DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dnah3 and Dnah17

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_647937.2 Gene:Dnah3 / 38586 FlyBaseID:FBgn0035581 Length:4385 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038943440.1 Gene:Dnah17 / 287845 RGDID:1563805 Length:4459 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4740 Identity:1339/4740 - (28%)
Similarity:2186/4740 - (46%) Gaps:881/4740 - (18%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    28 LH-LPRVSQAQKKGEKRQLNDCPFYNLTYGFDQLPLDPVKEFLQEKISHMQTDKIVGHCNREFDF 91
            || ||||        :.:..|....||             :.:.|:::..:.:|||         
  Rat   217 LHPLPRV--------EFEFWDARLMNL-------------QCIHEQLNRPKVNKIV--------- 251

  Fly    92 HRYDLDNVKDEYDECDDDSLQEL---------QLEDIIMPEQFEMLRDAKDHLYNFDSTACNQFP 147
                  .:.::...|...:||.:         :..||::  ..:.||...:.:...|.|....| 
  Rat   252 ------EILEKAKSCYWPALQNVYMNVTQGLKEANDIVL--YLKPLRILLEEMEQADFTVLPSF- 307

  Fly   148 WIDK--------WMTG------------VRPSEQEIYEMTSHLL---EIYCNRRVRIFYPGCGTS 189
             |.|        |.|.            :|....:|.|||...|   |:....:..|.....|.|
  Rat   308 -IVKVLSTICFIWATSEHYNTPSRVIVILREFSNQIIEMTRTYLSPEEVLKGLQGEIEEVLGGIS 371

  Fly   190 SSLWTNQLRRQHGSPSELIGAYRTPSARHMRVNNMRGPPKKEKFTAGDHYA-------------- 240
            .|:         |...||..||....| :|::.....||...:|.:...::              
  Rat   372 QSV---------GVLKELFHAYDFCCA-NMKLFFKDRPPVPWEFPSSLAFSRMNAFFHRVQTIED 426

  Fly   241 -FRTPQE-CRNELMRVG------------KIIDELIEPVLKAAEHKIGHGLTKY----PDPPSCK 287
             ::|..| .:.|.:.:|            :|.||:.|.|...||       .||    |...|..
  Rat   427 LYKTAIEFLKLEKIELGGVRGNILGNLVTQIYDEVFELVKVFAE-------CKYDPLDPGDSSFD 484

  Fly   288 DNTNRILRSAGILVGKKKNCYVGKCRIHRKDFATNEEFLRCLKRMEATHF--------------- 337
            |:.|                          ||.|.   ::.|.|..||.|               
  Rat   485 DDYN--------------------------DFETK---IQDLDRRLATIFCQAFDDCNCIESSAK 520

  Fly   338 -PYM------QPLQPVDPDDQKIKMLAKYRVELARAEKLF------------------------- 370
             .||      :||..|:...:...||..:..||..|:.::                         
  Rat   521 LLYMCGGLLERPLILVEVVPRYSVMLEMFNTELDNAKLMYDAQMAASEDGQIPPIHKNMPPVAGQ 585

  Fly   371 ---TLKIQKRYQCLLKSMSIVQLATYPSHLIRKAFRRINPRSALLQDAYQFIV--------KEKR 424
               :|::|:|.:..:|         |..|:.......:..:  |:.|.|..::        |:.:
  Rat   586 LKWSLELQERLEVSMK---------YLKHIDHPVMSSVEAK--LVYDKYDEMIGLLKGYREKKYQ 639

  Fly   425 DWPKLPPEVILMDYLFVGDRGVRQDLAILIIVCLIDL------QEDFRHYVKRSFLNYLLSSNME 483
            .|.:                ||.||       |..:|      ::.|...::.:|...|::...|
  Rat   640 QWVE----------------GVDQD-------CHFNLGQPLIQRDPFSSLIQVNFSKALVAVLRE 681

  Fly   484 RRRLQLEREPPEFP----------------ILTISPPVSWRSNLLRGKARIGEVLMTTHPTVQAL 532
            .:.|..::: .|.|                :..:...|.|.:.:   |..:.||   ..|.::: 
  Rat   682 VKYLNFQQQ-KEIPSSAEKLFSENEIFRKFVGNLELIVGWYNEI---KTTVMEV---EFPLIKS- 738

  Fly   533 NRLWHDLYEDLVVVDLGQLLLAQRPL--DADTVQVFIEKSCADVRDLLLNDWLPRCADLMNEMRG 595
                     :|..:|: :|:.|:..|  :.:.|..:|:    ::|::|.|        |.|.::.
  Rat   739 ---------ELEEIDV-KLMSAETTLFWNGENVMEYIQ----EMREILHN--------LQNRIQK 781

  Fly   596 TWKDLVPMSGKYGGRAAMLFRCIHSAMSRHLNSLISKSINYLF-------KVLCAFKG--GNRIE 651
            |.:::               ..|..||...       |.|.||       :.|....|  .|..:
  Rat   782 TKQNI---------------EGITQAMQEW-------SANPLFERKDNKKEALLDLDGRVANLNK 824

  Fly   652 KY-SMFDAKLKRIPLMTLIASVVGAHFDHEP----INMGPGVRPASNIYVYDEDDADPFQQPQVN 711
            :| ::.||.::...::|..|.:..|....:|    :|.         |.....|:.|.|.:..:|
  Rat   825 RYAAVKDAGVRIQAMVTENAELFKADTTSQPWKDYVNY---------IDAMVLDEFDRFIRKSLN 880

  Fly   712 QFVENVPDIDDVA-----QFELDHSNKLYIYPYMQELPRIFTEHFKSILA--------VGYEIPR 763
            ..::|:...:::|     :.|||... |...|.::....   :.|.|::.        |...|||
  Rat   881 YLMDNMTMDENIAPLFEIRMELDEDG-LTFNPTLEMGDE---DSFLSLIEGLINDLYNVARLIPR 941

  Fly   764 LEFVMSGGEPETKGFLHFID--EDHVDFLELCEKVEQIVKVNWQGVHVYLKPVYKYYFGLFQKLI 826
            |          .||.:::..  ||..|.:|:.|::..:|....:....|.....:|.:       
  Rat   942 L----------AKGRINYKSDLEDITDLIEMREELSSLVIGAMKVAEEYQDSFERYSY------- 989

  Fly   827 LPMVQKVWTENNLPELGAVQELLKKLQAVS--------DTTYYLRDFIPLNLFMLDNRHVKLSLR 883
                  :|.::       :||.:|......        ||.  :.|.||         ..:.:|.
  Rat   990 ------LWVDD-------LQEFMKNFLIFGHAPTPEELDTK--IDDTIP---------KTQPTLA 1030

  Fly   884 MYVREIYDFIIDFYKALNWNENRAICEELEEMSMKAGERPEETPEVVALQNYIN-DCREMRIFAI 947
            .:.::     ||.|:.|           .||:|     |.|.|.   ....::. |||     ..
  Rat  1031 QFQQQ-----IDSYEKL-----------YEEVS-----RCENTK---VFHGWLQCDCR-----PF 1066

  Fly   948 KDEIKNVLKRVVFLLTHTYLSSDELHLNSRTFILPGELEEVLDLSAARLAVVRDNLELALRERRM 1012
            |..:.|.:|| ..||...|||.   |:          :..:.||.:. :.|.|..|:..|:|.  
  Rat  1067 KQALLNTIKR-WSLLFKRYLSD---HV----------INSLADLESF-MGVTRTGLKKPLKEG-- 1114

  Fly  1013 EFEKLLAQEKRTMDGFRIREIRDVLT---LEELKERVDTVDLLFTTIENLSREA---------KA 1065
            :::.|:......|   :::| |.|.|   .|.||:   |::||.:..|.:..|.         :.
  Rat  1115 DYDGLVEVMGHLM---KVKE-RQVATDSMFEPLKQ---TIELLKSYGEEMPEETYLKLQELPEQW 1172

  Fly  1066 INTEETLLQIDVSAFPLLAEII----EKMEPIE-KLWKTSYEFEKD--YLIWMFERFECLN---- 1119
            .||::..:|:..:..||.|..:    .|.:..| |..:...:|.:|  :.....:.::.||    
  Rat  1173 TNTKKLAIQVKQNVAPLQANEVNILRRKCQQFELKQHEFREKFRRDAPFTFSDPDPYKSLNKQQK 1237

  Fly  1120 ----ADGVRE-----------------QVENMHK------------IM-------YKLSRQLAYN 1144
                .:||.|                 |::..||            :|       :|.::....|
  Rat  1238 SISAMEGVMEALCKSGSLFEVTVPDYKQLKACHKEVRLLKELWDMIVMVNTSIDDWKTTKWKDIN 1302

  Fly  1145 PVAKRAAEQMRMKIEKFRVYLPVLD---------------------------SICRHGLEKRHWD 1182
                  .|||.:..:||...:..||                           .:....:.:|||.
  Rat  1303 ------VEQMDIDCKKFAKDVRSLDKEMKAWDAFVGLDNTVKNMITSLRAVSELQNPAIRERHWQ 1361

  Fly  1183 QISKILGRKVNPKLFPTLKDMIDVDIMSILPQLEEIANAAGKEYDLNNGLRIMQADWRDVMFEVL 1247
            |:.:....|.......||.|::.:::.....::..|.:.|.||..:...|:.:.:.|..:.||..
  Rat  1362 QLMQATQVKFEMSEETTLADLLQLNLHKYEDEVRNIVDKAVKESGMEKVLKTLDSTWSTMEFEHE 1426

  Fly  1248 QYRDSDTHILASLDDIQTLLDDHIMRTQAMKRSPFITALGSKADDWEARLLLIQNIIDAWTQVQI 1312
            .:..:.|.:|.|.:.:...|:|:.::.|.:..|.:::....:...|:.:|....::|..|.:||.
  Rat  1427 LHPRTGTMLLKSDELLVETLEDNQVQLQNLMMSKYLSHFLKEVTSWQQKLSTADSVISIWFEVQR 1491

  Fly  1313 TWMYLEPIF-SSEDIMRQMPLEGRNFKAVDKLWRKIMKHTLKDRHVMAATEYPEMLEVFTKAIED 1376
            ||.:||.|| .||||..|:|.:.|.|.::|:.::.:|:..:|..:|:.||..|.:.:...:..:.
  Rat  1492 TWSHLESIFIGSEDIRAQLPEDSRRFDSIDQEFKALMEDAVKTPNVVEATNKPGLYDKLERLKKS 1556

  Fly  1377 LETVTKGLNTYLEQKRLFFARFFFLSNDELLEILSETKDPMRVQPHLRKCFEGIGSLTF--DDNM 1439
            |....|.|..|||.|||.|.||:|:|:.:||:|||...||:.|..||.|.|:.:..|.|  |.:.
  Rat  1557 LAVCEKALAEYLETKRLAFPRFYFVSSADLLDILSNGNDPVEVSRHLSKLFDSLCKLKFRLDASG 1621

  Fly  1440 EIVE----MVSDEEERVALVRKINPQLANGLVEMWLKEVEMVMLDSVKEQMREAWEDYAMVERIS 1500
            ..::    |.|.|:|.:...::.:   .:|.||:||..|...|..:::.::.||...|....|..
  Rat  1622 NPIKVGLGMYSKEDEYMDFDKECD---LSGQVEVWLNRVLDRMCATLRHEIPEAVVTYEEKPREQ 1683

  Fly  1501 WVVSWPGQVVQGISCMAWTYEV-------EEAIETKELPAYLEKSNLQIADLVQLVRTDLQAGVR 1558
            |:..:|.||....:.:.||.||       ||..| ..:..|.:|...|:..|:.|:..:|.||.|
  Rat  1684 WIFDYPAQVALTCTQIWWTTEVGLAFARLEEGYE-NAIKDYNKKQISQLNALITLLIGNLSAGDR 1747

  Fly  1559 IAVEALIVLDVHDRDVVKYLTDCRITNIQDFDWISQLRYYWKVNEKNEDWVCVSMVV-TDVEYGM 1622
            :.:..:..:|||.||||..:...::.:.|.|.|.||||:.|...:|:    |.:.:. ..::|..
  Rat  1748 MKIMTICTIDVHARDVVAKMITAKVESSQAFTWQSQLRHRWDEEKKH----CFANICDAQIQYSY 1808

  Fly  1623 EYLGNLPRLVVTPLTDRCYRTLMGALKLCLGGAPEGPAGTGKTETCKDLAKAVAKKCVVFNCSDG 1687
            |||||.||||:||||||||.||..:|.|.:||||.||||||||||.|||.:|:.....|||||:.
  Rat  1809 EYLGNTPRLVITPLTDRCYITLTQSLHLIMGGAPAGPAGTGKTETTKDLGRALGTMVYVFNCSEQ 1873

  Fly  1688 LDYKALGKFFKGLAQSGAWACFDEFNRIELEVLSVVAQQILTIQRAIGRKVVKFFFEDTMLKLDP 1752
            :|||:.|..:|||||:|||.||||||||.:|||||:|.|:..:|.||..|..||.|...|:.|.|
  Rat  1874 MDYKSCGNIYKGLAQTGAWGCFDEFNRISVEVLSVIAVQVKCVQDAIRAKKKKFNFLGEMISLIP 1938

  Fly  1753 TCSIFITMNPGYAGRTELPDNLKVLFRTVAMMVPDYAMIGEITLYSNGFDMARNLSQKIVQAYKL 1817
            |..||||||||||||||||:|||.|||..||:|||:.:|.||.|.:.||..||.|::|.:..|.|
  Rat  1939 TVGIFITMNPGYAGRTELPENLKALFRPCAMVVPDFELICEIMLVAEGFLEARLLARKFITLYTL 2003

  Fly  1818 CSEQLSSQSHYDYGMRAVKSVLLASASLRRLYVDLPEPEIVLRAIVDVNLPKFLEQDISLFIGIY 1882
            |.|.||.|.|||:|:||:||||:.:.||:|......|.::::||:.|.|:||.:..|:.:|:|:.
  Rat  2004 CKELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVAGSLKRGDPTRAEDQVLMRALRDFNIPKIVTDDLPVFMGLI 2068

  Fly  1883 MDLFPGVELPMPQRGDILKWLHINLADRNLQATPWYLEKILQIYEMLLVRHGLMIVGGSMGGKTT 1947
            .||||.:::|..:..:..|.:..::.:..|||...::.|::|:.|:|.|||.:.::|.:..||:.
  Rat  2069 GDLFPALDVPRKRDLNFEKIIKQSIVELKLQAEDSFVLKVVQLEELLQVRHSVFVIGNAGSGKSQ 2133

  Fly  1948 AYQVLAQTLRNVSTDEEATLKEFPVTFRIINPKAITMGQLYGRFDPVSHEWYDGVLAKTFREQV- 2011
            ..:.|.:|.:|        :|..||... ::|||:|..:|:|..:|.:.||.||:.:...|:.. 
  Rat  2134 VLKSLNKTYQN--------MKRKPVAVD-LDPKAVTCDELFGIINPATREWKDGLFSTIMRDLAN 2189

  Fly  2012 ---QGPKGERAWVMFDGPVDAVWIENLNTVLDDNKKLCLMSGEIMQMTKLMNMMFEPADLEQASP 2073
               .|||    |::.||.:|.:|||:||||:||||.|.|.|.|.:.:.:.|.::||.:.|..|:|
  Rat  2190 ITHDGPK----WIVLDGDIDPMWIESLNTVMDDNKVLTLASNERIPLNRTMRLVFEISHLRTATP 2250

  Fly  2074 ATVSRCGMIYMEPSQLGWRALHKSFI---NVLVNKVGLGDIYMTLFEDMTEWLVPAALEFLPQCK 2135
            |||||.|::|:.|:.|||..:..|:|   .|...|..|    :.||:           ::||.|.
  Rat  2251 ATVSRAGILYINPADLGWNPVVSSWIERRKVQSEKANL----IILFD-----------KYLPTCL 2300

  Fly  2136 QML-----ELSPIYQYQTFSRFFLHFLE-----------KHKQFNQAWFQQMFLFCFAWAYCSAL 2184
            ..|     .::|:.:. |..:..|:.||           ..|:.    ::..|:|...||:    
  Rat  2301 DKLRFGFKRITPVPEI-TVIQTILYLLECLLTEKNAPPDSPKEL----YELYFVFACFWAF---- 2356

  Fly  2185 TGQGQKTFDALLRKVIYGSNENFPKPKYFSLNRGQMFPEKLLFLDYRFDEAENWW---------- 2239
                                            .|.||.::|  :|||. |...||          
  Rat  2357 --------------------------------GGAMFQDQL--IDYRV-EFSKWWINEFKTIKLP 2386

  Fly  2240 ------------------TWQKSDDSASTTSNFPENAQISELIVPTKETGYISYWQEFCISKSYA 2286
                              .|.....:.....:.|..|.    :|.|.||..|.|:.:..::|::.
  Rat  2387 SQGTIFDYYIDPETKKFLPWTDKVPNFELDPDIPLQAS----LVHTTETIRIRYFMDLLMAKAWP 2447

  Fly  2287 MLVVGPTGTGKSAIITSNLLAMPKFANLVNVINFSARTSAQMVQDTIMSKLDRRRKGVFGPSLGK 2351
            :::||..|||||.::...|..:.....||..:.|:..|::.|:|..:...|:::....:||...|
  Rat  2448 VMLVGNAGTGKSVLMGDKLENLSTDDYLVQAVPFNFYTTSAMLQGVLEKPLEKKSGRNYGPPGTK 2512

  Fly  2352 KCTVFCDDVAMPSKDTYGSQAPLELLRTWLDHGYWSDLVDTTKIELVDMTLMCAMGTLGGSNFIF 2416
            |...|.||:.||..|.||:.||..|:|..:||.:|.|....|..::.:...:..|....||..|.
  Rat  2513 KLIYFIDDMNMPEVDKYGTVAPHTLIRQHMDHRHWYDRQKLTLKDVHNCQYVACMNPTSGSFTID 2577

  Fly  2417 PRLYRHMFVVAVDSFEDSTIVRIFTTIGDWHFS-KGYPEKVALLSRGLSEAMVSVYRDAIRSFLP 2480
            |||.||..|.||.......::.|:.||...|.| :..|..:..|...|..|.:::::....:|||
  Rat  2578 PRLQRHFCVFAVSFPGHEALITIYNTILAQHLSYRSAPSVIQRLCSHLVTAALALHQKVAATFLP 2642

  Fly  2481 TPAKSHYSFSLRDITRVFQGIVMVPPKRMPDPEKLGRLWAHETYRVFYDRLVDQQDRDRLLVMAV 2545
            |..|.||.|:|||::.:||||:....:.:..|..:.|||.||..||:.|::||::|::.|..:.:
  Rat  2643 TAIKFHYIFNLRDLSNIFQGILFSTLEILRTPLDIVRLWLHEAERVYGDKMVDEKDQETLRRVTM 2707

  Fly  2546 DACKSNLRFPLEQAFGERIEPGEKLTDNDL--RNLF-----YGNYMEPDAEPKFYDEGDTYEKLE 2603
            .:.|                   |..| ||  .:||     :.::.:...:||::...|. ..|.
  Rat  2708 ASTK-------------------KFFD-DLGEEHLFAKPNIFCHFTQGIGDPKYFPVTDV-AHLN 2751

  Fly  2604 KLMKYYLREYNSFSSTPMDLVMFRFAIEHVSRVSRVLQMPRGNILMVGMGGSGRRSSARLAAYIA 2668
            ||:|..|..||..::. |:||:|..|:.|:.|::|:|:.||||.|:||:||||::|.:||||||:
  Rat  2752 KLLKDVLDSYNEVNAV-MNLVLFEDAVAHICRINRILESPRGNALLVGVGGSGKQSLSRLAAYIS 2815

  Fly  2669 DCRLMTVQVSKSYTITDWRDDLKKILMSASFNLNHTVFLFSDAQATDEGYVEDINGILNTGDLPN 2733
            ...:..:.:.|.|.|.|.:.||....:.::.....:|||.:|:|..:|.::..||.:|.:|::|.
  Rat  2816 ALDVFQITLKKGYAIPDLKMDLAAQYIKSAVKNVPSVFLMTDSQVAEEQFLVLINDLLASGEIPG 2880

  Fly  2734 LYQLEDKATIMENMANVAKQLGKILDTLPSEVYAYYIDRIREQLHIALAFSPIGDSFKERIRVYP 2798
            |:..:|...|:.:|....|.|| :.||..: .:.::|:::|:||.:.|.|||:|...:.|.|.:|
  Rat  2881 LFGDDDLENIISSMRPQVKSLG-MTDTREA-CWKFFIEKVRKQLKVILCFSPVGSVLRVRARKFP 2943

  Fly  2799 SLINCCTIDWYMPWPEEALSRVGVYFVSSMNLNRPHGEETQEPVQSKDAADPDEEEVRRETVGVE 2863
            :::||..|||:..|||:||..|...|:                               :||.|: 
  Rat  2944 AVVNCTAIDWFHEWPEDALVSVSARFL-------------------------------QETQGI- 2976

  Fly  2864 REQTQLEADLVDCVMYFHQSVVDASEKCYLELNRR-NYVTPSAYLELLKAFRTFYTRKLDEITRL 2927
              |.:::..:...:.|.|.:|.:.| |.||...|| ||.||..:||.:|.::....:|..|:...
  Rat  2977 --QPEVKTSISLFMSYVHTTVNEMS-KTYLATERRYNYTTPKTFLEQIKLYQNLLAKKRMELVAK 3038

  Fly  2928 RDRYTTGLEKLDFAAGQVGEMQTNLYDLQPKLKVLSEETDRIMVNIERETAEAEKKKEVVGADEA 2992
            .:|...||.||...|.||.:::..|...:.:||..:|..|:::..:..||.:..|:|.:...:|.
  Rat  3039 IERLENGLMKLQSTASQVDDLKAKLAVQEAELKQKNENADKLIQVVGVETEKVSKEKAIADEEEI 3103

  Fly  2993 AANEAAAAAQAIKDDCETDLAEAIPAMEAALEALNTLKPADIFIVKSMKNPPYGVKLTMEAVCVI 3057
            ............:..||||||:|.||:.||.|||:||...::..:||..:||..|.....||.::
  Rat  3104 KVEVINKNVTEKQKACETDLAKAEPALLAAQEALDTLNKNNLTELKSFGSPPDAVVNVTAAVMIL 3168

  Fly  3058 RGIKPDRKPDPSGHMVED-YWGPSMRMLSDM-KFLDSLKTFDKDNIPPPIIKRIREKYIADRDFV 3120
            ..        |.|.:.:| .|..:..|:..: .||||||.|||::||...:|..: .|..:..|.
  Rat  3169 TA--------PGGKIPKDKSWKAAKIMMGKVDTFLDSLKRFDKEHIPEACLKAFK-PYQGNPTFD 3224

  Fly  3121 PEKIKAASMACEGICRW----VRAMDVYDKVARIVMPKKAALAEAEGELSQQMEKLNAKRAELQV 3181
            ||.|::.|.|..|:|.|    ||..:||..||    ||:.||.||..||::..:||:..:.::..
  Rat  3225 PEFIRSKSTAAAGLCSWCINIVRFYEVYCDVA----PKRQALEEANAELAEAQDKLSRIKNKIAE 3285

  Fly  3182 ILDKLQKLNDFFAEKSREKKRLEDEIDNCEKKLNRAEKLLGGLGGEKTRWSEAAKNLHESISNIV 3246
            :...|..|...|.:.:.||.:.:.|.|...:.::.|.:|:|||..|..||:|:.:|.......:.
  Rat  3286 LNANLNNLTSAFEKATAEKIKCQQEADATNRVISLANRLVGGLASENVRWAESVENFRSQGVTLC 3350

  Fly  3247 GDVLLAGGCTAYLGYFTTEYRVNILDD-W----NALCKRKHIPSSETFSLATTLGHPMTIRAWSL 3306
            |||||.....:|:||||.:||..:::. |    |.|  :..||.:|.....|.|.....:..|:.
  Rat  3351 GDVLLISAFVSYVGYFTKKYRNELMEKFWIPYVNNL--KVPIPITEGLDPLTLLTDDADVATWNN 3413

  Fly  3307 AGLPADNFSVENGIIVTNSSRYSLLIDPQVQANKWIKNMEKNNNLKVIKQSDANYMQVLELAITF 3371
            .|||:|..|.||..|:.|:.|:.|::|.|:|..||||| :..:.||.|:....:|:.::|.||:.
  Rat  3414 QGLPSDRMSTENATILCNTERWPLIVDAQLQGIKWIKN-KYGSELKAIRLGQKSYLDIIEQAISE 3477

  Fly  3372 GQPVLIENVGEKLDSNLTPILEKNVIKHKGGLFIKSGDQMIEYNPNFRLYITTCLRNPRYPPEVM 3436
            |..:||||:||.:|..|.|:|.:|.||.  |.|||.||:.:||:|:|||.:.|...||.|.||:.
  Rat  3478 GDTLLIENIGETVDPVLDPLLGRNTIKK--GRFIKIGDKEVEYHPSFRLILHTKYFNPHYKPEMQ 3540

  Fly  3437 VMVTVLNFMITEQGLREQLLAIVVAHERPDLQEKKEQLIIESARNRDALYTIESKILEVLSTSEG 3501
            ...|::||::|..||.:||||.|||.|||||::.|..|.......:..|..:|..:|..||.:.|
  Rat  3541 AQCTLINFLVTRDGLEDQLLAAVVAKERPDLEQLKANLTKSQNEFKIVLKELEDSLLARLSAASG 3605

  Fly  3502 NVLEDENAINILSSSKILSEDIQEKQVIAVATEIEIDAARQQYIPVSKHSAILFFCISELANVDP 3566
            |.|.|...:..|.::|..:.:|:||...|..||.:|:.||:.|.|.:..:::|:|.:::|..::|
  Rat  3606 NFLGDTALVENLETTKHTANEIEEKVQEAKITETKINEARENYRPAAARASLLYFILNDLNKINP 3670

  Fly  3567 MYQYSLSWFLNLFVNTILKAPKSDQLSERLKNLNDYFTKSIYTNVCRSLFEKDKLVISLVMCLGI 3631
            :||:||..|..:|...|.|.|.::::.:|:.||.|..|.|:|....|.|||:|||:....:...:
  Rat  3671 IYQFSLKAFNVVFEKAIQKTPPAEEVRQRVINLTDEITYSVYMYTARGLFERDKLIFLAQVTFQV 3735

  Fly  3632 LVSQGRVEKAALLFFLTGGIGYKTIPPNPLGAWLPDKSWASVCKAADLEGLKNLPQMMETYSDEW 3696
            |..:..:....|.|.|.  ..:|....:|:. :|..:||..:...::::..|||...:|..:..|
  Rat  3736 LSMKKELNPVELDFLLR--FPFKAGVVSPVD-FLQHQSWGGIKALSEMDEFKNLDSDIEGSAKRW 3797

  Fly  3697 HNFYDASNPDQLQLPAPHNTVNDMYFLIVIKSLRPDKLVPAVRAFITRNLDRSFVEPPPFDLAAS 3761
            ....::..|::...|........:..|.:::.:|||::..||:.|:...:...|||....:.:.|
  Rat  3798 KKLVESEAPEKEIFPKEWKNKTALQKLCMVRCMRPDRMTYAVKNFVEEKMGSKFVEGRSVEFSKS 3862

  Fly  3762 FADSSPKIPLVFLLSAGSDPMASLFMFAKQRNM---YDKLKTISLGQGQGPRAEKMIMEAARHGQ 3823
            :.:|||..|:.|:||.|.||:..:....|:...   ..||..:||||||...||..:..||..|.
  Rat  3863 YEESSPSTPIFFILSPGVDPLKDVEALGKKLGFTIDNGKLHNVSLGQGQEVVAEDALDVAAEKGH 3927

  Fly  3824 WVVLQNCHVAISWMGDLERICNDTTLTDGANHDYRLWCTSYPSA-----VFPVSVLQNSVKMTNE 3883
            ||:|||.|:...|:..|::  .....:.|::.|||::.::.|:.     :.|..:|:|::|:|||
  Rat  3928 WVILQNIHLVARWLSILDK--KVERYSSGSHEDYRVFISAEPAPSVETHIIPQGILENAIKITNE 3990

  Fly  3884 PPKGLRANMHRS---FTSDPLMRDKFFTNAFLFSDSANKCWLRGVFALVFFHAVVQERREFGPLG 3945
            ||.|:.||:|::   ||.|.|   :..|....|     ||.|   |||.:|||||.|||:||..|
  Rat  3991 PPTGMYANLHKALDLFTQDTL---EMCTKEIEF-----KCIL---FALCYFHAVVAERRKFGAQG 4044

  Fly  3946 WNIPYEFNESDLKISLLQLKMFINQSQSIPFRGHVYLTGECNYGGRVTDDKDRRLILSLLNMIYN 4010
            ||..|.||..||.||:..|..::..:..:|:....||.||..|||.:|||.||||..:.|.....
  Rat  4045 WNRSYPFNNGDLTISINVLYNYLEANPKVPWDDLRYLFGEIMYGGHITDDWDRRLCRTYLIEFIR 4109

  Fly  4011 PNTIEEDNYALSQSGTYRVPLSPTRLNSIEYVSSFPLSPHPEVYGLHENADINRNVKETNALISG 4075
            ...:|.:  .|...| :::|.:.......||:........|.:||||.||:|......:..|...
  Rat  4110 VEMLEGE--VLLAPG-FQIPPNLDYKGYHEYIDENLPPESPYLYGLHPNAEIGFLTVTSEKLFRT 4171

  Fly  4076 VLLTQ---TDLMASVKASSSGGAKEDPAIAICKQVLKQLPEEFNIDEV-----SKTYPVIYTNSM 4132
            ||..|   ||     ..:.:|.::|:...|:...:|:::||.||:.|:     .||..|:     
  Rat  4172 VLEMQPKETD-----SGAGTGVSREEKVKAVLDDILEKIPETFNMAEIMAKAAEKTPYVV----- 4226

  Fly  4133 NTVLRQELIRFNRLLSYIRKSLVNVGKAVVGQIAMIPELERTHASMVIGKLPADWLKKSYPSLKP 4197
              |..||..|.|.|.:.:|:||..:...:.|::.:..::|....::....:|..|:.::|||:..
  Rat  4227 --VAFQECERMNILTNEMRRSLKELNLGLKGELTITTDMEDLSTALFYDTVPETWVARAYPSMMG 4289

  Fly  4198 LGSYVSDLLARLAFFQEW-IDNGEPMVYWISGFYFTQSFITGVLQNYSRKNRFQIDMILIEFAVT 4261
            |.::.||||.|:...:.| .|...|...|::||:..|||:|.::|:.:|||.:.:|.:.:...||
  Rat  4290 LAAWYSDLLQRIRELESWTTDFALPTTVWLAGFFNPQSFLTAIMQSMARKNEWPLDKMCLSVEVT 4354

  Fly  4262 -KFEVQVPGTPDIGAYIRGIFIEGARWNRKTKEVDESFSKVLFDTLPVIYLR--PVLKALEDLPR 4323
             |....:...|..|:|:.|:|:|||||:.:|..:.|:..|.|...:|||:::  ||.:.      
  Rat  4355 KKTREDMTAPPREGSYVYGLFMEGARWDTQTGVIAEAKLKDLTPVMPVIFIKAIPVDRM------ 4413

  Fly  4324 STAGGEPETIYDCPVYKTSERRGVLSTTGHSTNFVMYLQLRCSRKPMHWINRGTACLCQL 4383
                 |.:.||:||||||..|         ...:|....|:...|...||....|.|.|:
  Rat  4414 -----ETKNIYECPVYKTRIR---------GPTYVWTFNLKTKEKAAKWILAAVALLLQV 4459

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dnah3NP_647937.2 DHC_N2 1083..1489 CDD:462462 114/490 (23%)
DYN1 <1322..4005 CDD:227570 938/2778 (34%)
AAA_6 1620..1946 CDD:463697 168/325 (52%)
AAA_9 3302..3523 CDD:463702 90/220 (41%)
Dynein_C 4067..4381 CDD:465677 93/325 (29%)
Dnah17XP_038943440.1 DHC_N1 187..764 CDD:462457 119/684 (17%)
DHC_N2 1266..1672 CDD:462462 102/414 (25%)
DYN1 1493..4124 CDD:227570 947/2810 (34%)
AAA_6 1806..2132 CDD:463697 168/325 (52%)
MT 3040..3383 CDD:463699 114/355 (32%)
Dynein_C 4162..4457 CDD:465677 93/326 (29%)

Return to query results.
Submit another query.