DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dnah3 and Dnah17

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_647937.2 Gene:Dnah3 / 38586 FlyBaseID:FBgn0035581 Length:4385 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038943439.1 Gene:Dnah17 / 287845 RGDID:1563805 Length:4459 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4734 Identity:1338/4734 - (28%)
Similarity:2186/4734 - (46%) Gaps:869/4734 - (18%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    28 LH-LPRVSQAQKKGEKRQLNDCPFYNLTYGFDQLPLDPVKEFLQEKISHMQTDKIVGHCNREFDF 91
            || ||||        :.:..|....||             :.:.|:::..:.:|||         
  Rat   217 LHPLPRV--------EFEFWDARLMNL-------------QCIHEQLNRPKVNKIV--------- 251

  Fly    92 HRYDLDNVKDEYDECDDDSLQEL---------QLEDIIMPEQFEMLRDAKDHLYNFDSTACNQFP 147
                  .:.::...|...:||.:         :..||::  ..:.||...:.:...|.|....| 
  Rat   252 ------EILEKAKSCYWPALQNVYMNVTQGLKEANDIVL--YLKPLRILLEEMEQADFTVLPSF- 307

  Fly   148 WIDK--------WMTG------------VRPSEQEIYEMTSHLL---EIYCNRRVRIFYPGCGTS 189
             |.|        |.|.            :|....:|.|||...|   |:....:..|.....|.|
  Rat   308 -IVKVLSTICFIWATSEHYNTPSRVIVILREFSNQIIEMTRTYLSPEEVLKGLQGEIEEVLGGIS 371

  Fly   190 SSLWTNQLRRQHGSPSELIGAYRTPSARHMRVNNMRGPPKKEKFTAGDHYA-------------- 240
            .|:         |...||..||....| :|::.....||...:|.:...::              
  Rat   372 QSV---------GVLKELFHAYDFCCA-NMKLFFKDRPPVPWEFPSSLAFSRMNAFFHRVQTIED 426

  Fly   241 -FRTPQE-CRNELMRVG------------KIIDELIEPVLKAAEHKIGHGLTKY----PDPPSCK 287
             ::|..| .:.|.:.:|            :|.||:.|.|...||       .||    |...|..
  Rat   427 LYKTAIEFLKLEKIELGGVRGNILGNLVTQIYDEVFELVKVFAE-------CKYDPLDPGDSSFD 484

  Fly   288 DNTNRILRSAGILVGKKKNCYVGKCRIHRKDFATNEEFLRCLKRMEATHF--------------- 337
            |:.|                          ||.|.   ::.|.|..||.|               
  Rat   485 DDYN--------------------------DFETK---IQDLDRRLATIFCQAFDDCNCIESSAK 520

  Fly   338 -PYM------QPLQPVDPDDQKIKMLAKYRVELARAEKLF------------------------- 370
             .||      :||..|:...:...||..:..||..|:.::                         
  Rat   521 LLYMCGGLLERPLILVEVVPRYSVMLEMFNTELDNAKLMYDAQMAASEDGQIPPIHKNMPPVAGQ 585

  Fly   371 ---TLKIQKRYQCLLKSMSIVQLATYPSHLIRKAFRRINPRSALLQDAYQFIV--------KEKR 424
               :|::|:|.:..:|         |..|:.......:..:  |:.|.|..::        |:.:
  Rat   586 LKWSLELQERLEVSMK---------YLKHIDHPVMSSVEAK--LVYDKYDEMIGLLKGYREKKYQ 639

  Fly   425 DWPKLPPEVILMDYLFVGDRGVRQDLAILIIVCLIDL------QEDFRHYVKRSFLNYLLSSNME 483
            .|.:                ||.||       |..:|      ::.|...::.:|...|::...|
  Rat   640 QWVE----------------GVDQD-------CHFNLGQPLIQRDPFSSLIQVNFSKALVAVLRE 681

  Fly   484 RRRLQLEREPPEFP----------------ILTISPPVSWRSNLLRGKARIGEVLMTTHPTVQAL 532
            .:.|..::: .|.|                :..:...|.|.:.:   |..:.||   ..|.::: 
  Rat   682 VKYLNFQQQ-KEIPSSAEKLFSENEIFRKFVGNLELIVGWYNEI---KTTVMEV---EFPLIKS- 738

  Fly   533 NRLWHDLYEDLVVVDLGQLLLAQRPL--DADTVQVFIEKSCADVRDLLLNDWLPRCADLMNEMRG 595
                     :|..:|: :|:.|:..|  :.:.|..:|:    ::|::|.|        |.|.::.
  Rat   739 ---------ELEEIDV-KLMSAETTLFWNGENVMEYIQ----EMREILHN--------LQNRIQK 781

  Fly   596 TWKDLVPMSGKYGGRAAMLFRCIHSAMSR-HLNSLISKSINYLFKVLCAFKG--GNRIEKY-SMF 656
            |.:::               ..|..||.. ..|.|..:..|.. :.|....|  .|..::| ::.
  Rat   782 TKQNI---------------EGITQAMQEWSANPLFERKDNKK-EALLDLDGRVANLNKRYAAVK 830

  Fly   657 DAKLKRIPLMTLIASVVGAHFDHEP----INMGPGVRPASNIYVYDEDDADPFQQPQVNQFVENV 717
            ||.::...::|..|.:..|....:|    :|.         |.....|:.|.|.:..:|..::|:
  Rat   831 DAGVRIQAMVTENAELFKADTTSQPWKDYVNY---------IDAMVLDEFDRFIRKSLNYLMDNM 886

  Fly   718 PDIDDVA-----QFELDHSNKLYIYPYMQELPRIFTEHFKSILA--------VGYEIPRLEFVMS 769
            ...:::|     :.|||... |...|.::....   :.|.|::.        |...||||     
  Rat   887 TMDENIAPLFEIRMELDEDG-LTFNPTLEMGDE---DSFLSLIEGLINDLYNVARLIPRL----- 942

  Fly   770 GGEPETKGFLHFID--EDHVDFLELCEKVEQIVKVNWQGVHVYLKPVYKYYFGLFQKLILPMVQK 832
                 .||.:::..  ||..|.:|:.|::..:|....:....|.....:|.:             
  Rat   943 -----AKGRINYKSDLEDITDLIEMREELSSLVIGAMKVAEEYQDSFERYSY------------- 989

  Fly   833 VWTENNLPELGAVQELLKKLQAVS--------DTTYYLRDFIPLNLFMLDNRHVKLSLRMYVREI 889
            :|.::       :||.:|......        ||.  :.|.||         ..:.:|..:.:: 
  Rat   990 LWVDD-------LQEFMKNFLIFGHAPTPEELDTK--IDDTIP---------KTQPTLAQFQQQ- 1035

  Fly   890 YDFIIDFYKALNWNENRAICEELEEMSMKAGERPEETPEVVALQNYIN-DCREMRIFAIKDEIKN 953
                ||.|:.|           .||:|     |.|.|.   ....::. |||     ..|..:.|
  Rat  1036 ----IDSYEKL-----------YEEVS-----RCENTK---VFHGWLQCDCR-----PFKQALLN 1072

  Fly   954 VLKRVVFLLTHTYLSSDELHLNSRTFILPGELEEVLDLSAARLAVVRDNLELALRERRMEFEKLL 1018
            .:|| ..||...|||.   |:          :..:.||.:. :.|.|..|:..|:|.  :::.|:
  Rat  1073 TIKR-WSLLFKRYLSD---HV----------INSLADLESF-MGVTRTGLKKPLKEG--DYDGLV 1120

  Fly  1019 AQEKRTMDGFRIREIRDVLT---LEELKERVDTVDLLFTTIENLSREA---------KAINTEET 1071
            ......|   :::| |.|.|   .|.||:   |::||.:..|.:..|.         :..||::.
  Rat  1121 EVMGHLM---KVKE-RQVATDSMFEPLKQ---TIELLKSYGEEMPEETYLKLQELPEQWTNTKKL 1178

  Fly  1072 LLQIDVSAFPLLAEII----EKMEPIE-KLWKTSYEFEKD--YLIWMFERFECLN--------AD 1121
            .:|:..:..||.|..:    .|.:..| |..:...:|.:|  :.....:.::.||        .:
  Rat  1179 AIQVKQNVAPLQANEVNILRRKCQQFELKQHEFREKFRRDAPFTFSDPDPYKSLNKQQKSISAME 1243

  Fly  1122 GVRE-----------------QVENMHK------------IM-------YKLSRQLAYNPVAKRA 1150
            ||.|                 |::..||            :|       :|.::....|      
  Rat  1244 GVMEALCKSGSLFEVTVPDYKQLKACHKEVRLLKELWDMIVMVNTSIDDWKTTKWKDIN------ 1302

  Fly  1151 AEQMRMKIEKFRVYLPVLD---------------------------SICRHGLEKRHWDQISKIL 1188
            .|||.:..:||...:..||                           .:....:.:|||.|:.:..
  Rat  1303 VEQMDIDCKKFAKDVRSLDKEMKAWDAFVGLDNTVKNMITSLRAVSELQNPAIRERHWQQLMQAT 1367

  Fly  1189 GRKVNPKLFPTLKDMIDVDIMSILPQLEEIANAAGKEYDLNNGLRIMQADWRDVMFEVLQYRDSD 1253
            ..|.......||.|::.:::.....::..|.:.|.||..:...|:.:.:.|..:.||...:..:.
  Rat  1368 QVKFEMSEETTLADLLQLNLHKYEDEVRNIVDKAVKESGMEKVLKTLDSTWSTMEFEHELHPRTG 1432

  Fly  1254 THILASLDDIQTLLDDHIMRTQAMKRSPFITALGSKADDWEARLLLIQNIIDAWTQVQITWMYLE 1318
            |.:|.|.:.:...|:|:.::.|.:..|.:::....:...|:.:|....::|..|.:||.||.:||
  Rat  1433 TMLLKSDELLVETLEDNQVQLQNLMMSKYLSHFLKEVTSWQQKLSTADSVISIWFEVQRTWSHLE 1497

  Fly  1319 PIF-SSEDIMRQMPLEGRNFKAVDKLWRKIMKHTLKDRHVMAATEYPEMLEVFTKAIEDLETVTK 1382
            .|| .||||..|:|.:.|.|.::|:.::.:|:..:|..:|:.||..|.:.:...:..:.|....|
  Rat  1498 SIFIGSEDIRAQLPEDSRRFDSIDQEFKALMEDAVKTPNVVEATNKPGLYDKLERLKKSLAVCEK 1562

  Fly  1383 GLNTYLEQKRLFFARFFFLSNDELLEILSETKDPMRVQPHLRKCFEGIGSLTF--DDNMEIVE-- 1443
            .|..|||.|||.|.||:|:|:.:||:|||...||:.|..||.|.|:.:..|.|  |.:...::  
  Rat  1563 ALAEYLETKRLAFPRFYFVSSADLLDILSNGNDPVEVSRHLSKLFDSLCKLKFRLDASGNPIKVG 1627

  Fly  1444 --MVSDEEERVALVRKINPQLANGLVEMWLKEVEMVMLDSVKEQMREAWEDYAMVERISWVVSWP 1506
              |.|.|:|.:...::.:   .:|.||:||..|...|..:::.::.||...|....|..|:..:|
  Rat  1628 LGMYSKEDEYMDFDKECD---LSGQVEVWLNRVLDRMCATLRHEIPEAVVTYEEKPREQWIFDYP 1689

  Fly  1507 GQVVQGISCMAWTYEV-------EEAIETKELPAYLEKSNLQIADLVQLVRTDLQAGVRIAVEAL 1564
            .||....:.:.||.||       ||..| ..:..|.:|...|:..|:.|:..:|.||.|:.:..:
  Rat  1690 AQVALTCTQIWWTTEVGLAFARLEEGYE-NAIKDYNKKQISQLNALITLLIGNLSAGDRMKIMTI 1753

  Fly  1565 IVLDVHDRDVVKYLTDCRITNIQDFDWISQLRYYWKVNEKNEDWVCVSMVV-TDVEYGMEYLGNL 1628
            ..:|||.||||..:...::.:.|.|.|.||||:.|...:|:    |.:.:. ..::|..|||||.
  Rat  1754 CTIDVHARDVVAKMITAKVESSQAFTWQSQLRHRWDEEKKH----CFANICDAQIQYSYEYLGNT 1814

  Fly  1629 PRLVVTPLTDRCYRTLMGALKLCLGGAPEGPAGTGKTETCKDLAKAVAKKCVVFNCSDGLDYKAL 1693
            ||||:||||||||.||..:|.|.:||||.||||||||||.|||.:|:.....|||||:.:|||:.
  Rat  1815 PRLVITPLTDRCYITLTQSLHLIMGGAPAGPAGTGKTETTKDLGRALGTMVYVFNCSEQMDYKSC 1879

  Fly  1694 GKFFKGLAQSGAWACFDEFNRIELEVLSVVAQQILTIQRAIGRKVVKFFFEDTMLKLDPTCSIFI 1758
            |..:|||||:|||.||||||||.:|||||:|.|:..:|.||..|..||.|...|:.|.||..|||
  Rat  1880 GNIYKGLAQTGAWGCFDEFNRISVEVLSVIAVQVKCVQDAIRAKKKKFNFLGEMISLIPTVGIFI 1944

  Fly  1759 TMNPGYAGRTELPDNLKVLFRTVAMMVPDYAMIGEITLYSNGFDMARNLSQKIVQAYKLCSEQLS 1823
            |||||||||||||:|||.|||..||:|||:.:|.||.|.:.||..||.|::|.:..|.||.|.||
  Rat  1945 TMNPGYAGRTELPENLKALFRPCAMVVPDFELICEIMLVAEGFLEARLLARKFITLYTLCKELLS 2009

  Fly  1824 SQSHYDYGMRAVKSVLLASASLRRLYVDLPEPEIVLRAIVDVNLPKFLEQDISLFIGIYMDLFPG 1888
            .|.|||:|:||:||||:.:.||:|......|.::::||:.|.|:||.:..|:.:|:|:..||||.
  Rat  2010 KQDHYDWGLRAIKSVLVVAGSLKRGDPTRAEDQVLMRALRDFNIPKIVTDDLPVFMGLIGDLFPA 2074

  Fly  1889 VELPMPQRGDILKWLHINLADRNLQATPWYLEKILQIYEMLLVRHGLMIVGGSMGGKTTAYQVLA 1953
            :::|..:..:..|.:..::.:..|||...::.|::|:.|:|.|||.:.::|.:..||:...:.|.
  Rat  2075 LDVPRKRDLNFEKIIKQSIVELKLQAEDSFVLKVVQLEELLQVRHSVFVIGNAGSGKSQVLKSLN 2139

  Fly  1954 QTLRNVSTDEEATLKEFPVTFRIINPKAITMGQLYGRFDPVSHEWYDGVLAKTFREQV----QGP 2014
            :|.:|        :|..||... ::|||:|..:|:|..:|.:.||.||:.:...|:..    .||
  Rat  2140 KTYQN--------MKRKPVAVD-LDPKAVTCDELFGIINPATREWKDGLFSTIMRDLANITHDGP 2195

  Fly  2015 KGERAWVMFDGPVDAVWIENLNTVLDDNKKLCLMSGEIMQMTKLMNMMFEPADLEQASPATVSRC 2079
            |    |::.||.:|.:|||:||||:||||.|.|.|.|.:.:.:.|.::||.:.|..|:||||||.
  Rat  2196 K----WIVLDGDIDPMWIESLNTVMDDNKVLTLASNERIPLNRTMRLVFEISHLRTATPATVSRA 2256

  Fly  2080 GMIYMEPSQLGWRALHKSFI---NVLVNKVGLGDIYMTLFEDMTEWLVPAALEFLPQCKQML--- 2138
            |::|:.|:.|||..:..|:|   .|...|..|    :.||:           ::||.|...|   
  Rat  2257 GILYINPADLGWNPVVSSWIERRKVQSEKANL----IILFD-----------KYLPTCLDKLRFG 2306

  Fly  2139 --ELSPIYQYQTFSRFFLHFLE-----------KHKQFNQAWFQQMFLFCFAWAYCSALTGQGQK 2190
              .::|:.:. |..:..|:.||           ..|:.    ::..|:|...||:          
  Rat  2307 FKRITPVPEI-TVIQTILYLLECLLTEKNAPPDSPKEL----YELYFVFACFWAF---------- 2356

  Fly  2191 TFDALLRKVIYGSNENFPKPKYFSLNRGQMFPEKLLFLDYRFDEAENWW---------------- 2239
                                      .|.||.::|  :|||. |...||                
  Rat  2357 --------------------------GGAMFQDQL--IDYRV-EFSKWWINEFKTIKLPSQGTIF 2392

  Fly  2240 ------------TWQKSDDSASTTSNFPENAQISELIVPTKETGYISYWQEFCISKSYAMLVVGP 2292
                        .|.....:.....:.|..|.    :|.|.||..|.|:.:..::|::.:::||.
  Rat  2393 DYYIDPETKKFLPWTDKVPNFELDPDIPLQAS----LVHTTETIRIRYFMDLLMAKAWPVMLVGN 2453

  Fly  2293 TGTGKSAIITSNLLAMPKFANLVNVINFSARTSAQMVQDTIMSKLDRRRKGVFGPSLGKKCTVFC 2357
            .|||||.::...|..:.....||..:.|:..|::.|:|..:...|:::....:||...||...|.
  Rat  2454 AGTGKSVLMGDKLENLSTDDYLVQAVPFNFYTTSAMLQGVLEKPLEKKSGRNYGPPGTKKLIYFI 2518

  Fly  2358 DDVAMPSKDTYGSQAPLELLRTWLDHGYWSDLVDTTKIELVDMTLMCAMGTLGGSNFIFPRLYRH 2422
            ||:.||..|.||:.||..|:|..:||.:|.|....|..::.:...:..|....||..|.|||.||
  Rat  2519 DDMNMPEVDKYGTVAPHTLIRQHMDHRHWYDRQKLTLKDVHNCQYVACMNPTSGSFTIDPRLQRH 2583

  Fly  2423 MFVVAVDSFEDSTIVRIFTTIGDWHFS-KGYPEKVALLSRGLSEAMVSVYRDAIRSFLPTPAKSH 2486
            ..|.||.......::.|:.||...|.| :..|..:..|...|..|.:::::....:||||..|.|
  Rat  2584 FCVFAVSFPGHEALITIYNTILAQHLSYRSAPSVIQRLCSHLVTAALALHQKVAATFLPTAIKFH 2648

  Fly  2487 YSFSLRDITRVFQGIVMVPPKRMPDPEKLGRLWAHETYRVFYDRLVDQQDRDRLLVMAVDACKSN 2551
            |.|:|||::.:||||:....:.:..|..:.|||.||..||:.|::||::|::.|..:.:.:.|  
  Rat  2649 YIFNLRDLSNIFQGILFSTLEILRTPLDIVRLWLHEAERVYGDKMVDEKDQETLRRVTMASTK-- 2711

  Fly  2552 LRFPLEQAFGERIEPGEKLTDNDL--RNLF-----YGNYMEPDAEPKFYDEGDTYEKLEKLMKYY 2609
                             |..| ||  .:||     :.::.:...:||::...|. ..|.||:|..
  Rat  2712 -----------------KFFD-DLGEEHLFAKPNIFCHFTQGIGDPKYFPVTDV-AHLNKLLKDV 2757

  Fly  2610 LREYNSFSSTPMDLVMFRFAIEHVSRVSRVLQMPRGNILMVGMGGSGRRSSARLAAYIADCRLMT 2674
            |..||..::. |:||:|..|:.|:.|::|:|:.||||.|:||:||||::|.:||||||:...:..
  Rat  2758 LDSYNEVNAV-MNLVLFEDAVAHICRINRILESPRGNALLVGVGGSGKQSLSRLAAYISALDVFQ 2821

  Fly  2675 VQVSKSYTITDWRDDLKKILMSASFNLNHTVFLFSDAQATDEGYVEDINGILNTGDLPNLYQLED 2739
            :.:.|.|.|.|.:.||....:.::.....:|||.:|:|..:|.::..||.:|.:|::|.|:..:|
  Rat  2822 ITLKKGYAIPDLKMDLAAQYIKSAVKNVPSVFLMTDSQVAEEQFLVLINDLLASGEIPGLFGDDD 2886

  Fly  2740 KATIMENMANVAKQLGKILDTLPSEVYAYYIDRIREQLHIALAFSPIGDSFKERIRVYPSLINCC 2804
            ...|:.:|....|.|| :.||..: .:.::|:::|:||.:.|.|||:|...:.|.|.:|:::||.
  Rat  2887 LENIISSMRPQVKSLG-MTDTREA-CWKFFIEKVRKQLKVILCFSPVGSVLRVRARKFPAVVNCT 2949

  Fly  2805 TIDWYMPWPEEALSRVGVYFVSSMNLNRPHGEETQEPVQSKDAADPDEEEVRRETVGVEREQTQL 2869
            .|||:..|||:||..|...|:                               :||.|:   |.::
  Rat  2950 AIDWFHEWPEDALVSVSARFL-------------------------------QETQGI---QPEV 2980

  Fly  2870 EADLVDCVMYFHQSVVDASEKCYLELNRR-NYVTPSAYLELLKAFRTFYTRKLDEITRLRDRYTT 2933
            :..:...:.|.|.:|.:.| |.||...|| ||.||..:||.:|.::....:|..|:....:|...
  Rat  2981 KTSISLFMSYVHTTVNEMS-KTYLATERRYNYTTPKTFLEQIKLYQNLLAKKRMELVAKIERLEN 3044

  Fly  2934 GLEKLDFAAGQVGEMQTNLYDLQPKLKVLSEETDRIMVNIERETAEAEKKKEVVGADEAAANEAA 2998
            ||.||...|.||.:::..|...:.:||..:|..|:::..:..||.:..|:|.:...:|.......
  Rat  3045 GLMKLQSTASQVDDLKAKLAVQEAELKQKNENADKLIQVVGVETEKVSKEKAIADEEEIKVEVIN 3109

  Fly  2999 AAAQAIKDDCETDLAEAIPAMEAALEALNTLKPADIFIVKSMKNPPYGVKLTMEAVCVIRGIKPD 3063
            ......:..||||||:|.||:.||.|||:||...::..:||..:||..|.....||.::..    
  Rat  3110 KNVTEKQKACETDLAKAEPALLAAQEALDTLNKNNLTELKSFGSPPDAVVNVTAAVMILTA---- 3170

  Fly  3064 RKPDPSGHMVED-YWGPSMRMLSDM-KFLDSLKTFDKDNIPPPIIKRIREKYIADRDFVPEKIKA 3126
                |.|.:.:| .|..:..|:..: .||||||.|||::||...:|..: .|..:..|.||.|::
  Rat  3171 ----PGGKIPKDKSWKAAKIMMGKVDTFLDSLKRFDKEHIPEACLKAFK-PYQGNPTFDPEFIRS 3230

  Fly  3127 ASMACEGICRW----VRAMDVYDKVARIVMPKKAALAEAEGELSQQMEKLNAKRAELQVILDKLQ 3187
            .|.|..|:|.|    ||..:||..||    ||:.||.||..||::..:||:..:.::..:...|.
  Rat  3231 KSTAAAGLCSWCINIVRFYEVYCDVA----PKRQALEEANAELAEAQDKLSRIKNKIAELNANLN 3291

  Fly  3188 KLNDFFAEKSREKKRLEDEIDNCEKKLNRAEKLLGGLGGEKTRWSEAAKNLHESISNIVGDVLLA 3252
            .|...|.:.:.||.:.:.|.|...:.::.|.:|:|||..|..||:|:.:|.......:.|||||.
  Rat  3292 NLTSAFEKATAEKIKCQQEADATNRVISLANRLVGGLASENVRWAESVENFRSQGVTLCGDVLLI 3356

  Fly  3253 GGCTAYLGYFTTEYRVNILDD-W----NALCKRKHIPSSETFSLATTLGHPMTIRAWSLAGLPAD 3312
            ....:|:||||.:||..:::. |    |.|  :..||.:|.....|.|.....:..|:..|||:|
  Rat  3357 SAFVSYVGYFTKKYRNELMEKFWIPYVNNL--KVPIPITEGLDPLTLLTDDADVATWNNQGLPSD 3419

  Fly  3313 NFSVENGIIVTNSSRYSLLIDPQVQANKWIKNMEKNNNLKVIKQSDANYMQVLELAITFGQPVLI 3377
            ..|.||..|:.|:.|:.|::|.|:|..||||| :..:.||.|:....:|:.::|.||:.|..:||
  Rat  3420 RMSTENATILCNTERWPLIVDAQLQGIKWIKN-KYGSELKAIRLGQKSYLDIIEQAISEGDTLLI 3483

  Fly  3378 ENVGEKLDSNLTPILEKNVIKHKGGLFIKSGDQMIEYNPNFRLYITTCLRNPRYPPEVMVMVTVL 3442
            ||:||.:|..|.|:|.:|.||.  |.|||.||:.:||:|:|||.:.|...||.|.||:....|::
  Rat  3484 ENIGETVDPVLDPLLGRNTIKK--GRFIKIGDKEVEYHPSFRLILHTKYFNPHYKPEMQAQCTLI 3546

  Fly  3443 NFMITEQGLREQLLAIVVAHERPDLQEKKEQLIIESARNRDALYTIESKILEVLSTSEGNVLEDE 3507
            ||::|..||.:||||.|||.|||||::.|..|.......:..|..:|..:|..||.:.||.|.|.
  Rat  3547 NFLVTRDGLEDQLLAAVVAKERPDLEQLKANLTKSQNEFKIVLKELEDSLLARLSAASGNFLGDT 3611

  Fly  3508 NAINILSSSKILSEDIQEKQVIAVATEIEIDAARQQYIPVSKHSAILFFCISELANVDPMYQYSL 3572
            ..:..|.::|..:.:|:||...|..||.:|:.||:.|.|.:..:::|:|.:::|..::|:||:||
  Rat  3612 ALVENLETTKHTANEIEEKVQEAKITETKINEARENYRPAAARASLLYFILNDLNKINPIYQFSL 3676

  Fly  3573 SWFLNLFVNTILKAPKSDQLSERLKNLNDYFTKSIYTNVCRSLFEKDKLVISLVMCLGILVSQGR 3637
            ..|..:|...|.|.|.::::.:|:.||.|..|.|:|....|.|||:|||:....:...:|..:..
  Rat  3677 KAFNVVFEKAIQKTPPAEEVRQRVINLTDEITYSVYMYTARGLFERDKLIFLAQVTFQVLSMKKE 3741

  Fly  3638 VEKAALLFFLTGGIGYKTIPPNPLGAWLPDKSWASVCKAADLEGLKNLPQMMETYSDEWHNFYDA 3702
            :....|.|.|.  ..:|....:|:. :|..:||..:...::::..|||...:|..:..|....::
  Rat  3742 LNPVELDFLLR--FPFKAGVVSPVD-FLQHQSWGGIKALSEMDEFKNLDSDIEGSAKRWKKLVES 3803

  Fly  3703 SNPDQLQLPAPHNTVNDMYFLIVIKSLRPDKLVPAVRAFITRNLDRSFVEPPPFDLAASFADSSP 3767
            ..|::...|........:..|.:::.:|||::..||:.|:...:...|||....:.:.|:.:|||
  Rat  3804 EAPEKEIFPKEWKNKTALQKLCMVRCMRPDRMTYAVKNFVEEKMGSKFVEGRSVEFSKSYEESSP 3868

  Fly  3768 KIPLVFLLSAGSDPMASLFMFAKQRNM---YDKLKTISLGQGQGPRAEKMIMEAARHGQWVVLQN 3829
            ..|:.|:||.|.||:..:....|:...   ..||..:||||||...||..:..||..|.||:|||
  Rat  3869 STPIFFILSPGVDPLKDVEALGKKLGFTIDNGKLHNVSLGQGQEVVAEDALDVAAEKGHWVILQN 3933

  Fly  3830 CHVAISWMGDLERICNDTTLTDGANHDYRLWCTSYPSA-----VFPVSVLQNSVKMTNEPPKGLR 3889
            .|:...|:..|::  .....:.|::.|||::.::.|:.     :.|..:|:|::|:|||||.|:.
  Rat  3934 IHLVARWLSILDK--KVERYSSGSHEDYRVFISAEPAPSVETHIIPQGILENAIKITNEPPTGMY 3996

  Fly  3890 ANMHRS---FTSDPLMRDKFFTNAFLFSDSANKCWLRGVFALVFFHAVVQERREFGPLGWNIPYE 3951
            ||:|::   ||.|.|   :..|....|     ||.|   |||.:|||||.|||:||..|||..|.
  Rat  3997 ANLHKALDLFTQDTL---EMCTKEIEF-----KCIL---FALCYFHAVVAERRKFGAQGWNRSYP 4050

  Fly  3952 FNESDLKISLLQLKMFINQSQSIPFRGHVYLTGECNYGGRVTDDKDRRLILSLLNMIYNPNTIEE 4016
            ||..||.||:..|..::..:..:|:....||.||..|||.:|||.||||..:.|........:|.
  Rat  4051 FNNGDLTISINVLYNYLEANPKVPWDDLRYLFGEIMYGGHITDDWDRRLCRTYLIEFIRVEMLEG 4115

  Fly  4017 DNYALSQSGTYRVPLSPTRLNSIEYVSSFPLSPHPEVYGLHENADINRNVKETNALISGVLLTQ- 4080
            :  .|...| :::|.:.......||:........|.:||||.||:|......:..|...||..| 
  Rat  4116 E--VLLAPG-FQIPPNLDYKGYHEYIDENLPPESPYLYGLHPNAEIGFLTVTSEKLFRTVLEMQP 4177

  Fly  4081 --TDLMASVKASSSGGAKEDPAIAICKQVLKQLPEEFNIDEV-----SKTYPVIYTNSMNTVLRQ 4138
              ||     ..:.:|.::|:...|:...:|:::||.||:.|:     .||..|:       |..|
  Rat  4178 KETD-----SGAGTGVSREEKVKAVLDDILEKIPETFNMAEIMAKAAEKTPYVV-------VAFQ 4230

  Fly  4139 ELIRFNRLLSYIRKSLVNVGKAVVGQIAMIPELERTHASMVIGKLPADWLKKSYPSLKPLGSYVS 4203
            |..|.|.|.:.:|:||..:...:.|::.:..::|....::....:|..|:.::|||:..|.::.|
  Rat  4231 ECERMNILTNEMRRSLKELNLGLKGELTITTDMEDLSTALFYDTVPETWVARAYPSMMGLAAWYS 4295

  Fly  4204 DLLARLAFFQEW-IDNGEPMVYWISGFYFTQSFITGVLQNYSRKNRFQIDMILIEFAVT-KFEVQ 4266
            |||.|:...:.| .|...|...|::||:..|||:|.::|:.:|||.:.:|.:.:...|| |....
  Rat  4296 DLLQRIRELESWTTDFALPTTVWLAGFFNPQSFLTAIMQSMARKNEWPLDKMCLSVEVTKKTRED 4360

  Fly  4267 VPGTPDIGAYIRGIFIEGARWNRKTKEVDESFSKVLFDTLPVIYLR--PVLKALEDLPRSTAGGE 4329
            :...|..|:|:.|:|:|||||:.:|..:.|:..|.|...:|||:::  ||.:.           |
  Rat  4361 MTAPPREGSYVYGLFMEGARWDTQTGVIAEAKLKDLTPVMPVIFIKAIPVDRM-----------E 4414

  Fly  4330 PETIYDCPVYKTSERRGVLSTTGHSTNFVMYLQLRCSRKPMHWINRGTACLCQL 4383
            .:.||:||||||..|         ...:|....|:...|...||....|.|.|:
  Rat  4415 TKNIYECPVYKTRIR---------GPTYVWTFNLKTKEKAAKWILAAVALLLQV 4459

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dnah3NP_647937.2 DHC_N2 1086..1489 CDD:285579 113/487 (23%)
P-loop_NTPase 1620..1847 CDD:304359 139/226 (62%)
P-loop_NTPase 1934..2079 CDD:304359 53/148 (36%)
P-loop_NTPase 2264..2522 CDD:304359 83/258 (32%)
P-loop_NTPase 2613..2916 CDD:304359 99/303 (33%)
MT 2929..3272 CDD:289543 113/348 (32%)
AAA_9 3304..3519 CDD:289547 90/214 (42%)
Dynein_heavy 3659..4373 CDD:281078 225/736 (31%)
Dnah17XP_038943439.1 DHC_N1 187..764 CDD:400611 119/684 (17%)
DHC_N2 1266..1672 CDD:400618 102/414 (25%)
DYN1 1493..4124 CDD:227570 947/2810 (34%)
AAA_6 1806..2132 CDD:403853 168/325 (52%)
MT 3040..3383 CDD:289543 114/355 (32%)
Dynein_C 4162..4457 CDD:408026 93/326 (29%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
32.810

Return to query results.
Submit another query.