DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dnah3 and Dhc16F

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_647937.2 Gene:Dnah3 / 38586 FlyBaseID:FBgn0035581 Length:4385 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_523394.1 Gene:Dhc16F / 32785 FlyBaseID:FBgn0283476 Length:4081 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:4396 Identity:1420/4396 - (32%)
Similarity:2167/4396 - (49%) Gaps:610/4396 - (13%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   225 RGPPKKEKFTAGDH---YAF-RTPQECRNELMRVGKIIDELIEPVLKAAEHKIGHGLTKYPDPPS 285
            ||..:::....|||   ..| |...|.|...|.:.::..:......:|::...| .:|...|...
  Fly    44 RGRSRRQSAGGGDHSVDMGFKRVTGEDRPSSMSMDRLDSDFAAFTDRASDANDG-SITGPADGNG 107

  Fly   286 CKDNTNRILRSAGILVGKKKNCYVGKCRIHRKDFATNEE-------------------------- 324
            .|..|.          ||:|     :...||.:|:|::.                          
  Fly   108 KKAQTG----------GKQK-----RASKHRLNFSTSKSAGSGTGNKSRSASTTKITTGASLIPD 157

  Fly   325 ---FLRCLKRMEATHFPYMQPLQPVDPD--------DQKIKMLAKYR---------VELARAEKL 369
               .:..::.|....|.||..:.|.|.:        :.:.|.|..|.         |......:.
  Fly   158 LNLIINRMRNMPDDSFVYMDYMLPHDSEYFTPYSLREVEYKDLNTYEPFYTVTRHGVTFWHCSEN 222

  Fly   370 FTLKIQKRYQCLLKSMSIVQLATYPSHLIRKAF---------RRINPRSALLQDAYQFIVKEKRD 425
            |...:.:..|...:.:||:|:.::....:.|.|         |::|.....||:....::     
  Fly   223 FFTPLDQWQQEFKQFLSIIQIRSFSIFRLWKGFKVWEKTIKWRKLNEARDYLQNNLFIVI----- 282

  Fly   426 WPKLPPEVILMDYLFVGDRGVRQDLAILIIVCLIDLQEDFRHYVKRSFLNYLLSSNMERRRLQLE 490
             |:|...::.|          |.|        ::.||.          ||::..||:|.      
  Fly   283 -PQLAKAILRM----------RSD--------IVQLQR----------LNFVNVSNIEN------ 312

  Fly   491 REPPEFPILTISPPVSWRSNLLRGKARIGEVLMTTHPTVQALNRLWHDLYEDLVVVDLGQLLLAQ 555
                                                         ||..|    .::....:..|
  Fly   313 ---------------------------------------------WHPFY----FLETHMRIYEQ 328

  Fly   556 RPLDADTVQVFIEKSCADVRDLLLNDWLPRCADLMNEMRGTWKD----LVPMSGKYGGRAAMLFR 616
                       :.|:..|.|:.:.......|.|.: :.||.:.|    ..|...|        .|
  Fly   329 -----------LHKTFTDFREFIAKTIFRACTDAI-QARGFYPDDEVNYYPSLKK--------MR 373

  Fly   617 CIHSAMSRHLNSLISKSI-NYL-FKVLCAFKGGNRIEKYSMFDAKLKRIPLMTLIASVVGAHFDH 679
            ..||.|.|.......|:: |:| :..:..::...||.|.|..|           :|:....|.: 
  Fly   374 EAHSFMDRARKRAFCKTLTNFLTYCDMMVYQMLYRITKKSFED-----------LATSFEVHDE- 426

  Fly   680 EPINMGPGVRPASNIYVYDEDD--------ADPFQQPQVNQFVENVPDIDDVAQFE--------- 727
                :||.   .::|..:|..|        .|..|.|.....:..:||..|:...|         
  Fly   427 ----VGPS---EADINKHDRVDKRIEKQRPQDKPQSPFFLAMLRLLPDRIDIEPSEDIIRIIFQR 484

  Fly   728 ---LDHSNKLYIYPYMQELPRIFTEHFK-SILAVGYEIPRLEFVMSGGEPETKGFLHFIDEDHVD 788
               |.....|.|:|:..:  ..||::.: ||:.      |.|.|:..|.|:    ||::....:.
  Fly   485 ITGLILETVLEIHPFTTD--PFFTQYTQPSIMG------RQEEVLYEGAPD----LHYLLRADIR 537

  Fly   789 FLELCEKVEQIVKVNWQGVHVYLKPVY---KYYFGLFQKL---------ILPMVQKVWTENNLPE 841
            |           :.|.:.:.|.::..|   :.|...|.::         ..|.|..  ||.:|..
  Fly   538 F-----------QYNRKNMFVLIRKAYERARLYTQRFHQIRENFEIDNSTDPTVLN--TERDLQI 589

  Fly   842 LGA-VQELLKKLQAVSDTTYYLRDFIPLNLFMLDNRHVKLSLRMYVREIYDFIIDFYKALNWNEN 905
            |.| .......::|:..    :.:::.|.|..|...:.|.::......:.:.:..:...|...|.
  Fly   590 LRAYCDRYCNNVRALDG----ILEYVFLGLLKLTQTNFKDTVTPVCSRLQNVLATYLPKLAEEET 650

  Fly   906 RAICEELEEMSMKAGERPEETPEVVALQNYINDCREMRIFAIKDEIKNVLKRVVFLLTHTYLSSD 970
            ..:.||.::...:....|.||.|:||...:::.|        ..|:..:...:.::        .
  Fly   651 TRLYEEAQDFHGRICYEPHETLEIVAHIRFLDKC--------STELDGIFDGIDYV--------H 699

  Fly   971 ELHLNSRTFILP---GELEEVLDLSAARLAVVRDNLELALRERRMEFEKLLAQEKRTMDGFRIRE 1032
            :|.|..:.|.:|   ...|:.:| :...|...|:.|| .:||:|.:|...| ::....|...::|
  Fly   700 DLLLIIKDFGIPIDDDSKEDYMD-TEDYLNRTRETLE-EIREKRQDFINRL-EDAMQDDIAALKE 761

  Fly  1033 IRDVLTLEELK--------ERVDTVDLLFTTIENLSREAKAINTEETLL------QIDVSAFPLL 1083
            ....:.:|.|:        .|:...:.|.:.:|.|:   |...|.:..|      |||::.:..:
  Fly   762 DIHEVAIEALQPWLLDANSNRLSVTNKLDSMLERLN---KCRETADEFLGYQKEFQIDLTMYDEM 823

  Fly  1084 AEIIEKMEPIEKLWKTSYEFEKDYLIWMFERFECLNADGVREQVENMHKIMYKLSRQLAYN---P 1145
            |.....:...:.|::|..::|:....|:...|..||...:.|......|...:..:.|..|   |
  Fly   824 ASGFYDIRMRQNLYRTWSDWEESLAEWIVSDFNTLNVVDMVELNSKTIKNCMQFQKYLPENNIVP 888

  Fly  1146 VAKRAAEQMRMKIEKFRVYLPVLDSICRHGLEKRHWDQISKILGRKVNPK---LFPTLKDMIDVD 1207
            |.:::||..:.|       |||:..:....|..|||.:|..:|.||...:   |..|.:|:...|
  Fly   889 VLQKSAEAFKEK-------LPVIGYLRNPNLRARHWAEIEDLLNRKFFQEKDILIQTYEDVHAFD 946

  Fly  1208 IMSILPQLEEIANAAGKEYDLNNGLRIMQADWRDVMFEVLQYRDS-DTHILASLDDIQTLLDDHI 1271
            .::|...|.:|::.|..|..|.|.|:.::..|::....::.:.|: |..|||..:::|.:|||..
  Fly   947 DVAIGEALMQISSQATGEVQLENMLKGIETTWKETELSIVPHHDAKDVFILAGTEELQAVLDDSN 1011

  Fly  1272 MRTQAMKRSPFITALGSKADDWEARLLLIQNIIDAWTQVQITWMYLEPIFSSEDIMRQMPLEGRN 1336
            :....:..|.|:..:.||.|:|...:.......::|...|..|:|||.||:|.||.||:|.|.:.
  Fly  1012 VNINTIAASKFVGPIKSKVDEWINAMDQFAKTFESWMDCQGAWIYLEAIFASADIQRQLPHEAKM 1076

  Fly  1337 FKAVDKLWRKIMKHTLKDRHVMAATEYPEM--LEVFTKAIED---LETVTKGLNTYLEQKRLFFA 1396
            |..|||.:::.::...|     .|...|.|  ::|....:|:   |:.:::||..|||.||:.|.
  Fly  1077 FFTVDKSFKETVRQAKK-----VALALPTMSSVDVHKVLVENNRLLDLISRGLEAYLEVKRVVFP 1136

  Fly  1397 RFFFLSNDELLEILSETKDPMRVQPHLRKCFEGIGSLTF------DDNM----EIVEMVSDEEER 1451
            ||:|||||||||||::|:.|..|||||||||:.|..|.|      |..|    :||..:|.|.|:
  Fly  1137 RFYFLSNDELLEILAQTRIPQAVQPHLRKCFDAIYRLEFGSKEGGDGKMVATNDIVAFLSPEGEK 1201

  Fly  1452 VALVRKINPQLANGLVEMWLKEVEMVMLDSVKEQMREAWEDYAMVERISWVVSWPGQVVQGISCM 1516
            :...:.:.   |.|.||.||.:||..|..|.|..||..::.|...||..|....|.|||..:|.:
  Fly  1202 LQFGKGLK---ARGAVEEWLSKVEEAMFVSCKRYMRFGYQCYPAKEREDWFQDHPNQVVLTVSQV 1263

  Fly  1517 AWTYEVEEAIETKE---------LPAYLEKSNLQIADLVQLVRTDLQAGVRIAVEALIVLDVHDR 1572
            .|..::....|.||         :..:..|....:..|..|.|.::.:.:|..:.|||.:|||.:
  Fly  1264 QWAADIHRIYEGKERNPLNILEKMAKFEIKCLKDLGALAALTRKNISSLLRKILCALITIDVHAK 1328

  Fly  1573 DVVKYLTDCRITNIQDFDWISQLRYYWKVNEKNEDWVCVSMVVTDVEYGMEYLGNLPRLVVTPLT 1637
            |.|:.|.:..:....||:|:..||:||   ....:.|...|...::.|..||||....||:||||
  Fly  1329 DSVRMLIEKEVCKASDFNWLKMLRFYW---ADETETVYSRMAAANIPYYYEYLGAGGVLVLTPLT 1390

  Fly  1638 DRCYRTLMGALKLCLGGAPEGPAGTGKTETCKDLAKAVAKKCVVFNCSDGLDYKALGKFFKGLAQ 1702
            ||||..||||.::.|||||.||||||||||.||||||:||:|||||||||||||.:|:||.||||
  Fly  1391 DRCYLCLMGAFQMDLGGAPAGPAGTGKTETTKDLAKALAKQCVVFNCSDGLDYKMMGRFFSGLAQ 1455

  Fly  1703 SGAWACFDEFNRIELEVLSVVAQQILTIQRAIGRKVVKFFFEDTMLKLDPTCSIFITMNPGYAGR 1767
            .|||.||||||||::|||||:|||::||:.|...:|.:|.||...:|::.:|.:|||||||||||
  Fly  1456 CGAWCCFDEFNRIDIEVLSVIAQQLITIRTAKAMRVKRFIFEGREIKINRSCCVFITMNPGYAGR 1520

  Fly  1768 TELPDNLKVLFRTVAMMVPDYAMIGEITLYSNGFDMARNLSQKIVQAYKLCSEQLSSQSHYDYGM 1832
            ||||||||.|||.::|||||||:|.|:.|||.||:..:.|::|:||.|:|||:|||.|:|||:||
  Fly  1521 TELPDNLKALFRPISMMVPDYALISEVILYSEGFEDPKILARKMVQMYQLCSQQLSQQNHYDFGM 1585

  Fly  1833 RAVKSVLLASASLRRLYVDLPEPEIVLRAIVDVNLPKFLEQDISLFIGIYMDLFPGVELPMPQRG 1897
            |||||||:.:.:|:|...:..|...::.|:.|.|:||||..|..||.||..|||||||||..|..
  Fly  1586 RAVKSVLVMAGALKRASPNQREDITLIAALRDSNIPKFLADDAVLFRGILSDLFPGVELPDSQHP 1650

  Fly  1898 DILKWLHINLADRNLQATPWYLEKILQIYEMLLVRHGLMIVGGSMGGKTTAYQVLAQTLRNVSTD 1962
            .:...|.:.|..:||||.|..:.|.||:||.:.||.|:|:||.:.|||:.....|...|.::..:
  Fly  1651 HLEASLRLGLRQKNLQAVPTTIRKCLQLYETMCVRWGVMLVGPTGGGKSVVLHALEFALSHLFEN 1715

  Fly  1963 EEATLKEFPVTFRIINPKAITMGQLYGRFDPVSHEWYDGVLAKTFREQVQGPKGERAWVMFDGPV 2027
            |.......||..:.:||||:||.:|||..|..:.||.||:|....|...........|:|.||||
  Fly  1716 EVQDPNFRPVVIQTMNPKAVTMNELYGYVDLKTLEWQDGLLGLAVRTATTVEDEIHQWIMCDGPV 1780

  Fly  2028 DAVWIENLNTVLDDNKKLCLMSGEIMQMTKLMNMMFEPADLEQASPATVSRCGMIYMEPSQLGWR 2092
            ||||||||||||||||.|||.:.|.:::|..::|:||..||.||||||||||||:|::|..|||.
  Fly  1781 DAVWIENLNTVLDDNKMLCLANSERIKLTAWIHMLFEVQDLLQASPATVSRCGMVYVDPGDLGWI 1845

  Fly  2093 ALHKSFINVLVNKVGLGDIYMTLFEDMTEWLVPAALEFLPQCKQMLELSPIYQYQTFSRFF---- 2153
            .|..::..|                ||...|.....||   |           ||.|..:|    
  Fly  1846 PLIDTWREV----------------DMKHKLPAPLAEF---C-----------YQLFVGYFDKAL 1880

  Fly  2154 ----------LHFLEKHK-----QFNQAWFQ-----------------QMFLFCFAWAYCSALTG 2186
                      :|.:...|     :.|.|.|:                 ::|.:...||..|.|..
  Fly  1881 KIERKRAVYTIHQVLGSKVRLCCELNSAQFEAVKWSAMSEEQGKELVTKIFAWAVLWAIASNLKD 1945

  Fly  2187 QGQKTFDALLRKVIYGSNENFPKPKYFSLNRGQMFPEKLLFLDYRFD-EAENWWTWQKSDDSAST 2250
            ..:.:|:....|.| ..:.|...|.:...|             ||.| |..:|.:|  .|..|..
  Fly  1946 AEKVSFEEQWSKAI-AQHPNMTLPNFTLWN-------------YRIDLEKMDWGSW--IDIMAKF 1994

  Fly  2251 TSNFPENAQISELIVPTKETGYISYWQEFCISKSYAMLVVGPTGTGKSAIITSNLLAMPKFANLV 2315
            .  |.......::.|||.:|....|..:....:...::|.|.||.||:.:..|.:..:.: .|::
  Fly  1995 V--FDPETSYYDMQVPTVDTTKYGYVSDLLFKRGMPVMVTGDTGVGKTVLAISCMKRLSQ-GNVI 2056

  Fly  2316 NVI-NFSARTSAQMVQDTIMSKLDRRRKGVFGPSLGKKCTVFCDDVAMPSKDTYGSQAPLELLRT 2379
            .|| ||||:||:...|:.|...|::|:|...|..:||...||.|||.||..||||:...:||||.
  Fly  2057 PVILNFSAQTSSNRTQEMIEGPLEKRKKTQLGAPVGKTVIVFIDDVNMPKLDTYGASPAIELLRQ 2121

  Fly  2380 WLD-HGYWSDLVDTTKI---ELVDMTLMCAMGTLGGS-NFIFPRLYRHMFVVAVDSFEDSTIVRI 2439
            :|| .|::    |..|:   |::|:.|.||....||. |.:.||..||..:.::....:.|:.:|
  Fly  2122 FLDFKGFY----DREKLYWKEILDVVLGCACAPPGGGRNPLTPRFVRHFALFSLPKPNEETLTQI 2182

  Fly  2440 FTTIGDWHFSKGYPEKVALLSRGLSEAMVS----VYRDAIRSFLPTPAKSHYSFSLRDITRVFQG 2500
            |..|     .:|:.:..:...|.|||.||:    ||.......||||.||||.|:|||:::..||
  Fly  2183 FNGI-----LRGFLQTFSSAVRALSEPMVNACVDVYMRVATVMLPTPDKSHYIFNLRDLSKCIQG 2242

  Fly  2501 IVMVPPKRMPDPEKLGRLWAHETYRVFYDRLVDQQDRDRLLVMAVDACKSNLRFPLEQAFGERIE 2565
            |:...........::.||:.|||.|||:|||::.:|::....:..:.|..:...|:         
  Fly  2243 ILQASNLHYNQENQILRLFYHETTRVFHDRLINIEDKNIFKALMKEVCMDHFNRPV--------- 2298

  Fly  2566 PGEKLTDNDLRNLFYGNYM---EPDAEPKFYDEGDTYEKLEKLMKYYLREYNSFS-STPMDLVMF 2626
                :.||:...|| |::|   :|..| :.|||...:.|||.::..|:.:|||.: ...|.|::|
  Fly  2299 ----INDNEPPILF-GDFMVFGKPKNE-RIYDEIRDHTKLESVLNDYIADYNSVAVGKQMKLILF 2357

  Fly  2627 RFAIEHVSRVSRVLQMPRGNILMVGMGGSGRRSSARLAAYIADCRLMTVQVSKSYTITDWRDDLK 2691
            :.|:||..|::|:|:..|||.|:||:.|.|::|..|||:::.:.....:::.::|.:..:.:||:
  Fly  2358 QDAMEHTVRLARLLRSDRGNGLLVGVAGMGKQSLTRLASHVNEYNCWQIEMRRNYDLNAFHEDLR 2422

  Fly  2692 KILMSASFNLNHTVFLFSDAQATDEGYVEDINGILNTGDLPNLYQLEDKATIMENMANVAKQLGK 2756
            .:...|..:.....||..|:|..:|.::||||.|||:|::|||::.::...|:.:..:...:..|
  Fly  2423 VLYRIAGIDNQPVTFLLIDSQIVEEEFLEDINNILNSGEVPNLFEGDEFEKIILDARDGCNENRK 2487

  Fly  2757 ILDTLPSEVYAYYIDRIREQLHIALAFSPIGDSFKERIRVYPSLINCCTIDWYMPWPEEALSRVG 2821
            .......::|.::|:|:|..||:.::.||:||:|:.|.|::|||:||.||||:..||.|||..|.
  Fly  2488 DDPCTRDDIYKFFINRVRNNLHVVMSMSPVGDAFRRRCRMFPSLVNCTTIDWFTSWPTEALYSVA 2552

  Fly  2822 VYFVSSMNLNRPHGEETQEPVQSKDAADPDEEEVRRETVGVEREQTQLEADLVDCVMYFHQSVVD 2886
            :..::.:                   |...|:.:                .|....::.|::|.|
  Fly  2553 LGLLTKI-------------------APKMEDRI----------------SLASTTVFMHKTVED 2582

  Fly  2887 ASEKCYLELNRRNYVTPSAYLELLKAFRTFYTRKLDEITRLRDRYTTGLEKLDFAAGQVGEMQTN 2951
            ||.|.|.|:.|..|.|||:||||||.::.....|..||...|.|...||.||......:..|...
  Fly  2583 ASVKFYKEMKRHYYTTPSSYLELLKLYQNLLKIKNMEIIAKRKRIANGLNKLLETNEVIAVMGKE 2647

  Fly  2952 LYDLQPKLKVLSEETDRIMVNIERETAEAEKKKEVVGADEAAANEAAAAAQAIKDDCETDLAEAI 3016
            |..:.|:|...|.....::.|:.:||.:|:..|:.|..||..|.|.||.||||.:|...||..|:
  Fly  2648 LEVMVPQLDEKSAMMKSLVDNLTKETKQADAVKQSVLEDEMNAKEKAAVAQAISEDAGKDLEIAM 2712

  Fly  3017 PAMEAALEALNTLKPADIFIVKSMKNPPYGVKLTMEAVCVIRGIKPDRKPDPSGHMVEDYWGPSM 3081
            ||:..|.|||..|..|||..:||...||..|:..|||||::.|:||.             |..:.
  Fly  2713 PALREAEEALKGLTKADINELKSFTTPPALVQFCMEAVCILLGVKPT-------------WASAK 2764

  Fly  3082 RMLSDMKFLDSLKTFDKDNIPPPIIKRIREKYIADRDFVPEKIKAASMACEGICRWVRAMDVYDK 3146
            .:::|:.|:..|..:||:::....:|::: |||..:||||.|.:..|...:.:..||.:||.:.|
  Fly  2765 AIMADINFIKRLFEYDKEHMKEDTLKKVK-KYIDHKDFVPAKFEKVSKVAKSMSMWVISMDKFSK 2828

  Fly  3147 VARIVMPKKAALAEAEGELSQQMEKLNAKRAELQVILDKLQKLNDFFAEKSREKKRLEDEIDNCE 3211
            |.::|.||......||.||.:.|..|..|:.||..:..|:|.|.|...||.||.:.::|.:|...
  Fly  2829 VYKVVEPKIKRKEAAEAELKEVMTVLRQKQKELAAVEAKIQGLRDSLEEKQREFQVIQDNVDLTY 2893

  Fly  3212 KKLNRAEKLLGGLGGEKTRWSEAAKNLHESISNIVGDVLLAGGCTAYLGYFTTEYRVNILDDWNA 3276
            .::|||.:|...|..|:.||.|..|:|...::.:.||||:|..|.||||.|:.|||.::...|.:
  Fly  2894 GRINRAGRLTSALSDEQVRWRETVKSLTGDLACVPGDVLVAAACVAYLGAFSHEYRRDMSALWVS 2958

  Fly  3277 LCKRKHIPSSETFSLATTLGHPMTIRAWSLAGLPADNFSVENGIIVTNSSRYSLLIDPQVQANKW 3341
            .|:...||||..|:|...||.|..:|.|::.|||.||.|:||||..|.:.|::|:||||.|||:|
  Fly  2959 KCREHKIPSSPEFNLLKVLGDPYEMRQWNVDGLPKDNISIENGIYATRALRWALMIDPQEQANRW 3023

  Fly  3342 IKNMEKNNNLKVIKQSDANYMQVLELAITFGQPVLIENVGEKLDSNLTPILEKNVIKHKGGLFIK 3406
            |:|||:.|||:|||.:|:..|:|||.|:..|.|||:|.:.|.:|.:|.|||::...:.:|..::|
  Fly  3024 IRNMERANNLQVIKMTDSTMMRVLENAVRQGYPVLLEEINETIDPSLRPILQRETYRFEGRTYLK 3088

  Fly  3407 SGDQMIEYNPNFRLYITTCLRNPRYPPEVMVMVTVLNFMITEQGLREQLLAIVVAHERPDLQEKK 3471
            .||.:|:|:.||:||:||.|.||.|.|||.:.||::||::||.||.:||||.:||.|.|.::.::
  Fly  3089 LGDMVIDYDDNFKLYMTTKLPNPHYLPEVCINVTLVNFLVTESGLEDQLLADIVAIELPAMEIQR 3153

  Fly  3472 EQLIIESARNRDALYTIESKILEVLSTSEGNVLEDENAINILSSSKILSEDIQEKQVIAVATEIE 3536
            ..|:::...::..|..:|.|:|::|..||||:|:||..:..|:.:|..|..|..:.:....||..
  Fly  3154 NDLVVKINSDKQQLLALEDKVLKLLFNSEGNILDDEELVETLNDAKETSLIIAARLIDTEETEKV 3218

  Fly  3537 IDAARQQYIPVSKHSAILFFCISELANVDPMYQYSLSWFLNLFVNTILKAPKSDQLSERLKNLND 3601
            |.|:|::|..::...|||:|.::.||.:||||||||.:|..:|.|.:........:..|:..|..
  Fly  3219 ITASRERYRILASRGAILYFVVAGLAEIDPMYQYSLKYFTQVFCNVLRLDHPPQSVEVRISTLMT 3283

  Fly  3602 YFTKSIYTNVCRSLFEKDKLVISLVMCLGILVSQGRVEKAALLFFLTGGIGYKTIPPNPLGAWLP 3666
            ...::|:.|:.|.|||..|::.|.::.|.:...:|||.:...||...|.:|.......|....:.
  Fly  3284 DELRAIFDNISRGLFENHKIIFSFLLALSVERQEGRVTEEEFLFLSRGPVGNIRTKIQPAKIKMS 3348

  Fly  3667 DKSWASVCKAAD-----LEGLKN------LPQMMETYSDEWHNFYDASNPDQLQLPAPHNTVNDM 3720
            ...|.|.....|     ..||.:      ..||.|.     ...:|.:..:|......:..:...
  Fly  3349 QIEWDSCIFLEDNFSSFFSGLTDELDKPFFIQMQEN-----KEVFDFAQTNQPPTDKWNKRLRVF 3408

  Fly  3721 YFLIVIKSLRPDKLVPAVRAFITRNLDRSFVEPP-PFDLAASFADSSPKIPLVFLLSAGSDPMAS 3784
            :.|:.|.:.|..:.:..|..::...:.:.|.|.. ...|::.:.|:|...||:|:||.|||||:.
  Fly  3409 HKLMFISAFRKPRFLLNVVCYLQSTVGKYFTEASGGTQLSSVYLDTSAVTPLIFVLSTGSDPMSG 3473

  Fly  3785 LFMFAKQRNMYDKLKTISLGQGQGPRAEKMIMEAARHGQWVVLQNCHVAISWMGDLERICNDTTL 3849
            ...|..|....||..:|||||||||.||.:|.::.|.|.||.|||||:|.|:|..||.|..:.||
  Fly  3474 FLKFTTQMQFTDKYYSISLGQGQGPLAENLIEKSLRLGHWVFLQNCHLATSFMQTLETIVRNLTL 3538

  Fly  3850 -TDGANHDYRLWCTSYPSAVFPVSVLQNSVKMTNEPPKGLRANMHRSFTSDPLMRDKFFTNAFLF 3913
             ...|:.|:||:.:|.|...||:||||||||:|||||||::||:..:.|.   ::..||....  
  Fly  3539 GITKAHVDFRLYLSSMPIQTFPISVLQNSVKITNEPPKGIKANVFGALTD---LKQDFFEQHI-- 3598

  Fly  3914 SDSANKCWLRGVFALVFFHAVVQERREFGPLGWNIPYEFNESDLKISLLQLKMFINQS--QSIPF 3976
               .|..|...||.|..||||:.|||:||||||||.|||:|||.:..|..|..||::.  ..||:
  Fly  3599 ---QNGNWRAIVFGLCMFHAVLLERRKFGPLGWNITYEFSESDRECGLKTLDFFIDREVLDEIPW 3660

  Fly  3977 RGHVYLTGECNYGGRVTDDKDRRLILSLLNMIYNPNTIEEDNYALSQSGTYRVPLSPTRLNSIEY 4041
            ...:|:.|:..:||||||..|.|.:.::|.:..:...|:.|.........||.|...|......|
  Fly  3661 EAILYINGDITWGGRVTDYWDLRCLRTILTIFSSKRIIQPDYKYCRGDSYYRDPRKKTLTEYSAY 3725

  Fly  4042 VSSFPLSPHPEVYGLHENADINRNVKETNALISGVLLTQTDLMASVKASSSGGAKEDPAIAICKQ 4106
            |..||:...||::|:::||:|....|||...|:.:||.|..     .|:..|.|.|:   .|.:|
  Fly  3726 VQGFPVLEDPEIFGMNQNANIVFQTKETAFFINTLLLGQPR-----SAADEGQAMEN---EIAQQ 3782

  Fly  4107 VL----KQLPEEFNIDEVSKTYPVI----YTNSMNTVLRQELIRFNRLLSYIRKSLVNVGKAVVG 4163
            .:    |.|..:...:.:..|..|:    ...|:..||.||:.|||..|..|..||||:.||:.|
  Fly  3783 TIARIQKALATKIKREPIHDTLSVLDAKGQVPSLTIVLVQEIDRFNIALGIIHDSLVNLSKAIKG 3847

  Fly  4164 QIAMIPELERTHASMVIGKLPADWLKKSYPSLKPLGSYVSDLLARLAFFQEWIDNGEPMVYWISG 4228
            .:.|..|||....:::..::||.|.|:|:.|:|||.||:||...|:.|.|:|.:||.|..|||||
  Fly  3848 LVVMSEELENVFKALLSNQVPASWAKRSFLSIKPLPSYISDFQRRIDFIQQWAENGAPRSYWISG 3912

  Fly  4229 FYFTQSFITGVLQNYSRKNRFQIDMILIEFAVTK--------FEVQVPGTPDIGAY--------- 4276
            |:|.|||:|||||.|:|:....||.:.|:|.|.:        ||:......|...|         
  Fly  3913 FFFPQSFLTGVLQTYARRRVLPIDSLKIDFDVFERELVQQDFFEMHTNNMSDQKLYGNLPECTDA 3977

  Fly  4277 ---IRGIFIEGARWN-RKTKEVDESFSKVLFDTLPVIYLRPVLKALEDLPRSTAGGEPETIYDCP 4337
               :.|||||.|||: .|....|.:|.: ||..:||:..:|.|:.           .|...|:.|
  Fly  3978 IINVHGIFIEAARWDLSKGGLCDANFGE-LFSRMPVVRFKPCLEI-----------SPTVRYEAP 4030

  Fly  4338 VYKTSERRGVLSTTGHSTNFVMYLQLRCSRKPMHWINRGTA 4378
            :|||.:|.||||||||||||::.:.||....|..||.||||
  Fly  4031 LYKTQQRSGVLSTTGHSTNFILAVLLRSHNDPEFWIMRGTA 4071

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dnah3NP_647937.2 DHC_N2 1083..1489 CDD:462462 137/427 (32%)
DYN1 <1322..4005 CDD:227570 1039/2772 (37%)
AAA_6 1620..1946 CDD:463697 195/325 (60%)
AAA_9 3302..3523 CDD:463702 101/220 (46%)
Dynein_C 4067..4381 CDD:465677 129/341 (38%)
Dhc16FNP_523394.1 DHC_N2 829..1234 CDD:462462 134/419 (32%)
DYN1 1047..3704 CDD:227570 1050/2802 (37%)
AAA_6 1373..1699 CDD:463697 195/325 (60%)
Dynein_C 3750..4073 CDD:465677 129/342 (38%)

Return to query results.
Submit another query.