------------------LNDWLPRCADLMNEMRGTWKDLVPMSGKYGGRAAMLFR 616
                                       |:.::.|.|:.:...:....||:.:..|.......|..
Zfish   801 SLLVAGLKKEVQALITEGISLVWESYKLDPYVQRLAETVFNFQEKVDDLLLIEEKIDLEVRSLET 865

  Fly   617 CI--HSAMSRHLNSLISKSINYLFKVLCAFKGGNRIEKYSMFDAKLKRIPLMTLIASVVGAHFDH 679
            |:  |...:..||. |.|:::.|           .:..||.....:.::.:.  |..::|     
Zfish   866 CMYEHKMFTEILNR-IQKAVDDL-----------NLHSYSNLPIWVNKLDIE--IERILG----- 911

  Fly   680 EPINMGPGVRPASNI---YVYDEDDAD-PFQQPQVNQFVENVPDIDDVAQFELDHSNK-LYIYPY 739
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Zfish   912 --VRLQAGLKAWTQVLRGQMEDKADVDMDTEAPQVSHKPGGEPRIKNIIH-ELRITNQVIYLNPP 973

  Fly   740 MQE------------------LPRIFTEHFKSILAVGYEIPRLEFVMSGGEPETKGFLHFIDEDH 786
            :::                  ||||.::.::  :.|.||:          ..|.|.:.:.:.. .
Zfish   974 IEDCRYRLYQEMFAWKMNILSLPRIQSQRYQ--VGVHYEL----------SEEEKFYRNALTR-M 1025

  Fly   787 VDFLELCEKVEQIVKVNWQGVHVYLKPVYKYYFGLFQKLILPMVQKVW----------TENNLPE 841
            .|.....|:....||.|...|..|:|...:|             |.:|          .|.:|.:
Zfish  1026 PDGPSALEEAYNAVKENVSEVEQYVKVWLQY-------------QCLWDMQPENIYNRLEEDLNK 1077

  Fly   842 LGAVQELLKKLQAVSDTTYYLRDFIP-----------LNLFMLDNRHVKLSLRMYVREIYDFIID 895
            ..|:...::|.:...|.....::|.|           :|| ..|:.| |..|..:.:.:.:.:.|
Zfish  1078 WQALLVQIRKARGTFDNAETRKEFGPVIIDYGKVQSKVNL-KYDSWH-KEVLSRFGQMLGNNMQD 1140

  Fly   896 FYKALNWNENRAICEELEEMSMKAGERPEETPEVVALQNYINDCREMRIFAIKDEIKNVLKRVVF 960
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Zfish  1141 FHSQISKSR-----QELEQHSVDTA----STSDAVTFITYVQ--------TLKRKIKQFEKQV-- 1186

  Fly   961 LLTHTYLSSDELHLNSRTFILP----------GELEEVLDLSAARLAVVRD---NLELAL-RERR 1011
               ..:.:...| |..:.|..|          ||.....|:...:...::.   ||::.: :|.|
Zfish  1187 ---DLFRNGQRL-LEKQRFQFPPSWLYIDNIEGEWGAFSDIMKRKDTAIQQQVANLQMKIVQEDR 1247

  Fly  1012 MEFEKLLAQEKRTMD-------------GFRIREIRDVLTL------------EELKERVDTVDL 1051
                   |.|.||.|             ..|..|....||:            |:..:..:.::|
Zfish  1248 -------AVENRTTDLLADWEKTKPVAGSLRPEEALQSLTIYEGKFGRLKDDREKCAKAKEALEL 1305

  Fly  1052 LFTTIENLSREAKAINTEETLLQIDVSAFPLLAEIIEKMEPIEKLWKTSYEFEKDYLIWMFERFE 1116
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Zfish  1306 TDTGLPSSSEERVQVALEE------------LQDLKGVWSELSKVWEQIDQMKEQPWVSVQPRKL 1358

  Fly  1117 CLNADGVREQVENMHKIMYKLSRQLAYNPVAKRAAEQMRMKIEKFRVYLPVLDSICRHGLEKRHW 1181
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Zfish  1359 RQSLDGLLNQLKNFPA---RLRQYASYEYVQRLLKGYMKVNM--------LVIELKSEALKDRHW 1412

  Fly  1182 DQISKILGRKVNPKLFP-TLKDMIDVDIMSILPQLEEIANAAGKEYDLNNGLRIMQADWRDVMFE 1245
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Zfish  1413 KQLMKRL--HVNWVLSELSLGQIWDVDLQKNEMVVKDVLLVAQGEMALEEFLKQIREVWNSYELD 1475

  Fly  1246 VLQYRDSDTHILASLDDIQTLLDDHIMRTQAMKRSPFITALGSKADDWEARLLLIQNIIDAWTQV 1310
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Zfish  1476 LVNYQNK-CRLIRGWDDLFNKVKEHINSVSAMKLSPYYKVFEEDALSWEDKLNRIMALFDVWIDV 1539

  Fly  1311 QITWMYLEPIFS-SEDIMRQMPLEGRNFKAVDKLWRKIMKHTLKDRHVMAATEYPEMLEVFTKAI 1374
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Zfish  1540 QRRWVYLEGIFTGSADIKHLLPVETQRFQSISTEFLALMKKVTKSPLVMDVLNIQGVQRSLERLA 1604

  Fly  1375 EDLETVTKGLNTYLEQKRLFFARFFFLSNDELLEILSETKDPMRVQPHLRKCFEGIGSLTF-DDN 1438
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Zfish  1605 DLLGKIQKALGEYLERERSSFPRFYFVGDEDLLEIIGNSKNVAKLQKHFKKMFAGVSSILLNEDN 1669

  Fly  1439 MEIVEMVSDEEERVALVRKI----NPQLANGLVEMWLKEVEMVMLDSVKEQMREAWEDYA----- 1494
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Zfish  1670 TEVLGISSREGEEVLYKTAVSITEHPK-----INEWLTLVEREMRVTLAKLLAESVTEVGGFNKG 1729

  Fly  1495 ----MVERISWVVSWPGQVVQGISCMAWTYEVEEAIET-------KELPAYLEKSNLQ-----IA 1543
                :...|||:..:..|:|...:.:.|:..||.|:.|       ..|.|.|:  |::     :|
Zfish  1730 TGIDLTTYISWIDRYQAQLVVLSTQIDWSENVESALSTIAGGGNMAPLQAVLQ--NVEATLNLLA 1792

  Fly  1544 DLVQLVRTDLQAGVRIAVEALIVLDVHDRDVVKYLTDCRITNIQDFDWISQLRYYWKVNEKNED- 1607
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Zfish  1793 DTVLMEQPPLR---RKKLEHLITELVHQRDVTRTLIKNKIDNPKSFEWLSQMRFYF--DPKQTDV 1852

  Fly  1608 --WVCVSMVVTDVEYGMEYLGNLPRLVVTPLTDRCYRTLMGALKLCLGGAPEGPAGTGKTETCKD 1670
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Zfish  1853 LQQLSIQMANAKFNYGFEYLGVQEKLVQTPLTDRCYLTMTQALEARLGGSPFGPAGTGKTESVKA 1917

  Fly  1671 LAKAVAKKCVVFNCSDGLDYKALGKFFKGLAQSGAWACFDEFNRIELEVLSVVAQQILTIQRAIG 1735
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Zfish  1918 LGHQLGRFVLVFNCDETFDFQAMGRIFVGLCQVGAWGCFDEFNRLEERMLSAVSQQVQFIQVALR 1982

  Fly  1736 RK---------VVKFFFEDTMLKLDPTCSIFITMNPGYAGRTELPDNLKVLFRTVAMMVPDYAMI 1791
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Zfish  1983 EHSNPNRDHSVPVTTELLNKQVKVSAEMAIFITMNPGYAGRSNLPDNLKKLFRSLAMTKPDRQLI 2047

  Fly  1792 GEITLYSNGFDMARNLSQKIVQAYKLCSEQLSSQSHYDYGMRAVKSVLLASASLRR--------- 1847
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Zfish  2048 AQVMLYSQGFRTAETLAKKIVPFFKLCDEQLSSQSHYDFGLRALKSVLISAGNVKRERIQKIKRE 2112

  Fly  1848 ------------LYVDLPEPEIVLRAIVDVNLPKFLEQDISLFIGIYMDLFPGVELPMPQRGD-- 1898
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Zfish  2113 KCERGEDVDENEIAENLPEQEILIQSVCETMVPKLVAEDIPLLFSLLSDVFPGVQY---MRGEMT 2174

  Fly  1899 --------ILKWLHINLADRNLQATPWYLEKILQIYEMLLVRHGLMIVGGSMGGKTTAYQVLAQT 1955
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Zfish  2175 ALREELKKVCAEMYLTYGDGDDVGSMW-VEKVLQLYQITQINHGLMMVGPSGSGKTLAWRVLLKA 2238

  Fly  1956 LRNVSTDEEATLKEFPVTFRIINPKAITMGQLYGRFDPVSHEWYDGVLAKTFREQVQGPKGE--- 2017
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Zfish  2239 LERLEGVEGVA--------HIIDPKAISKDHLYGTLDPNTREWTDGLFTHVLRKIIDNVRGELQK 2295

  Fly  2018 RAWVMFDGPVDAVWIENLNTVLDDNKKLCLMSGEIMQMTKLMNMMFEPADLEQASPATVSRCGMI 2082
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Zfish  2296 RQWIIFDGDVDPEWVENLNSVLDDNKLLTLPNGERLSLPPNVRIMFEVQDLKYATLATVSRCGMV 2360

  Fly  2083 YMEPSQLGWRALHKSFINVLVNKVGLGDIYMTLFEDMTE-------------------------- 2121
            :.....|....:...|:      ..|..|.:...||..:                          
Zfish  2361 WFSEDVLSTDMIFNHFL------ARLRSIPLDEGEDEAQRMRKATEDEGEENASPMLQIQRDAAA 2419

  Fly  2122 ---------WLVPAALEFLPQCKQMLELSPIYQY-QTFSRFFLH--------FLEKHKQFN---- 2164
                     .||..|||...:.:.:::.:.:... ..||  .||        :...|..|.    
Zfish  2420 VLQPYFTSTGLVIKALEHASKMEHIMDFTRLRSLGSLFS--MLHQACRNIALYNNNHPDFPMPID 2482

  Fly  2165 --QAWFQQMFLFCFAWAYCSALTGQGQKTFDALLRKVIYGSNENFPKPKYFSLNRGQMFPEKLLF 2227
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Zfish  2483 QLEKYMQKYLIYAVLWSFSGDSRLKMRAELGEYIRRITTVSLPSAP---------------NVPI 2532

  Fly  2228 LDYRFDEAENWWTWQKSDDSASTTSNFPENAQISELIVPTKET----GYISYWQEFCISKSYAML 2288
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Zfish  2533 IDYEVSITGEWQSWQGKVPQIEVETH---KVASPDVVVPTLDTVRHEALLYTW----LAEHKPLV 2590

  Fly  2289 VVGPTGTGKSAIITSNLLAMPKFANLVNVINFSARTSAQMVQDTIMSKLDRRRKG---VFGP-SL 2349
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Zfish  2591 LCGPPGSGKTMTLFSALRALPDME--VVGLNFSSATTPELLLKTFDHYCEYRRTPNGVVLAPVQL 2653

  Fly  2350 GKKCTVFCDDVAMPSKDTYGSQAPLELLRTWLDHGYWSDLVDTT--KIELVDMTLMCAMGTLGGS 2412
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Zfish  2654 GKWLVLFCDEINLPDMDKYGTQRVISFIRQMVEHGGFYRTSDQTWVKLERIQFVGACNPPTDPGR 2718

  Fly  2413 NFIFPRLYRHMFVVAVDSFEDSTIVRIFTTIGDWHFSKGYPEKVALL---SRGLSEAMVSVYRDA 2474
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Zfish  2719 KPLSYRFLRHVPVVYVDYPGPASLTQIYGT-----FNRAMLRLIPSLRTFAEPLTAAMVEFYTMS 2778

  Fly  2475 IRSFLPTPAKSHYSFSLRDITRVFQGI--VMVPPKRMPDPEKLGRLWAHETYRVFYDRLVDQQDR 2537
            ...| ....:.||.:|.|::||..:||  .:.|.:.:| .|.|.|:||||..|:|.||||:.::|
Zfish  2779 QERF-TQDTQPHYIYSPREMTRWVRGIFEALRPLETLP-VEGLIRIWAHEALRLFQDRLVEDEER 2841

  Fly  2538 ---DRLLVMAVDACKSNLRFPLEQAFGERIEPGEKLTDNDLRNLFYGNYMEPDAEPKFYDEGDTY 2599
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Zfish  2842 RWTDENIDMV--ALK---HFP-------NIDREKALN----RPILYSNWLSKDYVPVEQEELRDY 2890

  Fly  2600 EKLEKLMKYYLREYNSFSSTPMDLVMFRFAIEHVSRVSRVLQMPRGNILMVGMGGSGRRSSARLA 2664
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Zfish  2891 VK-ARLKVFYEEELD------VPLVLFNEVLDHVLRIDRIFRQPQGHLLLIGVSGAGKTTLSRFV 2948

  Fly  2665 AYIADCRLMTVQVSKSYTITDWRDDLKKILMSASFNLNHTVFLFSDAQATDEGYVEDINGILNTG 2729
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Zfish  2949 AWMNGLSVYQIKVHRKYTGEDFDEDLRTVLRRSGCKNEKIAFIMDESNVLDSGFLERMNTLLANG 3013

  Fly  2730 DLPNLYQLEDKATIMENMANVAKQLGKILDTLPSEVYAYYIDRIREQLHIALAFSPIGDSFKERI 2794
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Zfish  3014 EVPGLFEGDEYATLMTQCKEGAQKEGLMLDT-HEELYKWFTSQVIRNLHVVFTMNPSSEGLKDRA 3077

  Fly  2795 RVYPSLINCCTIDWYMPWPEEALSRVGVYFVSSMNLNRPHGEETQEPVQSKDAADPDEEEVRRET 2859
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Zfish  3078 ATSPALFNRCVLNWFGDWSTEALYQVGKEFTSKMDLEKPNYKV------------PDYMPIVYDK 3130

  Fly  2860 VGVEREQTQLEADLVDCVMYFHQSVVDASEKCYLELNRRNYVTPSAYLELLKAFRTFYTRKLDEI 2924
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Zfish  3131 --LPQPPTHREAIVNGCV-FVHQTLHQANNRLAKRGGRTMAITPRHYLDFINHYANLFNEKRSEL 3192

  Fly  2925 TRLRDRYTTGLEKLDFAAGQVGEMQTNLYDLQPKLKVLSEETDRIMVNIERETAEAEKKKEVVGA 2989
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Zfish  3193 EEQQMHLNVGLRKIKETVDQVEELRRDLRIKSQELEVKNAAANDKLKKMVKDQQEAEKKK--VMS 3255

  Fly  2990 DEAAANEAAAAAQ-AIKDD---CETDLAEAIPAMEAALEALNTLKPADIFIVKSMKNPPYGVKLT 3050
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Zfish  3256 QE--IQEAVYKQQEVIKDKQLRVKQDLDQVEPAVIEAQNAVSSIKKHHLVEVRAMANPPAAVKLA 3318

  Fly  3051 MEAVCVIRGIKPDRKPDPSGHMVEDYWGPSMRMLSDMKFLDSLKTFDKDNIPPPIIKRIREKYIA 3115
            :|::|::.|.:.:.            |....:::....|:.|:..|..:::...|.:::::.|::
Zfish  3319 LESICLLLGEETND------------WKKIRQVIIRDNFISSIVNFVSEDMSDSIREKMKKNYMS 3371

  Fly  3116 DRDFVPEKIKAASMACEGICRWVRAMDVYDKVARIVMPKKAALAEAEGELSQQMEKLNAKRAELQ 3180
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Zfish  3372 NPSYNYEQVNRASLACGPMVKWAIAQLNYADMLKRVEPLRNELQKLEDDAKD--NKTKAEEVE-Q 3433

  Fly  3181 VILD---KLQKLNDFFAEKSREKKRLEDEIDNCEKKLNRAEKLLGGLGGEKTRWSEAAKNLHESI 3242
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Zfish  3434 MIRDLEASIARYKEEYAVLISEAQAIKADLAAVEAKVNRSTALLKSLSAERERWEKTSETFKNQM 3498

  Fly  3243 SNIVGDVLLAGGCTAYLGYFTTEYRVNILDDWNALCKRKHIPSSETFSLATTLGHPMTIRAWSLA 3307
            |.|.||.||:....||.|||..:.|.|:...|:...::.::......:....|.:......|...
Zfish  3499 STIAGDCLLSAAFIAYAGYFDQQMRQNLFTTWSHHLQQANVQFRTDIARTEYLSNADERLRWQAN 3563

  Fly  3308 GLPADNFSVENGIIVTNSSRYSLLIDPQVQANKWIKNMEKNNNLKVIKQSDANYMQVLELAITFG 3372
            .||||:...||.|::...:||.|:|||..||.::|.|..|:..:......|..:.:.||.|:.||
Zfish  3564 SLPADDLCTENAIMLKRFNRYPLIIDPSGQATEFIMNEYKDKKITRTSFLDDAFRKNLESALRFG 3628

  Fly  3373 QPVLIENVGEKLDSNLTPILEKNVIKHKGGLFIKSGDQMIEYNPNFRLYITTCLRNP--RYPPEV 3435
            .|:|:::| |..|..|.|:|.:.|.:..|.:.|..|||.|:.:|:|.::::|  |:|  .:||::
Zfish  3629 NPLLVQDV-ESYDPILNPVLNREVRRTGGRVLITLGDQDIDLSPSFVIFLST--RDPTVEFPPDL 3690

  Fly  3436 MVMVTVLNFMITEQGLREQLLAIVVAHERPDLQEKKEQLIIESARNRDALYTIESKILEVLSTSE 3500
            ...||.:||.:|...|:.|.|..|:..||||:.||:..|:......:..|..:|..:|:.|:..:
Zfish  3691 CSRVTFVNFTVTRSSLQSQCLNEVLKAERPDVDEKRSDLLKLQGEFQLRLRQLEKSLLQALNEVK 3755

  Fly  3501 GNVLEDENAINILSSSKILSEDIQEKQVIAVATEI---EIDAARQQYIPVSKHSAILFFCISELA 3562
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Zfish  3756 GRILDDDTIITTLENLKKEAAEVTRK---VEETDIVMQEVESVSQQYLSLSTACSSIYFTMEALN 3817

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Zfish  4591 ---KQSSSEKRNMVTLPVYLNFTRADLI--------FTVDFDIATKEDPHHFYERGVAILC 4640

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
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DYN1 <1322..4005 CDD:227570 813/2869 (28%)
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dync1h1NP_001036210.2 None

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