DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dnah3 and Dnah11

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_647937.2 Gene:Dnah3 / 38586 FlyBaseID:FBgn0035581 Length:4385 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038934019.1 Gene:Dnah11 / 117253 RGDID:621088 Length:4514 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4497 Identity:1279/4497 - (28%)
Similarity:2091/4497 - (46%) Gaps:678/4497 - (15%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    96 LDNVKDEYDECDDDSLQELQLEDIIMPEQFEMLRDAKDHLYNFDSTACNQFPWIDKWMTGVRPSE 160
            :.::|:|:.||.:...|.:                       :|.:.|:...:           |
  Rat   485 IHSMKEEFIECCNVFRQSI-----------------------YDPSDCDSMEF-----------E 515

  Fly   161 QEIYEMTSHLLEIYCNRRV-RIFYPGCGTSSSLWTNQLRRQHGSPSELIGAYRTPSARHMRVNNM 224
            .:.::..|..|:.  :||: .:...|....|.|         .|..:|:..:.         |.:
  Rat   516 SDYFQFKSKTLDF--DRRLGTLLCEGLSNCSGL---------ESAFKLLTIFG---------NFL 560

  Fly   225 RGPPKKEKFTAGDHYA-----FRTPQECRNELMRVGKIIDELIEPVLKAAEHKIGHGLTKYPDPP 284
            ..|...|.|:  .||:     |..      ||....::.||    .:|..||  ||.:.....| 
  Rat   561 EKPVVMEIFS--PHYSTLLNMFNA------ELDMCKRLYDE----HMKQIEH--GHEILNKNMP- 610

  Fly   285 SCKDNTNRILRSAGILVGKKKNCYVGKCRIHRKDFATNEEFLRCLKRMEAT-------------- 335
                .|:..::.|.:|:.:.:..:.....:|.....:.:|...|.|..|.|              
  Rat   611 ----FTSGNIKWARMLLERLQMFWSNFTSLHYLFPDSPDEAAVCQKYAEMTTLLDQFESRIYSEW 671

  Fly   336 --------HFPYMQPLQPVDPDDQKIKMLAKYRVELARAEKLFTLKIQKRYQCLLKSMSIVQLAT 392
                    .|...|||....|    |..|.....:    .||..:..:.:|..:||..:|...|.
  Rat   672 RRNVDKTCEFNLNQPLVKFSP----INGLLSVNFD----PKLVAVLREVKYLLMLKKSNIPDSAL 728

  Fly   393 ---YPSHLIRKAFRRINPRSALLQDAYQFIVKEKRDWPKLPPEVILMDYLFVGDRGVRQDLAILI 454
               ...::|.|....:.    ||...|.          ||...::.::|..:.......|..:.:
  Rat   729 GIFQKKNIILKHIGNLE----LLVQGYN----------KLKQTLLEVEYPLIEKELGAIDEQLRV 779

  Fly   455 IVCLIDLQEDFRHYVKRSFLNYLLSSNMERRRLQLEREP----------PEFPILTISPPVSWRS 509
            ....:..|:||..|:::.   .:.::.:|||..|.:...          .|:|:|.       |.
  Rat   780 AATWLTWQDDFWVYMEKV---QVATAELERRVSQTQSNVQTIQQTMQAWAEWPLLP-------RR 834

  Fly   510 NLLRGKARI----GEVLMTTHPTVQALNRLWHDLYEDLVVVDLGQLLLAQRPLDADTVQVFIEKS 570
            ...|..|..    |::....:..::......|:|.|:      .:.|....| ..|:.::::|  
  Rat   835 ETRREAALTLDDKGDLFAKKYKLIREDGYKIHNLVEE------NRKLFRADP-SLDSWKIYVE-- 890

  Fly   571 CADVRDLLLNDWLPRCA-DLMNEMRGTWKDLVPMSGKYGGRAAMLFRCIHSAMSRHLNSLISKSI 634
              .:.|:::..:..... ||...:|.|.|.|.|         |..|:.          .::....
  Rat   891 --FIDDIVVEGFFQTILHDLDFFLRNTEKQLKP---------APFFQA----------QMLLMPP 934

  Fly   635 NYLFKVLCAFKGGNRIEKYSMFDAKLKRIPLMTLIASVVGAHFDHEPINMGPGVRPASNIYVYDE 699
            ..:||.....:.|:..  |::.:|.|.....::.....|.||.|               |..|..
  Rat   935 EIVFKPPLEREAGDGF--YNLVEAMLCGSFKVSAQMGRVAAHLD---------------IPDYQN 982

  Fly   700 DDADPFQQPQVNQFVEN-VPD-IDDVAQFELDHSNKLYIYPYMQELPRIFTEHFKSILAVGYEIP 762
            |..:.....:|.|.:.| |.| ||.|.:|.    :.|..|.|:....|:  |..:..|..|:.:|
  Rat   983 DMDNMLGLAEVRQEIMNRVADVIDKVLEFR----SSLETYSYLWVDDRV--EILRQFLLYGHAVP 1041

  Fly   763 RLEFVMSGGE-----PETKGFLHFIDEDHVDFLELCEKVEQIVKVNWQGVHVYLKPVYKYYFGLF 822
            ..|.....||     |..:.|...||.....::::.:..:..|..:|  ..:.::|.        
  Rat  1042 SEEIDAPAGEDILQSPTLEQFKEQIDIYEALYVQMSKFDDFRVFNSW--FKIDMRPF-------- 1096

  Fly   823 QKLILPMVQKVWTENNLPELGAVQELLKKLQAVSDTTYYLRDFIPLNLFMLDNRHVKLSLRMYVR 887
             ||.:..|.|.|:       ...||.|  |:.|.|:...|:.||         :.....|:....
  Rat  1097 -KLSMLNVIKKWS-------WMFQEHL--LRFVVDSLSELQGFI---------KQTNAGLQRQPH 1142

  Fly   888 E-IYDFIIDFYKAL--NWNENRAICEELEEMSMKAGERPEETPEVVALQNYINDCREMRIFAIKD 949
            | .:|.::|....|  ..:..||..|..|.:        :||  ::.|::|.....| :::|..:
  Rat  1143 EGDHDGLVDIMGHLLAVRSRQRATDELFEPL--------KET--IMLLESYGQKMPE-QVYAQLE 1196

  Fly   950 EIK---NVLKRVVFLLTHTYLSSDELHLNSRTFILPGELEEVLDLSAARLAVVR------DNLEL 1005
            |:.   ...|::..::.|                      ||..|..|.:.::|      |..:.
  Rat  1197 ELPERWETTKKIAAVVRH----------------------EVSPLQNAEVTLLRKKCILFDEKQA 1239

  Fly  1006 ALRERRMEFEKLLAQEKRTMDGFRIREIRDVL-----TLEELKERVDTVDLLFTTIENLSREAKA 1065
            ..|||...:..|         ||:......||     .||.|:|.|       ..::|.:|    
  Rat  1240 EFRERFRSYAPL---------GFKAENPYSVLDKANQELEALEEEV-------VQMQNCAR---- 1284

  Fly  1066 INTEETLLQIDVSAFPLLAEIIEKMEPIEKLWKTSYEFEKDYLIWMFERFECLNADGVREQVENM 1130
                  |.::.:..:..:.:...::..:::||        |.:::            ||..::|.
  Rat  1285 ------LFEVVLPEYKQMKQCRREVRLLKELW--------DIIVY------------VRRSIDNW 1323

  Fly  1131 HKIMYKLSRQLAYNPVAKRAAEQMRMKIEKFRVYLPVLDSICR-----HGLE------------- 1177
            .:..:   ||:        ..|||.:::.:|...:..||...|     .|||             
  Rat  1324 TETRW---RQV--------NMEQMDLELRRFAKEIWSLDKAVRVWDAYSGLEGTVKDMTTSLRAV 1377

  Fly  1178 ---------KRHWDQISKILGRKVNPKLFPTLKDMIDVDIMSILPQLEEIANAAGKE-------- 1225
                     .|||.|::..:|.:.:.....||.|::.|.:..:...:.:|.:.|.||        
  Rat  1378 AELQNPALRDRHWQQLTNAIGVRFSINDSTTLADLLAVQLHQVEEDVRDIVDKAVKELGTEKVIT 1442

  Fly  1226 ------------YDLNN--GLRIMQADWRDVMFEVLQYRDS----------DTHILASLDDIQTL 1266
                        |::::  |..::::|  :.:||.|::..|          .|..|.|......:
  Rat  1443 DVSHTWEALEFSYEVHHRTGTPLLKSD--EQLFETLEHNQSFLLGLGTSWLATEPLGSAYSHAGI 1505

  Fly  1267 LDDHIMRTQAMKRSPFITALGSKADDWEARLLLIQNIIDAWTQVQITWMYLEPIF-SSEDIMRQM 1330
            |.   ::.|.:.:|.::.....:...|:.:|.:...:|..|.|||.||.:||.|| .||||..|:
  Rat  1506 LQ---VQLQTLLQSKYVEYFIDQVLSWQNKLNVADAVIFTWMQVQRTWSHLESIFVCSEDIRIQL 1567

  Fly  1331 PLEGRNFKAVDKLWRKIMKHTLKDRHVMAATEYPEMLEVFTKAIEDLETVTKGLNTYLEQKRLFF 1395
            ..:.:.|..||..::::|..|.|.::|:.||..|.:.|........|....|.|..|||.||:.|
  Rat  1568 VEDAQRFDEVDAEFKELMFKTAKIKNVLEATCRPHLYEKLKDFQHRLSLCEKALAEYLETKRVTF 1632

  Fly  1396 ARFFFLSNDELLEILSETKDPMRVQPHLRKCFEGIGSLTFDDNMEI-----VEMVSDEEERVALV 1455
            :||:|:|:.:||::||:...|.:|..||.|.|:.|..|.|:||.|:     |.|.|.|:|.|:..
  Rat  1633 SRFYFISSADLLDLLSKGAQPKQVTRHLVKLFDSISDLQFEDNPEVSTCKAVGMFSKEKEYVSFQ 1697

  Fly  1456 RKINPQLANGLVEMWLKEVEMVMLDSVKEQMREAWEDYAMVERISWVVSWPGQVVQGISCMAWTY 1520
            ....   ..|.||.||.::|..|.::|:..:.||...|....|..|:..:|.||....|.:.||.
  Rat  1698 AGCE---CIGHVESWLLQLEQTMKETVRLAIAEAIAAYEEKPRELWIFDFPAQVALTGSQIWWTT 1759

  Fly  1521 EV-------EEAIETKELPAYLEKSNLQIADLVQLVRTDLQAGVRIAVEALIVLDVHDRDVVKYL 1578
            :|       ||..|| .|..:.:|...|:..|:.|:..:|..|.|..|..:..:|||.||||..|
  Rat  1760 DVGIAFSRLEEGYET-ALKDFHKKQISQLNTLITLLLGELSPGDRQKVMTICTIDVHARDVVAKL 1823

  Fly  1579 TDCRITNIQDFDWISQLRYYWKVNEKNEDWVC-VSMVVTDVEYGMEYLGNLPRLVVTPLTDRCYR 1642
            ...::.:.:.|.|:||||:.|:.:.|:    | |::.....:|..|||||.||||:||||||||.
  Rat  1824 ISQKVVSPRAFTWLSQLRHEWEESRKH----CIVNICDAHFQYCYEYLGNSPRLVITPLTDRCYI 1884

  Fly  1643 TLMGALKLCLGGAPEGPAGTGKTETCKDLAKAVAKKCVVFNCSDGLDYKALGKFFKGLAQSGAWA 1707
            ||..:|.|.:.|||.||||||||||.|||.:|:.....|||||:.:||:::|..:|||.|:|||.
  Rat  1885 TLTQSLHLTMSGAPAGPAGTGKTETTKDLGRALGMMVYVFNCSEQMDYRSIGNIYKGLVQTGAWG 1949

  Fly  1708 CFDEFNRIELEVLSVVAQQILTIQRAIGRKVVKFFFEDTMLKLDPTCSIFITMNPGYAGRTELPD 1772
            ||||||||.:|||||||.|:..|..||..:..:|.|....:.|.|:..||||:|||||||||||:
  Rat  1950 CFDEFNRIAVEVLSVVAVQVKMIHDAIRSRRRRFVFLGETIPLKPSVGIFITLNPGYAGRTELPE 2014

  Fly  1773 NLKVLFRTVAMMVPDYAMIGEITLYSNGFDMARNLSQKIVQAYKLCSEQLSSQSHYDYGMRAVKS 1837
            |||.|||..||:.||..:|.||.|.:.||..||:|::|.:..|.||.|.||.|.|||:|:||:||
  Rat  2015 NLKALFRPCAMVAPDTELICEIMLVAEGFVDARSLARKFISLYTLCDELLSKQDHYDWGLRAIKS 2079

  Fly  1838 VLLASASLRRLYVDLPEPEIVLRAIVDVNLPKFLEQDISLFIGIYMDLFPGVELPMPQRGDILKW 1902
            ||:.:.||:|...:.||.::::||:.|.|:||.:..|:.:|:|:..||||.:::|..::....:.
  Rat  2080 VLVVAGSLKRGDKNRPEDQVLMRALRDFNMPKIVTDDVPVFLGLVSDLFPALDVPRQRKPHFEQM 2144

  Fly  1903 LHINLADRNLQATPWYLEKILQIYEMLLVRHGLMIVGGSMGGKTTAYQVLAQTLRNVSTDEEATL 1967
            :..:..:..||....::.|::|:.|:|.|||.:.:||.:..||:...:.|.:|..|        :
  Rat  2145 VKQSTLELRLQPEESFILKVVQLEELLAVRHSIFVVGNAGTGKSKILRTLNRTYVN--------M 2201

  Fly  1968 KEFPVTFRIINPKAITMGQLYGRFDPVSHEWYDGVLAKTFREQV----QGPKGERAWVMFDGPVD 2028
            |:.|| :..:||||:|..:|:|.....:.||.||:|:...|||.    .||    .|::.||.:|
  Rat  2202 KQKPV-WNDLNPKAVTTDELFGFIHHATREWKDGLLSSILREQANLTHDGP----TWIVLDGDID 2261

  Fly  2029 AVWIENLNTVLDDNKKLCLMSGEIMQMTKLMNMMFEPADLEQASPATVSRCGMIYMEPSQLGW-- 2091
            .:|||:||||:||||.|.|.|.|.:.:|..|.::||...|:.|:||||||.|::|:.|..|||  
  Rat  2262 PLWIESLNTVMDDNKVLTLASNERVALTPSMRLLFETHHLQTATPATVSRAGILYVNPQDLGWNP 2326

  Fly  2092 -------RALHKS-----------FINVLVNKVGLGDIYMTLFEDMTEWLVPAA---------LE 2129
                   |..|:|           :|.|.:.|:      .|.|:.:|.  ||.:         ||
  Rat  2327 YVASWIDRRRHQSEKANLTILFDKYIPVCLEKL------RTSFKAITS--VPESSLVQTICTLLE 2383

  Fly  2130 FLPQCKQMLELSPIYQYQTFSRFFLHFLEKHKQFNQAWFQQMFLFCFAWAYCSALTGQGQKTFDA 2194
            .|...:.:...||...|:.:                      |:|...|.:..           .
  Rat  2384 CLLTPENIPSDSPKETYEVY----------------------FVFACVWTFGG-----------T 2415

  Fly  2195 LLRKVIYGSNENFPKPKYFSLNRGQMFPEKLLFLDYRFD-EAENWWTWQKSDDSASTTSNFPE-- 2256
            |||..:.....:|.:..:..: :...||.:....||..| :.:.:..|         |...|:  
  Rat  2416 LLRDQLSDYQADFSRWWHKEM-KAVKFPSQGTIFDYYLDHKTKKFLPW---------TDKVPQFT 2470

  Fly  2257 ---NAQISELIVPTKETGYISYWQEFCISKSYAMLVVGPTGTGKSAIITSNLLAMPKFANLVNVI 2318
               :|.:..::|.|.||..:.|:.|..::|...:::||..|.||:..::..|.::.: ..:|:.:
  Rat  2471 MDADAPLKTVLVHTPETTRLRYFTELLLNKGKPLMLVGNAGVGKTVFLSDTLASISE-DYIVSRV 2534

  Fly  2319 NFSARTSAQMVQDTIMSKLDRRRKGVFGPSLGKKCTVFCDDVAMPSKDTYGSQAPLELLRTWLDH 2383
            .|:..|::..:|..:...|:::....:||...||...|.||:.||..|.||:..|..|||..:|:
  Rat  2535 PFNYYTTSADLQRILEKPLEKKAGRNYGPRGNKKLVYFIDDLNMPEVDLYGTVQPHALLRQHIDY 2599

  Fly  2384 GYWSDLVDTTKIELVDMTLMCAMGTLGGSNFIFPRLYRHMFVVAVDSFEDSTIVRIFTTIGDWHF 2448
            |:|.|.......|:.:...:..|..:.||..:.|||.||..|:|.:.....|:..|:..|..::.
  Rat  2600 GHWYDRHKVMLKEIRNCQYVACMNPMAGSFTVDPRLKRHFTVLAFNFPSLDTLTTIYGQIFSFYL 2664

  Fly  2449 -SKGYPEKVALLSRGLSEAMVSVYRDAIRSFLPTPAKSHYSFSLRDITRVFQGIVMVPPKRMPDP 2512
             .:.:...|......|.:|.::.::....:|:||..|.||:|:|||::.:||||:...|:.:..|
  Rat  2665 QQQAFCPSVLRTGPSLIQATIAFHQTMAENFVPTAIKFHYNFNLRDLSNIFQGILFASPECLKCP 2729

  Fly  2513 EKLGRLWAHETYRVFYDRLVDQQDRDRLLVMAVDACKSNLRFPLEQAFGERIEPGEKLTDNDLRN 2577
            |.|.|||.|||.||:.|||||..|.|......::|.....:             |........:.
  Rat  2730 EDLARLWLHETSRVYGDRLVDANDSDLFQRKMLEAAHKYFK-------------GADANTLQQQP 2781

  Fly  2578 LFYGNYMEPDAEPKFYDEGDTYEKLEKLMKYYLREYNSFSSTPMDLVMFRFAIEHVSRVSRVLQM 2642
            |.|.::.....:| .|:....:|.|:.::...:..||...| .|.||:|..|::||.|:||:|:.
  Rat  2782 LVYCHFASGREDP-CYEPVKDWEGLKAVLTEMMGNYNELHS-EMHLVLFEDAMQHVCRISRILRT 2844

  Fly  2643 PRGNILMVGMGGSGRRSSARLAAYIADCRLMTVQVSKSYTITDWRDDLKKILMSASFNLNHTVFL 2707
            |:|:.|:||:||||::|.:||||||....:..:.:::.|...|.|.||..:.:........||||
  Rat  2845 PQGHALLVGVGGSGKQSLSRLAAYICSLEVFQITLTEGYGTQDLRVDLANLYVRTGAKNMPTVFL 2909

  Fly  2708 FSDAQATDEGYVEDINGILNTGDLPNLYQLEDKATIMENMANVAKQLGKILDTLPSEVYAYYIDR 2772
            .:||...||.::..||.:|.:||:|.|:..||...|:..:.|..:.|| |.|: ....:|:::.|
  Rat  2910 LTDAHVLDESFLVLINDLLASGDIPGLFSDEDTDKIISGIRNEVRGLG-ITDS-RENCWAFFLAR 2972

  Fly  2773 IREQLHIALAFSPIGDSFKERIRVYPSLINCCTIDWYMPWPEEALSRVGVYFVSSMNLNRPHGEE 2837
            :|.||.:...|||:|.:.:.|.|.:|:|:||..|||:..||:|||..|...|:            
  Rat  2973 VRLQLKMVFCFSPVGHTLRVRARKFPALVNCTAIDWFHAWPQEALVSVSRRFI------------ 3025

  Fly  2838 TQEPVQSKDAADPDEEEVRRETVGVEREQTQLEADLVDCVM-YFHQSVVDASEKCYLELNRRNYV 2901
                           ||:.    |:|.:    ..|.:...| |.|.||.:.|...|....|.||.
  Rat  3026 ---------------EEIE----GIEPQ----HKDSISLFMAYVHTSVKEVSAWYYQNERRYNYT 3067

  Fly  2902 TPSAYLELLKAFRTFYTRKLDEITRLRDRYTTGLEKLDFAAGQVGEMQTNLYDLQPKLKVLSEET 2966
            ||.::||.:..|::...:|..|:.|.::....|::||...|.|||.::..|...:.:|::.:::.
  Rat  3068 TPRSFLEQISLFKSLLKKKRGEVQRKKEHLGNGIQKLQTTASQVGNLKARLASQEAELQLRNQDA 3132

  Fly  2967 DRIMVNIERETAEAEKKKEVVGADEAAANEAAAAAQAIKDDCETDLAEAIPAMEAALEALNTLKP 3031
            :.::..|..:|.:..::|.:..|:|.........|...:.:||.||.:|.||:.||..|||||..
  Rat  3133 EALITKIGLQTEKVSREKAIADAEERKVAAIQTEASQKQRECEADLLKAEPALVAATAALNTLNR 3197

  Fly  3032 ADIFIVKSMKNPPYGVKLTMEAVCVIRGIKPDRKPDPSGHMVED-YWGPS---MRMLSDMKFLDS 3092
            .::..:|:..|||..|.....||.|:..        |.|.:.:| .|..:   |..:.|  ||.:
  Rat  3198 VNLTELKTFPNPPNAVTNVTAAVMVLLA--------PRGRVPKDRSWKAARIFMGKVDD--FLQA 3252

  Fly  3093 LKTFDKDNIPPPIIKRIREKYIADRDFVPEKIKAASMACEGICRWVRAMDVYDKVARIVMPKKAA 3157
            |..:||::||...:|.:.|:|:.|.:|.|..|:..|.|..|:|.||..:..:.:|...|.||:.|
  Rat  3253 LINYDKEHIPENCLKVVNEQYLKDPEFNPNLIRTKSFAAAGLCAWVINIIKFYEVYCDVEPKRQA 3317

  Fly  3158 LAEAEGELSQQMEKLNAKRAELQVILDKLQKLNDFFAEKSREKKRLEDEIDNCEKKLNRAEKLLG 3222
            ||:...:|:...|||.|.|.:|..:...|::|...|.:.:.||.|.::|::...|.::.|.:|:.
  Rat  3318 LAQTNLDLAAATEKLEAVRRKLVDLDHNLRRLTASFEKATAEKVRCQEEVNQTNKTIDLANRLVS 3382

  Fly  3223 GLGGEKTRWSEAAKNLHESISNIVGDVLLAGGCTAYLGYFTTEYRVNILD-DWNALCKRK-HIPS 3285
            .|..||.||.::.|:.......:.|||||.....:|:|.||.:||..::| .|....::| .||.
  Rat  3383 ELESEKIRWGQSIKSFETQEKTLCGDVLLTAAFVSYIGSFTRQYRQELVDCKWIPFLQQKVSIPI 3447

  Fly  3286 SETFSLATTLGHPMTIRAWSLAGLPADNFSVENGIIVTNSSRYSLLIDPQVQANKWIKNMEKNNN 3350
            :|...:..||....||..|:..|||:|..|.||..|:|:..|:.|:||||.|..||||| :...:
  Rat  3448 AEGLDMIATLTDDATIATWNNQGLPSDRMSTENATILTHCKRWPLMIDPQQQGIKWIKN-KYGPD 3511

  Fly  3351 LKVIKQSDANYMQVLELAITFGQPVLIENVGEKLDSNLTPILEKNVIKHKGGLFIKSGDQMIEYN 3415
            |||.......::..:|:|:.||..:||||:.|.:|..|.|:|.:|.||.  |.:|:.||:..|:|
  Rat  3512 LKVTHLGQKGFLNAIEMALAFGDVILIENLKETVDPVLGPLLGRNTIKK--GKYIRIGDKECEFN 3574

  Fly  3416 PNFRLYITTCLRNPRYPPEVMVMVTVLNFMITEQGLREQLLAIVVAHERPDLQEKKEQLIIESAR 3480
            .||||.:.|.|.||.|.||:....|:|||.:||.||..||||.||:.|||||:..|  |::...:
  Rat  3575 KNFRLILHTKLANPHYKPELQAQTTLLNFTVTEDGLEGQLLAEVVSVERPDLERLK--LVLTKHQ 3637

  Fly  3481 N--RDALYTIESKILEVLSTSEGNVLEDENAINILSSSKILSEDIQEKQVIAVATEIEIDAARQQ 3543
            |  :..|..:|..:|..||.:||:.|:|.:.:..|.::|..:.:|:.|.:.|...|.:|:..|:.
  Rat  3638 NDFKIELRHLEEDLLLRLSAAEGSFLDDTDLVERLETTKATAAEIEHKVIEARENERKINETREC 3702

  Fly  3544 YIPVSKHSAILFFCISELANVDPMYQYSLSWFLNLFVNTILKAPKSDQLSERLKNLNDYFTKSIY 3608
            |.||:..:::::|.||:|..::|:||:||..|..||...|.:|.|.:...||:..|.:..|.:.:
  Rat  3703 YRPVAARASLMYFVISDLRKINPVYQFSLKAFKTLFHRAIEQADKVEDTQERICALMESVTYATF 3767

  Fly  3609 TNVCRSLFEKDKLVISLVMCLGILVSQGRVEKAALLFFLTGGIGYKTIPPNPLGAWLPDKSWASV 3673
            .:..::|||||||.....|...||:.:..:....|.|.|...:.:....|..   :|..:||::|
  Rat  3768 LHASQALFEKDKLTFLSQMAFQILLRRNEIHPLELDFLLRFTVEHTYSSPVD---FLTAQSWSAV 3829

  Fly  3674 CKAADLEGLKNLPQMMETYSDEWHNFYDASNPDQLQLPAPHNTVNDMYFLIVIKSLRPDKLVPAV 3738
            ...|.:|..:.|.:.:|..:.:|..:.::..|::.:||......:.:..||:::::|||::..|:
  Rat  3830 KAVALMEEFRGLDRDVEGSAKQWRKWVESECPEKEKLPQEWKKKSLIQKLIILRAVRPDRMTYAL 3894

  Fly  3739 RAFITRNLDRSFVEPPPFDLAASFADSSPKIPLVFLLSAGSDPMASLFMFAKQRNM---YDKLKT 3800
            |.|:...|...:||....||..:|.:|||..|:.|:||.|.|.:..|.:..|:...   ..|...
  Rat  3895 RNFVEEKLGTKYVERTRLDLGKAFGESSPGTPVFFILSPGVDALKDLEVLGKRLGFTIDSGKFHN 3959

  Fly  3801 ISLGQGQGPRAEKMIMEAARHGQWVVLQNCHVAISWMGDLERICNDTTLTDGANHDYRLWCT--- 3862
            :||||||...||..:.:||..|.||.|||.|:...|:|.||::..  ..:.|::.|||::.:   
  Rat  3960 VSLGQGQELVAEMALEKAAIGGHWVFLQNVHLVAKWLGTLEKLLE--KFSQGSHRDYRVFLSAEA 4022

  Fly  3863 --SYPSAVFPVSVLQNSVKMTNEPPKGLRANMHR---SFTSDPL---MRDKFFTNAFLFSDSANK 3919
              |....|.|..:|:||:|:|||||.|:.||:|.   :|..|.|   .:|:.|.:.         
  Rat  4023 APSQHEPVIPQGLLENSIKITNEPPTGMLANLHAALYNFDQDTLEMCSKDQEFKSI--------- 4078

  Fly  3920 CWLRGVFALVFFHAVVQERREFGPLGWNIPYEFNESDLKISLLQLKMFINQSQSIPFRGHVYLTG 3984
                 :|:|.:||..|..|..|||.||:..|.|:..||.|....|...:..:..:|:....||.|
  Rat  4079 -----LFSLCYFHGCVAGRLRFGPQGWSRSYPFSPGDLTICTNILYNHLEANPHVPWEDLRYLFG 4138

  Fly  3985 ECNYGGRVTDDKDRRLILSLLNMIYNPNTIEEDNYALSQSGTYRVPLSPTRLNSIEYVSSFPLSP 4049
            |..|||.:||..||:|....|....||:.||::   |..:..:..|.........:|:.......
  Rat  4139 EIIYGGHITDAWDRKLCRVYLEEFMNPSLIEDE---LMLAPGFAAPPYSDYSGYHQYIEDMLPPE 4200

  Fly  4050 HPEVYGLHENADINRNVKETNALISGVLLTQTDLMASVKASSSGGAKEDPAIAICKQVLKQLPEE 4114
            .|.:||||.||:|......:|.|...:|..|.  ..:|.....|.:.||....|...:|::||||
  Rat  4201 SPALYGLHPNAEIELLTVTSNMLFRTLLEMQP--RNAVSNEEQGQSTEDKVKNILDDILERLPEE 4263

  Fly  4115 FNIDEVSKTYPVIYTNSMNTVL--RQELIRFNRLLSYIRKSLVNVGKAVVGQIAMIPELERTHAS 4177
            ||:.|:.:..|    |....:|  .||..|.|.||..||.||.::...:.|::.:.|::|...::
  Rat  4264 FNMAEIMQKNP----NRSPYILVCFQECERMNVLLREIRVSLQHLDLGLKGELTLSPDVETQLSA 4324

  Fly  4178 MVIGKLPADWLKKSYPSLKPLGSYVSDLLARLAFFQEWI-DNGEPMVYWISGFYFTQSFITGVLQ 4241
            :...::|..|.|.:|||...|..:.:|||.|......|. |...|.|.|:||.:..|||:|.::|
  Rat  4325 LSYDRVPDTWNKLAYPSTYGLAQWFNDLLLRCRELDTWTQDLTLPAVVWLSGLFNPQSFLTAIMQ 4389

  Fly  4242 NYSRKNRFQIDMILIEFAVTKFEVQVPG-TPDIGAYIRGIFIEGARWNRKTKEVDESFSKVLFDT 4305
            ..:|||.:.:|.:.:...|||...:..| .|..|||:.|:.:|||||:.::..:.::..|.|..|
  Rat  4390 TMARKNEWPLDRMCLTIDVTKKTKEDYGHPPREGAYLHGLHLEGARWDIQSGALVDARLKELTST 4454

  Fly  4306 LPVIYLRPVLKALEDLPRSTAGGEPETIYDCPVYKTSERRGVLSTTGHSTNFVMYLQLRCSRKPM 4370
            :|||:.:.:....:::..:         |:||||||..|         ...:|...:||...:..
  Rat  4455 MPVIFAKAIPADRQEVKHA---------YECPVYKTKAR---------GLTYVWTFRLRSKDRIA 4501

  Fly  4371 HWINRGTACLCQ 4382
            .|:..|.|.|.:
  Rat  4502 KWVLAGVALLLE 4513

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dnah3NP_647937.2 DHC_N2 1083..1489 CDD:462462 116/470 (25%)
DYN1 <1322..4005 CDD:227570 919/2758 (33%)
AAA_6 1620..1946 CDD:463697 160/325 (49%)
AAA_9 3302..3523 CDD:463702 91/222 (41%)
Dynein_C 4067..4381 CDD:465677 94/317 (30%)
Dnah11XP_038934019.1 DHC_N1 220..791 CDD:462457 68/400 (17%)
DHC_N2 1296..1722 CDD:462462 115/464 (25%)
DYN1 1550..4164 CDD:227570 925/2772 (33%)
AAA_6 1862..2188 CDD:463697 160/325 (49%)
MT 3095..3439 CDD:463699 106/353 (30%)
Dynein_C 4217..4512 CDD:465677 94/318 (30%)

Return to query results.
Submit another query.