DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dnah3 and Dnah11

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_647937.2 Gene:Dnah3 / 38586 FlyBaseID:FBgn0035581 Length:4385 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038934019.1 Gene:Dnah11 / 117253 RGDID:621088 Length:4514 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4497 Identity:1279/4497 - (28%)
Similarity:2091/4497 - (46%) Gaps:678/4497 - (15%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    96 LDNVKDEYDECDDDSLQELQLEDIIMPEQFEMLRDAKDHLYNFDSTACNQFPWIDKWMTGVRPSE 160
            :.::|:|:.||.:...|.:                       :|.:.|:...:           |
  Rat   485 IHSMKEEFIECCNVFRQSI-----------------------YDPSDCDSMEF-----------E 515

  Fly   161 QEIYEMTSHLLEIYCNRRV-RIFYPGCGTSSSLWTNQLRRQHGSPSELIGAYRTPSARHMRVNNM 224
            .:.::..|..|:.  :||: .:...|....|.|         .|..:|:..:.         |.:
  Rat   516 SDYFQFKSKTLDF--DRRLGTLLCEGLSNCSGL---------ESAFKLLTIFG---------NFL 560

  Fly   225 RGPPKKEKFTAGDHYA-----FRTPQECRNELMRVGKIIDELIEPVLKAAEHKIGHGLTKYPDPP 284
            ..|...|.|:  .||:     |..      ||....::.||    .:|..||  ||.:.....| 
  Rat   561 EKPVVMEIFS--PHYSTLLNMFNA------ELDMCKRLYDE----HMKQIEH--GHEILNKNMP- 610

  Fly   285 SCKDNTNRILRSAGILVGKKKNCYVGKCRIHRKDFATNEEFLRCLKRMEAT-------------- 335
                .|:..::.|.:|:.:.:..:.....:|.....:.:|...|.|..|.|              
  Rat   611 ----FTSGNIKWARMLLERLQMFWSNFTSLHYLFPDSPDEAAVCQKYAEMTTLLDQFESRIYSEW 671

  Fly   336 --------HFPYMQPLQPVDPDDQKIKMLAKYRVELARAEKLFTLKIQKRYQCLLKSMSIVQLAT 392
                    .|...|||....|    |..|.....:    .||..:..:.:|..:||..:|...|.
  Rat   672 RRNVDKTCEFNLNQPLVKFSP----INGLLSVNFD----PKLVAVLREVKYLLMLKKSNIPDSAL 728

  Fly   393 ---YPSHLIRKAFRRINPRSALLQDAYQFIVKEKRDWPKLPPEVILMDYLFVGDRGVRQDLAILI 454
               ...::|.|....:.    ||...|.          ||...::.::|..:.......|..:.:
  Rat   729 GIFQKKNIILKHIGNLE----LLVQGYN----------KLKQTLLEVEYPLIEKELGAIDEQLRV 779

  Fly   455 IVCLIDLQEDFRHYVKRSFLNYLLSSNMERRRLQLEREP----------PEFPILTISPPVSWRS 509
            ....:..|:||..|:::.   .:.::.:|||..|.:...          .|:|:|.       |.
  Rat   780 AATWLTWQDDFWVYMEKV---QVATAELERRVSQTQSNVQTIQQTMQAWAEWPLLP-------RR 834

  Fly   510 NLLRGKARI----GEVLMTTHPTVQALNRLWHDLYEDLVVVDLGQLLLAQRPLDADTVQVFIEKS 570
            ...|..|..    |::....:..::......|:|.|:      .:.|....| ..|:.::::|  
  Rat   835 ETRREAALTLDDKGDLFAKKYKLIREDGYKIHNLVEE------NRKLFRADP-SLDSWKIYVE-- 890

  Fly   571 CADVRDLLLNDWLPRCA-DLMNEMRGTWKDLVPMSGKYGGRAAMLFRCIHSAMSRHLNSLISKSI 634
              .:.|:::..:..... ||...:|.|.|.|.|         |..|:.          .::....
  Rat   891 --FIDDIVVEGFFQTILHDLDFFLRNTEKQLKP---------APFFQA----------QMLLMPP 934

  Fly   635 NYLFKVLCAFKGGNRIEKYSMFDAKLKRIPLMTLIASVVGAHFDHEPINMGPGVRPASNIYVYDE 699
            ..:||.....:.|:..  |::.:|.|.....::.....|.||.|               |..|..
  Rat   935 EIVFKPPLEREAGDGF--YNLVEAMLCGSFKVSAQMGRVAAHLD---------------IPDYQN 982

  Fly   700 DDADPFQQPQVNQFVEN-VPD-IDDVAQFELDHSNKLYIYPYMQELPRIFTEHFKSILAVGYEIP 762
            |..:.....:|.|.:.| |.| ||.|.:|.    :.|..|.|:....|:  |..:..|..|:.:|
  Rat   983 DMDNMLGLAEVRQEIMNRVADVIDKVLEFR----SSLETYSYLWVDDRV--EILRQFLLYGHAVP 1041

  Fly   763 RLEFVMSGGE-----PETKGFLHFIDEDHVDFLELCEKVEQIVKVNWQGVHVYLKPVYKYYFGLF 822
            ..|.....||     |..:.|...||.....::::.:..:..|..:|  ..:.::|.        
  Rat  1042 SEEIDAPAGEDILQSPTLEQFKEQIDIYEALYVQMSKFDDFRVFNSW--FKIDMRPF-------- 1096

  Fly   823 QKLILPMVQKVWTENNLPELGAVQELLKKLQAVSDTTYYLRDFIPLNLFMLDNRHVKLSLRMYVR 887
             ||.:..|.|.|:       ...||.|  |:.|.|:...|:.||         :.....|:....
  Rat  1097 -KLSMLNVIKKWS-------WMFQEHL--LRFVVDSLSELQGFI---------KQTNAGLQRQPH 1142

  Fly   888 E-IYDFIIDFYKAL--NWNENRAICEELEEMSMKAGERPEETPEVVALQNYINDCREMRIFAIKD 949
            | .:|.::|....|  ..:..||..|..|.:        :||  ::.|::|.....| :::|..:
  Rat  1143 EGDHDGLVDIMGHLLAVRSRQRATDELFEPL--------KET--IMLLESYGQKMPE-QVYAQLE 1196

  Fly   950 EIK---NVLKRVVFLLTHTYLSSDELHLNSRTFILPGELEEVLDLSAARLAVVR------DNLEL 1005
            |:.   ...|::..::.|                      ||..|..|.:.::|      |..:.
  Rat  1197 ELPERWETTKKIAAVVRH----------------------EVSPLQNAEVTLLRKKCILFDEKQA 1239

  Fly  1006 ALRERRMEFEKLLAQEKRTMDGFRIREIRDVL-----TLEELKERVDTVDLLFTTIENLSREAKA 1065
            ..|||...:..|         ||:......||     .||.|:|.|       ..::|.:|    
  Rat  1240 EFRERFRSYAPL---------GFKAENPYSVLDKANQELEALEEEV-------VQMQNCAR---- 1284

  Fly  1066 INTEETLLQIDVSAFPLLAEIIEKMEPIEKLWKTSYEFEKDYLIWMFERFECLNADGVREQVENM 1130
                  |.::.:..:..:.:...::..:::||        |.:::            ||..::|.
  Rat  1285 ------LFEVVLPEYKQMKQCRREVRLLKELW--------DIIVY------------VRRSIDNW 1323

  Fly  1131 HKIMYKLSRQLAYNPVAKRAAEQMRMKIEKFRVYLPVLDSICR-----HGLE------------- 1177
            .:..:   ||:        ..|||.:::.:|...:..||...|     .|||             
  Rat  1324 TETRW---RQV--------NMEQMDLELRRFAKEIWSLDKAVRVWDAYSGLEGTVKDMTTSLRAV 1377

  Fly  1178 ---------KRHWDQISKILGRKVNPKLFPTLKDMIDVDIMSILPQLEEIANAAGKE-------- 1225
                     .|||.|::..:|.:.:.....||.|::.|.:..:...:.:|.:.|.||        
  Rat  1378 AELQNPALRDRHWQQLTNAIGVRFSINDSTTLADLLAVQLHQVEEDVRDIVDKAVKELGTEKVIT 1442

  Fly  1226 ------------YDLNN--GLRIMQADWRDVMFEVLQYRDS----------DTHILASLDDIQTL 1266
                        |::::  |..::::|  :.:||.|::..|          .|..|.|......:
  Rat  1443 DVSHTWEALEFSYEVHHRTGTPLLKSD--EQLFETLEHNQSFLLGLGTSWLATEPLGSAYSHAGI 1505

  Fly  1267 LDDHIMRTQAMKRSPFITALGSKADDWEARLLLIQNIIDAWTQVQITWMYLEPIF-SSEDIMRQM 1330
            |.   ::.|.:.:|.::.....:...|:.:|.:...:|..|.|||.||.:||.|| .||||..|:
  Rat  1506 LQ---VQLQTLLQSKYVEYFIDQVLSWQNKLNVADAVIFTWMQVQRTWSHLESIFVCSEDIRIQL 1567

  Fly  1331 PLEGRNFKAVDKLWRKIMKHTLKDRHVMAATEYPEMLEVFTKAIEDLETVTKGLNTYLEQKRLFF 1395
            ..:.:.|..||..::::|..|.|.::|:.||..|.:.|........|....|.|..|||.||:.|
  Rat  1568 VEDAQRFDEVDAEFKELMFKTAKIKNVLEATCRPHLYEKLKDFQHRLSLCEKALAEYLETKRVTF 1632

  Fly  1396 ARFFFLSNDELLEILSETKDPMRVQPHLRKCFEGIGSLTFDDNMEI-----VEMVSDEEERVALV 1455
            :||:|:|:.:||::||:...|.:|..||.|.|:.|..|.|:||.|:     |.|.|.|:|.|:..
  Rat  1633 SRFYFISSADLLDLLSKGAQPKQVTRHLVKLFDSISDLQFEDNPEVSTCKAVGMFSKEKEYVSFQ 1697

  Fly  1456 RKINPQLANGLVEMWLKEVEMVMLDSVKEQMREAWEDYAMVERISWVVSWPGQVVQGISCMAWTY 1520
            ....   ..|.||.||.::|..|.::|:..:.||...|....|..|:..:|.||....|.:.||.
  Rat  1698 AGCE---CIGHVESWLLQLEQTMKETVRLAIAEAIAAYEEKPRELWIFDFPAQVALTGSQIWWTT 1759

  Fly  1521 EV-------EEAIETKELPAYLEKSNLQIADLVQLVRTDLQAGVRIAVEALIVLDVHDRDVVKYL 1578
            :|       ||..|| .|..:.:|...|:..|:.|:..:|..|.|..|..:..:|||.||||..|
  Rat  1760 DVGIAFSRLEEGYET-ALKDFHKKQISQLNTLITLLLGELSPGDRQKVMTICTIDVHARDVVAKL 1823

  Fly  1579 TDCRITNIQDFDWISQLRYYWKVNEKNEDWVC-VSMVVTDVEYGMEYLGNLPRLVVTPLTDRCYR 1642
            ...::.:.:.|.|:||||:.|:.:.|:    | |::.....:|..|||||.||||:||||||||.
  Rat  1824 ISQKVVSPRAFTWLSQLRHEWEESRKH----CIVNICDAHFQYCYEYLGNSPRLVITPLTDRCYI 1884

  Fly  1643 TLMGALKLCLGGAPEGPAGTGKTETCKDLAKAVAKKCVVFNCSDGLDYKALGKFFKGLAQSGAWA 1707
            ||..:|.|.:.|||.||||||||||.|||.:|:.....|||||:.:||:::|..:|||.|:|||.
  Rat  1885 TLTQSLHLTMSGAPAGPAGTGKTETTKDLGRALGMMVYVFNCSEQMDYRSIGNIYKGLVQTGAWG 1949

  Fly  1708 CFDEFNRIELEVLSVVAQQILTIQRAIGRKVVKFFFEDTMLKLDPTCSIFITMNPGYAGRTELPD 1772
            ||||||||.:|||||||.|:..|..||..:..:|.|....:.|.|:..||||:|||||||||||:
  Rat  1950 CFDEFNRIAVEVLSVVAVQVKMIHDAIRSRRRRFVFLGETIPLKPSVGIFITLNPGYAGRTELPE 2014

  Fly  1773 NLKVLFRTVAMMVPDYAMIGEITLYSNGFDMARNLSQKIVQAYKLCSEQLSSQSHYDYGMRAVKS 1837
            |||.|||..||:.||..:|.||.|.:.||..||:|::|.:..|.||.|.||.|.|||:|:||:||
  Rat  2015 NLKALFRPCAMVAPDTELICEIMLVAEGFVDARSLARKFISLYTLCDELLSKQDHYDWGLRAIKS 2079

  Fly  1838 VLLASASLRRLYVDLPEPEIVLRAIVDVNLPKFLEQDISLFIGIYMDLFPGVELPMPQRGDILKW 1902
            ||:.:.||:|...:.||.::::||:.|.|:||.:..|:.:|:|:..||||.:::|..::....:.
  Rat  2080 VLVVAGSLKRGDKNRPEDQVLMRALRDFNMPKIVTDDVPVFLGLVSDLFPALDVPRQRKPHFEQM 2144

  Fly  1903 LHINLADRNLQATPWYLEKILQIYEMLLVRHGLMIVGGSMGGKTTAYQVLAQTLRNVSTDEEATL 1967
            :..:..:..||....::.|::|:.|:|.|||.:.:||.:..||:...:.|.:|..|        :
  Rat  2145 VKQSTLELRLQPEESFILKVVQLEELLAVRHSIFVVGNAGTGKSKILRTLNRTYVN--------M 2201

  Fly  1968 KEFPVTFRIINPKAITMGQLYGRFDPVSHEWYDGVLAKTFREQV----QGPKGERAWVMFDGPVD 2028
            |:.|| :..:||||:|..:|:|.....:.||.||:|:...|||.    .||    .|::.||.:|
  Rat  2202 KQKPV-WNDLNPKAVTTDELFGFIHHATREWKDGLLSSILREQANLTHDGP----TWIVLDGDID 2261

  Fly  2029 AVWIENLNTVLDDNKKLCLMSGEIMQMTKLMNMMFEPADLEQASPATVSRCGMIYMEPSQLGW-- 2091
            .:|||:||||:||||.|.|.|.|.:.:|..|.::||...|:.|:||||||.|::|:.|..|||  
  Rat  2262 PLWIESLNTVMDDNKVLTLASNERVALTPSMRLLFETHHLQTATPATVSRAGILYVNPQDLGWNP 2326

  Fly  2092 -------RALHKS-----------FINVLVNKVGLGDIYMTLFEDMTEWLVPAA---------LE 2129
                   |..|:|           :|.|.:.|:      .|.|:.:|.  ||.:         ||
  Rat  2327 YVASWIDRRRHQSEKANLTILFDKYIPVCLEKL------RTSFKAITS--VPESSLVQTICTLLE 2383

  Fly  2130 FLPQCKQMLELSPIYQYQTFSRFFLHFLEKHKQFNQAWFQQMFLFCFAWAYCSALTGQGQKTFDA 2194
            .|...:.:...||...|:.:                      |:|...|.:..           .
  Rat  2384 CLLTPENIPSDSPKETYEVY----------------------FVFACVWTFGG-----------T 2415

  Fly  2195 LLRKVIYGSNENFPKPKYFSLNRGQMFPEKLLFLDYRFD-EAENWWTWQKSDDSASTTSNFPE-- 2256
            |||..:.....:|.:..:..: :...||.:....||..| :.:.:..|         |...|:  
  Rat  2416 LLRDQLSDYQADFSRWWHKEM-KAVKFPSQGTIFDYYLDHKTKKFLPW---------TDKVPQFT 2470

  Fly  2257 ---NAQISELIVPTKETGYISYWQEFCISKSYAMLVVGPTGTGKSAIITSNLLAMPKFANLVNVI 2318
               :|.:..::|.|.||..:.|:.|..::|...:::||..|.||:..::..|.::.: ..:|:.:
  Rat  2471 MDADAPLKTVLVHTPETTRLRYFTELLLNKGKPLMLVGNAGVGKTVFLSDTLASISE-DYIVSRV 2534

  Fly  2319 NFSARTSAQMVQDTIMSKLDRRRKGVFGPSLGKKCTVFCDDVAMPSKDTYGSQAPLELLRTWLDH 2383
            .|:..|::..:|..:...|:::....:||...||...|.||:.||..|.||:..|..|||..:|:
  Rat  2535 PFNYYTTSADLQRILEKPLEKKAGRNYGPRGNKKLVYFIDDLNMPEVDLYGTVQPHALLRQHIDY 2599

  Fly  2384 GYWSDLVDTTKIELVDMTLMCAMGTLGGSNFIFPRLYRHMFVVAVDSFEDSTIVRIFTTIGDWHF 2448
            |:|.|.......|:.:...:..|..:.||..:.|||.||..|:|.:.....|:..|:..|..::.
  Rat  2600 GHWYDRHKVMLKEIRNCQYVACMNPMAGSFTVDPRLKRHFTVLAFNFPSLDTLTTIYGQIFSFYL 2664

  Fly  2449 -SKGYPEKVALLSRGLSEAMVSVYRDAIRSFLPTPAKSHYSFSLRDITRVFQGIVMVPPKRMPDP 2512
             .:.:...|......|.:|.::.::....:|:||..|.||:|:|||::.:||||:...|:.:..|
  Rat  2665 QQQAFCPSVLRTGPSLIQATIAFHQTMAENFVPTAIKFHYNFNLRDLSNIFQGILFASPECLKCP 2729

  Fly  2513 EKLGRLWAHETYRVFYDRLVDQQDRDRLLVMAVDACKSNLRFPLEQAFGERIEPGEKLTDNDLRN 2577
            |.|.|||.|||.||:.|||||..|.|......::|.....:             |........:.
  Rat  2730 EDLARLWLHETSRVYGDRLVDANDSDLFQRKMLEAAHKYFK-------------GADANTLQQQP 2781

  Fly  2578 LFYGNYMEPDAEPKFYDEGDTYEKLEKLMKYYLREYNSFSSTPMDLVMFRFAIEHVSRVSRVLQM 2642
            |.|.::.....:| .|:....:|.|:.::...:..||...| .|.||:|..|::||.|:||:|:.
  Rat  2782 LVYCHFASGREDP-CYEPVKDWEGLKAVLTEMMGNYNELHS-EMHLVLFEDAMQHVCRISRILRT 2844

  Fly  2643 PRGNILMVGMGGSGRRSSARLAAYIADCRLMTVQVSKSYTITDWRDDLKKILMSASFNLNHTVFL 2707
            |:|:.|:||:||||::|.:||||||....:..:.:::.|...|.|.||..:.:........||||
  Rat  2845 PQGHALLVGVGGSGKQSLSRLAAYICSLEVFQITLTEGYGTQDLRVDLANLYVRTGAKNMPTVFL 2909

  Fly  2708 FSDAQATDEGYVEDINGILNTGDLPNLYQLEDKATIMENMANVAKQLGKILDTLPSEVYAYYIDR 2772
            .:||...||.::..||.:|.:||:|.|:..||...|:..:.|..:.|| |.|: ....:|:::.|
  Rat  2910 LTDAHVLDESFLVLINDLLASGDIPGLFSDEDTDKIISGIRNEVRGLG-ITDS-RENCWAFFLAR 2972

  Fly  2773 IREQLHIALAFSPIGDSFKERIRVYPSLINCCTIDWYMPWPEEALSRVGVYFVSSMNLNRPHGEE 2837
            :|.||.:...|||:|.:.:.|.|.:|:|:||..|||:..||:|||..|...|:            
  Rat  2973 VRLQLKMVFCFSPVGHTLRVRARKFPALVNCTAIDWFHAWPQEALVSVSRRFI------------ 3025

  Fly  2838 TQEPVQSKDAADPDEEEVRRETVGVEREQTQLEADLVDCVM-YFHQSVVDASEKCYLELNRRNYV 2901
                           ||:.    |:|.:    ..|.:...| |.|.||.:.|...|....|.||.
  Rat  3026 ---------------EEIE----GIEPQ----HKDSISLFMAYVHTSVKEVSAWYYQNERRYNYT 3067

  Fly  2902 TPSAYLELLKAFRTFYTRKLDEITRLRDRYTTGLEKLDFAAGQVGEMQTNLYDLQPKLKVLSEET 2966
            ||.::||.:..|::...:|..|:.|.::....|::||...|.|||.::..|...:.:|::.:::.
  Rat  3068 TPRSFLEQISLFKSLLKKKRGEVQRKKEHLGNGIQKLQTTASQVGNLKARLASQEAELQLRNQDA 3132

  Fly  2967 DRIMVNIERETAEAEKKKEVVGADEAAANEAAAAAQAIKDDCETDLAEAIPAMEAALEALNTLKP 3031
            :.::..|..:|.:..::|.:..|:|.........|...:.:||.||.:|.||:.||..|||||..
  Rat  3133 EALITKIGLQTEKVSREKAIADAEERKVAAIQTEASQKQRECEADLLKAEPALVAATAALNTLNR 3197

  Fly  3032 ADIFIVKSMKNPPYGVKLTMEAVCVIRGIKPDRKPDPSGHMVED-YWGPS---MRMLSDMKFLDS 3092
            .::..:|:..|||..|.....||.|:..        |.|.:.:| .|..:   |..:.|  ||.:
  Rat  3198 VNLTELKTFPNPPNAVTNVTAAVMVLLA--------PRGRVPKDRSWKAARIFMGKVDD--FLQA 3252

  Fly  3093 LKTFDKDNIPPPIIKRIREKYIADRDFVPEKIKAASMACEGICRWVRAMDVYDKVARIVMPKKAA 3157
            |..:||::||...:|.:.|:|:.|.:|.|..|:..|.|..|:|.||..:..:.:|...|.||:.|
  Rat  3253 LINYDKEHIPENCLKVVNEQYLKDPEFNPNLIRTKSFAAAGLCAWVINIIKFYEVYCDVEPKRQA 3317

  Fly  3158 LAEAEGELSQQMEKLNAKRAELQVILDKLQKLNDFFAEKSREKKRLEDEIDNCEKKLNRAEKLLG 3222
            ||:...:|:...|||.|.|.:|..:...|::|...|.:.:.||.|.::|::...|.::.|.:|:.
  Rat  3318 LAQTNLDLAAATEKLEAVRRKLVDLDHNLRRLTASFEKATAEKVRCQEEVNQTNKTIDLANRLVS 3382

  Fly  3223 GLGGEKTRWSEAAKNLHESISNIVGDVLLAGGCTAYLGYFTTEYRVNILD-DWNALCKRK-HIPS 3285
            .|..||.||.::.|:.......:.|||||.....:|:|.||.:||..::| .|....::| .||.
  Rat  3383 ELESEKIRWGQSIKSFETQEKTLCGDVLLTAAFVSYIGSFTRQYRQELVDCKWIPFLQQKVSIPI 3447

  Fly  3286 SETFSLATTLGHPMTIRAWSLAGLPADNFSVENGIIVTNSSRYSLLIDPQVQANKWIKNMEKNNN 3350
            :|...:..||....||..|:..|||:|..|.||..|:|:..|:.|:||||.|..||||| :...:
  Rat  3448 AEGLDMIATLTDDATIATWNNQGLPSDRMSTENATILTHCKRWPLMIDPQQQGIKWIKN-KYGPD 3511

  Fly  3351 LKVIKQSDANYMQVLELAITFGQPVLIENVGEKLDSNLTPILEKNVIKHKGGLFIKSGDQMIEYN 3415
            |||.......::..:|:|:.||..:||||:.|.:|..|.|:|.:|.||.  |.:|:.||:..|:|
  Rat  3512 LKVTHLGQKGFLNAIEMALAFGDVILIENLKETVDPVLGPLLGRNTIKK--GKYIRIGDKECEFN 3574

  Fly  3416 PNFRLYITTCLRNPRYPPEVMVMVTVLNFMITEQGLREQLLAIVVAHERPDLQEKKEQLIIESAR 3480
            .||||.:.|.|.||.|.||:....|:|||.:||.||..||||.||:.|||||:..|  |::...:
  Rat  3575 KNFRLILHTKLANPHYKPELQAQTTLLNFTVTEDGLEGQLLAEVVSVERPDLERLK--LVLTKHQ 3637

  Fly  3481 N--RDALYTIESKILEVLSTSEGNVLEDENAINILSSSKILSEDIQEKQVIAVATEIEIDAARQQ 3543
            |  :..|..:|..:|..||.:||:.|:|.:.:..|.::|..:.:|:.|.:.|...|.:|:..|:.
  Rat  3638 NDFKIELRHLEEDLLLRLSAAEGSFLDDTDLVERLETTKATAAEIEHKVIEARENERKINETREC 3702

  Fly  3544 YIPVSKHSAILFFCISELANVDPMYQYSLSWFLNLFVNTILKAPKSDQLSERLKNLNDYFTKSIY 3608
            |.||:..:::::|.||:|..::|:||:||..|..||...|.:|.|.:...||:..|.:..|.:.:
  Rat  3703 YRPVAARASLMYFVISDLRKINPVYQFSLKAFKTLFHRAIEQADKVEDTQERICALMESVTYATF 3767

  Fly  3609 TNVCRSLFEKDKLVISLVMCLGILVSQGRVEKAALLFFLTGGIGYKTIPPNPLGAWLPDKSWASV 3673
            .:..::|||||||.....|...||:.:..:....|.|.|...:.:....|..   :|..:||::|
  Rat  3768 LHASQALFEKDKLTFLSQMAFQILLRRNEIHPLELDFLLRFTVEHTYSSPVD---FLTAQSWSAV 3829

  Fly  3674 CKAADLEGLKNLPQMMETYSDEWHNFYDASNPDQLQLPAPHNTVNDMYFLIVIKSLRPDKLVPAV 3738
            ...|.:|..:.|.:.:|..:.:|..:.::..|::.:||......:.:..||:::::|||::..|:
  Rat  3830 KAVALMEEFRGLDRDVEGSAKQWRKWVESECPEKEKLPQEWKKKSLIQKLIILRAVRPDRMTYAL 3894

  Fly  3739 RAFITRNLDRSFVEPPPFDLAASFADSSPKIPLVFLLSAGSDPMASLFMFAKQRNM---YDKLKT 3800
            |.|:...|...:||....||..:|.:|||..|:.|:||.|.|.:..|.:..|:...   ..|...
  Rat  3895 RNFVEEKLGTKYVERTRLDLGKAFGESSPGTPVFFILSPGVDALKDLEVLGKRLGFTIDSGKFHN 3959

  Fly  3801 ISLGQGQGPRAEKMIMEAARHGQWVVLQNCHVAISWMGDLERICNDTTLTDGANHDYRLWCT--- 3862
            :||||||...||..:.:||..|.||.|||.|:...|:|.||::..  ..:.|::.|||::.:   
  Rat  3960 VSLGQGQELVAEMALEKAAIGGHWVFLQNVHLVAKWLGTLEKLLE--KFSQGSHRDYRVFLSAEA 4022

  Fly  3863 --SYPSAVFPVSVLQNSVKMTNEPPKGLRANMHR---SFTSDPL---MRDKFFTNAFLFSDSANK 3919
              |....|.|..:|:||:|:|||||.|:.||:|.   :|..|.|   .:|:.|.:.         
  Rat  4023 APSQHEPVIPQGLLENSIKITNEPPTGMLANLHAALYNFDQDTLEMCSKDQEFKSI--------- 4078

  Fly  3920 CWLRGVFALVFFHAVVQERREFGPLGWNIPYEFNESDLKISLLQLKMFINQSQSIPFRGHVYLTG 3984
                 :|:|.:||..|..|..|||.||:..|.|:..||.|....|...:..:..:|:....||.|
  Rat  4079 -----LFSLCYFHGCVAGRLRFGPQGWSRSYPFSPGDLTICTNILYNHLEANPHVPWEDLRYLFG 4138

  Fly  3985 ECNYGGRVTDDKDRRLILSLLNMIYNPNTIEEDNYALSQSGTYRVPLSPTRLNSIEYVSSFPLSP 4049
            |..|||.:||..||:|....|....||:.||::   |..:..:..|.........:|:.......
  Rat  4139 EIIYGGHITDAWDRKLCRVYLEEFMNPSLIEDE---LMLAPGFAAPPYSDYSGYHQYIEDMLPPE 4200

  Fly  4050 HPEVYGLHENADINRNVKETNALISGVLLTQTDLMASVKASSSGGAKEDPAIAICKQVLKQLPEE 4114
            .|.:||||.||:|......:|.|...:|..|.  ..:|.....|.:.||....|...:|::||||
  Rat  4201 SPALYGLHPNAEIELLTVTSNMLFRTLLEMQP--RNAVSNEEQGQSTEDKVKNILDDILERLPEE 4263

  Fly  4115 FNIDEVSKTYPVIYTNSMNTVL--RQELIRFNRLLSYIRKSLVNVGKAVVGQIAMIPELERTHAS 4177
            ||:.|:.:..|    |....:|  .||..|.|.||..||.||.::...:.|::.:.|::|...::
  Rat  4264 FNMAEIMQKNP----NRSPYILVCFQECERMNVLLREIRVSLQHLDLGLKGELTLSPDVETQLSA 4324

  Fly  4178 MVIGKLPADWLKKSYPSLKPLGSYVSDLLARLAFFQEWI-DNGEPMVYWISGFYFTQSFITGVLQ 4241
            :...::|..|.|.:|||...|..:.:|||.|......|. |...|.|.|:||.:..|||:|.::|
  Rat  4325 LSYDRVPDTWNKLAYPSTYGLAQWFNDLLLRCRELDTWTQDLTLPAVVWLSGLFNPQSFLTAIMQ 4389

  Fly  4242 NYSRKNRFQIDMILIEFAVTKFEVQVPG-TPDIGAYIRGIFIEGARWNRKTKEVDESFSKVLFDT 4305
            ..:|||.:.:|.:.:...|||...:..| .|..|||:.|:.:|||||:.::..:.::..|.|..|
  Rat  4390 TMARKNEWPLDRMCLTIDVTKKTKEDYGHPPREGAYLHGLHLEGARWDIQSGALVDARLKELTST 4454

  Fly  4306 LPVIYLRPVLKALEDLPRSTAGGEPETIYDCPVYKTSERRGVLSTTGHSTNFVMYLQLRCSRKPM 4370
            :|||:.:.:....:::..:         |:||||||..|         ...:|...:||...:..
  Rat  4455 MPVIFAKAIPADRQEVKHA---------YECPVYKTKAR---------GLTYVWTFRLRSKDRIA 4501

  Fly  4371 HWINRGTACLCQ 4382
            .|:..|.|.|.:
  Rat  4502 KWVLAGVALLLE 4513

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dnah3NP_647937.2 DHC_N2 1086..1489 CDD:285579 116/467 (25%)
P-loop_NTPase 1620..1847 CDD:304359 131/226 (58%)
P-loop_NTPase 1934..2079 CDD:304359 57/148 (39%)
P-loop_NTPase 2264..2522 CDD:304359 76/258 (29%)
P-loop_NTPase 2613..2916 CDD:304359 103/303 (34%)
MT 2929..3272 CDD:289543 104/346 (30%)
AAA_9 3304..3519 CDD:289547 91/216 (42%)
Dynein_heavy 3659..4373 CDD:281078 221/731 (30%)
Dnah11XP_038934019.1 DHC_N1 220..789 CDD:400611 67/398 (17%)
DHC_N2 1296..1722 CDD:400618 115/464 (25%)
DYN1 1550..4164 CDD:227570 925/2772 (33%)
AAA_6 1862..2188 CDD:403853 160/325 (49%)
MT 3095..3439 CDD:289543 106/353 (30%)
Dynein_C 4217..4512 CDD:408026 94/318 (30%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
21.810

Return to query results.
Submit another query.