DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dnah3 and Dnah12

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_647937.2 Gene:Dnah3 / 38586 FlyBaseID:FBgn0035581 Length:4385 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_063131137.1 Gene:Dnah12 / 252959 RGDID:619990 Length:3962 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4148 Identity:1737/4148 - (41%)
Similarity:2500/4148 - (60%) Gaps:307/4148 - (7%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   338 PYMQPLQPVDPDDQKIKMLAKYRVELARAEKLFTLKIQKRYQCLLKSMS--IVQL------ATYP 394
            |.:.|.:.:..|..|...|..||....:.:|:..|.|....:.|.|::.  |..|      .|..
  Rat    22 PIVHPPKNIGVDTPKQSELLNYRRSKEQQKKINQLVISAAKKSLDKTLDKRIPPLPEPDFPPTMT 86

  Fly   395 SHLIRKAFRRINPRSALLQDAYQFIVKEKRDWPKLP--PE------VILMDYLFVGDRGVRQDLA 451
            |.:.:|...            |.|:.:.....|.:|  |:      :::.::|..|.:  |::|.
  Rat    87 SEIKKKGLN------------YIFMKQCVESSPIVPIQPQWLDHMLMLIPEHLKEGKK--REELL 137

  Fly   452 ILIIVCLIDLQEDFRHYVKRSFLNYLLSSNMER---RRLQLEREP-PEFPI-LTISPPVSWRSNL 511
            ..:|   .::..||...:||    ||:.|.:.:   :.|:.|..| ||.|. |..|.|  |.||.
  Rat   138 GSLI---NEVSMDFEKSMKR----YLVQSVLVKPPVKWLEDEWGPLPESPEGLDYSNP--WHSNF 193

  Fly   512 LRGKARIGEVLMTTHPTVQALNRLWHDLYEDLVVVDLGQLLLAQRPLDADTVQVFIEKSCADVRD 576
            ::.:::|...|...|||::.|..|.:..:.|::::||.. :..:.|:|.:.::..:........:
  Rat   194 VQARSQILANLHIVHPTMKLLLELGYTTFSDIILLDLTG-IRDRGPIDCEALRNDLSIQARKAEE 257

  Fly   577 LLLNDWLPRCADLMNEMRGTWKDLVPMSGKYGGRAAMLFRCIHSAMSRHLNSLISKSINYLFKVL 641
            .::|.|.|:..:|..:...       :.|....:....:.|:...||..|..|:.:::.      
  Rat   258 RIMNTWYPKVINLFTKKEA-------LEGIKPEKVDSFYNCVSILMSNQLKDLLWRTVE------ 309

  Fly   642 CAFKGGNRIEKYSMFDAK-LKRIPLMTLIASVVGAHFDHEPINMGPGVRPASNIYVYDEDDADPF 705
                     |...:||:: :.|:|:..:..:                         :|:|     
  Rat   310 ---------EFVRLFDSRYILRLPIFKMELT-------------------------FDDD----- 335

  Fly   706 QQPQVNQFVENVPDIDDVAQFELDHSNKLYIYPYMQELPRI---FTEHFKSILAVGYEIPRLEFV 767
                                       |:..||..|:|..:   ..|.....|.....:|..   
  Rat   336 ---------------------------KMEFYPTFQDLEDVVLGLIERISETLQTVQTVPSW--- 370

  Fly   768 MSGGEPETKGFLHFIDE--DHVDFLELCEKVEQIVKVNWQGVHVYLKPVYKYYFGLFQKLILPMV 830
            :||    |...::...|  :||.:..| ..:...|..|.:||..:.|.....|..|.......|:
  Rat   371 LSG----TTAPVNLDTELPEHVMYWAL-STLRIAVHQNLEGVRAHYKTYVTNYNWLLDGTATKMI 430

  Fly   831 QKVWTENNLPELGAVQELLKKLQAVSDTTYYLRDFIPLNLFMLDNRHVKLSLRMYVREIYDFIID 895
            ::..:||:  ......|.:::..:::.....|..:....:..||...:|..|....:...:.:::
  Rat   431 ERFQSENH--TFDEYTEFIERFFSLASEIMLLPQWAHYPMVRLDCEDLKTGLTNKAKAFANILLN 493

  Fly   896 FYKALNWNENRAICEELEEMSMKAGERPEETPEVVALQNYINDCREMRIFAIKDEIKNVLKRVVF 960
            ...:.:..||.:||.|.|.:...|...||.|.|::.|..:|...|...|..:...|:...:::.:
  Rat   494 DIASKHRKENESICSEFETIKEHALRVPETTEEMMELIAFIEKARTTGIQNLAQRIQESKRQMGY 558

  Fly   961 LLTHTYLSSDELHLNSRTFILPGELEEVLDLSAARLAVVRDNLELALRERRMEFEKLLAQEKRTM 1025
            .|....||.::|:||:...:.|.::..|.|          :|.||....:|.:..:|:|:.::.:
  Rat   559 FLDTFLLSQEDLNLNASVLLWPSKINPVFD----------ENDELIENSKRTKENELIAKREKLI 613

  Fly  1026 -----DGFRIREIRDVLTLEELKERVDTVDLLFTTIENLSREAKAINTEETLLQIDVSAFPLLAE 1085
                 :..|:.|..:...|:.:::.|..|..|...|::.....:.||.||.|.:.:::.:|.|.:
  Rat   614 LEIEKESRRMEEFTEFAELDRMQQYVADVRHLQKRIQDSEEAVQFINKEEELFKWELTKYPELEK 678

  Fly  1086 IIEKMEPIEKLWKTSYEFEKDYLIWMFERFECLNADGVREQVENMHKIMYKL--------SRQLA 1142
            :...:||.:|.:....::::....||...|..||.:.:...::...:.::|.        .::|.
  Rat   679 LKVTIEPYQKFFNFVLKWQRTEKRWMDGGFLDLNGESMEADIDEFSREVFKTLKFFQTKQKKELQ 743

  Fly  1143 YNPVAKRAAEQMRMK--------------------IEKFRVYLPVLDSICRHGLEKRHWDQISKI 1187
            ....|.|....|..|                    |:.|:.|:|.:..:|..|:..|||.|:|:|
  Rat   744 EKRKAARKRSLMEEKPEEEPKESPTITMCATVMEQIKVFKEYIPTVSILCNPGMRARHWKQMSEI 808

  Fly  1188 LGRKVNPKLFPTLKDMIDVDIMSILPQLEEIANAAGKEYDLNNGLRIMQADWRDVMFEVLQYRDS 1252
            :|..:.|....||:.::.:::...|...|.|:..|.||:.|...:..|.|.|.|:.|.:..|||:
  Rat   809 VGYDLTPDSGTTLRKVLKLNLTPYLESFEVISAGASKEFSLERAMNAMIATWDDISFHISLYRDT 873

  Fly  1253 DTHILASLDDIQTLLDDHIMRTQAMKRSPFITALGSKADDWEARLLLIQNIIDAWTQVQITWMYL 1317
            ..:||:|:|:||.:|||.|::||.|:.||||....::...||.||:.||..||.|.:||..|:||
  Rat   874 GVYILSSVDEIQAILDDQIIKTQTMRGSPFIKPFENEIKAWEDRLIRIQETIDEWLKVQAQWLYL 938

  Fly  1318 EPIFSSEDIMRQMPLEGRNFKAVDKLWRKIMKHTLKDRHVMAATEYPEMLEVFTKAIEDLETVTK 1382
            ||||.|||||:|||.|||.|:.||:.|:.|||...||..|:|||....:||......:.|:.:.|
  Rat   939 EPIFCSEDIMQQMPEEGRQFQTVDRHWKDIMKFCAKDPKVLAATSLTGLLEKLQNCNDLLDKIMK 1003

  Fly  1383 GLNTYLEQKRLFFARFFFLSNDELLEILSETKDPMRVQPHLRKCFEGIGSLTFDDNMEIVEMVSD 1447
            |||.|||:|||||.|||||||||:||||||||||:||||||:||||||..|.|..|::|..|.|.
  Rat  1004 GLNAYLEKKRLFFPRFFFLSNDEMLEILSETKDPLRVQPHLKKCFEGIAKLEFLTNLDIKAMYSS 1068

  Fly  1448 EEERVALVRKINPQLANGLVEMWLKEVEMVMLDSVKEQMREAWEDYAMVERISWVVSWPGQVVQG 1512
            |.|||.|:..|:...|.|.||.||.:||.:||.|:.:.:..:...|....|..||..||||||..
  Rat  1069 EGERVELISVISTSAARGAVEKWLIQVEDLMLRSIHDVIAASRLAYPESARKDWVREWPGQVVLC 1133

  Fly  1513 ISCMAWTYEVEEAIE--TKELPAYLEKSNLQIADLVQLVRTDLQAGVRIAVEALIVLDVHDRDVV 1575
            :|.|.||.|.:|.|.  .:.|..|.::...|:.|:|:|||..|....||.:.||:.:|||.||||
  Rat  1134 VSQMFWTSETQEVISGGNEGLKKYYKELQYQLNDIVELVRGKLSKQTRITLGALVTIDVHARDVV 1198

  Fly  1576 KYLTDCRITNIQDFDWISQLRYYWKVNEKNEDWVCVSMVVTDVEYGMEYLGNLPRLVVTPLTDRC 1640
            ..:.|..:::..||.|::||||||:.....     |.:|..:|:|..|||||.||||:|||||||
  Rat  1199 MDMIDMGVSHDTDFQWLAQLRYYWEYENAR-----VRIVNCNVKYAYEYLGNSPRLVITPLTDRC 1258

  Fly  1641 YRTLMGALKLCLGGAPEGPAGTGKTETCKDLAKAVAKKCVVFNCSDGLDYKALGKFFKGLAQSGA 1705
            ||||:||..|.||||||||||||||||.||||||:|.:||||||||||||.|:||||||||.|||
  Rat  1259 YRTLIGAFYLNLGGAPEGPAGTGKTETTKDLAKALAVQCVVFNCSDGLDYLAMGKFFKGLASSGA 1323

  Fly  1706 WACFDEFNRIELEVLSVVAQQILTIQRAIGRKVVKFFFEDTMLKLDPTCSIFITMNPGYAGRTEL 1770
            |||||||||||||||||||||||.|||||.:|:..|.||.|.|:|:|.|.:.||||||||||:||
  Rat  1324 WACFDEFNRIELEVLSVVAQQILCIQRAIQQKLEVFVFEGTELRLNPNCFVAITMNPGYAGRSEL 1388

  Fly  1771 PDNLKVLFRTVAMMVPDYAMIGEITLYSNGFDMARNLSQKIVQAYKLCSEQLSSQSHYDYGMRAV 1835
            ||||||||||||||||:||:|.||:|||.||..|:.||.|||..|:|||||||||.|||||||||
  Rat  1389 PDNLKVLFRTVAMMVPNYALIAEISLYSYGFLNAKPLSVKIVMTYRLCSEQLSSQFHYDYGMRAV 1453

  Fly  1836 KSVLLASASLRRLYVDLPEPEIVLRAIVDVNLPKFLEQDISLFIGIYMDLFPGVELPMPQRGDIL 1900
            |:||:|:.:|:..|.:..|..::||:|.|||.||||..||.||.||..|||||::||.....:.|
  Rat  1454 KAVLVAAGNLKLKYPNENEDILLLRSIKDVNEPKFLSHDIPLFNGITSDLFPGIKLPEADYQEFL 1518

  Fly  1901 KWLHINLADRNLQATPWYLEKILQIYEMLLVRHGLMIVGGSMGGKTTAYQVLAQTL-----RNVS 1960
            :..:.....:|||...::||||:|.|||::||||.|:||.....||....:||.||     ||..
  Rat  1519 ECAYEACETQNLQPVKFFLEKIIQTYEMMIVRHGFMLVGEPFAAKTEVLHILADTLTLMNERNYG 1583

  Fly  1961 TDEEATLKEFPVTFRIINPKAITMGQLYGRFDPVSHEWYDGVLAKTFREQVQGPKGERAWVMFDG 2025
            .:|:       |.:|.:|||:||||||:|:||||||||.||::|.||||.......:|.||:|||
  Rat  1584 DEEK-------VMYRTVNPKSITMGQLFGQFDPVSHEWTDGIVANTFREFALAESPDRKWVVFDG 1641

  Fly  2026 PVDAVWIENLNTVLDDNKKLCLMSGEIMQMTKLMNMMFEPADLEQASPATVSRCGMIYMEPSQLG 2090
            |:|.:|||::|||||||||||||||||:||:..|:::||..||.||||||||||||||:||||||
  Rat  1642 PIDTLWIESMNTVLDDNKKLCLMSGEIIQMSPQMSLIFETMDLSQASPATVSRCGMIYLEPSQLG 1706

  Fly  2091 WRALHKSFINVLVNKVGLGDI-YMTLFEDMTEWLVPAALEF-LPQCKQMLELSPIYQYQTFSRFF 2153
            |..:..|::|.|  |..|.:: :..|.:::..|||..:||| ..:||:::....|......:|..
  Rat  1707 WEPIVASWLNSL--KEPLNELEHQNLLKELFNWLVQPSLEFRRKKCKELIPTGNINAVVALTRLI 1769

  Fly  2154 LHFL---------EKHKQFNQAWFQQMFLFCFAWAYCSALTGQGQKTFDALLRKVIYGSNENFPK 2209
            ...|         .||   .:.|....|:|...|:..::....|:..||..||.::.|.|:..|.
  Rat  1770 EILLCTVVENDPSSKH---IRVWIMATFVFSLIWSVGASCDTDGRLAFDNFLRSLVTGKNDKAPM 1831

  Fly  2210 PKYFSLNRGQM-FPEKLLFLDYRFDEAENWWTWQKSDDSASTTSNFPENAQISELIVPTKETGYI 2273
            |.:  :|:.:. |.||.|..||.: |..|...|...:|...::.......:|.::||||.:|...
  Rat  1832 PVF--INKWECPFDEKGLVYDYMY-ELRNRGRWIHWNDLIKSSDIEDRRTKIQDIIVPTMDTIRY 1893

  Fly  2274 SYWQEFCISKSYAMLVVGPTGTGKSAIITSNLL-AMPKFANLVNVINFSARTSAQMVQDTIMSKL 2337
            ::..:.|||.:..:|.|||||||||..:...|: .:.|.......:||||||||..||:.||::|
  Rat  1894 TFLMDLCISHAKPLLFVGPTGTGKSVYVKDKLMNHLEKGKYFPFYVNFSARTSANQVQNIIMARL 1958

  Fly  2338 DRRRKGVFGPSLGKKCTVFCDDVAMPSKDTYGSQAPLELLRTWLDHGYWSDLVDTTKIELVDMTL 2402
            |:||||||||.:||||.||.||:.|||.:.||:|.|:||||.:.|.|:|.||.|||||.|||:.|
  Rat  1959 DKRRKGVFGPPMGKKCVVFIDDMNMPSLEKYGAQPPIELLRQFFDCGHWYDLKDTTKITLVDIEL 2023

  Fly  2403 MCAMGTLGGS-NFIFPRLYRHMFVVAVDSFEDSTIVRIFTTIGDWH-----FSKGYPEKVALLSR 2461
            :.|||..||. |.:.||..||..:..::||.|.|:||||::|..::     ||..|    .:|..
  Rat  2024 IAAMGPPGGGRNAVTPRFIRHFNICTINSFSDETMVRIFSSIMMFYLRTHDFSPEY----FVLGH 2084

  Fly  2462 GLSEAMVSVYRDAIRSFLPTPAKSHYSFSLRDITRVFQGIVMVPPKRMPDPEKLGRLWAHETYRV 2526
            .:..|.:.:|:.::.:.|||||||||:|:|||.:||.:|.:::..:.:.....:.||:.||..||
  Rat  2085 QIVSATMEIYKQSMGNLLPTPAKSHYTFNLRDFSRVIRGCLLIDKEAIESKHTMIRLFVHEVLRV 2149

  Fly  2527 FYDRLVDQQDRDRLLVMAVDACKSNLRFPLEQAFGERIEPGEKLTDNDLRNLFYGNYMEPDAE-- 2589
            |||||::.:||:.|.::..:..|.:.:..||..|.........:.:.|||||.:|:||.||.|  
  Rat  2150 FYDRLINDEDRNWLFLLIKNVIKDHFKESLENVFSHLRRGNSSINEEDLRNLMFGDYMNPDLEGD 2214

  Fly  2590 PKFYDEGDTYEKLEKLMKYYLREYNSFSSTPMDLVMFRFAIEHVSRVSRVLQMPRGNILMVGMGG 2654
            .:.|.|.....:..:::...|.|||......|:||:||:.:||:||:.|:|:...||.|::|:||
  Rat  2215 DRVYIEILNIHQFNEVVDQCLDEYNQTHKRRMNLVVFRYVLEHLSRICRILKQSGGNALLIGLGG 2279

  Fly  2655 SGRRSSARLAAYIADCRLMTVQVSKSYTITDWRDDLKKILMSASFNLNHTVFLFSDAQATDEGYV 2719
            |||:|...||..:|..::...::||||.:.:||:|:|.:|.:.......||||.:|.|..:|.::
  Rat  2280 SGRQSLTSLATSMAKMQIFQPEISKSYGMNEWREDIKSLLRNVGVKGQKTVFLITDTQIKEEAFL 2344

  Fly  2720 EDINGILNTGDLPNLYQLEDKATIMENMANVAKQLGKILDTLPSEVYAYYIDRIREQLHIALAFS 2784
            |||:.:||||::||::..::|..:||.:..||:...|..:..|..::|::::|.::.||:.:|||
  Rat  2345 EDIDSVLNTGEVPNIFAADEKQEVMEGVRPVAQVGNKHGELSPLALFAFFVNRCKDNLHVVVAFS 2409

  Fly  2785 PIGDSFKERIRVYPSLINCCTIDWYMPWPEEALSRVGVYFVSSMNLNRPHGEETQEPVQSKDAAD 2849
            ||||:|:.|:|.:|||||||||||:.||||:||.||.|.|:.::.|..                 
  Rat  2410 PIGDAFRNRLRQFPSLINCCTIDWFQPWPEDALERVAVSFLETVELTE----------------- 2457

  Fly  2850 PDEEEVRRETVGVEREQTQLEADLVDCVMYFHQSVVDASEKCYLELNRRNYVTPSAYLELLKAFR 2914
                        |||.      ::|....:||.|:::.||:...||.|.||||.::||||:.:||
  Rat  2458 ------------VERH------EIVPICKHFHTSIMNLSERFLEELGRHNYVTATSYLELIGSFR 2504

  Fly  2915 TFYTRKLDEITRLRDRYTTGLEKLDFAAGQVGEMQTNLYDLQPKLKVLSEETDRIMVNIERETAE 2979
            ...|:|...:...:.||..||::|.||..|||||:..|.:|||||:....|..|:|..||.|:|:
  Rat  2505 QLLTKKRQSVMEAKQRYVNGLDQLAFAESQVGEMKLELVELQPKLEAAKVENARMMQIIEIESAQ 2569

  Fly  2980 AEKKKEVVGADEAAANEAAAAAQAIKDDCETDLAEAIPAMEAALEALNTLK--PADIFIVKSMKN 3042
            .|.|:::|..||..|:..|..|||:|::||:||||||||:||||.||:|||  ||||.|||||||
  Rat  2570 VEAKRKIVKLDEEIASGKAEEAQALKNECESDLAEAIPALEAALSALDTLKESPADITIVKSMKN 2634

  Fly  3043 PPYGVKLTMEAVCVIRGIKPDRKPDPS--GHMVEDYWGPSMRMLSDMKFLDSLKTFDKDNIPPPI 3105
            ||.||||.|.||||::.|||::..|||  |..:.||||||.::|.||.||..|:.:||:|||..:
  Rat  2635 PPAGVKLVMAAVCVMKDIKPEKISDPSGTGGKIFDYWGPSKKLLGDMNFLRDLREYDKENIPVAV 2699

  Fly  3106 IKRIREKYIADRDFVPEKIKAASMACEGICRWVRAMDVYDKVARIVMPKKAALAEAEGELSQQME 3170
            :::||.:|:.:.:|.|.|:..||.|.||:|:|:.||:|||:||::|.||||.||||:..|::.||
  Rat  2700 MQKIRSEYLTNPEFDPPKVAKASSAAEGLCKWIMAMEVYDRVAKVVAPKKARLAEAQKSLAETME 2764

  Fly  3171 KLNAKRAELQVILDKLQKLNDFFAEKSREKKRLEDEIDNCEKKLNRAEKLLGGLGGEKTRWSEAA 3235
            .||.||.||..:...|:.|...|.||:.||..|||:::.|.|||.||.||:|||||||:|||:||
  Rat  2765 LLNQKRGELAQVEHHLENLQKTFQEKTEEKAALEDQVELCAKKLERATKLIGGLGGEKSRWSQAA 2829

  Fly  3236 KNLHESISNIVGDVLLAGGCTAYLGYFTTEYRVNILDDWNALCKRKHIPSSETFSLATTLGHPMT 3300
            .:|..:..|:.||||::.|..||||.||:.:|....:||:.|||.|..|.||.|||:.|||.|:.
  Rat  2830 NDLQATYENLTGDVLVSAGVIAYLGAFTSGFRQECTEDWSKLCKEKKFPCSEEFSLSKTLGDPVK 2894

  Fly  3301 IRAWSLAGLPADNFSVENGIIVTNSSRYSLLIDPQVQANKWIKNMEKNNNLKVIKQSDANYMQVL 3365
            ||||::||||.|.||::||:||.||.|:.|:||||.||||||||.||:|.|.|||.||::||:.|
  Rat  2895 IRAWNIAGLPTDTFSIDNGVIVNNSRRWPLMIDPQGQANKWIKNSEKDNQLSVIKLSDSDYMRTL 2959

  Fly  3366 ELAITFGQPVLIENVGEKLDSNLTPILEKNVIKHKGGLFIKSGDQMIEYNPNFRLYITTCLRNPR 3430
            |..|..|.|||:|||||.||.:|.|:|.:...|..|...|:.|:.:|||:.:|:.||||.||||.
  Rat  2960 ENCIQLGTPVLLENVGEDLDPSLEPLLLRQTFKQGGIDCIRLGEVIIEYSFDFKFYITTKLRNPH 3024

  Fly  3431 YPPEVMVMVTVLNFMITEQGLREQLLAIVVAHERPDLQEKKEQLIIESARNRDALYTIESKILEV 3495
            |.||:...|::||||||.:||.:|||.||||.|||:|:|::..||::||.|:..|..||::|||.
  Rat  3025 YMPELATKVSLLNFMITPEGLEDQLLGIVVAKERPELEEERNALILQSAANKKQLKDIETRILET 3089

  Fly  3496 LSTSEGNVLEDENAINILSSSKILSEDIQEKQVIAVATEIEIDAARQQYIPVSKHSAILFFCISE 3560
            ||.||||:||||:||.:|.|:|::|.:|.:||.:|..||::|..:|:.|.|::|||::|||.|::
  Rat  3090 LSCSEGNILEDESAIKVLDSAKMMSNEITKKQQVAEKTELKIAESREGYRPIAKHSSVLFFSIAD 3154

  Fly  3561 LANVDPMYQYSLSWFLNLFVNTILKAPKSDQLSERLKNLNDYFTKSIYTNVCRSLFEKDKLVISL 3625
            |||:||||||||:||:||::|:|..:.:|..|.:||:.|||:||.::|.|:||||||||||:.|.
  Rat  3155 LANIDPMYQYSLTWFVNLYINSIHDSNRSKILEKRLRYLNDHFTYNLYCNICRSLFEKDKLLFSF 3219

  Fly  3626 VMCLGILVSQGRVEKAALLFFLTGGIGYKTIPPNPLGAWLPDKSWASVCKAADLEGLKNLPQMME 3690
            ::|..:|:::..:|...|:|.||||:..|:...||...||.||||..:|:|::|.....|.:...
  Rat  3220 LLCANLLLAKKEIEYQELMFLLTGGVSLKSAEKNPDPNWLQDKSWEEICRASELPVFHGLREHFC 3284

  Fly  3691 TYSDEWHNFYDASNPDQLQLP-APHNTVNDMYFLIVIKSLRPDKLVPAVRAFITRNLDRSFVEPP 3754
            .:..||.:.|::..|..::|| :...|:|::..:|:::.|||||:.||:..::|..|.:.|||||
  Rat  3285 NHIREWEDIYNSKEPHNMKLPESMDKTLNELQKIIILRCLRPDKITPAITNYVTDKLGKKFVEPP 3349

  Fly  3755 PFDLAASFADSSPKIPLVFLLSAGSDPMASLFMFAKQRNMY-DKLKTISLGQGQGPRAEKMIMEA 3818
            ||||..|:.||:..|||:|:||.|:||||||..||..::|. :|.:.|||||||||.|.|||..|
  Rat  3350 PFDLTKSYLDSNCTIPLIFVLSPGADPMASLLKFANDKSMSGNKFQAISLGQGQGPVATKMITAA 3414

  Fly  3819 ARHGQWVVLQNCHVAISWMGDLERICNDTTLTDGANHDYRLWCTSYPSAVFPVSVLQNSVKMTNE 3883
            ...|.||.|||||:|:|||..||:||.|.: .:..|..:|||.|||||..|||::|||.||||||
  Rat  3415 IEEGTWVCLQNCHLAVSWMPTLEKICEDFS-PEICNPTFRLWLTSYPSPKFPVTILQNGVKMTNE 3478

  Fly  3884 PPKGLRANMHRSFTSDPLMRDKFFTNAFLFSDSANKC------WLRGVFALVFFHAVVQERREFG 3942
            ||.|||.|:.:|:.|||:...:||          |.|      |.:.:|.:.||||:||||::||
  Rat  3479 PPTGLRLNLLQSYLSDPISDPEFF----------NGCPGKELAWEKLLFGVCFFHALVQERKKFG 3533

  Fly  3943 PLGWNIPYEFNESDLKISLLQLKMFINQSQSIPFRGHVYLTGECNYGGRVTDDKDRRLILSLLNM 4007
            ||||||||.||||||:||:.||::|||:..:|||....|||||||||||||||.||||:|::|..
  Rat  3534 PLGWNIPYGFNESDLRISIRQLQLFINEYDTIPFEAISYLTGECNYGGRVTDDWDRRLLLTMLAD 3598

  Fly  4008 IYNPNTIEEDNYALSQSGTYRVPLSPTRLNSIEYVSSFPLSPHPEVYGLHENADINRNVKETNAL 4072
            .||...||..:|..|.||.|..|...|....||::...|.:..||::|||||.||::::::|..|
  Rat  3599 FYNSLIIENPHYKFSPSGNYFAPPKGTYDEYIEFIKKLPFTQEPEIFGLHENVDISKDLQQTKLL 3663

  Fly  4073 ISGVLLTQTDLMASVKASSSGGAKEDPAIAICKQVLKQLPEEFNIDEVSKTYPVIYTNSMNTVLR 4137
            ...:||||    ..||.:.|.|:.:...:.|.:.:|.|||.:|:|:...::|||.|..||||||.
  Rat  3664 FESLLLTQ----GGVKQTGSSGSTDQILLEITEDILTQLPNDFDIEAALRSYPVRYEESMNTVLV 3724

  Fly  4138 QELIRFNRLLSYIRKSLVNVGKAVVGQIAMIPELERTHASMVIGKLPADWLKKSYPSLKPLGSYV 4202
            ||:.|||.|:..||.:|.::.||:.|.:.|...||....|::|||:|..|.::|||||||||||:
  Rat  3725 QEMERFNNLIITIRNTLRDLKKAIKGVVVMDSALEALSGSLLIGKVPEMWAQRSYPSLKPLGSYI 3789

  Fly  4203 SDLLARLAFFQEWIDNGEPMVYWISGFYFTQSFITGVLQNYSRKNRFQIDMILIEFAVTKFEVQV 4267
            :|.|.||.|.::|...|:|.|:|||||:|||:|:||.:|||:||....||::..||.|...: ..
  Rat  3790 TDFLTRLKFLEDWFTMGKPNVFWISGFFFTQAFLTGAMQNYARKYTIPIDLLGYEFEVIPSD-NA 3853

  Fly  4268 PGTPDIGAYIRGIFIEGARWNRKTKEVDESFSKVLFDTLPVIYLRPVLKALEDLPRSTAGGEPET 4332
            ...|:.|.||.|::::||||||.:..:.|...|:|||.:|:|:::|.:|.  ::.::.|      
  Rat  3854 TNPPEDGVYIHGLYLDGARWNRTSGLLAEQHPKLLFDLMPIIWIKPNVKT--EIVKTDA------ 3910

  Fly  4333 IYDCPVYKTSERRGVLSTTGHSTNFVMYLQLRCSRKPMHWINRGTACLCQLDD 4385
             |.||:||||||:|.|||||||||||:.:.||......|||.||.|.|||||:
  Rat  3911 -YVCPLYKTSERKGTLSTTGHSTNFVIAMLLRTELPAQHWIKRGVALLCQLDN 3962

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dnah3NP_647937.2 DHC_N2 1083..1489 CDD:462462 174/433 (40%)
DYN1 <1322..4005 CDD:227570 1338/2722 (49%)
AAA_6 1620..1946 CDD:463697 220/325 (68%)
AAA_9 3302..3523 CDD:463702 125/220 (57%)
Dynein_C 4067..4381 CDD:465677 139/313 (44%)
Dnah12XP_063131137.1 None

Return to query results.
Submit another query.