DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dnah3 and Dync1h1

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_647937.2 Gene:Dnah3 / 38586 FlyBaseID:FBgn0035581 Length:4385 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_062099.3 Gene:Dync1h1 / 29489 RGDID:2511 Length:4644 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4884 Identity:1192/4884 - (24%)
Similarity:2104/4884 - (43%) Gaps:924/4884 - (18%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MQKKVAPERRPYCDPRLQDDKLRRKRTLHLPRVS------------QAQKKGEKRQLNDC----- 48
            ::||:|         .|:...|..::.:.:|.:|            |..::|||.::.|.     
  Rat   180 VEKKIA---------ELEMGLLHLQQNIEIPEISLPIHPIITNVAKQCYERGEKPKVTDFGDKVE 235

  Fly    49 --PFYN-LTYGFD----------QLPLDPVKEFLQEKISH--------------------MQTDK 80
              .|.| |..|.:          :|..||......::||.                    :.|..
  Rat   236 DPTFLNQLQSGVNRWIREIQKVTKLDRDPASGTALQEISFWLNLERALYRIQEKRESPEVLLTLD 300

  Fly    81 IVGHCNREFDFH---RYDLD-NVKDEYDECDDDS--LQELQLEDIIMPEQFEMLRDAK----DHL 135
            |:.|..|   ||   .:|.| .:|...:..:|.:  :::..|.|::...:.:.:|.|.    .||
  Rat   301 ILKHGKR---FHATVSFDTDTGLKQALETVNDYNPLMKDFPLNDLLSATELDKIRQALVAIFTHL 362

  Fly   136 YNFDSTACNQFPWIDKWMTGVRPSEQEIYEMTSHLLEIYCNRR-VRIFYP-------GCGTSSSL 192
            ....:|   ::| |.:   .:|..|....:::|.||::...|: :.:.|.       .|......
  Rat   363 RKIRNT---KYP-IQR---ALRLVEAISRDLSSQLLKVLGTRKLMHVAYEEFEKVMVACFEVFQT 420

  Fly   193 WTNQLRRQHGSPSELIGAYR----------TPSARHM--RVNNMRGPPKKEKFTAGDHYAFRTPQ 245
            |.::..:......:::...|          .|:.|.:  |::.||      ||.       |..:
  Rat   421 WDDEYEKLQVLLRDIVKRKREENLKMVWRINPAHRKLQARLDQMR------KFR-------RQHE 472

  Fly   246 ECRNELMRVGKIIDELIEPVLKAAEHKIGHGLTKYPDPPSCK---------------------DN 289
            :.|..::||      |...|...|:...|..    |:|...|                     :|
  Rat   473 QLRAVIVRV------LRPQVTAVAQQNQGEA----PEPQDMKVAEVLFDAADANAIEEVNLAYEN 527

  Fly   290 TNRILRSAGILVGKKKNCYVGKCRIHRKDFATNEEFLRCLKRMEATHFPYMQPLQPVDPDDQKIK 354
            ...:   .|:.|.|:                ..|.:...:||       |.:.:..|:     .:
  Rat   528 VKEV---DGLDVSKE----------------GTEAWEAAMKR-------YDERIDRVE-----TR 561

  Fly   355 MLAKYRVELA---RAEKLFTLKIQKRYQCLLKSMSI-VQLATYPSHLIRKA----------FRRI 405
            :.|:.|.:|.   .|.::|  :|..|:..|.....| ..:..|.:.||::.          |:..
  Rat   562 ITARLRDQLGTAKNANEMF--RIFSRFNALFVRPHIRGAIREYQTQLIQRVKDDIESLHDKFKVQ 624

  Fly   406 NPRSALLQDAYQFIVKEKRDWPKLPPEVI--------LMDYL-------------FVGDRGVRQD 449
            .|:|...:      :...||.|.:...:|        |..|:             .|..:.::||
  Rat   625 YPQSQACK------MSHVRDLPPVSGSIIWAKQIDRQLTAYMKRVEDVLGKGWENHVEGQKLKQD 683

  Fly   450 LAILIIVCLIDLQEDFRHYVKRSFLNYLLSSNMERRRLQLEREPPEFPILTI-SPPVSWRS-NLL 512
            .....:  .::.||.|..:.::          :::|.|.:...     |.|| |..|..|| |:|
  Rat   684 GDSFRM--KLNTQEIFDDWARK----------VQQRNLGVSGR-----IFTIESARVRGRSGNVL 731

  Fly   513 RGKARIGEVLMTTHPTVQALNRLWHDLYEDLVVVD----LGQLL---------------LAQRPL 558
            :.|......::|....|:  |..|......|.:|:    ..||.               ..::..
  Rat   732 KLKVNFLPEIITLSKEVR--NLKWLGFRVPLAIVNKAHQANQLYPFAISLIESVRTYERTCEKVE 794

  Fly   559 DADTVQVFIEKSCADVRDLL------------LNDWLPRCADLMNEMRGTWKDLVPMSGKYGGRA 611
            :.:|:.:.:.....:|:.|:            |:.::.|.|:.:...:....||:.:..|.....
  Rat   795 ERNTISLLVAGLKKEVQALIAEGIALVWESYKLDPYVQRLAETVFNFQEKVDDLLIIEEKIDLEV 859

  Fly   612 AMLFRCI--HSAMSRHLNSLISKSINYLFKVLCAFKGGNRIEKYSMFDAKLKRIPLMTLIASVVG 674
            ..|..|:  |...|..||. :.|:::.|           .:..||.....:.::.:.  |..::|
  Rat   860 RSLETCMYDHKTFSEILNR-VQKAVDDL-----------NLHSYSNLPIWVNKLDME--IERILG 910

  Fly   675 AHFDHEPINMGPGVRPASNIYV-YDEDDAD---PFQQPQVNQFVENVPDIDDVAQFELDHSNK-L 734
                   :.:..|:|..:.:.: ..||.|:   ....|||:......|.|.:|.. ||..:|: :
  Rat   911 -------VRLQAGLRAWTQVLLGQAEDKAEVDMDTDAPQVSHKPGGEPKIKNVVH-ELRITNQVI 967

  Fly   735 YIYPYMQE------------------LPRIFTEHFKSILAVGYEIPRLEFVMSGGEPETKGFLHF 781
            |:.|.::|                  ||||.::.::  :.|.||:...|................
  Rat   968 YLNPPIEECRYKLYQEMFAWKMIVLSLPRIQSQRYQ--VGVHYELTEEEKFYRNALTRMPDGPVA 1030

  Fly   782 IDEDHVDFLELCEKVEQIVKVNWQGVHVYLKPVYKYYFGLFQKLILPMVQKVW---TENNLPELG 843
            ::|.:...:.:..:|||.||| |          .:|             |.:|   .||....||
  Rat  1031 LEESYSAVMGIVTEVEQYVKV-W----------LQY-------------QCLWDMQAENIYNRLG 1071

  Fly   844 AVQELLKKLQAV----------SDTTYYLRDFIP-----------LNLFMLDNRHVKLSLRMYVR 887
               |.|.|.||:          .|.....::|.|           :|| ..|:.| |..|..:.:
  Rat  1072 ---EDLSKWQALLVQIRRARGTFDNAETKKEFGPVVIDYGKVQSKVNL-KYDSWH-KEVLSKFGQ 1131

  Fly   888 EIYDFIIDFYKALNWNENRAICEELEEMSMKAGERPEETPEVVALQNYINDCREMRIFAIKDEIK 952
            .:...:.:|:..::.:.     :|||:.|:...    .|.:.|....|:.        ::|.:||
  Rat  1132 MLGSNMTEFHSQISKSR-----QELEQHSVDTA----STSDAVTFITYVQ--------SLKRKIK 1179

  Fly   953 NVLKRVVFLLTHTYLSSDELHLNSRTFILP----------GELEEVLDLSAARLAVVRD---NLE 1004
            ...|:|     ..|.:...| |..:.|..|          ||.....|:...:.:.::.   ||:
  Rat  1180 QFEKQV-----ELYRNGQRL-LEKQRFQFPPSWLYIDNIEGEWGAFNDIMRRKDSAIQQQVANLQ 1238

  Fly  1005 LAL-RERRMEFEKLLAQEKRTMD-------------GFRIREIRDVLTL------------EELK 1043
            :.: :|.|       |.|.||.|             ..|..|....||:            |:..
  Rat  1239 MKIVQEDR-------AVESRTTDLLTDWEKTKPVTGNLRPEEALQALTIYEGKFGRLKDDREKCA 1296

  Fly  1044 ERVDTVDLLFTTIENLSREAKAINTEETLLQIDVSAFPLLAEIIEKMEPIEKLWKTSYEFEKDYL 1108
            :..:.::|..|.:.:.|.|...:..||            |.::......:.|:|:...:.::...
  Rat  1297 KAKEALELTDTGLLSGSEERVQVALEE------------LQDLKGVWSELSKVWEQIDQMKEQPW 1349

  Fly  1109 IWMFERFECLNADGVREQVENMHKIMYKLSRQLAYNPVAKRAAEQMRMKIEKFRVYLPVLDSICR 1173
            :.:..|....|.||:..|::|...   :|.:..:|..|.:.....|::.:        ::..:..
  Rat  1350 VSVQPRKLRQNLDGLLNQLKNFPA---RLRQYASYEFVQRLLKGYMKINM--------LVIELKS 1403

  Fly  1174 HGLEKRHWDQISKILGRKVN---PKLFPTLKDMIDVDIMSILPQLEEIANAAGKEYDLNNGLRIM 1235
            ..|:.|||.|:.|.|  .||   .:|  ||..:.|||:......::::...|..|..|...|:.:
  Rat  1404 EALKDRHWKQLMKRL--HVNWVVSEL--TLGQIWDVDLQKNEAIVKDVLLVAQGEMALEEFLKQI 1464

  Fly  1236 QADWRDVMFEVLQYRDSDTHILASLDDIQTLLDDHIMRTQAMKRSPFITALGSKADDWEARLLLI 1300
            :..|.....:::.|::. ..::...||:...:.:||....|||.||:.......|..||.:|..|
  Rat  1465 REVWNTYELDLVNYQNK-CRLIRGWDDLFNKVKEHINSVSAMKLSPYYKVFEEDALSWEDKLNRI 1528

  Fly  1301 QNIIDAWTQVQITWMYLEPIFS-SEDIMRQMPLEGRNFKAVDKLWRKIMKHTLKDRHVMAATEYP 1364
            ..:.|.|..||..|:|||.||: |.||...:|:|.:.|:::...:..:||...|...||......
  Rat  1529 MALFDVWIDVQRRWVYLEGIFTGSADIKHLLPVETQRFQSISTEFLALMKKVSKSPLVMDVLNIQ 1593

  Fly  1365 EMLEVFTKAIEDLETVTKGLNTYLEQKRLFFARFFFLSNDELLEILSETKDPMRVQPHLRKCFEG 1429
            .:.....:..:.|..:.|.|..|||::|..|.||:|:.:::||||:..:|:..::|.|.:|.|.|
  Rat  1594 GVQRSLERLADLLGKIQKALGEYLERERSSFPRFYFVGDEDLLEIIGNSKNVAKLQKHFKKMFAG 1658

  Fly  1430 IGSLTFDDNMEIVEMVSDEEERVALVR---------KINPQLANGLVEMWLKEVEMVMLDSVKEQ 1485
            :.|:..:::..:|..:|..|....:.:         |||..|.  |||   ||:.:.:...:.|.
  Rat  1659 VSSIILNEDSSVVLGISSREGEEVMFKTPVSITEHPKINEWLT--LVE---KEMRVTLAKLLAES 1718

  Fly  1486 MREAWEDYAMVER------ISWVVSWPGQVVQGISCMAWTYEVEEAI-------ETKELPAYLEK 1537
            :.|. |.:.....      |:|:..:..|:|...:.:||:..||.|:       :...|.:.|  
  Rat  1719 VTEV-EIFGKATSIDPNTYITWIDKYQAQLVVLSAQIAWSENVENALSNVGGGGDVGPLQSVL-- 1780

  Fly  1538 SNLQI-----ADLVQLVRTDLQAGVRIAVEALIVLDVHDRDVVKYLTDCRITNIQDFDWISQLRY 1597
            ||:::     ||.|.:.:..|:   |..:|.||...||.|||.:.|...:|.|.:.|:|:||:|:
  Rat  1781 SNVEVTLNVLADSVLMEQPPLR---RRKLEHLITELVHQRDVTRSLIKSKIDNAKSFEWLSQMRF 1842

  Fly  1598 YWKVNEKNED---WVCVSMVVTDVEYGMEYLGNLPRLVVTPLTDRCYRTLMGALKLCLGGAPEGP 1659
            |:  :.|..|   .:.:.|......||.||||...:||.||||||||.|:..||:..|||:|.||
  Rat  1843 YF--DPKQTDVLQQLSIQMANAKFNYGFEYLGVQDKLVQTPLTDRCYLTMTQALEARLGGSPFGP 1905

  Fly  1660 AGTGKTETCKDLAKAVAKKCVVFNCSDGLDYKALGKFFKGLAQSGAWACFDEFNRIELEVLSVVA 1724
            |||||||:.|.|...:.:..:||||.:..|::|:|:.|.||.|.|||.|||||||:|..:||.|:
  Rat  1906 AGTGKTESVKALGHQLGRFVLVFNCDETFDFQAMGRIFVGLCQVGAWGCFDEFNRLEERMLSAVS 1970

  Fly  1725 QQILTIQRAIGRKVVKFFFEDT-----------MLKLDPTCSIFITMNPGYAGRTELPDNLKVLF 1778
            ||:..||.|: |:.....::.|           .:|:.|..:||||||||||||:.||||||.||
  Rat  1971 QQVQCIQEAL-REHSNPNYDKTSAPITCELLNKQVKVSPDMAIFITMNPGYAGRSNLPDNLKKLF 2034

  Fly  1779 RTVAMMVPDYAMIGEITLYSNGFDMARNLSQKIVQAYKLCSEQLSSQSHYDYGMRAVKSVLLASA 1843
            |::||..||..:|.::.|||.||..|..|:.|||..:|||.||||||||||:|:||:||||:::.
  Rat  2035 RSLAMTKPDRQLIAQVMLYSQGFRTAEVLANKIVPFFKLCDEQLSSQSHYDFGLRALKSVLVSAG 2099

  Fly  1844 SLRR---------------------LYVDLPEPEIVLRAIVDVNLPKFLEQDISLFIGIYMDLFP 1887
            :::|                     :..:|||.||:::::.:..:||.:.:||.|...:..|:||
  Rat  2100 NVKRERIQKIKREKEERGEAVDEGEIAENLPEQEILIQSVCETMVPKLVAEDIPLLFSLLSDVFP 2164

  Fly  1888 GVELPMPQRGD----------ILKWLHINLADRNLQATPWYLEKILQIYEMLLVRHGLMIVGGSM 1942
            ||:.   .||:          :.:.:::...|.......| :||:||:|::..:.||||:||.|.
  Rat  2165 GVQY---HRGEMTALREELKKVCQEMYLTYGDGEEVGGMW-VEKVLQLYQITQINHGLMMVGPSG 2225

  Fly  1943 GGKTTAYQVLAQTLRNVSTDEEATLKEFPVTFRIINPKAITMGQLYGRFDPVSHEWYDGVLAKTF 2007
            .||:.|::||.:.|..:...|...        .||:||||:...|||..||.:.||.||:.....
  Rat  2226 SGKSMAWRVLLKALERLEGVEGVA--------HIIDPKAISKDHLYGTLDPNTREWTDGLFTHVL 2282

  Fly  2008 REQVQGPKGE---RAWVMFDGPVDAVWIENLNTVLDDNKKLCLMSGEIMQMTKLMNMMFEPADLE 2069
            |:.:...:||   |.|::|||.||..|:||||:||||||.|.|.:||.:.:...:.:|||..||:
  Rat  2283 RKIIDNVRGELQKRQWIVFDGDVDPEWVENLNSVLDDNKLLTLPNGERLSLPPNVRIMFEVQDLK 2347

  Fly  2070 QASPATVSRCGMIYMEPSQLGWRALHKSFINVLVNKVGLGDIYMTLFED---------------- 2118
            .|:.||||||||::.....|....:..:|:      ..|..|.:...||                
  Rat  2348 YATLATVSRCGMVWFSEDVLSTDMIFNNFL------ARLRSIPLDEGEDEAQRRRKGKEDEGEEA 2406

  Fly  2119 -------------------MTEWLVPAALEFLPQCKQMLELSPIYQYQTFSRFF--LH------- 2155
                               .:..||..|||...:.:.:::|:   :.:.....|  ||       
  Rat  2407 ASPMLQIQRDAATIMQPYFTSNGLVTKALEHAFKLEHIMDLT---RLRCLGSLFSMLHQACRNVA 2468

  Fly  2156 -FLEKHKQFN------QAWFQQMFLFCFAWAYCSALTGQGQKTFDALLRKVIYGSNENFPKPKYF 2213
             :...|..|.      :.:.|:..::...|    :|:|..:....|.|.:.|.... ..|.|.  
  Rat  2469 QYNANHPDFPMQIEQLERYIQRYLVYAILW----SLSGDSRLKMRAELGEYIRRIT-TVPLPT-- 2526

  Fly  2214 SLNRGQMFPEKLLFLDYRFDEAENWWTWQKSDDSASTTSNFPENAQISELIVPTKET----GYIS 2274
                    ...:..:||....:..|..||.........::   .....:::|||.:|    ..:.
  Rat  2527 --------APNIPIIDYEVSISGEWSPWQAKVPQIEVETH---KVAAPDVVVPTLDTVRHEALLY 2580

  Fly  2275 YWQEFCISKSYAMLVVGPTGTGKSAIITSNLLAMPKFANLVNVINFSARTSAQMVQDTIMSKLDR 2339
            .|    :::...:::.||.|:||:..:.|.|.|:|...  |..:|||:.|:.:::..|.....:.
  Rat  2581 TW----LAEHKPLVLCGPPGSGKTMTLFSALRALPDME--VVGLNFSSATTPELLLKTFDHYCEY 2639

  Fly  2340 RRKG---VFGP-SLGKKCTVFCDDVAMPSKDTYGSQAPLELLRTWLDHGYWSDLVDTT--KIELV 2398
            ||..   |..| .|||...:|||::.:|..|.||:|..:..:|..::||.:....|.|  |:|.:
  Rat  2640 RRTPNGVVLAPVQLGKWLVLFCDEINLPDMDKYGTQRVISFIRQMVEHGGFYRTSDQTWVKLERI 2704

  Fly  2399 DMTLMCAMGTLGGSNFIFPRLYRHMFVVAVDSFEDSTIVRIFTTIGDWHFSKGYPEKVALL---S 2460
            .....|...|..|...:..|..||:.||.||....:::.:|:.|     |::.....:..|   :
  Rat  2705 QFVGACNPPTDPGRKPLSHRFLRHVPVVYVDYPGPASLTQIYGT-----FNRAMLRLIPSLRTYA 2764

  Fly  2461 RGLSEAMVSVYRDAIRSFLPTPAKSHYSFSLRDITRVFQGI--VMVPPKRMPDPEKLGRLWAHET 2523
            ..|:.|||..|..:...| ....:.||.:|.|::||..:||  .:.|.:.:| .|.|.|:||||.
  Rat  2765 EPLTAAMVEFYTMSQERF-TQDTQPHYIYSPREMTRWVRGIFEALRPLETLP-VEGLIRIWAHEA 2827

  Fly  2524 YRVFYDRLVDQQDR---DRLLVMAVDACKSNLRFPLEQAFGERIEPGEKLTDNDLRNLFYGNYME 2585
            .|:|.||||:.::|   |..:.|.  |.|   .||       .|:..:.::    |.:.|.|::.
  Rat  2828 LRLFQDRLVEDEERRWTDENIDMV--ALK---HFP-------NIDKEKAMS----RPILYSNWLS 2876

  Fly  2586 PDAEPKFYDEGDTYEKLEKLMKYYLREYNSFSSTPMDLVMFRFAIEHVSRVSRVLQMPRGNILMV 2650
            .|..|...:|...|.| .:|..:|..|.:      :.||:|...::||.|:.|:.:.|:|::|::
  Rat  2877 KDYIPVDQEELRDYVK-ARLKVFYEEELD------VPLVLFNEVLDHVLRIDRIFRQPQGHLLLI 2934

  Fly  2651 GMGGSGRRSSARLAAYIADCRLMTVQVSKSYTITDWRDDLKKILMSASFNLNHTVFLFSDAQATD 2715
            |:.|:|:.:.:|..|::....:..::|.:.||..|:.:||:.:|..:........|:..::...|
  Rat  2935 GVSGAGKTTLSRFVAWMNGLSVYQIKVHRKYTGEDFDEDLRTVLRRSGCKNEKIAFIMDESNVLD 2999

  Fly  2716 EGYVEDINGILNTGDLPNLYQLEDKATIMENMANVAKQLGKILDTLPSEVYAYYIDRIREQLHIA 2780
            .|::|.:|.:|..|::|.|::.::.||:|......|::.|.:||: ..|:|.::..::...||:.
  Rat  3000 SGFLERMNTLLANGEVPGLFEGDEYATLMTQCKEGAQKEGLMLDS-HEELYKWFTSQVIRNLHVV 3063

  Fly  2781 LAFSPIGDSFKERIRVYPSLINCCTIDWYMPWPEEALSRVGVYFVSSMNLNRPHGEETQEPVQSK 2845
            ...:|..:..|:|....|:|.|.|.::|:..|..|||.:||..|.|.|:|.:|            
  Rat  3064 FTMNPSSEGLKDRAATSPALFNRCVLNWFGDWSTEALYQVGKEFTSKMDLEKP------------ 3116

  Fly  2846 DAADPDEEEVRRETVGVEREQTQLEADLVDCVMYFHQSVVDASEKCYLELNRRNYVTPSAYLELL 2910
            :...||...|..:.  :.:..|..||.:..|| :.||::..|:.:......|...:||..||:.:
  Rat  3117 NYIVPDYMPVVYDK--LPQPPTHREAIVNSCV-FVHQTLHQANARLAKRGGRTMAITPRHYLDFI 3178

  Fly  2911 KAFRTFYTRKLDEITRLRDRYTTGLEKLDFAAGQVGEMQTNLYDLQPKLKVLSEETDRIMVNIER 2975
            ..:...:..|..|:...:.....||.|:.....||.|::.:|.....:|:|.:...:..:..:.:
  Rat  3179 NHYANLFHEKRSELEEQQMHLNVGLRKIKETVDQVEELRRDLRIKSQELEVKNAAANDKLKKMVK 3243

  Fly  2976 ETAEAEKKK--------------EVVGADEAAANEAAAAAQAIKDDCETDLAEAIPAMEAALEAL 3026
            :..||||||              ||:...:.:..|              ||.:..||:..|..|:
  Rat  3244 DQQEAEKKKVMSQEIQEQLHKQQEVIADKQMSVKE--------------DLDKVEPAVIEAQNAV 3294

  Fly  3027 NTLKPADIFIVKSMKNPPYGVKLTMEAVCVIRGIKPDRKPDPSGHMVEDYWGPSMRMLSDMKFLD 3091
            .::|...:..|:||.|||..|||.:|::|::.|   :...|         |.....::....|:.
  Rat  3295 KSIKKQHLVEVRSMANPPAAVKLALESICLLLG---ESTTD---------WKQIRSIIMRENFIP 3347

  Fly  3092 SLKTFDKDNIPPPIIKRIREKYIADRDFVPEKIKAASMACEGICRWVRAMDVYDKVARIVMPKKA 3156
            ::..|..:.|...|.:::::.|:::..:..|.:..||:||..:.:|..|...|..:.:.|.|.:.
  Rat  3348 TIVNFSAEEISDAIREKMKKNYMSNPSYNYEIVNRASLACGPMVKWAIAQLNYADMLKRVEPLRN 3412

  Fly  3157 ALAEAEGELSQQMEKLNAKRAELQVILDKLQKLNDFFAEKSREKKRLEDEIDNCEKKLNRAEKLL 3221
            .|.:.|.:.....:|.|.....::.:...:.:..:.:|....|.:.::.::...|.|:||:..||
  Rat  3413 ELQKLEDDAKDNQQKANEVEQMIRDLEASIARYKEEYAVLISEAQAIKADLAAVEAKVNRSTALL 3477

  Fly  3222 GGLGGEKTRWSEAAKNLHESISNIVGDVLLAGGCTAYLGYFTTEYRVNILDDWNALCKRKHIPSS 3286
            ..|..|:.||.:.::.....:|.|.||.||:....||.|||..:.|.|:...|:...::.:|...
  Rat  3478 KSLSAERERWEKTSETFKNQMSTIAGDCLLSAAFIAYAGYFDQQMRQNLFTTWSHHLQQANIQFR 3542

  Fly  3287 ETFSLATTLGHPMTIRAWSLAGLPADNFSVENGIIVTNSSRYSLLIDPQVQANKWIKNMEKNNNL 3351
            ...:....|.:......|..:.||||:...||.|::...:||.|:|||..||.::|.|..|:..:
  Rat  3543 TDIARTEYLSNADERLRWQASSLPADDLCTENAIMLKRFNRYPLIIDPSGQATEFIMNEYKDRKI 3607

  Fly  3352 KVIKQSDANYMQVLELAITFGQPVLIENVGEKLDSNLTPILEKNVIKHKGGLFIKSGDQMIEYNP 3416
            ......|..:.:.||.|:.||.|:|:::| |..|..|.|:|.:.|.:..|.:.|..|||.|:.:|
  Rat  3608 TRTSFLDDAFRKNLESALRFGNPLLVQDV-ESYDPVLNPVLNREVRRTGGRVLITLGDQDIDLSP 3671

  Fly  3417 NFRLYITTCLRNP--RYPPEVMVMVTVLNFMITEQGLREQLLAIVVAHERPDLQEKKEQLIIESA 3479
            :|.::::|  |:|  .:||::...||.:||.:|...|:.|.|..|:..||||:.||:..|:....
  Rat  3672 SFVIFLST--RDPTVEFPPDLCSRVTFVNFTVTRSSLQSQCLNEVLKAERPDVDEKRSDLLKLQG 3734

  Fly  3480 RNRDALYTIESKILEVLSTSEGNVLEDENAINILSSSKILSEDIQEKQVIAVATEI---EIDAAR 3541
            ..:..|..:|..:|:.|:..:|.:|:|:..|..|.:.|..:.::..|   ...|:|   |::...
  Rat  3735 EFQLRLRQLEKSLLQALNEVKGRILDDDTIITTLENLKREAAEVTRK---VEETDIVMQEVETVS 3796

  Fly  3542 QQYIPVSKHSAILFFCISELANVDPMYQYSLSWFLNLFVNTILKAPKSDQLSERLKNLNDYFTKS 3606
            |||:|:|...:.::|.:..|..|..:|||||.:||:::.|.:.:.|.....::..:.|: ..||.
  Rat  3797 QQYLPLSTACSSIYFTMESLKQVHFLYQYSLQFFLDIYHNVLYENPNLKGATDHTQRLS-VITKD 3860

  Fly  3607 I----YTNVCRSLFEKDKLVISLVMCLGILVSQGRVEK----AALLFFLTGGIGYKTIPPNPLGA 3663
            :    :..|.|.:..:|.  |:..|.|..:..:|.:.:    |....||.|.....:....|...
  Rat  3861 LFQVAFNRVARGMLHQDH--ITFAMLLARIKLKGTMGEPTYDAEFQHFLRGKEIVLSAGSTPKVQ 3923

  Fly  3664 WLPDKSWASVCKAADLEGLKNLPQMMETYSDEWHNFY-DASNPDQLQLP------APHNTVND-M 3720
            .|..:...:|.:.:.|...|:|  :.:..:||....: ::|:|:| .:|      .|...:.. :
  Rat  3924 GLTVEQAEAVARLSCLPAFKDL--IAKVQADEQFGIWLESSSPEQ-TVPYLWTEETPATPIGQAI 3985

  Fly  3721 YFLIVIKSLRPDKLVPAVRAFITRNLDRSF--VEPPPFDLAASF-ADSSPKIPLVFLLSAGSDPM 3782
            :.|::|::.|||:|:.....|::.||..||  :...|.||.... .:..|..|::.....|.|..
  Rat  3986 HRLLLIQAFRPDRLLAMAHMFVSTNLGESFMSIMEQPLDLTHIVGTEVKPNTPVLMCSVPGYDAS 4050

  Fly  3783 ASLFMFAKQRNMYDKLKTISLGQGQG-PRAEKMIMEAARHGQWVVLQNCHVAISWMGDLER---- 3842
            ..:...|.::|  .::.:|::|..:| .:|:|.|..|.:.|:||:|:|.|:|..|:..||:    
  Rat  4051 GHVEDLAAEQN--TQITSIAIGSAEGFNQADKAINTAVKSGRWVMLKNVHLAPGWLMQLEKKLHS 4113

  Fly  3843 ----ICNDTTLTDGANHDYRLWCTSYPSAVFPVSVLQNSVKMTNEPPKGLRANMHRSFTSDPLMR 3903
                .|            :||:.|...:...||::|:.......|||.|::|||.|:|:|.|:.|
  Rat  4114 LQPHAC------------FRLFLTMEINPKVPVNLLRAGRIFVFEPPPGVKANMLRTFSSIPVSR 4166

  Fly  3904 DKFFTNAFLFSDSANKCWLRGVFALVFFHAVVQERREFGPLGWNIPYEFNESDLKISLLQLKMFI 3968
                     ...|.|: ..|..|.|.:||||:|||..:.||||:..|||.||||:.:...:..::
  Rat  4167 ---------MCKSPNE-RARLYFLLAWFHAVIQERLRYAPLGWSKKYEFGESDLRSACDTVDTWL 4221

  Fly  3969 NQS---------QSIPFRGHVYLTGECNYGGRVTDDKDRRLILSLLNMIYNPNTIE-EDNYALSQ 4023
            :.:         ..||:.....|..:..|||||.::.|:||:.:.|..::...:.: |...|...
  Rat  4222 DDTAKGRQNISPDKIPWSALKTLMAQSIYGGRVDNEFDQRLLNTFLERLFTTRSFDSEFKLACKV 4286

  Fly  4024 SG--TYRVPLSPTRLNSIEYVSSFPLSPHPEVYGLHENADINRNVKETNALISGVLLTQ--TDLM 4084
            .|  ..::|....|...:::|...|.:..|...||..||:             .||||.  .|::
  Rat  4287 DGHKDIQMPDGIRREEFVQWVELLPDAQTPSWLGLPNNAE-------------RVLLTTQGVDMI 4338

  Fly  4085 ASVKASSSGGAKEDPAIAICKQVLKQLPEEFNIDEVSKTYP----VIYTNSMN------------ 4133
            :.:........::|.|.|       :..::...|..|...|    .::|.:.|            
  Rat  4339 SKMLKMQMLEDEDDLAYA-------ETEKKTRTDSTSDGRPAWMRTLHTTASNWLHLIPQTLSPL 4396

  Fly  4134 --TV--LRQELIRF--------NRLLSYIRKSLVNVGKAVVGQIAMIPELERTHASMVIGKLPAD 4186
              ||  ::..|.||        .:||..:|:.|.:|.:...|:......|......:|.|.||..
  Rat  4397 KRTVENIKDPLFRFFEREVKMGAKLLQDVRQDLADVVQVCEGKKKQTNYLRTLINELVKGILPRS 4461

  Fly  4187 WLKKSYPSLKPLGSYVSDLLARLAFFQEWIDNG---------EPMVYWISGFYFTQSFITGVLQN 4242
            |...:.|:...:..:|||...|:...|. |...         :.:...:.|.:..:::||...|.
  Rat  4462 WSHYTVPAGMTVIQWVSDFSERIKQLQN-ISQAAAAGGAKELKNIHVCLGGLFVPEAYITATRQY 4525

  Fly  4243 YSRKNRFQIDMILIEFAVTKFEVQVPGTPDIGAYIRGIFIEGARWNRKTKEVDESFSKVLFDTLP 4307
            .::.|.:.::.:.:|..||..:.........|  :.|:.::||..:.....:..:.|.|    ||
  Rat  4526 VAQANSWSLEELCLEVNVTASQSTTLDACSFG--VTGLKLQGATCSNNKLSLSNAISTV----LP 4584

  Fly  4308 VIYLRPVLKALEDLPRSTAGGEPETIYDCPVYKTSERRGVLSTTGHSTNFVMYLQLRCSRKPMHW 4372
            :..||        ..:.|:..:..::...|||....|..::        |.:..::.....|..:
  Rat  4585 LTQLR--------WGKQTSAEKKASVVTLPVYLNFTRADLI--------FTVDFEIATKEDPRSF 4633

  Fly  4373 INRGTACLC 4381
            ..||.|.||
  Rat  4634 YERGVAVLC 4642

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dnah3NP_647937.2 DHC_N2 1083..1489 CDD:462462 104/418 (25%)
DYN1 <1322..4005 CDD:227570 814/2883 (28%)
AAA_6 1620..1946 CDD:463697 157/367 (43%)
AAA_9 3302..3523 CDD:463702 73/222 (33%)
Dynein_C 4067..4381 CDD:465677 65/352 (18%)
Dync1h1NP_062099.3 Stem. /evidence=ECO:0000250 2..1865 384/1908 (20%)
DHC_N1 240..830 CDD:462457 115/680 (17%)
Interaction with DYNC1I2. /evidence=ECO:0000269|PubMed:10893223 446..701 54/318 (17%)
Interaction with DYNC1LI2. /evidence=ECO:0000269|PubMed:10893223 649..800 29/169 (17%)
DYN1 1044..4327 CDD:227570 954/3549 (27%)
AAA 1. /evidence=ECO:0000250 1866..2097 124/231 (54%)
AAA 2. /evidence=ECO:0000250 2178..2450 87/289 (30%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2389..2409 2/19 (11%)
AAA 3. /evidence=ECO:0000250 2554..2803 68/263 (26%)
AAA 4. /evidence=ECO:0000250 2897..3166 74/290 (26%)
Stalk. /evidence=ECO:0000250 3187..3498 72/336 (21%)
AAA 5. /evidence=ECO:0000250 3551..3780 74/231 (32%)
AAA 6. /evidence=ECO:0000250 4003..4219 73/239 (31%)
Dynein_C 4331..4642 CDD:465677 62/340 (18%)

Return to query results.
Submit another query.