DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dnah3 and Dnah12

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_647937.2 Gene:Dnah3 / 38586 FlyBaseID:FBgn0035581 Length:4385 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_006252733.1 Gene:Dnah12 / 252959 RGDID:619990 Length:3960 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4146 Identity:1737/4146 - (41%)
Similarity:2500/4146 - (60%) Gaps:305/4146 - (7%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   338 PYMQPLQPVDPDDQKIKMLAKYRVELARAEKLFTLKIQKRYQCLLKSMS--IVQL------ATYP 394
            |.:.|.:.:..|..|...|..||....:.:|:..|.|....:.|.|::.  |..|      .|..
  Rat    22 PIVHPPKNIGVDTPKQSELLNYRRSKEQQKKINQLVISAAKKSLDKTLDKRIPPLPEPDFPPTMT 86

  Fly   395 SHLIRKAFRRINPRSALLQDAYQFIVKEKRDWPKLP--PE------VILMDYLFVGDRGVRQDLA 451
            |.:.:|...            |.|:.:.....|.:|  |:      :::.::|..|.:  |::|.
  Rat    87 SEIKKKGLN------------YIFMKQCVESSPIVPIQPQWLDHMLMLIPEHLKEGKK--REELL 137

  Fly   452 ILIIVCLIDLQEDFRHYVKRSFLNYLLSSNMER---RRLQLEREP-PEFPI-LTISPPVSWRSNL 511
            ..:|   .::..||...:||    ||:.|.:.:   :.|:.|..| ||.|. |..|.|  |.||.
  Rat   138 GSLI---NEVSMDFEKSMKR----YLVQSVLVKPPVKWLEDEWGPLPESPEGLDYSNP--WHSNF 193

  Fly   512 LRGKARIGEVLMTTHPTVQALNRLWHDLYEDLVVVDLGQLLLAQRPLDADTVQVFIEKSCADVRD 576
            ::.:::|...|...|||::.|..|.:..:.|::::||.. :..:.|:|.:.::..:........:
  Rat   194 VQARSQILANLHIVHPTMKLLLELGYTTFSDIILLDLTG-IRDRGPIDCEALRNDLSIQARKAEE 257

  Fly   577 LLLNDWLPRCADLMNEMRGTWKDLVPMSGKYGGRAAMLFRCIHSAMSRHLNSLISKSINYLFKVL 641
            .::|.|.|:..:|..:...       :.|....:....:.|:...||..|..|:.:::.      
  Rat   258 RIMNTWYPKVINLFTKKEA-------LEGIKPEKVDSFYNCVSILMSNQLKDLLWRTVE------ 309

  Fly   642 CAFKGGNRIEKYSMFDAK-LKRIPLMTLIASVVGAHFDHEPINMGPGVRPASNIYVYDEDDADPF 705
                     |...:||:: :.|:|:..:..:                         :|:|     
  Rat   310 ---------EFVRLFDSRYILRLPIFKMELT-------------------------FDDD----- 335

  Fly   706 QQPQVNQFVENVPDIDDVAQFELDHSNKLYIYPYMQELPRI---FTEHFKSILAVGYEIPRLEFV 767
                                       |:..||..|:|..:   ..|.....|.....:|..   
  Rat   336 ---------------------------KMEFYPTFQDLEDVVLGLIERISETLQTVQTVPSW--- 370

  Fly   768 MSGGEPETKGFLHFIDE--DHVDFLELCEKVEQIVKVNWQGVHVYLKPVYKYYFGLFQKLILPMV 830
            :||    |...::...|  :||.:..| ..:...|..|.:||..:.|.....|..|.......|:
  Rat   371 LSG----TTAPVNLDTELPEHVMYWAL-STLRIAVHQNLEGVRAHYKTYVTNYNWLLDGTATKMI 430

  Fly   831 QKVWTENNLPELGAVQELLKKLQAVSDTTYYLRDFIPLNLFMLDNRHVKLSLRMYVREIYDFIID 895
            ::..:||:  ......|.:::..:::.....|..:....:..||...:|..|....:...:.:::
  Rat   431 ERFQSENH--TFDEYTEFIERFFSLASEIMLLPQWAHYPMVRLDCEDLKTGLTNKAKAFANILLN 493

  Fly   896 FYKALNWNENRAICEELEEMSMKAGERPEETPEVVALQNYINDCREMRIFAIKDEIKNVLKRVVF 960
            ...:.:..||.:||.|.|.:...|...||.|.|::.|..:|...|...|..:...|:...:::.:
  Rat   494 DIASKHRKENESICSEFETIKEHALRVPETTEEMMELIAFIEKARTTGIQNLAQRIQESKRQMGY 558

  Fly   961 LLTHTYLSSDELHLNSRTFILPGELEEVLDLSAARLAVVRDNLELALRERRMEFEKLLAQEKRTM 1025
            .|....||.::|:||:...:.|.::..|.|          :|.||....:|.:..:|:|:.::.:
  Rat   559 FLDTFLLSQEDLNLNASVLLWPSKINPVFD----------ENDELIENSKRTKENELIAKREKLI 613

  Fly  1026 -----DGFRIREIRDVLTLEELKERVDTVDLLFTTIENLSREAKAINTEETLLQIDVSAFPLLAE 1085
                 :..|:.|..:...|:.:::.|..|..|...|::.....:.||.||.|.:.:::.:|.|.:
  Rat   614 LEIEKESRRMEEFTEFAELDRMQQYVADVRHLQKRIQDSEEAVQFINKEEELFKWELTKYPELEK 678

  Fly  1086 IIEKMEPIEKLWKTSYEFEKDYLIWMFERFECLNADGVREQVENMHKIMYKL--------SRQLA 1142
            :...:||.:|.:....::::....||...|..||.:.:...::...:.::|.        .::|.
  Rat   679 LKVTIEPYQKFFNFVLKWQRTEKRWMDGGFLDLNGESMEADIDEFSREVFKTLKFFQTKQKKELQ 743

  Fly  1143 YNPVAKRAAEQMRMK--------------------IEKFRVYLPVLDSICRHGLEKRHWDQISKI 1187
            ....|.|....|..|                    |:.|:.|:|.:..:|..|:..|||.|:|:|
  Rat   744 EKRKAARKRSLMEEKPEEEPKESPTITMCATVMEQIKVFKEYIPTVSILCNPGMRARHWKQMSEI 808

  Fly  1188 LGRKVNPKLFPTLKDMIDVDIMSILPQLEEIANAAGKEYDLNNGLRIMQADWRDVMFEVLQYRDS 1252
            :|..:.|....||:.::.:::...|...|.|:..|.||:.|...:..|.|.|.|:.|.:..|||:
  Rat   809 VGYDLTPDSGTTLRKVLKLNLTPYLESFEVISAGASKEFSLERAMNAMIATWDDISFHISLYRDT 873

  Fly  1253 DTHILASLDDIQTLLDDHIMRTQAMKRSPFITALGSKADDWEARLLLIQNIIDAWTQVQITWMYL 1317
            ..:||:|:|:||.:|||.|::||.|:.||||....::...||.||:.||..||.|.:||..|:||
  Rat   874 GVYILSSVDEIQAILDDQIIKTQTMRGSPFIKPFENEIKAWEDRLIRIQETIDEWLKVQAQWLYL 938

  Fly  1318 EPIFSSEDIMRQMPLEGRNFKAVDKLWRKIMKHTLKDRHVMAATEYPEMLEVFTKAIEDLETVTK 1382
            ||||.|||||:|||.|||.|:.||:.|:.|||...||..|:|||....:||......:.|:.:.|
  Rat   939 EPIFCSEDIMQQMPEEGRQFQTVDRHWKDIMKFCAKDPKVLAATSLTGLLEKLQNCNDLLDKIMK 1003

  Fly  1383 GLNTYLEQKRLFFARFFFLSNDELLEILSETKDPMRVQPHLRKCFEGIGSLTFDDNMEIVEMVSD 1447
            |||.|||:|||||.|||||||||:||||||||||:||||||:||||||..|.|..|::|..|.|.
  Rat  1004 GLNAYLEKKRLFFPRFFFLSNDEMLEILSETKDPLRVQPHLKKCFEGIAKLEFLTNLDIKAMYSS 1068

  Fly  1448 EEERVALVRKINPQLANGLVEMWLKEVEMVMLDSVKEQMREAWEDYAMVERISWVVSWPGQVVQG 1512
            |.|||.|:..|:...|.|.||.||.:||.:||.|:.:.:..:...|....|..||..||||||..
  Rat  1069 EGERVELISVISTSAARGAVEKWLIQVEDLMLRSIHDVIAASRLAYPESARKDWVREWPGQVVLC 1133

  Fly  1513 ISCMAWTYEVEEAIE--TKELPAYLEKSNLQIADLVQLVRTDLQAGVRIAVEALIVLDVHDRDVV 1575
            :|.|.||.|.:|.|.  .:.|..|.::...|:.|:|:|||..|....||.:.||:.:|||.||||
  Rat  1134 VSQMFWTSETQEVISGGNEGLKKYYKELQYQLNDIVELVRGKLSKQTRITLGALVTIDVHARDVV 1198

  Fly  1576 KYLTDCRITNIQDFDWISQLRYYWKVNEKNEDWVCVSMVVTDVEYGMEYLGNLPRLVVTPLTDRC 1640
            ..:.|..:::..||.|::||||||:.....     |.:|..:|:|..|||||.||||:|||||||
  Rat  1199 MDMIDMGVSHDTDFQWLAQLRYYWEYENAR-----VRIVNCNVKYAYEYLGNSPRLVITPLTDRC 1258

  Fly  1641 YRTLMGALKLCLGGAPEGPAGTGKTETCKDLAKAVAKKCVVFNCSDGLDYKALGKFFKGLAQSGA 1705
            ||||:||..|.||||||||||||||||.||||||:|.:||||||||||||.|:||||||||.|||
  Rat  1259 YRTLIGAFYLNLGGAPEGPAGTGKTETTKDLAKALAVQCVVFNCSDGLDYLAMGKFFKGLASSGA 1323

  Fly  1706 WACFDEFNRIELEVLSVVAQQILTIQRAIGRKVVKFFFEDTMLKLDPTCSIFITMNPGYAGRTEL 1770
            |||||||||||||||||||||||.|||||.:|:..|.||.|.|:|:|.|.:.||||||||||:||
  Rat  1324 WACFDEFNRIELEVLSVVAQQILCIQRAIQQKLEVFVFEGTELRLNPNCFVAITMNPGYAGRSEL 1388

  Fly  1771 PDNLKVLFRTVAMMVPDYAMIGEITLYSNGFDMARNLSQKIVQAYKLCSEQLSSQSHYDYGMRAV 1835
            ||||||||||||||||:||:|.||:|||.||..|:.||.|||..|:|||||||||.|||||||||
  Rat  1389 PDNLKVLFRTVAMMVPNYALIAEISLYSYGFLNAKPLSVKIVMTYRLCSEQLSSQFHYDYGMRAV 1453

  Fly  1836 KSVLLASASLRRLYVDLPEPEIVLRAIVDVNLPKFLEQDISLFIGIYMDLFPGVELPMPQRGDIL 1900
            |:||:|:.:|:..|.:..|..::||:|.|||.||||..||.||.||..|||||::||.....:.|
  Rat  1454 KAVLVAAGNLKLKYPNENEDILLLRSIKDVNEPKFLSHDIPLFNGITSDLFPGIKLPEADYQEFL 1518

  Fly  1901 KWLHINLADRNLQATPWYLEKILQIYEMLLVRHGLMIVGGSMGGKTTAYQVLAQTL-----RNVS 1960
            :..:.....:|||...::||||:|.|||::||||.|:||.....||....:||.||     ||..
  Rat  1519 ECAYEACETQNLQPVKFFLEKIIQTYEMMIVRHGFMLVGEPFAAKTEVLHILADTLTLMNERNYG 1583

  Fly  1961 TDEEATLKEFPVTFRIINPKAITMGQLYGRFDPVSHEWYDGVLAKTFREQVQGPKGERAWVMFDG 2025
            .:|:       |.:|.:|||:||||||:|:||||||||.||::|.||||.......:|.||:|||
  Rat  1584 DEEK-------VMYRTVNPKSITMGQLFGQFDPVSHEWTDGIVANTFREFALAESPDRKWVVFDG 1641

  Fly  2026 PVDAVWIENLNTVLDDNKKLCLMSGEIMQMTKLMNMMFEPADLEQASPATVSRCGMIYMEPSQLG 2090
            |:|.:|||::|||||||||||||||||:||:..|:::||..||.||||||||||||||:||||||
  Rat  1642 PIDTLWIESMNTVLDDNKKLCLMSGEIIQMSPQMSLIFETMDLSQASPATVSRCGMIYLEPSQLG 1706

  Fly  2091 WRALHKSFINVLVNKVGLGDI-YMTLFEDMTEWLVPAALEF-LPQCKQMLELSPIYQYQTFSRFF 2153
            |..:..|::|.|  |..|.:: :..|.:::..|||..:||| ..:||:::....|......:|..
  Rat  1707 WEPIVASWLNSL--KEPLNELEHQNLLKELFNWLVQPSLEFRRKKCKELIPTGNINAVVALTRLI 1769

  Fly  2154 LHFL---------EKHKQFNQAWFQQMFLFCFAWAYCSALTGQGQKTFDALLRKVIYGSNENFPK 2209
            ...|         .||   .:.|....|:|...|:..::....|:..||..||.::.|.|:..|.
  Rat  1770 EILLCTVVENDPSSKH---IRVWIMATFVFSLIWSVGASCDTDGRLAFDNFLRSLVTGKNDKAPM 1831

  Fly  2210 PKYFSLNRGQM-FPEKLLFLDYRFDEAENWWTWQKSDDSASTTSNFPENAQISELIVPTKETGYI 2273
            |.:  :|:.:. |.||.|..||.: |..|...|...:|...::.......:|.::||||.:|...
  Rat  1832 PVF--INKWECPFDEKGLVYDYMY-ELRNRGRWIHWNDLIKSSDIEDRRTKIQDIIVPTMDTIRY 1893

  Fly  2274 SYWQEFCISKSYAMLVVGPTGTGKSAIITSNLL-AMPKFANLVNVINFSARTSAQMVQDTIMSKL 2337
            ::..:.|||.:..:|.|||||||||..:...|: .:.|.......:||||||||..||:.||::|
  Rat  1894 TFLMDLCISHAKPLLFVGPTGTGKSVYVKDKLMNHLEKGKYFPFYVNFSARTSANQVQNIIMARL 1958

  Fly  2338 DRRRKGVFGPSLGKKCTVFCDDVAMPSKDTYGSQAPLELLRTWLDHGYWSDLVDTTKIELVDMTL 2402
            |:||||||||.:||||.||.||:.|||.:.||:|.|:||||.:.|.|:|.||.|||||.|||:.|
  Rat  1959 DKRRKGVFGPPMGKKCVVFIDDMNMPSLEKYGAQPPIELLRQFFDCGHWYDLKDTTKITLVDIEL 2023

  Fly  2403 MCAMGTLGGS-NFIFPRLYRHMFVVAVDSFEDSTIVRIFTTIGDWH-----FSKGYPEKVALLSR 2461
            :.|||..||. |.:.||..||..:..::||.|.|:||||::|..::     ||..|    .:|..
  Rat  2024 IAAMGPPGGGRNAVTPRFIRHFNICTINSFSDETMVRIFSSIMMFYLRTHDFSPEY----FVLGH 2084

  Fly  2462 GLSEAMVSVYRDAIRSFLPTPAKSHYSFSLRDITRVFQGIVMVPPKRMPDPEKLGRLWAHETYRV 2526
            .:..|.:.:|:.::.:.|||||||||:|:|||.:||.:|.:::..:.:.....:.||:.||..||
  Rat  2085 QIVSATMEIYKQSMGNLLPTPAKSHYTFNLRDFSRVIRGCLLIDKEAIESKHTMIRLFVHEVLRV 2149

  Fly  2527 FYDRLVDQQDRDRLLVMAVDACKSNLRFPLEQAFGERIEPGEKLTDNDLRNLFYGNYMEPDAE-- 2589
            |||||::.:||:.|.::..:..|.:.:..||..|.........:.:.|||||.:|:||.||.|  
  Rat  2150 FYDRLINDEDRNWLFLLIKNVIKDHFKESLENVFSHLRRGNSSINEEDLRNLMFGDYMNPDLEGD 2214

  Fly  2590 PKFYDEGDTYEKLEKLMKYYLREYNSFSSTPMDLVMFRFAIEHVSRVSRVLQMPRGNILMVGMGG 2654
            .:.|.|.....:..:::...|.|||......|:||:||:.:||:||:.|:|:...||.|::|:||
  Rat  2215 DRVYIEILNIHQFNEVVDQCLDEYNQTHKRRMNLVVFRYVLEHLSRICRILKQSGGNALLIGLGG 2279

  Fly  2655 SGRRSSARLAAYIADCRLMTVQVSKSYTITDWRDDLKKILMSASFNLNHTVFLFSDAQATDEGYV 2719
            |||:|...||..:|..::...::||||.:.:||:|:|.:|.:.......||||.:|.|..:|.::
  Rat  2280 SGRQSLTSLATSMAKMQIFQPEISKSYGMNEWREDIKSLLRNVGVKGQKTVFLITDTQIKEEAFL 2344

  Fly  2720 EDINGILNTGDLPNLYQLEDKATIMENMANVAKQLGKILDTLPSEVYAYYIDRIREQLHIALAFS 2784
            |||:.:||||::||::..::|..:||.:..||:...|..:..|..::|::::|.::.||:.:|||
  Rat  2345 EDIDSVLNTGEVPNIFAADEKQEVMEGVRPVAQVGNKHGELSPLALFAFFVNRCKDNLHVVVAFS 2409

  Fly  2785 PIGDSFKERIRVYPSLINCCTIDWYMPWPEEALSRVGVYFVSSMNLNRPHGEETQEPVQSKDAAD 2849
            ||||:|:.|:|.:|||||||||||:.||||:||.||.|.|:.::.|..                 
  Rat  2410 PIGDAFRNRLRQFPSLINCCTIDWFQPWPEDALERVAVSFLETVELTE----------------- 2457

  Fly  2850 PDEEEVRRETVGVEREQTQLEADLVDCVMYFHQSVVDASEKCYLELNRRNYVTPSAYLELLKAFR 2914
                        |||.      ::|....:||.|:::.||:...||.|.||||.::||||:.:||
  Rat  2458 ------------VERH------EIVPICKHFHTSIMNLSERFLEELGRHNYVTATSYLELIGSFR 2504

  Fly  2915 TFYTRKLDEITRLRDRYTTGLEKLDFAAGQVGEMQTNLYDLQPKLKVLSEETDRIMVNIERETAE 2979
            ...|:|...:...:.||..||::|.||..|||||:..|.:|||||:....|..|:|..||.|:|:
  Rat  2505 QLLTKKRQSVMEAKQRYVNGLDQLAFAESQVGEMKLELVELQPKLEAAKVENARMMQIIEIESAQ 2569

  Fly  2980 AEKKKEVVGADEAAANEAAAAAQAIKDDCETDLAEAIPAMEAALEALNTLKPADIFIVKSMKNPP 3044
            .|.|:::|..||..|:..|..|||:|::||:||||||||:||||.||:|||||||.|||||||||
  Rat  2570 VEAKRKIVKLDEEIASGKAEEAQALKNECESDLAEAIPALEAALSALDTLKPADITIVKSMKNPP 2634

  Fly  3045 YGVKLTMEAVCVIRGIKPDRKPDPS--GHMVEDYWGPSMRMLSDMKFLDSLKTFDKDNIPPPIIK 3107
            .||||.|.||||::.|||::..|||  |..:.||||||.::|.||.||..|:.:||:|||..:::
  Rat  2635 AGVKLVMAAVCVMKDIKPEKISDPSGTGGKIFDYWGPSKKLLGDMNFLRDLREYDKENIPVAVMQ 2699

  Fly  3108 RIREKYIADRDFVPEKIKAASMACEGICRWVRAMDVYDKVARIVMPKKAALAEAEGELSQQMEKL 3172
            :||.:|:.:.:|.|.|:..||.|.||:|:|:.||:|||:||::|.||||.||||:..|::.||.|
  Rat  2700 KIRSEYLTNPEFDPPKVAKASSAAEGLCKWIMAMEVYDRVAKVVAPKKARLAEAQKSLAETMELL 2764

  Fly  3173 NAKRAELQVILDKLQKLNDFFAEKSREKKRLEDEIDNCEKKLNRAEKLLGGLGGEKTRWSEAAKN 3237
            |.||.||..:...|:.|...|.||:.||..|||:::.|.|||.||.||:|||||||:|||:||.:
  Rat  2765 NQKRGELAQVEHHLENLQKTFQEKTEEKAALEDQVELCAKKLERATKLIGGLGGEKSRWSQAAND 2829

  Fly  3238 LHESISNIVGDVLLAGGCTAYLGYFTTEYRVNILDDWNALCKRKHIPSSETFSLATTLGHPMTIR 3302
            |..:..|:.||||::.|..||||.||:.:|....:||:.|||.|..|.||.|||:.|||.|:.||
  Rat  2830 LQATYENLTGDVLVSAGVIAYLGAFTSGFRQECTEDWSKLCKEKKFPCSEEFSLSKTLGDPVKIR 2894

  Fly  3303 AWSLAGLPADNFSVENGIIVTNSSRYSLLIDPQVQANKWIKNMEKNNNLKVIKQSDANYMQVLEL 3367
            ||::||||.|.||::||:||.||.|:.|:||||.||||||||.||:|.|.|||.||::||:.||.
  Rat  2895 AWNIAGLPTDTFSIDNGVIVNNSRRWPLMIDPQGQANKWIKNSEKDNQLSVIKLSDSDYMRTLEN 2959

  Fly  3368 AITFGQPVLIENVGEKLDSNLTPILEKNVIKHKGGLFIKSGDQMIEYNPNFRLYITTCLRNPRYP 3432
            .|..|.|||:|||||.||.:|.|:|.:...|..|...|:.|:.:|||:.:|:.||||.||||.|.
  Rat  2960 CIQLGTPVLLENVGEDLDPSLEPLLLRQTFKQGGIDCIRLGEVIIEYSFDFKFYITTKLRNPHYM 3024

  Fly  3433 PEVMVMVTVLNFMITEQGLREQLLAIVVAHERPDLQEKKEQLIIESARNRDALYTIESKILEVLS 3497
            ||:...|::||||||.:||.:|||.||||.|||:|:|::..||::||.|:..|..||::|||.||
  Rat  3025 PELATKVSLLNFMITPEGLEDQLLGIVVAKERPELEEERNALILQSAANKKQLKDIETRILETLS 3089

  Fly  3498 TSEGNVLEDENAINILSSSKILSEDIQEKQVIAVATEIEIDAARQQYIPVSKHSAILFFCISELA 3562
            .||||:||||:||.:|.|:|::|.:|.:||.:|..||::|..:|:.|.|::|||::|||.|::||
  Rat  3090 CSEGNILEDESAIKVLDSAKMMSNEITKKQQVAEKTELKIAESREGYRPIAKHSSVLFFSIADLA 3154

  Fly  3563 NVDPMYQYSLSWFLNLFVNTILKAPKSDQLSERLKNLNDYFTKSIYTNVCRSLFEKDKLVISLVM 3627
            |:||||||||:||:||::|:|..:.:|..|.:||:.|||:||.::|.|:||||||||||:.|.::
  Rat  3155 NIDPMYQYSLTWFVNLYINSIHDSNRSKILEKRLRYLNDHFTYNLYCNICRSLFEKDKLLFSFLL 3219

  Fly  3628 CLGILVSQGRVEKAALLFFLTGGIGYKTIPPNPLGAWLPDKSWASVCKAADLEGLKNLPQMMETY 3692
            |..:|:::..:|...|:|.||||:..|:...||...||.||||..:|:|::|.....|.:....:
  Rat  3220 CANLLLAKKEIEYQELMFLLTGGVSLKSAEKNPDPNWLQDKSWEEICRASELPVFHGLREHFCNH 3284

  Fly  3693 SDEWHNFYDASNPDQLQLP-APHNTVNDMYFLIVIKSLRPDKLVPAVRAFITRNLDRSFVEPPPF 3756
            ..||.:.|::..|..::|| :...|:|::..:|:::.|||||:.||:..::|..|.:.|||||||
  Rat  3285 IREWEDIYNSKEPHNMKLPESMDKTLNELQKIIILRCLRPDKITPAITNYVTDKLGKKFVEPPPF 3349

  Fly  3757 DLAASFADSSPKIPLVFLLSAGSDPMASLFMFAKQRNMY-DKLKTISLGQGQGPRAEKMIMEAAR 3820
            ||..|:.||:..|||:|:||.|:||||||..||..::|. :|.:.|||||||||.|.|||..|..
  Rat  3350 DLTKSYLDSNCTIPLIFVLSPGADPMASLLKFANDKSMSGNKFQAISLGQGQGPVATKMITAAIE 3414

  Fly  3821 HGQWVVLQNCHVAISWMGDLERICNDTTLTDGANHDYRLWCTSYPSAVFPVSVLQNSVKMTNEPP 3885
            .|.||.|||||:|:|||..||:||.|.: .:..|..:|||.|||||..|||::|||.||||||||
  Rat  3415 EGTWVCLQNCHLAVSWMPTLEKICEDFS-PEICNPTFRLWLTSYPSPKFPVTILQNGVKMTNEPP 3478

  Fly  3886 KGLRANMHRSFTSDPLMRDKFFTNAFLFSDSANKC------WLRGVFALVFFHAVVQERREFGPL 3944
            .|||.|:.:|:.|||:...:||          |.|      |.:.:|.:.||||:||||::||||
  Rat  3479 TGLRLNLLQSYLSDPISDPEFF----------NGCPGKELAWEKLLFGVCFFHALVQERKKFGPL 3533

  Fly  3945 GWNIPYEFNESDLKISLLQLKMFINQSQSIPFRGHVYLTGECNYGGRVTDDKDRRLILSLLNMIY 4009
            ||||||.||||||:||:.||::|||:..:|||....|||||||||||||||.||||:|::|...|
  Rat  3534 GWNIPYGFNESDLRISIRQLQLFINEYDTIPFEAISYLTGECNYGGRVTDDWDRRLLLTMLADFY 3598

  Fly  4010 NPNTIEEDNYALSQSGTYRVPLSPTRLNSIEYVSSFPLSPHPEVYGLHENADINRNVKETNALIS 4074
            |...||..:|..|.||.|..|...|....||::...|.:..||::|||||.||::::::|..|..
  Rat  3599 NSLIIENPHYKFSPSGNYFAPPKGTYDEYIEFIKKLPFTQEPEIFGLHENVDISKDLQQTKLLFE 3663

  Fly  4075 GVLLTQTDLMASVKASSSGGAKEDPAIAICKQVLKQLPEEFNIDEVSKTYPVIYTNSMNTVLRQE 4139
            .:||||    ..||.:.|.|:.:...:.|.:.:|.|||.:|:|:...::|||.|..||||||.||
  Rat  3664 SLLLTQ----GGVKQTGSSGSTDQILLEITEDILTQLPNDFDIEAALRSYPVRYEESMNTVLVQE 3724

  Fly  4140 LIRFNRLLSYIRKSLVNVGKAVVGQIAMIPELERTHASMVIGKLPADWLKKSYPSLKPLGSYVSD 4204
            :.|||.|:..||.:|.::.||:.|.:.|...||....|::|||:|..|.::|||||||||||::|
  Rat  3725 MERFNNLIITIRNTLRDLKKAIKGVVVMDSALEALSGSLLIGKVPEMWAQRSYPSLKPLGSYITD 3789

  Fly  4205 LLARLAFFQEWIDNGEPMVYWISGFYFTQSFITGVLQNYSRKNRFQIDMILIEFAVTKFEVQVPG 4269
            .|.||.|.::|...|:|.|:|||||:|||:|:||.:|||:||....||::..||.|...: ....
  Rat  3790 FLTRLKFLEDWFTMGKPNVFWISGFFFTQAFLTGAMQNYARKYTIPIDLLGYEFEVIPSD-NATN 3853

  Fly  4270 TPDIGAYIRGIFIEGARWNRKTKEVDESFSKVLFDTLPVIYLRPVLKALEDLPRSTAGGEPETIY 4334
            .|:.|.||.|::::||||||.:..:.|...|:|||.:|:|:::|.:|.  ::.::.|       |
  Rat  3854 PPEDGVYIHGLYLDGARWNRTSGLLAEQHPKLLFDLMPIIWIKPNVKT--EIVKTDA-------Y 3909

  Fly  4335 DCPVYKTSERRGVLSTTGHSTNFVMYLQLRCSRKPMHWINRGTACLCQLDD 4385
            .||:||||||:|.|||||||||||:.:.||......|||.||.|.|||||:
  Rat  3910 VCPLYKTSERKGTLSTTGHSTNFVIAMLLRTELPAQHWIKRGVALLCQLDN 3960

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dnah3NP_647937.2 DHC_N2 1086..1489 CDD:285579 173/430 (40%)
P-loop_NTPase 1620..1847 CDD:304359 176/226 (78%)
P-loop_NTPase 1934..2079 CDD:304359 83/149 (56%)
P-loop_NTPase 2264..2522 CDD:304359 118/264 (45%)
P-loop_NTPase 2613..2916 CDD:304359 116/302 (38%)
MT 2929..3272 CDD:289543 183/344 (53%)
AAA_9 3304..3519 CDD:289547 122/214 (57%)
Dynein_heavy 3659..4373 CDD:281078 339/721 (47%)
Dnah12XP_006252733.1 DHC_N2 679..1110 CDD:285579 173/430 (40%)
P-loop_NTPase 1238..1468 CDD:304359 176/229 (77%)
P-loop_NTPase 1552..1695 CDD:304359 83/149 (56%)
P-loop_NTPase 1875..2145 CDD:304359 119/273 (44%)
P-loop_NTPase 2246..2507 CDD:304359 114/295 (39%)
MT 2519..2864 CDD:289543 183/344 (53%)
AAA_9 2896..3110 CDD:289547 121/213 (57%)
Dynein_heavy 3251..3948 CDD:281078 339/721 (47%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 1 1.010 - - QHG56321
OrthoDB 1 1.010 - - D1872at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0000321
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
65.830

Return to query results.
Submit another query.