DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dnah3 and Dnah9

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_647937.2 Gene:Dnah3 / 38586 FlyBaseID:FBgn0035581 Length:4385 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_002727768.2 Gene:Dnah9 / 117251 RGDID:621799 Length:4484 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:4506 Identity:1289/4506 - (28%)
Similarity:2111/4506 - (46%) Gaps:685/4506 - (15%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    69 LQEKISHMQTD-----KIVGHCNREFDFHRYDL---DNVKDEYDECDDDSLQELQLEDI------ 119
            |.:|:..|..:     |:...|:       ||.   ::::.|.|.|..:.    ::||:      
  Rat   473 LSQKVQQMHEEFEEMYKVFLDCS-------YDCLNPESMEFENDVCGFNK----RVEDLDRRLGT 526

  Fly   120 IMPEQFEMLRDAKDHLYNFDSTACNQFPWIDKWMTGVRPSEQEIYEMTSH----LLEIYCNR--R 178
            |:.:.|:.:.:.:           :.|..:|  :||.......:.:..||    |:.::...  .
  Rat   527 ILIQAFDDVPEVE-----------HAFKLLD--ITGTLVERPLVAQDVSHKYLALIRMFNTELDA 578

  Fly   179 VRIFYPGCGTSSSLWTNQLRR--QHG-SPSELIGAYRTPSARHMRVNNMRGPPKKEKFTAGDHYA 240
            |||.|          :..:|.  :|| ||.            |..:..|.|             .
  Rat   579 VRIIY----------SQHIREEVEHGFSPV------------HKNMPTMAG-------------G 608

  Fly   241 FRTPQECRNELMRVGKIIDELIEPVLKAAEHKIGHGLTKYPDPPS-CKDNTNRILRSAGILVGKK 304
            .|..||.|..:.........:....|::||.|  ..:.||.|..: .::...|:.......|.:|
  Rat   609 IRWAQELRQRIKGPFSNFKNIPHWCLQSAEGK--RMIQKYEDLLTLLEEYERRLYEDWCQTVSEK 671

  Fly   305 KNCYVGKCRIHRKDFAT------NEEFLRCLKRMEATHFPYMQP--LQPVDPDDQKIKMLAK--Y 359
            ....:....:||.....      |.:.:..||.|.     |:||  ::|: |:.......::  |
  Rat   672 SQRNLSLPLLHRDPITKQLSVNFNSQLISVLKEMN-----YLQPTEVKPI-PETAAAMFSSREFY 730

  Fly   360 RVELARAEKLFTLKIQKRYQCLLKSMSIVQLATYPSHLIRKAFRRINPRSALLQDAYQFIVKEKR 424
            |..:|..|.:     ...|..::.::..|:   :|  |:.:..:.|:.|....::...:  |.:.
  Rat   731 RQLVANLELM-----ANWYNKVITTLLEVE---FP--LVEEELQNIDLRLRAAEETLSW--KTEG 783

  Fly   425 DWPKLPPEVILMDYLFVGDRGVRQDLAILIIVCLIDLQEDFRHYVKRSFLNYLLSSNMERRRLQL 489
            .|                      |.|:.|...:.||:                      ||:|.
  Rat   784 IW----------------------DYAMQITNSIHDLE----------------------RRIQK 804

  Fly   490 EREPPEFPILTISPPVSWRSNLLRGKARIGEVLMTTHPTVQALNRLWHDLYEDLVVVDLGQLLLA 554
            .::..| .|.||..  :|.|.:.:.|....|.                                 
  Rat   805 TKDNVE-EIQTIMK--TWVSPIFKRKDGKKEC--------------------------------- 833

  Fly   555 QRPLDADTVQVFIEKSCADVRD-------LLLNDWLPRCADLMNEMRGTWKDLVPMSGKYGGRAA 612
              ||..|..|..:||..:.:|:       |:..:.:...||   ....|||..|           
  Rat   834 --PLSLDDQQDLLEKYYSLIRESGLKIHALVQENLVLFAAD---PASSTWKSYV----------- 882

  Fly   613 MLFRCIHSAMSRHLNSLISKSINYLFKVLCAFKGGNRIEKYSMFDAKLKRIPLMTLIASVVGAHF 677
                       .|::|::..  .:...:.|:.       ||.:.:.:.|                
  Rat   883 -----------GHIDSMLLD--GFFLAIECSL-------KYLLENTECK---------------- 911

  Fly   678 DHEPINMGPGVRPASNIYVYDEDDADPFQQPQVNQFVENVPDIDDVAQFELDHSNKLYIYPYMQE 742
                    ||:.|   |:           :.|:|..   .|::  |....||...|..:|..:|.
  Rat   912 --------PGLTP---IF-----------EAQLNLV---TPEL--VFYPSLDSGVKGGLYDIVQS 949

  Fly   743 LPRIFTEHFKSILAVGYEIPRLEFVMSGGEPETKGFLHFIDEDHVDFLE----LCEKVEQIVKVN 803
            |       ..||.||...:|||.  ...|.|..:|.|    |:..|...    |.|:|:.::.:.
  Rat   950 L-------VTSIFAVPSLVPRLS--PHSGSPHYQGDL----EEMADLASLRSLLLERVQTMMTLC 1001

  Fly   804 WQGVHVYLKPVYKY---------YFGLFQKLILPMVQKVWTENNLPE-----------LGAVQEL 848
            ....:...:..|.|         .|.|:..::.|...:...|:.:||           :.:.::|
  Rat  1002 CSYRNTLSQYSYLYVEDRKEALGQFLLYGHVLTPEEIEAHVEDGIPESPPLLHHFKDQIDSYEKL 1066

  Fly   849 LKKLQAVSDTTYY---LR-DFIPLNLFMLDNRHVKLSLRMYVREIYDFIIDFYKALNWNENRAIC 909
            .:.:.::..:..:   :| |..|....:| |...|.|| |:.:.:.||:.:....|:     :..
  Rat  1067 YEDVVSLEPSKVFDGWMRVDVRPFKASLL-NTIKKWSL-MFKQHLVDFVTNSLADLD-----SFI 1124

  Fly   910 EELEEMSMKAGERPEETPEVVALQNYINDCREMRIFAIKDEIKNVLKRVVFLLTHTYLSSDELHL 974
            :..|...:|..|: .:...:|.:..::...:|.:  :..|::...||:.:.|     |.|.|..|
  Rat  1125 KSTECGLLKRVEK-GDFQGLVEIMGHLVTLKERQ--SSTDDMFEPLKQTIEL-----LKSYEQEL 1181

  Fly   975 NSRTFILPGEL---------------EEVLDLSAARLAVVRDNLELALRERRMEFEKLLAQEKR- 1023
            ....|....||               ::|..|.|..:|::|.... |..:.:.:|::...:|.. 
  Rat  1182 PETVFKQLEELPEKWKNVKKMAITVRQQVAPLQANEVALLRQRCS-AFDDEQQQFQERFHKEAPF 1245

  Fly  1024 TMDGFRIREIRDVLTLEELKERVDTVDLLFTTIENLSREAKAINTEETLLQIDVSAFPLLAEIIE 1088
            ..|.....::.||..:|               |:::......|:....|.:::|..:..|.:..:
  Rat  1246 RFDSINPHQMLDVWHME---------------IQHMESTMATISKSADLFEVNVPDYKQLRQCRK 1295

  Fly  1089 KMEPIEKLWKTSYEFEKDYLIWMFERFECLNADGVREQVENMHKIMYKLSRQLAYNPVAKRAAEQ 1153
            :...:::||.|..........|....:..::.:                    |.:...|:.|.|
  Rat  1296 EACQLKELWDTIGMVTSSIQAWEATSWRNISVE--------------------AMDSECKQFARQ 1340

  Fly  1154 MRMKIEKFRVY----------------LPVLDSICRHGLEKRHWDQISKILGRKVNPKLFPTLKD 1202
            :|...::||.:                |..:..:....:.:|||.|:.:..|.........||..
  Rat  1341 IRNLDKEFRTWDAFTGLESTVLNTLTSLRAVAELQNPAIRERHWRQLMQATGVNFTMDRDTTLAH 1405

  Fly  1203 MIDVDIMSILPQLEEIANAAGKEYDLNNGLRIMQADWRDVMFEVLQYR-DSDTHI--LASLDDIQ 1264
            ::.:.:.....::.:|.:.|.||..:...|:.:|..|..:.|   ||. .:.|||  |.|.:|:.
  Rat  1406 LLQLQLHHFEDEVRDIVDRAVKEMSMEKTLKELQTTWASMEF---QYETHARTHIPLLQSDEDLI 1467

  Fly  1265 TLLDDHIMRTQAMKRSPFITALGSKADDWEARLLLIQNIIDAWTQVQITWMYLEPIF-SSEDIMR 1328
            .:|:|:.::.|.:..|.::.....:...|:.:|....::|..|.:||.||.:||.|| .||||..
  Rat  1468 EVLEDNQVQLQNLMMSKYVAFFLEEVSSWQKKLSTADSVISIWFEVQRTWSHLESIFIGSEDIRA 1532

  Fly  1329 QMPLEGRNFKAVDKLWRKIMKHTLKDRHVMAATEYPEMLEVFTKAIEDLET----VTKGLNTYLE 1389
            |:|.:.:.|:::|..:|:::....|..:|:.||....:.|    .:||:::    ..|.|..||:
  Rat  1533 QLPQDAKRFESIDSDFRELVYDAQKTPNVVEATNKSGLYE----KLEDIQSRLCLCEKALAEYLD 1593

  Fly  1390 QKRLFFARFFFLSNDELLEILSETKDPMRVQPHLRKCFEGIGSLTF------DDNMEIVEMVSDE 1448
            .|||.|.||:|||:.:||:|||....|.:||.||.|.|:.:..:.|      :.....:.|.|.|
  Rat  1594 TKRLAFPRFYFLSSSDLLDILSNGTAPQQVQRHLSKLFDNMAKMQFQLDASQNPTKTSLGMYSKE 1658

  Fly  1449 EERVALVRKINPQLANGLVEMWLKEVEMVMLDSVKEQMREAWEDYAMVERISWVVSWPGQVVQGI 1513
            ||.||.   ..|...:|.||:||..|...|..:|:.:|.||...|....|..|:..:|.||....
  Rat  1659 EEYVAF---SEPCDCSGQVEIWLNRVLRHMKATVRHEMTEAVTAYEEKPRDQWLFDYPAQVALTC 1720

  Fly  1514 SCMAWTYEV-------EEAIETKELPAYLEKSNLQIADLVQLVRTDLQAGVRIAVEALIVLDVHD 1571
            :.:.||.||       ||..| ..:..|.:|...|:..|:.::...|..|.|..:..:..:|||.
  Rat  1721 TQIWWTTEVGIAFARLEEGYE-NAMKDYYKKQVAQLKTLITMLIGQLSKGDRQKIMTICTIDVHA 1784

  Fly  1572 RDVVKYLTDCRITNIQDFDWISQLRYYWKVNEKNEDWVCVSMVVTDVE--YGMEYLGNLPRLVVT 1634
            ||||..:...::.|.|.|.|:||||:.|....|:    |.:. :.|.:  |..|||||.||||:|
  Rat  1785 RDVVAKMIAQKVDNAQAFLWLSQLRHRWDDEAKH----CFAN-ICDAQFLYSYEYLGNTPRLVIT 1844

  Fly  1635 PLTDRCYRTLMGALKLCLGGAPEGPAGTGKTETCKDLAKAVAKKCVVFNCSDGLDYKALGKFFKG 1699
            |||||||.||..:|.|.:.|||.||||||||||.|||.:|:.....|||||:.:|||:.|..:||
  Rat  1845 PLTDRCYITLTQSLHLTMSGAPAGPAGTGKTETTKDLGRALGIMVYVFNCSEQMDYKSCGNIYKG 1909

  Fly  1700 LAQSGAWACFDEFNRIELEVLSVVAQQILTIQRAIGRKVVKFFFEDTMLKLDPTCSIFITMNPGY 1764
            |||:|||.||||||||.:|||||||.|:.:||.||..|..:|.|....:.|||:..|||||||||
  Rat  1910 LAQTGAWGCFDEFNRISVEVLSVVAVQVKSIQDAIRDKKQRFSFLGEEISLDPSVGIFITMNPGY 1974

  Fly  1765 AGRTELPDNLKVLFRTVAMMVPDYAMIGEITLYSNGFDMARNLSQKIVQAYKLCSEQLSSQSHYD 1829
            |||||||:|||.|||..||:|||:.:|.||.|.:.||..||.|::|.:..|:||.|.||.|.|||
  Rat  1975 AGRTELPENLKALFRPCAMVVPDFELICEIMLVAEGFIEARLLARKFITLYRLCKELLSKQDHYD 2039

  Fly  1830 YGMRAVKSVLLASASLRRLYVDLPEPEIVLRAIVDVNLPKFLEQDISLFIGIYMDLFPGVELPMP 1894
            :|:||:||||:.:.||:|...|.||.::::|::.|.|:||.:..|:.:|:|:..||||.:::|..
  Rat  2040 WGLRAIKSVLVVAGSLKRGDPDRPEDQVLMRSLRDFNIPKIVTDDMPVFMGLISDLFPALDVPRK 2104

  Fly  1895 QRGDILKWLHINLADRNLQATPWYLEKILQIYEMLLVRHGLMIVGGSMGGKTTAYQVLAQT---- 1955
            :..|....:...:.|..|||...::.|::|:.|:|.|||.:.||||:..||:...:.|.:|    
  Rat  2105 RDLDFEAVVRKAIVDLKLQAEDNFVLKVVQLEELLAVRHSVFIVGGAGTGKSQVLKSLHKTYQIM 2169

  Fly  1956 -LRNVSTDEEATLKEFPVTFRIINPKAITMGQLYGRFDPVSHEWYDGVLAKTFREQV----QGPK 2015
             .|.|.||              :||||:|..:|:|..:|.:.||.||:.:...||..    .|||
  Rat  2170 RCRPVWTD--------------LNPKAVTNDELFGIINPATREWKDGLFSSIMRELANISHDGPK 2220

  Fly  2016 GERAWVMFDGPVDAVWIENLNTVLDDNKKLCLMSGEIMQMTKLMNMMFEPADLEQASPATVSRCG 2080
                |::.||.:|.:|||:||||:||||.|.|.|.|.:.:...|.::||.:.|..|:||||||.|
  Rat  2221 ----WILLDGDIDPMWIESLNTVMDDNKVLTLASNERIPLNPTMRLLFEISHLRTATPATVSRAG 2281

  Fly  2081 MIYMEPSQLGWRALHKSFIN---VLVNKVGLGDIYMTLFEDMTEWLVPAALEFLPQCKQML---- 2138
            ::|:.|:.|||.....|:|:   |...:..|     |:..|          ::||.|...|    
  Rat  2282 ILYINPADLGWNPPVNSWIDQREVQTERANL-----TILFD----------KYLPTCLDTLRTRF 2331

  Fly  2139 -ELSPIYQYQTFSRFFLHFLE----KH-------KQFNQAWFQQMFLFCFAWAYCSALTGQGQKT 2191
             ::.|:.: |:..:...:.||    |.       |:.    ::..|:|...||:.|::. |.|  
  Rat  2332 KKIIPVPE-QSMIQMLCYLLECLLTKEAVPADCPKEI----YELYFVFAAIWAFGSSMV-QDQ-- 2388

  Fly  2192 FDALLRKVIYGSNENFPKPKYFSLNRGQMFPEKLLFLDYRFD-EAENWWTWQKSDDSASTTSNFP 2255
                    :......|.| .:.:..:...||.:....||..| |.:.:..|.|    ......|.
  Rat  2389 --------LVDYRAEFSK-WWLTEFKTVKFPSQGTVFDYYIDQETKKFEPWGK----LIPQFEFD 2440

  Fly  2256 ENAQISELIVPTKETGYISYWQEFCISKSYAMLVVGPTGTGKSAIITSNLLAMPKFANLVNVINF 2320
            ....:...:|.|.||..:.|:.|..:.:...:::||..|:|||.::.:.|.::.....:|..:.|
  Rat  2441 PEMPLQACLVHTSETIRVCYFMERLMERRRPVMLVGSAGSGKSVLVGAKLSSLNPEEYMVKNVPF 2505

  Fly  2321 SARTSAQMVQDTIMSKLDRRRKGVFGPSLGKKCTVFCDDVAMPSKDTYGSQAPLELLRTWLDHGY 2385
            :..|::.|:|..:...|:::....:||...:|...|.||:.||..|.||:..|..::|..||:|:
  Rat  2506 NYYTTSAMLQAVLEKPLEKKAGRNYGPPGNRKLIYFIDDMNMPEVDAYGTVQPHTVIRQHLDYGH 2570

  Fly  2386 WSDLVDTTKIELVDMTLMCAMGTLGGSNFIFPRLYRHMFVVAVDSFEDSTIVRIFTTIGDWHFSK 2450
            |.|....:..|::::..:..|....||..|.|||.||..|.|:.......:..|::||...|...
  Rat  2571 WYDRNKLSLKEIMNVQYISCMNPTAGSFTINPRLQRHFSVFALCFPGADALSSIYSTILTHHLKL 2635

  Fly  2451 G-YPEKVALLSRGLSEAMVSVYRDAIRSFLPTPAKSHYSFSLRDITRVFQGIVMVPPKRMPDPEK 2514
            | :|..:......|....|:.::....:||||..|.||.|:|||...:||||:....:.:...:.
  Rat  2636 GNFPTTLQKSIPSLINLAVTFHQKIATTFLPTAIKFHYIFNLRDFANIFQGILFSSTECVKSTQD 2700

  Fly  2515 LGRLWAHETYRVFYDRLVDQQDRDRLLVMAVDACKSNL---RFPLEQAFGERIEPGEKLTDNDLR 2576
            |.:|:.||:.||:.|::|:::|.:....:..:..|.|.   :..|||.                :
  Rat  2701 LVKLYLHESDRVYRDKMVEEKDFNLFDKLQTEFLKKNFDDSKGMLEQT----------------Q 2749

  Fly  2577 NL-FYGNYMEPDAEPKFYDEGDTYEKLEKLMKYYLREYNSFSSTPMDLVMFRFAIEHVSRVSRVL 2640
            || .|.::.....||| |....:::.|.:.:...|..:|..::. ||||:|..||.|:..::|:|
  Rat  2750 NLNMYCHFANGIGEPK-YMPVQSWDLLSQTLVEALESHNEVNAV-MDLVLFEDAIHHICHINRIL 2812

  Fly  2641 QMPRGNILMVGMGGSGRRSSARLAAYIADCRLMTVQVSKSYTITDWRDDLKKILMSASFNLNHTV 2705
            :.||||.|:||:||||::|..||||:|:...:..:.:.|.|.|.|::.||..:.:.|......||
  Rat  2813 ESPRGNALLVGVGGSGKQSLTRLAAFISSMDVFQITLRKGYQIPDFKVDLASLCLKAGVKNLSTV 2877

  Fly  2706 FLFSDAQATDEGYVEDINGILNTGDLPNLYQLEDKATIMENMANVAKQLGKILDTLPSEVYAYYI 2770
            ||.:||...||.::..||.:|.:|::|:||..|::..|:.|:.|..|..| ::|: ....:.::|
  Rat  2878 FLMTDAHVADERFLVLINDLLASGEIPDLYSEEEEENIINNVRNEVKSQG-LIDS-RENCWKFFI 2940

  Fly  2771 DRIREQLHIALAFSPIGDSFKERIRVYPSLINCCTIDWYMPWPEEALSRVGVYFV-SSMNLNRPH 2834
            :|:|.||.:.|.|||:|:..:.|.|.:|:::||..|:|:..||:|||..|.:.|: ::.|:    
  Rat  2941 ERVRRQLKVTLCFSPVGNKLRIRSRKFPAIVNCTAINWFHEWPQEALESVSLRFLQNTKNI---- 3001

  Fly  2835 GEETQEPVQSKDAADPDEEEVRRETVGVEREQTQLEADLVDCVMYFHQSVVDASEKCYLELNRRN 2899
                 ||.                          ::..:...:.:.|.||...|:...:...|.|
  Rat  3002 -----EPA--------------------------VKQSISKFMAFVHISVNKISQSYLINEQRYN 3035

  Fly  2900 YVTPSAYLELLKAFRTFYTRKLDEITRLRDRYTTGLEKLDFAAGQVGEMQTNLYDLQPKLKVLSE 2964
            |.||.::||.::.:::...|...|:....:|...||.||...:.||.:::..|...:.:|:..:|
  Rat  3036 YTTPKSFLEFIRLYQSLLERNGKELQSKVERLENGLLKLHSTSAQVDDLKAKLATQEVELRQKNE 3100

  Fly  2965 ETDRIMVNIERETAEAEKKKEVVGADEAAANEAAAAAQAIKDDCETDLAEAIPAMEAALEALNTL 3029
            :||:::..:..||::..::|.:...:|..........|..:.|||.|||:|.||:.||..|||||
  Rat  3101 DTDKLIQVVGVETSKVSREKAIADEEEQKVALIMLEVQQKQKDCEEDLAKAEPALTAAQAALNTL 3165

  Fly  3030 KPADIFIVKSMKNPPYGVKLTMEAVCVIRGIKPDRKPDPSGHMVED-YW-GPSMRMLSDMKFLDS 3092
            ...::..:||..:||..|.....||.|:..        |.|.:.:| .| ...:.|.....||||
  Rat  3166 NKTNLTELKSFGSPPLAVSNVSAAVMVLMA--------PGGKVPKDRSWKAAKITMTKVDSFLDS 3222

  Fly  3093 LKTFDKDNIPPPIIKRIREKYIADRDFVPEKIKAASMACEGICRWVRAMDVYDKVARIVMPKKAA 3157
            |..|||:||....:|.|| .|:.|..|.||.:...|.|..|:|.||..:..:.:|...|.||:.|
  Rat  3223 LIHFDKENIHENCLKAIR-PYLQDPAFNPEFVATKSYAAAGLCSWVINIVRFYEVFCDVEPKRQA 3286

  Fly  3158 LAEAEGELSQQMEKLNAKRAELQVILDKLQKLNDFFAEKSREKKRLEDEIDNCEKKLNRAEKLLG 3222
            |.:|..:|:...|||.|.:|::..:.:.|.||...|.:.:.||.:.:.|.:.....::.|.:|:|
  Rat  3287 LNKATSDLTAAQEKLAAIKAKITHLNENLAKLTTKFEKATAEKLKCQQEAEVTAGTISLANRLVG 3351

  Fly  3223 GLGGEKTRWSEAAKNLHESISNIVGDVLLAGGCTAYLGYFTTEYRVNILD-DWNALCK--RKHIP 3284
            ||..|..||:||.:|..:....:.||:||.....:|||:||.:||.:::| .|.....  :..||
  Rat  3352 GLASENVRWAEAVQNFRQQERTLCGDILLTTAFISYLGFFTKKYRKSLMDGTWKPYLSQLKVPIP 3416

  Fly  3285 SSETFSLATTLGHPMTIRAWSLAGLPADNFSVENGIIVTNSSRYSLLIDPQVQANKWIKNMEKNN 3349
            ::.|......|.....:..|...|||||..|:||..|:.|..|:.|::|||:|..||||| :...
  Rat  3417 TTPTLDPLKMLTDDADVATWQNEGLPADRMSMENATILINCERWPLMVDPQLQGIKWIKN-KYGE 3480

  Fly  3350 NLKVIKQSDANYMQVLELAITFGQPVLIENVGEKLDSNLTPILEKNVIKHKGGLFIKSGDQMIEY 3414
            .|:|.:......:|.:|.|:..|..|||||:.|.:|..|.|:|.:.|||.  |.|||.||:..|:
  Rat  3481 ELRVTQIGQKGCLQTIERALEAGDVVLIENLEESIDPVLGPLLGREVIKK--GRFIKIGDKECEF 3543

  Fly  3415 NPNFRLYITTCLRNPRYPPEVMVMVTVLNFMITEQGLREQLLAIVVAHERPDLQEKKEQLIIESA 3479
            ||.|||.:.|.|.||.|.||:....|::||.:|..||.:||||.||:.|.|||:..|..|..:..
  Rat  3544 NPKFRLILHTKLANPHYQPELQAQATLINFTVTRDGLEDQLLAAVVSMEIPDLEHLKSDLTKQQN 3608

  Fly  3480 RNRDALYTIESKILEVLSTSEGNVLEDENAINILSSSKILSEDIQEKQVIAVATEIEIDAARQQY 3544
            ..:..|.|:|..:|..||::.||.|.:...:..|..:|..:.::|||...|..||::|:.||:.|
  Rat  3609 GFKITLKTLEDNLLSRLSSASGNFLGETALVENLEVTKQTAAEVQEKVQEAKLTEVKINEAREHY 3673

  Fly  3545 IPVSKHSAILFFCISELANVDPMYQYSLSWFLNLFVNTILKAPKSDQLSERLKNLNDYFTKSIYT 3609
            .|.:..:::|:|.:::|:.:.||||:||..|..:|...:.||..|:.:.||:.||.|..|.|:|.
  Rat  3674 RPAAARASLLYFIMNDLSKIHPMYQFSLKAFSIVFQKAVEKAAPSEDVKERVTNLIDSITFSVYQ 3738

  Fly  3610 NVCRSLFEKDKLVISLVMCLGILVSQGRVEKAALLFFLTGGIGYKTIPPNPLGAWLPDKSWASVC 3674
            ...|.|||.|||.....:...||:....|..|.|.|.|...:...|  |:|: .:|..::|.|:.
  Rat  3739 YTTRGLFECDKLTYLAQLTFQILLVNQEVNAAELDFLLRAPVQAGT--PSPM-EFLSHQAWGSIK 3800

  Fly  3675 KAADLEGLKNLPQMMETYSDEWHNFYDASNPDQLQLPAPHNTVNDMYFLIVIKSLRPDKLVPAVR 3739
            ..:.:|...||.:.:|..:..|..|.::..|::.:.|........:..|.:::::|||::..|:|
  Rat  3801 ALSSMEEFCNLDRDIEGSAKSWKKFVESECPEKEKFPQDWKNKTGLQRLCMMRAMRPDRMTYAMR 3865

  Fly  3740 AFITRNLDRSFVEPPPFDLAASFADSSPKIPLVFLLSAGSDPMASLFMFAKQ-------RNMYDK 3797
            .|:...|...:|...|.|..:||.:|.|..|:.|:||.|.||:..:....|:       ||.:: 
  Rat  3866 DFVEEKLGSKYVMGRPLDFVSSFEESGPATPMFFILSPGVDPLKDVENQGKKLGYTFNNRNFHN- 3929

  Fly  3798 LKTISLGQGQGPRAEKMIMEAARHGQWVVLQNCHVAISWMGDLERICNDTTLTDGANHDYRLWCT 3862
               :||||||...||..:..||:.|.||:|||.|:...|:..||:...:  |::.::.|:|::.:
  Rat  3930 ---VSLGQGQEVVAEAALDLAAKKGHWVILQNIHLVAKWLSTLEKKLEE--LSEESHPDFRVFIS 3989

  Fly  3863 SYPSA-----VFPVSVLQNSVKMTNEPPKGLRANMHR---SFTSDPL---MRDKFFTNAFLFSDS 3916
            :.|:.     :.|..:|:||:|:|||||.|:.||:|:   :||.|.|   .|:..|...      
  Rat  3990 AEPAPSPEGHIIPQGILENSIKITNEPPTGMHANLHKALDNFTQDTLEMCSRETEFKTI------ 4048

  Fly  3917 ANKCWLRGVFALVFFHAVVQERREFGPLGWNIPYEFNESDLKISLLQLKMFINQSQSIPFRGHVY 3981
                    :|||.:|||||.|||:|||.|||..|.||..||.||:..|..|:..:..:|:....|
  Rat  4049 --------LFALCYFHAVVAERRKFGPQGWNRSYPFNTGDLTISVNVLYNFLEANTKVPYDDLRY 4105

  Fly  3982 LTGECNYGGRVTDDKDRRLILSLLNMIYNPNTIEEDNYALSQSGTYRVPLSPTRLNSIEYVSSFP 4046
            |.||..|||.:|||.||||..:.|.....|..:|.:   ||.:..:.:|.:.......:|:.: .
  Rat  4106 LFGEIMYGGHITDDWDRRLCRTYLEEFIRPEMLEGE---LSLAPGFPLPGNMDYSGYHQYIDA-E 4166

  Fly  4047 LSPH-PEVYGLHENADINRNVKETNALISGVLLTQTDLMASVKASSSGGAKEDPAIAICKQVLKQ 4110
            |.|. |.:||||.||:|....:.:..|...||..|.  ..|.....:|..:|:...|..:::|.:
  Rat  4167 LPPESPYLYGLHPNAEIGFLTQTSEKLFRTVLEMQP--RDSQAGDGAGSTREEKVKAFLEEILDR 4229

  Fly  4111 LPEEFNIDE----VSKTYPVIYTNSMNTVLRQELIRFNRLLSYIRKSLVNVGKAVVGQIAMIPEL 4171
            :.:||||.|    |.:..|.|      .|..||..|.|.|...|::||..:...:.|::.|..|:
  Rat  4230 VTDEFNIPELMAKVEERTPYI------VVALQECERMNILTREIQRSLRELHLGLQGELTMTSEM 4288

  Fly  4172 ERTHASMVIGKLPADWLKKSYPSLKPLGSYVSDLLARLAFFQEWI-DNGEPMVYWISGFYFTQSF 4235
            |....::.:..:|..|.:::|||...|.::..|||.|:...:.|. |...|...|::||:..|||
  Rat  4289 ENLQNALYLDVVPEPWARRAYPSTAGLAAWFLDLLNRIKELETWTGDFVMPSTVWLTGFFNPQSF 4353

  Fly  4236 ITGVLQNYSRKNRFQIDMILIEFAVTK---FEVQVPGTPDIGAYIRGIFIEGARWNRKTKEVDES 4297
            :|.::|:.:|||.:.:|.:.::..|||   .|.:.|  |..||||.|:|:|||.|:.:...:.|:
  Rat  4354 LTAIMQSMARKNEWPLDQMALQCDVTKKNREEFRSP--PREGAYIYGLFMEGACWDTQAGIIAEA 4416

  Fly  4298 FSKVLFDTLPVIYLRPVLKALEDLPRSTAGGEPETIYDCPVYKTSERRGVLSTTGHSTNFVMYLQ 4362
            ..|.|...:||::|:.:....:|.         .:||.||||||.:|         ...:|....
  Rat  4417 KLKDLTPPMPVMFLKAIPAEKQDC---------RSIYACPVYKTCQR---------GPTYVWTFN 4463

  Fly  4363 LRCSRKPMHWINRGTACLCQL 4383
            |:....|..|:..|.|.|.|:
  Rat  4464 LKTKENPSKWVLAGVALLLQI 4484

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dnah3NP_647937.2 DHC_N2 1086..1489 CDD:285579 110/432 (25%)
P-loop_NTPase 1620..1847 CDD:304359 138/226 (61%)
P-loop_NTPase 1934..2079 CDD:304359 58/153 (38%)
P-loop_NTPase 2264..2522 CDD:304359 74/258 (29%)
P-loop_NTPase 2613..2916 CDD:304359 95/303 (31%)
MT 2929..3272 CDD:289543 112/344 (33%)
AAA_9 3304..3519 CDD:289547 89/214 (42%)
Dynein_heavy 3659..4373 CDD:281078 229/740 (31%)
Dnah9XP_002727768.2 DHC_N1 210..787 CDD:285571 70/414 (17%)
DHC_N2 1293..1697 CDD:285579 111/433 (26%)
P-loop_NTPase 1830..2060 CDD:304359 139/229 (61%)
P-loop_NTPase 2144..2279 CDD:304359 57/152 (38%)
P-loop_NTPase 2437..2708 CDD:304359 75/270 (28%)
P-loop_NTPase 2786..3053 CDD:304359 95/304 (31%)
MT 3065..3408 CDD:289543 114/351 (32%)
AAA_9 3435..3648 CDD:289547 89/215 (41%)
Dynein_heavy 3785..4474 CDD:281078 230/741 (31%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 00.000 Not matched by this tool.
eggNOG 1 0.900 - - E1_COG5245
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 00.000 Not matched by this tool.
OrthoInspector 00.000 Not matched by this tool.
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_100025
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 00.000 Not matched by this tool.
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
43.710

Return to query results.
Submit another query.