DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dnah3 and dhc-1

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_647937.2 Gene:Dnah3 / 38586 FlyBaseID:FBgn0035581 Length:4385 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_491363.1 Gene:dhc-1 / 172041 WormBaseID:WBGene00000962 Length:4568 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:4741 Identity:1152/4741 - (24%)
Similarity:2037/4741 - (42%) Gaps:864/4741 - (18%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    11 PYCDPRL-QDDKLRRKRTLHLPRVSQAQKKGEKRQLN-----DCPFYNLTYGFDQLPLDPV---- 65
            |||...: |..:..|......|.|.:...:.|...|:     |.|..||.  .:|..||.:    
 Worm   155 PYCKSFIGQSGRGERDGDKLAPTVQKCFTEAEAALLHLQQNIDIPEINLV--VNQHILDAIEQAG 217

  Fly    66 KEFLQEKISHMQ--------TDKIVGHCNREFDFHRYDLDNVKD-------EYDECDDDSLQE-- 113
            ||..:.||..:.        .:.:...|||.          ||:       |.|.....||||  
 Worm   218 KENRRAKIEDLGDLVEDANFLNALQSGCNRW----------VKEIRKVTQLERDPSSGTSLQEMT 272

  Fly   114 --LQLEDIIMPEQFEMLRDAKDHLYNFDSTACNQFPWIDKWMTGVRPSEQEIYEMTSHLLEIYCN 176
              |.||..::  :....||.:                                |:|..|..:.|.
 Worm   273 FWLNLERALL--KISQKRDGE--------------------------------EVTLTLEALKCG 303

  Fly   177 RRVRIFYPGCGTSSSLWTNQLRR------------QHGSPSELIGAYRTPSARHMRVNNMRGPPK 229
            :|   |:...|..|.   |.|::            :....|||:.|...|...|..|        
 Worm   304 KR---FHATVGFDSD---NGLKQKLAVVQDYNTLMKEFPLSELVSATDVPKLMHAVV-------- 354

  Fly   230 KEKFTAGDHYAFRTPQECRNELMRVGKIID----ELIEPVLKAAEHKIGHGLTKYPDP------P 284
                  |.....|..:..:..|.|..::::    :|...:||...   .:.|.:.|..      .
 Worm   355 ------GIFLHLRKLRSTKYPLQRALRLVEAISRDLNSQLLKVLS---SYNLMRTPIAEFNEIMS 410

  Fly   285 SCK----------DNTNRILRSAGILVGKKKNCYVGK-----CRIHRKDFATNEEFLRCLKRMEA 334
            .|:          |....:||.    :.|||.....|     ..:|::......:.|:..|:.|.
 Worm   411 QCQALFSKWDDEYDKFIALLRD----INKKKRDDPSKLSWKVTAVHKRLETRLMQILQFRKQHEQ 471

  Fly   335 THFPYMQPLQPVDPDDQKIKMLAKYRVELARAEKLFTLKIQKRYQCLLKSMSIVQLATYPSHLIR 399
            ......:.|:||....::.:.|   .::.:..||....::...|: .||::..:.:   .|....
 Worm   472 FRTVIERVLRPVGNGSREREQL---MIDSSEGEKSPDEQVDIAYE-FLKNVDFLDV---DSPAWE 529

  Fly   400 KAFRRINPRSALLQDAYQFIVKEKRDWPKLPPEV--ILMDY--LFVGDRGVRQDLAILIIVCLID 460
            .||:|...:..:::.|....:|.:.:..:...|:  |...|  ||:..|         |...:.:
 Worm   530 NAFKRYEDQIGVVETAITTRLKSQLESSRNSNEMFSIFSRYNALFIRPR---------IRGAIYE 585

  Fly   461 LQEDFRHYVKRSFLNYLLSSNMERRR------LQLEREPPEFPILTISPPVSWRSN----LLRGK 515
            .|....:.||.. :|.|.:...:.|.      :|....||      .|..:.|..|    |.|..
 Worm   586 YQTRLINRVKED-INELQARFTKARGEQGVKIMQTVGLPP------FSAKIMWIRNYERQLQRYM 643

  Fly   516 ARIGEVL-----------------------MTTHP-------TVQALNRLW----HDLYEDLVVV 546
            .|:.:||                       :.|.|       :||:.|  |    ..|..|.|.|
 Worm   644 KRVEDVLGKQWENHVDGRQLKADGDNFKVKLNTQPMFDEWVESVQSQN--WTLPNKILTVDRVQV 706

  Fly   547 DLGQLLLAQRPLDADTVQVFIE----KSCADVRDLLLNDWLPRCADLMNEMRGTWKDLVPMSGKY 607
            |....|..:....:|:..::.|    ||......|.:.:|    |...|:||.:...|:      
 Worm   707 DGRMQLQLKINYHSDSSVLYKEVSHLKSMGFRVPLKIVNW----AHQANQMRPSATSLI------ 761

  Fly   608 GGRAAMLFRCIHSAMS--RHLNSLIS---KSI-NYLFKVLCAFKGGNRIEKYSMFDAKL-----K 661
              .||..|..:::|::  :.::||::   |.| |.|.:.........::::|.:..|:.     :
 Worm   762 --EAARTFASVNAALASVQGVDSLLASYKKDIQNQLIEGATLGWDSYKVDQYQLKLAETVNTYQE 824

  Fly   662 RIPLMTLIASVVGA--------HFDHEPI--------------------NMGPGV----RPASNI 694
            |...:..:..:|.|        .:|.|.|                    |:...|    |....|
 Worm   825 RCEELLNVVRIVNADLNVLKSCRYDKETIENLLTSIQKGVDQLSLGNYSNLAQWVNTLDRQIETI 889

  Fly   695 YVYDEDDADPF------QQPQVNQFVEN---VPDIDDVAQFELDHSNKLYIYPYMQE-----LPR 745
            .....:||...      |..:|.:..|.   :|.:.:|.......:..|||.|..:|     |.:
 Worm   890 LARRVEDAIRVWTLVFSQSEEVEELRERQVVLPTVKNVVVDLCMTAQTLYISPSTRETREKILEQ 954

  Fly   746 IFTEHFKSILAVGYEIPRLEFVMSGG-EPET-KGFLHFIDEDHVDFLELC-EKVEQIVKVNWQGV 807
            ::..|......:.....|.:.||:.. |||| ...|:.:.|.     :.| ||....|......:
 Worm   955 LYEWHSVCTAQMRISGKRFQMVMNEEIEPETYHNILNVMPEG-----QACLEKAYDCVNGIMSDL 1014

  Fly   808 HVYLKPVYKYYFGLFQKLILPMVQKVW---TENNLPELG-AVQELLKKL------QAVSDTTYYL 862
            ..||.....|             |.:|   .|.....|| ::.:.:|.|      :.|.||....
 Worm  1015 EEYLSEWLSY-------------QSLWVLQAEQLFEMLGTSLSKWMKTLMEIRKGRLVFDTQDTR 1066

  Fly   863 RDFIPLN----------LFMLDNRHVKLSLRMYVREIYDFIIDFYKALN-WNENRAICEELEEMS 916
            :...|::          ||..|..|.::.:: :...:.|.:..|:.::: |.      ..||..|
 Worm  1067 KVIFPVSVEYGKAQQKILFKYDYWHKEMLVK-FGAVVGDEMQKFFNSVSKWR------NVLETQS 1124

  Fly   917 MKAGERPEETPEVVALQNYINDCREMRIFAIKDEIKNVLKRVVFLLTHTYLSSDELHLNSRTFIL 981
            :..|    .|.:.:.|.:::.        ::|.:.|:....|     ..|.||..| ||.:.:..
 Worm  1125 VDGG----STSDTIGLISFVQ--------SLKKQTKSGQDAV-----DLYRSSQRL-LNQQRYQF 1171

  Fly   982 PGE-------------LEEVLDLSAARLAVVRDNLELALRERRMEFEKLLAQEKRTMDGF----- 1028
            |.:             ..|:|.|..|.:.....||:....:.    ::|:  ||||::..     
 Worm  1172 PAQWLYSENVEGEWSAFTEILSLRDASIQTQMMNLQTKFAQE----DELV--EKRTVETLTEWNK 1230

  Fly  1029 --------RIREIRDVLTLEELKERVDTVDLLFTTIENLSREAKAINTEETLLQIDVSAF----- 1080
                    |.:|..:|:|..|.|            :..|:.|...:......|.:..||.     
 Worm  1231 SKPVEGAQRPQEALNVITAFEAK------------LNKLTEERNKMRKARVALDLSDSAHAPSEG 1283

  Fly  1081 PLLAEIIEKMEPIEKLWK------TSYEFEKDYLIWMFERFECLNADGVREQVENMHKIMYKLSR 1139
            ..|....|::..::.:||      |..:..|: ..|:            ..|...:.:.:.:|..
 Worm  1284 DKLTVATEELAAMKDVWKALQPVYTGIDEAKE-KTWL------------SVQPRKIRQSLDELMN 1335

  Fly  1140 QLAYNPVAKRA------AEQMRMKIEKFRVYLPVLDSICRHGLEKRHWDQISKILGRKVNPKLFP 1198
            ||...||..|.      .:||.....|..:.:..|.|   ..|::|||.|:.|.:  :||..|..
 Worm  1336 QLKQLPVKCRTYKSYEHVKQMLHTYGKMNMLVAELKS---EALKERHWHQMMKEM--RVNWNLSD 1395

  Fly  1199 -TLKDMIDVDIMSILPQLEEIANAAGKEYDLNNGLRIMQADWRDVMFEVLQYRDSDTHILASLDD 1262
             ||..:.|.||:.....:::|...|..|..|...||.|:..|::...|::.|::. |.::...||
 Worm  1396 LTLGQVWDADILRHEHTIKKILLVAQGEMALEEFLREMREYWQNYEVELVNYQNK-TRLIKGWDD 1459

  Fly  1263 IQTLLDDHIMRTQAMKRSPFITALGSKADDWEARLLLIQNIIDAWTQVQITWMYLEPIFS-SEDI 1326
            :...|.:|.....|||.||:.......|..|:.:|..|..:.|.|..||..|:|||.:|| |.:|
 Worm  1460 LFNKLKEHQNSLSAMKLSPYYKQFEESAQSWDEKLNKINAMFDVWIDVQRRWVYLEGLFSGSAEI 1524

  Fly  1327 MRQMPLEGRNFKAVDKLWRKIMKHTLKDRHVMAATEYPEMLEVFTKAIEDLETVTKGLNTYLEQK 1391
            ...:|.|...|..:......:||.......::..........:..:..:.|..:.|.|..|||::
 Worm  1525 STLLPFESSRFATITTDVLALMKKVAASPRILDVVNMQGAQRLLERLADMLAKIQKALGEYLERE 1589

  Fly  1392 RLFFARFFFLSNDELLEILSETKDPMRVQPHLRKCFEGIGSLTF-DDNMEIVEMVSDEEERVALV 1455
            |..|.||:|:.:::||||:..:||..|:|.||:|.|.||.::.. :::..|....|.|.|:|.||
 Worm  1590 RSSFPRFYFVGDEDLLEIMGNSKDITRIQKHLKKMFAGITAIDINEEDRSITAFHSREGEKVDLV 1654

  Fly  1456 RKINPQLANGLVEMWLKEVEMVMLDSVKEQMREAWEDYAMV--------ERISWVVSWPGQVVQG 1512
            :.::.:  :..:..||:.:|..|..::..|:..:...::.:        :.:.|:..:|.||:..
 Worm  1655 KIVSTK--DVRINDWLQALEAEMKHTLARQLAASLTHFSKMNIQTMTTDDYVEWLDKFPAQVITL 1717

  Fly  1513 ISCMAWTYEVEEAIETKELPAYLEKSNLQ----IADLVQLVRTDLQAGVRIAVEALIVLDVHDRD 1573
            .:.:.|..|:|:.:...:....:|::.::    :||.|...:..::   |..:||||...||.||
 Worm  1718 TAEIWWCDEMEKTLADGKGAENVEQAVVKTLELLADSVLKEQPPIR---RKKMEALITELVHKRD 1779

  Fly  1574 VVKYLTDCRITNIQDFDWISQLRYYWKVNEKNEDWVC-VSMVVTDVEYGMEYLGNLPRLVVTPLT 1637
            ..:.|...:|....||.|:..:|:|:...:.:....| |.|..:...||.||||...|||.||||
 Worm  1780 TCRKLVSMKIRAANDFGWLQCMRFYFDPKQVDPVRCCVVKMANSQFFYGFEYLGIQERLVRTPLT 1844

  Fly  1638 DRCYRTLMGALKLCLGGAPEGPAGTGKTETCKDLAKAVAKKCVVFNCSDGLDYKALGKFFKGLAQ 1702
            ||||.|:..||...|||:|.|||||||||:.|.|...:.:..:||||.:..|::|:|:...||.|
 Worm  1845 DRCYLTMTQALHSRLGGSPFGPAGTGKTESVKALGHQLGRFVLVFNCDETFDFQAMGRILVGLCQ 1909

  Fly  1703 SGAWACFDEFNRIELEVLSVVAQQILTIQRA-----------IGRKVVKFFFEDTMLKLDPTCSI 1756
            .|||.|||||||:|..:||.|:|||.|||.|           :|::          |.::....|
 Worm  1910 VGAWGCFDEFNRLEERMLSAVSQQIQTIQEAVRAGGDMSVDLVGKR----------LNVNSNIGI 1964

  Fly  1757 FITMNPGYAGRTELPDNLKVLFRTVAMMVPDYAMIGEITLYSNGFDMARNLSQKIVQAYKLCSEQ 1821
            ||||||||:||:.||||||.|||::||..||..:|.::.|:|.||..|..|:.|||..:.||.||
 Worm  1965 FITMNPGYSGRSNLPDNLKQLFRSLAMTQPDRQLIAQVMLFSQGFRTAETLANKIVPLFILCKEQ 2029

  Fly  1822 LSSQSHYDYGMRAVKSVLLASASLRR---------LYVDLPEPEIVLRAIVDVNLPKFLEQDISL 1877
            ||.|.|||:|:||:|.||:::.:::|         ...|:.|.:::::::.:..:||.:.:||:|
 Worm  2030 LSDQCHYDFGLRALKYVLVSAGNIKRDKLDKMGSAALEDVAEQQMLIQSVCETLVPKLVNEDIAL 2094

  Fly  1878 FIGIYMDLFPGVELPMPQRGDILKWLHINLADRNL---------QATPWYLEKILQIYEMLLVRH 1933
            ...:..|:|||:.....|..::.:.|. .:.|.:|         ..:.| |:|:||:|::..:.|
 Worm  2095 LFSLLSDVFPGIHYTANQMRELRQQLS-TVCDEHLLIYSDVQGEMGSMW-LDKVLQLYQITNLNH 2157

  Fly  1934 GLMIVGGSMGGKTTAYQVLAQTLRNVSTDEEATLKEFPVTFRIINPKAITMGQLYGRFDPVSHEW 1998
            |||:||.|..|||.|::||.:.|......|...        .:|:.||::...|||..||.:.||
 Worm  2158 GLMLVGSSGSGKTMAWKVLLKALERWENVEGVA--------HVIDAKAMSKDSLYGVMDPNTREW 2214

  Fly  1999 YDGVLAKTFREQVQGPKGE---RAWVMFDGPVDAVWIENLNTVLDDNKKLCLMSGEIMQMTKLMN 2060
            .||:.....|:.:...:||   |.|::|||.||..|:||||:||||||.|.|.:||.:.:...:.
 Worm  2215 TDGLFTSVIRKIIDNVRGEADRRQWIIFDGDVDPEWVENLNSVLDDNKLLTLPNGERLSIPPNVR 2279

  Fly  2061 MMFEPADLEQASPATVSRCGMIYMEPSQLGWRALHKSFINVL-------------------VNKV 2106
            ::||.|||:.|:.||||||||::.....:....|.:.:::::                   ||.:
 Worm  2280 IIFEVADLKYATLATVSRCGMVWFSEEVVTSEMLFERYLSIIRRVPLDSDSAISFSSSSAPVNLI 2344

  Fly  2107 GLGDIYMTLFED---------------------MTEWLVPAALEF--------LPQCKQMLELSP 2142
            |         ||                     ..:.:||.:|::        :|...|.| ||.
 Worm  2345 G---------EDAKPTRSIEIQRTAALALQTHFSPDGIVPGSLKYAVSELEHIMPPTPQRL-LSS 2399

  Fly  2143 IYQYQTFS--RFFLH---FLEKHKQFN--QAWFQQMFLFCFAWAYCSALTGQGQ-KTFDALLRKV 2199
            .:...::|  :...|   .::...:.:  |::..:..|....||:    :|.|: |:.:.:...:
 Worm  2400 FFSMMSYSIRKIVSHDEGLIDDSVEIDQIQSFVLRSMLTNLVWAF----SGDGKWKSREMMSDFI 2460

  Fly  2200 IYGSNENFPKPKYFSLNRGQMFPEKLLFLDYRFDEAENWWTWQKSDDSASTTSNFPENAQISELI 2264
            ...:..:.| |.           ::...:||....:.:|..|.....:....|:   ....::|:
 Worm  2461 RQATTISLP-PN-----------QQACLIDYEVQLSGDWQPWLSKVPTMEIESH---RVAAADLV 2510

  Fly  2265 VPTKET----GYISYWQEFCISKSYAMLVVGPTGTGKSAIITSNLLAMPKFANLVNVINFSARTS 2325
            |||.:|    ..::.|    :::...:::.||.|:||:..:.:.|.:..:. .:||| |||:.|:
 Worm  2511 VPTIDTVRHEMLLAAW----LAEHKPLVLCGPPGSGKTMTLLAALRSQQEM-EVVNV-NFSSSTT 2569

  Fly  2326 AQMVQDTIMSKLDRRRKG---VFGP-SLGKKCTVFCDDVAMPSKDTYGSQAPLELLRTWL----- 2381
            .:::..|.....:.||..   |..| .|.:...:|||::.:|:.|.||:|..:..||..:     
 Worm  2570 PELLLRTFDHYCEYRRTPNGVVLAPVQLSQWLVIFCDEINLPAPDKYGTQRVISFLRQLVELNGF 2634

  Fly  2382 ----DHGYWSDLVDTTKIELVDMTLMCAMGTLGGSNFIFPRLYRHMFVVAVDSFEDSTIVRIFTT 2442
                ||.:.|       :|.:.....|...|..|.:.:..|..||:.:|.||....:::.:|:.|
 Worm  2635 YRTSDHSWVS-------LERIQFVGACNPPTDPGRHPMTSRFLRHVPIVYVDYPGQTSLQQIYGT 2692

  Fly  2443 IGDWHFSKGYPEKVALLSRGLSE----AMVSVYRDAIRSFLPTPAKSHYSFSLRDITRVFQGI-V 2502
                 |::.. .|:....|||::    |||.||. |.:.......:.||.:|.|::||..:|| .
 Worm  2693 -----FNRAM-LKMTPAVRGLADQLTNAMVDVYL-ASQEHFTQDDQPHYVYSPRELTRWVRGISE 2750

  Fly  2503 MVPPKRMPDPEKLGRLWAHETYRVFYDRLVDQQDR---DRLLVMAVDACKSNLRFPLEQAFGERI 2564
            .:.|......|:|.||||||..|:|.||||.:::|   |:|    ||.       ..|:.||...
 Worm  2751 AITPLESLSAEQLVRLWAHEAIRLFQDRLVTEEEREWTDKL----VDT-------TAERYFGNAC 2804

  Fly  2565 EPGEKLTDNDLRNLFYGNYMEPDAEPKFYDEGDTYEKLEKLMKYYLREYNSFSSTPMDLVMFRFA 2629
            ...|.|.    |.|.|..::..:..|...:|...|.. .:|..:|..|.:      :.||:|...
 Worm  2805 RLDEALK----RPLLYSCWLSRNYVPVTREELQDYVS-ARLKGFYEEELD------VKLVLFDQM 2858

  Fly  2630 IEHVSRVSRVLQMPRGNILMVGMGGSGRRSSARLAAYIADCRLMTVQVSKSYTITDWRDDLKKIL 2694
            ::||.|:.|:.:..:|::|::|..|:|:.:.:|..|::....:..::|...||..|:.:|::.:|
 Worm  2859 LDHVLRIDRIYRQSQGHLLLIGTAGAGKTTLSRFVAWLNGLSVFQLKVHSKYTAADFDEDMRTVL 2923

  Fly  2695 MSASFNLNHTVFLFSDAQATDEGYVEDINGILNTGDLPNLYQLEDKATIMENMANVAKQLGKILD 2759
            ..|........|:..::...|.|::|.:|.:|..|::|.|::.::..|:|..:...|::.|.|||
 Worm  2924 RRAGCRNEKLCFIMDESNMLDTGFLERLNTLLANGEVPGLFEGDEHTTLMTQIKEGAQRQGLILD 2988

  Fly  2760 TLPSEVYAYYIDRIREQLHIALAFSPIGDSFKERIRVYPSLINCCTIDWYMPWPEEALSRVGVYF 2824
            : ..|:|.::..::...||:....:|.|...:||....|:|.|.|.::|:..|.|.||.:||...
 Worm  2989 S-HDELYKWFTQQVMRNLHVVFTMNPSGSGLRERASTSPALFNRCVLNWFGDWSENALYQVGSEL 3052

  Fly  2825 VSSMNLNRPHGEETQEPVQSKDAADPDEEEVRRETVGVEREQTQLEADLVDCVMYFHQSVVDASE 2889
            ..:|:|:|...|.:.....|.:.              |..:.|..:| :|:.:...|::|...:|
 Worm  3053 TRTMDLDRTDYEGSVRLTPSCEL--------------VPSQPTYRDA-VVNTLCLVHKTVQKFNE 3102

  Fly  2890 KCYLELNRRNYV---TPSAYLELLKAFRTFYTRKLDEITRLRDRYTTGLEKLDFAAGQVGEMQTN 2951
               :|..:.:.|   ||..:|:.:|.|.:.:..|..::...:.....||.|       :.|.:..
 Worm  3103 ---METKKGHRVMACTPRHFLDFIKQFMSLFHEKRSDLEEEKIHLNIGLNK-------ISETEEQ 3157

  Fly  2952 LYDLQPKLKVLSEETDRIMVNIERETAEAEKKKEVVGADEAAANEAAAAAQAIKD---------- 3006
            :.:||..||:.|.|..      |::.|...|.||::|..:.|..|...:.|..|:          
 Worm  3158 VKELQKSLKLKSNELQ------EKKEAANLKLKEMLGDQQKAEEEKKFSEQLQKELAEQLKQMAE 3216

  Fly  3007 ---DCETDLAEAIPAMEAALEALNTLKPADIFIVKSMKNPPYGVKLTMEAVCVIRGIKPDRKPDP 3068
               ..|.|||:..||:..|..|:..:|.:.:..||||.:||..||||:||:|::           
 Worm  3217 KKTFVENDLAQVEPAVAEAQTAVQGIKKSQLVEVKSMSSPPVTVKLTLEAICIL----------- 3270

  Fly  3069 SGHMVEDYWGPSMRMLSDMKFLDSLKTFDKDNIPPPIIKRIREKYIADRDFVPEKIKAASMACEG 3133
            .|..|...|....:::....|:..:..||.:.:.|.|:|:: ||||.:.|:..:|:..||:||..
 Worm  3271 LGENVGTDWKAIRQVMMKDDFMTRILQFDTELLTPEILKQM-EKYIQNPDWEFDKVNRASVACGP 3334

  Fly  3134 ICRWVRAMDVYDKVARIVMPKKAALAEAEGELSQQMEKLNAKRAELQVILDKLQKLNDFFAEKSR 3198
            :.:|.||..:|..:...|.|.:..|...|.|.:::.::.......:..:.:.:.|..:.:|:...
 Worm  3335 MVKWARAQLLYSTMLHKVEPLRNELKRLEQEAAKKTQEGKVVDVRITELEESIGKYKEEYAQLIG 3399

  Fly  3199 EKKRLEDEIDNCEKKLNRAEKLLGGLGGEKTRWSEAAKNLHESISNIVGDVLLAGGCTAYLGYFT 3263
            :.:.::.::.:.::|:||:.:||..|..|:.|||..:....:.:.::|||.||:....||.||:.
 Worm  3400 QAENIKQDLLSVQEKVNRSTELLSSLRSERDRWSSGSAGFSQQMDSLVGDALLSSAFLAYAGYYD 3464

  Fly  3264 TEYRVNILDDW-----NALCKRKHIPSSETFSLATTLGHPMTIRAWSLAGLPADNFSVENGIIVT 3323
            ...|..|...|     ||....:|  ........:|:...:   .|.|..||.|:...||.|::.
 Worm  3465 QMLRDEIFHKWFNHVVNAGLHFRH--DLARIEYLSTVDDRL---QWQLNSLPVDDLCTENAIMLH 3524

  Fly  3324 NSSRYSLLIDPQVQANKWIKNMEKNNNLKVIKQSDANYMQVLELAITFGQPVLIENVGEKLDSNL 3388
            ..:||.|:|||..||.::|.......|::.....|.::.:.||.|:.||..:|:::| |..|..|
 Worm  3525 RFNRYPLIIDPSGQAVEYIMKQFAGKNIQKTSFLDESFRKNLESALRFGNSLLVQDV-EAYDPIL 3588

  Fly  3389 TPILEKNVIKHKGGLFIKSGDQMIEYNPNFRLYITTCLRNPRYPPEVMVMVTVLNFMITEQGLRE 3453
            .|:|.:.|.:..|.:.|..|||.|:.:|:|::::.|......:.|::...||.:||.:|...|..
 Worm  3589 NPVLNREVKRAGGRVLITIGDQDIDLSPSFQIFMITRDSTVEFSPDICSRVTFVNFTVTSSSLAS 3653

  Fly  3454 QLLAIVVAHERPDLQEKKEQLIIESARNRDALYTIESKILEVLSTSEGNVLEDENAINILSSSKI 3518
            |.|..|:..||||:.:|:..|:.........|..:|..:|..|:.|:|.:|:|.:.|..|...|.
 Worm  3654 QCLNQVLRSERPDVDKKRNDLLKLQGEFAVRLRHLEKALLAALNESKGKILDDNSVIETLEKLKN 3718

  Fly  3519 LSEDIQEKQVIAVATEIEIDAARQQYIPVSKHSAILFFCISELANVDPMYQYSLSWFLNLFVNTI 3583
            .:.::.:|.........|:||...||..:|...:.::..:.:|..:..:|.|||.:.:.:|.: :
 Worm  3719 EAAEVAQKSAETDKVMAEVDAVSAQYQRLSTACSHIYHTLQQLNEIHFLYHYSLDFLVEIFTH-V 3782

  Fly  3584 LKAPK---SDQLSERLKNLNDYFTKSIYTNVCRSLFEKDKLVISLVMCLGILVSQGRVEKAALLF 3645
            ||.|:   :...::||:.:.....::::..|.|.:...||::::|:: :.|.:.......|....
 Worm  3783 LKTPELSSTTDYAKRLRIITTSLFQTVFRRVSRGMLHTDKVLLALLL-MRIHIRSNPSAPAYEQH 3846

  Fly  3646 F-------------------LTGGIGYKTIPPNPLGAWLPDKSWASVCKAADLEGLKNLPQMMET 3691
            |                   :.||:.:.|:           ::..|:.||..:.|.:|:...::.
 Worm  3847 FDLLLGRSDFVAKNDEADSTIPGGLDFLTV-----------ENKKSIAKARKVVGFENVFAHLQH 3900

  Fly  3692 YSDEWHNFYDASNPDQLQLPAPHNTVND--------MYFLIVIKSLRPDKLVPAVRAFITRNLDR 3748
            .|....::....||:. .:|...:..:.        |..|||:.:||||:|:.:....::...|.
 Worm  3901 NSAAVTSWLTNDNPES-NVPVVWDDADGKLSPLCIAMNSLIVVHALRPDRLMASAHRVVSTAFDD 3964

  Fly  3749 SFVEPPPFDLAASFADS--SPKIPLVFLLSAGSDPMASLFMFAKQRNMYDKLKTISLGQGQG-PR 3810
            .|::........|..|:  ||..|::...:.|.|....:...|.:.|.  :|.:|::|..:| .:
 Worm  3965 HFMQQDKVVDILSIVDNEVSPSEPVLLCSATGYDASGKIEDLAVETNR--QLTSIAIGSAEGFNQ 4027

  Fly  3811 AEKMIMEAARHGQWVVLQNCHVAISWMGDLERICNDTTLTDGANHDYRLWCTSYPSAVFPVSVLQ 3875
            |:..:..|.:.|:||:|:|.|:|.||:..||:..:...    .:..:||:.|:......|.|:|:
 Worm  4028 ADSALGTATKSGRWVLLKNVHLAPSWLAQLEKRLHSMK----PHAQFRLFLTAEIHPKLPSSILR 4088

  Fly  3876 NSVKMTNEPPKGLRANMHRSFTSDPLMRDKFFTNA-------FLFSDSANKCWLRGVFALVFFHA 3933
            .|..:..||..||:||:.||.:|.|..|   .|.|       :|.     .|||         ||
 Worm  4089 ASRVVVFEPATGLKANLLRSLSSIPPQR---LTKAPTERSRLYLL-----VCWL---------HA 4136

  Fly  3934 VVQERREFGPLGWNIPYEFNESDLKISLLQLKMFIN---------QSQSIPFRGHVYLTGECNYG 3989
            :||||..:.||||:..|||:::||:::...|...::         :.:.:|:.....|..:|.||
 Worm  4137 LVQERLRYTPLGWSTAYEFSDADLRVACDTLDAAVDAVAQGRPNVEPERLPWTTLRTLLSQCIYG 4201

  Fly  3990 GRVTDDKDRRLILSLLNMIYNPNTIEEDNYALSQ---SGTYRVPLSPTRLNSIEYVSSFPLSPHP 4051
            |::.:..|:.|:..:|..::...:.|:|:..:.:   ..:...|....:...|.:|........|
 Worm  4202 GKIDNQFDQVLLDCVLENLFTAKSFEQDHVLIPKYDGDDSLFTPNMSKKDQMIGWVEELKNEQLP 4266

  Fly  4052 EVYGLHENADINRNVKETNALISGVL-LTQTDLMASVKASSSGGAKE-DPAI-----AICKQVLK 4109
            ...||..||:.....|...:::..:| :|..:|     |.:..|.:| .|..     .:.||.|:
 Worm  4267 AWLGLPNNAEKVLLTKRGESMLRNMLKVTDEEL-----AFNEDGKEEVKPQWMAQLGELAKQWLQ 4326

  Fly  4110 QLPEEFNIDEVSKTYPVIYTNSMNTVLRQELIRF--------NRLLSYIRKSLVNVGKAVVGQIA 4166
            .||:|  |.::.:|...|         :..|.||        ::||..||:.|..:......:..
 Worm  4327 LLPKE--IVKMRRTVENI---------KDPLFRFFEREVNLGSQLLKDIRRDLNEISAVCRAEKK 4380

  Fly  4167 MIPELERTHASMVIGKLPADWLKKSYPSLKPLGSYVSDLLARLAFFQEWI-----DNGEPMVYWI 4226
            ...|.....||:..|::|..|.:.:.|....:..:::||..||   ::.|     ||.:...:|:
 Worm  4381 QNNETRALAASLQKGEVPTGWKRYTVPREVTVMDWMTDLNERL---KQLIRIGGADNLKRETFWL 4442

  Fly  4227 SGFYFTQSFITGVLQNYSRKNRFQIDMILIEFAVTKFEVQVPGTPDIGAY-IRGIFIEGAR 4286
            .|.:..:::||...|..::.|.:.::.:       ...:.:..|.....: |.||.|.||:
 Worm  4443 GGTFSPEAYITATRQQVAQANTWSLEQL-------NLHIHIGRTDSTDVFRISGIDIRGAK 4496

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dnah3NP_647937.2 DHC_N2 1086..1489 CDD:285579 110/417 (26%)
P-loop_NTPase 1620..1847 CDD:304359 118/237 (50%)
P-loop_NTPase 1934..2079 CDD:304359 61/147 (41%)
P-loop_NTPase 2264..2522 CDD:304359 75/279 (27%)
P-loop_NTPase 2613..2916 CDD:304359 75/305 (25%)
MT 2929..3272 CDD:289543 93/355 (26%)
AAA_9 3304..3519 CDD:289547 68/214 (32%)
Dynein_heavy 3659..4373 CDD:281078 157/679 (23%)
dhc-1NP_491363.1 DHC_N1 236..811 CDD:285571 126/682 (18%)
DYN1 985..4276 CDD:227570 921/3553 (26%)
DHC_N2 1291..1687 CDD:285579 110/416 (26%)
P-loop_NTPase 1827..2055 CDD:304359 118/237 (50%)
P-loop_NTPase 2158..2298 CDD:304359 61/147 (41%)
P-loop_NTPase 2510..2770 CDD:304359 75/279 (27%)
Cas4_I-A_I-B_I-C_I-D_II-B 2769..>2879 CDD:294426 36/131 (27%)
P-loop_NTPase 2852..3130 CDD:304359 75/296 (25%)
MT 3144..3475 CDD:289543 93/355 (26%)
AAA_9 3504..3719 CDD:289547 68/215 (32%)
Dynein_heavy 3872..4549 CDD:281078 158/686 (23%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 1 1.000 49 1.000 Domainoid score I7912
eggNOG 1 0.900 - - E1_COG5245
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
Isobase 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 00.000 Not matched by this tool.
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
54.710

Return to query results.
Submit another query.